The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
|
sequence length |
73
|
structure length |
73
|
Chain Sequence |
MDSNTVSSFQVDCFLWHVRKRFADQELGDAPFLDRLRRDQKSLRGRGSTLGLDIETATRAGKQIVERILKEES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Non-structural protein 1
|
| publication title |
Structural Basis for a Novel Interaction between the NS1 Protein Derived from the 1918 Influenza Virus and RIG-I.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Influenza a virus
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| molecule tags |
Viral protein
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| total genus |
21
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| structure length |
73
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| sequence length |
73
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-09-03 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | S15/NS1, RNA-binding |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4DV1 O; 2ZKO A; 4LFB O; 2JRI A; 2F4V O; 4JI8 O; 1X59 A; 3J7A U; 5BY1 A; 5H5N A; 1F7Y A; 4DR7 O; 5IT9 N; 2DJV A; 3O65 A; 1HNZ O; 2N74 A; 1FJG O; 4AQY O; 2ZM6 O; 4NXM O; 1N34 O; 3T1Y O; 1G1X B; 1IBL O; 2UUC O; 2UUA O; 4DV2 O; 4GKJ O; 1D2D A; 4DUZ O; 2UUB O; 4X62 O; 1NS1 A; 4DV7 O; 4X66 O; 4NXN O; 3J80 N; 5BXZ A; 3R66 A; 4DR6 O; 2UXC O; 3M8A A; 1XEQ A; 2HHH O; 4LF5 O; 4X65 O; 4X64 O; 1AB3 A; 4JI0 O; 4DR4 O; 4JI3 O; 4YHH O; 4LF8 O; 1IBK O; 3JAM N; 4JI6 O; 4OPA A; 4B3R O; 4DUY O; 4LFC O; 3J81 N; 2VQF O; 1IBM O; 4LF7 O; 3OTO O; 4JV5 O; 4JYA O; 4JI4 O; 1R6T A; 1J5E O; 4B3S O; 4JI1 O; 4JI7 O; 2E5L O; 4LF6 O; 2FKX A; 1XNR O; 1FKA O; 1HR0 O; 3F5T A; 4JI2 O; 4LFA O; 2DOS A; 1YZB A; 5IWA O; 4OPH A; 1R1B A; 5BR8 O; 2Z0A A; 1AIL A; 2UXB O; 3SDL A; 4K0K O; 1HNW O; 1KUQ A; 2VQE O; 2UXD O; 1N32 O; 5LMU O; 4LF9 O; 1XMQ O; 1I94 O; 4YY3 O; 5LL6 Y; 4DR1 O; 4B3T O; 4DV5 O; 5A2Q N; 4DR3 O; 1XMO O; 4B3M O; 1HNX O; 4DV0 O; 4DV6 O; 1A32 A; 3RT3 C; 1N33 O; 4A5U B; 4DR5 O; 2UU9 O; 4DV4 O; 3T1H O; 1N36 O; 4LF4 O; 2AGA A; 5LMN O; 1FYJ A; 4GKK O; 1DK1 A; 1XNQ O; 4KHP O; 5FLX N; 4DV3 O; 4OX9 O; 4DR2 O; 4JI5 O; 2LW7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5EC2 C; 3ZBH A; 3QO5 A; 2WLK A; 5H2F Z; 1I0H A; 1KB9 F; 1S72 V; 5KAF Z; 1PV0 A; 4LWS A; 4X62 B; 2E74 B; 1J95 A; 4X66 B; 3N2G B; 3S3X A; 2ZNI A; 3RBZ A; 4DR6 B; 1ROP A; 3P3N A; 1MG1 A; 4IT5 A; 3VQV A; 3K04 A; 4JI0 O; 1Q81 W; 3RYF A; 2QDO A; 1IBM B; 2N05 A; 1OCR B; 3ZRV A; 3CRR A; 1V54 B; 2V1D A; 4UCS A; 4LF6 B; 1EFR G; 3QO7 A; 2WLH A; 3FAV B; 2DWE C; 5B1A C; 1XHZ A; 1XL6 A; 1K34 A; 1P7B A; 5IYZ B; 2Y48 A; 1RFY A; 3JD4 A; 1V55 B; 1ZL8 A; 2A3Q A; 4JI3 B; 3IGA C; 5FPR A; 4BIO A; 2UXB O; 1NH2 B; 1JJO A; 1Y76 A; 5FL7 G; 1WAZ A; 3CXC U; 4CZZ A; 5C8Y A; 4ZIB A; 2P90 A; 1AR5 A; 3OM3 B; 3F7Y C; 1F4N A; 1B04 A; 2BE3 A; 2RCV A; 3DSQ A; 2QKS A; 3RFR A; 1N36 O; 4MVZ A; 2DYS B; 5FNV A; 1H8E G; 2OTJ V; 2LP7 A; 2C2A A; 2GHY A; 4EKW A; 5LA6 B; 1WNS A; 1DF5 A; 1W0J G; 3FFQ A; 5JQG B; 1MMM A; 5EIB D; 3SYA A; 5EBW C; 1KP2 A; 1TVK B; 4WF9 V; 2O57 A; 2DJV A; 4BAY A; 2EZP A; 4I9W A; 2ZM6 B; 5L3E A; 1YVW A; 3QG5 A; 1G1X B; 3QO8 A; 4GKJ B; 3X2Q B; 3L74 H; 4QIW F; 4GUN A; 4IL6 Z; 4DRX A; 4X62 O; 5BMV B; 3TK1 A; 3RYC B; 4X66 O; 3R66 A; 3T1C A; 1NH2 D; 4DR6 O; 3I55 V; 4UB8 Z; 2P06 A; 3K0G A; 1XEQ A; 2EJ7 A; 3SJB C; 1VQ8 V; 3FAV A; 3IFX A; 4QE7 A; 4OGQ B; 3N2K B; 1R3J C; 4O4J A; 2QWR B; 1IBM O; 1GK9 A; 3HKD A; 1G6U A; 3HKC B; 3D3Q A; 3MHH C; 4UB6 Z; 1R3L C; 2IU3 A; 3U11 A; 3CRQ A; 2KG7 B; 1YJW V; 4WFB V; 4LF6 O; 1QQC A; 1MSW D; 1HWY A; 3CCM V; 3F5W C; 2XND G; 4ASU G; 3AG4 C; 5LXT A; 4K0K B; 1GRJ A; 1EN6 A; 1BSM A; 3GWO A; 3JSL A; 3KKY A; 4FM1 A; 5H6Q A; 3DGE A; 4W4K A; 3MD0 A; 2YXY A; 4I55 A; 3UO3 A; 2OIG A; 3L72 H; 4UUJ C; 2A7W A; 2F93 B; 3AG3 C; 5LA6 A; 5EYP A; 1Q5O A; 3SPI A; 2LFS A; 5D5P A; 1Y74 A; 3RVZ A; 4TQD A; 4PD4 F; 4Z1V A; 2PTM A; 1WB8 A; 3WB0 A; 2BOB C; 4DV1 B; 2WA4 A; 3SYP A; 4X20 B; 5EC1 C; 4BW9 A; 4JPR A; 3L73 H; 2UXN A; 4J11 A; 4UFZ A; 2HJF C; 3JAT A; 2ZM6 O; 3OUF A; 2CUG A; 2ITC C; 2E76 B; 4NVP A; 5CMU A; 4GKJ O; 4DV7 B; 4Z2W A; 1S5H C; 4NXN B; 4X1I A; 1MA1 A; 5EBM C; 1BHB A; 4IYH A; 5BXZ A; 1BCC H; 1OJH A; 1VQN V; 1FPO A; 2RJZ A; 3APO A; 4FLZ A; 1ZX3 A; 3RYI B; 1AB3 A; 4TUY A; 4JTC B; 2E3C A; 3T4D A; 4QPK A; 3LDD A; 2UXX A; 1NR1 A; 3E8F A; 4N23 A; 3JD0 A; 3G67 A; 2KSD A; 2JGU A; 2Q0O C; 2DYR C; 1JQ0 A; 1B3Q A; 5IWA B; 4HNA B; 3B4S A; 1E1Q G; 1UFI A; 4CH3 A; 4RO2 A; 3SDL A; 4K0K O; 2YIB A; 4WFH A; 2CTR A; 1YTF B; 2LW1 A; 4O4L A; 4I4T B; 4G27 B; 1SKV A; 1AJP A; 3ZMU A; 5KA6 A; 4X1K B; 4HZ3 A; 1MZF A; 4FVM A; 4CH5 A; 3L75 H; 3P32 A; 1KQS U; 2BTQ B; 1E79 G; 5KUM A; 3CC4 V; 5KUK A; 1FFX B; 1I5Y A; 1SZX A; 3ZIA G; 4NTY A; 5KMG A; 4GX0 A; 4DV1 O; 1WJZ A; 2AXT Z; 4TOI A; 1MAB G; 1KC8 W; 1M57 C; 3BA9 A; 2DE0 X; 4PDL A; 3T1Y B; 1H2M A; 1VEW A; 3G6E V; 5CA1 B; 1KMI Z; 3APQ A; 3QVN A; 4FLT A; 4DUZ B; 4ZI7 A; 2A9H A; 1YHQ V; 1NVP B; 3ZN0 A; 4DV7 O; 1M5I A; 3ASN C; 4GT1 A; 2RMK B; 4DYL A; 4NXN O; 4ZBM A; 1F51 A; 1ZUQ A; 2DQ3 A; 3G80 A; 5CBF A; 2GBO A; 2WSS G; 5JJE B; 2EUL A; 4UCT A; 1FXH A; 3K0D A; 1JJ2 U; 2CDY A; 5LYJ B; 1ORQ C; 2QM7 A; 1H2L A; 2W0X A; 3FB8 C; 3F7V C; 3CC2 V; 1WPB A; 5H6R A; 4MVU A; 3JAL A; 4E4E A; 5EZY A; 4O2B B; 3KG2 A; 3QNE A; 2P5O A; 1YZB A; 3H01 A; 4F6E A; 5IWA O; 3ZRW B; 1N32 B; 2OIE A; 5B1A B; 1XMQ B; 1M9N A; 4YY3 B; 4B3T B; 4LBE C; 5HFM A; 4ZHQ A; 3CCE V; 1FFX A; 1GM8 A; 2M6Y A; 2W6I G; 4WFG A; 2BTO A; 1TUE B; 2M7W A; 5B3S C; 2HJD A; 1A32 A; 4LF4 B; 1EN4 A; 4W4L A; 2P22 C; 3ABM C; 3OTF A; 4JAU A; 4R7C A; 1NVP D; 1DGS A; 5IDJ A; 1JOY A; 1NR7 A; 3OFN G; 4PA6 A; 3UCS C; 5JVD B; 4Q20 A; 4XDL A; 1TGO A; 4JTA B; 4EB6 A; 4K8Z A; 4FJC C; 1VQ9 V; 1THZ A; 1QHT A; 4J42 A; 1X59 A; 3BAB A; 4HBN A; 1ZAU A; 1Q8I A; 2QWQ B; 2WPD G; 3L70 H; 2ZIO A; 4B7K A; 3HKB B; 4JGS A; 4CS2 A; 2FML A; 3T1Y O; 2HVK C; 4DV2 B; 1SZT A; 2QM4 A; 1CEZ A; 1I7F A; 1WP8 A; 1RSO A; 4F6R A; 1WA8 A; 2ZD9 A; 3OEE G; 4XDJ A; 4X88 A; 4DUZ O; 1GN2 A; 5AG2 A; 3CP1 A; 2WLI B; 2ODM A; 1GO3 F; 5KHI A; 2HHH B; 2X7R B; 1MOF A; 4P9O A; 4LF8 B; 4FK5 C; 1IXB A; 3CCV V; 1N0J A; 3AK3 A; 3ABL C; 2PZS A; 4D6T H; 2YDE A; 4JI4 B; 2Q73 A; 3K06 A; 1LR1 A; 3IC9 A; 3FX7 A; 3FYI B; 2P6J A; 2ILM A; 2XTA A; 3BEH A; 3D3I A; 2KKW A; 1V9P A; 3DC5 A; 3ABT A; 2HG5 C; 4LWS B; 1VQ6 V; 2R9I A; 2WAM A; 5B5E Z; 2F43 G; 3ETE A; 2Z0A A; 1AIL A; 2YXL A; 4KXR A; 1SQX H; 3ZRS A; 1N32 O; 3OMA B; 1XMQ O; 4YY3 O; 4WCE V; 3CPW U; 1E1R G; 1H8H G; 5IY5 C; 4B3T O; 4LP8 A; 3AG4 B; 3JAK A; 3B77 A; 2OTL V; 3ML0 A; 2QWN B; 4P30 A; 1FXK A; 3RYF B; 1XL4 A; 2JS3 A; 2P7T C; 3PJS K; 3DXR B; 3OR7 C; 4P2Z A; 1YSC A; 1Y67 A; 3SPG A; 4FM2 A; 4LF4 O; 1VQ4 V; 3HB3 B; 4DW1 A; 3I5D A; 3MDS A; 3B2E E; 2Q6A A; 1CPY A; 1QCE A; 3AG3 B; 1L8D A; 2CAZ C; 3VQW A; 1S76 D; 2AW9 A; 1ZL8 B; 2BSK A; 3ASO C; 5BY1 A; 4FLX A; 1FD9 A; 1Y76 B; 1VQ7 V; 4U7O A; 3FKS G; 5DN6 G; 4UV9 A; 4FIP C; 2Q5Z A; 4O4H A; 3G4S V; 1IBL B; 5C8Y B; 4J80 A; 4G2K A; 2XAJ A; 4DK1 A; 4LC1 A; 3CMA V; 4DV2 O; 1U96 A; 1D2D A; 1FAF A; 2QWO B; 2AZ0 A; 2CGO A; 1YEW A; 3OUS A; 1YIJ V; 4GLX A; 4GX5 A; 4UCO A; 4LF5 B; 5FNV B; 4JYB A; 2F1M A; 2VWJ A; 2HHH O; 3BCC H; 1XQ8 A; 3AEI A; 1XDC A; 1H38 A; 2OYQ A; 2IH3 C; 3HR0 A; 4LF8 O; 1KBH A; 3FD9 A; 3T4Z A; 4JZG A; 1MSD A; 2N04 A; 4JI4 O; 2AZ2 A; 1YI2 V; 1SA0 A; 1YXB A; 3CEI A; 4J7J A; 4PV1 B; 3CXH F; 4BWA A; 2D3O W; 5BR8 B; 1XIL A; 4Q6G A; 4DRX B; 1IX9 A; 3DXR A; 3GB7 C; 1GN3 A; 2GTA A; 2DYR B; 3EHB B; 1Z2G A; 4B3M B; 1X4T A; 4DV0 B; 3R65 A; 2Q7H A; 3TGU H; 4U3F H; 4DW0 A; 2Q7G A; 4O4J B; 2DN9 A; 5GW7 A; 4QE9 A; 3ETG A; 3CS5 A; 1SQV H; 2X6A A; 4GKK B; 3HKD B; 3U10 A; 4PDV A; 2AGA A; 4PA4 A; 4XDK A; 3ZRX A; 2H94 A; 2G38 A; 1SQQ H; 4L8J A; 3ZN1 A; 4GX2 A; 5LXT B; 5LHI A; 3K57 A; 1FXK C; 4RUF A; 1Q6H A; 3OR6 C; 2WLM A; 1OCC C; 4I55 B; 1N34 B; 1VF6 A; 4TSF G; 1AP6 A; 1IBL O; 1M57 B; 1R3I C; 1PNK A; 1EM1 A; 1QU7 A; 2P4V A; 5EYP B; 5CN0 A; 3MHS C; 4H37 A; 1PNL A; 1Y74 B; 2EBO A; 2QGN A; 2XAG A; 3TJT A; 3VQY A; 2ZCE A; 4LF5 O; 3JYC A; 4H0L B; 4YHH B; 3K5M A; 3ZJZ A; 4LH7 A; 5F2V O; 3UQ8 A; 3ASN B; 4X1Y A; 2VQF B; 2R72 A; 4I0X A; 2Y69 C; 5KHH A; 3A8T A; 2ZE6 A; 2JK5 C; 2CGN A; 4JI1 B; 4CS4 A; 5CA3 A; 1GTO A; 4ZKI A; 2A06 H; 1WPX A; 1TUB A; 4PA9 A; 1MNG A; 3JAT B; 3ABU A; 1WLE A; 4JTD B; 3CCQ V; 3FB7 C; 5LGT A; 3CME V; 1M93 A; 5BR8 O; 3N27 A; 2HKO A; 4X1I B; 1N0N A; 4GCZ A; 2Z5U A; 2OCH A; 3SJC C; 2L35 A; 2WLN A; 2ZDI C; 4TUY B; 4B3M O; 3U0Z A; 5KX5 A; 2GSM B; 3LDC A; 1BMF G; 3PN1 A; 4DV0 O; 4UV8 A; 1SF9 A; 3CCS V; 3B8M A; 2ETN A; 5CB4 A; 4MSW C; 3JCZ A; 1GN4 A; 4OX9 B; 4DR2 B; 2PI5 A; 4GKK O; 2RN9 A; 4BIU A; 5B3S B; 3E83 A; 3B8N A; 2ZT9 B; 3E22 A; 4TT3 G; 4WBN A; 3ICX A; 3BRC A; 2XUM A; 1ARO P; 3ABM B; 4YJ3 B; 3AG2 C; 1JCH A; 1SQG A; 2WLL B; 3VQX A; 2WLJ A; 4EFB A; 3AG7 A; 1ZTE A; 1TA8 A; 4R50 A; 3ZS8 C; 3JAR A; 1SES A; 4O4L B; 2P67 A; 1N34 O; 1JPX A; 2YI8 A; 2ZQM A; 4WFA V; 5K1X A; 1NTZ H; 3BA8 A; 2Q69 A; 1TAE A; 1AI6 A; 1COW G; 2X6C A; 2QKC A; 5KMG B; 1NI8 A; 4YHH O; 1VF6 C; 4OPA A; 3OTO B; 5LHH A; 1KU9 A; 3D8C A; 2VQF O; 2QR4 A; 3BPZ A; 1EZJ A; 3ZMS A; 4AIL C; 2IM9 A; 3ZMZ A; 4JI1 O; 2W0F C; 1O9G A; 3ABL B; 1YJN V; 2EIK C; 2LJ2 A; 3ZMT A; 4JI2 B; 2ZXW C; 1VMG A; 3SYQ A; 1P4R A; 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2PUS A; 1SS3 A; 4QPJ A; 5LGU A; 1KUQ A; 5L3F A; 4JAA A; 2PYL A; 3ABK C; 5LL6 Y; 2OT5 A; 4LNU B; 2XAS A; 2GUZ A; 3OGI B; 4R8C A; 1H2K A; 2EIN C; 4A5U B; 2Q4P A; 4KL1 A; 4DV4 O; 3ZHT A; 3BHP A; 3T1H O; 3KCY A; 3E89 A; 4KHP O; 4BR6 A; 2B9Z A; 1FXV A; 2Q9L A; 3CCR V; 3FB6 C; 1AJN A; 3KCX A; 2ADQ B; 4LFB O; 2GTS A; 1K3E A; 4JI8 O; 2HR3 A; 1HNZ O; 1GH6 A; 4IIJ A; 1ZLZ A; 2V4D A; 4AQY O; 3JAK B; 4RQF A; 3WG7 C; 1H2N A; 1FXK B; 1JX9 A; 4FFB B; 4PEL A; 5GTH Z; 1OCC B; 1AP5 A; 1OCZ C; 4JYY A; 5FPO A; 3UM7 A; 4QJF B; 4YIO A; 3K5N A; 3H1K H; 3SYO A; 3G6B A; 5J2U A; 4X64 O; 1JFF A; 1IBK B; 3DTU B; 2YIC A; 1D5N A; 3AK2 A; 2BSK B; 2ZR2 A; 2MK3 A; 4LF7 O; 1J5E B; 4MVS A; 3L71 H; 1G4Y B; 1BS3 A; 4I5S A; 2E5L O; 1QNM A; 1B6Q A; 1XUQ A; 4O4H B; 2WWW A; 5LHG A; 2Y69 B; 3F5T A; 2F95 B; 4LNU A; 2HEP A; 4PA3 A; 4IHJ A; 1HNW B; 4U3J A; 5LMU B; 3C3T A; 3SPH A; 1I08 A; 4NTW A; 2EJR A; 4YIP A; 2RQ6 A; 2XHB A; 1HNX B; 1NJI W; 2Y0P A; 1K92 A; 3ETQ A; 5E79 Z; 2QTO A; 2AHY A; 1UPG A; 4DV3 B; 3E8G A; 2MW2 B; 1SA0 B; 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