The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
87
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structure length |
87
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Chain Sequence |
PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRALIEKLGIR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
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| total genus |
31
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| structure length |
87
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| sequence length |
87
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| O | PF00312 | Ribosomal_S15 | Ribosomal protein S15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | S15/NS1, RNA-binding |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5A2Q N; 5BXZ A; 4DV0 O; 1G1X B; 2JRI A; 4LF5 O; 4LF6 O; 4DV4 O; 5FLX N; 1AIL A; 4AQY O; 4LFC O; 4X64 O; 1XEQ A; 2UXC O; 4X66 O; 1I94 O; 4JI2 O; 4GKK O; 4DR6 O; 3R66 A; 1HNW O; 1N32 O; 4X65 O; 4GKJ O; 2N74 A; 1YZB A; 2VQE O; 1IBK O; 3O65 A; 1J5E O; 4DUY O; 1KUQ A; 4OPA A; 4JV5 O; 2HHH O; 1FKA O; 2F4V O; 2AGA A; 3F5T A; 4JI7 O; 4X62 O; 3OTO O; 4JI1 O; 4B3S O; 4JI4 O; 1X59 A; 4KHP O; 2ZKO A; 4LFA O; 3J81 N; 4JI3 O; 4OPH A; 2UUB O; 4JI5 O; 5H5N A; 4B3T O; 2Z0A A; 2UUC O; 2UUA O; 2ZM6 O; 4DV5 O; 1HNX O; 1R6T A; 3J80 N; 2E5L O; 4OX9 O; 1HR0 O; 1N36 O; 5IWA O; 4LF7 O; 1XNR O; 4DR1 O; 4DR7 O; 4DR4 O; 1FJG O; 3JAM N; 5BY1 A; 1IBL O; 4DV7 O; 4DR3 O; 5LMN O; 1N34 O; 4DV2 O; 4NXN O; 2LW7 A; 3RT3 C; 5BR8 O; 4LF8 O; 2DOS A; 4B3M O; 2UU9 O; 1DK1 A; 4DV1 O; 1XMO O; 4DUZ O; 1AB3 A; 1D2D A; 4DR2 O; 4NXM O; 1XNQ O; 1A32 A; 3T1H O; 4LF4 O; 3M8A A; 4JI0 O; 3T1Y O; 1R1B A; 4DV6 O; 1NS1 A; 5LL6 Y; 4YHH O; 4JI8 O; 4DR5 O; 1HNZ O; 1IBM O; 4DV3 O; 4JI6 O; 1XMQ O; 4JYA O; 5IT9 N; 2DJV A; 4B3R O; 3J7A U; 4YY3 O; 4A5U B; 1F7Y A; 1FYJ A; 4K0K O; 4LFB O; 5LMU O; 2UXB O; 3SDL A; 2FKX A; 2VQF O; 2UXD O; 4LF9 O; 1N33 O; #chains in the Genus database with same CATH topology 1US6 A; 1GN6 A; 3D36 A; 1CXZ B; 4FLV A; 2PGG A; 1VQ7 V; 1NVP D; 3BA8 A; 1AI6 A; 2E5L B; 2ZIM A; 1SA0 A; 5H2F Z; 3TXS A; 4XDJ A; 5BMV A; 4CS2 A; 1OJH A; 2CH7 B; 3B09 A; 2OCC B; 3CC2 V; 5JJJ B; 5KLV H; 5B1O A; 3JAS A; 5BR8 B; 1R6N A; 4PA3 A; 3CCR V; 4U7N A; 1Y74 B; 4RQE A; 1QBZ A; 4LF4 B; 3HKC A; 1GM7 A; 3G71 V; 2Q67 A; 4YHH B; 2Q4P A; 2HJD A; 2UXX A; 1XQ8 A; 4IT5 A; 3EHB B; 4B7E A; 4NYK A; 3UO3 A; 2MW2 B; 1FJG O; 1VQ5 V; 3BCC H; 4JAS A; 4ICG A; 3FB5 C; 5LMN O; 5KHI A; 2QM4 A; 4LFB B; 1ZL8 A; 4E4E A; 4MW8 A; 5LBQ A; 3OFN G; 1SES A; 4DV0 B; 4LF6 B; 4DR2 O; 2QM8 A; 1PPJ H; 4NXM O; 4PHZ A; 4FZ1 A; 2LFR A; 3M8A A; 3P32 A; 1BQ0 A; 2Z3Y A; 3ABL C; 3OUF A; 5LL6 Y; 4GKK B; 4JGS A; 2HVK C; 5IY5 C; 2W6I G; 2R9A A; 4G2K A; 1XDC A; 4MSW C; 4UCV A; 5CN0 A; 4UB8 Z; 1DTO A; 1ZAU A; 2ZXW B; 1AJP A; 1JX9 A; 1F7Y A; 4FZ0 A; 2IH3 C; 3BPZ A; 5KA5 A; 3TXQ A; 3RW0 A; 3LSU A; 2PF4 E; 2IM9 A; 3SYQ A; 1WA8 A; 2KG7 A; 4TV8 B; 4JI5 B; 2UUB B; 5B3S C; 2JRI A; 3QTC A; 3UT5 B; 2YEV B; 4LFC O; 5CA0 A; 4X64 O; 3CXC U; 4Z2W A; 1S5J A; 5KMG B; 3U11 A; 3RYC B; 1VQ6 V; 1ZUQ A; 2QWO B; 4DR6 O; 1QR9 A; 2AZ2 A; 1SF9 A; 4I0X A; 1Y76 B; 4GKJ O; 3AG3 C; 1MA1 A; 3G67 A; 3VQY A; 1DLB A; 2ZQM A; 2HFE C; 2F4V O; 3A0B Z; 3F5T A; 3S3W A; 2UU9 B; 4LNU B; 3BA9 A; 1RPR A; 2CK3 G; 3RN4 A; 4D7T A; 2OTL V; 1QLE C; 4J9Z B; 4GLX A; 5IJ0 B; 4LWS B; 1O9H A; 3GWK C; 1B3Q A; 5H5N A; 3ZHV A; 5DEC A; 3RYF A; 2AHZ A; 1Q90 D; 3ASN C; 3C3T A; 2DYS B; 1AJQ A; 4OX9 O; 1N36 O; 5LXT A; 5GTH Z; 4MT8 A; 3OR6 C; 1M57 C; 4J41 A; 1IBL O; 1BZK A; 5CB4 B; 3LDE A; 4ZHQ B; 1P4R A; 1WPB A; 1GKF A; 4DV2 O; 2UXB B; 2QKA A; 1K5Q A; 1FXK C; 1PKX A; 3GB7 C; 2YID A; 4DV1 O; 5DED A; 1D2D A; 3CJH B; 1HWY A; 2WLJ A; 1H8H G; 4H0L B; 2KSD A; 5K1X A; 4K8X A; 4UV9 A; 3FD9 A; 1M9N A; 2Q6A A; 1GM9 A; 2DWE C; 4QPJ A; 4UCU A; 2G38 A; 2ZNI A; 1QQC A; 3W7X A; 4LR3 A; 1J5E B; 4AIL C; 3SJC C; 1AR1 B; 1VMG A; 3HKD B; 4JZ2 A; 1S5H C; 2YIB D; 3W7T A; 4WFB V; 4I55 A; 4WFH A; 1N33 O; 4I50 A; 4FK5 C; 4TUY B; 2QA4 V; 3LDD A; 4LF5 O; 1XL6 A; 3K59 A; 3WG7 C; 4F6R A; 4X66 O; 4J80 A; 1E1R G; 3ABK B; 1QNM A; 2DQ0 A; 1FS0 G; 1HDJ A; 5CBG A; 1XUQ A; 2P5O A; 4CC5 A; 1MG1 A; 4EB6 A; 1SA0 B; 4DUZ B; 4X62 O; 5EYP A; 3KZI Z; 2LW1 A; 5BMV B; 4JYB A; 1SQF A; 4GYC B; 3F7V C; 5HFL A; 3L74 H; 4JI3 O; 4DV6 B; 1AI5 A; 2EX3 A; 2LGW A; 3ZHQ A; 1TA8 A; 3ZHT A; 5EZY A; 1W59 A; 4MW3 A; 3ZRS A; 1R3K C; 4I4T A; 4DV7 O; 3MAQ A; 1HP8 A; 2BOC C; 1BGY H; 1GH6 A; 4FLY A; 2UXN A; 3JD3 A; 3AG1 B; 4LF9 B; 1RSO B; 1VQK V; 2VRZ A; 2QM7 A; 5FNV B; 4UVA A; 1AB3 A; 4PDR A; 2QKC A; 2IH1 C; 3CXH F; 4X1K A; 3TCU A; 3HKB A; 2YIC A; 4O2A A; 3B8M A; 1P84 F; 5L3D A; 1WLE A; 3OGC C; 3K79 A; 1IZ3 A; 3UCS C; 1BHA A; 4ZBM A; 4I9Q A; 4A5U B; 1S77 D; 2DMX A; 3G80 A; 5GTI Z; 1NTZ H; 4B3S B; 3BHP A; 4JI4 B; 2V1D A; 1I5Y A; 2YIB A; 4LFA B; 1AI7 A; 3JD2 A; 3DGE A; 3L72 H; 4TSF G; 5IYZ B; 4G27 B; 2L6L A; 3JAR A; 5CBF A; 1DF4 A; 3FB6 C; 1VAR A; 4PA7 A; 3N2G B; 1CP9 A; 1L8D A; 2IW5 A; 4X65 O; 1YIT V; 2Q9L A; 2ZE8 A; 1CPY A; 4GX1 A; 4DUY O; 4LCU C; 4Q6G A; 3OGI B; 1NTM H; 1KP2 A; 3OMA B; 2V4D A; 2PY5 A; 1DF5 A; 1S3J A; 2N04 A; 3A0R A; 3RBZ A; 3T1Y B; 1QVF U; 5JJE B; 1Y67 A; 1HNX O; 1GMG A; 4FLT A; 1IBM B; 3OEH G; 2E75 B; 4DK0 A; 2Y69 B; 2RNB A; 4JI6 B; 3RYH A; 2PYL A; 4JYA B; 2XND G; 4N21 A; 5LYJ A; 2Q68 A; 1ZTE A; 4K0K B; 5JQG A; 1K34 A; 1F51 A; 4TV9 A; 1JVM A; 2DOS A; 4B3M O; 5DN6 G; 3CSX A; 1PL0 A; 2YXL A; 5DM6 V; 2ADP A; 1K33 A; 2F95 B; 1IUR A; 4CC6 A; 4O2B A; 2YIA A; 3IC7 A; 1SQB H; 1P7B A; 3U0Z A; 2LP7 A; 1N32 B; 5EBL C; 4DV3 O; 3ZIA G; 4FLU A; 4P2Z A; 2EIK B; 1XOU A; 3T4D A; 2DJV A; 3E8G A; 4CBC A; 1K73 W; 4Z1M G; 2IJI A; 1MMM A; 2XAG A; 3AG2 C; 4R6Z A; 2ODM A; 4I9W A; 3M99 B; 2ATK C; 3H1L H; 3QG5 A; 4B3T B; 3ZMU A; 4DV4 O; 1FPO A; 4CS4 A; 1OCO C; 3MDS A; 4X20 A; 2WA4 A; 1KMI Z; 4DR7 B; 4DR4 B; 3FYI B; 3JAW A; 1PNM A; 2RN9 A; 5LOV A; 3SPC A; 4I55 B; 2HP8 A; 4DW1 A; 2N74 A; 3K9A A; 1SKV A; 2R9R B; 1KUQ A; 4CH4 A; 1Z5V A; 1VQM V; 2F1M A; 1JFF A; 3K03 A; 1XRE A; 2MK3 A; 1ARO P; 3JYC A; 4DV5 O; 1R6T A; 1JPX A; 3UKM A; 4JI8 B; 3DXR B; 3VQX A; 4EFB A; 5F2V O; 4FM0 A; 4KL1 A; 4LF7 O; 3RVZ A; 1I5X A; 4QPK A; 5EYP B; 2WLI A; 3ABL B; 3K04 A; 4BIZ A; 1Z2G A; 5EC1 C; 3N27 A; 4ZKI A; 1UFI A; 4NXN O; 5IY5 B; 5LA6 A; 2JDI G; 4YJ2 A; 3I55 V; 4MVQ A; 4ABM A; 3QNE A; 4NKG B; 4JYC A; 5H6R A; 3ETD A; 3HKE B; 3CWB H; 5L3F A; 1OCC C; 3QVN A; 4UFZ A; 3FKS G; 3AK3 A; 5B3S B; 2EJ7 A; 3G6B A; 5KHK A; 1GM8 A; 1W0J G; 2OCH A; 5K1P A; 3JCZ A; 2QWP B; 2GUZ A; 4X1K B; 4GT1 A; 2ZDI A; 3FAV B; 4GUN A; 3HR0 A; 4O2A B; 1JCH A; 3SDL A; 4LP8 A; 3ZED A; 3THO A; 3AG3 B; 4RQF A; 5A2Q N; 1QR8 A; 1N8R W; 5GW7 A; 2Z5U A; 5EIB C; 3ASO C; 3D3I A; 5L3E A; 3E83 A; 3K5M A; 1QLE B; 5IJ9 A; 2ZR3 A; 2EIL C; 5LHH A; 1FJG B; 1LUV A; 2BE3 A; 4H37 A; 1BSM A; 5LMN B; 3Q4H B; 1I08 A; 2JGD B; 4ZI7 A; 2PUS A; 1M57 B; 2C2A A; 2IU3 A; 4QIW F; 3A8T A; 1BL8 A; 3JAR B; 3SPH A; 2QEX V; 4DR2 B; 2ZIN A; 4NXM B; 1Q81 W; 2LO1 A; 1FXK B; 2UUC O; 2X6B A; 2QWQ B; 4UVB A; 3KCX A; 2X6C A; 3CPW U; 5IYC O; 4DR1 O; 5JVD A; 4R7C A; 1KC8 W; 3CMA V; 1GO3 F; 2ZNJ A; 2WLM A; 1M5I A; 1LNQ A; 2BTQ A; 1N34 O; 3X2Q C; 2X0L A; 3ABM C; 1PM9 A; 1I0H A; 3AG4 B; 3K57 A; 1G6U A; 2ZR2 A; 1YDX A; 2EIJ C; 2OT5 A; 3RYH B; 1M1K W; 3VOU A; 4ZOL A; 4LFC B; 1GAX A; 4X64 B; 1VP7 A; 4O4I A; 5LYJ B; 1YI2 V; 1GRJ A; 1YHQ V; 2GSM B; 2CUG A; 5J2T A; 4MVR A; 3STL C; 4DR6 B; 3WFV A; 1VQN V; 2GHY A; 4BW5 A; 3PN1 A; 1NJI W; 4TV9 B; 2CTP A; 5D5Q A; 1YCI A; 4GKJ B; 3WG7 B; 1R3L C; 1WB8 A; 3ABU A; 3B77 A; 2Q73 A; 3K3W A; 2F4V B; 4DK1 A; 1YTF B; 4O2B B; 4J11 A; 4FLX A; 1Q6I A; 3LSS A; 1W0K G; 1ZWI C; 1YJW V; 1KEC A; 3DC6 A; 2A79 B; 1N0N A; 3CME V; 4FPP A; 1Q6U A; 4OX9 B; 1N36 B; 1XHZ A; 2UXC O; 4UVC A; 1D5N A; 5KHG A; 4WBN A; 1IBL B; 3F7Y C; 3JAT A; 3C90 A; 1XL4 A; 2YS8 A; 4Z1V A; 4RWU A; 3LNN A; 2PZS A; 4DV2 B; 3C3S A; 2VQE O; 1AR4 A; 2EIN C; 1COW G; 2HHH O; 1FKA O; 2GTA A; 3CCS V; 4DV1 B; 4IIJ B; 3ETQ A; 4JI7 O; 3ZN0 A; 2QGN A; 1Q86 W; 4FFB A; 3WB2 A; 5LOV B; 4OPH A; 2P7T C; 4MVZ A; 1NI8 A; 2UUA O; 3P3N A; 1K7D A; 1FD9 A; 1SQV H; 2K1E A; 3RYI B; 3SYC A; 1TVK A; 3CC4 V; 2Y4U A; 5J9P C; 4DR3 O; 3E2E A; 2A0L A; 3T4Z A; 5C8Y B; 5A9G A; 4L87 A; 1N33 B; 3CP1 A; 4CH3 A; 1M56 C; 3TJT A; 5GON A; 1XMO O; 4LF5 B; 3ZRV A; 1A32 A; 2WLI B; 3LDC A; 5IYB O; 4X66 B; 2WLH A; 1MZE A; 2GBO A; 5LGN A; 3N2K A; 1G4Y B; 3SJQ C; 4HZ3 A; 3ML0 A; 2Q7E A; 1WNS A; 3CYO A; 4X62 B; 2VQF O; 4B08 A; 1JOY A; 2JGU A; 4JI3 B; 4O4J A; 5BXZ A; 2OWO A; 1IXB A; 2NN4 A; 2IJJ A; 5LGU A; 2DQ3 A; 2Q8V A; 5KAF Z; 4AQY O; 3K08 A; 1OCZ C; 1SER A; 4DXW A; 2GUZ B; 4RUE A; 1T5E A; 4O4H A; 4MVS A; 3CRM A; 1JQ0 A; 4DV7 B; 3E8B A; 2JJ1 G; 2DE0 X; 5EBM C; 1HNW O; 2IJH A; 3SPI A; 4X88 A; 4DW0 A; 2OIG A; 1H2K A; 1J95 A; 1L0N H; 1Q7Y W; 4FM2 A; 4NR1 A; 4QGP A; 4J7K A; 5KA6 A; 1WN7 A; 1ZSP A; 2CTR A; 4IHJ A; 4FVM A; 3L73 H; 4JPR A; 3JAL A; 1OZ0 A; 1PP9 H; 2XUM A; 4ZI7 B; 2QJ1 A; 1KD1 W; 1EZJ A; 2ZIO A; 1EFR G; 2Y48 A; 3KG2 A; 2YXY A; 1HR0 O; 2ILM A; 3DC5 A; 1IXM A; 3I5D A; 4NTW A; 3SPJ A; 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3E8H A; 3CC7 V; 2LW7 A; 1B6Q A; 4KXR A; 3OAA G; 1QU7 A; 2ZDI C; 2EUL A; 4K3A A; 5B1N A; 1NKD A; 4I0X B; 3ZS8 C; 4DV4 B; 4YIP A; 1XNQ O; 2CH7 A; 3T1H O; 2K9P A; 3ZMV A; 1EN4 A; 2W0X A; 1R1B A; 3G6E V; 1MOF A; 4G28 B; 1NS1 A; 4RAI A; 1CEZ A; 4K35 A; 3BY6 A; 2JK5 C; 1Q8I A; 2F43 G; 3ASO B; 4UCT A; 4DR5 O; 4JAU A; 3SPG A; 2Q5Z A; 1XMQ O; 5GON B; 3OD4 A; 4B3R O; 3RYF B; 2NLJ C; 4PI2 A; 1S5L Z; 3STZ C; 3SYA A; 5LXT B; 2AW9 A; 1S0V A; 4NTX A; 4X8A A; 4JF3 A; 5LMU O; 3CX5 F; 5H6Q A; 4DV5 B; 2H3O A; 3RVY A; 4LF7 B; 3CCE V; 5KHH A; 1I94 O; 3CE2 A; 2XOK G; 3R66 A; 3T1C A; 1PNL A; 2IBZ H; 2W0F C; 1WJZ A; 4J7J A; 2R70 A; 2H8P C; 4NXN B; 4FMT A; 4L8J A; 2Q69 A; 4J7Z A; 4JV5 O; 3K0D A; 2ITD C; 4O4H B; 1NZ6 A; 1F23 A; 3X2Q B; 3ABM B; 4KHP O; 1R3I C; 3J81 N; 4WFG A; 3SR2 C; 4AHC A; 1B04 A; 1X4T A; 1G8M A; 3J80 N; 2EIJ B; 3NXS A; 4I50 B; 5IWA O; 3JSN A; 3JAL B; 4TV8 A; 1BMF G; 4F6R B; 3BFR A; 4UUJ C; 4BW9 A; 5CBH A; 1VF6 A; 3UT5 A; 2YEV A; 4JI0 B; 3E22 A; 3AK2 A; 2JS3 A; 3UM7 A; 2AZ0 A; 2GTS A; 1KKD A; 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