The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
88
|
structure length |
88
|
Chain Sequence |
MHHHHHHLVPRGSILKEVTSVVEQAWKLPESERKKIIRRLYLKWHPDKNPENHDIANEVFKHLQNEINRLEKQAFLDQNADRASRRTF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
KIAA0730 protein
|
| publication title |
Solution structure of DnaJ domain of human KIAA0730 protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| total genus |
15
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| structure length |
88
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| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2L6L A; 2QWO B; 1GH6 A; 2CTQ A; 2EJ7 A; 2GUZ B; 2LGW A; 4IT5 A; 1HDJ A; 2CTP A; 2DN9 A; 2CTR A; 2OCH A; 2KQX A; 2M6Y A; 2QWP B; 3UO3 A; 1IUR A; 3UO2 A; 2N05 A; 3APO A; 1WJZ A; 4RWU A; 3AG7 A; 4J80 A; 2DMX A; 2Y4U A; 1BQ0 A; 2LO1 A; 1N4C A; 2YS8 A; 2QWR B; 2PF4 E; 1FPO A; 3APQ A; 2N04 A; 2CTW A; 2YUA A; 2Y4T A; 1FAF A; 1NZ6 A; 2CUG A; 2QWN B; 2GUZ A; 1BQZ A; 4J7Z A; 1XBL A; 2QWQ B; 3UCS C; 3BVO A; 2QSA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4NKG B; 2QGN A; 3HB3 B; 1PD3 A; 5KHH A; 2Q6A A; 4DV1 B; 2X6A A; 3THO A; 4UCT A; 1H2G A; 1YTF D; 3W7W A; 2EIJ C; 1VQN V; 1MMM A; 4JAU A; 5GW7 A; 3KCY A; 2P22 C; 5BXZ A; 3E8B A; 2HEP A; 1AP5 A; 4B3T B; 4GKJ B; 1L8D A; 3CRR A; 5LGN A; 1FXK A; 1YSC A; 1RPO A; 2XTA A; 4UXN A; 1KU9 A; 3E8F A; 4FVM A; 2UU9 O; 4IIJ B; 2XOK G; 3CCE V; 2PF4 E; 2UXB O; 1R3I C; 1FFX A; 5C93 A; 2P4K A; 1OJH A; 4LFB O; 1EBO A; 2ZIM A; 3UCS C; 4DUY O; 5A2Q N; 2XUM A; 3FAV A; 4YJ3 B; 5IYC O; 1K4D C; 1JCH A; 4JTA B; 1TUB B; 2P4V A; 2QDO A; 4TV9 A; 4D7T A; 1ENV A; 4UB6 Z; 2OCC C; 3EFF K; 5CB4 A; 2HR3 A; 1QNM A; 2WWW A; 1N34 O; 3RGB A; 3GWK C; 5IJ9 B; 5J9P C; 3C90 A; 1URF A; 3CS5 A; 3RYF A; 2Y0I A; 2JIZ G; 4JZG A; 1IBK O; 2Q7H A; 1W2B U; 4WFE A; 3CCQ V; 2FKX A; 4DRX B; 1Q6I A; 1QU7 A; 2HKO A; 4FK5 C; 2R9R B; 3M99 B; 5IWA O; 4PI0 A; 3UO2 A; 4CH3 A; 4BR6 A; 1RP3 B; 3OR7 C; 1VIB A; 4UUJ C; 2X6B A; 2Y69 C; 1WLE A; 4QGP A; 2DYR B; 1N36 O; 1GM7 A; 1AIL A; 4J7J A; 3CRC A; 1GK9 A; 4Z1M G; 1MNG A; 2PI4 A; 1WP8 A; 2A7W A; 3A0B Z; 3OW2 U; 3U10 A; 2JVD A; 4QIW F; 3OUF A; 1F4N A; 5JJN B; 2WPD G; 3C3S A; 4O2A B; 4GZR B; 1NBM G; 3ETG A; 1TGO A; 1RSO A; 1W59 A; 3G67 A; 5EC1 C; 1Y74 A; 1EFR G; 3E22 A; 2X6C A; 4DV7 O; 1KC8 W; 1FXH A; 2QSA A; 4QNH B; 3OFN G; 4N21 A; 4IT5 A; 3JAM N; 5DN6 G; 2XAG A; 4DR5 O; 4TUY B; 1H8H G; 4L87 A; 5JQG A; 1FJG B; 1Z5W A; 2UXD O; 2VRZ A; 3CRA A; 3JD2 A; 3OEE G; 1R3L C; 5L3C A; 5LMU O; 4JI6 B; 3HKB B; 4R6Z A; 4H37 A; 1Q6H A; 4U3J A; 4X62 B; 1DGS A; 4PA9 A; 5FPR A; 4UV8 A; 2CE4 A; 3HKC A; 1MSD A; 4RUE A; 1VQ5 V; 1XMQ B; 3MHH C; 4I50 A; 1VEW A; 3B4S A; 3ETE A; 4O4I A; 5LOV B; 1JQ0 A; 4WFB V; 2AHY A; 2F4V B; 4DR4 B; 4DV1 O; 3D3Q A; 3I55 V; 2CTR A; 4RQF A; 1IDS A; 2B9Z A; 3CRQ A; 1TUE B; 3N2K A; 1XHZ A; 1F4M A; 3S3W A; 3PN1 A; 5J2T A; 3UKM A; 3TXQ A; 2IU3 A; 3CX5 F; 1BQZ A; 3F7Y C; 3OM3 B; 4WFG A; 4EEQ A; 2Q7E A; 5LYJ A; 4K3A A; 3P3P A; 5JWP A; 5L3E A; 3JSL A; 4GKJ O; 3CWB H; 2V4D A; 2HHH B; 1PKX A; 1A32 A; 4DR3 B; 3FKS G; 1QBZ A; 1XNQ O; 2V1D A; 4O4H A; 3VQY A; 2EIK B; 4WBN B; 2MK3 A; 4LF5 O; 5LHG A; 4X65 B; 1NVP B; 2B1G A; 2ZNJ A; 2HP8 A; 5KHJ A; 1I0H A; 4NTX A; 5LXT A; 1N0N A; 2CAZ C; 2WA3 A; 5L3B A; 3C3T A; 4BW5 A; 2FTK A; 5GON A; 1IXM A; 2K1E A; 4LF7 B; 4AQY B; 3E8G A; 1Q3E A; 3E8H A; 4CC5 A; 2RJZ A; 1BZK A; 1Y66 A; 5LP6 B; 4FLX A; 2A0L A; 3ZN1 A; 2Z0A A; 3BA9 A; 2AZ2 A; 3ZHQ A; 4K0K B; 2KQX A; 5EBW C; 5EZY A; 4DV4 B; 4YY3 B; 1VQP V; 4F4L A; 2NNU A; 2EIL C; 4U3F H; 2VQE B; 1B3Q A; 2QKA A; 3APQ A; 5FPO A; 4XDJ A; 5KA6 A; 4K8X A; 3J80 N; 1VF5 B; 4L8J A; 3DTU B; 5IT9 N; 3VQX A; 2Q68 A; 1VF6 A; 2YXH A; 2Q0O C; 4JV5 B; 2JGD A; 1RM1 C; 3H1H H; 3R66 A; 3M8A A; 3O65 A; 1Y4M A; 5B3S B; 4DV5 O; 1PNM A; 4RAI A; 2OYQ A; 5J2U A; 4RWU A; 1EN6 A; 4TOI A; 2IW5 A; 4NTW A; 3QO7 A; 2NLJ C; 2XAS A; 1J95 A; 4JI1 B; 5CA1 A; 3K08 A; 1ZX3 A; 2ZD9 A; 1CP9 A; 5JH7 B; 2OT5 A; 2LJ2 A; 4J41 A; 3WU2 Z; 2Q0A A; 4PJ0 Z; 1THZ A; 3T1C A; 2UUA B; 3K04 A; 1YXB A; 2UXN A; 3B09 A; 1PV0 A; 4PHZ A; 4LFC O; 4CH5 A; 2YEV A; 5BMV B; 5TIS Z; 1Q6U A; 5BY1 A; 4YHH B; 5FNV B; 1TVK A; 2A06 H; 2EBO A; 2E5L B; 4R7C A; 3TGU H; 4PA7 A; 1VQ7 V; 4CZZ A; 1VQ6 V; 4JYC A; 1NJI W; 3IAY A; 4U7O A; 3LUT B; 4OGQ B; 4X20 A; 3ZHU A; 1GN2 A; 1ZTE A; 1XRE A; 2FB5 A; 4EB6 B; 4HAM A; 4DYL A; 2F4V O; 2DQ0 A; 2WLL B; 4WF9 V; 1YF2 A; 3CCJ V; 2EIJ B; 2Q4P A; 1NT2 B; 2B1I A; 4DXW A; 1NH2 B; 3VOU A; 2OTJ V; 1X59 A; 3ZMU A; 1VF7 A; 2NR5 A; 4MTF A; 4Z1V A; 5IJ0 A; 3ABK C; 1YIT V; 1L1F A; 3ZMS A; 2VWJ A; 1JFF B; 1MZE A; 4CS2 A; 2IJH A; 3CCU V; 1HNX B; 3SYA A; 3N2G B; 4DR3 O; 3KKY A; 2HJF C; 1OCC C; 4KUM A; 2N05 A; 3ZRW A; 4UVA A; 4O4L B; 4PDL A; 5JVD A; 4G2K A; 1M93 A; 4XDL A; 3FFQ A; 4PV1 B; 1ORQ C; 2EJR A; 4HZ3 A; 3X2Q B; 3E86 A; 4K8Z A; 2RMK B; 5BZB A; 3SYC A; 3W7S A; 3W7X A; 2EIK C; 1O9H A; 2YSU B; 3SGI A; 3CMA V; 1FYJ A; 4DV3 O; 2Q8V A; 4JI0 B; 1OCR C; 2R9I A; 3CRM A; 3ZRX A; 3N2K B; 1GN3 A; 4KXR A; 4JAV A; 1BHA A; 4MVZ A; 4DUZ B; 4R8C A; 4BWA A; 5J2T B; 3CXC U; 4P30 A; 1S76 D; 4FZ1 A; 3FB5 C; 3K79 A; 3ZHT A; 2WLK A; 2DYS B; 2OIG A; 3JD3 A; 1ROP A; 3JAT A; 4K0K O; 1KD1 W; 4DV4 O; 1EZJ A; 3HPL C; 3BRC A; 2Y69 B; 1G6U A; 2C2A A; 3BAA A; 1VQL V; 2PYJ A; 2VQE O; 1V9P A; 1YTF B; 2JJ2 G; 2H8P C; 1QVG U; 1N33 B; 5EIB C; 4UCO A; 1FXK C; 3HKD B; 3AG1 C; 5IYZ A; 1XMO B; 1D2D A; 1YCI A; 4I0X B; 2LGW A; 4JV5 O; 3JAS B; 2JS3 A; 4LNU B; 4I9W A; 3ZHV A; 4I4T A; 1M57 C; 1R6N A; 2ZIN A; 3JD4 A; 5CBF A; 5LXT B; 4I55 B; 3I5D A; 4EKW A; 3K9A A; 3EVK A; 3K9S A; 2OWO A; 1VQ9 V; 2CTW A; 4X1I A; 1LUW A; 1I94 B; 1K3E A; 3P30 A; 1DLB A; 3K58 A; 3ABU A; 1AJP A; 4MTO A; 2LP7 A; 1IX9 A; 2RNB A; 1GTO A; 1SES A; 2RN9 A; 2Q9L A; 5LBQ A; 2UUA O; 1WNS A; 1WB8 A; 2WA4 A; 3L73 H; 3GWO A; 4TQF A; 3HR0 A; 1JVM A; 4RQE A; 1M4U A; 1XL4 A; 3BA8 A; 3Q4H A; 2PYL A; 4QE9 A; 2HVK C; 5DED A; 4FLT A; 2YIA A; 4MVQ A; 4PA3 A; 1SQQ H; 3JAK B; 3L72 H; 1KUQ A; 4J80 A; 4DW1 A; 4R50 A; 1Y76 A; 3AEI A; 3CCL V; 1XHX A; 3SJA C; 4OPH A; 1H2M A; 1WPX A; 4IYI A; 2ATK C; 1U97 A; 5IE9 A; 4NVP A; 2GV9 A; 4WFA V; 1QLE C; 3STZ C; 3RT3 C; 2ILM A; 4DV2 B; 3RYC A; 2ZE7 A; 2QM8 A; 2RDC A; 1QVF U; 2VS0 A; 1BGY H; 5EBM C; 1D5N A; 1IVS A; 3OTO B; 2YID A; 2EZP A; 1K8A W; 4UV9 A; 4LF6 B; 2R70 A; 4RUF A; 2IU0 A; 1HR0 B; 4TV8 B; 4MTG A; 4C7U A; 2YEV B; 2GTS A; 2H3O A; 3ZRV A; 4BIO A; 1Y67 A; 4O4J A; 1XQ8 A; 3RVZ A; 1JR9 A; 3CCR V; 4G27 B; 4I9Q A; 3K3W A; 3EHB B; 1FPO A; 4PD4 F; 3B8M A; 1ZAU A; 3CME V; 1XOU A; 2XAH A; 1SER A; 3RYH A; 4F6R A; 2ZE5 A; 4UCS A; 2GUZ B; 2EUL A; 4P2Z A; 3ZMV A; 1WPB A; 2JDI G; 1OCO C; 1XL6 A; 1SQF A; 2ZDI A; 4JI0 O; 3ZX6 A; 4TWK A; 3X2Q C; 3WFV A; 2F23 A; 4QPK A; 5LMN O; 1JJO A; 4DUZ O; 2CH7 A; 4FM2 A; 4J42 A; 5KMG B; 1Q86 W; 5IJ0 B; 2BSK A; 3KCX A; 2EIL B; 1UFI A; 3PJS K; 1WAZ A; 1H8E G; 2DYS C; 4DR2 B; 1VQM V; 5BR8 B; 4LWS B; 1N33 O; 1GM9 A; 1AI7 A; 1FFT B; 2XND G; 4ZHQ B; 4X1K A; 5KLV H; 5JVD B; 1RM1 B; 1MA1 A; 2OTL V; 3LDE A; 3LDC A; 4P9O A; 3H1L H; 3ZS8 C; 2E74 B; 4LF9 B; 2CTQ A; 1TAE A; 3K06 A; 2Y48 A; 1OV9 A; 1IBL B; 4ZOL A; 1KQS U; 1AB3 A; 1KMI Z; 2XAJ A; 4XBF A; 1H2N A; 3L9D A; 5ITZ B; 3AG7 A; 1EZV H; 1J5E O; 4UVC A; 1AJN A; 1SQX H; 1I94 O; 1ZLZ A; 4IHJ A; 2BOB C; 1FXV A; 2ETN A; 1P84 F; 3P32 A; 1M5I A; 2O57 A; 4PA4 A; 5B1N A; 1JX9 A; 1XNR O; 3FB6 C; 2ZQM A; 2ZNI A; 5LGT A; 4JI8 O; 4ICG A; 4OX9 B; 3L75 H; 1UPG A; 2FYU H; 4UCV A; 3IJ4 A; 3OUS A; 4FLY A; 4DR6 O; 3L74 H; 3OMA B; 1K7D A; 3F5W C; 3BCC H; 1YJN V; 2ITC C; 4UCR A; 2QWQ B; 1NR1 A; 1SET A; 2WLI A; 5GTI Z; 1W0K G; 2QTO A; 5CA0 B; 2YC0 A; 5JCO A; 4JPR A; 2DN9 A; 3DGE A; 5C8Y B; 3ZIA G; 1PPJ H; 1SA0 B; 5B5E Z; 1N4C A; 4GX1 A; 2HJD A; 3UM7 A; 3SYO A; 1VF6 C; 5FL7 G; 2AZ0 A; 1S0V A; 4FFB B; 3QF7 A; 1COW G; 2Q5Z A; 2QWN B; 3HKE B; 3QO8 A; 1M1K W; 4LF8 B; 1ZL8 B; 4BIZ A; 5IY5 C; 1NTM H; 1AR1 B; 4X64 B; 3VQV A; 2K9P A; 4LBE C; 2UUB B; 1XEQ A; 5KUM A; 4LFA B; 2Q7G A; 5B1B C; 5DEC A; 4DV2 O; 3ABK B; 5KHI A; 3JCU Z; 2V7Q G; 5H6Q A; 3OD4 A; 3LSU A; 4GCZ A; 2ZE8 A; 4GT1 A; 3OMN B; 2XAQ A; 2ZKO A; 4Z2W A; 5LGU A; 2LW7 A; 4LF6 O; 3JAW B; 5E79 Z; 4J7K A; 1OCC B; 3B8N A; 4GX5 A; 3F5T A; 4NXN B; 1JPX A; 3AK3 A; 4EFE A; 4KL1 A; 1WA8 A; 3UT5 A; 4B3T O; 4YJ2 B; 4X66 B; 4B3R B; 2QWP B; 3MHS C; 1YIJ V; 1Q43 A; 3CJH B; 1L0L H; 2KG7 B; 4QE7 A; 4KHP B; 2LW1 A; 3DXR A; 3WG7 B; 1HNZ B; 1K5Q A; 5LA6 B; 1XDC A; 5H5N A; 5KX5 A; 4JGS A; 4O2B B; 1OCR B; 2PTM A; 4X8A A; 1HDJ A; 4J11 A; 1YHQ V; 3ZN0 A; 3ICX A; 4DR7 B; 2EIN C; 2BTQ A; 1VP7 A; 1FS0 G; 3U0Z A; 4DR1 B; 3SPC A; 1NZ6 A; 2DE0 X; 2CGO A; 4I7Z B; 3KZI Z; 1AJQ A; 1N0J A; 3D36 A; 1N32 B; 3CYO A; 1P4R A; 1KBH A; 3UO3 A; 1Q81 W; 3M7M X; 2BCC H; 3OEH G; 1FXK B; 3K5O A; 3AG1 B; 2XAF A; 2GTA A; 3K5L A; 4ZI7 A; 4ZKI A; 1Q5O A; 5CBH A; 1M57 B; 1XBL A; 1FFX B; 4FJC C; 1IBL O; 1Q90 D; 1R1B A; 5H6R A; 3FAV B; 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4KHP O; 1LR1 A; 2IJI A; 1MSW D; 1GM8 A; 5IJ9 A; 3HKC B; 1SRY A; 3E83 A; 3CB2 A; 3FYE B; 1FAF A; 2Y4T A; 4GX0 A; 1OCO B; 2N74 A; 4I50 B; 2YIC A; 4DRX A; 4GKK B; 4X65 O; 4PA6 A; 4KP4 A; 1OHH G; 1SZT A; 3T1H B; 3JYC A; 3WG7 C; 2LFS A; 4O4I B; 5DM6 V; 4DR7 O; 2YI8 A; 2Q67 A; 4LH6 A; 1I08 A; 1QR9 A; 3ASN C; 2UU9 B; 4BIU A; 4LF7 O; 4AQY O; 3RFR A; 1SQP H; 4LFB B; 1GAX A; 1ARO P; 3G6B A; 3ASO B; 4DUY B; 1N32 O; 2JK5 C; 1PP9 H; 1MAB G; 4O2A A; 5LYJ B; 3QG5 A; 3S3X A; 1I7F A; 4YY3 O; 3UT5 B; 3CC4 V; 3BHP A; 2L35 A; 4YIP A; 1QCE A; 3DXR B; 4FLV A; 1M9N A; 1S3J A; 1BCC H; 1SC5 B; 1K92 A; 4O4H B; 1AI6 A; 4JYB A; 4DK1 A; 4TUY A; 3B2E E; 4E4E A; 1Z2G A; 3A0R A; 1T5E A; 1G1X B; 4IYH A; 5IWA B; 2YXL A; 3HKB A; 3QTC A; 3GB7 C; 4MVU A; 4JI7 O; 2F93 B; 5EK0 A; 5GON B; 1MZF A; 3L71 H; 2A3Q A; 5EC2 C; 5LHI A; 4LP8 A; 1V54 C; 4CBC A; 1VQO V; 2ZDI C; 4JI1 O; 1H2K A; 4B3S B; 5D5Q A; 2PUS A; 1NH2 D; 1R6K A; 3SYQ A; 1L0N H; 1QHT A; 2NN4 A; 4JI4 O; 2QE7 G; 3QVN A; 3N27 A; 5EZY B; 5LOV A; 5E1A C; 4CS4 A; 1V55 C; 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