The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
46
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structure length |
46
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Chain Sequence |
MDIFREIASSMKGENVFISPPSISSVLTILYYGANGSTAEQLSKYV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Viral protein
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| source organism |
Cowpox virus
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| publication title |
Crystal structure of viral serpin crmA provides insights into its mechanism of cysteine proteinase inhibition
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
Serine proteinase inhibitor 2
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| total genus |
15
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| structure length |
46
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| sequence length |
46
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-07-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix hairpin bin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1M93 A; 1JJO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5B1B B; 3E22 B; 1FS0 G; 2C2A A; 4JYY A; 4O4H B; 1MSW D; 1URF A; 3CJH A; 2MK3 A; 1VEW A; 3E35 A; 1T5E A; 5GON B; 4BW5 A; 4MW8 A; 5FNV A; 3BY6 A; 2WPD G; 2QGN A; 3JSN A; 2XOK G; 3K0D A; 4BIO A; 3SR2 C; 3CC2 V; 1HDJ A; 3ABT A; 1I08 A; 1AP5 A; 2YXH A; 5A9G A; 3ZN1 A; 3RN4 A; 4BIU A; 1BHA A; 4PEL A; 2PY5 A; 2DYS B; 2KG7 A; 1N4C A; 3SJC C; 1JPX A; 1H2S B; 1QR9 A; 3QO5 A; 3UO3 A; 3H1I H; 3MHH C; 4GX2 A; 2Q67 A; 3FYI B; 2XAJ A; 3STZ C; 3FB5 C; 4I7Z B; 1KKC A; 4QNH B; 5H2F Z; 2IU3 A; 1AJN A; 3OUF A; 2UUB O; 3HKE A; 1GH6 A; 4CZZ A; 2JGU A; 2ZDI A; 2UXD B; 4HYO A; 4U7O A; 3SYQ A; 3LDE A; 1XL6 A; 2NNU A; 4G27 B; 1ZL8 B; 2H3O A; 4JI3 B; 4DV7 O; 3N2G B; 3Q4H B; 4ZKI A; 5KUK A; 1EZV H; 4G2K A; 4F6R A; 5JH7 A; 4NVP A; 3ZN0 A; 2JIZ G; 3ZMV A; 2R9I A; 5BR8 O; 1XEQ A; 3K9A A; 5KAI Z; 1BHB A; 1IZ3 A; 4X62 B; 4EKW A; 1Y67 A; 2AZ2 A; 3H01 A; 1KMI Z; 5L3G A; 2HR3 A; 1XIL A; 1QHT A; 2YEV A; 2MW2 B; 4I4T A; 2CTP A; 2ZNJ A; 5J2T A; 1RM1 B; 1VQN V; 4RWU A; 1JCH A; 2E75 B; 4O4L A; 1G8M A; 3JD1 A; 3KG2 A; 1RPO A; 1NI8 A; 5FNV B; 5CA3 A; 1YCI A; 5IYD O; 4LF9 B; 3ABU A; 3MDS A; 2LO1 A; 1QLN A; 2W6J G; 4J11 A; 2X6B A; 2ATK C; 4KFM A; 3SJQ C; 3B8N A; 5LP6 C; 2YXL A; 3H1L H; 5JJN B; 1FXK A; 2KG7 B; 4PA6 A; 4OPA A; 4LCU C; 2PI4 A; 1O9G A; 5LGT A; 4AHC A; 5CMU A; 4BR6 A; 4MVS A; 3T1Y B; 4P9O A; 1R1B A; 3HKE B; 1BT8 A; 2ARH A; 2PYJ A; 1KKD A; 4DR6 B; 1B06 A; 1AI7 A; 2WLI A; 2UUC B; 1OCC C; 2E3C A; 1UFI A; 3LSQ A; 3IGA C; 3CSX A; 4MT8 A; 1JFF A; 3JYC A; 2OYQ A; 1IBM O; 3CX5 F; 1FXV A; 1RPR A; 1Z5W A; 2B9Z A; 1YSC A; 2CUG A; 4K3A A; 2P5O A; 3A2F A; 4F6R B; 3FFQ A; 5JH7 B; 3ZHR A; 2ZD9 A; 5K1X A; 3PJS K; 5LYJ A; 1ROP A; 1NJI W; 2ODM A; 4GX1 A; 4GX0 A; 4OGQ B; 3TXS A; 1M5I A; 3W7X A; 4X1K A; 2WLN A; 4Q6G A; 2VQE O; 2EIJ B; 4O2A A; 4TWK A; 4WF9 V; 2Y4U A; 4I4T B; 2UU9 B; 4KUM A; 1NTM H; 5L3C A; 4YHH B; 5J2T B; 1N0J A; 3ABK C; 4QIW F; 4O4L B; 3CC4 V; 4PDM A; 2YIA A; 1K5Q A; 1KC8 W; 3OMN B; 3FB7 C; 2YS8 A; 5LP6 A; 4FZ1 A; 1XUQ A; 1SQB H; 3RBZ A; 1FXK B; 4H33 A; 4QJF B; 5GW7 A; 3DSQ A; 4TSF G; 4P30 A; 3OR7 C; 2AZ0 A; 1FKA O; 4LFC B; 3ZCC A; 4DR2 B; 2L6L A; 3ABM B; 2X6A A; 2WLL A; 1YJW V; 1GK9 A; 1S5J A; 4QPK A; 3E8H A; 4PHZ A; 2WLI B; 3G80 A; 1BS3 A; 2DYR B; 4ASU G; 2BSK A; 3H1K H; 1RSO A; 1JFF B; 1US6 A; 1HWY A; 1P4R A; 2JJ1 G; 2UUB B; 2RN9 A; 1VQP V; 3CXC U; 1ENV A; 1KUQ A; 2F43 G; 3SDL A; 5K1P A; 1CPY A; 5CB4 A; 5LYJ B; 4JI2 O; 1I0H A; 5B1O A; 4UVB A; 1ZWI C; 1L8D A; 4B3R O; 4UVA A; 4X1K B; 4DV7 B; 1MZF A; 3KCY A; 4KHP O; 4O2A B; 3K9S A; 1IBL B; 1G1X B; 1S0V A; 4MTG A; 2HHH O; 1QQC A; 5BR8 B; 1GM8 A; 1VQ4 V; 1H8E G; 4PI2 A; 2QEX V; 1JQ0 A; 5AG2 A; 4JI6 B; 2EIN C; 5LP6 B; 4RO2 A; 3GVM A; 2QM7 A; 4X1Y A; 1WPB A; 5LGU A; 3GB7 C; 4JGS A; 1K4D C; 1FAF A; 1ZAU A; 1AR1 B; 1DGS A; 5CA1 B; 2KSD A; 4UCV A; 4J9Z B; 1TVK A; 4JI0 O; 4RAI A; 1OCC B; 2WLL B; 1GM9 A; 3J7A U; 3ICX A; 2VQF O; 2Q0A A; 4RUF A; 2AW9 A; 3HPL C; 4JAU A; 2BSK B; 4JTC B; 3E86 A; 3K5N A; 4LF8 O; 1SQX H; 4DV0 O; 1RSO B; 4FM2 A; 4B7E A; 1TGO A; 2E5L O; 3QF7 A; 3SJA C; 5B5E Z; 1SC5 B; 2Q6A A; 4LFA O; 2W0F C; 1K8A W; 4H37 A; 3JCU Z; 1JA8 A; 5CB4 B; 1K9M W; 4YY3 O; 2IH3 C; 2CGN A; 1IBM B; 2QKS A; 1Y74 A; 2LFS A; 5FPO A; 3OR6 C; 1XHZ A; 2YC0 A; 3CHX A; 3GWK C; 1FJG O; 1AR4 A; 5HFM A; 4XBF A; 3SPC A; 2VWJ A; 3JAT A; 4ABM A; 5GTI Z; 3CXH F; 1QCE A; 4HNA A; 2VQE B; 4L8J A; 3PN1 A; 1SQG A; 4P2Z A; 3ZRW A; 4RQE A; 1YI2 V; 1I5Y A; 4IYH A; 4X1Y B; 5LHG A; 4UB6 Z; 2ZNI A; 1LNQ A; 3A0H Z; 3CWB H; 3OEE G; 1YEW A; 4LH7 A; 1TVK B; 1B04 A; 3CCL V; 5IJ0 A; 1K97 A; 2DQ0 A; 1UJW B; 2QM8 A; 4OX9 O; 2WA4 A; 4PD4 F; 2Z3Y A; 2YIB A; 3RYI B; 1GMG A; 2N05 A; 3TK1 A; 1LUV A; 3BVO A; 3VQW A; 2QTO A; 3ZHV A; 3D3Q A; 5LMU O; 4D7S A; 3P32 A; 2Q73 A; 3B40 A; 1XNR O; 3K06 A; 4LF7 O; 3K5O A; 2OT5 A; 4IHJ A; 4LF4 O; 1RP3 B; 3MHS C; 4PA7 A; 3SYC A; 1Y74 B; 4K35 A; 1VQL V; 4CH5 A; 1KBH A; 1TUB A; 1NS1 A; 1KB9 F; 2IH1 C; 3JAR A; 3OAA G; 2ZR2 A; 3ASO C; 4JI2 B; 4PDL A; 2EJR A; 4PA3 A; 2EIN B; 2UXB O; 4DV3 B; 3JAT B; 4NTW A; 1YIT V; 2ZXW C; 4B3R B; 2DW4 A; 2RCV A; 4HNA B; 4KHP B; 1KP2 A; 3EHB B; 4KXR A; 3P3N A; 3ZRW B; 1NBM G; 3VBB A; 2QM4 A; 1XOU A; 2HHH B; 2X7R B; 3S3X A; 1P7G A; 4DR4 O; 2P4V A; 2F93 B; 2F95 B; 1N33 O; 5EBW C; 3ZS8 C; 5DEC A; 2D2C B; 2P67 A; 3CP1 A; 2EJ7 A; 2WLJ A; 3BAA A; 5IJ0 B; 1QBZ A; 5EIB C; 3AG2 C; 4CS4 A; 4I50 A; 3WG7 C; 4QPJ A; 3D3I A; 4X64 O; 1W0J G; 2IJI A; 1HW7 A; 1VQ9 V; 2X6C A; 1E1Q G; 1YVW A; 5CBF A; 4MVQ A; 1M1K W; 4IIJ A; 1EM1 A; 2VQF B; 4CS3 A; 2HVJ C; 3ETD A; 2ZKO A; 3M7M X; 5CBH A; 4LF8 B; 2DWE C; 4IHJ B; 5LHH A; 1JMK C; 5H6Q A; 1NTZ H; 4DV0 B; 2PI5 A; 1SA0 A; 2ILM A; 4JPR A; 4G28 B; 3T2M A; 4H0L B; 5JVD A; 2E5L B; 2A7W A; 2AHZ A; 4LFA B; 1TUB B; 2JVD A; 3H1H H; 3OD4 A; 4UCR A; 1PNK A; 3JAR B; 3N2K A; 4I0X B; 3GWO A; 4NTY A; 2IJH A; 1Y4M A; 2AGA A; 2BCC H; 5B1A B; 4YY3 B; 2V7Q G; 1M56 C; 3N2G A; 2PUS A; 3T4D A; 3VQV A; 3Q4H A; 2N04 A; 2UXN A; 3BHP A; 4N21 A; 4JTD B; 1SKV A; 2EX3 A; 4JI7 O; 4K8X A; 4LF6 B; 1FJG B; 5BXZ A; 2JK5 C; 1KD1 W; 1JJ2 U; 3WB1 A; 4JYA O; 4WFB V; 4FJC C; 1PD3 A; 2DOS A; 1G6U A; 1IXM A; 2FKX A; 3CYO A; 4FLZ A; 1YTF B; 1EN4 A; 4I50 B; 2A9H A; 3RVZ A; 3K5L A; 1IUR A; 4FIP C; 4UB8 Z; 5H5N A; 1QVF U; 2QWP B; 1K3E A; 4WFG A; 3R65 A; 1HNW O; 1S3J A; 1Y76 A; 2QJ1 A; 5JQG A; 1YJN V; 2W6I G; 2RQ6 A; 3THO A; 1DF5 A; 4IIJ B; 2EIL C; 1AVM A; 1AIL A; 4OX9 B; 1IX9 A; 1WJZ A; 1NTK H; 1OJH A; 3AG3 C; 2JRI A; 3UKM A; 3OMI B; 2YDE A; 1SA0 B; 5ITZ A; 1PNM A; 5JVD B; 4DV2 O; 2JEX A; 4JI5 O; 1F7Y A; 4CBC A; 5LMU B; 1JR9 A; 4ZI7 A; 1BL8 A; 1XNR B; 1KYO F; 4X20 A; 3K57 A; 3N2K B; 5EZY A; 4LF7 B; 3ZMS A; 1K73 W; 2ZXW B; 1OCO B; 1YZB A; 4LF4 B; 3WU2 Z; 3ETQ A; 1Q3E A; 3CCS V; 2CTW A; 2Q0O C; 1K34 A; 2JS5 A; 1D5N A; 1D5A A; 4J7Z A; 2P90 A; 1XNQ O; 2QWQ B; 3OUS A; 1R3I C; 3QO8 A; 1PNL A; 4YJ2 A; 3AG2 B; 4WFH A; 1PP9 H; 2OTL V; 4JYB A; 4MVM A; 2LW1 A; 3VOU A; 2EBO A; 3WG7 B; 3IC7 A; 1DLB A; 4YIO A; 2Y0P A; 3W7U A; 1K7D A; 3HKB B; 3AEI A; 2Y4T A; 1PKX A; 1N33 B; 4DR5 O; 2Y69 B; 1Y76 B; 2DE0 X; 5B3S C; 3FB8 C; 1IXB A; 5JQG B; 5TIS Z; 4CH4 A; 2WAM A; 1NKD A; 4H13 B; 5C8Y B; 1K5S A; 2HVK C; 2OCC B; 4JAA A; 4FLX A; 2IU0 A; 1HR0 O; 1OZ0 A; 3ZED A; 2H94 A; 4X64 B; 3G4S V; 5ITZ B; 2EIK B; 4KP4 A; 4Z1V A; 2NLJ C; 4Z2W A; 3EFF K; 1Q6I A; 2EIM C; 2XAS A; 4ZI7 B; 4X20 B; 5EZY B; 4HAM A; 3ZMZ A; 4MTO A; 4YJ3 B; 5LL6 Y; 4UXN A; 1M56 B; 5LBQ A; 4F4L A; 2CH7 A; 3AK1 A; 1JX9 A; 1ZX3 A; 2UXX A; 3OFN G; 3AK3 A; 1AI5 A; 5KHJ A; 1NR1 A; 3RWR D; 1GTO A; 1QU7 A; 1S72 V; 4YJ2 B; 5CA0 A; 4PV1 B; 2YIB D; 2AHY A; 4B08 A; 1XHX A; 4TV9 A; 1VF5 B; 2XAF A; 4JI7 B; 4LWS B; 5HFL A; 5IY5 C; 3OGI B; 1OCR C; 1MSD A; 4JYA B; 2Q5Z A; 5DN6 G; 2F4V B; 3SPG A; 4DK0 A; 3OTO O; 1R6K A; 3FAV A; 3AG3 B; 4CC6 A; 1CP9 A; 1H38 A; 1J5E O; 3ABL C; 1NR7 A; 2QTS A; 4MTX A; 1HNW B; 4UUJ C; 5CA1 A; 3TGU H; 1NH2 D; 3FD9 A; 4R50 A; 2WA3 A; 4E2L A; 3TET A; 2GTA A; 3HR0 A; 3A8T A; 3AG7 A; 4L87 A; 5J9P C; 3RYH A; 2HJD A; 2GTS A; 5LA6 A; 2R70 A; 1F4N A; 1BE3 H; 5IWA O; 2DWD C; 2YSU B; 1SQF A; 2CH7 B; 3L73 H; 4DV2 B; 1BQ0 A; 4JI5 B; 1E1R G; 1M90 W; 4ZIB A; 4PDR A; 4TQF A; 3MAQ A; 3UQ8 A; 4H44 B; 4GT1 A; 1GO3 F; 3CD6 V; 1P7B A; 4MVU A; 1S5L Z; 1Q86 W; 1XMO O; 3W7T A; 1JOY A; 2H8P C; 1EFR G; 1R3J C; 2WSS G; 1ORQ C; 2ITD C; 4JZ2 A; 4RUE A; 3T1C A; 5CA0 B; 4AQY O; 2YUA A; 1GN4 A; 4B3S O; 2VWK A; 1X59 A; 1MMM A; 4TV9 B; 2JJ2 G; 3E8G A; 1F4M A; 3U11 A; 3CCR V; 3K03 A; 5KLV H; 4F6E A; 1L0L H; 1Y6X A; 2ZT9 B; 1XNQ B; 4FLU A; 1WLE A; 4C7U A; 5B3S B; 5CN0 A; 2Y0I A; 4JI4 O; 3WFV A; 2LP7 A; 2XT9 A; 3OGC C; 4JI1 O; 3FAV B; 2QKC A; 2QKA A; 3DGE A; 2PZS A; 3RVY A; 4FZ0 A; 2A3Q A; 3K59 A; 3ETG A; 1R6N A; 2FTK A; 3K58 A; 1MZE A; 3F7V C; 2XTA A; 1MAB G; 4DV1 O; 1VQ6 V; 2WLK A; 3LNN A; 1N36 O; 5IJ9 A; 2AXT Z; 3DC5 A; 5DED A; 4LP8 A; 2LJ2 A; 1AP6 A; 2IW5 A; 4FVM A; 4NYK A; 3RYH B; 4B3M O; 5D5Q A; 1HR0 B; 5LA6 B; 5H6R A; 4O4I A; 3BPZ A; 4JAV A; 1IVS A; 3ZX6 A; 3RYI A; 3KCX A; 1AB3 A; 3CRR A; 4HBN A; 3WB0 A; 5EIB D; 3O65 A; 4PI0 A; 3H1J H; 4FMT A; 2ZQM A; 5F2V O; 3H9V A; 2ADP A; 5KMG A; 2OTJ V; 2QE7 G; 4X1I A; 5IYC O; 4CS2 A; 5JCO C; 1QR8 A; 2Q4P A; 3LDD A; 1NQT A; 3CMA V; 1BZK A; 2OCH A; 3OEH G; 1CXZ B; 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2P22 C; 5KHK A; 2FL4 A; 1NU1 H; 4JI1 B; 2QWO B; 4LFB O; 1HP8 A; 1W0K G; 1I5X A; 1FFX A; 3QVN A; 1NVP B; 4DK1 A; 4DV5 O; 2HLD G; 4IGG A; 2XHB A; 5KA6 A; 4K0K O; 2G38 A; 2CDY A; 1N36 B; 4LF9 O; 1YXB A; 4JI0 B; 5IYZ B; 1R3L C; 1QVG U; 5L3B A; 4MSW C; 3HKC A; 2B5U A; 3L74 H; 1VQ5 V; 3TJT A; 4B3M B; 4FLY A; 2WLH A; 4GZR B; 2BE3 A; 3CCV V; 2YXY A; 4FM1 A; 4NKG B; 1Q6U A; 1H2N A; 2P06 A; 4O4J A; 2HKO A; 4DYL A; 3CC7 V; 4EFB A; 4UCS A; 2GUZ A; 3QG5 A; 4YXW G; 4DR6 O; 4TV8 B; 1HNX O; 3K79 A; 3RFR A; 3E8B A; 3D8C A; 3HB3 B; 3RYC B; 3K04 A; 1B3Q A; 3QTC A; 1V54 B; 4B3T B; 3IC9 A; 3FKS G; 1FFT B; 3DC6 A; 4ZHQ A; 5BMV A; 2BOC C; 1KP3 A; 4MTF A; 4J9Y B; 3DXR A; 4BWA A; 5IDJ A; 3CCJ V; 1E79 G; 4W4K A; 4GUN A; 2ADQ B; 4DUZ B; 1K33 A; 1H8H G; 1ZLZ A; 3UCS C; 4IT5 A; 4U3J A; 1OV9 A; 3SYO A; 4K8Z A; 1FFX B; 3ZHU A; 3AG4 C; 2QDO A; 3AG1 C; 3RT3 C; 3D36 C; 1XMQ O; 3I5D A; 3U0Z A; 4J7K A; 1AI4 A; 4XDJ A; 4U7N A; 3HKB A; 3J80 N; 1WNS A; 2UXC B; 1K4C C; 2BOB C; 1GKF A; 4DV6 B; 1PL0 A; 2ETN A; 5EK0 A; 2UUA O; 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