The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
70
|
structure length |
70
|
Chain Sequence |
EEEELVDPLTTIREHCEQTEKCVKARERLELCDARVSSRSHTEEQCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNKLK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| publication title |
Electron Transfer by Domain Movement in Cytochrome Bc1
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
UBIQUINOL-CYTOCHROME-C REDUCTASE COMPLEX CORE PROTEIN I, MIT
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| total genus |
24
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| chains with identical sequence |
U
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-04-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3H1J H; 1L0N H; 1NTK H; 4D6T H; 3H1L H; 3L70 H; 1SQQ H; 1KB9 F; 1NTZ H; 3L71 H; 1SQV H; 3CX5 F; 1BGY H; 1EZV H; 1NTM H; 1SQB H; 5KLV H; 3CWB H; 1P84 F; 3H1H H; 1BCC H; 4PD4 F; 2IBZ H; 1L0L H; 1KYO F; 2FYU H; 3BCC H; 3L75 H; 3H1I H; 1SQX H; 3L74 H; 3L72 H; 3H1K H; 1PPJ H; 1NU1 H; 3L73 H; 2BCC H; 1BE3 H; 4U3F H; 2A06 H; 3TGU H; 1SQP H; 3CXH F; 1PP9 H; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CCR V; 3JSL A; 5KHG A; 1D5N A; 2IJI A; 1KEC A; 1P4R A; 3THO A; 1XIL A; 1BMF G; 3SGI A; 2D2C B; 1L0L H; 3N2K B; 5CA1 A; 1HNX O; 4GX2 A; 3G6B A; 2LP7 A; 2UXD O; 3G4S V; 4DV1 B; 2QKC A; 4OPH A; 1UPG A; 3ETD A; 3H1J H; 2UXB O; 4GCZ A; 3SR2 C; 4DR2 B; 2YC0 A; 2YS8 A; 1O9G A; 2WAM A; 3BAB A; 2HJF C; 1RPO A; 3GWK C; 3FAV A; 4K35 A; 1S77 D; 2Q7H A; 5A2Q N; 3ASN C; 3K79 A; 4U3F H; 3AK2 A; 3H1K H; 1Z5V A; 2ZNJ A; 1IXB A; 5GON A; 2P67 A; 4DV1 O; 1GN4 A; 4UXN A; 1VIB A; 4PDV A; 3EFF K; 5FPR A; 4DR2 O; 2Q8V A; 1B06 A; 1D5A A; 3VQW A; 2R9I A; 3EXA A; 4PI0 A; 4UB8 Z; 4X64 B; 1S5H C; 1HP8 A; 1A32 A; 3E8B A; 4UCR A; 3CS5 A; 1DF4 A; 3G80 A; 1PKX A; 3APO A; 3EVK A; 4YJ2 B; 2K9P A; 2V4D A; 4IHJ A; 3SPH A; 2GSM B; 4WFG A; 3CCS V; 3CC4 V; 2X0L A; 3ZMS A; 2BTQ B; 1PNM A; 2ZDI C; 3RYC A; 2JS5 A; 4X64 O; 4EFB A; 4P9O A; 4DR5 B; 1FFT B; 5LGN A; 2IW5 A; 3BFR A; 2EIL B; 1S5J A; 4TSF G; 3HKC B; 5ITZ A; 2E75 B; 2YIB D; 1N4C A; 4JI3 B; 1XEQ A; 4YIP A; 1VQL V; 1MNG A; 5LMN B; 1KB9 F; 3N2K A; 1XQ8 A; 1AR5 A; 2V1D A; 1J95 A; 5CN0 A; 1S5L Z; 1EN4 A; 5JJN B; 3ZS8 C; 4DR5 O; 1O9H A; 3CCL V; 1QLN A; 3LDD A; 3ASN B; 4DO2 A; 1W2B U; 3K57 A; 1I94 B; 4CS3 A; 4YY3 B; 5CA3 A; 2DYS C; 3R66 A; 2CGO A; 2CE4 A; 1THZ A; 1FXH A; 4GYC B; 3QO5 A; 4JI3 O; 2KG7 B; 3HPL C; 3FB8 C; 4MS2 A; 5J2T B; 3LSS A; 4P2Z A; 5LMN O; 4B3S B; 5IY5 C; 4MTF A; 1M57 B; 1IZ3 A; 2A06 H; 3ZJZ A; 1V54 C; 2DOS A; 3F5W C; 2R9R B; 1H2S B; 3LSQ A; 1I94 O; 1VF5 B; 4YY3 O; 5IYD O; 1AIL A; 4JI1 B; 2QWQ B; 2B1G A; 2G38 A; 1BCC H; 3CCQ V; 4UVB A; 2WA3 A; 3U10 A; 3A0H Z; 1MG1 A; 3AG7 A; 3T1H O; 4DUY B; 1JFF B; 3E22 B; 2WLH A; 4DXW A; 4X1Y B; 1KP2 A; 1MOF A; 4YJ2 A; 4Z2W A; 4J41 A; 2XT9 A; 2YIB A; 5IYC O; 4JI1 O; 2BTQ A; 3ABT A; 4FJC C; 4DR3 B; 4YXW G; 5LYJ B; 3EHB B; 2FML A; 4EB6 B; 2AHY A; 1K92 A; 2QM7 A; 3OM3 B; 4BIO A; 4LFB B; 3HKC A; 1DLB A; 5IJ9 B; 4DUY O; 2R9A A; 1TVK B; 3FD9 A; 2EJR A; 1Q3E A; 3IC7 A; 3RFR A; 4MVO A; 3JAL B; 1OCR C; 3B8N A; 4UCU A; 3LNN A; 3NR7 A; 3A0R A; 2F4V B; 5BMV B; 4IL6 Z; 4WFA V; 1Z2G A; 2CK3 G; 4PDR A; 3KG2 A; 4KP4 A; 4DR3 O; 4KHP B; 3K58 A; 2DYS B; 1KU9 A; 4X62 B; 4LFB O; 2AXT Z; 3SPG A; 5L3C A; 1PNK A; 2PYL A; 3TK1 A; 1M4U A; 5H6Q A; 1JMK C; 5IY5 B; 1ZWI C; 2CUG A; 2KG7 A; 4DV6 B; 1G8M A; 2GDS A; 5J2T A; 1YDX A; 2VWK A; 2F4V O; 4DRX B; 2ZCE A; 1ENV A; 1V54 B; 1G4Y B; 2RJZ A; 1KKD A; 4CS4 A; 3OTF A; 3S3X A; 4KHP O; 4DR1 B; 5LHH A; 1S3J A; 4GX0 A; 4X62 O; 4UFZ A; 4MTO A; 4LF7 B; 5B3S C; 3JSN A; 4JI0 B; 2ZXW B; 3QTC A; 3G71 V; 5H6R A; 5EZY B; 4N23 A; 4UCT A; 5IE9 A; 4B3M B; 2P7T C; 1NH2 B; 4X88 A; 3ZHQ A; 1WP7 A; 4DV6 O; 2EIJ C; 2KQX A; 1EZV H; 1K33 A; 2JRI A; 3H1H H; 3QF7 A; 1JFF A; 3E22 A; 3FX7 A; 4KFM A; 1F4M A; 4JPR A; 4X1Y A; 4DR1 O; 2ZDI A; 4JI8 O; 2ITC C; 4J42 A; 1VQM V; 4K3A A; 2O57 A; 4FMT A; 4LF7 O; 4G28 B; 4JI0 O; 5FLX N; 1NH2 D; 2ILM A; 3X2Q C; 4FLW A; 4B3M O; 1GTO A; 1FAF A; 5IT9 N; 1OCC C; 4ZKI A; 5L3F A; 5LYJ A; 2LFS A; 4WBN B; 1NBM G; 1XNR B; 4EB6 A; 2D3O W; 1GM7 A; 5IJ9 A; 4XDJ A; 1OCR B; 1I5X A; 1TVK A; 3SPC A; 3BHP A; 2ITD C; 4UCO A; 3W7S A; 2M6Y A; 3JAL A; 2ADQ B; 2VRZ A; 1DGS A; 5LA6 B; 3QNE A; 5BZB A; 2HJD A; 5BMV A; 1H2K A; 4UVC A; 3ZED A; 3CSX A; 3JAK B; 1ZTE A; 2VWJ A; 3CEI A; 3LSU A; 4BR6 A; 1XNR O; 1M90 W; 2WLK A; 2YIC A; 1BE3 H; 3SPJ A; 4F6E A; 4TV9 B; 4WFE A; 1W59 A; 1XRE A; 2B9Z A; 1K3E A; 2RNB A; 2PGG A; 1F4N A; 1H2G A; 2QR4 A; 5KMG B; 3STL C; 1VQ7 V; 4NKG B; 5LOV B; 3SYA A; 3KCY A; 2N04 A; 4DRX A; 2ZM6 B; 1WPB A; 5DN6 G; 1BZK A; 4W4L A; 5B3S B; 1AI7 A; 1IUR A; 1GK9 A; 3S3W A; 3ZMT A; 2ZE5 A; 1GKF A; 3BA8 A; 2RQ6 A; 5FL7 G; 4X8A A; 1VQO V; 2EIJ B; 5IDJ A; 5EZY A; 5K1X A; 4DK0 A; 4K8X A; 3N27 A; 1P49 A; 1ROP A; 3E8F A; 4RAI A; 4MT8 A; 1V55 C; 3SYO A; 4J10 A; 1I08 A; 1JA8 A; 3RT3 C; 4KL1 A; 1VQN V; 2ZM6 O; 4R8C A; 4MVR A; 1NR7 A; 5DEC A; 3SJQ C; 3X2Q B; 1M1K W; 3ZRV A; 1OCC B; 1M56 C; 4FLU A; 3T1C A; 1H8H G; 1S72 V; 1P7B A; 2YID A; 3RBZ A; 4NR1 A; 2ATK C; 3WU2 Z; 4LC1 A; 2ZKO A; 1G1X B; 4WBN A; 3P3N A; 1MZE A; 1Y67 A; 3A8T A; 3ZHV A; 3M99 B; 4DV5 B; 4QE7 A; 4DV3 B; 1SQX H; 5JJE B; 1AJP A; 2WPD G; 2WLL B; 4H13 B; 5AG2 A; 2Z5U A; 5LA6 A; 3OW2 U; 1FS0 G; 4UB6 Z; 5DED A; 1PD3 A; 2Q73 A; 2P06 A; 2QM8 A; 3JAK A; 4F4L A; 2IH1 C; 2B5U A; 2RCV A; 1K5Q A; 2X6A A; 3T1Y O; 3OAA G; 4O4I B; 3F7Y C; 2QGN A; 4TV9 A; 4DV5 O; 4MVZ A; 4JTA B; 3G6E V; 3MD0 A; 3RYH B; 5CMU A; 1T5E A; 1EZJ A; 3OGI B; 3CME V; 1P7G A; 1OCO C; 2EIM C; 1AI6 A; 2HKO A; 5KMG A; 4ZIB A; 2NNU A; 4W4K A; 5LOV A; 2P22 C; 3RWR D; 3I56 V; 1XMQ B; 1PL0 A; 3AK1 A; 2HHH B; 3H1I H; 2XTA A; 5EIB C; 3D3I A; 2YI8 A; 2VQE B; 5EK0 A; 1FXK C; 1V55 B; 1LNQ A; 1MAB G; 4QNH B; 4I55 B; 2PY5 A; 2W6J G; 1WP8 A; 2EIL C; 5B5E Z; 4PEL A; 2MK3 A; 3W7T A; 1R3K C; 5KLV H; 4MVU A; 3U0Z A; 1WA8 B; 1NZ6 A; 4IYI A; 3DTU B; 4LWS B; 2Q0A A; 2AW9 A; 1M56 B; 3AG1 C; 2JVD A; 3HKE B; 5CA0 B; 4JTC B; 2Q0O C; 2HHH O; 2A9H A; 2QEX V; 1QR9 A; 2BE3 A; 2DN9 A; 2VQE O; 1E1Q G; 5IYZ B; 3OT7 A; 3ZX6 A; 4JZ2 A; 1SRY A; 4DV4 B; 1VQ5 V; 1RP3 B; 2EIN C; 2L6L A; 4LF8 B; 3L75 H; 3GVM A; 2IU0 A; 3BAA A; 1B6Q A; 3OFN G; 4FK5 C; 2RN9 A; 2IU3 A; 2YDE A; 3B09 A; 5H2F Z; 2ZR2 A; 1R6T A; 3ZHR A; 1IBM B; 1ZAU A; 2XAQ A; 4N21 A; 1QBZ A; 3OD4 A; 2WLL A; 2CGN A; 1SQF A; 1M57 C; 1UFI A; 1B3Q A; 3FB7 C; 4LF6 B; 2X6B A; 4DV4 O; 1KKC A; 2CTW A; 1KMI Z; 4J80 A; 4FFK A; 3SYQ A; 4JAV A; 4LF8 O; 4UCS A; 4H44 B; 4PA3 A; 1SZX A; 5KAI Z; 3CCV V; 4PA9 A; 1OCO B; 4K8Z A; 2EIM B; 4O4I A; 4OXS A; 4J7Z A; 2HLD G; 3RYH A; 2JK5 C; 1IBM O; 2NN4 A; 3ZHS A; 3K03 A; 4F6R B; 2CAZ C; 5F2V O; 1PV0 A; 2AZ2 A; 1AJQ A; 5EBM C; 1YJW V; 1XHZ A; 4LF6 O; 3ETG A; 5LMU B; 3CJH B; 3WFV A; 3H9V A; 1TUB B; 1M5I A; 3ETQ A; 3E8G A; 1FXK B; 2R70 A; 1X59 A; 4NTY A; 3N2G B; 1K5S A; 3ZCC A; 1R73 A; 2IBZ H; 4BIZ A; 2QA4 V; 4ABM A; 5JVD B; 4I55 A; 3RVY A; 1JX9 A; 3UO3 A; 3K5N A; 4FZ0 A; 2HR3 A; 1XHX A; 3AG1 B; 4FM2 A; 3OEH G; 5EIB D; 1WA8 A; 5IYB O; 4TT3 G; 4LWS A; 1N0N A; 5LMU O; 1FJG B; 1SZT A; 2UXN A; 3E86 A; 1WB8 A; 3HKE A; 3JAT B; 5CA0 A; 1H8E G; 1KYO F; 1NI8 A; 1XI1 A; 2EIN B; 1F51 A; 4CH3 A; 1YIJ V; 5IYZ A; 1AR4 A; 4KUM A; 2GTA A; 2BCC H; 4LFA B; 4EKW A; 3CYO A; 1AP6 A; 4FVM A; 1SET A; 2HEP A; 3WB0 A; 2FKX A; 1BQ0 A; 1H2M A; 1I5Y A; 4NXN B; 1NTZ H; 4AIL C; 3OMI B; 4JTD B; 5IWA B; 4J9Z B; 4FLV A; 3STZ C; 1FJG O; 3AG4 C; 1EM1 A; 2QWO B; 4E2L A; 5JQG B; 2E3C A; 4O2A B; 2K1E A; 4O4J B; 3SJA C; 3GWO A; 1PL4 A; 5K1P A; 2XAS A; 1IX9 A; 3OUF A; 3TCU A; 1AP5 A; 4LFA O; 2XAF A; 1DF5 A; 2X7R B; 3D8C A; 1X4T A; 3ZRS A; 3BPZ A; 4NVP A; 4PD4 F; 2Q7G A; 4B3R B; 4NXN O; 3CD6 V; 5LP6 B; 3ZRX A; 3L74 H; 2ZXW C; 3BVO A; 5B1O A; 5IWA O; 1KQS U; 2Y69 C; 2QKA A; 1K8A W; 2F1M A; 3UCS C; 2E74 B; 1QCE A; 4B3S O; 3ZIA G; 1SS3 A; 2HVK C; 1XL4 A; 4DR4 B; 4I7Z B; 4GX5 A; 4F6R A; 1GM8 A; 1CXZ B; 1QLE C; 1Y74 B; 1SES A; 1SQB H; 2XUM A; 4JI2 B; 1IVS A; 3OMA B; 4TWK A; 1SC5 B; 3CJH A; 2ZD9 A; 4IIJ B; 1TUB A; 1PM9 A; 1OZ0 A; 1FXK A; 4B3R O; 1S0V A; 1ZSP A; 4X9Q A; 2Z3Y A; 4FLT A; 1IBK B; 5KHJ A; 3UKM A; 3N2G A; 2XOK G; 1MMM A; 1L0N H; 3T2M A; 1Q86 W; 2OTJ V; 1HWY A; 5D5Q A; 2BTO A; 5JVD A; 3CRR A; 3JD4 A; 4DR4 O; 4WFB V; 1H38 A; 4AI8 A; 2UXC B; 3K9S A; 4A5U B; 4JI2 O; 2F43 G; 5B1A B; 2P4V A; 4ICG A; 2Y0I A; 2P4K A; 3DC6 A; 5EC1 C; 3JAT A; 1VQ4 V; 4X65 B; 1GN2 A; 2HG5 C; 1IBK O; 3W7U A; 4X1K B; 4H37 A; 3JAW B; 1YJ9 V; 2PZS A; 2Q4P A; 1SER A; 1QQC A; 3APQ A; 3TJT A; 1H2N A; 4ZI7 B; 3K5O A; 4XDK A; 3VQV A; 3DC5 A; 2BSK B; 1CEZ A; 3TXS A; 4JAS A; 3AG4 B; 3CB2 A; 2UXC O; 2JJ1 G; 4IGG A; 1IDS A; 2Q68 A; 4U7O A; 3E8H A; 4GZR B; 3RW0 A; 1U97 A; 4X65 O; 5JQG A; 4O2A A; 4O4J A; 4H33 A; 2Y4T A; 1ARO P; 4FFB B; 1K9M W; 1K34 A; 2JS3 A; 2Y69 B; 2QJ1 A; 1UJW B; 4I4T B; 4B7K A; 2GV9 A; 1I0H A; 2P90 A; 3MDS A; 3LDC A; 2LFR A; 5GTH Z; 3AG3 C; 5LP6 A; 3K08 A; 1FPO A; 2Q5Z A; 3QVN A; 3UT5 B; 4BIU A; 1P84 F; 1QU7 A; 1QLE B; 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1NJI W; 1N32 B; 1TUE B; 2W0X A; 1WLE A; 2ETN A; 3ABU A; 3OGC C; 5KHH A; 5LGU A; 4WFH A; 4LNU A; 3CRQ A; 3VQY A; 3JCU Z; 4O4H A; 2Q9L A; 3ZBH A; 3PJS K; 3HB3 B; 4KXR A; 5JH7 B; 4O2B B; 1TAE A; 1CPY A; 1QR8 A; 4Z1M G; 3BRC A; 1N34 O; 2OYQ A; 3LNM B; 2N74 A; 4YJ3 A; 3DXR A; 1YEW A; 3ZRW B; 3K9A A; 1FFX B; 4U3J A; 2UXX A; 4AQY O; 4LCU C; 5J2U B; 3D36 C; 1N32 O; 2Q67 A; 1DK1 A; 2ZNI A; 2EIK B; 1Q6H A; 2WSS G; 3K0D A; 4G27 B; 2P5O A; 3RYI A; 5FPO A; 2DJV A; 4JAU A; 1G6U A; 5LHG A; 1AI5 A; 1L1F A; 2DQ3 A; 3CC7 V; 1AR1 B; 4LF4 B; 3B2E E; 3KZI Z; 3OTO B; 2OCH A; 5BXZ A; 4X20 A; 4CC6 A; 2ARH A; 4X1I B; 2ZIO A; 4FM1 A; 5CB4 B; 3RN4 A; 5KA5 A; 1NR1 A; 4CZZ A; 2H94 A; 4DV3 O; 1Q7Y W; 2WWW A; 5LGT A; 1VMG A; 1JQ0 A; 2ZE8 A; 1K4C C; 5BR8 B; 3FYE B; 4JYC A; 1YSC A; 2VQF B; 1ORQ C; 3JAR A; 3P30 A; 4LF4 O; 2LW7 A; 3OTO O; 3L72 H; 3CP1 A; 5D5P A; 1FYJ A; 4DV7 B; 2H8P C; 4ZOL A; 4TQF A; 1PP9 H; 3CMA V; 3RGB A; 3AK3 A; 3IAY A; 2GUZ B; 1Y76 B; 3L70 H; 4HAM A; 2GHY A; 1YXB A; 4GUN A; 1SQV H; 4R7C A; 3JAS B; 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