The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Bos taurus
|
| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
|
| total genus |
30
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YS8 A; 2N05 A; 2DN9 A; 2LO1 A; 1BQ0 A; 1XBL A; 2QSA A; 1HDJ A; 2PF4 E; 4RWU A; 2CTQ A; 1IUR A; 3UO2 A; 2DMX A; 3UCS C; 2Y4T A; 1GH6 A; 3UO3 A; 1WJZ A; 2N04 A; 2QWN B; 2QWQ B; 2QWR B; 2GUZ A; 2QWP B; 1NZ6 A; 1FAF A; 2EJ7 A; 2CTP A; 2Y4U A; 4J80 A; 1N4C A; 3APQ A; 2CTW A; 3APO A; 1BQZ A; 2CUG A; 4J7Z A; 4IT5 A; 2CTR A; 2QWO B; 2M6Y A; 2GUZ B; 2YUA A; 3AG7 A; 2LGW A; 1FPO A; 2OCH A; 2L6L A; 2KQX A; 3BVO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ZR2 A; 1MOF A; 4QE9 A; 3LSS A; 4PA3 A; 1B06 A; 1HWY A; 1QBZ A; 1WB7 A; 4BWA A; 2EIL C; 1K4D C; 1MSD A; 2UXX A; 1JPX A; 4K8Z A; 2X0L A; 4J9Z B; 4MVR A; 1MSW D; 2OTJ V; 3CP1 A; 5JVD B; 1SQV H; 2ZE7 A; 3J81 N; 1GAX A; 2P90 A; 2QSA A; 2QA4 V; 4BR6 A; 1JOY A; 4KUM A; 1XNR B; 2EIK C; 3CCJ V; 3QO5 A; 4DXW A; 5JWP A; 4JTC B; 2CH7 B; 1VQN V; 1JJO A; 5JCO A; 4FLX A; 3E8F A; 3S3W A; 4DV1 O; 5DN6 G; 2D2C B; 2QWO B; 4JTA B; 2OCC B; 4X20 A; 2FKX A; 4NXM O; 4WFH A; 4QPJ A; 3B4S A; 3OMI B; 3K9A A; 5BR8 O; 2VWJ A; 4YIP A; 3ZMS A; 3AG2 C; 1JR9 A; 1Q6U A; 4KXR A; 2Y0P A; 3MD0 A; 2VS0 A; 1N33 O; 1ZTE A; 2Q6A A; 3ABL B; 3JAT B; 1JFF A; 3JD2 A; 3D3I A; 5KHG A; 1F23 A; 1GN4 A; 1QR9 A; 4OX9 B; 1GRJ A; 4DV6 O; 4TV8 B; 1AJQ A; 1R73 A; 1NR7 A; 1YIT V; 2KKW A; 4X64 B; 2FTK A; 2QEX V; 4I55 A; 1I0H A; 3N2K B; 3JAT A; 1O9H A; 2XAF A; 4DR6 O; 1XMO O; 1FAF A; 1DF5 A; 1FD9 A; 3ZS8 C; 4UCT A; 1FYJ A; 3DXR B; 3E89 A; 4JI6 O; 4C7U A; 3AG7 A; 4UVC A; 1RSO B; 3N2K A; 2JS5 A; 4G27 B; 2JS3 A; 3CHX A; 2N05 A; 1HW7 A; 2E76 B; 4FIP C; 3QO7 A; 2EIN B; 1H2M A; 2HVK C; 3K9S A; 2G38 A; 4DV3 B; 1OCO C; 2CTP A; 2RN9 A; 1IX9 A; 4DUZ B; 2RQ6 A; 3TXQ A; 4A5U B; 4BIU A; 1YJ9 V; 4B3S O; 2P5O A; 1Q8I A; 4P9O A; 1YDX A; 4FPP A; 4RO2 A; 1M57 B; 4J9Y B; 2B1G A; 2CAZ C; 4GZR B; 2E5L B; 3CWB H; 1L8D A; 1UFI A; 5BZB A; 2XTA A; 1B04 A; 4H37 A; 4JAU A; 4R8C A; 1K92 A; 3RBZ A; 5CA1 B; 4R50 A; 1HR0 O; 2QE7 G; 4ABM A; 3ABL C; 1WB8 A; 2LGW A; 2Y0I A; 3EVK A; 1NR1 A; 5LYJ B; 2UXC O; 3AG3 B; 1HDJ A; 5L3B A; 4X65 O; 1KP3 A; 4LFA O; 3K5M A; 3UO3 A; 3ZRV A; 1SS3 A; 2YXY A; 3JSL A; 5LYJ A; 3SYO A; 4B08 A; 4QGP A; 2BOB C; 4J7Z A; 4K0K O; 4Q6G A; 2UXD O; 2JEX A; 3WB2 A; 2L35 A; 4FM0 A; 4Z2W A; 5J2T B; 5KHH A; 4MVM A; 5LHG A; 4QE7 A; 1R3I C; 2ZDI A; 4O4J B; 4I9W A; 4I4T B; 4ZIB A; 1NVP D; 1QQC A; 1Q6H A; 1TA8 A; 2LJ2 A; 2BTQ B; 3LDC A; 4AIL C; 1Y66 A; 4JI2 O; 2EIN C; 3ABM B; 5KUM A; 1DGS A; 1IDS A; 2BCC H; 5LP6 A; 1AJP A; 4D6T H; 3SJB C; 2BE3 A; 5LMU B; 1NTZ H; 3UQ8 A; 3ABK B; 2CGO A; 4I0X B; 2CDY A; 4DR1 O; 4NTW A; 1J5E O; 1F7Y A; 1BSM A; 3OW2 U; 1WP7 A; 1FXK A; 3X2Q C; 3A0B Z; 3T2M A; 3ASN B; 1GN2 A; 5EYP B; 4IHJ B; 4JI3 B; 5KLV H; 3HKC A; 4O4L B; 1EN4 A; 3ZMZ A; 3KCX A; 2XT9 A; 3CSX A; 3SJQ C; 1F51 A; 2QKC A; 4LF5 B; 3HKD A; 3BY6 A; 4JPR A; 4O2A B; 4X64 O; 4JV5 O; 3KCY A; 2H8P C; 1GH6 A; 4O4L A; 2PI5 A; 2E3C A; 2HFE C; 2N74 A; 4JF3 A; 3MAQ A; 1JA8 A; 3ETQ A; 4P30 A; 2ZM6 O; 4BAY A; 2ZDI C; 1CP9 A; 4DUY B; 2ADQ B; 4HYO A; 1HNX O; 3K04 A; 1N36 B; 1JQ0 A; 1L0N H; 1ZUQ A; 1GKF A; 2Z0A A; 4O2A A; 4MT8 A; 2UUB B; 4UUJ C; 2BTO A; 4JTD B; 1AB3 A; 1F4N A; 5LP6 C; 3P32 A; 1RM1 B; 3TET A; 1A32 A; 3T1H B; 3R65 A; 4UFZ A; 1XMQ B; 1E79 G; 1DF4 A; 2A0L A; 4CH4 A; 3U11 A; 2Y48 A; 1EBO A; 4JYY A; 1FXK C; 4IYH A; 1IBM B; 3WU2 Z; 3DSQ A; 3ABK C; 3RYI B; 1IBL O; 3W7T A; 1OV9 A; 3UKM A; 3K59 A; 4F4L A; 2R9R B; 1I08 A; 3VBB A; 2WLK A; 3CJH B; 5LA6 B; 1PNK A; 3UO2 A; 2GHY A; 2UXB B; 3ZHU A; 2Q7E A; 1WJZ A; 4RUE A; 1FS0 G; 1EZJ A; 1G8M A; 5LA6 A; 1U96 A; 2CGN A; 3W7X A; 4DV4 B; 1Q86 W; 3B8M A; 4EEQ A; 2YIA A; 2QTO A; 2ZE8 A; 3LDD A; 1XEQ A; 4K8X A; 1IXB A; 1EFR G; 4O4I B; 1PV0 A; 1KKD A; 4X88 A; 4GKK B; 1FJG B; 1UPG A; 2WA3 A; 1NTM H; 1YI2 V; 1XQ8 A; 4R7C A; 4CS3 A; 1QU7 A; 3FB7 C; 5IYD O; 1RM1 C; 4YJ3 A; 4PA9 A; 2DQ0 A; 3SPI A; 3FAV A; 3ZHV A; 1H8E G; 3CCR V; 4GX0 A; 3FD9 A; 4JI8 B; 3BAB A; 1Y6X A; 2GUZ B; 2OCH A; 2Y69 B; 2Q9L A; 1Q5O A; 3H01 A; 1W0J G; 3H1J H; 1FXH A; 5KMG A; 4LBE C; 1S76 D; 5KAF Z; 1VQ4 V; 2GUZ A; 3K06 A; 4JI3 O; 1FFX B; 3QF7 A; 2CUG A; 2F23 A; 4YJ2 B; 1AJN A; 4DK1 A; 2HG5 C; 4TSF G; 1MAB G; 2FYU H; 1JX9 A; 1Q43 A; 1Q6I A; 4AHC A; 4LF5 O; 2OWO A; 4N23 A; 1JVM A; 1SRY A; 3TK1 A; 2UXN A; 3TJT A; 3M7M X; 3CCM V; 4K35 A; 1N36 O; 4LFB B; 1YCI A; 3CRR A; 4I5S A; 4ZKI A; 5CA0 B; 2DYS B; 2VQF B; 4NKG B; 5B3S C; 2HR3 A; 1NQT A; 4ZBM A; 1PL0 A; 4NYK A; 2LQT A; 4FLW A; 3OR6 C; 4LF4 B; 3K5O A; 1S0V A; 5IYC O; 3STL C; 4MTX A; 3WB1 A; 1IBM O; 4EB6 B; 3JAW B; 1HNW O; 3OE7 G; 5GON B; 2PTM A; 4OGQ B; 4BIZ A; 2WLI B; 4XDL A; 2IH3 C; 2HHH B; 2DW4 A; 1YTF B; 2CTW A; 4JAA A; 1XNQ B; 1MA1 A; 4DR2 O; 3THO A; 1UJW B; 5GON A; 3CME V; 2WLI A; 2XOK G; 2QM8 A; 3OGI B; 1ZWI C; 1BZK A; 1EM1 A; 3A0R A; 3UT5 A; 1ORQ C; 2F4V B; 5L3G A; 3OM3 B; 3B2E E; 1AP6 A; 1YJN V; 3G67 A; 3WG7 B; 2WLL B; 5C93 A; 3RFR A; 5CB4 B; 3JCU Z; 4JZG A; 3JD0 A; 2DYS C; 1V9P A; 5JJN B; 4H44 B; 1X4T A; 3ABT A; 3U0Z A; 3OMN B; 3QVN A; 3ABU A; 2PI4 A; 4KHP B; 2YC0 A; 3KKY A; 4UVA A; 4LF7 B; 3K03 A; 1J95 A; 4JI4 O; 1OCR B; 1H2K A; 2HVJ C; 5CB4 A; 4WBN A; 3MHS C; 1P49 A; 1IBK B; 4DRX B; 4DR7 B; 2UU9 B; 5FPR A; 1K5Q A; 1KEC A; 2KSD A; 3DGE A; 3VQW A; 4O4H A; 3ZRW B; 4CS4 A; 3PJS K; 3K57 A; 2QTS A; 2QWP B; 1BMF G; 5HFM A; 1V54 B; 4MSW C; 1VQ5 V; 3G6B A; 4WFE A; 5KX5 A; 5D5Q A; 2ZR3 A; 1GMG A; 1MNG A; 3RN4 A; 4ZOL B; 3FKS G; 2C2A A; 4FMT A; 1ARO P; 3CD6 V; 2XND G; 2EIM C; 1QVF U; 2FML A; 4JI7 O; 5IWA O; 4FLV A; 2YI8 A; 3CB2 A; 3N27 A; 1WA8 B; 4YHH B; 4LFB O; 2WLJ A; 4TQD A; 4D7S A; 2BOC C; 1NKD A; 3JAL B; 3WG7 C; 4PHZ A; 1ZL8 B; 2VQF O; 3E86 A; 4O2B B; 1V55 B; 4MVU A; 3H9V A; 2QDO A; 2YID A; 4LCU C; 4JYB A; 2WA4 A; 2ATK C; 1NS1 A; 2JK5 C; 3CRM A; 3CYO A; 4JYC A; 1VQK V; 4NB5 A; 5E1A C; 3C3S A; 1PM9 A; 5JVD A; 1B3Q A; 3ASO B; 1ZL8 A; 4O2B A; 2VRZ A; 2X6A A; 2CTR A; 3CMA V; 1VQ6 V; 3F7V C; 4FK5 C; 4B7K A; 5KHJ A; 2EZP A; 4TWK A; 1EN5 A; 5LXT B; 2ZE5 A; 2CH7 A; 1AI7 A; 3O65 A; 4YY3 O; 4GX2 A; 4JYA O; 3T4D A; 2HHH O; 5LMN B; 4JI5 B; 1KUQ A; 1K34 A; 3K79 A; 2JJ2 G; 4LFC B; 2YXH A; 3M8A A; 2ZXW B; 1E1R G; 2JGU A; 3AG1 B; 3RW0 A; 3EFF K; 1TVK B; 1Q3E A; 5A2Q N; 3JAR B; 1SZX A; 1BS3 A; 2ZNJ A; 3HB3 B; 4LF8 O; 1K5S A; 1KQS U; 1H2G A; 3E83 A; 4LF6 O; 2F4V O; 5FL7 G; 5IDJ A; 4TV8 A; 1SQX H; 2EJR A; 4PDR A; 1BHA A; 4X66 B; 1WN7 A; 1ROP A; 3L72 H; 3KZI Z; 4X1I B; 5JCO C; 5K1P A; 4FLT A; 3DXR A; 2QWN B; 1URF A; 4CBC A; 1RSO A; 3ETD A; 2IJK A; 3ASO C; 4B3M B; 4DR7 O; 3CRA A; 4PI2 A; 1W2B U; 4DV0 B; 2HEP A; 2OCC C; 1BQ0 A; 3K3W A; 2IU3 A; 4DR3 B; 4YXW G; 3M99 B; 3K0D A; 2XHB A; 1Z2G A; 2A79 B; 3CRQ A; 3WFV A; 2WLM A; 3GB7 C; 3CCE V; 3FFQ A; 3G71 V; 1RP3 B; 4FFB B; 3AG1 C; 1D5N A; 4EFE A; 5CA1 A; 2GTS A; 4UCS A; 2OTL V; 3HKE B; 1TAE A; 2Z3Y A; 1YVW A; 1LNQ A; 1R1B A; 3LNM B; 4FFB A; 3ZHT A; 2MW2 B; 5L3E A; 2B5U A; 4LH6 A; 3TCU A; 4J7J A; 3CXH F; 4F6E A; 2QKS A; 2Z5U A; 2XAS A; 4PDM A; 3HKE A; 5GTH Z; 1PNL A; 1Z5V A; 2IJJ A; 3E8B A; 2EX3 A; 2A9H A; 5IY5 B; 1YF2 A; 1XNR O; 4B7E A; 4CC6 A; 3LNN A; 1S5H C; 5J2T A; 1N0N A; 3ZIA G; 5TIS Z; 2EIJ B; 4LNU B; 4I4T A; 4O4J A; 3CCS V; 2BTQ A; 2H94 A; 3R66 A; 3L74 H; 1VQO V; 5LGT A; 1XHZ A; 1M57 C; 2OIE A; 4IIJ B; 2CK3 G; 3QG5 A; 1QR8 A; 1XL6 A; 3AG4 B; 2Q69 A; 1VF5 B; 2LW7 A; 3ICX A; 4LNU A; 1XIL A; 4I50 B; 3OEE G; 4ASU G; 3ZED A; 3J80 N; 1XI1 A; 1BQZ A; 4NXN B; 4I0X A; 5F2V O; 2WLH A; 3F5T A; 4IIJ A; 2DWD C; 2PY5 A; 1QLN A; 1S5J A; 4B3T B; 4DV5 B; 5EC1 C; 3N2G B; 1SQP H; 4OX9 O; 3CCQ V; 2VQE B; 2ZQM A; 2ZKO A; 2KG7 B; 3AG3 C; 4OPH A; 3JAK B; 4IHJ A; 5EYP A; 1KD1 W; 3SYQ A; 5IJ0 B; 3HKB B; 2QKA A; 5KUK A; 1FFT B; 3D3Q A; 1K3E A; 4I7Z B; 2P4V A; 1VQL V; 2WPD G; 4UB6 Z; 2KG7 A; 2Q68 A; 1BL8 A; 5H9C A; 2AGA A; 5H6R A; 3W7S A; 1Z5W A; 1NI8 A; 2R9I A; 3CC4 V; 2QM7 A; 1M90 W; 5BMV B; 3CPW U; 4NTY A; 3ZHS A; 4DO2 A; 4U3F H; 5AG2 A; 2K1E A; 1W0K G; 3L70 H; 2O57 A; 4DV3 O; 2ETN A; 2HLD G; 1EN6 A; 3ABM C; 4GUN A; 4DUZ O; 3G80 A; 5CA3 A; 1OCC B; 1YSC A; 1M1K W; 1NH2 D; 3QO8 A; 3OUS A; 4DV0 O; 2UUC B; 2EIJ C; 3RT3 C; 4U3J B; 4TUY B; 3WB0 A; 2QGN A; 2DOS A; 2E5L O; 2UUA B; 4E4E A; 4FLZ A; 2P4K A; 5IJ9 B; 3FB8 C; 1VIB A; 1VQP V; 4RUF A; 5GW7 A; 4G28 B; 3ASN C; 4BW5 A; 4MW8 A; 3QTC A; 2GV9 A; 2IU0 A; 3OUF A; 4JI0 B; 3RYI A; 2Q7H A; 4JAV A; 3ZX6 A; 1MG1 A; 2XAJ A; 4PI0 A; 1NU1 H; 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2QR4 A; 1SZT A; 5J9P C; 1XMQ O; 3ZCC A; 2ZD9 A; 4GLX A; 1B6Q A; 4LWS B; 3SPC A; 2PZS A; 2ZIN A; 5CA0 A; 1GM9 A; 4KP4 A; 1MZE A; 5J2U A; 5IYZ B; 3U10 A; 3LSQ A; 1X59 A; 1FPO A; 4TV9 B; 3C3T A; 4D7T A; 2DWE C; 2Q67 A; 5E79 Z; 2Y69 C; 3W7U A; 4WFG A; 5BXZ A; 4H13 B; 1I5Y A; 2YIB A; 3DTU B; 1R6N A; 4TV9 A; 1AI4 A; 1PKX A; 4PA4 A; 4JI0 O; 5L3F A; 4DV1 B; 1VF6 C; 2EUL A; 4EB6 A; 3JAW A; 4WCE V; 3CCU V; 4W4L A; 1YTF D; 3TGU H; 2A7W A; 2Q73 A; 3B09 A; 4NXM B; 5JJE B; 3JD4 A; 5BR8 B; 3AEI A; 2UXB O; 1GO3 F; 4TOI A; 5CBG A; 4HAM A; 5LHI A; 5IT9 N; 2QM4 A; 4J10 A; 3T1C A; 5ITZ B; 1PPJ H; 4DV4 O; 1YHQ V; 1N33 B; 3H1H H; 4R6Z A; 1VQM V; 1N8R W; 3D36 C; 2W0F C; 1ENV A; 3CRC A; 3RYC B; 3JAM N; 1EZV H; 5ITZ A; 4GKK O; 1FJG O; 3RYF B; 4DV6 B; 3RGB A; 4DK0 A; 1DK1 A; 1H2L A; 3LDE A; 4Z1V A; 3ML0 A; 1OZ0 A; 3AK3 A; 4X1Y B; 4DR6 B; 2HJF C; 1G1X B; 5L3C A; 1XMO B; 5JH7 B; 2WLL A; 1RPO A; 4JI6 B; 3Q4H B; 5L3D A; 3ZMT A; 4JI8 O; 3OTF A; 1NTK H; 3CC2 V; 3SPG A; 4CS2 A; 2HJD A; 5B1B B; 1XBL A; 1E1Q G; 1Y67 A; 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