The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
46
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structure length |
46
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Chain Sequence |
MRKLSDELLIESYFKATEMNLNRDFIELIENEIKRRSLGHIISVSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Bacillus subtilis
|
| publication title |
Structure and mechanism of Sda: an inhibitor of the histidine kinases that regulate initiation of sporulation in Bacillus subtilis
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Sda
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| total genus |
13
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| structure length |
46
|
| sequence length |
46
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-06-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08970 | Sda | Sporulation inhibitor A |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Sporulation inhibitor A |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D36 C; 1PV0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OR6 C; 5B1B B; 1YF2 A; 4UCV A; 1JR9 A; 3LSQ A; 3KCY A; 4CBC A; 2OYQ A; 4WFB V; 1F7Y A; 2PI4 A; 2DN9 A; 3CME V; 4OGQ B; 2IJJ A; 4LH6 A; 2ZCE A; 1CEZ A; 1S5L Z; 3CJH B; 2UXX A; 4EB6 B; 3THO A; 3ASO C; 4GT1 A; 4X1I B; 5KLV H; 5LOV B; 3CWB H; 4AHC A; 4DUZ B; 1OCZ B; 4DV7 B; 2AGA A; 4JYB A; 2YID A; 4DW0 A; 1D5A A; 4G28 B; 3K9A A; 4U3J B; 1XMO O; 4PD4 F; 3ZS8 C; 2DYR C; 3W7X A; 4J11 A; 3CRC A; 3FYI B; 4QE7 A; 5FPR A; 2BOB C; 2GDS A; 3BPZ A; 1HR0 B; 3B2E E; 4JI2 B; 3ZMV A; 1LR1 A; 4DV4 O; 3C90 A; 1F4M A; 4E2L A; 1Y66 A; 1HNX B; 1ZL8 A; 4JYY A; 2KG7 B; 4O4I B; 1GN2 A; 3QO7 A; 1XMQ O; 2CDY A; 2YC0 A; 3AG3 C; 4YY3 B; 1GM7 A; 1AVM A; 4UCR A; 1OCC C; 2LW7 A; 2Q73 A; 5EZY B; 4I55 B; 1VIB A; 2WLI A; 3LDE A; 3JAW B; 2CTW A; 5ITZ A; 5LGT A; 1YSC A; 3FAV B; 2CH7 A; 3RYI A; 1SQX H; 3LSU A; 5JQG A; 4GZR B; 1MA1 A; 3ABM C; 1Q6H A; 3AK1 A; 1EBO A; 2VWK A; 4HNA B; 3H1L H; 2QDO A; 4B3M B; 3B40 A; 1FYJ A; 3JSL A; 2QKA A; 1XRE A; 3IGA C; 4FZ0 A; 1Q43 A; 3UCS C; 2A3Q A; 4I9W A; 5GON A; 4MW3 A; 5L3G A; 1QU7 A; 3W7W A; 4JI7 B; 1M57 C; 3T1H O; 3I55 V; 2EZO A; 4ZI7 A; 4YJ3 A; 1R3J C; 3PJS K; 3Q4H B; 1TAE A; 2QTO A; 3F7V C; 3K0D A; 3OMA B; 3ZRX A; 1F4N A; 3ZHQ A; 4GX1 A; 1XNQ B; 2WLJ A; 2HEP A; 5B5E Z; 5J2U B; 2FTK A; 3TGU H; 3HPL C; 4O2B A; 1JJO A; 2F43 G; 2YIC A; 1F23 A; 2R70 A; 2LGW A; 4NVP A; 1JFF B; 4X64 O; 3D36 C; 2HJD A; 4TV8 B; 2UU9 B; 3JAS A; 2DQ3 A; 2JVD A; 3SPJ A; 2EIL C; 4ZOL A; 4QPJ A; 2XAS A; 2D3O W; 5A2Q N; 2WPD G; 5JVD B; 1N34 B; 1TVK B; 5JCO C; 4MVM A; 3ZHV A; 3H01 A; 1XIL A; 3W7S A; 1AJQ A; 1URF A; 3N27 A; 4CH6 A; 1WB8 A; 1YJN V; 1G6U A; 4NR1 A; 1QVG U; 3K0G A; 3ZRW A; 3E8B A; 1FPO A; 2Y4U A; 1VQL V; 4TV9 B; 2ATK C; 3BAA A; 5LHH A; 3TXS A; 3LNM B; 2HHH O; 4MW8 A; 1KP3 A; 1MZF A; 2LFS A; 5TIS Z; 5D5Q A; 3HR0 A; 3FYE B; 3K03 A; 2IJI A; 1RFY A; 5LMU O; 2HP8 A; 4JZG A; 5CB4 B; 5KA5 A; 2P90 A; 4UVC A; 3UT5 A; 1WN7 A; 3EXA A; 4N23 A; 3SGI A; 1DGS A; 5LXT B; 5EC1 C; 1TUB B; 1US6 A; 4LF9 O; 1SA0 A; 2XUM A; 1OCO C; 3RYH B; 1FXH A; 2QWQ B; 4J42 A; 4WBN B; 4DRX A; 3ZMU A; 2Q5Z A; 3L72 H; 4UCS A; 5B1O A; 1KB9 F; 4O4H B; 2WLL B; 1V55 B; 4EKW A; 4LFB O; 1TUE B; 3A8T A; 4PJ0 Z; 3HKC B; 3G4S V; 2EUL A; 2V1D A; 2FKX A; 5L3C A; 4W4L A; 1V9P A; 1N4C A; 4JGS A; 3T1Y O; 5K1P A; 2PYJ A; 3CCQ V; 1XL6 A; 5H6Q A; 2VRZ A; 2UXB B; 2ZD9 A; 1FXK C; 4F4L A; 1SF9 A; 1S77 D; 1X4T A; 4CS4 A; 2YSU B; 1AR5 A; 1GN4 A; 4JYC A; 4FMT A; 2QWO B; 5IYZ B; 2CTQ A; 3ZHU A; 2CK3 G; 3DGE A; 4P9O A; 4N21 A; 3T1C A; 2B1G A; 1NR7 A; 2PZS A; 1JPX A; 4HBN A; 4WFG A; 1QLE C; 3ZCC A; 2K9P A; 1ZWI C; 2GTS A; 4J80 A; 4ZIB A; 1PL0 A; 4I0X B; 3CHX A; 4PI2 A; 1N0J A; 2X6C A; 5IY5 C; 4LF5 O; 4J7J A; 1NH2 D; 3SDL A; 1FS0 G; 1AP5 A; 4L87 A; 1B3Q A; 1N33 B; 1MSD A; 1IBK B; 4JZ2 A; 2KSD A; 1GMG A; 1NZ6 A; 1NVP D; 1XNR O; 4NXM B; 4JYA O; 2XND G; 4DV1 O; 1I94 O; 3HKB A; 1BHB A; 4EFB A; 1P7G A; 3R66 A; 1KEC A; 5LGU A; 1O9G A; 1QQC A; 5FNV A; 4I4T A; 4DV5 O; 4UUJ C; 4J41 A; 3JAT B; 3C3S A; 1KMI Z; 4NXN O; 1P7B A; 2L35 A; 3JD0 A; 2YIB D; 4RQE A; 1IDS A; 2A7W A; 1DF4 A; 1K5Q A; 2YIB A; 4JAV A; 1P84 F; 3KKY A; 3E8F A; 2PI5 A; 3F5T A; 3QG5 A; 3HKE A; 4NYK A; 2ITD C; 4X9Q A; 4JI4 B; 3ZN0 A; 2JIZ G; 3JCZ A; 2DWD C; 2P4V A; 4U7N A; 3CC7 V; 1GK9 A; 4JI3 B; 4LNU A; 4DV6 B; 1HNZ B; 4CH5 A; 2NNU A; 2JS3 A; 2FYU H; 4X62 B; 2IJK A; 4CH3 A; 3AG1 B; 5LHI A; 1Z2G A; 3AG4 C; 5K1X A; 5B1B C; 1GAX A; 4JAS A; 4X8A A; 2HG5 C; 4TQD A; 4U7O A; 2F23 A; 1JJ2 U; 1YZB A; 1RSO A; 3D8C A; 2H8P C; 2ZDI C; 2EBO A; 3JAK A; 1K97 A; 4P9P A; 1IBL B; 3HKD A; 4BAY A; 3WFV A; 4PA3 A; 4MVZ A; 4Z1M G; 4DUZ O; 4DV7 O; 1OCZ C; 2OCC B; 5LP6 B; 2IU0 A; 3MD0 A; 3U10 A; 3P3N A; 1S76 D; 3B77 A; 3W7T A; 2HKO A; 2W6I G; 4DR7 B; 3JAL B; 4U3F H; 3EHB B; 3OUS A; 1AB3 A; 2F93 B; 5H5N A; 4B7E A; 4JI2 O; 4I9Q A; 2NLJ C; 1SQF A; 2YXL A; 1LUV A; 1K5S A; 5BXZ A; 1JVM A; 4FLY A; 4FK5 C; 5H9C A; 3KG2 A; 4GX0 A; 2HFE C; 3BHP A; 4YY3 O; 1VQP V; 5J9P C; 3AEI A; 5CA1 B; 4DR3 O; 4JI6 B; 2HVK C; 1FJG O; 3FX7 A; 1VF6 C; 4G27 B; 4X66 B; 2ILM A; 4B3R O; 4OX9 B; 1Q6I A; 3OEE G; 2HR3 A; 2R9A A; 1L0N H; 5J2T B; 4MT8 A; 5B1N A; 2UXC O; 1FAF A; 3OFN G; 2QJ1 A; 2M6Y A; 1N32 B; 4QPK A; 1NBM G; 1QVF U; 4CC6 A; 1QNM A; 3H1H H; 1R6T A; 1QHT A; 2V4D A; 2BCC H; 4X89 A; 4X88 A; 5IJ9 A; 1ZUQ A; 3OT7 A; 5KUM A; 3M99 B; 1K8A W; 5BR8 B; 1NKD A; 5F2V O; 3RVZ A; 1ZX3 A; 4MVR A; 4RQF A; 2DOS A; 5IE9 A; 5LYJ B; 5LGN A; 2X0L A; 5JH7 B; 3N2K B; 3ASN B; 4TUY B; 1VQ5 V; 1XNQ O; 4LWS B; 1MOF A; 2QWP B; 2W0X A; 5KMG A; 4QGP A; 1K3E A; 4F6R B; 3I56 V; 5IYD O; 3RWR D; 2ZXW B; 3OTO O; 1SKV A; 1AR1 B; 4JV5 B; 2F4V B; 1Q90 D; 4GKK B; 3A0R A; 3A0B Z; 2VS0 A; 4I50 B; 3JD1 A; 4E4E A; 2YXH A; 3UM7 A; 1EFR G; 1W0K G; 1L1F A; 2VWJ A; 3K59 A; 2YEV A; 2Z0A A; 1SC5 B; 1WB7 A; 4GKJ B; 1A32 A; 4TWK A; 4PA7 A; 1FFX A; 4O2A B; 2HJF C; 3JD2 A; 3VBB A; 3K5N A; 1N34 O; 2BSK B; 1Y76 B; 2QGN A; 4HYO A; 4FLZ A; 3ZMZ A; 1S5H C; 4FM2 A; 1B6Q A; 1R6N A; 1NR1 A; 4DV3 O; 4XDK A; 5GTH Z; 2XHB A; 3BRC A; 4H44 B; 5JJN B; 3OTF A; 1Q86 W; 3L9D A; 3DXR B; 4YHH B; 5DN6 G; 1I5X A; 1R6K A; 1R3K C; 4IHJ A; 5DM6 V; 3L75 H; 2ZE6 A; 3RYC B; 4IYH A; 2DJV A; 1VQ4 V; 2BTO A; 2IU3 A; 4KP4 A; 3L71 H; 3E2E A; 1BT8 A; 3JCU Z; 4UV8 A; 1IXM A; 4LF6 O; 4H13 B; 2UUA B; 4JF3 A; 3CRA A; 3X2Q B; 2GTA A; 1CXZ B; 3L70 H; 1YIJ V; 3DC5 A; 2X6A A; 4DR1 B; 4L8J A; 4X65 B; 2AZ2 A; 4DV2 B; 3VQX A; 1BMF G; 3OD4 A; 3NXS A; 4Q20 A; 2JJ1 G; 2WLM A; 4XDL A; 5LA6 A; 4GUN A; 3IC9 A; 2F95 B; 4DUY O; 1SQV H; 3ETE A; 2YI9 A; 1PP9 H; 2YS8 A; 4MVS A; 4BW5 A; 4CC5 A; 1MAB G; 4MTO A; 3S3W A; 5H6R A; 4JI5 B; 1WPX A; 2O57 A; 2AXT Z; 3LNN A; 1AI4 A; 1ZL8 B; 2QKS A; 1OCR B; 2YUA A; 2D2C B; 4IGG A; 4F6E A; 2OTL V; 3N2G A; 1NS1 A; 2B9Z A; 2IH3 C; 1IZ3 A; 4IIJ A; 5KAI Z; 1V55 C; 4KHP B; 3CCR V; 2IH1 C; 3SR2 C; 2WLI B; 2ZNJ A; 3K3W A; 3VOU A; 3MHH C; 4O4J A; 3D3Q A; 2CH7 B; 1MZE A; 1WJZ A; 3WB0 A; 3VQV A; 3K57 A; 5JQG B; 3SJA C; 3TJT A; 4LF4 O; 2PF4 E; 4B3T B; 4U3J A; 3BEH A; 1J5E B; 3H1J H; 5E1A C; 4BR6 A; 4GX2 A; 5GON B; 2P6J A; 1PNK A; 4OPH A; 4AQY B; 5LMN O; 3ZRV A; 2ZT9 B; 4ZI7 B; 4YJ3 B; 4UCO A; 4QJF B; 2N05 A; 1IXB A; 5EYP A; 1PNM A; 5L3F A; 2FB5 A; 1YVW A; 1R1B A; 4K0K O; 5LL6 Y; 5IWA O; 3CRR A; 4UCU A; 1K73 W; 5DEC A; 1SQP H; 1WP7 A; 2ZIO A; 4B3S B; 4O2B B; 1LUW A; 3ML0 A; 3JAW A; 1JMK C; 1SRY A; 3UO3 A; 2XAJ A; 2EZP A; 2GSM B; 1EN5 A; 1IBK O; 3K79 A; 3JAS B; 5CA3 A; 4ZOL B; 3M8A A; 1GRJ A; 5IYB O; 2DYS B; 4WFH A; 5KUK A; 4OPA A; 4DR4 B; 1WA8 A; 3RGB A; 2EX3 A; 3K9S A; 4DR2 O; 2UUC O; 1BL8 A; 1BZK A; 1MNG A; 5BMV A; 4LP8 A; 3UQ8 A; 3BFR A; 1YDX A; 2JEU A; 2UUB B; 4LFA O; 3VQW A; 1QR8 A; 1N36 B; 1Q8I A; 3TET A; 3OW2 U; 2EIN C; 1M4U A; 4R8C A; 2BTQ A; 4D7T A; 4X1K A; 5HFL A; 4KFM A; 5B3S C; 3OGC C; 3ZRW B; 1NTZ H; 4KL1 A; 5KHH A; 2W0F C; 2R9R B; 2ADP A; 5B1A B; 1KQS U; 4DV6 O; 3QF7 A; 1H2L A; 3E22 A; 4WCE V; 3B8N A; 3K06 A; 5EIB D; 4UVB A; 4DK0 A; 2JGD B; 5IJ0 A; 1IBM B; 4MTX A; 3P32 A; 3LUT B; 4NTX A; 3AG1 C; 3UT5 B; 1XHZ A; 3ZX6 A; 3MHS C; 1FD9 A; 1KD1 W; 2Z5U A; 2Q6A A; 2XOK G; 4DXW A; 4CS2 A; 3RYF A; 1KKD A; 2KB1 A; 3CP1 A; 4WFE A; 3JAR A; 3A0H Z; 3SYO A; 4JAU A; 4BWA A; 2UXD O; 4WF9 V; 5CN0 A; 3SPH A; 2OCC C; 5LP6 C; 5DED A; 2QWR B; 2A9H A; 4DRX B; 5EK0 A; 4DR7 O; 3ETG A; 3F7Y C; 3ABL C; 2ZE7 A; 1H2M A; 2JEX A; 2YDE A; 2WLN A; 4JI0 O; 1G8M A; 4EFE A; 3MAQ A; 2VQF O; 3GWK C; 1WPB A; 1Y6X A; 4PA4 A; 2XAG A; 4DV0 O; 3A2F A; 3QO8 A; 3RN4 A; 3ZBH A; 1W2B U; 5FPO A; 1M56 C; 3K5L A; 5A9G A; 3CCJ V; 3SYQ A; 3BY6 A; 3T2M A; 3SPI A; 2IJH A; 4DV4 B; 4BW9 A; 1RPO A; 3PN1 A; 3F5W C; 3EVK A; 4J9Y B; 3E83 A; 4GCZ A; 3C3T A; 1O9H A; 1UPG A; 1U97 A; 4DR6 B; 1SES A; 1E1R G; 3P3P A; 1XMQ B; 1DLB A; 1OJH A; 3ZN1 A; 2CGN A; 1GKF A; 4O4L A; 3JSN A; 3E8G A; 3ABK B; 3GVM A; 5BR8 O; 2NN4 A; 3APO A; 3RBZ A; 3SYA A; 1NH2 B; 2GUZ A; 4BIO A; 1HDJ A; 3ASN C; 2P5O A; 1NVP B; 3HKB B; 4JTA B; 1SZT A; 5IYZ A; 4TQF A; 3ZRS A; 2ZXW C; 4JI1 B; 4GKK O; 4I4T B; 1GN6 A; 5KX5 A; 3OGI B; 4Z2W A; 4CH4 A; 1TGO A; 1J95 A; 4AIL C; 3W7U A; 1ORQ C; 4GKJ O; 4ZHQ A; 1ROP A; 5C8Y A; 1BQZ A; 1Z5V A; 2P67 A; 2PYL A; 1OHH G; 4NTW A; 1K33 A; 5CBG A; 3OR7 C; 3RFR A; 4JI8 O; 2EIN B; 1CP9 A; 2JK5 C; 4LNU B; 2QWN B; 5B3S B; 3E8H A; 3JD3 A; 2E3C A; 4IT5 A; 3HB3 B; 2QM7 A; 2ZE8 A; 3ZMT A; 1Q7Y W; 3D3I A; 3STL C; 3D36 A; 3GWO A; 2P7T C; 1NTM H; 1MG1 A; 4ICG A; 4LF8 O; 2JGU A; 4PHZ A; 1RSO B; 4MVQ A; 2CAZ C; 3WG7 B; 2OCH A; 3X2Q C; 5KHJ A; 3JAK B; 1Q5O A; 4IYI A; 1IX9 A; 3HKD B; 2ARH A; 4ZBM A; 2XAQ A; 5JCO A; 4X65 O; 1SQG A; 1W59 A; 5IDJ A; 2YIA A; 3CCV V; 1HNW B; 2UXN A; 4MVU A; 1ZLZ A; 3R65 A; 4BIZ A; 1K4C C; 1M1K W; 5KHG A; 2RQ6 A; 2H3O A; 4LR3 A; 1IUR A; 4FFB A; 2HHH B; 1RP3 B; 2QSA A; 4JPR A; 3J7A U; 2JDI G; 5BY1 A; 1VQ7 V; 2HLD G; 1BSM A; 1UJW B; 5LMU B; 3ABL B; 1BHA A; 1OCR C; 3CCM V; 3U0Z A; 1G4Y B; 1HR0 O; 1BE3 H; 4K3A A; 4KHP O; 3OEH G; 4W4K A; 3WB2 A; 1I7F A; 1HNX O; 2ZNI A; 3ZHT A; 2Y69 B; 5EBM C; 4LF9 B; 2OWO A; 3ZJZ A; 3H1I H; 2GHY A; 4J7Z A; 4LCU C; 5KHI A; 1P4R A; 2OIE A; 4KXR A; 3SPG A; 4FLT A; 4FLV A; 2R72 A; 3VQY A; 1M56 B; 4R7C A; 1EN4 A; 3FB6 C; 4B3T O; 1ENV A; 3SJQ C; 5C93 A; 4LC1 A; 2Q0A A; 3FFQ A; 4LFB B; 3AG2 B; 2KQX A; 2ZIM A; 4AQY O; 1Y74 A; 1KKC A; 5IJ9 B; 2E5L B; 4B3M O; 1XDC A; 2GV9 A; 4FLU A; 5JWP A; 3CCS V; 1MSW D; 4UCT A; 1PL4 A; 3CB2 A; 1H2G A; 4PA6 A; 4JI7 O; 2LP7 A; 2H94 A; 1OV9 A; 3AG7 A; 3K04 A; 5CA1 A; 3OAA G; 1AJN A; 5KMG B; 4LH7 A; 1M9N A; 3I5D A; 3QTC A; 2ITC C; 4FJC C; 1AJP A; 2CUG A; 2ADQ B; 1FXK A; 1HW7 A; 1YI2 V; 2JS5 A; 1U96 A; 1SET A; 3TCU A; 4JAA A; 5CA0 A; 1EN6 A; 4FIP C; 5L3B A; 4YJ2 A; 4D6T H; 2YEV B; 1KP2 A; 3SYC A; 2ETN A; 4OXS A; 2DYS C; 1AI5 A; 2ODM A; 1FFX B; 1N8R W; 2RN9 A; 2W6J G; 1WP8 A; 5EC2 C; 2UU9 O; 4X20 A; 1WLE A; 4PDR A; 5HFM A; 3T4D A; 1PPJ H; 1AR4 A; 2Q7E A; 4LF5 B; 1VF5 B; 2EIM B; 3CD6 V; 4Z1V A; 2Q67 A; 4IHJ B; 4RUF A; 4DK1 A; 4PDL A; 1XNR B; 4JYA B; 4K35 A; 3J80 N; 1M93 A; 2GBO A; 3TXQ A; 2F66 C; 5KAF Z; 3DSQ A; 4DV5 B; 5B1A C; 5LBQ A; 2WA3 A; 4NXN B; 4QNH B; 1NI8 A; 4PA9 A; 2AHZ A; 3K58 A; 2P4K A; 2X7R B; 1KC8 W; 2IBZ H; 5LA6 B; 1EM1 A; 4TT3 G; 3E89 A; 2BOC C; 5EBL C; 2FML A; 1Z5W A; 2XT9 A; 2LO1 A; 4GX5 A; 1V54 B; 2FL4 A; 4J10 A; 5IT9 N; 4XDJ A; 2C2A A; 1T5E A; 1AI7 A; 5GW7 A; 3N2G B; 2VQE B; 4X1Y A; 3BAB A; 4DR5 B; 4K8Z A; 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