The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
b'MHHHHHHLVPRGSILKEVTSVVEQAWKLPESERKKIIRRLYLKWHPDKNPENHDIANEVFKHLQNEINRLEKQAFLDQNADRASRRTF'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
KIAA0730 protein
|
| publication title |
Solution structure of DnaJ domain of human KIAA0730 protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| total genus |
15
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| structure length |
88
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| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1N4C A; 2QWO B; 1XBL A; 2GUZ B; 1HDJ A; 2KQX A; 3UO2 A; 2CTQ A; 2DMX A; 1IUR A; 4J7Z A; 1FPO A; 2QWQ B; 2YUA A; 2CTP A; 2LGW A; 1BQ0 A; 2QWN B; 1WJZ A; 2Y4U A; 2Y4T A; 2DN9 A; 2L6L A; 4RWU A; 1BQZ A; 2CTR A; 2EJ7 A; 2QWR B; 2CTW A; 2YS8 A; 2N04 A; 3BVO A; 2M6Y A; 2PF4 E; 1GH6 A; 2N05 A; 2CUG A; 3UCS C; 2QSA A; 3UO3 A; 1NZ6 A; 2OCH A; 2QWP B; 2LO1 A; 3APQ A; 3APO A; 3AG7 A; 2GUZ A; 4J80 A; 1FAF A; 4IT5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DR5 B; 2DWD C; 2DMX A; 1AI5 A; 4JI7 O; 3I56 V; 3IC9 A; 3JYC A; 3T4D A; 3VQY A; 1NTZ H; 4DV7 O; 1VF7 A; 1DTO A; 1N0J A; 1UPG A; 2YXY A; 3N2K A; 3T2M A; 3H1I H; 4E4E A; 4MVQ A; 2JGU A; 4MW3 A; 1S5H C; 4JI8 B; 2Y0P A; 1B3Q A; 5KUM A; 2EBO A; 2F66 C; 3CMA V; 5LP6 A; 4U3J A; 1AJP A; 5H9C A; 5LBQ A; 2DQ3 A; 2CAZ C; 1VQ7 V; 4JV5 B; 3FB5 C; 1OCZ C; 4FM0 A; 3T1Y O; 1RPR A; 1A32 A; 5J9P C; 4KL1 A; 1AB3 A; 2H8P C; 5LMN B; 2F4V O; 4IYH A; 2JIZ G; 2Q7E A; 1NTK H; 1OV9 A; 2MK3 A; 2FYU H; 2WLH A; 3FAV A; 1IVS A; 1VMG A; 4FLU A; 4FLW A; 2P6J A; 1FFX B; 3OUS A; 5KHJ A; 3G80 A; 4FVM A; 2QKS A; 4NXN B; 4JAS A; 1Y76 A; 4L8J A; 3UT5 B; 3ABM C; 4DR7 O; 3SR2 C; 3KKY A; 3T1H B; 1K4D C; 4JPR A; 4XDJ A; 3LDD A; 1HDJ A; 4LF7 B; 1N36 O; 4X20 A; 4MTO A; 2JJ2 G; 1LNQ A; 4HNA A; 3K06 A; 3MAQ A; 2QWR B; 3JAR B; 5K1X A; 1K5S A; 2XOK G; 4QJF B; 2PGG A; 5IY5 B; 1AR4 A; 4PDM A; 1PPJ H; 4DV5 O; 4QE9 A; 2Q9L A; 4EFB A; 4O2B A; 3JAL B; 1V54 B; 4X1K B; 3HPL C; 5D5Q A; 3CB2 A; 1OCR C; 2Q8V A; 4MVS A; 1N33 O; 1WLE A; 1TUE B; 2ETN A; 2QKA A; 3BCC H; 2VS0 A; 1ZX3 A; 4W4L A; 1EN6 A; 4PDV A; 4BIO A; 1YI2 V; 2NNU A; 1N8R W; 2PYL A; 3ABK B; 1OHH G; 5FL7 G; 5FPR A; 3SJQ C; 1HR0 B; 2GTS A; 2CTQ A; 1K97 A; 1JJ2 U; 1V55 C; 4DV3 O; 3RYH B; 4U7N A; 1QVF U; 4DUY O; 3HKE A; 2ZE6 A; 1XMO B; 1KKD A; 1YJW V; 4OXS A; 1BCC H; 1Q82 W; 4B3R B; 2ZCE A; 3JCU Z; 3LSS A; 4DV4 O; 3G6E V; 1YF2 A; 3OUF A; 2LJ2 A; 3W7W A; 2KKW A; 4BW9 A; 5DED A; 5LGT A; 4LF5 O; 2IH1 C; 1BL8 A; 5J2T A; 4PHZ A; 5H2F Z; 2MW2 B; 2ITC C; 3QTC A; 1I5Y A; 3GB7 C; 2FTK A; 4DR1 O; 1F4M A; 1H38 A; 3UM7 A; 4DRX A; 5B66 Z; 3ZHS A; 3CRC A; 1YTF B; 4B3M B; 5A2Q N; 4WF9 V; 4JI1 B; 3QO7 A; 4LWS A; 2XT9 A; 1UJW B; 2EIN B; 4Q20 A; 4PJ0 Z; 1WPB A; 2ZXW C; 4TWK A; 4ZOL B; 4PEL A; 3TXQ A; 2QTO A; 1ROP A; 2VQE B; 2BCC H; 3E83 A; 4I7Z B; 1XBL A; 2D3O W; 5LOV B; 5IDJ A; 3L73 H; 1ZSP A; 2V4D A; 4FK5 C; 3E22 A; 4YJ2 A; 1E79 G; 3DGE A; 3RWR D; 4W4K A; 4AQY O; 2EZP A; 3ZRV A; 2ZE8 A; 1XHX A; 3RYI A; 1YCI A; 3K3W A; 2PTM A; 4D7T A; 3M7M X; 2FKX A; 4P2Z A; 1CP9 A; 3OAA G; 2VRZ A; 3HKC B; 2XAF A; 4J7J A; 4J10 A; 1F7Y A; 2ATK C; 1OCC C; 3OFN G; 1PNM A; 2EIK C; 3W7T A; 4LF8 O; 1NS1 A; 3U0Z A; 4Q6G A; 4B3T B; 2M6Y A; 4WBN B; 3JAK B; 3AG4 B; 3ZHQ A; 2V1D A; 3OGC C; 2JS5 A; 1OJH A; 5KX5 A; 2LW1 A; 4LFB B; 2UXD O; 1N32 O; 4MTF A; 5TIS Z; 1XQ8 A; 2WAM A; 5B3S B; 1HP8 A; 1GM8 A; 4J9Y B; 2RNB A; 3FD9 A; 2PZS A; 3H01 A; 2UU9 O; 4J7Z A; 2QWQ B; 4UCO A; 5GW7 A; 4UCV A; 1COW G; 1I5X A; 2Q0A A; 4WFA V; 4AI8 A; 1BS3 A; 2ZM6 B; 3WG7 B; 3RYF B; 3B09 A; 1AJN A; 4TSF G; 5LXT B; 1GH6 A; 2ZDI A; 5LYJ B; 3GWK C; 1ZLZ A; 3KG2 A; 2WSS G; 4I0X B; 4GT1 A; 3ZHU A; 3JAS B; 1R3L C; 2RN9 A; 3ZRX A; 5H5N A; 4LFC B; 2E5L B; 4LF6 O; 5H6Q A; 3AG2 C; 3WB0 A; 2RDC A; 3FB8 C; 3SPH A; 1F51 A; 4YJ3 B; 2F43 G; 4JZ2 A; 1Y66 A; 4P30 A; 2WLI B; 4JI6 B; 2UXB B; 2Y69 C; 1VQL V; 1SS3 A; 1YIT V; 3CRR A; 1SET A; 3KZI Z; 1RM1 C; 2AHY A; 1OCZ B; 3CE2 A; 5IY5 C; 2Q68 A; 3RFR A; 1BHB A; 1FFX A; 4H0L B; 3BHP A; 2YIC A; 3SPC A; 3UT5 A; 4X89 A; 2CUG A; 3CEI A; 1M56 C; 2OT5 A; 3ZIA G; 1VF6 C; 2DJV A; 5LMU O; 2X7R B; 4K0K O; 1IBK B; 1Q43 A; 4DV1 O; 3D3Q A; 3ABK C; 3ABM B; 2LFS A; 4AHC A; 4DV0 B; 1WB8 A; 3K03 A; 4DXW A; 3JAR A; 2KB1 A; 5CA0 B; 3EVK A; 3SDL A; 2GTA A; 5EIB D; 1JVM A; 4KUM A; 4DW1 A; 1Q90 D; 3DXR B; 4RQF A; 4IIJ B; 4GKK B; 3JAL A; 4X1K A; 1N34 B; 4JAU A; 4X64 O; 4HYO A; 1SA0 B; 2WLM A; 4JAA A; 3SJB C; 2QEX V; 3H1H H; 2CTR A; 4I9W A; 1IX9 A; 3ETE A; 1HNZ B; 3F7Y C; 3UO3 A; 3OTO O; 1OCR B; 1QLE C; 5HFL A; 5CBH A; 3D36 C; 2LQT A; 4NTW A; 2HG5 C; 4YIO A; 2VQF O; 2LGW A; 4CC6 A; 3CME V; 4RO2 A; 3RYH A; 3TET A; 3D3I A; 3BAB A; 3UKM A; 2QDO A; 2IJH A; 4UCT A; 4GX0 A; 1SKV A; 2PI4 A; 4DR6 O; 3K9A A; 4Z1V A; 4NR1 A; 3CCJ V; 5EC1 C; 1V55 B; 4K35 A; 4YY3 O; 5IYB O; 1DF4 A; 1AP6 A; 3RGB A; 2X6B A; 4JI7 B; 1FPO A; 4WFE A; 1TGO A; 3U10 A; 3T4Z A; 4YHH O; 3C90 A; 3JD0 A; 3CRA A; 1EN4 A; 4DV7 B; 4GKJ O; 2YXL A; 1H8H G; 5ITZ B; 1WB7 A; 3CRQ A; 5JVD B; 5B5E Z; 3K5N A; 3OM3 B; 3RBZ A; 2EIM C; 2BOB C; 2QWP B; 3J81 N; 1K7D A; 2IU0 A; 4GCZ A; 4NTY A; 4I5S A; 2CH7 B; 2RMK B; 3CCE V; 3ZJZ A; 2P5O A; 1Q8I A; 5CA1 B; 3LDC A; 1K3E A; 4G27 B; 3K9S A; 1QLN A; 2Q5Z A; 5J2U B; 4DR4 O; 3A0H Z; 5JQG B; 1PNK A; 4FZ1 A; 1BQZ A; 2JGD B; 3T1Y B; 4ZOL A; 2PF4 E; 3B8N A; 2A9H A; 4X62 O; 2F4V B; 3CRM A; 3AEI A; 4CS3 A; 2E3C A; 4P9P A; 3P30 A; 4JI5 B; 5LOV A; 4I9Q A; 2R72 A; 4I55 B; 2ZXW B; 3E8F A; 2IH3 C; 5CB4 B; 2E74 B; 4K8Z A; 2ILM A; 4UXN A; 1M1K W; 5KHI A; 3JAT A; 3VBB A; 1PD3 A; 1YDX A; 1K8A W; 1P4R A; 4KXR A; 1B6Q A; 3B77 A; 2HP8 A; 3BPZ A; 3E8B A; 3WFV A; 4DR7 B; 2PUS A; 3NXS A; 4JGS A; 5B1B C; 2ZR3 A; 1P49 A; 4NB5 A; 1QBZ A; 1YTF D; 3HKC A; 1DGS A; 5BMV B; 2JEU A; 3CCV V; 4PA7 A; 3UO2 A; 3OR6 C; 1FJG O; 5B3S C; 2A0L A; 2FL4 A; 2YIA A; 1N0N A; 4LF9 O; 4WFF A; 1J5E O; 4LC1 A; 1R3I C; 2X0L A; 4MVM A; 3JD4 A; 2R9I A; 2A7W A; 1J95 A; 3FYE B; 3LNN A; 2QJ1 A; 4WBN A; 3JAK A; 1OCC B; 4WFB V; 1FKA O; 1I0H A; 3WG7 C; 4FLV A; 2D2C B; 3EXA A; 4X1I B; 3UQ8 A; 2YXH A; 2PY5 A; 1Q6H A; 2ITD C; 2GSM B; 4BWA A; 1N33 B; 2LW7 A; 1H8E G; 4UVA A; 3L75 H; 4LF4 B; 1I7F A; 3HKB B; 4H33 A; 1SQG A; 5GTH Z; 2DE0 X; 5JCO C; 5LGU A; 4OX9 O; 3SYQ A; 4F4L A; 1JOY A; 5BR8 B; 3FB7 C; 4JTD B; 4DUY B; 2OIG A; 3RYF A; 2ZQM A; 4X66 O; 2EIL C; 5LXT A; 1K92 A; 4J42 A; 4UFZ A; 5LYJ A; 4PDL A; 4I0X A; 3W7U A; 1JQ0 A; 3JAS A; 4FZ0 A; 1QCE A; 3H1L H; 2P4V A; 2AXT Z; 2V7Q G; 1ZAU A; 4LF5 B; 1K5Q A; 4QPJ A; 3EFF K; 1AI7 A; 4YJ3 A; 3K0G A; 2EIJ C; 2EJ7 A; 3JSN A; 5FNV B; 1X4T A; 2WLI A; 3DC5 A; 5KUK A; 2Z5U A; 3X2Q C; 4MTX A; 4DK1 A; 3AG2 B; 4DR1 B; 4FJC C; 3ZRS A; 2OCC C; 1GAX A; 3ZHT A; 3WU2 Z; 3OMI B; 1R6N A; 4ZI7 B; 2Y69 B; 3LDE A; 2BTO A; 4QGP A; 5C93 A; 1Z2G A; 1RM1 B; 5C8Y B; 4DUZ B; 3BEH A; 1DLB A; 2UUC O; 4UCS A; 2G38 A; 5IYZ B; 2DYS C; 4MVU A; 4B08 A; 1H2M A; 1P7G A; 4DR3 O; 2HJF C; 1M56 B; 5CN0 A; 2B1I A; 1KKC A; 5CA0 A; 1VQN V; 4CC5 A; 1Z5W A; 4U3F H; 5HFM A; 1HNW O; 3DXR A; 1YJ9 V; 4IIJ A; 2P06 A; 1ZUQ A; 4K8X A; 1SA0 A; 4O4H B; 1NH2 B; 4K3A A; 3BAA A; 3ZHR A; 2CGN A; 3H9V A; 2OTJ V; 1NBM G; 2YS8 A; 5JH7 B; 3LNM B; 3AG3 C; 2YEV B; 2YC0 A; 4GX5 A; 4X65 O; 4G2K A; 3SYO A; 4UB6 Z; 1FD9 A; 5KHG A; 3SJC C; 4XBF A; 1NI8 A; 1N4C A; 4UCU A; 1S3J A; 2R9R B; 3BA9 A; 1P7B A; 3TGU H; 2HHH O; 2UXD B; 3ASN C; 3DSQ A; 3ZMV A; 4RQE A; 5DEC A; 4RWU A; 1L0L H; 2F23 A; 4DO2 A; 1XNQ O; 1QLE B; 3LSU A; 4J11 A; 4U7O A; 5L3C A; 4DV6 O; 3IFX A; 2UU9 B; 2ZNI A; 2WA4 A; 2RCV A; 3AK3 A; 1PP9 H; 4CH3 A; 1MNG A; 1I94 O; 1YJN V; 1SQX H; 1VQ4 V; 3STZ C; 1VQ9 V; 2Y4U A; 5ITZ A; 5JVD A; 4R7C A; 1NR7 A; 3M99 B; 2M7W A; 5JJJ B; 4WFG A; 4QPK A; 4NKG B; 3T1H O; 2XUM A; 2CH7 A; 5LA6 B; 1KMI Z; 3EHB B; 4LF7 O; 2WPD G; 1H2N A; 3ETD A; 1YHQ V; 5CA1 A; 4LF6 B; 4GUN A; 3VQV A; 4PV1 B; 4AIL C; 1SQF A; 3HKD B; 5J2U A; 4RAI A; 2EIM B; 5CBF A; 5JQG A; 4RUF A; 1YIJ V; 2JGD A; 1ZTE A; 4IGG A; 3BFR A; 3U11 A; 4BW5 A; 4MW8 A; 1Q81 W; 1CPY A; 3B8M A; 5KA6 A; 2B5U A; 4I55 A; 2QE7 G; 5CB4 A; 3ABT A; 4DV2 O; 1QVG U; 4PA9 A; 2W6I G; 1OCO C; 3OEE G; 2JEX A; 3IGA C; 3QO5 A; 4TT3 G; 1IBM O; 2CE4 A; 1AVM A; 4MVR A; 2YIB A; 3DC6 A; 4EB6 B; 3JCZ A; 3ZMT A; 4PI2 A; 5BMV A; 3O9O A; 5EBL C; 3ZED A; 1YSC A; 3FFQ A; 4I4T B; 5B1B B; 4CS2 A; 2UUB O; 3THO A; 2UXX A; 2KG7 B; 1ARO P; 1D5N A; 5IWA O; 3UCS C; 2WLL B; 2UUA O; 1XMQ O; 4H44 B; 1AI4 A; 1TVK B; 1BMF G; 2CGO A; 1E1Q G; 1NQT A; 1Q6I A; 1AIL A; 1XEQ A; 4X1I A; 4JI3 O; 1RP3 B; 1IZ3 A; 5KMG B; 1LUW A; 2BSK B; 4UB8 Z; 2NR5 A; 3E89 A; 5B1O A; 2HKO A; 4NXM B; 4KHP B; 4PI0 A; 5EBW C; 1YEW A; 5EYP B; 1M5I A; 1WP7 A; 5IE9 A; 5IYD O; 1EZV H; 1SZT A; 4UUJ C; 3HKB A; 1NZ6 A; 3OTO B; 4X9Q A; 4FLY A; 4EEQ A; 1RSO B; 2JK5 C; 2GUZ B; 2VQF B; 1L0N H; 3SYA A; 2IBZ H; 3A0B Z; 4GZR B; 3CCU V; 1AR5 A; 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5CBG A; 1QU7 A; 3ZHV A; 1KC8 W; 3PN1 A; 1NJI W; 3AG3 B; 5JJE B; 2E5L O; 1H2L A; 3HR0 A; 5DM6 V; 2Y4T A; 3OGI B; 3AK2 A; 2Q7H A; 1BSM A; 1WNS A; 4I50 B; 3D36 A; 5J2T B; 4WFH A; 2DW4 A; 3ABU A; 3LSQ A; 1L1F A; 1R73 A; 5EZY B; 5LGN A; 3CJH B; 1S0V A; 3ASN B; 5CMU A; 1Z5V A; 3JAW B; 1NH2 D; 3N2G B; 3TCU A; 3M8A A; 4O4L B; 1US6 A; 3BA8 A; 1WJZ A; 4J41 A; 1NR1 A; 1JCH A; 1URF A; 2IJI A; 2F95 B; 4X66 B; 3G6B A; 5EC2 C; 4JF3 A; 1MSD A; 5L3D A; 3QO8 A; 4JI0 O; 5LA6 A; 1DF5 A; 4O4I B; 1FAF A; 1V9P A; 1K34 A; 1M57 C; 1D5A A; 3OR7 C; 4CZZ A; 5LHG A; 2AZ0 A; 4DR2 O; 1JPX A; 3AG1 C; 1U96 A; 4ZKI A; 1FXK C; 3HKD A; 2UXC O; 3ABL B; 2XAG A; 4FLX A; 1PM9 A; 2R70 A; 1H2K A; 2Q69 A; 4CS4 A; 3OD4 A; 2AW9 A; 4LFA O; 1GTO A; 3FX7 A; 2ADP A; 4N21 A; 2OTL V; 3CD6 V; 4C7U A; 1Q3E A; 2JVD A; 1GK9 A; 3RW0 A; 1XL6 A; 3KCY A; 1N36 B; 1JFF B; 4O2A B; 2Z3Y A; 1W2B U; 2ZIM A; 2QTS A; 3W7S A; 3K58 A; 1SF9 A; 4FLT A; 2EZO A; 1SES A; 1S72 V; 4LCU C; 4E2L A; 5K1P A; 4PD4 F; 4UV8 A; 1SQQ H; 4FLZ A; 1HNX O; 4EB6 A; 1H2S B; 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