The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
MTETDKKQEQENHAECEDKPKPCCVCKPEKEERDTCILFNGQDSEKCKEFIEKYKECMKGYGFEVPSAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Folding studies of Cox17 reveal an important interplay of cysteine oxidation and copper binding
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Cytochrome c oxidase copper chaperone
|
| molecule tags |
Chaperone
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
24
|
| structure length |
69
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| sequence length |
69
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-03-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF05051 | COX17 | Cytochrome C oxidase copper chaperone (COX17) |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | CytochromE C oxidase copper chaperone |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1U97 A; 2LQT A; 2RNB A; 1Z2G A; 2HP8 A; 1U96 A; 2RN9 A; 2LGQ A; 1HP8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5JQG A; 3AEI A; 1QCE A; 4MTO A; 4KXR A; 2ZM6 B; 2GV9 A; 3UO2 A; 5AG2 A; 4MTX A; 1MA1 A; 2E75 B; 3L70 H; 5LHH A; 3CRR A; 1SES A; 3FB8 C; 4GLX A; 1Q8I A; 1HDJ A; 1WAZ A; 4U3J A; 4BIZ A; 3K5L A; 3CPW U; 3OTO O; 4LF6 B; 3OUS A; 2UXB O; 2EZP A; 4CBC A; 3OMN B; 5GON A; 2WLJ A; 3CCM V; 2ITD C; 2EJR A; 2KKW A; 4YJ3 A; 5EYP B; 3WG7 B; 2WWW A; 1QVG U; 2XAF A; 5FNV A; 4WCE V; 1KP2 A; 4RQF A; 2BCC H; 4JI1 B; 5LMN B; 1Q81 W; 2WLI B; 1CEZ A; 2DWE C; 4OPA A; 1K3E A; 5JH7 A; 3CC2 V; 4RAI A; 1WPB A; 2FKX A; 2HVJ C; 2ODM A; 2Q5Z A; 1DK1 A; 1I0H A; 4ASU G; 2HJD A; 2OTL V; 2ZCE A; 3TET A; 1B04 A; 1YJN V; 4UCT A; 1HNZ B; 4LWS B; 3UM7 A; 5KHJ A; 1K7D A; 4H44 B; 2ETN A; 3R66 A; 3LSU A; 2WPD G; 3JAW B; 3ZRX A; 4B3T B; 3RYH A; 1Q6U A; 4OPH A; 5BZB A; 1VP7 A; 1I7F A; 4X65 B; 1OCR B; 2ZT9 B; 2EIJ C; 2CGN A; 3K0G A; 3EXA A; 1IBK O; 4CH5 A; 5KUM A; 2VRZ A; 3SPJ A; 1FFX A; 2QWO B; 5CN0 A; 2QM8 A; 3N2G B; 1G6U A; 2ZR2 A; 4CZZ A; 3OAA G; 4QIW F; 3IFX A; 3BAA A; 5IYC O; 1F4N A; 1QLE B; 1WNS A; 5JQG B; 3OM3 B; 4IHJ A; 1HNX O; 1IZ3 A; 3CC4 V; 2IJI A; 2LQT A; 2ZIO A; 1NU1 H; 1K9M W; 3WFV A; 4K35 A; 4JZ2 A; 1QNM A; 3D36 C; 1N34 O; 1M90 W; 2DW4 A; 4U3J B; 3LDD A; 5LA6 B; 2ZIN A; 3BCC H; 3HPL C; 1AI6 A; 4PDM A; 5GON B; 3AG3 B; 4CC6 A; 1XMO O; 4YJ3 B; 3D8C A; 4DR1 O; 4B3S B; 5FNV B; 5D5P A; 2YI9 A; 2Q7H A; 4DV4 B; 1GN2 A; 3TJT A; 1K34 A; 3SYO A; 1R73 A; 1YCI A; 1O9G A; 3WB1 A; 1P7B A; 2A3Q A; 5L3G A; 2ILM A; 1FJG B; 5JH7 B; 4RO2 A; 4GX2 A; 5FPO A; 5E79 Z; 3SJQ C; 2RMK B; 4G28 B; 2HG5 C; 4WFF A; 2QM7 A; 4JPR A; 5KMG B; 3CXH F; 2HHH B; 2YIB A; 1AJN A; 1S5H C; 1KKD A; 4K8Z A; 4FM1 A; 3X2Q B; 4XBF A; 3T4Z A; 1ORQ C; 1PNM A; 2UXC O; 2HP8 A; 3RYH B; 1KU9 A; 5KA5 A; 4LC1 A; 4AHC A; 4FLY A; 4P9P A; 3E2E A; 1G8M A; 1N8R W; 1ENV A; 1J95 A; 4FLT A; 2UXD B; 1P49 A; 4JI0 B; 1DF5 A; 2IH3 C; 1FFX B; 3U11 A; 1NKD A; 4G2K A; 4X64 O; 4G27 B; 1XRE A; 1KKC A; 3L72 H; 1N33 B; 2FTK A; 2UXX A; 2Z3Y A; 4IHJ B; 4DR7 B; 3ABU A; 2BTO A; 4NR1 A; 3SPG A; 4JI8 B; 4LF4 B; 1JVM A; 1PKX A; 2P90 A; 4P9O A; 2N04 A; 1TGO A; 5D5Q A; 2QWN B; 2YEV A; 5JJE B; 5J2T A; 5B1N A; 3TCU A; 3ZMV A; 1K97 A; 1B6Q A; 2IJK A; 4DR3 B; 2H8P C; 3WU2 Z; 1WP7 A; 1Y76 A; 2MW2 B; 1UJW B; 4JI3 O; 2CE4 A; 3ABT A; 4LH6 A; 4LF5 O; 3SJA C; 5EK0 A; 2ADQ B; 2PYJ A; 3JAT A; 3AG4 B; 4QE7 A; 3ZRW A; 1US6 A; 4ZIB A; 3ZHR A; 3JAL A; 1DGS A; 2L6L A; 3HR0 A; 3AK2 A; 1VQ6 V; 3CRM A; 4FLZ A; 4LR3 A; 2AZ2 A; 1N4C A; 4I0X A; 3CCR V; 4AQY B; 2JRI A; 4R7C A; 4CS4 A; 5L3E A; 2DYR B; 2F23 A; 3D36 A; 1A32 A; 5BY1 A; 2ATK C; 4DR2 B; 4NB5 A; 2LFR A; 3Q4H A; 4DV7 O; 1KB9 F; 3JD1 A; 2WSS G; 3O65 A; 4JF3 A; 1EM1 A; 1VF7 A; 1V54 C; 3K79 A; 2Z0A A; 4JAA A; 3CHX A; 2GTS A; 1ARO P; 2QJ1 A; 3BRC A; 3T2M A; 1WB8 A; 2ITC C; 2FB5 A; 4JI5 O; 3UT5 A; 4YJ2 A; 3BPZ A; 3QTC A; 3HKD A; 4BAY A; 3T1H O; 5JVD A; 2PTM A; 3B40 A; 2WA4 A; 1ZLZ A; 5LMU B; 2RN9 A; 4I5S A; 4PA3 A; 3VQV A; 4CC5 A; 4RQE A; 2F4V O; 3BY6 A; 2YEV B; 5J2T B; 4JI4 B; 2F93 B; 1XUQ A; 4X8A A; 2ZDI C; 2JK5 C; 1BE3 H; 3FAV A; 1YTF D; 1HNW O; 4MTF A; 1Y76 B; 5IY5 C; 4ZKI A; 1O9H A; 4OGQ B; 2E3C A; 3DC6 A; 4MVU A; 2VQE B; 2EIJ B; 1RM1 C; 4IGG A; 4OX9 B; 1IXB A; 5CA0 A; 1SQV H; 5CBG A; 3CJH A; 3ZRW B; 3ETG A; 3FYE B; 4LFC B; 2R72 A; 1KC8 W; 5LBQ A; 1RSO A; 3GWK C; 3JAL B; 2Q0A A; 4QE9 A; 1SRY A; 5JJN B; 2CTW A; 2JEX A; 3ETQ A; 1F7Y A; 1UPG A; 2YXH A; 2ZM6 O; 2A7W A; 2P06 A; 4I0X B; 4MTG A; 1SS3 A; 2A0L A; 5KAI Z; 2DWD C; 5KX5 A; 2QKS A; 4WFH A; 4J7J A; 4TT3 G; 5IDJ A; 3Q4H B; 3K9A A; 2KB1 A; 2JGU A; 3ABM C; 3DXR A; 4LF6 O; 3K5M A; 1S0V A; 3SPC A; 4MVO A; 3OMI B; 4FFK A; 2YXY A; 2G38 A; 5KHG A; 3IAY A; 1CPY A; 3B09 A; 4MVM A; 2QEX V; 1EBO A; 3NR7 A; 2ZNI A; 4X20 A; 3FKS G; 3EFF K; 4FFB B; 4JI1 O; 3ZN1 A; 4QJF B; 3UCS C; 4YJ2 B; 2ARH A; 3UT5 B; 5GTH Z; 4J80 A; 1JA8 A; 1P84 F; 5LMN O; 5JCO A; 2E5L B; 1NQT A; 3K04 A; 3HKD B; 2D2C B; 1YJW V; 5JVD B; 1XNQ B; 3ABL C; 1NT2 B; 1TUB A; 4Z1M G; 4GT1 A; 4GCZ A; 1SZT A; 3APO A; 1XI1 A; 1GH6 A; 2V7Q G; 4HAM A; 3CRC A; 3ZBH A; 5EZY A; 5JWP A; 1HNZ O; 2YS8 A; 4BW9 A; 3JSL A; 1MNG A; 3FAV B; 1CP9 A; 4B3T O; 3LUT B; 4W4K A; 5H9C A; 4X65 O; 3J7A U; 1NBM G; 2Y4T A; 3F7Y C; 3UO3 A; 3A0H Z; 1W0K G; 4O4L A; 1EN6 A; 2E74 B; 2V4D A; 1AP6 A; 4FZ1 A; 4TQF A; 2QSA A; 4RUE A; 4FJC C; 3C3T A; 4QGP A; 1N0N A; 2ZQM A; 1GN3 A; 3SYC A; 4UCS A; 4TWK A; 1VQN V; 5C93 A; 1F51 A; 5KX5 B; 3HB3 B; 4AIL C; 3ZMZ A; 3CCS V; 2D3O W; 2F43 G; 3M7M X; 1OCC C; 2ZDI A; 4JYB A; 1YF2 A; 3IJ4 A; 3DXR B; 2GBO A; 3D3I A; 4FM2 A; 1GRJ A; 4XDK A; 2IM9 A; 4FK5 C; 3PJS K; 5H6R A; 3PN1 A; 2BOC C; 2P4V A; 1GK9 A; 2PGG A; 3N27 A; 1FYJ A; 2R9R B; 4B3S O; 1MZE A; 4X20 B; 1IBM B; 4I9Q A; 5B5E Z; 2CTR A; 4DV4 O; 5BMV A; 3BHP A; 4JAU A; 1BT8 A; 2OTJ V; 4IT5 A; 4HNA A; 1FJG O; 2L35 A; 2EZO A; 1VEW A; 1TUB B; 2NNU A; 2QM4 A; 1GM8 A; 1NH2 D; 2K9P A; 1VQ5 V; 3CCL V; 2UUC B; 4JZG A; 2HHH O; 2YSU B; 1Q82 W; 5EZY B; 3JSN A; 4QPJ A; 1V54 B; 1Q5O A; 4NXN B; 3A0B Z; 4D6T H; 2VS0 A; 1GAX A; 2UU9 B; 3T4D A; 3W7W A; 2ZIM A; 4WFG A; 2X6C A; 3OGC C; 2UXD O; 1M5I A; 4O4L B; 4X89 A; 4JI0 O; 4FLX A; 2DYR C; 1VQ9 V; 3VQX A; 3S3W A; 5IWA B; 3MHS C; 1MG1 A; 2X6B A; 4JYY A; 1JMK C; 4UB6 Z; 1K92 A; 3K9S A; 2P67 A; 4B7K A; 3ZHU A; 1QU7 A; 1R3I C; 1F23 A; 1N33 O; 2C2A A; 3N2K A; 4DR7 O; 2B1G A; 2LP7 A; 2W0X A; 1ZL8 A; 4JI8 O; 1ZTE A; 4LF4 O; 5CBF A; 3OGI B; 2R9I A; 4ZBM A; 1AR5 A; 5L3F A; 1KEC A; 1QHT A; 3CCE V; 4FZ0 A; 4DR3 O; 1E1R G; 5IY5 B; 2QWQ B; 1B3Q A; 2ZXW C; 2ZE7 A; 4MS2 A; 2CAZ C; 1XMQ B; 1WB7 A; 1RM1 B; 3L74 H; 4WFA V; 2Q69 A; 4IYI A; 2E76 B; 1GO3 F; 4YY3 B; 2QA4 V; 3AK3 A; 1SER A; 5B1B C; 4MVR A; 1FXV A; 1L0N H; 5BMV B; 4I55 A; 4HNA B; 5K1X A; 3OR7 C; 4X62 B; 1NVP D; 4EB6 A; 4AQY O; 4KUM A; 2JEU A; 2GSM B; 3OUF A; 3OE7 G; 2NR5 A; 4JV5 B; 4LF9 B; 4D7T A; 2OCC C; 1VQK V; 4DR2 O; 1FXK C; 3ABM B; 3O9O A; 4GX0 A; 1Q6H A; 2XAJ A; 5EIB C; 1URF A; 1U96 A; 2ZNJ A; 3L75 H; 5CA3 A; 4WF9 V; 1R6N A; 2UUA B; 1GKF A; 1ZSP A; 1NTZ H; 2UXN A; 2OCH A; 3ZMU A; 1IVS A; 3OMA B; 4FIP C; 1YIJ V; 3VQW A; 4JTC B; 5A2Q N; 4O2B A; 3E83 A; 5KUK A; 5A9G A; 2LGQ A; 3ABL B; 5IJ9 A; 2KQX A; 5EBL C; 1XQ8 A; 4ZI7 A; 1ZL8 B; 2EUL A; 2IJJ A; 1EZJ A; 4I4T A; 1S3J A; 5LMU O; 1XDC A; 1VQ7 V; 3MDS A; 1PNL A; 5LXT A; 3STZ C; 2P22 C; 3APQ A; 4J11 A; 1ZAU A; 2ZE8 A; 4JI4 O; 2JGD A; 4P2Z A; 3K57 A; 4FLV A; 2ZE5 A; 3G80 A; 1BL8 A; 2F1M A; 2DQ0 A; 3RT3 C; 4DV6 B; 2VQE O; 3HKC A; 2XT9 A; 1J5E B; 3RGB A; 1D5N A; 4OX9 O; 3BVO A; 1S72 V; 1OZ0 A; 2PUS A; 2HVK C; 1VQL V; 1W0J G; 4LFC O; 5CB4 A; 1NTK H; 5KAF Z; 3ZRS A; 1RP3 B; 2EIK C; 2Q4P A; 3A2F A; 4I55 B; 4K3A A; 3CCJ V; 2W6J G; 1X59 A; 2X7R B; 1QVF U; 2ZR3 A; 4B3M B; 4NVP A; 1GMG A; 2H94 A; 3WB2 A; 3FB5 C; 1YSC A; 2QKA A; 3TGU H; 1KMI Z; 3LNN A; 1OCC B; 3B8N A; 1FXH A; 5EBW C; 4D7S A; 4XDL A; 2LGW A; 3QF7 A; 2DJV A; 1QR9 A; 3ICX A; 3RYC A; 3K59 A; 3K0D A; 4U7N A; 2B1I A; 1V9P A; 4WBN A; 2YI8 A; 1YTF B; 1FAF A; 4LFB B; 1S5J A; 1R3J C; 1GN4 A; 4XDJ A; 4JGS A; 2PF4 E; 1VQ8 V; 3ZHT A; 2X6A A; 1HR0 B; 2IBZ H; 4RUF A; 4TV8 A; 1T5E A; 2XUM A; 2E5L O; 3OFN G; 1OCO C; 4L87 A; 1AJQ A; 4LFA B; 5L3D A; 2OWO A; 4FLU A; 2ZE6 A; 4PA6 A; 5IJ9 B; 1XNQ O; 5LL6 Y; 4ZI7 B; 4DW1 A; 4I4T B; 3W7X A; 3B8M A; 1BQZ A; 4I7Z B; 1VF5 B; 3T1Y B; 1WP8 A; 1Q43 A; 3J81 N; 1MOF A; 4DK1 A; 3OR6 C; 2ZKO A; 1FXK A; 3D3Q A; 3G6E V; 4J7K A; 3JD0 A; 2WA3 A; 2IU3 A; 1CXZ B; 1EN5 A; 3CEI A; 1IBL B; 1DTO A; 2JGD B; 5JCO C; 3VBB A; 4BIO A; 2W0F C; 2GDS A; 4UCO A; 1LUV A; 2BSK A; 5E1A C; 3E35 A; 4TQD A; 3HKC B; 1BS3 A; 1G1X B; 4UUJ C; 3ETE A; 2NLJ C; 1JCH A; 2YIC A; 4GKK B; 4QPK A; 2AXT Z; 1I94 B; 2WLM A; 2QTO A; 3CC7 V; 4FMT A; 4PA9 A; 3JYC A; 4BR6 A; 1Z5V A; 2W6I G; 4LF8 B; 3RBZ A; 1XNR B; 1Y67 A; 2MK3 A; 3G4S V; 3SYQ A; 4DUY B; 1KQS U; 1THZ A; 2Q67 A; 5EC2 C; 4B7E A; 3LDC A; 5FLX N; 4N21 A; 2RDC A; 1H38 A; 3E8F A; 1NS1 A; 3G71 V; 4JI2 B; 4QNH B; 4ICG A; 3FB6 C; 2ZXW B; 5B1O A; 3FYI B; 1Q3E A; 1DLB A; 2QDO A; 4E4E A; 1SET A; 4TOI A; 3E89 A; 4K0K B; 5GTI Z; 4B3R B; 3STL C; 1QR8 A; 4UFZ A; 4WBN B; 1EFR G; 2X0L A; 2QTS A; 5HFM A; 2XAQ A; 3CCQ V; 3K06 A; 3FD9 A; 1IBM O; 5L3C A; 1YEW A; 3P30 A; 5B1B B; 2KG7 A; 4DR5 B; 4PJ0 Z; 4PA7 A; 4TV8 B; 2JS3 A; 4X1I A; 1VQP V; 3BA9 A; 2IU0 A; 4KHP B; 4I9W A; 3SPH A; 4MW8 A; 1ZX3 A; 4RWU A; 1Y6X A; 2YXL A; 5IYB O; 2AHY A; 2Q73 A; 3JAT B; 4IYH A; 4Q20 A; 5B3S C; 2OCC B; 3W7U A; 1AP5 A; 1JQ0 A; 2XND G; 4L8J A; 2UUC O; 1GN6 A; 1FXK B; 1Y74 A; 3A8T A; 1MMM A; 3GVM A; 5KHH A; 1HW7 A; 2CTQ A; 3SR2 C; 1YIT V; 4NXN O; 1N32 B; 1JX9 A; 3VOU A; 4YHH B; 2BTQ A; 2Y48 A; 2UU9 O; 4DO2 A; 4J7Z A; 3ZCC A; 4O4J A; 4F6E A; 5IWA O; 3R65 A; 4EKW A; 2PY5 A; 1SC5 B; 3ZHV A; 1VF6 C; 1WPX A; 4EEQ A; 3CMA V; 1H2S B; 2EIN C; 4NXM B; 3THO A; 4R8C A; 4LBE C; 4DV5 B; 1SQG A; 5LP6 C; 3CB2 A; 2HFE C; 2Q8V A; 4JTA B; 3F7V C; 5KLV H; 2XOK G; 4X66 B; 3WB0 A; 3U10 A; 4TV9 A; 4FLW A; 1NH2 B; 3RWR D; 1AI5 A; 3TXQ A; 3SYA A; 2RJZ A; 3ABK C; 2OT5 A; 1XMQ O; 5KA6 A; 3OT7 A; 2FL4 A; 1N0J A; 3L9D A; 1R6T A; 3H01 A; 4JYC A; 1BSM A; 1K5Q A; 4YY3 O; 1VAR A; 2CDY A; 3CX5 F; 3OEE G; 2BOB C; 2EIK B; 1SF9 A; 5IT9 N; 1X4T A; 1IXM A; 2HJF C; 1OJH A; 2KSD A; 1W2B U; 3G67 A; 4X1I B; 3F5W C; 2IJH A; 2CUG A; 3DC5 A; 4NTW A; 4UCV A; 4X62 O; 1NR7 A; 2GUZ A; 2YUA A; 1Y66 A; 5CA0 B; 4JV5 O; 2P5O A; 3CJH B; 1MAB G; 4LF9 O; 2B9Z A; 3CRQ A; 1RSO B; 1Y74 B; 3OEH G; 4UVC A; 4J9Z B; 4B08 A; 2O57 A; 2RQ6 A; 4DV1 B; 1K4D C; 2F66 C; 3CWB H; 2YID A; 2VWJ A; 5IJ0 A; 2BTQ B; 3RYF A; 1WN7 A; 3HKE A; 3ZX6 A; 2PZS A; 2UUA O; 4CH6 A; 4PDL A; 4O4J B; 2XAG A; 1H2G A; 4ABM A; 4ZOL A; 3JAS A; 1LNQ A; 4DYL A; 1I5Y A; 4E2L A; 1SQP H; 2HEP A; 1VIB A; 1OCO B; 3QO5 A; 4DV2 B; 1S5L Z; 1I5X A; 1R1B A; 2QWR B; 2QKC A; 4O4H A; 3C90 A; 1U97 A; 1OCZ C; 3CSX A; 4KL1 A; 3E8H A; 1QBZ A; 4GUN A; 2JJ2 G; 4R50 A; 1BZK A; 1TUE B; 2YDE A; 1SQQ H; 1KBH A; 1E79 G; 1PM9 A; 2WAM A; 1AB3 A; 1NVP B; 4OXS A; 2CTP A; 5J2U A; 4WFB V; 1ZUQ A; 4EFE A; 4TV9 B; 2A9H A; 2YIA A; 2P6J A; 1JJO A; 3AG1 C; 4H0L B; 3FB7 C; 4N23 A; 4DV6 O; 1NI8 A; 1KD1 W; 3ZMS A; 1IX9 A; 1J5E O; 2Q7E A; 2AW9 A; 4H37 A; 4LWS A; 2M6Y A; 3IGA C; 1YI2 V; 2A06 H; 3SPI A; 3QO7 A; 1M57 C; 3HKB A; 1VF6 A; 4NTY A; 1M93 A; 3GWO A; 3JCZ A; 1K4C C; 4J42 A; 2PI4 A; 3E8G A; 1OV9 A; 2GTA A; 5LP6 A; 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