The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
|
sequence length |
88
|
structure length |
88
|
Chain Sequence |
MHHHHHHLVPRGSILKEVTSVVEQAWKLPESERKKIIRRLYLKWHPDKNPENHDIANEVFKHLQNEINRLEKQAFLDQNADRASRRTF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of DnaJ domain of human KIAA0730 protein
rcsb |
| molecule keywords |
KIAA0730 protein
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
15
|
| structure length |
88
|
| sequence length |
88
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3APO A; 2QWO B; 2CTP A; 2GUZ B; 2M6Y A; 2YS8 A; 1N4C A; 2LGW A; 2L6L A; 3AG7 A; 2EJ7 A; 2QWR B; 4IT5 A; 1HDJ A; 2Y4U A; 3UO3 A; 2KQX A; 2DMX A; 1NZ6 A; 2CTW A; 4RWU A; 2CTQ A; 2N04 A; 3UCS C; 2YUA A; 2CTR A; 3BVO A; 3UO2 A; 2LO1 A; 2CUG A; 2Y4T A; 1BQZ A; 4J7Z A; 1XBL A; 4J80 A; 1BQ0 A; 3APQ A; 2QWN B; 2PF4 E; 2N05 A; 1WJZ A; 2OCH A; 2QSA A; 1FAF A; 2GUZ A; 1FPO A; 2QWQ B; 1GH6 A; 2QWP B; 2DN9 A; 1IUR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CH7 A; 3F7V C; 4B3S O; 3D36 C; 4GKJ B; 3ZRS A; 2GV9 A; 2KB1 A; 3WG7 B; 4YIP A; 2F1M A; 1RFY A; 3JCU Z; 3L70 H; 5J2U B; 3TCU A; 1M1K W; 2QSA A; 1RSO A; 2YIB A; 2UXC B; 1SKV A; 1OCC C; 3QF7 A; 5IWA O; 1GRJ A; 2ODM A; 1JOY A; 2Y69 C; 2YS8 A; 2PI4 A; 4HBN A; 3BRC A; 1NH2 B; 3THO A; 3CCM V; 1DTO A; 1S5H C; 1WA8 A; 4JTD B; 2EZP A; 2ZT9 B; 4B3S B; 2OT5 A; 3HKB A; 4X1K A; 3G6B A; 5A9G A; 1JCH A; 4EB6 B; 2Y69 B; 4FK5 C; 2EX3 A; 3SJQ C; 1DF4 A; 1N36 O; 1CP9 A; 2BTQ A; 3UT5 B; 2EJR A; 4J11 A; 2XAG A; 3DGE A; 1PPJ H; 1JA8 A; 4B3M O; 4I9W A; 2WA4 A; 1VQ9 V; 4C7U A; 2IBZ H; 3TK1 A; 2WLI B; 2YI9 A; 3KKY A; 4HZ3 A; 3MAQ A; 5L3D A; 4FLY A; 4DUZ B; 4A5U B; 5F2V O; 4FM0 A; 4I55 A; 4AHC A; 4LFB O; 5KA6 A; 4TV8 B; 2ZE6 A; 2E76 B; 4HAM A; 5FPO A; 3JYC A; 4DR3 O; 5KMG B; 1S5J A; 1XBL A; 3D3I A; 5B3S C; 1BGY H; 3GVM A; 5DM6 V; 3A0R A; 5EZY B; 3LUT B; 5CA0 B; 2BSK A; 3K9A A; 3S3W A; 4Q6G A; 1U96 A; 1S5L Z; 5FL7 G; 2ZR2 A; 5K1P A; 2F66 C; 1Q8I A; 2ITC C; 5LMU B; 3JAR A; 4Q20 A; 5B3S B; 2N05 A; 1GK9 A; 1SRY A; 2R9I A; 4WFE A; 5H6Q A; 5C93 A; 2RDC A; 1QR8 A; 4L8J A; 3E83 A; 4PDL A; 4DR4 O; 1BQZ A; 1PL0 A; 1UJW B; 1BQ0 A; 5KHJ A; 1AIL A; 1GTO A; 4DV6 O; 2PI5 A; 1LR1 A; 2YID A; 2QGN A; 3N2K B; 2NN4 A; 3B8N A; 4WFF A; 1HR0 B; 4J9Z B; 3CXC U; 3CJH A; 2X6B A; 2XAH A; 1Q82 W; 4JTA B; 3OUF A; 2VWJ A; 2EZO A; 3ZRV A; 4IIJ B; 1AP5 A; 4BW5 A; 4J80 A; 4P30 A; 4QGP A; 1HNZ B; 1M4U A; 1SQX H; 2DYR B; 5BZB A; 1L8D A; 4TQF A; 4MVU A; 3UQ8 A; 3G4S V; 5LHI A; 4ICG A; 1Y74 A; 2D2C B; 2P4V A; 3D8C A; 1ENV A; 3CCR V; 3K08 A; 1W59 A; 3H01 A; 2HFE C; 1IX9 A; 4J7J A; 3HKE A; 4LF7 O; 4ZI7 B; 1VMG A; 4HNA A; 4CS3 A; 1XEQ A; 1JPX A; 2OWO A; 2EIK C; 3HR0 A; 2YC0 A; 3ABU A; 5IJ0 B; 2R9R B; 1Q5O A; 2QM7 A; 4FIP C; 4JI0 B; 1RPO A; 1YI2 V; 3OGC C; 3OW2 U; 2LJ2 A; 1H2N A; 2ATK C; 4JF3 A; 1COW G; 3ZX6 A; 1Q81 W; 4JI7 B; 5IT9 N; 3OMI B; 4X62 O; 3K5O A; 4I4T B; 2EIK B; 4BIZ A; 3FB8 C; 1T5E A; 3K59 A; 2RMK B; 5GW7 A; 3B8M A; 5L3G A; 2ZIO A; 2XTA A; 3K57 A; 1WP7 A; 3T1H B; 1K8A W; 2XUM A; 2ZNJ A; 3M8A A; 1VP7 A; 3O65 A; 2QKS A; 4IL6 Z; 4BWA A; 2GBO A; 1MZE A; 2DYS C; 4NKG B; 3AG2 C; 1I5Y A; 1JQ0 A; 1IBM B; 3ETD A; 2B1G A; 3CCV V; 4NXM O; 3PN1 A; 4JI4 B; 1NQT A; 4X62 B; 3DXR B; 4YJ3 B; 4LF4 O; 3RT3 C; 4DR5 O; 1G8M A; 5GON B; 2ZE7 A; 1K33 A; 3AG2 B; 4IYH A; 5FNV B; 4EFB A; 5L3C A; 1YTF B; 1VIB A; 4DV1 O; 4P2Z A; 3W7X A; 2LQT A; 3U11 A; 3E89 A; 3K9S A; 2IJK A; 4JI5 O; 1XNR O; 2F43 G; 4PI2 A; 4H37 A; 3CC2 V; 4KHP O; 4GX0 A; 2YXH A; 3G67 A; 1AR5 A; 3RGB A; 5KUK A; 2BOB C; 1MSD A; 3BVO A; 2ADP A; 5EIB C; 4K35 A; 4J7Z A; 3ZHR A; 3R65 A; 3J7A U; 1KEC A; 1V55 C; 3OEE G; 3A2F A; 4W4L A; 2CAZ C; 5LP6 C; 2GUZ B; 3SYC A; 1BHB A; 3SPG A; 1ARO P; 4PA4 A; 2QWR B; 3SDL A; 3OTO B; 1XHZ A; 3L75 H; 2AHZ A; 1OZ0 A; 4CS2 A; 3RFR A; 2WSS G; 4L87 A; 2DQ3 A; 2WAM A; 1K5S A; 1HW7 A; 1NR1 A; 1RPR A; 2G38 A; 1THZ A; 1WA8 B; 2YXY A; 1V55 B; 4UB6 Z; 1YVW A; 1OCR B; 5LP6 B; 4KL1 A; 4JI3 O; 4MSW C; 3HKB B; 4X1K B; 2XOK G; 4DK0 A; 4GUN A; 1OJH A; 4TV8 A; 2A0L A; 4EEQ A; 3HPL C; 4BIO A; 3FAV A; 4LF5 O; 4DV7 O; 2FYU H; 5KMG A; 3ICX A; 3UKM A; 1SQQ H; 5GTH Z; 2BTQ B; 3R66 A; 2KKW A; 3PJS K; 2PYL A; 1L1F A; 4TQD A; 1KKC A; 3I5D A; 2WLN A; 4MTX A; 4OPA A; 4B3T O; 1MOF A; 3JD1 A; 2JJ2 G; 4O4J A; 5CN0 A; 4JI3 B; 2GSM B; 3ZRW A; 4JAU A; 4DW1 A; 2CUG A; 4I55 B; 5LGU A; 4B08 A; 4DV4 B; 3FX7 A; 4LF5 B; 1PNL A; 3E8H A; 1QQC A; 4DO2 A; 3IAY A; 3G80 A; 4UCT A; 1SQG A; 2Q7G A; 3EFF K; 1NVP B; 1QLN A; 1KKD A; 4X9Q A; 4B3R O; 3S3X A; 2ZIM A; 1Q6U A; 2Q7H A; 4JI8 O; 3JSL A; 1MMM A; 1Y67 A; 1EN6 A; 3P32 A; 3L74 H; 5IYD O; 4LH7 A; 4GLX A; 5B66 Z; 3CP1 A; 2W6J G; 3JAR B; 5IYC O; 1R6N A; 4TV9 A; 5E79 Z; 1VF7 A; 5KLV H; 3D3Q A; 5KAF Z; 1M57 C; 4IIJ A; 4DW0 A; 3K0G A; 3CCL V; 3CMA V; 2JDI G; 1S72 V; 2VRZ A; 4JI8 B; 2JGU A; 2WLJ A; 1N34 B; 1QVF U; 1WB8 A; 2GDS A; 4DR2 O; 5JJE B; 4LF6 O; 2PTM A; 1XUQ A; 2OIE A; 1I7F A; 5KHK A; 1Q6I A; 1M57 B; 1HNX B; 1G4Y B; 2JIZ G; 4UCU A; 3TXS A; 1AI4 A; 1RP3 B; 3RWR D; 2H94 A; 4ZI7 A; 2WWW A; 3AG3 C; 2EBO A; 4FZ0 A; 4CH6 A; 5KX5 A; 5J2T A; 2XND G; 1F23 A; 2WLH A; 3JAS A; 2QKA A; 4JI1 O; 2BCC H; 3SJB C; 1VQ7 V; 2FB5 A; 1YHQ V; 3ZMU A; 5LXT A; 1IBK O; 4X66 B; 1B04 A; 3L9D A; 1GH6 A; 4OX9 B; 2MW2 B; 1BZK A; 3SYO A; 5KHH A; 2AZ0 A; 3BY6 A; 4GKK O; 4E2L A; 2Q73 A; 1TA8 A; 3CCE V; 3MDS A; 4DR2 B; 2JEX A; 1Q3E A; 1ZUQ A; 1GM8 A; 2CTQ A; 3B4S A; 3K5N A; 1WPB A; 1J95 A; 5K1X A; 2ZNI A; 4J42 A; 5DED A; 1VQ4 V; 3QNE A; 4Z2W A; 3K5L A; 4JI1 B; 3SYP A; 3KG2 A; 4F6E A; 1JR9 A; 4P9O A; 3ZCC A; 1IBK B; 3T1C A; 2CK3 G; 4HNA B; 3VQX A; 1TGO A; 3GWO A; 3HB3 B; 1K97 A; 2Y0P A; 2YDE A; 1YF2 A; 2A9H A; 3E8B A; 4JV5 O; 1PM9 A; 3ETG A; 5L3E A; 2IJI A; 5JJJ B; 3DXR A; 4GKJ O; 5L3B A; 1PL4 A; 4YJ3 A; 1Q6H A; 4GT1 A; 3H1H H; 4XDK A; 5IYB O; 3J81 N; 1DLB A; 5FNV A; 2B5U A; 1M56 C; 1XQ8 A; 2HVK C; 3K03 A; 2XAF A; 2UXC O; 1X59 A; 3ZHQ A; 3VQW A; 2YSU B; 4X1Y A; 4MTO A; 3ZHU A; 5B1O A; 5JH7 A; 4PEL A; 1XOU A; 4F4L A; 4JV5 B; 1N4C A; 5KA5 A; 1GM9 A; 3JAT A; 4G28 B; 3HKC A; 3HKD A; 1AJP A; 1LUV A; 1M56 B; 1WP8 A; 4PA9 A; 1WN7 A; 5JJN B; 1SER A; 2PY5 A; 4JAS A; 2DE0 X; 4IHJ A; 4MS2 A; 5IY5 C; 4CC6 A; 2GUZ A; 1S76 D; 2QWP B; 1F4N A; 4JYY A; 4MVZ A; 3OMA B; 2Q0A A; 3E8F A; 2UXD O; 4JI2 O; 2BE3 A; 1K5Q A; 1EM1 A; 5H5N A; 2Y4T A; 4FM2 A; 2FL4 A; 3OAA G; 2X0L A; 5LP6 A; 1N8R W; 3B09 A; 1NU1 H; 2HKO A; 1KBH A; 1OCC B; 4DUZ O; 3U10 A; 2W6I G; 2Q69 A; 4FLZ A; 2JK5 C; 4DV0 B; 1HNW B; 2UXD B; 2IJJ A; 3ZN1 A; 4JI2 B; 4CH5 A; 5LGN A; 2HVJ C; 4RO2 A; 3IC7 A; 1VF5 B; 4FLW A; 4LFA B; 2QR4 A; 1FXK A; 1DGS A; 2B9Z A; 2P6J A; 1YZB A; 3ML0 A; 1YIT V; 1S77 D; 1OCO C; 3CE2 A; 1XMO O; 1P7G A; 4FJC C; 1GN2 A; 2ZR3 A; 5LMU O; 5EC1 C; 3N27 A; 3TGU H; 1CXZ B; 4I5S A; 3FAV B; 5CB4 A; 1EZV H; 3AK3 A; 5D5Q A; 2BTO A; 1N0N A; 3BFR A; 4LBE C; 1KYO F; 2R9A A; 1OHH G; 2IH1 C; 3JD3 A; 1OCO B; 2HEP A; 4UV9 A; 4JAV A; 1NH2 D; 2M6Y A; 1V9P A; 3QG5 A; 4UCV A; 3JD4 A; 3QVN A; 4O4J B; 4DXW A; 3FYI B; 2YUA A; 2Q68 A; 3FB6 C; 3W7T A; 1XMO B; 1XL4 A; 3ZRW B; 1WB7 A; 3M7M X; 4NR1 A; 2A3Q A; 1QBZ A; 3JD2 A; 3F7Y C; 1HR0 O; 4FFK A; 3CCJ V; 1KMI Z; 3JCZ A; 3F5W C; 4UCR A; 4NTX A; 2UU9 B; 1JFF A; 2QDO A; 4I50 B; 1QLE C; 1H2G A; 1HNZ O; 4LWS B; 4O2A A; 4BIU A; 2ADQ B; 3NXS A; 2EIM C; 2XAQ A; 2PF4 E; 2EIN C; 3ZED A; 3ABK C; 3JAK B; 2F23 A; 4NTY A; 4PHZ A; 1ROP A; 1SZT A; 4Z1V A; 3DC5 A; 2DN9 A; 5CA3 A; 4RAI A; 4PI0 A; 3JAW B; 5J9P C; 1WPX A; 4D7S A; 4MTF A; 4ZHQ A; 1XI1 A; 1Q90 D; 2QTS A; 1FYJ A; 1QLE B; 1SES A; 3SJA C; 4TV9 B; 1IBL B; 3AK1 A; 4J41 A; 1GN4 A; 3UO2 A; 4JGS A; 1KQS U; 2EIM B; 2LW1 A; 2EIN B; 1SET A; 4W4K A; 2ZIN A; 1H2S B; 4TWK A; 3SYA A; 3J80 N; 3CC7 V; 4JI0 O; 3TXQ A; 3FD9 A; 3RYH B; 2ZM6 O; 4HYO A; 2K9P A; 4YHH O; 4ABM A; 3I55 V; 3OFN G; 3O9O A; 2A7W A; 4JI7 O; 1KP3 A; 3OD4 A; 1VQ6 V; 1AP6 A; 1FS0 G; 3JAM N; 5IYZ A; 1EN5 A; 2OTL V; 3LDC A; 3SPH A; 5KX5 B; 5KHG A; 5J2T B; 1JMK C; 1NJI W; 3JAS B; 2QWQ B; 3SR2 C; 5LXT B; 1B6Q A; 4KP4 A; 3T1H O; 2F4V B; 1PNK A; 2JS5 A; 1W0K G; 3RW0 A; 2YEV A; 2E3C A; 4DV2 B; 1XMQ B; 1K34 A; 1B3Q A; 3CRR A; 2ZM6 B; 4YHH B; 3M99 B; 1IBM O; 5CA1 A; 2UXX A; 3SPC A; 4PDM A; 4MW8 A; 1SC5 B; 4JI4 O; 1TUB A; 1H8E G; 1F7Y A; 5EYP A; 1QVG U; 3TJT A; 3E35 A; 3QO5 A; 2NNU A; 4NVP A; 2VWK A; 1HP8 A; 1XL6 A; 2V7Q G; 2W0X A; 4NB5 A; 1G6U A; 3CXH F; 2DOS A; 3LDD A; 1SQF A; 3E2E A; 2CGN A; 2IJH A; 2P22 C; 3NR7 A; 2UXN A; 2DW4 A; 2WLK A; 2KG7 A; 5LL6 Y; 4MVR A; 5CBF A; 1SS3 A; 2DQ0 A; 3DTU B; 1TAE A; 4LFC B; 2F95 B; 2UXB B; 3K58 A; 1FD9 A; 2IM9 A; 4H44 B; 4O4L A; 3CC4 V; 1VAR A; 2OYQ A; 4GCZ A; 4UVC A; 2DYS B; 1SF9 A; 2UUB B; 1KC8 W; 2XAJ A; 1VQN V; 1PKX A; 3CB2 A; 3MHS C; 4K8Z A; 5BY1 A; 3OTO O; 1NT2 B; 1R3J C; 2AHY A; 4X1Y B; 3A0B Z; 1FXV A; 3CRA A; 3K0D A; 5TIS Z; 5JH7 B; 2A79 B; 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1IUR A; 2RNB A; 5HFM A; 4MVQ A; 4JZ2 A; 2ZE5 A; 2WLL A; 2ZDI C; 4UB8 Z; 2QEX V; 1PV0 A; 4X66 O; 3E22 B; 1OCZ C; 1VQ8 V; 4OX9 O; 1GN6 A; 1JFF B; 1Q43 A; 3A8T A; 5LOV B; 2E74 B; 4TUY A; 4BW9 A; 2RN9 A; 3I56 V; 1GKF A; 3RYH A; 4O2A B; 2OCC C; 3AG4 C; 1SA0 A; 3DSQ A; 3OGI B; 4DR1 B; 1YIJ V; 2A06 H; 2Y48 A; 2DWD C; 3CWB H; 1JVM A; 1WAZ A; 4B7E A; 3KZI Z; 1K9M W; 3OTF A; 1H2L A; 2CTW A; 5LA6 B; 2MK3 A; 2E75 B; 1Y4M A; 4ZHQ B; 5BXZ A; 2UUA B; 5EBM C; 5ITZ A; 4DR7 B; 1M9N A; 4YY3 B; 4N23 A; 4TOI A; 1NVP D; 4X65 O; 1E1R G; 3AG4 B; 3B77 A; 4FFB A; 4PD4 F; 1PP9 H; 3JD0 A; 3T4D A; 3RYI A; 1TVK A; 4WFG A; 4UVA A; 3AG3 B; 2KQX A; 4O4I A; 2AXT Z; 1W0J G; 4RQE A; 1CPY A; 3ASO C; 4K0K O; 5BMV B; 1SQB H; 1BMF G; 1VQM V; 3ASN C; 4U7O A; 1BT8 A; 5IYZ B; 1ZSP A; 2IW5 A; 1P84 F; 4DV5 B; 1Q7Y W; 3BA8 A; 1NKD A; 4X65 B; 3H1J H; 2LGW A; 2K1E A; 3ABM C; 1HDJ A; 4WFH A; 1PD3 A; 1XRE A; 3G71 V; 1U97 A; 1YDX A; 4YJ2 A; 3BAB A; 4MVO A; 2YEV B; 4X64 O; 5KAI Z; 3ASN B; 4I7Z B; 3FB5 C; 4J7K A; 4JI6 B; 4PDV A; 4WFB V; 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