The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
70
|
structure length |
70
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Chain Sequence |
EEEELVDPLTTIREHCEQTEKCVKARERLELCDARVSSRSHTEEQCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNKLK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Electron Transfer by Domain Movement in Cytochrome Bc1
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
UBIQUINOL-CYTOCHROME-C REDUCTASE COMPLEX CORE PROTEIN I, MIT
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| total genus |
24
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| chains with identical sequence |
U
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-04-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1EZV H; 1SQP H; 1SQX H; 3L73 H; 2IBZ H; 3CWB H; 3L71 H; 3CXH F; 1SQB H; 1NTK H; 1L0N H; 1PPJ H; 1SQV H; 3H1L H; 1PP9 H; 1BGY H; 3CX5 F; 1BE3 H; 1NU1 H; 1P84 F; 3L72 H; 3H1I H; 3H1J H; 1KYO F; 3L75 H; 1SQQ H; 1L0L H; 1KB9 F; 3H1K H; 1NTM H; 3BCC H; 3L74 H; 3TGU H; 4PD4 F; 3H1H H; 5KLV H; 2A06 H; 2BCC H; 1NTZ H; 3L70 H; 4D6T H; 1BCC H; 2FYU H; 4U3F H; #chains in the Genus database with same CATH topology 4X1I B; 3PN1 A; 5KUM A; 5IJ0 B; 2P06 A; 2N74 A; 1YIJ V; 3M7M X; 1BS3 A; 2QWO B; 4MVZ A; 4LF7 B; 3CYO A; 1XMQ O; 3RYH B; 2QWN B; 3JAL A; 3JAW B; 3OUF A; 3SJA C; 4DR1 B; 2W0X A; 1BQ0 A; 1MA1 A; 4FFK A; 4TV9 A; 1HR0 O; 5KX5 B; 4ZOL A; 4MVO A; 4ABM A; 2IH1 C; 1S5L Z; 4YJ3 A; 2Q67 A; 3JSL A; 3AG4 B; 5JCO A; 1I94 B; 4OGQ B; 4F6R B; 3ZRW B; 1FXK A; 2D2C B; 3OFN G; 5FNV A; 2MW2 B; 3ASO C; 2DW4 A; 2Q7E A; 4JYY A; 2GHY A; 3HKC A; 1XHZ A; 3WB1 A; 3ABK B; 3K3W A; 4JI1 B; 2ZM6 O; 3D36 A; 1PPJ H; 1MMM A; 4N21 A; 4JAU A; 1AJN A; 5CB4 B; 3MD0 A; 1N33 O; 3JD4 A; 5IDJ A; 4XDL A; 1NTM H; 2IU3 A; 1RPR A; 2NNU A; 3JSN A; 4F4L A; 4X1Y A; 3HKE B; 1ZSP A; 4FIP C; 1M56 C; 4PA3 A; 1H2M A; 3TXS A; 2F93 B; 3AG4 C; 5BXZ A; 1Y67 A; 2GTA A; 2Q7H A; 2BOB C; 1V9P A; 2DJV A; 2HVJ C; 5LGT A; 2E75 B; 3SYQ A; 2FTK A; 3D3Q A; 5GTI Z; 2R70 A; 3UT5 A; 3WFV A; 2PI5 A; 1PV0 A; 1NR7 A; 1Y76 B; 2DN9 A; 4GKJ O; 4LNU A; 2YI8 A; 3TXQ A; 4IYI A; 1XL6 A; 3ABM B; 3CJH B; 4KL1 A; 4X65 O; 2H8P C; 3OE7 G; 3FX7 A; 4GX5 A; 4B3S B; 4I4T B; 2CTW A; 1J5E B; 4H13 B; 2A0L A; 5ITZ B; 1XMO O; 3CXH F; 4LF8 O; 2WLN A; 4FFB A; 1N34 O; 5B3S B; 1FFX A; 3CX5 F; 2Y0P A; 3HKB A; 5JH7 A; 3A0H Z; 3FKS G; 3CCM V; 1DTO A; 1OCZ B; 4QNH B; 1VQN V; 1KP2 A; 3BPZ A; 4HNA A; 4UCT A; 1VF7 A; 2QM7 A; 4DW0 A; 4YJ2 A; 3CRR A; 4U3F H; 5EZY B; 4JZG A; 5EK0 A; 2LO1 A; 5JQG B; 1K8A W; 4NXM B; 1I5Y A; 2ZE8 A; 3VOU A; 4ZI7 B; 5FL7 G; 4GKK B; 3UO3 A; 4YXW G; 2M7W A; 5J2T A; 3IC9 A; 5EBM C; 1RP3 B; 1VF6 A; 2K1E A; 4PI2 A; 1S5H C; 1QNM A; 2ZE5 A; 3H01 A; 3OGI B; 5EBL C; 2ZCE A; 3JYC A; 2VWJ A; 2QDO A; 2GBO A; 4WFE A; 1Y66 A; 2P4V A; 1K5Q A; 3B77 A; 2O57 A; 2DYS B; 5B1B B; 1QLN A; 4QE7 A; 3RYI B; 2XOK G; 1P4R A; 4PA6 A; 1Q90 D; 4PA7 A; 2WLJ A; 3F5W C; 4O4J B; 3FAV B; 1YTF B; 4TV8 A; 2IJK A; 4JI3 O; 5KA6 A; 1Q43 A; 4YY3 O; 2HG5 C; 1KP3 A; 4B3M O; 4LF9 B; 1FAF A; 1S77 D; 1D5A A; 1YJ9 V; 1YCI A; 1SF9 A; 2ZKO A; 1NQT A; 2HEP A; 2XAF A; 3B2E E; 1P7G A; 2P4K A; 1F4M A; 2CH7 B; 5LGU A; 3W7T A; 1PKX A; 1TUB A; 2YIA A; 4FZ1 A; 4O4I A; 5CBG A; 4MW3 A; 3LDC A; 3JD3 A; 1THZ A; 3RWR D; 1JFF B; 1URF A; 4BIU A; 2E74 B; 2EIM B; 2DYS C; 4L8J A; 1P49 A; 3G4S V; 1CPY A; 3JCZ A; 1YJN V; 3BCC H; 3JAK B; 4KUM A; 4F6E A; 2P90 A; 4O4H A; 2BOC C; 1WB8 A; 4DV5 B; 4GZR B; 1GN4 A; 2OIG A; 2LJ2 A; 1MNG A; 1XI1 A; 3BY6 A; 4GCZ A; 1SQB H; 1SQV H; 2OCH A; 1JOY A; 4U3J A; 2Q73 A; 1JA8 A; 1NT2 B; 3J7A U; 1BE3 H; 3THO A; 2PZS A; 4LF6 B; 1PNL A; 3L74 H; 2KKW A; 3OD4 A; 1QBZ A; 2DMX A; 3SR2 C; 4JI6 B; 4DR5 B; 4ZIB A; 2NR5 A; 3FB6 C; 2KG7 B; 1JVM A; 1N32 O; 3OTF A; 1F23 A; 5K1P A; 2UXC O; 3JAL B; 3K5N A; 4H0L B; 4PDM A; 4DUY O; 1LR1 A; 4NTW A; 2BTO A; 4JYA B; 3FB7 C; 5B1N A; 1OCC C; 1WA8 A; 5KAF Z; 1V54 B; 4LFC B; 4ZOL B; 4FLY A; 4LFB O; 1NTZ H; 1R3J C; 1VAR A; 1NVP D; 3MHS C; 2E3C A; 2VQF O; 4AHC A; 4RWU A; 3HB3 B; 1FXK B; 1MZF A; 2AHY A; 2Q68 A; 2EJR A; 5BR8 B; 5FNV B; 2RCV A; 3K0G A; 4MVR A; 4WCE V; 1LUW A; 2Q69 A; 3T2M A; 3ICX A; 3JAR A; 2EIK C; 2UUA B; 2UXX A; 5K1X A; 3HKC B; 3CXC U; 1HNZ B; 4X89 A; 4D7T A; 1I5X A; 4MVS A; 2OTL V; 2OWO A; 3DXR A; 2N05 A; 3ZHT A; 2HHH O; 1K97 A; 1GN3 A; 1Y4M A; 3WB2 A; 2HJF C; 3VBB A; 5JWP A; 1IXM A; 4J41 A; 1PP9 H; 4EB6 A; 1K92 A; 5BMV A; 2P5O A; 3KCX A; 4DR4 B; 4X1Y B; 1BL8 A; 3ZRW A; 3BHP A; 3SGI A; 4I5S A; 5B1A B; 4J7K A; 5JJN B; 1WPB A; 3RT3 C; 2EZO A; 1FXK C; 4RO2 A; 3CWB H; 3U10 A; 4YIP A; 5LGN A; 3UT5 B; 2Q6A A; 2PI4 A; 2CTR A; 2YXY A; 3OEE G; 2F4V B; 4IGG A; 1SC5 B; 2EJ7 A; 4JTD B; 5KA5 A; 5LYJ A; 4LNU B; 3CE2 A; 3CCS V; 1MAB G; 4OX9 B; 3H1K H; 3EVK A; 1VP7 A; 1VQL V; 1AR5 A; 3ZX6 A; 2AZ2 A; 1VQ5 V; 2W6I G; 4DR7 O; 4DK0 A; 4FFB B; 2RQ6 A; 4NYK A; 1FFX B; 3S3X A; 2JS5 A; 2ZXW C; 1N0J A; 1L0N H; 1KU9 A; 4B08 A; 3HKB B; 5LP6 C; 3ZHR A; 5JH7 B; 2ZDI C; 1P84 F; 3QNE A; 4HNA B; 4DV0 O; 2Y69 B; 5B1A C; 1CEZ A; 5JJJ B; 2H94 A; 2QTO A; 4YJ2 B; 1T5E A; 3ASN C; 2YS8 A; 1A32 A; 1Q6H A; 2X6B A; 2UXB B; 1QLE C; 4W4K A; 4GX0 A; 1R73 A; 1AVM A; 1H8E G; 4AIL C; 2UUB O; 1BHA A; 3GB7 C; 1H2K A; 2QEX V; 2OYQ A; 3F7Y C; 1H2L A; 1S76 D; 5J2T B; 2EIJ B; 2LGQ A; 2WLL B; 3QVN A; 1UFI A; 4FLW A; 1HW7 A; 3OMI B; 5IYB O; 3SYA A; 4UCV A; 1QU7 A; 3ABT A; 4ASU G; 4EEQ A; 1NTK H; 3ABL C; 3M99 B; 2ARH A; 1WLE A; 2XTA A; 4PV1 B; 1L0L H; 4ICG A; 4MT8 A; 2X6C A; 2W6J G; 3N2K A; 3LUT B; 5LBQ A; 1PM9 A; 3QO5 A; 1I7F A; 2UXD O; 4TV8 B; 3CC7 V; 1KD1 W; 2UU9 B; 4CS2 A; 2WA3 A; 1XHX A; 1N0N A; 1VF5 B; 1YZB A; 1P7B A; 3E35 A; 1PNM A; 4DR2 O; 3CCV V; 3CC4 V; 3NXS A; 2QSA A; 3NR7 A; 1TUB B; 4UFZ A; 1DF4 A; 4O4I B; 2EX3 A; 3WG7 C; 2QTS A; 2CK3 G; 4DV6 B; 3OT7 A; 4GUN A; 1D2D A; 4DV6 O; 4IYH A; 4QE9 A; 1YJW V; 1QR8 A; 4JV5 O; 4J42 A; 1ZUQ A; 3CME V; 3CCQ V; 1SET A; 4I9W A; 3X2Q B; 4MTX A; 5CN0 A; 4O4H B; 4FM2 A; 2B9Z A; 1KB9 F; 1RFY A; 2LFS A; 3K03 A; 3ZMZ A; 2OIE A; 5FPO A; 1RPO A; 4LF4 O; 4KXR A; 4LR3 A; 2HFE C; 4JYC A; 4UB8 Z; 3RYC A; 1YI2 V; 3QO8 A; 4I9Q A; 1B04 A; 2LW7 A; 5LMU O; 4DUZ B; 2WPD G; 2FKX A; 2QM4 A; 1HNW O; 2A06 H; 2F1M A; 4JI2 B; 4IL6 Z; 4JYB A; 4UB6 Z; 1AB3 A; 2X0L A; 3KG2 A; 1JJ2 U; 1MG1 A; 3E8H A; 4MTF A; 1ORQ C; 3UKM A; 1WNS A; 3AG3 C; 3P32 A; 1M57 C; 2IU0 A; 4LF5 O; 2ZD9 A; 2ZE6 A; 4MTO A; 2Z5U A; 3AG1 C; 4JGS A; 1WA8 B; 2Q9L A; 4DRX B; 3C90 A; 3HR0 A; 5IWA O; 4UCS A; 4NTX A; 1L8D A; 2BCC H; 3ASO B; 3OAA G; 5CMU A; 2YXH A; 4DYL A; 3CPW U; 1R6K A; 4JI8 O; 2DQ0 A; 4JAA A; 1EN4 A; 4PDV A; 4LP8 A; 4QGP A; 4JI7 O; 2ETN A; 1EZJ A; 4EFB A; 4PHZ A; 2YIB D; 3CMA V; 3JAR B; 2KB1 A; 1OCR C; 3VQW A; 5F2V O; 2QWR B; 2LQT A; 2KG7 A; 1XMQ B; 3N27 A; 3E22 A; 3SYP A; 4BIZ A; 3B40 A; 1LNQ A; 2XAS A; 3DXR B; 3UCS C; 4YIO A; 4WBN A; 4X66 O; 5KHI A; 1HR0 B; 1IX9 A; 1IZ3 A; 1YF2 A; 4H37 A; 2XAJ A; 1W2B U; 2IBZ H; 3R66 A; 3ZMV A; 4O2A A; 3BAA A; 3J81 N; 3JD2 A; 1M56 B; 4EB6 B; 2E5L O; 2PYL A; 3K5M A; 1XNR O; 1OV9 A; 2ZIO A; 5BMV B; 1FXV A; 3ZN0 A; 3JD1 A; 4PI0 A; 5DM6 V; 2LP7 A; 2JEU A; 4UV9 A; 4BW9 A; 3AG2 C; 2L35 A; 1VQP V; 4WFA V; 3OMA B; 1EN6 A; 2ZM6 B; 5LYJ B; 5IT9 N; 3A2F A; 1N33 B; 2JRI A; 3BFR A; 3CCR V; 2UUC O; 4TUY A; 3O9O A; 1DGS A; 2N04 A; 5B66 Z; 1Z5V A; 5LP6 A; 3OR6 C; 4JPR A; 4BAY A; 4TQD A; 4KHP B; 2ZDI A; 3KKY A; 4WFH A; 4DO2 A; 1H2S B; 4DV2 O; 3G71 V; 4KHP O; 3FYI B; 5IYC O; 4E2L A; 3VQX A; 1SZT A; 3I5D A; 2DWD C; 5IY5 C; 1OJH A; 1RM1 C; 4PA4 A; 2DE0 X; 1R1B A; 4DR3 O; 4BR6 A; 3ZRV A; 2ZNI A; 4GKJ B; 1RSO A; 5GTH Z; 4X65 B; 1TA8 A; 2UXN A; 5CA1 A; 2Q8V A; 3E8F A; 1EM1 A; 2PY5 A; 2Y4U A; 4H33 A; 2P67 A; 3F7V C; 1XMO B; 4LF8 B; 2M6Y A; 1N34 B; 1VQ8 V; 3CCE V; 2YC0 A; 4XDJ A; 3SJQ C; 2Y0I A; 4PA9 A; 4I0X A; 2WLH A; 2CE4 A; 1X4T A; 1M1K W; 2PUS A; 5CA3 A; 1XOU A; 1CP9 A; 3A0R A; 3AK3 A; 3Q4H A; 1U96 A; 3ZMU A; 1MSW D; 2A7W A; 2IW5 A; 3IC7 A; 3H1I H; 3N2K B; 5HFL A; 3CCU V; 1JPX A; 5GW7 A; 3T1H O; 5KLV H; 4AQY B; 3K5L A; 2LFR A; 2WLL A; 2WAM A; 2PTM A; 2IJH A; 4AQY O; 1UJW B; 1WP7 A; 1U97 A; 1K4D C; 3AK2 A; 1AP6 A; 3OM3 B; 2IJJ A; 5KUK A; 4R6Z A; 3L75 H; 2NLJ C; 4JI4 O; 3P3P A; 5KHJ A; 4MTG A; 5IE9 A; 1GN6 A; 4X64 O; 4J9Y B; 4B3T B; 2ATK C; 4FZ0 A; 1G8M A; 5EBW C; 4B3T O; 2XAG A; 4HZ3 A; 1GM7 A; 1WPX A; 4P2Z A; 4UCO A; 2OTJ V; 2QKS A; 3RVY A; 4JI3 B; 5IYZ A; 3I55 V; 3C3T A; 4YY3 B; 1FJG O; 3QTC A; 4B3M B; 2HP8 A; 2QE7 G; 4KFM A; 3ETE A; 4X62 O; 1H38 A; 3CCL V; 2F95 B; 5EIB D; 4LC1 A; 3U0Z A; 1SS3 A; 5C93 A; 4K35 A; 1LUV A; 4LBE C; 5GON B; 5IJ9 A; 3B4S A; 3CP1 A; 3RYC B; 4TQF A; 2CDY A; 3EFF K; 2WSS G; 5L3C A; 3CB2 A; 2DWE C; 5KMG B; 4AI8 A; 5FPR A; 3SYO A; 2YSU B; 3CHX A; 5CA0 A; 2EIN C; 4CH3 A; 2B5U A; 1VIB A; 4RAI A; 1TGO A; 4U7N A; 1VQ7 V; 3ZN1 A; 1OCC B; 2A79 B; 3SDL A; 1S5J A; 2YI9 A; 1XBL A; 3L73 H; 1X59 A; 3G6E V; 3W7S A; 4CH5 A; 3CRC A; 1Y6X A; 2Q4P A; 1KKD A; 3MHH C; 5LL6 Y; 3N2G A; 1M90 W; 4NVP A; 1GO3 F; 4IIJ A; 1GKF A; 2B1I A; 1SRY A; 1H2G A; 2R9R B; 3T4Z A; 2ZIN A; 2EIK B; 1OHH G; 1AI6 A; 1NZ6 A; 3APO A; 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1QVG U; 4MSW C; 4PD4 F; 2A3Q A; 4WFG A; 4J11 A; 2VQE O; 4A5U B; 5LOV A; 2GTS A; 3ZCC A; 2XND G; 3Q4H B; 4YHH O; 3IGA C; 3EHB B; 4GLX A; 1M4U A; 2CTP A; 3AK1 A; 2UUB B; 2Z0A A; 2HVK C; 2CUG A; 1SER A; 3IJ4 A; 2DYR B; 3JD0 A; 1IDS A; 1KBH A; 3AEI A; 1K33 A; 1E1Q G; 1R6T A; 1D5N A; 2CAZ C; 3K79 A; 3JAM N; 3WG7 B; 2WLI B; 1Q81 W; 1F51 A; 1VMG A; 4XBF A; 4FLT A; 2X7R B; 2GUZ A; 1S3J A; 1IUR A; 3DTU B; 1KC8 W; 3RGB A; 5TIS Z; 4NR1 A; 4BW5 A; 2B1G A; 4DV7 O; 1XNQ O; 2QJ1 A; 1SKV A; 1QCE A; 3QG5 A; 3UO2 A; 2UXD B; 2PYJ A; 1IBL O; 4K0K O; 5IYZ B; 1AR4 A; 2DYR C; 3JAT A; 3H1L H; 4U7O A; 5J2U A; 1Q86 W; 4J80 A; 1R6N A; 1F7Y A; 1YDX A; 3G6B A; 4DR2 B; 3ETQ A; 3ZHQ A; 5IJ9 B; 1K4C C; 4D7S A; 1BCC H; 2L6L A; 2QR4 A; 3K59 A; 4JV5 B; 2ZE7 A; 1GN2 A; 2ITD C; 1AP5 A; 5CA0 B; 1OCO C; 3AG3 B; 1M57 B; 2QWP B; 4TSF G; 1BZK A; 1NU1 H; 1Q7Y W; 3AG1 B; 3ZRX A; 4CC6 A; 1QQC A; 4PEL A; 3TGU H; 2AXT Z; 4DXW A; 2FB5 A; 1AJQ A; 2HLD G; 1ZWI C; 4LF4 B; 1H8H G; 2WLM A; 4TT3 G; 5L3B A; 4RQE A; 3N2G B; 5GON A; 4NTY A; 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