The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
54
|
structure length |
54
|
Chain Sequence |
SDAVQRAKEVLEEISCYPENNDAKELKRILTQPHFMALLQTHDVVAHEVYSDEA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Caenorhabditis elegans
|
| publication title |
A General Model for Preferential Hetero-oligomerization of LIN-2/7 Domains: Mechanism Underlying Directed Assembly of Supramolecular Signaling Complexes
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
LIN-7
|
| total genus |
14
|
| structure length |
54
|
| sequence length |
54
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2005-05-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | L27 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y74 A; 1Y76 A; 1ZL8 B; 1ZL8 A; 1RSO B; 1Y74 B; 1VF6 A; 3B40 A; 1Y76 B; 1VF6 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JI0 O; 1PPJ H; 1GM7 A; 1WB8 A; 2YSU B; 1GO3 F; 3G67 A; 4ZIB A; 1W0J G; 3S3W A; 4CS3 A; 4DK0 A; 2WA3 A; 2AZ0 A; 4UVA A; 4RAI A; 3FB7 C; 4CH3 A; 1Q86 W; 1BQ0 A; 2B9Z A; 2Q69 A; 1NU1 H; 3M7M X; 4YY3 B; 4RO2 A; 4JZG A; 2WPD G; 2WSS G; 4QIW F; 4JTD B; 2EIN C; 4IIJ B; 4DV1 B; 1Y76 A; 5KHG A; 4YIP A; 1IUR A; 4FLY A; 1LUW A; 1U96 A; 4CH5 A; 2A9H A; 1YJN V; 4PJ0 Z; 1DK1 A; 1Q6U A; 2NNU A; 1URF A; 4U7N A; 4DV2 B; 1VF5 B; 3ASO C; 1YIJ V; 2WWW A; 3ASO B; 1V9P A; 2HVK C; 4CC6 A; 1XMQ O; 2Y69 C; 3GWK C; 1ORQ C; 4PA4 A; 4KHP O; 1R3L C; 1RPR A; 1KB9 F; 1OCO B; 2QE7 G; 4CH4 A; 3HKC A; 3L74 H; 3FYE B; 2HEP A; 1JR9 A; 2F43 G; 3D36 C; 3SYQ A; 2AXT Z; 4YJ3 B; 3F5W C; 1NQT A; 4DR6 B; 5D5Q A; 3BCC H; 3KG2 A; 1TAE A; 2YIC A; 4I0X B; 2EUL A; 4TQF A; 2E75 B; 4GLX A; 1TUE B; 2IJI A; 4G27 B; 4FLV A; 1XNR B; 4JTA B; 1Z2G A; 3K03 A; 4UCO A; 4RUE A; 3I55 V; 3QTC A; 4TQD A; 4J41 A; 5BMV A; 3UT5 A; 1UPG A; 4BW9 A; 2LP7 A; 4P9O A; 3TXS A; 1JJ2 U; 2XND G; 2DQ3 A; 2ZKO A; 2EBO A; 1E1R G; 1VP7 A; 1MOF A; 4UB8 Z; 3LSU A; 1TA8 A; 4LP8 A; 1SES A; 4NR1 A; 1G8M A; 3JAW B; 1YCI A; 1KKC A; 4O4I B; 2G38 A; 3H1J H; 3VQX A; 3K5M A; 5FNV A; 2BSK A; 2GDS A; 2EJR A; 3C90 A; 4Z2W A; 4O2A A; 4IT5 A; 4WFG A; 4FMT A; 3OUS A; 2PGG A; 4X1K A; 1VQ8 V; 1R6T A; 3OT7 A; 4YJ2 B; 2X0L A; 3RYC A; 2PTM A; 3LNM B; 5B1A B; 3T1Y B; 1N8R W; 1KBH A; 2JK5 C; 3CPW U; 5L3G A; 4LF8 O; 3ZHV A; 3HKB A; 4JTC B; 5IWA O; 3CC4 V; 3AK3 A; 2X6A A; 4EFE A; 1R3I C; 2JS3 A; 5ITZ A; 1SET A; 4GYC B; 1KC8 W; 4OGQ B; 4PV1 B; 4BIZ A; 1IVS A; 2IU3 A; 4ZOL B; 4OX9 O; 5GON B; 3BEH A; 4I5S A; 2O57 A; 2ZM6 O; 3DXR B; 1S3J A; 1FFT B; 3E8H A; 2UUB O; 4DV6 O; 3ABT A; 2UXD B; 1V54 C; 4E2L A; 3B77 A; 2H94 A; 5JJN B; 3AG2 C; 2HFE C; 4WFF A; 3MHH C; 3JAR B; 4JV5 O; 3AG1 C; 3AG1 B; 1I0H A; 1NJI W; 2BCC H; 2QR4 A; 4LF7 B; 3C3T A; 2QKS A; 2KQX A; 2KB1 A; 1Y66 A; 2JJ2 G; 4J7J A; 4JI1 O; 1K3E A; 4UCR A; 1BE3 H; 1VIB A; 1Y74 B; 4HAM A; 3K59 A; 4DV0 B; 3B40 A; 1VF6 A; 2PF4 E; 4LCU C; 3CHX A; 4F4L A; 1K7D A; 4O4H B; 4WF9 V; 1Q82 W; 5DM6 V; 4DR2 O; 3CCV V; 1PM9 A; 3RT3 C; 2YS8 A; 4UFZ A; 2Q0O C; 1SQB H; 1MSW D; 3KKY A; 5H6Q A; 3E8G A; 1MAB G; 2C2A A; 2IBZ H; 4WCE V; 1YF2 A; 5BR8 O; 2QKC A; 4JI7 B; 1PNL A; 4MTG A; 4R7C A; 4GCZ A; 3TET A; 1XMO B; 3OD4 A; 1FXK A; 4LF5 B; 3BHP A; 5JQG A; 1N33 B; 4KUM A; 1XI1 A; 4DV3 O; 3LSQ A; 1WB7 A; 3OMI B; 1XBL A; 1M57 C; 3F7V C; 3FD9 A; 3RGB A; 3PN1 A; 1EM1 A; 3CCJ V; 3CRR A; 3ICX A; 4J42 A; 3KZI Z; 4B7K A; 4ABM A; 3PJS K; 4LNU A; 4DRX A; 1HNX O; 1K97 A; 2AHZ A; 5IYZ A; 2Q7G A; 3T4Z A; 4X20 A; 1X59 A; 5H6R A; 5KAI Z; 4DXW A; 3OR6 C; 1EFR G; 4IL6 Z; 4MVZ A; 3JAK A; 3ZRV A; 3G4S V; 4I55 B; 4QE9 A; 2KSD A; 1YTF D; 4QE7 A; 4GX2 A; 5KX5 A; 4K35 A; 1YJW V; 3BPZ A; 1OCC B; 2BTQ A; 1N0N A; 2GHY A; 2EJ7 A; 1T5E A; 3DTU B; 2VRZ A; 1CP9 A; 4PA3 A; 2GUZ A; 1QR8 A; 4D7T A; 4DR3 B; 4FFB B; 1IBK B; 3ABM C; 1GAX A; 4TUY B; 2ZE8 A; 4JI6 B; 3LNN A; 3SPG A; 1JCH A; 1GM8 A; 1Q5O A; 5J2T A; 2WLL B; 1JVM A; 1Q7Y W; 4EB6 B; 1Q90 D; 1I94 O; 4OXS A; 4X64 B; 4I4T B; 2HLD G; 3OUF A; 1XIL A; 1W0K G; 5GW7 A; 1L8D A; 1RM1 C; 4X89 A; 1RM1 B; 3L75 H; 1F4M A; 5C93 A; 5LHH A; 5BY1 A; 3HPL C; 3RWR D; 1ZAU A; 2P90 A; 4IHJ A; 4YHH O; 5LGT A; 3CD6 V; 5J2U B; 2N04 A; 2LW7 A; 5JJJ B; 3SPJ A; 1MG1 A; 3SJQ C; 1B3Q A; 4DR4 B; 4XDJ A; 1D5A A; 1HNZ B; 4UV8 A; 2OT5 A; 4PA7 A; 3CJH B; 5CA1 A; 4IYH A; 1OCR C; 1R6N A; 1OCR B; 1VEW A; 1SKV A; 1FXH A; 1HW7 A; 3P30 A; 2EX3 A; 2R9A A; 2VQE O; 3GB7 C; 4NTX A; 1VQ5 V; 3OE7 G; 1DF5 A; 1SQP H; 1AVM A; 5E1A C; 1Q81 W; 1LUV A; 3SYP A; 3ZRW B; 1XDC A; 3GVM A; 5LP6 C; 1AI7 A; 4B7E A; 1Y6X A; 3UCS C; 2BTO A; 3H01 A; 4I9Q A; 4FM2 A; 4WFB V; 1CPY A; 1NZ6 A; 4FLZ A; 3QG5 A; 3N27 A; 4X88 A; 1Y67 A; 4MVO A; 4JAA A; 1QLE C; 5A9G A; 1SF9 A; 3AG3 B; 4HZ3 A; 1QLE B; 2B1G A; 1KP3 A; 1N0J A; 3T1H B; 5CBG A; 2WLM A; 3BY6 A; 2DWE C; 1BT8 A; 1TVK A; 2ZE6 A; 1M9N A; 3JCZ A; 5D5P A; 3E83 A; 1I7F A; 4DK1 A; 5KA5 A; 2QSA A; 2R9R B; 4TV8 A; 1QLN A; 2F66 C; 2XT9 A; 4UVB A; 3HKE A; 2AGA A; 2YXH A; 2VS0 A; 5KMG A; 3L73 H; 3SJC C; 1NH2 B; 4HNA A; 2DYR C; 4K3A A; 4L8J A; 2DYR B; 4DW1 A; 3RYH A; 4DR5 B; 2UUC O; 1FJG O; 3WG7 B; 4DYL A; 3UO2 A; 2PZS A; 1YEW A; 3BAB A; 2OIE A; 4LF4 O; 3RBZ A; 3OFN G; 1PL4 A; 2ETN A; 4J80 A; 2BOC C; 5CA0 B; 2YEV A; 4O4J B; 5HFM A; 3LSS A; 1YTF B; 4DUY B; 1XUQ A; 4BAY A; 5LGN A; 3ZN1 A; 3FB6 C; 1VQM V; 3ZED A; 1YSC A; 3K0D A; 5CB4 B; 3L71 H; 5C8Y B; 1A32 A; 3H1H H; 1VQK V; 4GKJ B; 4X1Y B; 4MTO A; 1UJW B; 4B3T O; 4J11 A; 3JAS B; 1KMI Z; 4U3J A; 4X1I A; 2CTQ A; 2HHH B; 2NN4 A; 1S77 D; 3EHB B; 1AIL A; 4LH6 A; 4KXR A; 1Z5V A; 1S0V A; 1FKA O; 2F4V O; 4JYA O; 3ETG A; 1QCE A; 3A0H Z; 4NTW A; 4NXN B; 3HKD A; 3OR7 C; 4YXW G; 3T2M A; 3JD3 A; 3T4D A; 2ZE5 A; 2HJD A; 4DV4 B; 4X62 B; 4JI8 O; 3K3W A; 5B1N A; 4B3R B; 2LQT A; 2LO1 A; 1OCZ C; 3CC2 V; 4K0K O; 2QDO A; 4MTF A; 4B3M O; 3ZBH A; 4WFE A; 2PUS A; 1BHA A; 1WA8 A; 1THZ A; 2UU9 B; 1E1Q G; 3A0B Z; 3K5O A; 2Y0I A; 1IXM A; 1Y76 B; 1VQ4 V; 2F1M A; 2JJ1 G; 1FFX A; 2R72 A; 4D7S A; 4K8Z A; 2RDC A; 4H33 A; 4P9P A; 2V7Q G; 4O4L A; 2ZDI A; 4JI2 O; 1IBM O; 3ABU A; 3G6E V; 1GN6 A; 4F6R A; 2EIN B; 3K06 A; 3ZJZ A; 2XAQ A; 1O9H A; 1SER A; 2Q7H A; 4YY3 O; 5LYJ A; 5LA6 A; 1SZT A; 2CUG A; 4FLW A; 3RYI A; 4JI5 B; 3A8T A; 2P67 A; 1RFY A; 2XOK G; 2CH7 A; 5JCO A; 2CAZ C; 2UUA B; 1XQ8 A; 2Y69 B; 3CEI A; 1XMQ B; 1SA0 A; 3CMA V; 5H5N A; 1WP7 A; 1VQ6 V; 4FM0 A; 2B1I A; 1K9M W; 3D8C A; 2JDI G; 2DYS C; 2BOB C; 1MZE A; 5EBW C; 5BMV B; 2FB5 A; 4AQY B; 3UT5 B; 1XL6 A; 3KCX A; 5AG2 A; 2A79 B; 5GTH Z; 3BFR A; 3BA8 A; 5KA6 A; 2X6C A; 4WFA V; 1OZ0 A; 4XDK A; 2Z3Y A; 2Q7E A; 3ABL C; 5FNV B; 2BSK B; 3CCM V; 4O2A B; 1R73 A; 5LXT A; 2HJF C; 2CTW A; 3RYC B; 4PEL A; 3B8M A; 2IU0 A; 1YZB A; 1JFF A; 4U7O A; 2E76 B; 1H2N A; 4YJ3 A; 2WLI A; 3HKB B; 3BAA A; 1N4C A; 1LNQ A; 5FL7 G; 5DED A; 2NR5 A; 2ILM A; 3DGE A; 3W7X A; 4BR6 A; 1G6U A; 5ITZ B; 3O9O A; 3CSX A; 3SJA C; 4CS4 A; 3J81 N; 3G6B A; 4MVM A; 2YIB D; 1QU7 A; 3P3P A; 2P6J A; 2LJ2 A; 3A0R A; 5EC2 C; 3THO A; 1S5J A; 2QWP B; 4CH6 A; 2BE3 A; 2JIZ G; 1GK9 A; 4LF8 B; 4LF9 O; 4LFA O; 3ZMU A; 1QVG U; 5J9P C; 2PYL A; 1ZL8 A; 1XHX A; 5LMU O; 5FPR A; 2EIM C; 2W6J G; 2EIM B; 4U3F H; 2VQF B; 3CCR V; 4OX9 B; 4AI8 A; 1BSM A; 1AR1 B; 5EZY A; 2ARH A; 2ZM6 B; 3S3X A; 4ZI7 A; 4FLU A; 5LMN B; 1WLE A; 3U10 A; 1V54 B; 4I9W A; 4KL1 A; 2WLN A; 3N2K A; 1PV0 A; 2H8P C; 3AG2 B; 4BIU A; 2X7R B; 5KHH A; 1KEC A; 2RMK B; 2L35 A; 1NR1 A; 1VF6 C; 4OPA A; 2KKW A; 1AI5 A; 4MVS A; 1QQC A; 4TT3 G; 1LR1 A; 3N2G B; 1J5E B; 4YIO A; 1Q6H A; 4LWS A; 3CYO A; 4PA6 A; 4G28 B; 4PHZ A; 3U11 A; 1BCC H; 3M8A A; 4JI1 B; 4DW0 A; 3LUT B; 3ZHQ A; 4D6T H; 3R66 A; 2E5L O; 1GM9 A; 3ETQ A; 2WLH A; 2UXC B; 5B1O A; 1FXK C; 5JQG B; 3JD4 A; 4NXM O; 3JAR A; 5FLX N; 1ZTE A; 1TGO A; 5CN0 A; 3FKS G; 3W7T A; 2LGW A; 1EN6 A; 1IBL B; 1SQG A; 2YID A; 5B5E Z; 4I7Z B; 4CBC A; 4AHC A; 4DRX B; 1YXB A; 2RN9 A; 1Y74 A; 2P4V A; 3AK1 A; 4MW3 A; 2XAS A; 1HR0 B; 5LGU A; 3FAV A; 3H1I H; 5LBQ A; 1M57 B; 4X20 B; 4JYC A; 4H13 B; 1TUB A; 2MK3 A; 1N33 O; 3E22 A; 3L70 H; 3C3S A; 3JAK B; 3QF7 A; 4QPK A; 3CX5 F; 1NH2 D; 5DEC A; 1WP8 A; 1S5L Z; 3ZRX A; 2P7T C; 3ML0 A; 2EIL C; 5KX5 B; 3Q4H A; 1YJ9 V; 1R3K C; 3QO5 A; 4OPH A; 4QJF B; 2OCC C; 2BTQ B; 4RQE A; 2OCC B; 3DSQ A; 4G2K A; 1K4C C; 3K9S A; 3APQ A; 1PP9 H; 4JPR A; 2GUZ B; 2ADQ B; 1GN3 A; 3JD0 A; 1VAR A; 5JVD A; 3QVN A; 2DQ0 A; 5EBM C; 3OTO B; 2ATK C; 4JAS A; 2DWD C; 1S76 D; 2OCH A; 4X8A A; 3AG4 C; 2JEU A; 2AHY A; 4TOI A; 4FVM A; 4W4L A; 2V1D A; 5J2T B; 2ZNJ A; 1KUQ A; 4RUF A; 3HB3 B; 1M56 C; 3SJB C; 4RQF A; 1F7Y A; 4ZHQ B; 4LC1 A; 3KCY A; 2XAF A; 3R65 A; 1P49 A; 5LOV B; 4R8C A; 3ABM B; 2EIJ C; 5L3C A; 2EIJ B; 1OJH A; 2CDY A; 3E89 A; 2A7W A; 1RPO A; 4F6E A; 4DR3 O; 3B2E E; 1SQV H; 1IBK O; 3SGI A; 2OWO A; 4LFB O; 3OW2 U; 1VQO V; 1KKD A; 2HP8 A; 3OMN B; 1K4D C; 5KLV H; 1I94 B; 4I50 B; 4IHJ B; 5B3S C; 2K9P A; 5B3S B; 3CB2 A; 1QHT A; 4BIO A; 4X64 O; 5EC1 C; 4FFB A; 5IJ0 A; 5LHI A; 3TXQ A; 3ASN C; 1BHB A; 3G80 A; 4O2B A; 5CA1 B; 1F4N A; 4R50 A; 4UVC A; 2A06 H; 3B09 A; 2DOS A; 1IX9 A; 3K04 A; 3EVK A; 1GMG A; 1HWY A; 4FZ1 A; 2EIK C; 4YHH B; 5EYP A; 2EIK B; 2AZ2 A; 3CRQ A; 5DN6 G; 3T1C A; 4DV5 B; 1ROP A; 3NXS A; 3EXA A; 4DR1 O; 1XHZ A; 1K5Q A; 5LHG A; 1K92 A; 2CTR A; 4X9Q A; 1ARO P; 2XAG A; 4IGG A; 1IZ3 A; 1HNZ O; 2CGN A; 3B8N A; 1QVF U; 4UCU A; 2M6Y A; 4GT1 A; 1AI6 A; 3STL C; 1YI2 V; 1BL8 A; 1PNM A; 1WJZ A; 3ZMV A; 3IC7 A; 4N23 A; 5B1B C; 4ZBM A; 4GX0 A; 1N34 B; 4FJC C; 5J2U A; 5LP6 B; 2KG7 B; 3RYF B; 3L9D A; 1HP8 A; 3CE2 A; 4P30 A; 5IE9 A; 5JWP A; 4WBN A; 2JGD A; 3VQV A; 2JS5 A; 4NTY A; 1N32 B; 3CJH A; 5EBL C; 3RW0 A; 3F7Y C; 2WAM A; 3OEH G; 3QNE A; 1Q8I A; 4JI4 B; 1AJP A; 2R70 A; 3HKE B; 1RP3 B; 5H9C A; 4H37 A; 5KMG B; 1PL0 A; 1US6 A; 4JI3 B; 2Q0A A; 1NS1 A; 1S5H C; 4DV7 B; 4HNA B; 3UM7 A; 3A2F A; 3W7U A; 4MVR A; 3OAA G; 2IM9 A; 1Z5W A; 5EIB C; 3RYH B; 4MVU A; 3DC6 A; 1HNW O; 3ZRW A; 4LF6 O; 2Q9L A; 1VQN V; 2HR3 A; 2P4K A; 4AIL C; 4LFC O; 1XNQ O; 3U0Z A; 2ZIO A; 3F5T A; 4TWK A; 2B5U A; 1R1B A; 1N36 B; 1WN7 A; 4E4E A; 4PDM A; 3ETE A; 1FD9 A; 3OGI B; 2QM8 A; 2IJK A; 2ZIN A; 2VWJ A; 3I56 V; 4DR7 B; 3CRA A; 3J80 N; 1BGY H; 4A5U B; 1NVP B; 4X66 B; 4U3J B; 4DR5 O; 4HBN A; 4Q6G A; 4QNH B; 2R9I A; 1M90 W; 2DJV A; 2ZR2 A; 2UXB O; 3K5L A; 3JAT A; 1YDX A; 3K0G A; 4NVP A; 4FLT A; 1EZJ A; 2Y4U A; 4DUY O; 1AR4 A; 4GX1 A; 4UV9 A; 3VBB A; 2X6B A; 5IDJ A; 4GKJ O; 2YUA A; 4TV9 A; 4QPJ A; 2RJZ A; 2EZP A; 4WFH A; 2Q6A A; 3ABK C; 4GKK B; 1SZX A; 3CRM A; 5BXZ A; 2QWR B; 2W6I G; 2ZE7 A; 4TSF G; 1FFX B; 2P06 A; 3JAL A; 2QWN B; 3E8B A; 4LH7 A; 3UQ8 A; 5CB4 A; 1OCZ B; 4JI8 B; 4NXN O; 2ZDI C; 1JQ0 A; 1PKX A; 2V4D A; 4O4L B; 2YIA A; 4K0K B; 4DUZ O; 4X62 O; 4B3S B; 4B3M B; 2YI9 A; 4DO2 A; 1RSO A; 4F6R B; 2Y0P A; 2PYJ A; 2QWQ B; 4JI0 B; 2OTL V; 2OYQ A; 5LYJ B; 5LA6 B; 4L87 A; 3WB0 A; 1YVW A; 4X65 O; 1H8E G; 5K1P A; 1SC5 B; 3CXH F; 4J9Z B; 5JCO C; 5LL6 Y; 1VQP V; 2CH7 B; 1AP5 A; 2Y48 A; 1JPX A; 1EBO A; 3K57 A; 4J7Z A; 4JI2 B; 1IBM B; 1SA0 B; 3LDD A; 2JEX A; 3HKC B; 1L1F A; 3JAM N; 5IYD O; 5JH7 A; 5IJ9 A; 1MNG A; 3IJ4 A; 4MSW C; 2QM7 A; 2QTS A; 3P32 A; 4DV1 O; 1GKF A; 1ZX3 A; 4PDV A; 2D2C B; 3CCQ V; 3QO8 A; 2IH3 C; 4NKG B; 3APO A; 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