The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
88
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structure length |
88
|
Chain Sequence |
MHHHHHHLVPRGSILKEVTSVVEQAWKLPESERKKIIRRLYLKWHPDKNPENHDIANEVFKHLQNEINRLEKQAFLDQNADRASRRTF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of DnaJ domain of human KIAA0730 protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
KIAA0730 protein
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| total genus |
15
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| structure length |
88
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| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2Y4U A; 1FAF A; 2PF4 E; 3BVO A; 2LGW A; 3AG7 A; 4J7Z A; 1IUR A; 2QSA A; 2EJ7 A; 2L6L A; 2QWP B; 2QWN B; 1XBL A; 2GUZ A; 2YS8 A; 4RWU A; 3UO2 A; 2CTW A; 1GH6 A; 1FPO A; 3APQ A; 2N04 A; 2QWR B; 2QWO B; 1WJZ A; 2CUG A; 1BQ0 A; 2Y4T A; 2CTQ A; 2KQX A; 4J80 A; 2YUA A; 2CTP A; 2N05 A; 2OCH A; 2QWQ B; 2LO1 A; 3UO3 A; 2DN9 A; 1BQZ A; 2M6Y A; 1N4C A; 2CTR A; 2GUZ B; 3APO A; 4IT5 A; 1NZ6 A; 3UCS C; 1HDJ A; 2DMX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4H0L B; 4AQY B; 2QTO A; 3CRR A; 4O4H A; 2Q8V A; 1NR1 A; 3K06 A; 2QKS A; 4F6R A; 4B3R O; 3ABM C; 2Y69 B; 1H2N A; 1B6Q A; 5IJ0 B; 2IJJ A; 1B04 A; 4FFB B; 4PA3 A; 2AW9 A; 1Y4M A; 2OWO A; 1N0N A; 1H2G A; 5B66 Z; 4XDK A; 3ZX6 A; 1TA8 A; 1IUR A; 4ZI7 A; 3S3W A; 2WAM A; 3C3T A; 4CS3 A; 4KUM A; 2UXX A; 1URF A; 3K04 A; 4UFZ A; 3E8G A; 3BAA A; 1LR1 A; 3ETQ A; 2P22 C; 2IU0 A; 3IC9 A; 4EKW A; 3HR0 A; 3K9A A; 1M93 A; 2VWJ A; 4LF8 B; 2LP7 A; 2QR4 A; 4IHJ A; 5IT9 N; 4O4I A; 1RPR A; 1F23 A; 4PEL A; 4IIJ B; 4DYL A; 3LSU A; 4ZOL A; 3VQV A; 2PI5 A; 3P3P A; 4FPP A; 1IXM A; 1M9N A; 3AG3 C; 3AG3 B; 1SA0 B; 3TXS A; 4BR6 A; 3OM3 B; 4AIL C; 2JGD A; 3CC2 V; 1T5E A; 5IE9 A; 5JJJ B; 3E35 A; 3CXH F; 4R50 A; 3UQ8 A; 4DV2 O; 4Z1M G; 4FFB A; 1BT8 A; 3E8H A; 1PL0 A; 1R3L C; 1SRY A; 1Q6H A; 1SKV A; 4UVA A; 3D3Q A; 5L3C A; 1W2B U; 2PYL A; 1VQ8 V; 4B08 A; 4JYY A; 2LFS A; 3OAA G; 4J10 A; 1SC5 B; 5LL6 Y; 1YIJ V; 3S3X A; 2OTJ V; 4JI3 B; 4DR7 B; 1K34 A; 5CA1 B; 1P7G A; 2ZNJ A; 3OTO B; 1GAX A; 4GX1 A; 3ETD A; 1VQ7 V; 5LGT A; 1SER A; 4B3T B; 2KB1 A; 1X59 A; 4ZIB A; 1MSD A; 4YJ2 B; 2QWN B; 2UXC B; 1XMQ B; 3SYP A; 1VF7 A; 1IBM B; 3QTC A; 4JI6 B; 3J7A U; 4QIW F; 1IDS A; 3JAS A; 4QPJ A; 3ABK C; 1QBZ A; 3U10 A; 4DV3 O; 3BY6 A; 4TV9 B; 1EFR G; 2P4K A; 2P7T C; 4F6R B; 4AI8 A; 2AHY A; 2WPD G; 4B3T O; 3JD0 A; 2R9R B; 1AR4 A; 1NJI W; 1IVS A; 2Y4T A; 4WFB V; 3N27 A; 4DO2 A; 2CK3 G; 2Y48 A; 2WA4 A; 3P3N A; 3KCX A; 2GDS A; 4DR4 B; 1F7Y A; 3T2M A; 3VOU A; 4X8A A; 4TT3 G; 4LF4 B; 5DED A; 1WP7 A; 4AHC A; 1G6U A; 2W0F C; 3CCR V; 4LF4 O; 1EBO A; 4PA7 A; 1KC8 W; 2UXN A; 1MG1 A; 3CRM A; 5KMG B; 2OCC B; 4O4I B; 3HB3 B; 3R65 A; 4X1Y B; 4GKJ O; 5JCO C; 4GYC B; 3K5N A; 4QE9 A; 5KUK A; 4GT1 A; 3B8N A; 2WWW A; 4GKK O; 2GSM B; 2JEU A; 1K73 W; 1AI5 A; 1E79 G; 1VQ9 V; 3CSX A; 5LBQ A; 1KBH A; 2PYJ A; 1VF5 B; 3MDS A; 5J9P C; 4LH7 A; 2Q0O C; 4YJ3 A; 2Z0A A; 1OCO C; 4W4K A; 1N36 O; 4X1I B; 2V1D A; 1NS1 A; 5FPR A; 4LF8 O; 1CPY A; 1N33 O; 3G6B A; 4KP4 A; 1G8M A; 3SPC A; 2GUZ B; 3CRA A; 2X6A A; 1Z5V A; 5HFL A; 5TIS Z; 3N2K B; 1NVP D; 4O4H B; 2Q6A A; 4DR2 B; 1VQK V; 5GON B; 1KB9 F; 1KP2 A; 2LFR A; 3AEI A; 3RYF B; 1GTO A; 5B1N A; 1D5A A; 4CC5 A; 2ITD C; 1AI4 A; 4Q6G A; 3JAT B; 1NR7 A; 1ZX3 A; 2F43 G; 2RDC A; 3TET A; 2FTK A; 4DR1 B; 1FXK C; 3H1J H; 1ZL8 A; 1BS3 A; 2F1M A; 4ABM A; 4J11 A; 1JQ0 A; 1R3I C; 4MVS A; 5J2U A; 4IGG A; 3ABM B; 2V7Q G; 1CXZ B; 2BOC C; 5A9G A; 4AQY O; 1JPX A; 2F4V O; 4JYA O; 2E74 B; 4LF9 O; 1KU9 A; 4U3F H; 4X62 B; 1S3J A; 5B1B C; 4FLY A; 4X66 O; 4MVQ A; 5DN6 G; 3E2E A; 1XL6 A; 1BMF G; 4JTC B; 2ZM6 B; 4EB6 A; 4FLT A; 1KUQ A; 4PDL A; 1N33 B; 4NXM B; 3IGA C; 2CUG A; 4R7C A; 2JIZ G; 4JAS A; 2P5O A; 3UO3 A; 3K03 A; 3HKB B; 3OMI B; 4B3S B; 2E5L B; 1RPO A; 1MNG A; 4R8C A; 3T1C A; 5CA0 B; 4GZR B; 2KSD A; 3J80 N; 2E5L O; 4KFM A; 1FJG B; 1HWY A; 4JI7 B; 4LFC O; 5B1O A; 3JAR A; 4NYK A; 5JVD A; 5GTI Z; 4LWS A; 1AP6 A; 2WSS G; 3CCU V; 1JA8 A; 1SQQ H; 3RBZ A; 1EN5 A; 1FXK A; 4I0X B; 3JAW B; 4UCS A; 2B1I A; 1G1X B; 4OPA A; 2BOB C; 5EBL C; 1JCH A; 5EC1 C; 3OUF A; 2JVD A; 2M7W A; 2IJH A; 3F5W C; 3CWB H; 3AK1 A; 4LF9 B; 2OCC C; 5KHJ A; 4JYA B; 4UXN A; 3ABU A; 4LR3 A; 1DF4 A; 4FLX A; 3LSQ A; 3ZHR A; 3ABT A; 2OYQ A; 4OGQ B; 3L72 H; 4TV9 A; 3ZHS A; 2JRI A; 3SR2 C; 1NH2 B; 4WFH A; 4LNU B; 1FFX A; 3D8C A; 1Z2G A; 3AG1 B; 3QO7 A; 4EB6 B; 4I7Z B; 4TV8 A; 3EFF K; 1WA8 A; 3JSL A; 3K9S A; 4ZHQ A; 1H2L A; 5HFM A; 2KG7 B; 2FL4 A; 4RWU A; 2UU9 B; 5C8Y A; 4X89 A; 5GW7 A; 3CPW U; 3ABK B; 5DM6 V; 4H13 B; 1VQO V; 3T4Z A; 2FYU H; 1OCZ C; 3RYH A; 4DR5 O; 2PTM A; 3HPL C; 2UUA O; 1SQF A; 5CA3 A; 1Q6I A; 2YC0 A; 5CA1 A; 3I55 V; 2EIL B; 4DV6 O; 2HEP A; 4GX5 A; 5JCO A; 2OT5 A; 4O2A A; 3JAL A; 5IY5 B; 1IZ3 A; 2XT9 A; 3ASO B; 3ASO C; 4BWA A; 1LUW A; 1TVK B; 1Q5O A; 1N34 B; 1XMO B; 4PA6 A; 3X2Q C; 3K57 A; 3JCZ A; 3CMA V; 2Y0I A; 5K1P A; 2D3O W; 2A06 H; 3SPG A; 2ZQM A; 5BMV A; 2KKW A; 1WAZ A; 4J9Y B; 5JWP A; 4X1K A; 4UV9 A; 1AB3 A; 2DYS C; 5CA0 A; 4TUY A; 1K8A W; 1AJP A; 2HHH O; 3JAM N; 1PD3 A; 4I50 B; 3K0G A; 4A5U B; 2ZXW C; 3RVY A; 2ZR3 A; 1YZB A; 1GK9 A; 5L3F A; 3H1H H; 3UCS C; 3TCU A; 4LC1 A; 3NR7 A; 3ZJZ A; 4JGS A; 4I4T A; 2JEX A; 3ZBH A; 1TUB B; 4DV0 O; 1L8D A; 2OIE A; 1PPJ H; 4FZ1 A; 4JAA A; 3AG2 C; 2N74 A; 4PD4 F; 2YUA A; 5JQG B; 1XL4 A; 1SQP H; 1XQ8 A; 4HAM A; 4L87 A; 4DV3 B; 3OMN B; 5KUM A; 5H6R A; 2R9I A; 4B3S O; 3CRC A; 3CME V; 4X1K B; 3E8B A; 2ETN A; 2QJ1 A; 5FLX N; 1IBM O; 3TGU H; 1XMQ O; 3JAT A; 3OGI B; 3QO8 A; 3CHX A; 1VQM V; 2UXC O; 2WLL B; 3K5L A; 2QWQ B; 2E76 B; 4MVU A; 3CXC U; 1GMG A; 4DV4 O; 1F4N A; 2CTR A; 1NZ6 A; 2HJD A; 3VQW A; 2Z3Y A; 1AI6 A; 2A0L A; 2PF4 E; 2FML A; 4HNA A; 4J7Z A; 4I55 B; 1AJQ A; 3ZIA G; 2Q0A A; 4U7O A; 2WLM A; 4B7E A; 2F4V B; 2Q68 A; 2YDE A; 3SPH A; 2Z5U A; 3OFN G; 3W7X A; 4B7K A; 1P49 A; 4ICG A; 4X1I A; 3FAV B; 1IBL B; 4JI0 B; 4NXN O; 3LSS A; 4YJ3 B; 1RP3 B; 1Y66 A; 3G6E V; 2B9Z A; 4LF6 O; 3L74 H; 3RT3 C; 2IW5 A; 3RYC A; 2HG5 C; 2YSU B; 4P30 A; 2P90 A; 4PJ0 Z; 2F23 A; 3IFX A; 1M5I A; 4CBC A; 3L73 H; 3TJT A; 3K59 A; 5LXT A; 4JI1 O; 2EIL C; 3ZMZ A; 4N23 A; 3ZRX A; 1N32 O; 2IJK A; 1ARO P; 5FNV A; 2IJI A; 2L6L A; 2DYR B; 1NU1 H; 1HNZ B; 3O9O A; 2XAS A; 3HKD A; 3WG7 B; 2QTS A; 1QQC A; 3X2Q B; 1R6N A; 1NTK H; 3SYA A; 5LHG A; 2Q73 A; 4PDR A; 2H8P C; 3IAY A; 4MS2 A; 2YI8 A; 4B3R B; 4TWK A; 1H8H G; 2AXT Z; 2K9P A; 1YVW A; 4RUE A; 2V4D A; 5KA6 A; 2YIA A; 2WLK A; 3AG1 C; 5CB4 B; 3OEH G; 2Q5Z A; 1YI2 V; 2RNB A; 1COW G; 1NKD A; 4QGP A; 1P84 F; 1XNQ O; 1QU7 A; 4UCU A; 1VEW A; 4LFB B; 2Y4U A; 3HKB A; 3M8A A; 3OD4 A; 2JS3 A; 2ARH A; 1WA8 B; 2UXD B; 3T1Y B; 4FZ0 A; 3CX5 F; 4H44 B; 1N0J A; 3L9D A; 4DV5 B; 3Q4H A; 4F6E A; 3E22 B; 1FD9 A; 3RVZ A; 2BCC H; 4DV1 O; 4MT8 A; 1QNM A; 3K3W A; 4K3A A; 5J2U B; 3G80 A; 1GO3 F; 1MZE A; 5CB4 A; 2WLH A; 4K35 A; 3O65 A; 4GX0 A; 3JAW A; 2ZR2 A; 4KHP B; 1H38 A; 3QG5 A; 4JZ2 A; 3EHB B; 2PUS A; 1WLE A; 1UPG A; 3D3I A; 1VQ5 V; 4C7U A; 3EXA A; 4U7N A; 1G4Y B; 3OMA B; 5CN0 A; 2EIN C; 3ZN0 A; 4FIP C; 4IYI A; 4Z2W A; 1K7D A; 4FLV A; 2QKC A; 5A2Q N; 4BIZ A; 2GV9 A; 2DQ3 A; 3FB6 C; 1XDC A; 5LP6 C; 3FD9 A; 5LYJ B; 1YJN V; 4KXR A; 1S5H C; 1XHZ A; 3ZMT A; 1NTZ H; 4PDM A; 3B40 A; 3BCC H; 2Q69 A; 1BQ0 A; 4JPR A; 4X65 B; 4K8Z A; 2ADQ B; 2DWD C; 1E1R G; 1MA1 A; 4IIJ A; 2DWE C; 1JR9 A; 5CMU A; 1N4C A; 3FB5 C; 1OCO B; 1U96 A; 2EZP A; 4GUN A; 2QE7 G; 1XUQ A; 4BIU A; 4K8X A; 3T1H O; 1ZWI C; 3GVM A; 5B1A B; 2Q67 A; 5GTH Z; 1Z5W A; 1M90 W; 4CH4 A; 3BA9 A; 4U3J A; 1ZTE A; 2P6J A; 4LF5 O; 4LF7 O; 4O2B B; 3ZHV A; 5LMN O; 2AZ2 A; 4YIP A; 1J95 A; 2WLN A; 1OHH G; 1OCC C; 5H6Q A; 2RMK B; 3B8M A; 3B09 A; 2HP8 A; 2UXB B; 4UVC A; 2IH3 C; 1QHT A; 3F7V C; 2NLJ C; 2KG7 A; 2NN4 A; 1NH2 D; 1OJH A; 3Q4H B; 5LGN A; 1L0N H; 3CCM V; 1BE3 H; 2ILM A; 2QM4 A; 5LXT B; 2KQX A; 2R9A A; 1XIL A; 2XAH A; 5EK0 A; 4I9Q A; 2PY5 A; 2DQ0 A; 2VQE O; 5H9C A; 5LYJ A; 4WFF A; 1K4D C; 3UM7 A; 2IM9 A; 5EC2 C; 5BY1 A; 1PNL A; 4JF3 A; 5KX5 A; 2E3C A; 3GB7 C; 3HKE B; 4YXW G; 4ASU G; 5EYP A; 3SDL A; 1I5Y A; 2N04 A; 2XND G; 5K1X A; 3I56 V; 4YJ2 A; 1W0K G; 2MK3 A; 1K97 A; 2EIK C; 4NTY A; 5J2T B; 3AK2 A; 4DW1 A; 3JYC A; 4K0K O; 2ZNI A; 5BR8 B; 1QLE B; 3LNM B; 3WG7 C; 4MVR A; 1AJN A; 1FXH A; 3PJS K; 3ZMV A; 2A9H A; 1Q90 D; 1TUB A; 5KHH A; 5D5P A; 5L3D A; 3HKD B; 5ITZ B; 1JVM A; 2BSK A; 2ZT9 B; 3E86 A; 3K58 A; 4DUZ O; 2DYS B; 3E22 A; 5E1A C; 3APO A; 2XAQ A; 2YEV B; 1QR9 A; 4O4J B; 3CJH A; 3UT5 B; 4BW5 A; 3IJ4 A; 2QSA A; 3RYI A; 3OUS A; 5LA6 A; 3RN4 A; 4JI8 O; 2LGQ A; 4G28 B; 1BSM A; 4PDV A; 2RN9 A; 3FFQ A; 1FYJ A; 3E89 A; 4MVZ A; 1ZL8 B; 1KMI Z; 4LCU C; 4LF7 B; 1CP9 A; 4LP8 A; 3W7T A; 3KZI Z; 1HR0 B; 1OV9 A; 4I4T B; 4D7S A; 2XOK G; 2AGA A; 1I7F A; 1FXV A; 4X20 B; 2QWR B; 1V9P A; 2JGU A; 2EIM B; 4YHH B; 2EIM C; 4RAI A; 4ZI7 B; 4FLZ A; 1DK1 A; 1Q6U A; 3ZHQ A; 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4MTO A; 1KEC A; 2F95 B; 2ZE8 A; 2EX3 A; 1EM1 A; 3ABL B; 3CB2 A; 4BW9 A; 4BAY A; 2M6Y A; 5H2F Z; 1YJW V; 3ZMU A; 2EJR A; 1HDJ A; 2MW2 B; 1PKX A; 2IU3 A; 4JTA B; 5KX5 B; 1QCE A; 3FB7 C; 2EIK B; 4WBN A; 2XHB A; 1DF5 A; 4MW3 A; 1N32 B; 4MW8 A; 4WCE V; 3QF7 A; 3NXS A; 4FLW A; 2N05 A; 1AIL A; 1QVG U; 1I94 O; 2FB5 A; 5IYZ A; 3I5D A; 1IXB A; 4FMT A; 4RUF A; 1JFF A; 4X65 O; 3ZRS A; 1GRJ A; 2ZKO A; 5LHH A; 3FYI B; 2F93 B; 2RCV A; 1MMM A; 5LOV B; 1SA0 A; 2DW4 A; 3FX7 A; 1R3K C; 2Q7G A; 3W7S A; 4D6T H; 4ZOL B; 4N21 A; 4MTX A; 1SQB H; 4O4L A; 2F66 C; 4JI0 O; 1IBL O; 3C3S A; 4JI5 B; 2DMX A; 4DV7 O; 1VF6 A; 3OR7 C; 4R6Z A; 1XEQ A; 3CRQ A; 3AG7 A; 4NTW A; 2WA3 A; 5GON A; 3SJA C; 4OPH A; 3KKY A; 3B4S A; 1THZ A; 4UCR A; 4W4L A; 3VQY A; 2D2C B; 1NI8 A; 4E2L A; 2R70 A; 1K92 A; 2Q7H A; 5LMU B; 3ZN1 A; 5KAF Z; 4DR3 B; 1I08 A; 1X4T A; 3LNN A; 2YIC A; 1RM1 C; 4P9P A; 1PP9 H; 1BGY H; 1GH6 A; 1BZK A; 3WU2 Z; 2QWO B; 3SYC A; 2Q4P A; 2W6J G; 3LDC A; 5LMN B; 1P4R A; 4J7J A; 4P2Z A; 3H9V A; 1XNR O; 2ZDI C; 3GWK C; 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