The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
54
|
structure length |
54
|
Chain Sequence |
SDAVQRAKEVLEEISCYPENNDAKELKRILTQPHFMALLQTHDVVAHEVYSDEA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A General Model for Preferential Hetero-oligomerization of LIN-2/7 Domains: Mechanism Underlying Directed Assembly of Supramolecular Signaling Complexes
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
LIN-7
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Caenorhabditis elegans
|
| total genus |
14
|
| structure length |
54
|
| sequence length |
54
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2005-05-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | L27 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZL8 B; 1ZL8 A; 1Y74 B; 1Y74 A; 1Y76 B; 1Y76 A; 1VF6 C; 1VF6 A; 1RSO B; 3B40 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5JVD B; 3CC4 V; 2VS0 A; 3MAQ A; 5BR8 O; 1PM9 A; 5LYJ B; 2EIK B; 4DV7 B; 1JQ0 A; 4CH5 A; 5FLX N; 3VQY A; 1E79 G; 3SYP A; 3CCQ V; 1JPX A; 3KKY A; 3ABM B; 3BEH A; 3K04 A; 3LNN A; 1XL6 A; 5KMG B; 5IJ9 B; 1S76 D; 3CCL V; 3MDS A; 4HNA B; 5CMU A; 1FJG B; 5IYB O; 3SYO A; 3UCS C; 3QO5 A; 2BOC C; 2ZIN A; 3CD6 V; 2JJ1 G; 3A0H Z; 3P32 A; 2ITD C; 1NU1 H; 4DR3 B; 3JAT B; 1D5A A; 2QDO A; 3A0B Z; 1MZF A; 4DV5 B; 2KG7 A; 4FM2 A; 4NB5 A; 1TAE A; 2ZE6 A; 1WN7 A; 5GW7 A; 5GON A; 2HVJ C; 4DV4 B; 1VQK V; 4X1Y B; 2JGU A; 4QPK A; 1XUQ A; 4UCT A; 4MVZ A; 2OIE A; 5EYP B; 1IVS A; 3CCJ V; 2D3O W; 1VQ6 V; 3RVZ A; 5LGN A; 1SC5 B; 2LO1 A; 1PV0 A; 2GUZ B; 1R1B A; 1YF2 A; 1BQ0 A; 4LF9 O; 1XMQ B; 5IYZ B; 1OCR B; 1KD1 W; 3N2G A; 2CGO A; 4PEL A; 1K34 A; 2HJF C; 4PA3 A; 2KKW A; 1OZ0 A; 2R9I A; 4FPP A; 2ZQM A; 4J80 A; 1N34 O; 4I0X A; 1GN4 A; 2UXX A; 3CXH F; 4DR4 B; 4H44 B; 2P5O A; 4I4T A; 2Y0P A; 2P4V A; 1YVW A; 4A5U B; 1EFR G; 4P9P A; 3W7S A; 3AG1 B; 4DO2 A; 3EVK A; 4WF9 V; 2H94 A; 1GM8 A; 1MOF A; 1EZJ A; 1F4M A; 5FL7 G; 2CTQ A; 3UO2 A; 1URF A; 5LXT A; 1NS1 A; 4I55 B; 1PPJ H; 2EIL C; 4OGQ B; 5JJN B; 3ZRS A; 3AK2 A; 3T2M A; 3LDD A; 1OCC B; 3AG7 A; 3RT3 C; 1YEW A; 3D8C A; 1FXK A; 5D5P A; 1N32 B; 2EIK C; 2LGQ A; 3DSQ A; 4J42 A; 3ZMV A; 3AEI A; 2PF4 E; 5B66 Z; 2FYU H; 1XHZ A; 3QF7 A; 5EBL C; 2YEV A; 3MHH C; 4R6Z A; 1AI4 A; 1YDX A; 1FYJ A; 4O4I A; 4HAM A; 2IJH A; 1I7F A; 2AHY A; 1SQF A; 4GX2 A; 4E4E A; 4RQF A; 1WLE A; 3CRR A; 1DTO A; 4O4J A; 1NTK H; 1K7D A; 3G80 A; 5BZB A; 1SF9 A; 1K92 A; 1V9P A; 4JZ2 A; 1NQT A; 1I5X A; 1AI5 A; 1NVP B; 1P49 A; 4JI2 O; 3CJH A; 2KG7 B; 3D36 A; 4K35 A; 1IZ3 A; 1GMG A; 5GON B; 4YJ3 A; 1VQN V; 4W4L A; 2V4D A; 3LDC A; 2DMX A; 4GCZ A; 4PV1 B; 4JYA B; 2HLD G; 4X65 O; 1KP2 A; 4MW3 A; 1ZL8 A; 3B77 A; 2JJ2 G; 1Q90 D; 1NJI W; 3OTF A; 3QVN A; 3L75 H; 2BTQ A; 2P06 A; 3N2G B; 5B1N A; 5IDJ A; 2Y69 B; 1OCR C; 4N21 A; 4I0X B; 2VWK A; 4X8A A; 2EIJ B; 4BIO A; 4JI3 O; 1E1R G; 4I4T B; 2Q5Z A; 4DK0 A; 3OR7 C; 3K9A A; 4LH6 A; 4J7Z A; 4X20 A; 4YIO A; 1OCZ C; 1M93 A; 3HR0 A; 5CB4 A; 5LXT B; 2DOS A; 2OYQ A; 3JD3 A; 4LF7 O; 2M6Y A; 1HNX B; 2QR4 A; 5BMV A; 1IXM A; 1L0N H; 2OCC C; 4FJC C; 4TV9 A; 1VQ9 V; 1FXK B; 1QLE B; 2Q7H A; 3RW0 A; 5B1O A; 1PNK A; 1A32 A; 2BCC H; 2YEV B; 3G6B A; 4J9Y B; 2K9P A; 4WCE V; 2YID A; 3ZJZ A; 3ZRX A; 4O4I B; 1DLB A; 2Q9L A; 4O4J B; 2MK3 A; 3ABU A; 4LF9 B; 1Z2G A; 2CTP A; 1SZX A; 3I5D A; 1I08 A; 3CE2 A; 4PA7 A; 4AIL C; 4LFA O; 4JYY A; 1KKD A; 1M5I A; 3CJH B; 1N34 B; 2QWP B; 3C90 A; 2LP7 A; 1RFY A; 3A8T A; 4K8X A; 1Q6U A; 5IWA O; 1SET A; 4J9Z B; 4YJ3 B; 4UXN A; 1R3I C; 2A3Q A; 3K5M A; 1QU7 A; 4PJ0 Z; 2XAF A; 4DW1 A; 2JEU A; 1YCI A; 3E8B A; 4MTO A; 4FLW A; 1COW G; 1ZL8 B; 2MW2 B; 3E8G A; 1U97 A; 3B8M A; 4LF4 O; 4MT8 A; 2BTQ B; 5EBW C; 4L87 A; 4GKJ O; 2ZM6 O; 1G8M A; 3N27 A; 2RNB A; 5LOV A; 2Y69 C; 4PDM A; 3RFR A; 1ENV A; 5HFL A; 2L6L A; 5J9P C; 1JOY A; 4X20 B; 3JSN A; 4LFC B; 1KC8 W; 5CB4 B; 1PNL A; 4LFB B; 3ETD A; 3CRM A; 3CSX A; 4CH6 A; 5BMV B; 2ZDI C; 5JCO A; 3OTO O; 3CCS V; 4B3S O; 4YJ2 A; 4TV9 B; 4UVB A; 5LMN O; 2XAQ A; 1Q6H A; 1LR1 A; 3FFQ A; 4LF6 O; 4JI2 B; 3L72 H; 4LF5 O; 1QLE C; 2IBZ H; 1OJH A; 4NXN O; 3L9D A; 1FS0 G; 1HNW O; 1Z5V A; 2OTL V; 4JTD B; 5TIS Z; 1K3E A; 2WWW A; 4X65 B; 1XQ8 A; 3IJ4 A; 5B1A B; 1WPB A; 4JAS A; 4YXW G; 4FK5 C; 3Q4H A; 2F66 C; 1YTF D; 1V54 C; 1SES A; 3SJA C; 1RPO A; 2HFE C; 4KP4 A; 3LSS A; 5CA1 A; 2UUC B; 4JYB A; 4GZR B; 4RQE A; 3SYQ A; 4BW9 A; 3JD2 A; 3TCU A; 1XMO B; 4JI3 B; 4BAY A; 1Y67 A; 1FFT B; 1YZB A; 3QNE A; 1FAF A; 3SPI A; 2DQ3 A; 3C3T A; 2E5L O; 2EIN B; 2HHH O; 1VF5 B; 2R72 A; 4RUE A; 3A2F A; 1BS3 A; 4UCS A; 4O4L A; 5CBF A; 2PYJ A; 3PJS K; 1SRY A; 1AR1 B; 3CPW U; 1JX9 A; 5LOV B; 2YS8 A; 3ABL C; 2B9Z A; 4H33 A; 3ZMS A; 1ZSP A; 3SR2 C; 1JFF A; 4J10 A; 4TQD A; 2NN4 A; 5EBM C; 3LDE A; 1BHB A; 1KUQ A; 2W0F C; 3APO A; 2KSD A; 4XBF A; 4YHH O; 2IU0 A; 1AP5 A; 1LNQ A; 1N0J A; 3FYI B; 3P3N A; 4DK1 A; 2K1E A; 4UB6 Z; 3RVY A; 4Z1V A; 1IUR A; 4UUJ C; 4YJ2 B; 5LHH A; 2UUA O; 1XIL A; 4WFF A; 4LFA B; 3THO A; 3CCR V; 2PI5 A; 5IWA B; 3CRQ A; 4HYO A; 4DUY O; 2QKA A; 4CC5 A; 2DJV A; 4X9Q A; 4EB6 A; 2IJK A; 5IJ0 A; 3ZX6 A; 5LA6 A; 3CRA A; 3AG4 B; 3Q4H B; 1AIL A; 4IGG A; 1CPY A; 3QTC A; 5B1A C; 4U7O A; 4LF4 B; 1HR0 O; 1J95 A; 2BTO A; 1MA1 A; 2Q4P A; 2YIC A; 2AXT Z; 4GKJ B; 4PHZ A; 5CA1 B; 3J81 N; 1Q5O A; 2ZM6 B; 4R50 A; 2HG5 C; 2VRZ A; 4G2K A; 1R73 A; 1V55 C; 4X62 B; 2FB5 A; 2XAH A; 1HP8 A; 2UU9 O; 4DV6 O; 2Q0O C; 3NR7 A; 1VQP V; 3K08 A; 1JMK C; 2EIN C; 3B09 A; 4PA6 A; 4RWU A; 4O4L B; 3SJC C; 1IDS A; 2GDS A; 3E8F A; 1QNM A; 4CH4 A; 4DRX A; 2WA4 A; 3OTO B; 4B3S B; 1GAX A; 1XEQ A; 2EBO A; 3E8H A; 2WLJ A; 1SA0 A; 4IIJ A; 2UXN A; 2QJ1 A; 1OV9 A; 4IT5 A; 4LF6 B; 4GYC B; 1PL0 A; 1CXZ B; 4LF5 B; 1NH2 B; 1W59 A; 5IY5 C; 3ZHU A; 3FKS G; 4IYI A; 4DUZ O; 3RYF A; 2QM8 A; 4JI5 O; 1JFF B; 2XTA A; 1SQB H; 1Q7Y W; 4WFB V; 3CP1 A; 3KCX A; 4ASU G; 1ZX3 A; 3ICX A; 2QGN A; 1DK1 A; 3OUF A; 5JQG A; 1THZ A; 5JCO C; 1QHT A; 5L3C A; 4B7K A; 1EM1 A; 1XI1 A; 2QEX V; 5L3D A; 4CC6 A; 3CX5 F; 1EN4 A; 4MVR A; 2ATK C; 3T1H O; 5KHG A; 2Q68 A; 2E5L B; 2QM7 A; 2WAM A; 4NR1 A; 4EB6 B; 5IJ0 B; 3JD0 A; 4LBE C; 4JAA A; 4JYC A; 3BA8 A; 4DV2 O; 5LA6 B; 3JAS A; 1XNQ O; 1WP8 A; 2OT5 A; 5LP6 C; 5FPR A; 1P84 F; 2A0L A; 4J7J A; 3BRC A; 3RWR D; 3AG4 C; 4QE7 A; 2W6I G; 1VQO V; 1YHQ V; 4UV9 A; 4WBN A; 5CBH A; 4FLX A; 2P22 C; 4U7N A; 3OE7 G; 3OMN B; 4JTC B; 1KEC A; 4JI0 O; 3RYI A; 3BVO A; 2XT9 A; 1R6T A; 2A79 B; 2ZR2 A; 2F95 B; 2QM4 A; 3ABT A; 3J80 N; 1QVG U; 1JR9 A; 3D3I A; 4GT1 A; 4ZOL A; 2QE7 G; 4B3M O; 3OT7 A; 3HKB A; 2CTW A; 2PI4 A; 1IBM B; 1N36 O; 4YHH B; 2UXD O; 3ETG A; 1RSO A; 4DRX B; 3ZED A; 1S5L Z; 4MVM A; 1SA0 B; 2F23 A; 4IIJ B; 1WNS A; 3GB7 C; 2Y0I A; 3JAK A; 1FXV A; 3OGC C; 1TGO A; 1Q3E A; 4O2B A; 3SGI A; 4DUY B; 2XAG A; 1W2B U; 3F5T A; 1JVM A; 3RYF B; 3U11 A; 3UT5 A; 3LSQ A; 4JAV A; 2VQF O; 3FB6 C; 2X6B A; 4OX9 B; 4X88 A; 4JI6 O; 4JPR A; 2VQE O; 1JCH A; 5CA3 A; 1GO3 F; 4WFG A; 4B7E A; 1HR0 B; 5B1B C; 2CDY A; 1SQG A; 5JQG B; 1AB3 A; 5L3G A; 2JIZ G; 1MG1 A; 2FL4 A; 1UPG A; 3ML0 A; 3OUS A; 3SYA A; 4DV0 O; 4DV1 O; 1VF6 C; 1W0J G; 4MTG A; 1F51 A; 3P3P A; 1XNR O; 2KQX A; 5LHG A; 1FPO A; 4DV6 B; 2UU9 B; 3ASO C; 3JAS B; 5LGU A; 4TQF A; 1S77 D; 3FYE B; 1NVP D; 1AVM A; 4TOI A; 1NTM H; 2IH1 C; 4G27 B; 2EIM B; 1RP3 B; 4WBN B; 2Q67 A; 1GTO A; 3LNM B; 2O57 A; 1WB8 A; 3ABM C; 3RYI B; 2QWO B; 2IJJ A; 2V1D A; 3BAA A; 3STZ C; 4JI8 B; 2DN9 A; 3VQV A; 4JI5 B; 4DUZ B; 3UM7 A; 4NXM B; 4RAI A; 4ZOL B; 3H1H H; 3HKB B; 1TVK A; 1NI8 A; 3O9O A; 2Q73 A; 1RSO B; 1F23 A; 3SJQ C; 1TUB A; 1VAR A; 2F43 G; 4PDR A; 4B3T O; 2YIB A; 2IW5 A; 3K59 A; 1Y4M A; 2YSU B; 3JAK B; 2XHB A; 4UB8 Z; 4PI2 A; 4UCR A; 1VQL V; 4O2B B; 3T1H B; 1K33 A; 3UT5 B; 5BXZ A; 3VOU A; 3IC7 A; 1NR7 A; 3RBZ A; 5L3E A; 5BR8 B; 5E79 Z; 4B08 A; 1XNQ B; 1O9H A; 2WPD G; 2Q7E A; 1VQ8 V; 2DWE C; 1R6K A; 1GN3 A; 2BSK A; 2QKC A; 4I7Z B; 4Z2W A; 2F4V O; 2CK3 G; 2R9A A; 1YI2 V; 4ZI7 A; 2W6J G; 2NR5 A; 1M90 W; 3ZCC A; 4AI8 A; 3AG1 C; 3CME V; 4B3M B; 1SS3 A; 3AG2 B; 2UUB O; 1TUE B; 2EX3 A; 2RMK B; 4QJF B; 5A2Q N; 2ZNJ A; 1N36 B; 2UXD B; 2A9H A; 1OCC C; 3H9V A; 2DYR B; 4UCU A; 2EUL A; 3QO8 A; 2PZS A; 2YXL A; 5H5N A; 4DW0 A; 3L71 H; 3GWO A; 5HFM A; 1MNG A; 4NTW A; 5IYD O; 3F7Y C; 3TET A; 3HPL C; 4GKK O; 3OW2 U; 2HR3 A; 5CN0 A; 1VIB A; 4CS2 A; 4FLT A; 1TVK B; 2Q6A A; 1ZLZ A; 2X6C A; 5JJE B; 5J2T A; 4Z1M G; 4PA9 A; 2HJD A; 2VQE B; 3SPJ A; 5K1X A; 1RM1 B; 1XDC A; 2Q8V A; 5B3S B; 2X0L A; 1TUB B; 4X64 O; 3OMI B; 3AG3 B; 1R3K C; 4TSF G; 1Q6I A; 3E86 A; 5DED A; 1VP7 A; 1VQ5 V; 4CBC A; 1H2S B; 5L3F A; 2RQ6 A; 3N2K A; 4MVQ A; 2E75 B; 2Q7G A; 4DV0 B; 3U10 A; 2LFR A; 4DV1 B; 2ADQ B; 2DYS B; 3HKC A; 3RYH A; 5IYC O; 1VF7 A; 1ARO P; 4KHP O; 1XNR B; 1ZUQ A; 2EJ7 A; 2DE0 X; 1H8H G; 5KHI A; 1HNZ O; 4JGS A; 4NYK A; 1EN6 A; 5K1P A; 2BSK B; 2JEX A; 2YXY A; 4U3J A; 1M4U A; 1K5S A; 3C3S A; 4BW5 A; 4QPJ A; 1L1F A; 4ZI7 B; 2AHZ A; 4GLX A; 2EIJ C; 3AK3 A; 3OR6 C; 3DXR A; 1M57 B; 3OEE G; 4B3R O; 3GWK C; 3TGU H; 2LW7 A; 2JRI A; 3UO3 A; 1KB9 F; 1SQQ H; 1L8D A; 4BIU A; 3WB2 A; 3STL C; 1X4T A; 2YI8 A; 3OD4 A; 3EFF K; 1FXK C; 4JAU A; 4KFM A; 5KAF Z; 1AR4 A; 1R3J C; 2DYR C; 4UV8 A; 3L73 H; 2PYL A; 2UXB O; 2F1M A; 2QWQ B; 4UVC A; 4AHC A; 3K3W A; 5C8Y A; 5J2T B; 1YIJ V; 2QTS A; 1BCC H; 2Z5U A; 1OCO B; 4EKW A; 2F4V B; 5CBG A; 2YDE A; 1JJ2 U; 3CB2 A; 3CCU V; 3N2K B; 3AG3 C; 3ZRV A; 3D36 C; 3M8A A; 3FB8 C; 4DR6 O; 3FB5 C; 1PNM A; 1GM9 A; 1H2L A; 3HKC B; 4RUF A; 3RYH B; 4QNH B; 1PP9 H; 1QR9 A; 2AGA A; 2DYS C; 2ZNI A; 1NR1 A; 1X59 A; 3CCM V; 1Q82 W; 4LF7 B; 4UCV A; 4Q6G A; 4JZG A; 3CC2 V; 2ZD9 A; 1VQ7 V; 2UUB B; 5B5E Z; 4DR1 O; 1FKA O; 2XND G; 1EN5 A; 2CTR A; 4U3J B; 2Y48 A; 4FM1 A; 4G28 B; 3HB3 B; 3BPZ A; 4DR2 O; 5LL6 Y; 1S0V A; 2OCH A; 4LF8 O; 2ZIO A; 3K03 A; 4JI7 O; 3DXR B; 3DGE A; 3G67 A; 2YUA A; 1DF4 A; 1SKV A; 1Y6X A; 4GKK B; 1BSM A; 3IC9 A; 2YIA A; 3W7T A; 1JA8 A; 2Q69 A; 1QBZ A; 2B1G A; 1BZK A; 2CUG A; 4X64 B; 1K97 A; 4KXR A; 5EIB C; 4D6T H; 3JYC A; 3KZI Z; 3IGA C; 2HVK C; 1Q81 W; 4TUY A; 3B40 A; 1IBL O; 4LNU A; 5AG2 A; 3P30 A; 1GM7 A; 3SPC A; 4ZKI A; 3FD9 A; 2BOB C; 1NBM G; 1M56 B; 4KHP B; 3IAY A; 1FXH A; 1XL4 A; 2EJR A; 4GUN A; 4IL6 Z; 5C8Y B; 3H1J H; 2YC0 A; 3ASN B; 2FTK A; 2ZR3 A; 1K8A W; 4FMT A; 1NH2 D; 5F2V O; 4FLZ A; 3M7M X; 1NT2 B; 4F6E A; 2UXC O; 5FNV A; 5GTI Z; 4GX0 A; 4ABM A; 4FLY A; 3AK1 A; 2AZ0 A; 4OPH A; 3F5W C; 1WAZ A; 3M99 B; 2HKO A; 5ITZ A; 4B3R B; 4ICG A; 4WFA V; 5LMU O; 2RDC A; 4DV3 O; 5C93 A; 2N74 A; 1Y74 A; 4EFB A; 4CZZ A; 3TJT A; 4P2Z A; 5LMN B; 2L35 A; 3F7V C; 1LUW A; 4NXN B; 2Y4U A; 2DQ0 A; 1BHA A; 4N23 A; 4X66 O; 1BQZ A; 2ADP A; 4EFE A; 1HNW B; 3ZRW A; 4YIP A; 1N32 O; 3BAB A; 2DWD C; 1Q8I A; 4MVU A; 3JSL A; 4UCO A; 2ZE7 A; 4TT3 G; 1XRE A; 5KAI Z; 2M7W A; 4I9W A; 1SER A; 2YXH A; 1WP7 A; 4JTA B; 1H8E G; 4X89 A; 2XOK G; 3O65 A; 2XUM A; 1R6N A; 3SPG A; 1B3Q A; 3WB0 A; 5J2U A; 3RYC A; 3K0D A; 3X2Q B; 4FM0 A; 4XDL A; 1MSD A; 3JCZ A; 3CEI A; 4TUY B; 4LNU B; 4H13 B; 4MVS A; 2ZE5 A; 4DR6 B; 2ETN A; 1S3J A; 2HHH B; 1CP9 A; 1M9N A; 2ZKO A; 2JS3 A; 1VMG A; 2P4K A; 4JI1 O; 1YIT V; 3B4S A; 3B8N A; 1M56 C; 1YJN V; 2GV9 A; 5DM6 V; 1XOU A; 3CS5 A; 1NTZ H; 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