The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
|
sequence length |
70
|
structure length |
70
|
Chain Sequence |
EEEELVDPLTTIREHCEQTEKCVKARERLELCDARVSSRSHTEEQCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNKLK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
UBIQUINOL-CYTOCHROME-C REDUCTASE COMPLEX CORE PROTEIN I, MIT
|
| publication title |
Electron Transfer by Domain Movement in Cytochrome Bc1
pubmed rcsb |
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| total genus |
24
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| chains with identical sequence |
U
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-04-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3H1L H; 2IBZ H; 3L75 H; 1BE3 H; 1EZV H; 1BGY H; 1NTM H; 3L71 H; 3CXH F; 1PPJ H; 1L0N H; 1L0L H; 1SQX H; 3H1I H; 3L74 H; 1P84 F; 1SQB H; 1KYO F; 1SQP H; 4PD4 F; 1SQV H; 3CX5 F; 3L73 H; 3CWB H; 4U3F H; 1NTK H; 2A06 H; 3L70 H; 3TGU H; 1KB9 F; 1SQQ H; 2FYU H; 3BCC H; 4D6T H; 3H1J H; 3H1H H; 1BCC H; 1NTZ H; 5KLV H; 3H1K H; 2BCC H; 3L72 H; 1PP9 H; 1NU1 H; #chains in the Genus database with same CATH topology 2PY5 A; 4DR3 B; 3APQ A; 3TJT A; 2YIB D; 4MVR A; 3HKB A; 1Y6X A; 2K9P A; 3MD0 A; 3F5W C; 4DV6 O; 1GN4 A; 4YJ2 B; 2FL4 A; 1JOY A; 5JVD B; 1O9H A; 2OT5 A; 1J5E O; 1N36 B; 2P06 A; 4LF7 B; 3DXR B; 4MS2 A; 4LF6 B; 4GLX A; 4OPA A; 1Q43 A; 4OX9 B; 2EBO A; 1SF9 A; 4ZHQ B; 4AIL C; 3RWR D; 3SGI A; 3RYI A; 5B3S C; 1CPY A; 2HVJ C; 4WBN B; 3ABK C; 1LR1 A; 4FMT A; 3ASN B; 3FKS G; 4UCS A; 4RO2 A; 2JGD B; 3LNN A; 1PNK A; 3DGE A; 2Q7H A; 4TQF A; 2UUC B; 3OAA G; 5LA6 A; 2NN4 A; 1G8M A; 2V7Q G; 2BCC H; 1ZX3 A; 2A0L A; 2HJD A; 3ZN0 A; 3L75 H; 3QVN A; 4WFB V; 1XNR O; 3CJH A; 2Y4T A; 5C8Y A; 3B09 A; 3FFQ A; 3K59 A; 3D8C A; 4DR3 O; 3N2K A; 4WF9 V; 4HBN A; 1AJQ A; 4JAV A; 3K03 A; 1EN5 A; 3E22 B; 4R8C A; 5DED A; 4GX2 A; 5B1A C; 1I94 B; 3AG4 C; 1VQ7 V; 3LSS A; 4GX5 A; 3JD0 A; 4LF6 O; 1F51 A; 1BGY H; 4PJ0 Z; 4XBF A; 4OX9 O; 1PPJ H; 3GWO A; 2V1D A; 5LXT B; 3K06 A; 4IIJ A; 2OIG A; 2WLL B; 1SZX A; 4H37 A; 5IWA B; 2UXB B; 2QWP B; 2DOS A; 5IYZ B; 3SYC A; 1JMK C; 4F4L A; 5KX5 A; 3K0G A; 4Z1V A; 3B8N A; 3ZIA G; 4O4L B; 2UUC O; 3AG3 B; 3BY6 A; 3ZRX A; 3HR0 A; 5A9G A; 4K0K B; 3FB8 C; 3T1H B; 3Q4H A; 4DW0 A; 4K35 A; 2CH7 A; 2P22 C; 3M99 B; 3L9D A; 2E5L B; 2PGG A; 4R50 A; 3JAT A; 5KAI Z; 3H1K H; 4J7K A; 1A32 A; 1JFF B; 1SKV A; 3ZRW A; 1HWY A; 2N04 A; 2ZXW B; 3UCS C; 2EZP A; 1I94 O; 1H2L A; 4BR6 A; 1EZJ A; 3HB3 B; 4GCZ A; 2ZNJ A; 1KKD A; 1AVM A; 2B9Z A; 4FLW A; 2XAF A; 5L3G A; 3AG1 C; 3WU2 Z; 4YHH B; 1YTF D; 2UU9 B; 2EUL A; 4CS2 A; 5CA1 A; 1OCC B; 5KHH A; 4PA6 A; 2UXB O; 4XDJ A; 1FXH A; 4HAM A; 3CCM V; 1AP5 A; 4DR2 O; 4JYY A; 1Q5O A; 1Y66 A; 2LQT A; 4O2B B; 1WB8 A; 1JA8 A; 5BR8 B; 1V9P A; 2GHY A; 4R7C A; 5ITZ B; 2Y69 B; 3IGA C; 5J2T A; 2VQF O; 5FPR A; 2UXN A; 2BTO A; 4K0K O; 4JI8 O; 5FPO A; 1WA8 B; 2IBZ H; 4LFB B; 1Q6H A; 1BL8 A; 3CXH F; 1PNL A; 5IYD O; 2V4D A; 3ETQ A; 4U7O A; 2E5L O; 1O9G A; 2ARH A; 2QGN A; 2H8P C; 1RP3 B; 1S5H C; 1V54 C; 4I0X B; 1HP8 A; 4UUJ C; 3JSL A; 2RDC A; 4DR5 B; 1IZ3 A; 2WLI B; 4LC1 A; 2F4V B; 1Y74 A; 2FYU H; 2DQ0 A; 4MTO A; 2E74 B; 1K73 W; 1RPO A; 4YJ3 A; 4FIP C; 2QA4 V; 2CGN A; 4B3M B; 4DV5 B; 2UU9 O; 3QTC A; 3AK1 A; 1VQ9 V; 3ZHR A; 4TUY B; 4FLZ A; 2CAZ C; 2E3C A; 1TUB A; 1YZB A; 1QLN A; 1FXK A; 2GUZ B; 4J7Z A; 3E86 A; 2HVK C; 3CCL V; 3F7V C; 4Q20 A; 4DR7 B; 3CSX A; 1YEW A; 1FFX B; 4MVQ A; 1VQ4 V; 2GTA A; 4UB6 Z; 2WLK A; 4BWA A; 5LGT A; 1QNM A; 1SES A; 4I50 A; 5BR8 O; 1XHX A; 1XEQ A; 3ZJZ A; 3T1C A; 3JAM N; 3AG2 C; 1JR9 A; 1XI1 A; 3HKE B; 5L3E A; 5B1N A; 5BMV A; 1IBM B; 4LFB O; 2AW9 A; 4LWS B; 2YI9 A; 4JGS A; 3CCE V; 4HYO A; 3E35 A; 1COW G; 3BCC H; 3JAL A; 3T1Y B; 5E1A C; 1TAE A; 1K5Q A; 4DR5 O; 3P32 A; 1CP9 A; 4N21 A; 5A2Q N; 5CB4 B; 3J7A U; 1S5L Z; 5B3S B; 1VQL V; 3ZHQ A; 5EZY A; 1SQB H; 1N8R W; 4DV5 O; 2Q69 A; 2ZDI A; 3ABK B; 4JI3 B; 2AHY A; 1Q7Y W; 1FPO A; 1PKX A; 3E83 A; 5GON A; 5JH7 A; 5IYB O; 3ABU A; 3BEH A; 4P2Z A; 3K58 A; 5LGU A; 3SPG A; 3FX7 A; 1KU9 A; 1US6 A; 3B2E E; 4WCE V; 4DR7 O; 4GX0 A; 1NI8 A; 1H2G A; 1EZV H; 4JI2 B; 3CCQ V; 1KEC A; 2YIC A; 3HKD B; 5JQG A; 3CB2 A; 2JIZ G; 3U11 A; 2YXH A; 4IGG A; 2DWD C; 3RGB A; 4O4I A; 1IBM O; 4ZKI A; 2M6Y A; 3AG4 B; 2KKW A; 1OHH G; 3CCU V; 2DE0 X; 4YY3 B; 4JZ2 A; 4E4E A; 4RUE A; 2B1G A; 1YTF B; 3CRR A; 2YUA A; 4CH5 A; 1AI6 A; 2XTA A; 1Q86 W; 4J10 A; 2EIN C; 1KB9 F; 2PYJ A; 1KKC A; 3JYC A; 1DGS A; 1WP7 A; 2IW5 A; 3BPZ A; 3JAR A; 4JI3 O; 2QKS A; 5LP6 C; 2Z5U A; 4ICG A; 3G6E V; 2Z3Y A; 3K04 A; 1Q3E A; 2ZT9 B; 3K79 A; 3GWK C; 3K9A A; 4JI0 B; 1PL0 A; 4JI2 O; 4PA7 A; 2N05 A; 2QE7 G; 1ENV A; 4JI7 B; 3OTF A; 3ZED A; 3JD3 A; 2HEP A; 2QM8 A; 3KCX A; 1SER A; 3I5D A; 4X1Y B; 4BIU A; 4I5S A; 1L0L H; 2KB1 A; 3ASO C; 3BVO A; 4MTG A; 3W7X A; 3TGU H; 3S3W A; 3BRC A; 3CE2 A; 5LL6 Y; 2WWW A; 2VRZ A; 1K97 A; 2W6I G; 2Q5Z A; 2R9R B; 4IT5 A; 3D3I A; 1H8E G; 1SQX H; 1M90 W; 2P67 A; 5LMN B; 3QO5 A; 3FB5 C; 1KBH A; 4X1K A; 3D36 C; 4AQY O; 4DV2 B; 3CP1 A; 4J11 A; 5H9C A; 3D3Q A; 1Z2G A; 4JI0 O; 3C3S A; 1AI7 A; 1FAF A; 4NXM B; 2HJF C; 5IJ9 B; 3ZX6 A; 3ZMT A; 4FZ0 A; 1Q82 W; 4PA4 A; 1WPB A; 2D2C B; 3AG3 C; 1YIT V; 1K33 A; 4UFZ A; 3E8B A; 1HNX O; 1V54 B; 5KA6 A; 5DN6 G; 3B40 A; 3PN1 A; 1GK9 A; 4FVM A; 2HHH O; 4LF9 O; 5JWP A; 3JAS A; 1N32 O; 4MTX A; 1K34 A; 3S3X A; 2WA4 A; 2CTR A; 3CRA A; 1PNM A; 1M9N A; 1I5Y A; 1BSM A; 1BE3 H; 4W4L A; 2HFE C; 4K8Z A; 4X62 O; 1UJW B; 2DJV A; 4FJC C; 4GYC B; 2YEV B; 1N4C A; 1OCZ B; 1HNW B; 4FFB B; 2Q8V A; 1VQN V; 2ETN A; 2YI8 A; 1NR1 A; 3SJQ C; 4TV8 B; 2Q73 A; 1PV0 A; 2AHZ A; 3G4S V; 2Q67 A; 4DV2 O; 2F43 G; 1RSO A; 1XMO B; 2GSM B; 2YIA A; 2Q7G A; 1WPX A; 4UCT A; 4XDK A; 1F4M A; 3AG2 B; 3JAK A; 4AI8 A; 2CTQ A; 3VQX A; 2H3O A; 1XBL A; 2RMK B; 5B5E Z; 1JJ2 U; 2PI4 A; 1WNS A; 1DLB A; 3RFR A; 1YJW V; 1QR9 A; 3A0H Z; 1OJH A; 3AEI A; 3QO7 A; 2ZE7 A; 3ZN1 A; 4ZOL B; 5L3F A; 1Y76 B; 4TV9 B; 5J2U B; 4DRX A; 3ZHT A; 1VQP V; 4RQF A; 2QR4 A; 2IJK A; 1K9M W; 1VAR A; 3I55 V; 5IY5 C; 2YID A; 1X4T A; 4LH7 A; 1KD1 W; 2GV9 A; 3DC6 A; 5D5P A; 3QG5 A; 3HKC A; 4H13 B; 4UCO A; 2LP7 A; 4PHZ A; 1HNW O; 4DV3 O; 2RQ6 A; 3VBB A; 3OE7 G; 5CA0 A; 1ZTE A; 1I7F A; 4MT8 A; 2WLH A; 2FML A; 1XL6 A; 1XMO O; 5H6Q A; 5KHI A; 4I9Q A; 5K1P A; 2QWO B; 5EBL C; 3TCU A; 4ZIB A; 2ILM A; 2XAG A; 1TUE B; 4K8X A; 4I9W A; 3BFR A; 4PA9 A; 2UXC B; 1VP7 A; 1IBK B; 3F7Y C; 2RJZ A; 4YJ2 A; 5JVD A; 2UUB B; 3B77 A; 3STZ C; 3UQ8 A; 3DXR A; 4I55 B; 1K5S A; 1H8H G; 5LYJ A; 4X89 A; 4PDM A; 4WFF A; 1QU7 A; 1E1R G; 2EIN B; 3KCY A; 1E79 G; 4ZHQ A; 5DM6 V; 5CA3 A; 3LDC A; 4JYA B; 5LP6 B; 4WBN A; 4X65 O; 4DUZ B; 2A9H A; 3BA8 A; 3L74 H; 2O57 A; 1VQK V; 1SQF A; 1MZE A; 1OV9 A; 2JGD A; 5IE9 A; 3OEH G; 4LF5 B; 3SPI A; 5JCO A; 1XRE A; 4RQE A; 1MG1 A; 1OCO C; 4NTY A; 1MOF A; 4UVB A; 4NVP A; 1KP2 A; 1X59 A; 3NR7 A; 2IU3 A; 2CUG A; 5JJJ B; 2CTW A; 4DO2 A; 3RYC B; 1SQP H; 3ASO B; 3C90 A; 1KQS U; 4DV0 B; 3ZMV A; 3E22 A; 3IFX A; 2UXC O; 4U3F H; 4DXW A; 4FPP A; 2ITC C; 5CMU A; 1CXZ B; 3RVY A; 1N36 O; 4LF7 O; 2P90 A; 3CMA V; 5LHG A; 2LFR A; 3ZHV A; 2CTP A; 3SDL A; 2KSD A; 5LXT A; 5C8Y B; 4JYA O; 2WLL A; 1SQV H; 3WFV A; 4FK5 C; 3N2K B; 4DUZ O; 1F7Y A; 1FFT B; 2HG5 C; 5IYZ A; 3LSQ A; 5GTI Z; 4B7K A; 1BMF G; 1THZ A; 4O4L A; 2WAM A; 4UV9 A; 4LF5 O; 1JQ0 A; 3UKM A; 4NXN B; 4FLU A; 4KFM A; 2ZIN A; 4JYB A; 3RBZ A; 3RYH A; 1YSC A; 4GUN A; 4LH6 A; 1MNG A; 2EIL C; 2ZCE A; 4PDV A; 1BHA A; 3N2G B; 1R3I C; 3ZMZ A; 2UXD B; 1ZLZ A; 1JFF A; 1NTZ H; 4DV0 O; 5IDJ A; 3RN4 A; 1Q6I A; 3E8H A; 3TET A; 2LGQ A; 4F6R B; 3MAQ A; 5H6R A; 4QIW F; 1N0N A; 1BZK A; 5CN0 A; 3MDS A; 1U97 A; 1IX9 A; 4MVO A; 4B08 A; 3L73 H; 2IM9 A; 3OTO B; 1QQC A; 4N23 A; 1H2N A; 3CEI A; 2CE4 A; 1LNQ A; 2W6J G; 3IC7 A; 3OGC C; 3W7U A; 2X6B A; 1NZ6 A; 3ZRW B; 5IWA O; 4FM1 A; 1XMQ B; 3CRQ A; 4D7S A; 4O4H A; 4YIP A; 2BTQ B; 4O2B A; 1VF7 A; 1M57 C; 3GVM A; 4NXN O; 3ZBH A; 5ITZ A; 2QTO A; 2ZQM A; 3T4Z A; 1QR8 A; 4D6T H; 4PDR A; 4QPK A; 4DV1 B; 2JK5 C; 3JD4 A; 3X2Q C; 5LGN A; 4J9Z B; 3T1H O; 1GM7 A; 2YDE A; 2HP8 A; 4I0X A; 4X64 B; 1VQ8 V; 2UXD O; 4PI2 A; 2L35 A; 4DYL A; 2WLI A; 2DW4 A; 1M93 A; 4O4J B; 2PYL A; 3LDE A; 4LCU C; 2OYQ A; 5IY5 B; 4A5U B; 3L70 H; 1VF6 A; 4LNU A; 4EB6 A; 3ABL C; 1RPR A; 5KUM A; 3MHH C; 1GKF A; 3OTO O; 3H01 A; 2Q7E A; 3AK3 A; 4RAI A; 4TUY A; 1YCI A; 4YHH O; 1L0N H; 5JJN B; 3ETG A; 4DR6 B; 2GUZ A; 3ETD A; 2GTS A; 3SJC C; 1H2K A; 1OCZ C; 5KHG A; 4JTC B; 1QCE A; 2P7T C; 2H94 A; 4Z1M G; 1Y74 B; 2ZM6 B; 3VQW A; 1ROP A; 3UT5 B; 1KMI Z; 1OZ0 A; 1K7D A; 1SRY A; 3HKE A; 3CCS V; 4DV1 O; 1EN6 A; 2RCV A; 1SQG A; 3CRM A; 3H9V A; 1ZSP A; 1NKD A; 2P4K A; 1S77 D; 5EK0 A; 1J95 A; 3NXS A; 1NS1 A; 1QLE C; 3A0R A; 3HPL C; 2W0F C; 3H1J H; 3CC4 V; 5CB4 A; 4DR1 B; 2LGW A; 2F4V O; 3H1L H; 2XAS A; 5CBF A; 4UVA A; 3L71 H; 4I50 B; 4FM2 A; 4ZI7 A; 4FLX A; 5KHK A; 1HNZ B; 4QE9 A; 4WFG A; 3UO3 A; 3IC9 A; 3G67 A; 1W59 A; 4U3J B; 4I4T B; 1ZL8 B; 2RN9 A; 4B3M O; 4OXS A; 3CWB H; 5H2F Z; 4PEL A; 4DR6 O; 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4H44 B; 4LFA O; 4B3R O; 1M57 B; 3E2E A; 4IL6 Z; 1N34 B; 1P4R A; 1XIL A; 2DYS C; 2WA3 A; 2BSK B; 1GAX A; 5IJ9 A; 1NU1 H; 4QPJ A; 4X66 O; 1XHZ A; 3X2Q B; 4JI7 O; 2LW1 A; 2A79 B; 5BZB A; 1URF A; 4JZG A; 5LOV B; 3CCR V; 4FLY A; 1R6K A; 4LBE C; 1OCR C; 4IYI A; 4TOI A; 3SYP A; 4RUF A; 3M7M X; 1QHT A; 3OW2 U; 3UO2 A; 2EZO A; 4FM0 A; 4JAU A; 3ABL B; 5D5Q A; 4PV1 B; 4NKG B; 1FD9 A; 4E2L A; 1VQ5 V; 2YEV A; 1G1X B; 1IVS A; 4FFB A; 2Y0I A; 4KXR A; 3OMA B; 2NNU A; 2NR5 A; 5EC1 C; 3OMI B; 4NB5 A; 4IHJ B; 4TV8 A; 4X1I B; 5LMN O; 4ASU G; 4G27 B; 2YXL A; 4JYC A; 4JI4 B; 4GX1 A; 1S72 V; 1PP9 H; 4HZ3 A; 1N34 O; 2ZIO A; 1NH2 B; 3SJB C; 1Q8I A; 4FLV A; 4NXM O; 1SET A; 1MSD A; 3SPJ A; 3T4D A; 3A0B Z; 2DWE C; 4JAS A; 5E79 Z; 3K5O A; 4XDL A; 4W4K A; 1QLE B; 3CD6 V; 2QJ1 A; 3LSU A; 4NR1 A; 4GKK B; 4LR3 A; 2Q68 A; 1R6N A; 2R70 A; 4TV9 A; 5J2U A; 2WSS G; 1RSO B; 1MSW D; 4JI1 B; 1D5N A; 1R73 A; 2YS8 A; 5KMG B; 3K3W A; 4TT3 G; 2PI5 A; 3K5M A; 4BIZ A; 1LUV A; 4LP8 A; 3FAV B; 2PZS A; 4J7J A; 2Q0O C; 3WG7 C; 1YVW A; 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