The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
GSSGSSGSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKNKSPDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
DnaJ homolog subfamily B member 9
|
| publication title |
Solution structure of J-domain from human DnaJ subfamily B menber 9
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Chaperone
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| total genus |
17
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| structure length |
88
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| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LGW A; 2DN9 A; 3UO2 A; 2LO1 A; 3UCS C; 1XBL A; 1WJZ A; 2L6L A; 2EJ7 A; 2QWO B; 3AG7 A; 3APQ A; 2N04 A; 2KQX A; 2Y4U A; 3BVO A; 2OCH A; 2M6Y A; 2GUZ A; 1N4C A; 1FPO A; 2CTQ A; 2Y4T A; 3UO3 A; 1FAF A; 2YUA A; 4J7Z A; 2QWN B; 2N05 A; 1IUR A; 2DMX A; 1HDJ A; 1GH6 A; 2QWQ B; 4IT5 A; 1BQZ A; 2CUG A; 2PF4 E; 1BQ0 A; 2CTR A; 4J80 A; 4RWU A; 2QSA A; 2CTW A; 2QWP B; 2CTP A; 2GUZ B; 3APO A; 2YS8 A; 1NZ6 A; 2QWR B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1I0H A; 2R9R B; 4PA4 A; 2UXB O; 4D7S A; 3B4S A; 4WFF A; 1D5N A; 2DOS A; 4WFG A; 4FFB B; 3BVO A; 1QLE C; 2P90 A; 2QR4 A; 2H94 A; 2F4V O; 5EBW C; 3GWK C; 4FMT A; 1BHA A; 2EIN B; 1JOY A; 3ZJZ A; 4ICG A; 2OT5 A; 2UXD B; 1N33 B; 2E3C A; 3BA8 A; 1Q6I A; 2AHZ A; 3LSS A; 3OMI B; 1Y6X A; 3N2K A; 2AZ0 A; 4JI8 O; 3GVM A; 4FLT A; 2ETN A; 2QKS A; 4LFB B; 1BCC H; 1PNL A; 1PNM A; 4MT8 A; 2VQF B; 4NVP A; 4ZOL B; 4OPH A; 2B5U A; 3RFR A; 2AGA A; 1HDJ A; 3N2K B; 1SQP H; 2A79 B; 3CRM A; 1H8E G; 5IYZ A; 3K57 A; 3K9A A; 4PA3 A; 2ZXW C; 1GO3 F; 1CXZ B; 5KMG A; 3QO7 A; 3CRC A; 2ITC C; 4BIU A; 2P06 A; 5CB4 B; 1SRY A; 5IYZ B; 4IL6 Z; 5FPO A; 4DV3 B; 2PYL A; 2Q7H A; 1K7D A; 5KMG B; 4TUY A; 3OD4 A; 4O4L A; 4BAY A; 4R6Z A; 3R66 A; 1OCZ C; 1K3E A; 3IFX A; 3JAM N; 2VQE B; 5FLX N; 1IBM B; 4J10 A; 2PI4 A; 4HNA A; 3CX5 F; 1OCZ B; 1SQQ H; 4OX9 B; 4JI4 O; 4TUY B; 5KHI A; 3IAY A; 2V1D A; 4FZ1 A; 3P30 A; 5BMV A; 2LGQ A; 2YIA A; 3HR0 A; 1R6N A; 1VF5 B; 2XAF A; 4DV4 O; 3CEI A; 4X1K A; 1A32 A; 3ASO B; 1XI1 A; 1P4R A; 4WFH A; 4YIP A; 1KP3 A; 2ADP A; 3H1J H; 3CB2 A; 1VQ9 V; 3CJH A; 3BA9 A; 4UCO A; 4LF4 O; 1NS1 A; 4FM1 A; 1WA8 A; 1K34 A; 4AIL C; 1B6Q A; 5IWA O; 2X6C A; 3C3S A; 3JD0 A; 4BW5 A; 4PDM A; 3RYC A; 3CJH B; 4L8J A; 2OWO A; 3K0G A; 5JCO A; 1WA8 B; 3B77 A; 4LF6 O; 5H9C A; 3SYQ A; 3CRA A; 4QE7 A; 5JCO C; 3JAK B; 2R70 A; 4JYB A; 1L0L H; 2E5L O; 3ICX A; 2YDE A; 4KUM A; 3WFV A; 2A0L A; 3SJA C; 4O2A A; 4TSF G; 2IBZ H; 3E22 B; 3JD4 A; 3C3T A; 4KP4 A; 4B7K A; 4B3R O; 5EYP A; 3H9V A; 2X6A A; 1IBK O; 4LH7 A; 4DV7 B; 4LFC B; 3AK1 A; 1S72 V; 1AI5 A; 3T1H B; 1AI4 A; 2CTP A; 4O2A B; 3JYC A; 3FYI B; 5FNV B; 4EFE A; 4FLY A; 4DV5 O; 2DYR C; 4UXN A; 3ZN1 A; 3KCY A; 2DYR B; 2M6Y A; 3JAR B; 3CXH F; 3ZHT A; 4EFB A; 4RAI A; 1MG1 A; 4MVZ A; 1P7G A; 1S5J A; 4GCZ A; 4KFM A; 1NKD A; 3IC7 A; 3UKM A; 2H3O A; 1HP8 A; 3NR7 A; 3ZIA G; 3CCJ V; 1SC5 B; 4JTA B; 1AIL A; 4PD4 F; 4LH6 A; 1IXB A; 2ZIM A; 3CCU V; 2QWO B; 3Q4H B; 3UQ8 A; 4I7Z B; 4PHZ A; 3MHS C; 1J5E O; 3GB7 C; 1PL0 A; 1EN4 A; 2NNU A; 4BWA A; 1H2K A; 4I50 A; 1V55 C; 1R3J C; 3AK2 A; 2EIM B; 1YEW A; 4MTO A; 5LGU A; 4WCE V; 4CS4 A; 2PI5 A; 1WB8 A; 2IH3 C; 2XOK G; 4X1Y A; 1YCI A; 3ABK B; 4I50 B; 2YI9 A; 5LGN A; 5ITZ A; 1Y67 A; 1Y74 A; 4DYL A; 1FYJ A; 2KSD A; 4JZG A; 4X1Y B; 4JI3 O; 2P5O A; 1F7Y A; 3T4D A; 4RUF A; 4IIJ A; 2FL4 A; 5ITZ B; 3CPW U; 3FD9 A; 4KL1 A; 1QHT A; 4TQF A; 4BIZ A; 2V7Q G; 4B3M O; 3CCM V; 5AG2 A; 1WN7 A; 4IIJ B; 5IYD O; 4H0L B; 2OCC B; 4LFA B; 2ODM A; 5C93 A; 1H2M A; 1Q3E A; 4GYC B; 2YUA A; 5LMN B; 3CRQ A; 4WFA V; 1I7F A; 2LFR A; 5B5E Z; 2YID A; 1EZJ A; 4RWU A; 2WLK A; 2ZE6 A; 3T1Y B; 2PYJ A; 1D5A A; 1MAB G; 4MVQ A; 5DM6 V; 4U7O A; 4U7N A; 1SQX H; 3ZRX A; 2OTJ V; 2QTO A; 2QEX V; 1S76 D; 4JZ2 A; 3RBZ A; 1M1K W; 3EHB B; 1Q8I A; 4X66 O; 2XND G; 1XIL A; 4GLX A; 4JI7 B; 2ZR2 A; 1AJQ A; 2GDS A; 1QCE A; 1WP8 A; 2YIB A; 3CWB H; 3NXS A; 3FX7 A; 2BE3 A; 4K0K O; 5DED A; 3AG2 C; 1JFF A; 4FM2 A; 1IVS A; 4X20 B; 3ZRW B; 1XNR O; 4JI0 O; 4YJ3 A; 4DR4 B; 4H44 B; 4UVA A; 1VEW A; 2JDI G; 2HHH B; 1JFF B; 1CP9 A; 4J80 A; 1B3Q A; 1MSD A; 5HFM A; 4DR1 O; 5D5P A; 3OUS A; 5CA0 B; 2DYS B; 1OCR C; 3APO A; 5L3G A; 1BT8 A; 2A06 H; 3M7M X; 5IE9 A; 4ZIB A; 4N23 A; 2ZM6 O; 4DUZ B; 1NT2 B; 4DR7 B; 5IYC O; 1VMG A; 5B3S B; 4DV0 B; 4IHJ B; 3BFR A; 2OIG A; 5DN6 G; 3D8C A; 4IT5 A; 2RCV A; 1BMF G; 2W0F C; 3TXQ A; 4X1I A; 2YXY A; 3ML0 A; 4KHP B; 1K4D C; 5K1X A; 1SQG A; 1TVK A; 4DV6 O; 4GKK O; 3JSL A; 2GV9 A; 5DEC A; 5IJ0 B; 3M99 B; 5B66 Z; 4JI2 B; 2LP7 A; 5HFL A; 2GBO A; 4B3T B; 3CCR V; 2RDC A; 1NH2 D; 4FK5 C; 4K3A A; 1AB3 A; 3HKD A; 3AG1 C; 4MVS A; 3LDE A; 3JAL A; 1I08 A; 1XL4 A; 4P30 A; 2EIJ B; 3A0H Z; 5BY1 A; 5LMU B; 2M7W A; 4W4K A; 4O2B A; 3P3N A; 1XNQ B; 1DTO A; 3L71 H; 3JAL B; 4JI5 B; 1PL4 A; 4X62 O; 4CC6 A; 4JV5 O; 3LNN A; 3JSN A; 2Y0I A; 3WG7 C; 5IT9 N; 4G28 B; 4UB6 Z; 4O2B B; 3WB0 A; 3I56 V; 1HWY A; 4W4L A; 2BOC C; 5LA6 A; 3W7X A; 2EX3 A; 4PA7 A; 5EIB C; 2CTR A; 1VQ7 V; 3CME V; 2FB5 A; 4UCR A; 5L3F A; 5LA6 B; 4X62 B; 1LR1 A; 1RFY A; 1N32 O; 4JPR A; 2JGD B; 1I94 B; 2EZP A; 1K92 A; 4RQE A; 2BTO A; 5E1A C; 4DR2 B; 4Z1V A; 1BQZ A; 4EKW A; 1KC8 W; 4PI2 A; 1F4M A; 3E8H A; 4MVM A; 4JTC B; 3JAW A; 3J81 N; 4DR6 B; 3H1I H; 1SF9 A; 1DLB A; 2ZE7 A; 4LBE C; 1MOF A; 4DV1 O; 1LNQ A; 3DGE A; 1N32 B; 3ABU A; 1YJW V; 1IUR A; 3IJ4 A; 1MSW D; 4LF8 B; 4YJ2 A; 3BY6 A; 2XAQ A; 4CZZ A; 2KB1 A; 3HKB B; 2QKA A; 1R6K A; 4X64 O; 3X2Q C; 2QM7 A; 2WPD G; 1MNG A; 3X2Q B; 1WJZ A; 3G6B A; 4IYH A; 1SZX A; 4TV9 A; 3FB7 C; 2LJ2 A; 4CH3 A; 4NYK A; 1FPO A; 1BSM A; 1BHB A; 1AR1 B; 1OCO B; 3BAB A; 1NH2 B; 2QJ1 A; 3SPH A; 1YZB A; 1H38 A; 2O57 A; 4WBN A; 3CSX A; 5C8Y A; 5IYB O; 5JJJ B; 1JQ0 A; 2UXN A; 2GSM B; 2XTA A; 1VIB A; 4JYA O; 2HVK C; 4FLW A; 4WF9 V; 4WBN B; 3CP1 A; 3ASN C; 5C8Y B; 3G67 A; 1AI6 A; 1U97 A; 3B09 A; 3JAT A; 4RO2 A; 2JEU A; 1SKV A; 2IM9 A; 5CBF A; 3ZMS A; 4B7E A; 2DJV A; 4I9W A; 1R1B A; 5JWP A; 2QA4 V; 1QLN A; 4Q6G A; 4GKJ B; 1AJN A; 5A2Q N; 4OPA A; 2CK3 G; 3JAT B; 2Y69 C; 2F23 A; 4BW9 A; 3R65 A; 5LP6 C; 2CDY A; 1I5X A; 4X8A A; 4UVC A; 3SPJ A; 1Q81 W; 3CCS V; 3CD6 V; 1QR8 A; 1NBM G; 5D5Q A; 3VQY A; 1M57 B; 1KP2 A; 1NU1 H; 5JJE B; 3K06 A; 2ARH A; 2Q7E A; 2EIN C; 1IDS A; 5CMU A; 1EBO A; 1EN5 A; 1NR7 A; 1NVP D; 5BR8 B; 2HVJ C; 1Q6H A; 4DRX A; 2QWP B; 4ZOL A; 1X59 A; 3ZBH A; 1HNX B; 1FFT B; 3APQ A; 4DO2 A; 2UXB B; 4DRX B; 2XUM A; 3ABM C; 3UO3 A; 4TOI A; 5LHH A; 3ABM B; 2B9Z A; 2F4V B; 1S5H C; 5CB4 A; 2JVD A; 2F95 B; 2ZT9 B; 3TCU A; 2IJH A; 1QVF U; 1HNW O; 1W2B U; 1EFR G; 4LF7 O; 1S3J A; 5EC2 C; 4CH6 A; 1SA0 B; 4LR3 A; 1WAZ A; 4K35 A; 4JI8 B; 2AHY A; 3OGC C; 2Q4P A; 1ZL8 A; 4AI8 A; 3I5D A; 3K58 A; 4DUY O; 1G1X B; 4MTF A; 2NLJ C; 4H37 A; 1YSC A; 2E75 B; 1OCC B; 2F1M A; 3H01 A; 4FLV A; 3LDC A; 1ZL8 B; 1KUQ A; 4BR6 A; 3CYO A; 4DV2 O; 2B1G A; 1AVM A; 2XHB A; 3ABL B; 1WNS A; 3O9O A; 3ASO C; 3JCU Z; 4NTW A; 5L3D A; 3B2E E; 3EVK A; 1WLE A; 4I4T A; 2Y0P A; 4DXW A; 3M8A A; 4FLU A; 3FB6 C; 4XDL A; 5KLV H; 1OZ0 A; 4I4T B; 1YTF B; 3LNM B; 4JI4 B; 3BPZ A; 3ZMV A; 1NI8 A; 3L9D A; 2W6J G; 1QR9 A; 5CA1 A; 1QVG U; 2UXC O; 3CHX A; 5J2T A; 2XT9 A; 3JAK A; 2Q6A A; 1JA8 A; 1W0K G; 4J9Z B; 4DV4 B; 1M56 B; 2OYQ A; 1CEZ A; 5CA1 B; 3E22 A; 1KMI Z; 3SYC A; 3K5O A; 3H1H H; 5J2T B; 2EBO A; 3C90 A; 1WPB A; 1NR1 A; 4NXN O; 4GZR B; 4PDV A; 2P4V A; 1B06 A; 4GT1 A; 1UPG A; 2EJR A; 4LF4 B; 1FJG O; 1KB9 F; 4I5S A; 5KX5 A; 1ZUQ A; 4LCU C; 5FNV A; 5IWA B; 4E2L A; 4MTG A; 4Z1M G; 1VQK V; 2FKX A; 1N0N A; 2PF4 E; 3K59 A; 5B1A B; 2Y48 A; 3OAA G; 4F6R A; 3JAR A; 4LF6 B; 2BOB C; 5KX5 B; 1J95 A; 4NTX A; 2UUB O; 2QKC A; 1KKD A; 1R3L C; 2ZDI A; 2E5L B; 4F6R B; 1K5Q A; 1L1F A; 1K8A W; 2ZDI C; 4B3R B; 3Q4H A; 2R9I A; 3L72 H; 4H33 A; 4PDR A; 1VQM V; 1IBK B; 4JYY A; 2UUA O; 2A3Q A; 3JAS B; 3HKE A; 4Q20 A; 4TQD A; 5IJ9 B; 4HYO A; 4DV5 B; 3S3W A; 2EIM C; 4JF3 A; 3QF7 A; 3B40 A; 1FXK B; 3HKE B; 1G4Y B; 1VQN V; 3LUT B; 4P9O A; 3K3W A; 1H2S B; 3ZED A; 3ABK C; 3EFF K; 2EUL A; 1XMO O; 1KU9 A; 2HKO A; 1N8R W; 1TUB A; 4JGS A; 4JAS A; 2ADQ B; 4X65 O; 4JI1 O; 1J5E B; 5LHI A; 3SYA A; 2ZKO A; 2Q5Z A; 1TUB B; 3CCE V; 5B1N A; 2JJ2 G; 3O65 A; 1PNK A; 3G6E V; 4PI0 A; 1L0N H; 2OCC C; 3U11 A; 2QTS A; 3H1K H; 5CBG A; 3E35 A; 1N36 O; 1RP3 B; 1ZAU A; 4JI3 B; 4TWK A; 1VQ5 V; 5KA6 A; 1R6T A; 1XOU A; 4MW3 A; 1XHZ A; 2JRI A; 3RT3 C; 2JEX A; 3UT5 B; 3B8M A; 1AJP A; 2VWK A; 3WB2 A; 2JIZ G; 2P4K A; 2W0X A; 2HJD A; 2LO1 A; 4PV1 B; 1HR0 O; 4B3S O; 2N74 A; 2EIL B; 4B3M B; 2EJ7 A; 3FFQ A; 3L73 H; 5JH7 A; 2A9H A; 3ABT A; 3QO5 A; 1JR9 A; 5J9P C; 3K04 A; 3D3Q A; 1Y66 A; 4X20 A; 3ZRW A; 1BQ0 A; 4PDL A; 1US6 A; 5JH7 B; 2QSA A; 2WLN A; 1L8D A; 2QWR B; 3K5N A; 2DE0 X; 1HNZ O; 3SPC A; 1WPX A; 2GTA A; 2CAZ C; 1YI2 V; 1RSO A; 1XHX A; 3G4S V; 1IBL O; 3W7U A; 3E2E A; 1V54 B; 2AW9 A; 3FAV A; 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3E86 A; 4YHH O; 2P6J A; 1T5E A; 2JGD A; 4RUE A; 1SZT A; 3DXR B; 4YIO A; 5EK0 A; 4DR3 O; 3AG7 A; 2QM8 A; 4XDK A; 4JV5 B; 1GKF A; 3OUF A; 2WLI A; 1FXV A; 3F5T A; 1MA1 A; 3RYF A; 4J42 A; 2WA3 A; 3T1C A; 4QPJ A; 2YXL A; 4XDJ A; 2D3O W; 1N34 O; 2CTW A; 1DF5 A; 2WLI B; 1GM8 A; 4LF5 O; 1JPX A; 3K9S A; 3RYF B; 4DR5 O; 1Q6U A; 3HKB A; 1N4C A; 4NXM O; 2QWN B; 2ZE5 A; 4MVO A; 2ZNI A; 2X0L A; 2HJF C; 1GH6 A; 1KD1 W; 4X9Q A; 3AK3 A; 4FIP C; 1ROP A; 3OEH G; 2PTM A; 4UCT A; 4GX2 A; 3D36 A; 4BIO A; 2YXH A; 3JD3 A; 3FKS G; 3CS5 A; 1ZSP A; 3LSQ A; 1OCO C; 2PUS A; 4A5U B; 1RM1 B; 4DV1 B; 1FAF A; 2N05 A; 5EZY A; 4J9Y B; 3J80 N; 1GM9 A; 3TXS A; 3SYP A; 3ZHV A; 1VF7 A; 3G80 A; 2RJZ A; 1SQB H; 5EZY B; 1IZ3 A; 3RWR D; 4X64 B; 4J41 A; 1SES A; 2K1E A; 3G71 V; 1FFX B; 4LC1 A; 1EZV H; 2Y4U A; 2UU9 O; 4CBC A; 1M90 W; 1AI7 A; 4NB5 A; 1NQT A; 4P9P A; 3CXC U; 3FYE B; 3TJT A; 2Z3Y A; 3TGU H; 2Q0A A; 1X4T A; 1VP7 A; 4JAV A; 3QO8 A; 2HG5 C; 3ZHS A; 5LOV A; 4ZKI A; 4IYI A; 4U3J A; 5H5N A; 3WU2 Z; 4JYA B; 3JCZ A; 4EB6 A; 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