The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
88
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structure length |
88
|
Chain Sequence |
MHHHHHHLVPRGSILKEVTSVVEQAWKLPESERKKIIRRLYLKWHPDKNPENHDIANEVFKHLQNEINRLEKQAFLDQNADRASRRTF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of DnaJ domain of human KIAA0730 protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
KIAA0730 protein
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| total genus |
15
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| structure length |
88
|
| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3APQ A; 2QSA A; 2LO1 A; 2OCH A; 4J80 A; 1IUR A; 2DN9 A; 2CTQ A; 3APO A; 2CTP A; 2QWR B; 2YUA A; 1BQ0 A; 2M6Y A; 3UO2 A; 1FPO A; 2DMX A; 2LGW A; 2PF4 E; 2QWO B; 3BVO A; 1BQZ A; 2N05 A; 4RWU A; 2GUZ B; 1HDJ A; 1NZ6 A; 2QWQ B; 1WJZ A; 2CTR A; 2L6L A; 4J7Z A; 2N04 A; 2KQX A; 3UO3 A; 1N4C A; 2QWN B; 2Y4T A; 2YS8 A; 1GH6 A; 2QWP B; 4IT5 A; 3UCS C; 2CUG A; 2CTW A; 2Y4U A; 2EJ7 A; 3AG7 A; 1FAF A; 2GUZ A; 1XBL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3JCU Z; 1B6Q A; 5EK0 A; 3CCM V; 2C2A A; 3CCS V; 1FD9 A; 4JZ2 A; 2IH1 C; 1BQZ A; 3IGA C; 4I55 B; 5KHI A; 4X1K B; 2DJV A; 3OE7 G; 1SQX H; 2F66 C; 4U7O A; 3GWO A; 3LDE A; 1VF6 A; 1SET A; 2P67 A; 1OCZ B; 3T2M A; 3FB7 C; 4LNU B; 4ZOL B; 3VOU A; 3BFR A; 1TUE B; 4MW3 A; 3CC7 V; 5H5N A; 3MHS C; 4B7K A; 1XDC A; 1TGO A; 1IVS A; 3KCY A; 3QTC A; 2GSM B; 3IC9 A; 4JI1 B; 4BW5 A; 4OGQ B; 2XAH A; 2YXL A; 3EFF K; 1VQK V; 2BCC H; 3B77 A; 4BWA A; 5GON A; 2PYL A; 3K0G A; 2WPD G; 3D36 C; 1E1R G; 3IC7 A; 5BMV B; 3APQ A; 5C8Y A; 1K7D A; 4FZ0 A; 5KX5 B; 1NR1 A; 3E83 A; 1OJH A; 4FIP C; 4MTF A; 1ZL8 A; 5C8Y B; 5L3B A; 3RFR A; 1Q86 W; 4K8X A; 1Y74 B; 5LBQ A; 3VQX A; 2P90 A; 1E1Q G; 5CB4 A; 2WA4 A; 1SQB H; 2HVJ C; 1YDX A; 1V55 C; 3C3S A; 4LF6 O; 3B40 A; 2KSD A; 3CRC A; 3SJB C; 4L87 A; 4GX0 A; 3DGE A; 5LGU A; 4J9Y B; 3ZJZ A; 5L3G A; 3BEH A; 3FX7 A; 5CMU A; 4MVO A; 2PI5 A; 3NR7 A; 2A79 B; 3RVY A; 4AQY O; 4FLV A; 4G27 B; 4X65 O; 2ZNI A; 3OM3 B; 4E2L A; 4PA3 A; 2UUB B; 1KBH A; 1R3J C; 1MAB G; 2ZE5 A; 4GUN A; 1DGS A; 3CJH A; 1X59 A; 1Z5W A; 3E22 A; 3BCC H; 4B3T O; 3OUF A; 4LF5 B; 5EYP B; 2QDO A; 4R7C A; 3BRC A; 1JOY A; 4UV9 A; 2GHY A; 1HNW B; 1F51 A; 5J2U B; 4UCS A; 2HEP A; 5BXZ A; 4IHJ A; 4PDM A; 3H1J H; 2ZIM A; 5IDJ A; 1XIL A; 2VQE B; 1KKC A; 4WBN B; 1GN6 A; 4X62 B; 3D3Q A; 4IHJ B; 3UCS C; 3A0B Z; 4K3A A; 3CCE V; 3JSL A; 1BE3 H; 4BIU A; 2DE0 X; 4GKJ B; 3K5L A; 3CCU V; 4JYA O; 4O4L A; 1R3K C; 3T1Y O; 3BVO A; 5IJ9 A; 1OCR B; 2EIL C; 4RAI A; 2JGD A; 2RMK B; 4MVM A; 4NB5 A; 4DRX A; 2YXY A; 5DEC A; 1Q82 W; 2OIE A; 3J81 N; 2Y69 C; 1BL8 A; 4TQF A; 4DW0 A; 5LHG A; 1N34 B; 3DSQ A; 4OPH A; 1H8H G; 3L9D A; 2WLK A; 2Z0A A; 1S76 D; 1VF7 A; 3OD4 A; 2XAF A; 4Z1V A; 2BTQ A; 2DN9 A; 2YDE A; 4YY3 O; 1SC5 B; 2WLL B; 2ZM6 B; 2F1M A; 1BQ0 A; 4L8J A; 1NQT A; 4JI5 O; 2GUZ B; 3QNE A; 4O4H B; 2F23 A; 4I4T B; 2NNU A; 1GO3 F; 3D8C A; 5JH7 B; 4DUZ B; 1I5Y A; 3FB5 C; 4DR5 B; 1G8M A; 4LWS B; 2KG7 A; 1CP9 A; 3GWK C; 3BHP A; 3TK1 A; 4ZKI A; 3H9V A; 1YJ9 V; 3ASO C; 3ZCC A; 3ZRW B; 4FVM A; 1GM8 A; 3JYC A; 1KB9 F; 4DRX B; 3W7W A; 1MSD A; 3T1H O; 3FYI B; 4I5S A; 2V7Q G; 1L1F A; 1YF2 A; 4JI3 O; 1R1B A; 1K97 A; 2K9P A; 1M57 B; 5JJN B; 1WB7 A; 3ZMZ A; 1YHQ V; 1ZLZ A; 4PEL A; 1URF A; 1IBL B; 5B66 Z; 2YUA A; 1SER A; 3ZHV A; 1Y4M A; 1LR1 A; 3ABK B; 2V1D A; 2QM7 A; 4MS2 A; 4PDR A; 4JAV A; 3VQY A; 1VAR A; 4TUY A; 2OTL V; 3U11 A; 4PI2 A; 3I56 V; 2QA4 V; 4RQE A; 1K9M W; 2X0L A; 4JZG A; 2YEV B; 5BMV A; 3P3P A; 5L3F A; 4O2B B; 4WCE V; 4PV1 B; 4FLT A; 1BZK A; 1D5A A; 3ZRW A; 1KKD A; 2Q0O C; 4UVC A; 5CN0 A; 1HR0 O; 1KYO F; 4JI7 O; 1JQ0 A; 1SQF A; 3K0D A; 5CBH A; 4P2Z A; 2X6C A; 3S3X A; 2NLJ C; 1NBM G; 3A2F A; 3QVN A; 4AHC A; 4NKG B; 2IM9 A; 3FAV A; 3SYQ A; 4GT1 A; 3SPJ A; 1US6 A; 3P3N A; 4YJ3 A; 3CRR A; 3E22 B; 5CA1 A; 3OMN B; 3RN4 A; 5JWP A; 3ABT A; 4WFE A; 2D3O W; 1J95 A; 3OT7 A; 4FM1 A; 1VQP V; 2WLM A; 5B1A C; 3L71 H; 1MZF A; 2ZIO A; 5H9C A; 1YVW A; 4QIW F; 3JAM N; 1IBK B; 1O9H A; 2EIK C; 2B9Z A; 1IBK O; 2W6J G; 4WFH A; 2CTQ A; 3K04 A; 2AGA A; 5JQG B; 3ETD A; 3E35 A; 5CA0 B; 3RBZ A; 5KUM A; 2XHB A; 3CJH B; 2WLI B; 5LMU O; 1RPR A; 1KD1 W; 2R9I A; 4F6R A; 2R9R B; 2WLH A; 1V55 B; 4UVB A; 2MW2 B; 1QCE A; 5J2U A; 3HKC B; 1VQ8 V; 1K33 A; 4EFB A; 4XBF A; 1JX9 A; 4GZR B; 3CCL V; 4TWK A; 3ZMT A; 2EIJ B; 5B1B C; 5B3S B; 1S77 D; 4I50 B; 3SR2 C; 4JI7 B; 5AG2 A; 2WLL A; 1Q6U A; 1SES A; 4DW1 A; 1U97 A; 4O4H A; 2GUZ A; 5IYZ B; 2EIM B; 3JAL B; 4UCR A; 4UUJ C; 1XL4 A; 1AR1 B; 2ADP A; 2EUL A; 1KP3 A; 4H0L B; 2HLD G; 4F6R B; 5KHG A; 1VQ4 V; 3SJQ C; 3N2G A; 4HAM A; 1GH6 A; 2EIN C; 2ITD C; 3F7V C; 3AEI A; 4Q6G A; 4LFB B; 1S5J A; 3ZRX A; 2M7W A; 4X20 A; 1YCI A; 3QF7 A; 1FXV A; 5CBG A; 4TUY B; 4IYI A; 4OXS A; 1QLE C; 1HNX B; 1PM9 A; 3R65 A; 2M6Y A; 1DF5 A; 5KA6 A; 2ZKO A; 2QM8 A; 1SQP H; 3RYH A; 2YIB D; 2LJ2 A; 3SYA A; 1Q81 W; 3AG2 C; 1YIT V; 1N4C A; 2QWP B; 1OCO B; 4LF9 O; 1Q43 A; 2OIG A; 1K34 A; 2QKS A; 1XMO O; 4TV9 B; 2QTO A; 2ZM6 O; 1DLB A; 2XND G; 4NR1 A; 3WG7 C; 2IH3 C; 2OCC B; 3LDD A; 4TOI A; 4I9Q A; 2PY5 A; 2KKW A; 1Q5O A; 5KX5 A; 3ASN C; 1H2N A; 2HP8 A; 4X66 O; 1Y74 A; 3I55 V; 1U96 A; 1K5S A; 1K3E A; 2XAQ A; 3DC6 A; 3CME V; 5LXT A; 2WLI A; 2CUG A; 4DK0 A; 1HNZ B; 4JGS A; 4FM2 A; 2DYS C; 5EIB C; 1FFX B; 4JI6 B; 5JH7 A; 4DV4 O; 4KL1 A; 1VQO V; 4B3M O; 2QGN A; 3L72 H; 2PF4 E; 2RJZ A; 3WU2 Z; 4PDL A; 4PA4 A; 4B3R O; 1RM1 B; 3DXR A; 3RT3 C; 4O4L B; 4G2K A; 3JAW B; 4AQY B; 4JI5 B; 3CC4 V; 1NTM H; 1FYJ A; 2ATK C; 4PJ0 Z; 4X89 A; 2HHH B; 1KP2 A; 4QJF B; 3JAL A; 1QR9 A; 3SJA C; 2P7T C; 2AXT Z; 4X66 B; 2H8P C; 2Y0P A; 1I94 B; 3GB7 C; 2G38 A; 4KFM A; 3T1Y B; 4X64 B; 4R8C A; 1MSW D; 3T4D A; 3TET A; 2B1I A; 2ZR2 A; 1NS1 A; 2GTS A; 1NTK H; 2FML A; 2LGW A; 3BPZ A; 2LW1 A; 2A7W A; 4ICG A; 3AG3 C; 1WP7 A; 3TXS A; 4FLY A; 2WSS G; 5GTH Z; 2OWO A; 1Q6H A; 4PDV A; 4FPP A; 3UM7 A; 1HNX O; 4JI8 O; 3K9S A; 5JVD A; 1MZE A; 4O4I B; 4QE9 A; 5IJ0 A; 4A5U B; 4DUZ O; 4ZI7 A; 3WB2 A; 2AZ2 A; 5B1N A; 1AJP A; 1ARO P; 2UXX A; 4K35 A; 1R6K A; 1IXM A; 5C93 A; 5DM6 V; 1SQQ H; 3JAK A; 2DOS A; 1A32 A; 2CH7 B; 5IY5 B; 3K79 A; 2ODM A; 5LXT B; 5EC2 C; 4XDJ A; 1ZWI C; 2ZE8 A; 2F4V B; 2YI9 A; 3KKY A; 1VQ5 V; 2PZS A; 4P9P A; 3EVK A; 3MDS A; 3CPW U; 3RVZ A; 1GKF A; 4X20 B; 1IZ3 A; 1QLN A; 1M5I A; 2VS0 A; 2BOB C; 1LNQ A; 2EZO A; 2JEU A; 4MW8 A; 2E75 B; 4U7N A; 1AP5 A; 1S5H C; 4DR2 B; 4ZI7 B; 2CK3 G; 1WAZ A; 4DR3 O; 3FAV B; 3JD3 A; 2NN4 A; 4X9Q A; 3ZRV A; 1IBM B; 1WP8 A; 5LHI A; 1W0J G; 4DR6 B; 4D6T H; 1PKX A; 3FB6 C; 3E8B A; 5JCO A; 4ZIB A; 1IUR A; 3APO A; 3E2E A; 1S3J A; 1PL4 A; 4I0X B; 4B3T B; 1ZX3 A; 4B7E A; 4CZZ A; 2E76 B; 2GV9 A; 2PTM A; 3OEE G; 2A06 H; 4I50 A; 1X4T A; 1ZAU A; 1GTO A; 2HJD A; 2V4D A; 2F93 B; 1BHA A; 1MA1 A; 2ZNJ A; 5KAF Z; 3K06 A; 5D5P A; 1KEC A; 2FTK A; 4X62 O; 2E5L B; 1FXK B; 2Z5U A; 3JAW A; 3AK3 A; 3OMI B; 1Y67 A; 4UVA A; 4TV8 A; 5ITZ A; 2VQF B; 4G28 B; 2EIM C; 2IJH A; 4CS4 A; 3K03 A; 4QNH B; 3BY6 A; 4UB8 Z; 4RUE A; 4DR4 B; 4X65 B; 1BHB A; 5CA1 B; 3SJC C; 5KHH A; 4B3S B; 4J7Z A; 1WA8 A; 4LFC O; 1PL0 A; 4WF9 V; 5EBL C; 1THZ A; 3CE2 A; 4UCU A; 1LUV A; 3UT5 A; 1L0L H; 3ETG A; 4FLZ A; 3QO8 A; 3ABM C; 1G4Y B; 2RDC A; 1FS0 G; 1F4N A; 1JCH A; 2WLN A; 4NTW A; 5LOV A; 2DWD C; 1EM1 A; 2P4K A; 4U3J A; 3WG7 B; 1UFI A; 3T1H B; 3IFX A; 1M4U A; 2F4V O; 2PGG A; 3W7T A; 1OCZ C; 5FNV B; 4DR2 O; 5GTI Z; 2BTQ B; 5EIB D; 1UJW B; 4JI2 O; 1RSO B; 1LUW A; 2QWR B; 4TQD A; 4OX9 B; 4JI3 B; 3H1L H; 2UXC O; 3M8A A; 4DV7 B; 5KHJ A; 3STZ C; 1AB3 A; 3O9O A; 1DF4 A; 5A9G A; 1GN4 A; 4BW9 A; 4W4K A; 3CCJ V; 1HW7 A; 1AI6 A; 2ITC C; 3OR7 C; 4FZ1 A; 1XHZ A; 1KU9 A; 2A9H A; 3U10 A; 2Q7H A; 1Q7Y W; 4O2A A; 4AI8 A; 3VQW A; 1Q3E A; 1QR8 A; 2K1E A; 1SQV H; 4MVQ A; 1FFX A; 2Q68 A; 4X88 A; 2PYJ A; 3S3W A; 2ZR3 A; 3ABL C; 2RCV A; 4WFA V; 1L0N H; 2IU0 A; 1FAF A; 3D3I A; 3K58 A; 5HFL A; 1XL6 A; 4I4T A; 2BSK A; 2DQ0 A; 4CH6 A; 5BR8 B; 4F4L A; 1NH2 D; 4P9O A; 1YTF D; 2KG7 B; 1QVF U; 3AG3 B; 2CTR A; 2X7R B; 3OTO O; 4WBN A; 1I7F A; 4UV8 A; 3BA9 A; 4MVU A; 1YXB A; 4DK1 A; 3G80 A; 1WNS A; 2YID A; 4GKJ O; 3F5W C; 1XHX A; 2P22 C; 1M9N A; 5F2V O; 1OZ0 A; 1M1K W; 5KLV H; 3AG1 C; 2AW9 A; 4X64 O; 3THO A; 4KP4 A; 3CXH F; 1GM9 A; 3LUT B; 3JAS A; 2OTJ V; 4DV3 B; 3W7U A; 3CP1 A; 3UO3 A; 1K4D C; 2QWN B; 3CX5 F; 3JAS B; 4N23 A; 3L75 H; 4Q20 A; 4GCZ A; 3AG2 B; 4DR4 O; 2E5L O; 3LNM B; 4LFA B; 3E8F A; 4YJ3 B; 2P06 A; 4JYY A; 2P5O A; 3PJS K; 1VF5 B; 1JFF A; 5EC1 C; 1ORQ C; 2DYR C; 3JAR B; 3OTO B; 5IY5 C; 2A0L A; 2QKC A; 5LYJ A; 4LWS A; 4HBN A; 3OGC C; 4B3R B; 1AI4 A; 5D5Q A; 4NTY A; 3ABL B; 4X8A A; 4CH4 A; 4JI0 O; 3IAY A; 2LQT A; 1TVK B; 5JQG A; 1S0V A; 2DYR B; 3DC5 A; 2DMX A; 4LFA O; 3JAK B; 3OGI B; 1NZ6 A; 3SDL A; 5EBW C; 2HJF C; 3K57 A; 2FB5 A; 4LP8 A; 1NJI W; 1BGY H; 5BR8 O; 1PNM A; 3CRA A; 3SYC A; 3L74 H; 1K4C C; 3T1C A; 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2QWQ B; 4HYO A; 4YIP A; 3SYP A; 2AHY A; 2X6B A; 1P4R A; 4FLX A; 4JYC A; 5GON B; 1YJN V; 4QPK A; 1FKA O; 5IYZ A; 4Z1M G; 4PD4 F; 1OHH G; 3ABU A; 3HKB B; 2UUC B; 2JIZ G; 3P32 A; 1G1X B; 1XI1 A; 5DED A; 3N2K B; 1QBZ A; 5LGT A; 1QQC A; 3AG4 C; 2QM4 A; 3CB2 A; 1OCR C; 2EIL B; 4BIZ A; 4UXN A; 5LP6 B; 4YIO A; 4LNU A; 1SKV A; 5CB4 B; 4TV8 B; 2JK5 C; 1QVG U; 4LBE C; 5H6R A; 2FKX A; 4FM0 A; 2AHZ A; 1HNZ O; 2E74 B; 1N32 O; 2P4V A; 4DV2 O; 4JTD B; 5E1A C; 2EZP A; 2FL4 A; 2IJK A; 3WB0 A; 3FFQ A; 5KMG A; 1GN3 A; 4CH5 A; 2ZE6 A; 5LYJ B; 2YIB A; 1AR4 A; 4RQF A; 4DXW A; 1AVM A; 5B1A B; 4DV6 O; 4FFB B; 2ADQ B; 1H8E G; 2EIN B; 2JJ1 G; 4O2A B; 1ZL8 B; 2ZXW C; 4JAS A; 4MVS A; 4K0K B; 2W0F C; 4LFB O; 2H3O A; 4CBC A; 4NTX A; 1XNQ O; 3J7A U; 1TAE A; 3ZN1 A; 4DR3 B; 2LFS A; 2W6I G; 2GBO A; 5IT9 N; 1CXZ B; 4J80 A; 2JEX A; 4GYC B; 5JJE B; 4JV5 B; 3ZN0 A; 1M90 W; 1YEW A; 3B4S A; 2DYS B; 2WLJ A; 2ZCE A; 2JDI G; 1AR5 A; 3A0H Z; 1JVM A; 1SA0 A; 2BE3 A; 1AI7 A; 3A8T A; 4OX9 O; 3B8M A; 1KMI Z; 1B04 A; 5K1P A; 1GMG A; 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