The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
94
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structure length |
94
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Chain Sequence |
MDPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Bos taurus
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| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
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| total genus |
30
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| structure length |
94
|
| sequence length |
94
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3APQ A; 2QWP B; 2LO1 A; 3UO2 A; 2Y4U A; 1XBL A; 1N4C A; 1BQ0 A; 2GUZ A; 4J80 A; 2YUA A; 2CTQ A; 2L6L A; 2Y4T A; 2DMX A; 2LGW A; 2PF4 E; 2QWR B; 2GUZ B; 3UCS C; 2YS8 A; 2N04 A; 2EJ7 A; 2KQX A; 2CTR A; 1FPO A; 3APO A; 3UO3 A; 1BQZ A; 1GH6 A; 1NZ6 A; 2QSA A; 4RWU A; 2QWN B; 1FAF A; 4J7Z A; 4IT5 A; 1IUR A; 2CUG A; 2M6Y A; 2N05 A; 2CTP A; 2CTW A; 2QWO B; 2QWQ B; 2DN9 A; 3AG7 A; 3BVO A; 1HDJ A; 2OCH A; 1WJZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JZG A; 1RFY A; 4LF5 B; 1F51 A; 2XAQ A; 1K3E A; 2RCV A; 4BIU A; 4DV3 B; 5LGN A; 1P4R A; 1Z2G A; 2FML A; 2HR3 A; 2BSK A; 3J7A U; 2R9R B; 4JI5 O; 1YI2 V; 4TUY B; 1WP8 A; 3ZCC A; 4LCU C; 4DV7 B; 4PA7 A; 2YXL A; 4DK1 A; 5LL6 Y; 4MVO A; 2Q7G A; 1K7D A; 1NI8 A; 1GKF A; 2JGU A; 5ITZ A; 1ORQ C; 3UCS C; 2Z3Y A; 1BHA A; 3AK1 A; 1PNK A; 2X6B A; 4X8A A; 2RQ6 A; 3CRC A; 4NXN B; 3GWO A; 5LMN O; 2Y0I A; 1VF6 A; 2JGD A; 5E1A C; 3OW2 U; 4HZ3 A; 3R65 A; 3JAS B; 1ARO P; 1K33 A; 1WB7 A; 5FL7 G; 5TIS Z; 3RYC B; 1WNS A; 2ZE7 A; 4XDJ A; 2V7Q G; 3U0Z A; 3OGI B; 4U3F H; 5KHG A; 3UM7 A; 2UXB O; 1VQ5 V; 5B3S B; 1OZ0 A; 1M9N A; 4DW1 A; 3SR2 C; 4O4H A; 2ZKO A; 3P30 A; 4OX9 O; 1R3L C; 3FYE B; 3K03 A; 4FZ1 A; 4FLX A; 1FFX B; 1PNL A; 1VQ8 V; 2W0F C; 3A0H Z; 3OFN G; 4R8C A; 1AJN A; 1IVS A; 1N0N A; 2VQF B; 3ZRX A; 2E3C A; 1OCC B; 5LA6 B; 5C8Y A; 3HKB B; 4DR6 O; 4UVA A; 1AP6 A; 1TGO A; 2ZXW C; 4TQF A; 4IHJ B; 3STL C; 2F1M A; 3T1H B; 4YHH O; 5BR8 O; 4YY3 B; 3CRA A; 3UO2 A; 1YJN V; 2LW1 A; 5L3B A; 2NR5 A; 4I9Q A; 4QE7 A; 1YTF B; 1YHQ V; 2GBO A; 2RMK B; 5IJ9 A; 1LUW A; 4B3S O; 4NTX A; 4DV6 B; 2LW7 A; 1HNW B; 2ITC C; 3ETQ A; 1FXK C; 3OR7 C; 2EIN B; 3KKY A; 4PA3 A; 1N32 O; 1KB9 F; 1E1Q G; 3AG3 C; 1H2M A; 5GW7 A; 2EUL A; 1JJO A; 1OCO C; 4B3M B; 5K1P A; 4JI7 O; 2XUM A; 4AI8 A; 2YXH A; 2WLJ A; 4IYI A; 4LBE C; 3B40 A; 4Z1M G; 4DV5 B; 4MVU A; 1GMG A; 4I4T B; 4X62 B; 5EC1 C; 1S5L Z; 1JPX A; 2Y69 B; 2Q0A A; 2HHH O; 2JJ2 G; 4NYK A; 4UV9 A; 1QLE C; 3RW0 A; 3SJC C; 4IL6 Z; 1SER A; 1NT2 B; 2HFE C; 1R73 A; 1XUQ A; 4NR1 A; 3LSQ A; 2ITD C; 2CTP A; 3SYC A; 3AG7 A; 3JAW A; 1W0J G; 5A9G A; 3QTC A; 1Y76 B; 2DQ0 A; 1FXV A; 4LF4 O; 3FFQ A; 2KB1 A; 4NTW A; 2CTQ A; 1KEC A; 4H0L B; 2X6C A; 2YEV A; 3BHP A; 1I94 B; 4MTF A; 1I0H A; 2OTJ V; 5KX5 A; 4IT5 A; 5BMV B; 1QHT A; 2JVD A; 1L8D A; 3BFR A; 1EN6 A; 4LFA O; 3J80 N; 2B9Z A; 3RYI B; 1M56 C; 4J41 A; 1COW G; 4WCE V; 1RM1 C; 3EXA A; 3JAM N; 2QEX V; 3B2E E; 2ZDI A; 3ZRW A; 1R1B A; 1TA8 A; 4ZI7 B; 4PD4 F; 1RSO B; 2GDS A; 4TSF G; 3BAA A; 2AW9 A; 3D36 A; 2QKC A; 4HNA B; 5FNV A; 4JI2 B; 4GX5 A; 3J81 N; 2GV9 A; 1Q3E A; 4PDL A; 4DR2 B; 4K35 A; 1Y4M A; 1ZL8 B; 3LNM B; 4LF9 O; 2UUA B; 3CB2 A; 3ETD A; 4DRX B; 3N2K A; 2ZT9 B; 1N36 B; 5CA3 A; 3CHX A; 1EZV H; 1I7F A; 3P3N A; 3WB1 A; 4I9W A; 3CXC U; 4O4J A; 2RDC A; 5IJ0 B; 2ODM A; 4U7N A; 3I55 V; 4JYY A; 3NXS A; 2XAH A; 1KKD A; 4LP8 A; 4LF8 O; 2WSS G; 3H1I H; 3SYA A; 4PDM A; 3OD4 A; 5DM6 V; 2JDI G; 4LC1 A; 4FJC C; 1QVF U; 4JV5 B; 3JAK B; 3K0G A; 2PTM A; 1YTF D; 4BAY A; 4C7U A; 3HKC A; 4UXN A; 5KAF Z; 1HNZ O; 1P7B A; 3ZHV A; 2QTS A; 2ZQM A; 4LFC O; 1P49 A; 2BTO A; 3UQ8 A; 4YIO A; 4N23 A; 3N2G A; 5IT9 N; 4G2K A; 1R6T A; 1S5J A; 1VF5 B; 1NTK H; 4LF7 O; 5EK0 A; 2Q7H A; 1PNM A; 2L35 A; 3AK2 A; 4B7E A; 1US6 A; 4XDK A; 2E5L O; 4UV8 A; 4WFB V; 2DWD C; 3K06 A; 2ZCE A; 1KC8 W; 4NTY A; 1JR9 A; 4UB8 Z; 4PJ0 Z; 3ZN1 A; 3BY6 A; 4FFK A; 1YEW A; 1WN7 A; 3H1J H; 1EZJ A; 4GX2 A; 4JAS A; 4DYL A; 3KCX A; 2P4K A; 3K5M A; 1IBL O; 4D7S A; 4H13 B; 2IU3 A; 5LMN B; 2P90 A; 4JZ2 A; 4MVQ A; 1LUV A; 3RBZ A; 4ASU G; 3ZHS A; 1BQ0 A; 1TAE A; 2OWO A; 3OGC C; 3CMA V; 3BAB A; 2UXB B; 1FS0 G; 2D3O W; 1D5A A; 4OX9 B; 4DK0 A; 1XEQ A; 4RO2 A; 3E89 A; 1WLE A; 2Q73 A; 3K04 A; 1CPY A; 4JI0 O; 2Z0A A; 1NVP B; 2H3O A; 3G4S V; 4J7J A; 2RN9 A; 4RQF A; 4R7C A; 1GRJ A; 1SQF A; 3W7U A; 3K59 A; 1ZSP A; 4UCV A; 4DR5 B; 5KUM A; 1L0N H; 2WLK A; 2Q69 A; 3FAV B; 4LH7 A; 1YXB A; 4DUZ B; 4DR6 B; 2YIC A; 3K5N A; 4Q20 A; 3C3S A; 1F4M A; 4UCR A; 2QR4 A; 4GYC B; 3JAS A; 4O4I B; 3RYC A; 2Q6A A; 1N33 O; 4BIO A; 4YHH B; 2EIL B; 3H1L H; 3L70 H; 2FYU H; 5BR8 B; 4FPP A; 5B1B B; 1RP3 B; 2ILM A; 3ZMZ A; 4JYA O; 3K58 A; 4GKK O; 3S3X A; 1MA1 A; 1FFX A; 4B3S B; 5EYP B; 5KHH A; 2QGN A; 1ZWI C; 5CBH A; 4CC6 A; 1QCE A; 1QNM A; 4JI8 O; 1P7G A; 4FLV A; 3G6E V; 1N32 B; 4PA4 A; 5B1A C; 2OCH A; 2MW2 B; 4JI3 O; 2X6A A; 1VQN V; 3JSN A; 1K4C C; 3JSL A; 4E2L A; 2OT5 A; 1U96 A; 1VQ7 V; 1S5H C; 1VQP V; 1R6N A; 4J7K A; 4MTO A; 1SRY A; 1XDC A; 2A79 B; 1KD1 W; 1IXM A; 2Y0P A; 4IHJ A; 2DQ3 A; 3B8M A; 4CH4 A; 1IX9 A; 3OMI B; 4MW8 A; 3CCE V; 4UUJ C; 1H38 A; 1XQ8 A; 1VQ4 V; 1MNG A; 3I5D A; 2FL4 A; 2W6I G; 3CC2 V; 2RNB A; 1BT8 A; 1A32 A; 1XMO O; 4PV1 B; 5FPR A; 2HHH B; 4FM1 A; 1B04 A; 4K8X A; 1NZ6 A; 1FD9 A; 2PY5 A; 4NKG B; 3GB7 C; 3BVO A; 3X2Q C; 5KHK A; 5CN0 A; 1NR7 A; 3IJ4 A; 2WPD G; 4LF4 B; 3OR6 C; 4O4J B; 4PDV A; 2QWR B; 5L3D A; 3ABK B; 4I4T A; 3AG1 B; 2QM8 A; 3HB3 B; 2IM9 A; 1K73 W; 2Q5Z A; 2ATK C; 2CTW A; 5IYD O; 2GTA A; 2EIJ C; 2HKO A; 3L71 H; 3Q4H B; 3QO8 A; 3SYO A; 1MOF A; 3ASN C; 5LOV B; 3BEH A; 5KHI A; 3HKC B; 5IYZ B; 1BMF G; 3ZED A; 2ZM6 O; 2XTA A; 3GWK C; 2ARH A; 3M7M X; 5A2Q N; 1X59 A; 1JQ0 A; 1Y76 A; 3CC4 V; 2HJD A; 3R66 A; 4JI1 O; 5D5Q A; 4QPJ A; 4WFE A; 1WA8 B; 5B5E Z; 3DXR B; 3D3Q A; 1QR8 A; 4JTC B; 4ZBM A; 5KHJ A; 3E22 B; 1GTO A; 1PL4 A; 1MG1 A; 3ASO C; 4JTA B; 5BMV A; 2B5U A; 3ZJZ A; 4FLZ A; 1NVP D; 2QWO B; 2IBZ H; 3RYI A; 4BR6 A; 2CAZ C; 3IC7 A; 4ZHQ B; 1KMI Z; 3CX5 F; 3ICX A; 4ZI7 A; 1RSO A; 1HR0 B; 1VF6 C; 3SGI A; 1H8H G; 2YXY A; 3JCU Z; 3AG2 B; 4HNA A; 4N21 A; 2QWQ B; 1IXB A; 2LGQ A; 1NH2 D; 1NQT A; 4UCU A; 5LMU O; 1HNX O; 2NN4 A; 4X66 O; 2IU0 A; 4RUE A; 2XAF A; 3H1K H; 1EFR G; 1HNZ B; 1T5E A; 3MAQ A; 1ZL8 A; 4YJ2 A; 1S3J A; 4LFC B; 1H2K A; 4DRX A; 1FKA O; 2WLM A; 4J7Z A; 4FLU A; 1XNR O; 5IJ0 A; 4LFB O; 2B1I A; 2FKX A; 4ZIB A; 2YC0 A; 4FM2 A; 4GLX A; 2UU9 O; 3F7Y C; 2EIK C; 4CS2 A; 3SJQ C; 3T1Y O; 3ZMV A; 4DR1 O; 2WLL B; 1IBM B; 2UXC O; 2DYR C; 1VF7 A; 2WLI B; 1SC5 B; 3JAK A; 1DLB A; 2Z5U A; 3OUF A; 4X64 O; 1IBL B; 1JFF B; 2DE0 X; 1YJW V; 1XI1 A; 3TCU A; 2WLN A; 1D2D A; 3FB6 C; 3CRQ A; 3RYF A; 1Q6H A; 4MTG A; 4H37 A; 3VQY A; 3IFX A; 4YIP A; 4DW0 A; 2OIE A; 4J9Z B; 5EBM C; 4F4L A; 3S3W A; 4JI0 B; 3RVZ A; 3SJB C; 4WFG A; 4O2B B; 1JVM A; 1H2N A; 5FLX N; 2UXN A; 1GN2 A; 1BZK A; 4LH6 A; 2F93 B; 2UXX A; 4WFH A; 1GO3 F; 1YZB A; 1EN5 A; 3QNE A; 2VWK A; 4I7Z B; 1MSW D; 4WBN A; 3RT3 C; 4K0K O; 1N33 B; 4BIZ A; 4J80 A; 4UFZ A; 5LYJ B; 4TT3 G; 3DTU B; 3VQW A; 1ZLZ A; 3KG2 A; 3K0D A; 2JS3 A; 4DO2 A; 1DF4 A; 3K3W A; 4FZ0 A; 4BW9 A; 1GH6 A; 5K1X A; 4DR3 O; 4JYA B; 4FK5 C; 4WFA V; 2BTQ B; 3OUS A; 2FTK A; 4TWK A; 3E83 A; 1JOY A; 4CH5 A; 5B1B C; 4JI8 B; 4KFM A; 5CA0 A; 4CS3 A; 5IE9 A; 1SQX H; 4DUY O; 3JD3 A; 3FAV A; 2Q9L A; 2ZE6 A; 1W2B U; 5KMG B; 2OCC C; 5LP6 B; 3APO A; 1S76 D; 4O4I A; 1Y66 A; 3FYI B; 1FAF A; 3OT7 A; 3VQV A; 1NKD A; 4HBN A; 2WWW A; 4IYH A; 3K79 A; 5DEC A; 2A0L A; 4WFF A; 3TXS A; 1H8E G; 2DJV A; 4MVR A; 1M57 C; 2DOS A; 2YIB D; 4AHC A; 2ZDI C; 4I0X B; 4HAM A; 5EYP A; 3JD1 A; 1XMO B; 1R6K A; 5IY5 B; 1OCZ B; 1F4N A; 2ZE8 A; 2PYL A; 4FIP C; 4JI4 O; 3D36 C; 5BY1 A; 2CUG A; 2M7W A; 5C93 A; 2H8P C; 4TV8 B; 3ZS8 C; 1SKV A; 2A06 H; 1AI4 A; 3K08 A; 3L75 H; 3LUT B; 1NU1 H; 2IH1 C; 2QWP B; 5J2T B; 1VQ6 V; 4X20 B; 1Q7Y W; 1N4C A; 3FB5 C; 1VQL V; 1VEW A; 1Z5V A; 1XMQ B; 5E79 Z; 1K92 A; 1Q90 D; 4RWU A; 1IUR A; 3MHH C; 1M5I A; 4CC5 A; 3H1H H; 1SF9 A; 5FPO A; 1EM1 A; 3ETG A; 3QF7 A; 1ROP A; 3FD9 A; 2P67 A; 1R3K C; 3ABK C; 2DYS C; 5L3E A; 1EBO A; 1OCR B; 1V54 C; 1NBM G; 2PGG A; 2UXD B; 3EVK A; 1H2G A; 1V55 B; 3GVM A; 3MHS C; 1G1X B; 5L3C A; 1BQZ A; 2LQT A; 1LNQ A; 4QNH B; 2ZM6 B; 4CH6 A; 3JAR A; 4YJ2 B; 3CCM V; 4Z2W A; 5B66 Z; 3HPL C; 3CRM A; 1AI7 A; 2WLH A; 1WAZ A; 1AR1 B; 3K5L A; 1JMK C; 1N34 O; 1GN6 A; 1AVM A; 1XIL A; 4JI1 B; 1OHH G; 2JS5 A; 5KUK A; 4DXW A; 2EIM C; 2F95 B; 3SPC A; 3E35 A; 1O9H A; 2KKW A; 1OJH A; 2ETN A; 3E8H A; 5JWP A; 3OTO O; 3CCU V; 4FMT A; 4EFB A; 3F5T A; 5LGU A; 3N27 A; 4K8Z A; 4LF5 O; 5AG2 A; 3Q4H A; 3T4Z A; 3APQ A; 3CRR A; 5CBG A; 5GTI Z; 5LOV A; 4DV3 O; 3CJH B; 1IZ3 A; 5IYZ A; 4Z1V A; 4X88 A; 4X1I B; 1SS3 A; 3CE2 A; 1RPO A; 4D6T H; 3AG4 C; 3O65 A; 3ABL B; 2CDY A; 4TV9 B; 3RYF B; 4JI5 B; 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1TVK B; 1JFF A; 4LR3 A; 1GAX A; 3RVY A; 2R70 A; 3E2E A; 4P30 A; 1QBZ A; 3BPZ A; 2XAJ A; 2LFR A; 3AEI A; 4DV2 O; 4JI7 B; 2EIN C; 4K0K B; 4G28 B; 3RYH B; 2AZ0 A; 3A8T A; 2EJ7 A; 1ZTE A; 4H44 B; 2GTS A; 4J42 A; 2ZE5 A; 4W4K A; 3JD0 A; 1QLE B; 4L8J A; 1KU9 A; 4G27 B; 5JH7 B; 4P9O A; 3T2M A; 1PP9 H; 4O2B A; 4GT1 A; 1SQG A; 1PV0 A; 3ZHU A; 3U11 A; 3CCJ V; 2V4D A; 4PDR A; 4DUY B; 1CEZ A; 4KP4 A; 2P4V A; 4DV0 O; 2ADP A; 3CYO A; 1XRE A; 3ZRV A; 2YDE A; 2YI9 A; 5JJE B; 2O57 A; 4O2A A; 3ZIA G; 2YID A; 2Y69 C; 3JAR B; 1KBH A; 5LYJ A; 3DC5 A; 2QKA A; 3L9D A; 4PEL A; 5H9C A; 4FM0 A; 4EFE A; 4I5S A; 5J9P C; 1J5E O; 2GUZ B; 2VQE O; 2BTQ A; 1M56 B; 3PN1 A; 1KUQ A; 1TUB B; 1RM1 B; 3QO7 A; 2A9H A; 2P5O A; 4MSW C; 5EZY B; 5CA1 A; 5KMG A; 4LFA B; 4DR4 O; 5LP6 A; 5JVD A; 1AJP A; 1AR4 A; 4RUF A; 1QLN A; 3A0B Z; 4UB6 Z; 2HLD G; 2G38 A; 1AB3 A; 4I50 B; 1GN3 A; 2GHY A; 1VQO V; 3BRC A; 4CZZ A; 4I0X A; 4BW5 A; 4JYB A; 4TQD A; 2OIG A; 1AP5 A; 3HKD B; 1XHX A; 3ML0 A; 1ZAU A; 1JCH A; 3I56 V; 3CS5 A; 1W59 A; 5KLV H; 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