The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
46
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structure length |
46
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Chain Sequence |
SEALKILNNIRTLRAQARECTLETLEEMLEKLEVVVNERREEESAA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Dna binding protein
|
| source organism |
Escherichia coli
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| publication title |
The H-NS dimerisation domain defines a new fold contributing to DNA recognition
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
DNA-binding protein H-NS
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| total genus |
16
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| structure length |
46
|
| sequence length |
46
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-12-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | H-NS histone-like proteins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NI8 A; 1LR1 A; 3NR7 A; 4ICG A; 1OV9 A; 2MW2 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4TUY B; 2CH7 A; 1S0V A; 5LYJ B; 4YHH O; 3ZX6 A; 3CE2 A; 3F7Y C; 5LHH A; 1EN4 A; 3OTO B; 3SPC A; 3VQY A; 5CBH A; 3CCU V; 1Q7Y W; 2LO1 A; 2YS8 A; 2YIA A; 3CEI A; 1OCC B; 4FK5 C; 3CRR A; 1LNQ A; 2ZE7 A; 2ZM6 O; 3RYC A; 1NJI W; 3IC7 A; 2AGA A; 1VF5 B; 4P9O A; 3JCZ A; 4DR7 B; 1H8H G; 3FKS G; 4JI6 O; 1BSM A; 1RM1 C; 1L0N H; 3L71 H; 4GX5 A; 5BR8 B; 1XQ8 A; 2ZXW C; 3FYI B; 2JK5 C; 1FXV A; 2Q9L A; 3VQV A; 5JQG A; 1Y4M A; 3FX7 A; 1RP3 B; 1NTK H; 5LGN A; 4DR3 B; 4HAM A; 5KUM A; 1OCR B; 3H1I H; 4J80 A; 2Z0A A; 1FFT B; 4MTX A; 1AP6 A; 4FPP A; 1UJW B; 1BZK A; 4MSW C; 3GB7 C; 3CP1 A; 1ENV A; 2DYR C; 5C8Y A; 2BTQ A; 2EIJ C; 4FLW A; 4BIZ A; 4ABM A; 4J10 A; 1EBO A; 2ZIM A; 1XMQ O; 1D5A A; 3A0R A; 2YDE A; 4MTO A; 1MG1 A; 4B7E A; 3ZHS A; 1HWY A; 3BAA A; 2A7W A; 3CJH A; 4O4H B; 2HJD A; 1AI4 A; 4AHC A; 5L3E A; 4ZBM A; 1F23 A; 2PYJ A; 2NN4 A; 2V4D A; 5LGU A; 1IDS A; 2QM7 A; 2WLL A; 2G38 A; 1G6U A; 1Z5V A; 4H44 B; 1VQ9 V; 1XIL A; 2GBO A; 4UFZ A; 5EC1 C; 1BGY H; 3BA9 A; 2LGW A; 3TK1 A; 2EJR A; 4AIL C; 2VQE B; 4X62 O; 4TQD A; 5LL6 Y; 3ABK C; 2OT5 A; 2UU9 O; 1SET A; 2C2A A; 2IW5 A; 2IH1 C; 4JI2 B; 2WLK A; 4GKJ O; 3F7V C; 2LFR A; 2P6J A; 3EXA A; 3R66 A; 1MSD A; 3L75 H; 3AG4 C; 3M7M X; 5EBM C; 2MK3 A; 1BT8 A; 1ZWI C; 5B66 Z; 2QTS A; 1R3K C; 3TXQ A; 3ICX A; 5ITZ B; 4KHP B; 4I7Z B; 4UXN A; 4UB6 Z; 3A2F A; 4EFE A; 4F6R B; 4I5S A; 4OGQ B; 1H2M A; 5F2V O; 3FAV A; 1GN4 A; 4K0K O; 5KHI A; 1XNQ O; 2HVK C; 1DF4 A; 4QPJ A; 3OEH G; 4QE7 A; 1F7Y A; 1JVM A; 5LOV B; 2E5L O; 4LF5 B; 2N05 A; 5DN6 G; 4R6Z A; 4CC5 A; 1BCC H; 3RYH B; 3CCQ V; 2O57 A; 4HNA A; 2YI8 A; 5EYP B; 1SC5 B; 1GN3 A; 2HR3 A; 1TUE B; 1HDJ A; 5LP6 B; 1SKV A; 3N2K A; 2Y69 C; 1M57 B; 1D5N A; 5L3C A; 4YY3 O; 2XAS A; 3CCL V; 4GX1 A; 1GN6 A; 2ZNI A; 2HFE C; 3G6E V; 4RAI A; 2EX3 A; 3T1Y B; 1NS1 A; 3RGB A; 1IBL B; 2VS0 A; 4WFG A; 3CCE V; 1S5H C; 3ZN0 A; 4PDL A; 3ZMS A; 4IL6 Z; 1SS3 A; 2FTK A; 1RPO A; 2DQ0 A; 3F5W C; 3JAM N; 2BCC H; 1R6N A; 5IDJ A; 1K92 A; 1XUQ A; 1N34 B; 4JI7 O; 3K9S A; 1VF7 A; 3W7T A; 4JV5 B; 2UXD O; 2CTW A; 1KC8 W; 4FIP C; 2YIC A; 4YHH B; 3SPH A; 1B3Q A; 1CPY A; 4FMT A; 3OMI B; 1NQT A; 2P7T C; 2R9R B; 1KUQ A; 4DV7 O; 4BAY A; 2X6A A; 1TUB A; 2E76 B; 2Q7H A; 3QO8 A; 1YIT V; 2ZM6 B; 1QCE A; 4QJF B; 1Q81 W; 3P3N A; 4O4L B; 2KSD A; 3E83 A; 3QF7 A; 1HNW O; 1M5I A; 2ZR2 A; 5KMG B; 4JI4 B; 2NR5 A; 2P4K A; 5CA3 A; 3LUT B; 3G67 A; 3X2Q C; 4JI6 B; 1B6Q A; 3JAK B; 4RWU A; 1I94 O; 5DED A; 5BY1 A; 3JD1 A; 1RSO B; 1N32 B; 4O4J A; 1MMM A; 1SQF A; 1URF A; 4FZ1 A; 1FD9 A; 1VQK V; 3ABU A; 4AI8 A; 4UV9 A; 1HNX O; 3A8T A; 3BEH A; 1JFF B; 2BE3 A; 5BMV A; 2GSM B; 3AG3 B; 4I50 B; 5JVD A; 4LF4 O; 1PL0 A; 1AI7 A; 2JGD A; 4CC6 A; 1YTF D; 1SQQ H; 3L72 H; 1OCC C; 5IWA O; 1XHX A; 3CME V; 3B2E E; 1VQ4 V; 1XNR O; 3N27 A; 3AK2 A; 3BRC A; 4K35 A; 1XMQ B; 2KG7 B; 4LNU A; 3CPW U; 1KKC A; 3IJ4 A; 1R73 A; 3OTO O; 3QO5 A; 5DM6 V; 2RNB A; 5KHH A; 1NH2 B; 3BAB A; 4QPK A; 5CB4 A; 3SJQ C; 4MW8 A; 1OCR C; 3UT5 B; 3JAS A; 2Z5U A; 4PA9 A; 1MNG A; 3SPJ A; 4B3T O; 1ARO P; 4JYB A; 1MOF A; 4JI1 O; 4FFB B; 1H2L A; 4LWS A; 4U7N A; 1GMG A; 3RYI B; 1X4T A; 4G27 B; 4X62 B; 1NVP B; 3OFN G; 5IY5 B; 1ORQ C; 4DR3 O; 4GKJ B; 4DUY B; 3G6B A; 2HHH O; 3JAR A; 3OW2 U; 4DV6 B; 2UXC O; 2UXB B; 4JTD B; 4JI5 O; 2GTS A; 5JH7 A; 2B5U A; 4GKK B; 3ZED A; 1VF6 C; 4X1I A; 4FVM A; 2ZIO A; 1IXB A; 2K9P A; 1F4M A; 1XBL A; 1WB7 A; 3JAW B; 1N36 O; 4JAU A; 4J9Y B; 1VQN V; 4CS3 A; 4CS4 A; 2CAZ C; 4K0K B; 4B3R O; 4B3S B; 3DC6 A; 4FLX A; 2LGQ A; 3ZRV A; 4CS2 A; 3L70 H; 3CCM V; 2GDS A; 5CA1 B; 4P9P A; 3BA8 A; 4RQE A; 4YJ3 B; 3OR6 C; 2OTJ V; 2QKC A; 1VQM V; 3ETG A; 5ITZ A; 3JAT B; 2E3C A; 3OUS A; 3HKB B; 5GTH Z; 3CX5 F; 1IZ3 A; 1EN6 A; 4JI8 B; 5CBG A; 2QWP B; 1H38 A; 3DC5 A; 5FNV B; 4PDV A; 3CS5 A; 4R7C A; 3E22 B; 4JYC A; 3LDC A; 1VMG A; 2N74 A; 4N23 A; 2X0L A; 1H2K A; 4X1Y A; 4YY3 B; 2WLI A; 2F95 B; 3DTU B; 3BCC H; 1GKF A; 1HW7 A; 1NVP D; 1BL8 A; 2XTA A; 4A5U B; 3DXR B; 1K4D C; 4UVA A; 5IYZ A; 4KHP O; 5IE9 A; 3KCY A; 3RYH A; 1GN2 A; 4EB6 A; 2XAF A; 3BPZ A; 4DO2 A; 1UPG A; 1ZL8 A; 3T4D A; 2PY5 A; 4D6T H; 4GX2 A; 3QTC A; 2BSK B; 4JAA A; 4LF9 B; 4JI7 B; 4DR6 B; 4TQF A; 3TJT A; 2UXD B; 5LP6 C; 5A9G A; 5B3S B; 2GUZ A; 1NU1 H; 3G4S V; 1AJN A; 1D2D A; 3ASN B; 2DOS A; 1CXZ B; 4IYH A; 1FXK B; 1M57 C; 1VIB A; 3MD0 A; 1K9M W; 2OTL V; 2XND G; 1KMI Z; 4TV8 A; 1QLE B; 2B1G A; 3A0B Z; 2EIL C; 3WG7 B; 3JYC A; 1OCO B; 3RWR D; 1WPX A; 2MW2 B; 5KA6 A; 4NTX A; 2ARH A; 5K1P A; 3FD9 A; 1PNL A; 2XUM A; 3K03 A; 5LXT B; 4YJ2 A; 4EEQ A; 2JRI A; 2QJ1 A; 4F4L A; 3K5N A; 2P4V A; 4DR4 B; 5J2T B; 4X89 A; 1SQG A; 3ABL B; 1GM8 A; 1I5X A; 2XAG A; 1I94 B; 2ZE5 A; 1UFI A; 1NT2 B; 1XRE A; 4G2K A; 4U7O A; 1FFX B; 4ZHQ B; 4I4T A; 1RPR A; 3ZRX A; 1WA8 B; 2QWN B; 3M99 B; 3ZRS A; 1KEC A; 4TSF G; 1Q5O A; 5FL7 G; 4NTW A; 1DF5 A; 3O65 A; 3ZMT A; 4MT8 A; 2YEV B; 1J5E B; 1HNX B; 3T1Y O; 1IBL O; 2IU3 A; 1QLN A; 2R70 A; 2AXT Z; 3HKE A; 3H1H H; 5IWA B; 5KMG A; 2KQX A; 1QR8 A; 1XNR B; 3JAK A; 2P67 A; 1N34 O; 3SGI A; 3P30 A; 4BIO A; 2HJF C; 4PA4 A; 4K3A A; 2Q69 A; 3JD2 A; 4I9W A; 5JJJ B; 4LR3 A; 5GON B; 1Z5W A; 4AQY O; 4IHJ B; 2A3Q A; 3N2G B; 3RYF A; 2CTR A; 3A0H Z; 2P90 A; 4O2B B; 1AB3 A; 1Q3E A; 2W0X A; 2AW9 A; 1V9P A; 5LA6 A; 4IYI A; 4DR1 B; 4Q6G A; 1SRY A; 4JPR A; 3VQW A; 1ZTE A; 3APQ A; 4DR2 O; 1KD1 W; 3AG3 C; 2WLN A; 4B3T B; 2LW1 A; 3IFX A; 5BZB A; 3J81 N; 4X65 B; 4JI4 O; 1MZE A; 3AG7 A; 4JI1 B; 4DV5 B; 2XHB A; 2IJI A; 1JPX A; 4UCV A; 2KG7 A; 2VQF B; 5KA5 A; 4X9Q A; 4JYA B; 1N32 O; 4DV2 B; 1O9G A; 2V1D A; 5IJ0 A; 5FPR A; 1GM9 A; 1WN7 A; 2X6B A; 1GAX A; 2JEX A; 4PD4 F; 3WU2 Z; 2HVJ C; 4IIJ B; 4FZ0 A; 3U11 A; 4IGG A; 2HHH B; 2F4V B; 2UXC B; 3U10 A; 3UT5 A; 1ZLZ A; 1OCZ B; 4NR1 A; 5EK0 A; 1K34 A; 4JI5 B; 4X66 O; 1EFR G; 4FFB A; 1VP7 A; 1M4U A; 2WAM A; 2DYS B; 1IUR A; 3VOU A; 3RYI A; 2Q6A A; 4X20 B; 3QNE A; 2ZR3 A; 4DUZ O; 3T1H O; 4Z2W A; 1N36 B; 2OIE A; 1PP9 H; 4GX0 A; 3OMA B; 4P30 A; 3LSQ A; 2H8P C; 1US6 A; 5IY5 C; 2ZD9 A; 4B3R B; 3JD0 A; 4JI3 O; 4NKG B; 5E1A C; 3HKC B; 2JIZ G; 4UCO A; 2A9H A; 3LDD A; 2RDC A; 5C93 A; 2OCH A; 3BHP A; 4Z1V A; 3ZRW B; 3IAY A; 1YJW V; 2Y4T A; 4MTG A; 5CBF A; 5HFL A; 3SYA A; 3NR7 A; 5B1N A; 1N33 O; 3K5L A; 4LF7 B; 2DQ3 A; 4DK1 A; 4J42 A; 5DEC A; 3JAW A; 2ZT9 B; 4UCR A; 4BW9 A; 1FPO A; 3QVN A; 4HZ3 A; 2Y0I A; 4DUY O; 1IBK B; 4DRX B; 1PNK A; 1OV9 A; 2FYU H; 1T5E A; 4DV6 O; 1S77 D; 1WLE A; 3AG2 B; 2UXB O; 3HKD B; 5CA1 A; 3OD4 A; 2EIK B; 4GKK O; 4LH7 A; 3JAT A; 3UO3 A; 4N21 A; 2JEU A; 1N4C A; 4GYC B; 4MVU A; 3D8C A; 1THZ A; 4WFE A; 2QKS A; 4KFM A; 5FLX N; 4B3S O; 3C90 A; 1HP8 A; 1P7B A; 4ICG A; 5E79 Z; 4IT5 A; 4X88 A; 3DSQ A; 3OEE G; 4OPH A; 4LP8 A; 3STZ C; 2W0F C; 3CYO A; 2DW4 A; 3HB3 B; 1F51 A; 2Z3Y A; 3FFQ A; 3LDE A; 1L0L H; 3Q4H A; 1L1F A; 3DXR A; 1FKA O; 3SPG A; 3FYE B; 5JJN B; 4PDR A; 4WFA V; 4DXW A; 4JI8 O; 1YF2 A; 4E4E A; 4B3M B; 4PI0 A; 2WLJ A; 4NTY A; 5EZY A; 2BSK A; 3L74 H; 1L8D A; 2EIN B; 2FL4 A; 4J7K A; 3IC9 A; 1MSW D; 5LBQ A; 4U3J B; 2WA3 A; 1SZX A; 5KX5 B; 3GVM A; 3RN4 A; 1BQZ A; 1R3L C; 3OGI B; 5B3S C; 4LFA B; 3OT7 A; 4PHZ A; 3K79 A; 1FXK C; 3RVZ A; 3ZJZ A; 1YXB A; 3ZMZ A; 4FLZ A; 1K5S A; 5LXT A; 4TOI A; 3WG7 C; 1OCO C; 2WLM A; 2A0L A; 5JJE B; 4I55 B; 1B04 A; 2QWO B; 1EZJ A; 4O2A A; 4X1K A; 3LNN A; 1AR1 B; 4LF9 O; 2B9Z A; 4DR6 O; 4NVP A; 3JAL B; 1FFX A; 3SYP A; 4ZHQ A; 2WLH A; 2ZQM A; 2RQ6 A; 4CH3 A; 3ABL C; 2ADQ B; 2DE0 X; 4QNH B; 3E2E A; 3STL C; 2EBO A; 5JWP A; 3WB0 A; 1CEZ A; 4JYY A; 4HBN A; 3FB6 C; 4AQY B; 1ZAU A; 2EJ7 A; 3THO A; 4B08 A; 1S72 V; 4J7J A; 2QWR B; 2VWK A; 4MW3 A; 3H9V A; 3SYO A; 4Q20 A; 2OYQ A; 5HFM A; 4DR2 B; 1TVK A; 2H3O A; 4WBN B; 4DR4 O; 4PEL A; 3RVY A; 1JA8 A; 4ZI7 B; 4J7Z A; 5AG2 A; 1YJ9 V; 4FM2 A; 1QU7 A; 4TUY A; 2QEX V; 2ZDI A; 3H1K H; 4X8A A; 1YCI A; 1G8M A; 5LYJ A; 5L3F A; 4FLV A; 2IJK A; 4E2L A; 3R65 A; 4PA7 A; 2ZDI C; 1COW G; 1WP8 A; 2CGO A; 5KAI Z; 2IJJ A; 3N2G A; 3CXC U; 1J5E O; 2HLD G; 3CCR V; 3K5M A; 3DGE A; 5A2Q N; 4RO2 A; 3ZIA G; 4BR6 A; 2F43 G; 2CH7 B; 2Q0A A; 2ZKO A; 1R6K A; 1YDX A; 2VWJ A; 1W0J G; 4X66 B; 1Q90 D; 3E8B A; 1EM1 A; 2YC0 A; 1EZV H; 1DTO A; 1K3E A; 1DK1 A; 3C3T A; 4GLX A; 2FML A; 4DUZ B; 1BHA A; 3RYC B; 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4DYL A; 4LFC O; 1GK9 A; 1BHB A; 1IBK O; 3CXH F; 5KHJ A; 4PV1 B; 1QR9 A; 1M90 W; 4I0X B; 1GTO A; 4NXM O; 5KHG A; 5LOV A; 5LHG A; 4DR5 O; 1SQB H; 3FAV B; 4TWK A; 2HEP A; 1AJP A; 5EYP A; 2JJ2 G; 2UUA B; 3CWB H; 5B1B B; 5LP6 A; 4CH6 A; 1PNM A; 5B5E Z; 4U3J A; 2PUS A; 2AZ2 A; 4FLU A; 1XDC A; 5KX5 A; 2CTP A; 4GUN A; 1QQC A; 4HNA B; 2ETN A; 3J7A U; 2QTO A; 1H2N A; 1M93 A; 3OUF A; 4LF6 O; 2CGN A; 1SQV H; 5JCO C; 1PV0 A; 2QWQ B; 3K5O A; 5IYD O; 3M8A A; 3FB7 C; 4B3M O; 2Y4U A; 3CB2 A; 2A06 H; 2Y0P A; 4R50 A; 4ZKI A; 2IJH A; 4WFF A; 4YIP A; 1AP5 A; 3JAL A; 4GCZ A; 2QE7 G; 3EHB B; 1WJZ A; 1IBM B; 1Q6H A; 1NZ6 A; 2DN9 A; 4LFA O; 1QNM A; 1M1K W; 1SQP H; 2CTQ A; 1P49 A; 3AEI A; 2BOB C; 1JJ2 U; 3TCU A; 4MVQ A; 2DWE C; 3E35 A; 1I0H A; 4O4L A; 3CMA V; 1RFY A; 4OX9 O; 1TA8 A; 4K8X A; 5IT9 N; 2WWW A; 3K06 A; 1WB8 A; 4MVM A; 1VEW A; 5KAF Z; 3D3I A; 3B8N A; 3SYC A; 5LMN B; 3ABM B; 3ZMV A; 1GH6 A; 1RSO A; 4DV4 O; 5H5N A; 3AG1 B; 2OCC B; 2LQT A; 2UUC B; 4X64 B; 3OE7 G; 2YIB A; 1JFF A; 1H2G A; 1G4Y B; 1Y6X A; 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