The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
87
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structure length |
87
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Chain Sequence |
PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRALIEKLGIR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| total genus |
31
|
| structure length |
87
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| sequence length |
87
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| O | PF00312 | Ribosomal_S15 | Ribosomal protein S15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | S15/NS1, RNA-binding |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4B3R O; 1N32 O; 4DR1 O; 4LF6 O; 4JI7 O; 1F7Y A; 4OPA A; 2UXB O; 4OPH A; 4B3M O; 4YHH O; 1HR0 O; 5FLX N; 4JI4 O; 3F5T A; 2FKX A; 1N33 O; 5IWA O; 1YZB A; 4DR2 O; 5LMN O; 1N34 O; 4NXM O; 1R6T A; 4B3T O; 4DV7 O; 1DK1 A; 1AIL A; 2N74 A; 2UUB O; 4X62 O; 5BXZ A; 1IBL O; 4GKJ O; 4X66 O; 4JI3 O; 2LW7 A; 4JI2 O; 4LF9 O; 3RT3 C; 3M8A A; 4JI1 O; 4DR4 O; 1XMO O; 2UUC O; 3J80 N; 4GKK O; 4NXN O; 4JI8 O; 4X65 O; 5A2Q N; 2ZM6 O; 4JV5 O; 1AB3 A; 4OX9 O; 1XNR O; 4LF7 O; 2F4V O; 3J7A U; 1I94 O; 3O65 A; 1HNX O; 1XEQ A; 4YY3 O; 4K0K O; 2UXC O; 1N36 O; 1HNZ O; 4DV6 O; 4LF8 O; 4X64 O; 3J81 N; 4DV5 O; 4DR5 O; 4JI0 O; 1IBM O; 2UU9 O; 5BR8 O; 2DOS A; 1G1X B; 3JAM N; 3T1H O; 4DUY O; 4DV2 O; 2ZKO A; 4DR6 O; 4LF4 O; 4LFA O; 3SDL A; 4DV3 O; 4DR7 O; 5IT9 N; 1D2D A; 5H5N A; 1J5E O; 5BY1 A; 1FKA O; 3T1Y O; 1KUQ A; 1HNW O; 2AGA A; 2UXD O; 4KHP O; 1FYJ A; 4A5U B; 2JRI A; 1A32 A; 4LF5 O; 2VQF O; 4DV4 O; 2E5L O; 2DJV A; 3R66 A; 1X59 A; 5LL6 Y; 4JI6 O; 5LMU O; 2VQE O; 1XMQ O; 4DUZ O; 4DR3 O; 4DV0 O; 4B3S O; 4JI5 O; 4LFC O; 1XNQ O; 4DV1 O; 2Z0A A; 2UUA O; 1IBK O; 4JYA O; 1FJG O; 4LFB O; 4AQY O; 1R1B A; 1NS1 A; 3OTO O; 2HHH O; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Y66 A; 2YEV A; 1IBK B; 4TV9 B; 2FKX A; 2JJ1 G; 1VQ8 V; 1EN4 A; 2QWN B; 2QWR B; 1AJP A; 1Q43 A; 1LR1 A; 3UQ8 A; 1BHA A; 2YI9 A; 4GLX A; 1RM1 C; 1H2G A; 1TUB B; 1OCO B; 3K08 A; 4CH3 A; 2PI4 A; 1ROP A; 1N4C A; 2Q7H A; 3ZCC A; 4PI0 A; 1QR8 A; 3WB0 A; 3GVM A; 2CDY A; 4JAS A; 4L8J A; 2FML A; 4X65 O; 5A2Q N; 3VQX A; 2P7T C; 4UV9 A; 4OX9 O; 4DUY B; 4UCO A; 3T4Z A; 1Q5O A; 1THZ A; 3AG3 B; 2A06 H; 3CCE V; 3M7M X; 3CYO A; 5L3C A; 5FPO A; 1IXB A; 3EXA A; 1KYO F; 1HNX B; 2VQE B; 3L73 H; 3QO8 A; 1GO3 F; 1SQF A; 2NNU A; 5KHH A; 4R6Z A; 5IJ0 B; 2GTS A; 1AR1 B; 1KUQ A; 1HNW O; 3DC6 A; 3RWR D; 4D7S A; 1IXM A; 3ZRW A; 3DSQ A; 2ZIM A; 4WFH A; 4YJ3 A; 4UB8 Z; 4H37 A; 3C90 A; 4X1I B; 4LF5 O; 3E89 A; 4CZZ A; 2E5L O; 5LA6 A; 5LL6 Y; 3CCJ V; 2F1M A; 1FXV A; 1L8D A; 5GTH Z; 1XNQ O; 4DV1 O; 4O2B B; 4B08 A; 1QQC A; 3CB2 A; 2WWW A; 4MW3 A; 2EIM C; 2XAF A; 5JWP A; 1Q7Y W; 3ASO C; 2EIN B; 4DR1 B; 3ZHR A; 1BS3 A; 1NS1 A; 2LQT A; 3AG7 A; 5IDJ A; 2KG7 A; 4FFB A; 3GB7 C; 3AK1 A; 4J80 A; 4HZ3 A; 1Q82 W; 3WG7 C; 2W6J G; 2CGN A; 2ZCE A; 4DW0 A; 5IY5 C; 5JH7 A; 3F5T A; 2F43 G; 2N05 A; 4ZI7 A; 2CTW A; 4ZOL B; 3SJB C; 1RPR A; 1R6T A; 1RP3 B; 3BFR A; 4UXN A; 3CC4 V; 1GMG A; 2JS3 A; 3CEI A; 3W7S A; 4X66 O; 2JDI G; 3RYH A; 2EIK C; 1XHX A; 2NN4 A; 2BTQ A; 2KKW A; 4I0X B; 3UO2 A; 4NXN O; 1H2N A; 2Q0A A; 2HHH B; 4DV2 B; 3E83 A; 5EBW C; 1O9H A; 1IBM B; 3RYI A; 4UCU A; 4WFB V; 4YY3 O; 1N36 B; 1W59 A; 2Q6A A; 4ZIB A; 2BCC H; 1N36 O; 2XOK G; 1VAR A; 4JI5 B; 2KG7 B; 4NR1 A; 2DOS A; 2E5L B; 4CH6 A; 4DV2 O; 4DR6 O; 1UPG A; 5IYB O; 3ZX6 A; 2YI8 A; 4X1K A; 2HR3 A; 3OFN G; 4YXW G; 4J10 A; 2YID A; 4X66 B; 4NB5 A; 3CSX A; 4J7Z A; 1JJO A; 3BAA A; 3ETG A; 2RQ6 A; 5EBL C; 5LGU A; 3VBB A; 2M6Y A; 3A0H Z; 2WAM A; 5CBH A; 2GTA A; 4X20 A; 4WCE V; 1G4Y B; 2AW9 A; 2YIB D; 2ETN A; 3D3I A; 3OAA G; 5KMG B; 3BHP A; 4DR1 O; 4OPH A; 4PA6 A; 3AK3 A; 2DWD C; 1PNM A; 1S5J A; 3LDE A; 2F23 A; 3U11 A; 3OM3 B; 2VWK A; 1I7F A; 1KBH A; 5GON A; 4BIU A; 1IX9 A; 2PY5 A; 2IW5 A; 3K9S A; 3K5N A; 3ZMZ A; 4KFM A; 4LF5 B; 1N33 B; 4Z1M G; 4NYK A; 2QJ1 A; 4O4J B; 5JJJ B; 2UXB B; 1H2S B; 4DR4 O; 4C7U A; 3NR7 A; 3UCS C; 1Z2G A; 4JPR A; 5EC1 C; 2OYQ A; 3ZED A; 4CS4 A; 4PDL A; 5CA1 A; 2DMX A; 1ZLZ A; 4IHJ B; 4JZ2 A; 1HP8 A; 3STL C; 4LP8 A; 2RDC A; 1U97 A; 3GWK C; 1W2B U; 4TV8 B; 4BAY A; 4LF8 O; 4IHJ A; 1RPO A; 1SES A; 4LWS A; 5IYC O; 1H38 A; 4X1Y B; 4DUY O; 3OUS A; 4DV3 O; 1N0J A; 1W0J G; 2Q7E A; 4FLX A; 3CCV V; 1J5E O; 5BY1 A; 5F2V O; 5L3G A; 2DN9 A; 1B3Q A; 3CRM A; 4LF4 B; 1WB8 A; 3CPW U; 1QHT A; 4PHZ A; 1KKD A; 3H01 A; 5LMU O; 4LFC O; 1O9G A; 1ZX3 A; 5KLV H; 3JD2 A; 2GV9 A; 1IBK O; 3G71 V; 5LYJ B; 2EUL A; 1S3J A; 4D6T H; 3HKC B; 5KUM A; 2A7W A; 1IUR A; 3ZS8 C; 3G67 A; 3JAR A; 1YTF D; 3JSN A; 5L3B A; 4R7C A; 4X1Y A; 2ZIN A; 2R9A A; 3LDC A; 1BZK A; 4X20 B; 1SQX H; 1Y74 B; 4JI4 O; 1PV0 A; 5JVD B; 5IYZ B; 5IWA O; 1YZB A; 4LFC B; 4CC5 A; 1EN6 A; 2EJR A; 3CE2 A; 2LW1 A; 3ZBH A; 3CCS V; 5FPR A; 4MVR A; 2Q69 A; 4F6R A; 1K3E A; 3CRA A; 2P5O A; 5IE9 A; 4D7T A; 5KA6 A; 2HVJ C; 2DWE C; 2WLI B; 2MW2 B; 1PPJ H; 3EFF K; 1XL4 A; 4W4K A; 3U0Z A; 2YSU B; 3J80 N; 2Q0O C; 4DV3 B; 3CRQ A; 1FS0 G; 2BTO A; 1NTK H; 3P3P A; 3EHB B; 5KUK A; 4QJF B; 3OW2 U; 4LF8 B; 3ABL C; 5E79 Z; 2CE4 A; 3ZIA G; 2ZQM A; 1E79 G; 2JEU A; 4K0K O; 2IJI A; 3AEI A; 2LGQ A; 5CN0 A; 3E8H A; 2XND G; 1NH2 B; 4NVP A; 3SDL A; 1V54 B; 1M56 C; 2EIJ B; 4TQF A; 1K73 W; 4TV9 A; 4DR4 B; 5IY5 B; 1PM9 A; 2AGA A; 3L74 H; 4I4T B; 3FYI B; 4LCU C; 3CC7 V; 2NLJ C; 1M56 B; 2EIJ C; 3CS5 A; 2BE3 A; 4TT3 G; 3SPI A; 3R66 A; 5GTI Z; 4KUM A; 1QCE A; 5B5E Z; 4B3S O; 1SQV H; 5AG2 A; 2XTA A; 2QKC A; 2ZNJ A; 1P7B A; 2WLL A; 1FJG O; 4I0X A; 2OIE A; 1KC8 W; 2QTS A; 3JAK B; 2BOB C; 4O2A B; 1ZSP A; 1BCC H; 3OD4 A; 4H33 A; 4KL1 A; 2ZR2 A; 4FVM A; 2X6A A; 1K97 A; 2JGU A; 4K3A A; 5B66 Z; 4UVC A; 2ZE8 A; 4O4L A; 4I9Q A; 3VQV A; 4MTG A; 1R3K C; 1NT2 B; 2HJF C; 4DO2 A; 4WBN B; 4JI6 B; 1VQP V; 1Y76 A; 4WF9 V; 4NTY A; 2HFE C; 1DK1 A; 1WLE A; 2N74 A; 4BR6 A; 1EFR G; 1D5A A; 3JAT A; 2PGG A; 4EB6 A; 3JAW B; 2IH1 C; 4JI2 O; 4ZKI A; 3RT3 C; 3M8A A; 4JI1 O; 3I5D A; 4B7K A; 3CX5 F; 1XMO O; 5KHI A; 4LNU B; 1FFX A; 4HNA A; 3THO A; 4O2B A; 1KB9 F; 1YTF B; 1K4C C; 4XDL A; 2WLI A; 3F7V C; 3ZJZ A; 1TVK A; 4KP4 A; 2UUA B; 2A3Q A; 4J9Y B; 4FM2 A; 4YY3 B; 4PI2 A; 4DV6 O; 1KMI Z; 3ABM C; 1IBM O; 5CA0 A; 3K5O A; 4FLT A; 3CXH F; 1KEC A; 3T1H O; 2PZS A; 5LP6 B; 1VP7 A; 4PDV A; 3K0G A; 4NXN B; 1Y74 A; 5EZY B; 2LO1 A; 4I9W A; 1NQT A; 2UUC B; 1QVF U; 3OMI B; 4PA9 A; 4JAA A; 2B5U A; 4FPP A; 4TUY B; 3W7X A; 4TOI A; 1OV9 A; 1ORQ C; 1YEW A; 3RW0 A; 3BAB A; 1SQB H; 1FPO A; 2BTQ B; 1PD3 A; 5D5P A; 2CH7 B; 5CB4 A; 1F51 A; 2ZDI A; 1XNR B; 4CH5 A; 1RM1 B; 5LOV A; 2GBO A; 4G27 B; 4ASU G; 2ITD C; 3CCU V; 2QSA A; 3RVY A; 3AG4 B; 1F7Y A; 3JCU Z; 1LUW A; 5K1P A; 2H94 A; 3K0D A; 2Y0I A; 5EYP A; 3DGE A; 4EFB A; 1XNQ B; 1GH6 A; 1OCZ C; 1N34 B; 3C3T A; 2XAG A; 3CP1 A; 2B1G A; 3RYH B; 4AHC A; 2IM9 A; 4JYY A; 4DRX A; 3LDD A; 1NTM H; 3W7U A; 2P4K A; 1KU9 A; 1HNW B; 1URF A; 3CCQ V; 3QVN A; 1NVP B; 4JYC A; 1H2K A; 2OIG A; 1SRY A; 4X1I A; 3AG4 C; 3HR0 A; 1HNX O; 1QLN A; 4JYB A; 3WB1 A; 2NR5 A; 4RQF A; 1R6K A; 1NBM G; 1YI2 V; 3E86 A; 2Q7G A; 4FMT A; 4X64 O; 2JIZ G; 2F66 C; 4LF7 B; 3JAM N; 2ZKO A; 4U7N A; 2HEP A; 4X65 B; 5ITZ A; 1MA1 A; 2Y4T A; 1KKC A; 2FTK A; 2UXD B; 2XAS A; 2JJ2 G; 1E1R G; 4UVA A; 2KSD A; 1SER A; 5KHG A; 2VWJ A; 3ETE A; 1FYJ A; 3JD3 A; 2UUB B; 4A5U B; 5GW7 A; 2XUM A; 1T5E A; 5FL7 G; 3B8M A; 4DUZ O; 5IJ9 B; 4DR3 O; 4DV0 O; 3IC9 A; 1VQM V; 2GUZ B; 2OCH A; 1VQ4 V; 2UXX A; 2GDS A; 5DM6 V; 4LFB O; 4DK0 A; 3SYA A; 1GKF A; 1I94 B; 2GUZ A; 3NXS A; 3E8B A; 3ABM B; 2ZM6 B; 4ZI7 B; 2FYU H; 4PA7 A; 2HP8 A; 2Y69 C; 4AQY B; 1WP8 A; 4JI7 O; 1JMK C; 2W6I G; 1HWY A; 1VQ9 V; 4TUY A; 2EIK B; 4YHH O; 3CXC U; 1GM9 A; 5J2T A; 1PP9 H; 1WB7 A; 2R70 A; 3E35 A; 1CP9 A; 4DR2 O; 3ZRX A; 3KKY A; 5KHK A; 2B1I A; 1VQN V; 1Q86 W; 1QBZ A; 3LNM B; 2X7R B; 3HPL C; 3OMA B; 1CPY A; 1WPB A; 1GN6 A; 1YHQ V; 3G6E V; 2CAZ C; 3ABT A; 3LNN A; 4PD4 F; 1NH2 D; 4JV5 O; 4P9O A; 4BIZ A; 4U3F H; 2AXT Z; 3J7A U; 5BR8 B; 4MTF A; 3ZMU A; 2PI5 A; 2R72 A; 3MHS C; 1IZ3 A; 4ZHQ B; 1YXB A; 4JTC B; 3IC7 A; 3X2Q B; 2L35 A; 4DR5 O; 3KCX A; 2K9P A; 2QM4 A; 5B3S B; 4DV4 B; 2ZDI C; 4XDK A; 1D2D A; 4WBN A; 2KQX A; 2IU3 A; 3L75 H; 4UCR A; 3L71 H; 2P6J A; 2HJD A; 3PJS K; 3ZRV A; 2CTP A; 3ZHS A; 2RCV A; 2V1D A; 3A0B Z; 3FYE B; 1M57 B; 1XBL A; 3QF7 A; 1YJ9 V; 5H2F Z; 4MW8 A; 2VQF O; 4B3T B; 3RN4 A; 1R6N A; 4EFE A; 2WLK A; 2ZIO A; 4DV5 B; 3FB6 C; 3JSL A; 2DYS C; 2C2A A; 4F6E A; 1HR0 B; 4B3M B; 2QR4 A; 1DF5 A; 1DLB A; 1GM8 A; 2OTJ V; 1JJ2 U; 2YUA A; 4LF6 B; 1XOU A; 1LNQ A; 3ZRW B; 4TWK A; 1S5L Z; 2KB1 A; 1I0H A; 3ZHT A; 4B7E A; 3JD0 A; 4OPA A; 3S3X A; 3K59 A; 5L3E A; 3ZHV A; 1IBL B; 1MNG A; 1KP2 A; 5C8Y B; 3S3W A; 2LJ2 A; 5IJ9 A; 5LMN O; 5B1A B; 3W7W A; 1FAF A; 5CA0 B; 3APO A; 1GN2 A; 3CRC A; 1FD9 A; 1YJW V; 3AK2 A; 4YIO A; 3SJQ C; 3M99 B; 3HKD B; 5KMG A; 3D36 A; 1V9P A; 2ZD9 A; 3AG1 C; 3N2G B; 1OCR C; 4GX2 A; 5FNV A; 2CTR A; 3AG2 C; 1NR7 A; 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5L3F A; 3TXQ A; 1JOY A; 4JI0 B; 1AR5 A; 5CBF A; 3RFR A; 3ABK C; 3ETD A; 1HNZ O; 1FXK B; 4DV5 O; 5JJE B; 3FX7 A; 3AG3 C; 1HW7 A; 3X2Q C; 1K8A W; 5B1N A; 4O4I A; 4LFA O; 2R9I A; 2Y69 B; 3B4S A; 4JI8 B; 5IT9 N; 4OGQ B; 3H1L H; 1GTO A; 1ZUQ A; 3FFQ A; 3BPZ A; 3TK1 A; 4KHP O; 4X62 B; 2Q4P A; 3AG1 B; 1B6Q A; 3OR6 C; 4QE7 A; 3P32 A; 3IAY A; 4DR5 B; 1VQK V; 1SZT A; 2EZO A; 2HG5 C; 3OUF A; 4WFA V; 5ITZ B; 5B3S C; 4TSF G; 1J95 A; 2RMK B; 4X1K B; 1XHZ A; 1DGS A; 1E1Q G; 4DK1 A; 4JV5 B; 3LSQ A; 3MHH C; 3H1I H; 4IYH A; 5J2U B; 4X9Q A; 3OTO O; 1PKX A; 1F4M A; 2IU0 A; 1M90 W; 2Q68 A; 1FXK A; 5B1B C; 2E75 B; 2WLM A; 4GCZ A; 1TUB A; 3QNE A; 4QPJ A; 2LP7 A; 3AG2 B; 2V4D A; 1WAZ A; 4JYA B; 4OXS A; 2IH3 C; 3WFV A; 4I7Z B; 4UCT A; 1F4N A; 1G8M A; 3OE7 G; 5BMV B; 1I5X A; 4EEQ A; 4ZHQ A; 2ZXW B; 2D3O W; 1P49 A; 4TV8 A; 4MVO A; 4U3J A; 4YHH B; 4RQE A; 1LUV A; 4JI3 O; 1SET A; 3HKB B; 5B1O A; 4UB6 Z; 3JAT B; 1S5H C; 2YIA A; 3T4D A; 2P90 A; 4CS2 A; 1QNM A; 1MG1 A; 2DW4 A; 3RYC A; 1I94 O; 1BE3 H; 1QVG U; 4LFB B; 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