The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
46
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structure length |
46
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Chain Sequence |
SEALKILNNIRTLRAQARECTLETLEEMLEKLEVVVNERREEESAA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Dna binding protein
|
| source organism |
Escherichia coli
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| publication title |
The H-NS dimerisation domain defines a new fold contributing to DNA recognition
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
DNA-binding protein H-NS
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| total genus |
16
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| structure length |
46
|
| sequence length |
46
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-12-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | H-NS histone-like proteins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NI8 A; 2MW2 B; 1LR1 A; 4ICG A; 3NR7 A; 1OV9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CWB H; 4IHJ A; 4GKK B; 1QLE B; 3CRC A; 2LJ2 A; 3CX5 F; 2Q9L A; 2ZR2 A; 4B3R O; 3L74 H; 3CCU V; 3LSU A; 4H44 B; 1YTF B; 4DK0 A; 3OTO B; 2YI8 A; 1ZLZ A; 5KA5 A; 1N0N A; 3RYC A; 4GUN A; 4LWS B; 1VQ5 V; 1AP5 A; 3X2Q B; 3JD0 A; 1S5H C; 4GKJ B; 1ZL8 B; 2ZKO A; 4X64 B; 4JAS A; 2DQ0 A; 3ABK C; 2IJJ A; 1PM9 A; 4DUY O; 1IXB A; 3MHS C; 1W0J G; 3QF7 A; 1VQM V; 4I5S A; 3WB1 A; 3A0H Z; 4BIU A; 1WPB A; 4B3S O; 5CB4 A; 2WLL A; 4J9Z B; 1DF5 A; 1MZE A; 4LBE C; 3APQ A; 2JJ2 G; 1K34 A; 5BR8 O; 1HNW B; 5KAI Z; 2BCC H; 2FTK A; 4CC6 A; 3EFF K; 1QQC A; 2OYQ A; 2KG7 A; 3RW0 A; 1GMG A; 1R6N A; 2DE0 X; 3G67 A; 2AHZ A; 4YHH B; 1I7F A; 2PTM A; 4TWK A; 4FM1 A; 4JAV A; 3JAS B; 2YIC A; 3LSS A; 2UU9 O; 2F66 C; 5A9G A; 4JI2 O; 2Q4P A; 1YSC A; 2R9I A; 4DR3 B; 2UUB O; 1Y74 B; 5B1B C; 1F4M A; 3K5L A; 5BMV A; 3JAM N; 2ZDI A; 4LF8 B; 3RYF B; 3VQX A; 2AXT Z; 1FPO A; 3A2F A; 5ITZ B; 1YXB A; 1MOF A; 3T1Y O; 4GYC B; 1RM1 C; 1QCE A; 1SES A; 1VMG A; 4H37 A; 5LMN O; 2W0X A; 3F7V C; 5JVD B; 4MTF A; 3ZHU A; 2ZXW B; 3M99 B; 1IVS A; 1I5X A; 4TV9 B; 4DV6 B; 2UUC O; 1AJP A; 2Z0A A; 1KQS U; 4JF3 A; 5J2U B; 3STZ C; 3ZRW A; 3GWO A; 4X62 B; 5A2Q N; 3WG7 B; 5FPO A; 2QJ1 A; 1TVK B; 2ZNI A; 2YXH A; 4MS2 A; 4UUJ C; 3ZBH A; 3RYH A; 3ABL C; 3UCS C; 2QTO A; 4YY3 B; 3CCR V; 2E3C A; 4DK1 A; 3BA8 A; 1RSO A; 2XAJ A; 3SJQ C; 3G6E V; 5JCO C; 3AG7 A; 4JTC B; 1SQF A; 3LDE A; 3ASN C; 1XNQ O; 5EK0 A; 1YVW A; 1R6K A; 4DR7 B; 4F6E A; 1J5E O; 3JAK A; 1BS3 A; 3IC7 A; 1M57 B; 1Y76 B; 5AG2 A; 4CH5 A; 2KB1 A; 2EX3 A; 1XMO O; 1FD9 A; 3G6B A; 2ARH A; 2YEV B; 1AI4 A; 3ETD A; 5IWA B; 3H01 A; 1M4U A; 3SPC A; 3CRQ A; 4LF4 O; 1NTZ H; 4RQE A; 1Y4M A; 2QKA A; 4FLU A; 1IBM B; 3ZMV A; 4DUZ O; 3ZHR A; 3L71 H; 5LYJ B; 1XDC A; 2N74 A; 4FJC C; 4JZ2 A; 1BCC H; 2BTQ B; 2Q0O C; 3FB6 C; 4OXS A; 4IHJ B; 4JI3 B; 4R7C A; 1EBO A; 1QR9 A; 3OTO O; 5JJN B; 4DV1 B; 1S5L Z; 4R50 A; 2HVK C; 3SJB C; 4I50 A; 4QPK A; 1CPY A; 1Y66 A; 4I9W A; 4I55 A; 1W0K G; 5HFL A; 2G38 A; 3ZRS A; 4A5U B; 3ZHV A; 1COW G; 1IDS A; 1E1Q G; 1Q86 W; 5KHK A; 4X64 O; 1N4C A; 4K0K B; 1EN4 A; 2XAQ A; 1JVM A; 5CA0 A; 1OCO B; 1V55 C; 2LFR A; 2E76 B; 2FYU H; 5KHJ A; 1UJW B; 3OUS A; 2IJH A; 2A7W A; 4DV3 B; 4QGP A; 1G8M A; 2QTS A; 3K08 A; 2WLL B; 5GTI Z; 3UM7 A; 4JGS A; 1JR9 A; 4KL1 A; 2Y0I A; 4JYA B; 1Q3E A; 1XIL A; 3CPW U; 1HNW O; 1SRY A; 5H9C A; 2Y48 A; 3UT5 B; 1TUB B; 2IM9 A; 1JX9 A; 5IE9 A; 3KG2 A; 3E35 A; 1AR5 A; 2KG7 B; 3QG5 A; 1HNX O; 2Y69 C; 5KUK A; 1O9H A; 3QTC A; 1DF4 A; 4CC5 A; 3HKD A; 3FB8 C; 3CCJ V; 2ZE8 A; 4J7K A; 3GB7 C; 4YHH O; 4UCS A; 1A32 A; 4ZKI A; 1SF9 A; 4O4I B; 4XBF A; 3BVO A; 2LQT A; 5IYZ A; 4WFG A; 1VQ7 V; 4MTO A; 3MDS A; 4DR3 O; 5B1A B; 4AQY B; 4I9Q A; 3IC9 A; 4JI1 B; 4MTG A; 4JYY A; 1R73 A; 3BRC A; 5BMV B; 4F6R A; 3CCV V; 1YCI A; 2OCC B; 1VQL V; 1HWY A; 5KHH A; 1ZAU A; 2M7W A; 1CEZ A; 1K4C C; 1Q6U A; 1M9N A; 2CUG A; 1H38 A; 3G80 A; 1BQ0 A; 2XAH A; 4QJF B; 2Z5U A; 4WFB V; 4IIJ B; 3JAR A; 2EIL C; 2F43 G; 5LGN A; 1BL8 A; 2XAS A; 4BIZ A; 4NTY A; 4X1Y B; 2HVJ C; 2L6L A; 1IBK B; 1YJW V; 3E22 A; 3E89 A; 4LF6 B; 1EM1 A; 2OTJ V; 1RP3 B; 4NYK A; 4MVZ A; 3KKY A; 3MAQ A; 2JDI G; 2DYR C; 2O57 A; 4DV6 O; 1OHH G; 5CN0 A; 4FK5 C; 3EVK A; 3BY6 A; 4UCT A; 4X62 O; 5IY5 B; 3OW2 U; 1VF5 B; 4U3J A; 3U11 A; 2WAM A; 4DRX A; 1FXV A; 2YC0 A; 1B6Q A; 5D5Q A; 1SQP H; 1NBM G; 5LP6 B; 3OE7 G; 3ZHS A; 3H1I H; 4YY3 O; 3HB3 B; 4D6T H; 2V7Q G; 2HHH B; 1M56 C; 4B7E A; 1MAB G; 2CAZ C; 2XND G; 5LXT B; 5GW7 A; 1ARO P; 3HKC B; 4DR4 B; 4EB6 B; 2QSA A; 4YIP A; 4DR7 O; 2NNU A; 2VWK A; 1VF6 A; 4G2K A; 3ZED A; 4DV4 B; 1HDJ A; 4NXN B; 3ZMU A; 2ZD9 A; 1P7G A; 3LUT B; 3KCX A; 2W6I G; 2Q5Z A; 3CB2 A; 2BOB C; 5IWA O; 4JTA B; 4OPA A; 1VAR A; 3CD6 V; 4PV1 B; 1R1B A; 1GN2 A; 4DR1 B; 5IYC O; 3K5N A; 4XDJ A; 3CE2 A; 5L3D A; 3BEH A; 1IBM O; 4JTD B; 2DWE C; 3QO5 A; 1FYJ A; 2GUZ A; 1QU7 A; 4L87 A; 3M7M X; 4PI0 A; 3ASO C; 4XDL A; 4JI3 O; 5CA1 B; 2YID A; 2DW4 A; 4CH6 A; 4DV7 B; 4CBC A; 4DV1 O; 3HKE A; 2K1E A; 3JSN A; 4J9Y B; 1UFI A; 1WB8 A; 1FXK C; 1M1K W; 1KB9 F; 2PYL A; 3E83 A; 4O2A A; 5J2T A; 5GON A; 2OT5 A; 3VQV A; 2XHB A; 4ZOL B; 5CBF A; 1VEW A; 1J95 A; 4JI5 B; 2E75 B; 5LL6 Y; 4K0K O; 1N36 B; 2YXY A; 2LO1 A; 1Q5O A; 4ASU G; 1H2N A; 5CMU A; 3CME V; 4DV3 O; 1BHA A; 5LHI A; 4FPP A; 1RFY A; 1G6U A; 1BT8 A; 1DGS A; 1N0J A; 1ORQ C; 2PGG A; 4FFK A; 4FLY A; 3OT7 A; 2IU0 A; 3T1H B; 4JYA O; 1NU1 H; 3SPH A; 1TUE B; 3FX7 A; 4BW9 A; 4DR2 O; 2MK3 A; 2GSM B; 1NVP D; 3C90 A; 4PA6 A; 2XT9 A; 2H8P C; 3D3Q A; 2EIN C; 3TXS A; 1BQZ A; 3UO3 A; 2Y4T A; 5IJ0 A; 4UV9 A; 3HKD B; 2WLJ A; 2V1D A; 4BAY A; 1KD1 W; 3CCS V; 1Y6X A; 1IZ3 A; 5LOV B; 1Y67 A; 5IYZ B; 2GDS A; 2HKO A; 2B1G A; 5KX5 B; 2DN9 A; 2CTQ A; 4AQY O; 3SPJ A; 4YJ2 A; 3E8B A; 2H94 A; 4JI1 O; 4YJ3 B; 5CA3 A; 3AG1 C; 4LF5 O; 2N04 A; 4FLW A; 1YIJ V; 3OMN B; 3TXQ A; 1YF2 A; 2ETN A; 4HBN A; 2IJK A; 3FAV A; 1QHT A; 3CXH F; 4O4H B; 4UCV A; 1S72 V; 1BSM A; 2NLJ C; 3N2K B; 5IDJ A; 2YIB D; 3A0R A; 1JJO A; 1IBK O; 4GLX A; 4I0X A; 2P6J A; 4LF6 O; 2A06 H; 1L0N H; 2AW9 A; 5L3F A; 4K8X A; 4O2B A; 3BHP A; 4UVC A; 1M90 W; 1BMF G; 4PA3 A; 2WSS G; 4ZI7 B; 2ZIM A; 1MSW D; 1SQX H; 1SC5 B; 2EJR A; 1OCZ C; 1IX9 A; 1KC8 W; 1F4N A; 3W7S A; 2X6C A; 5FNV A; 4NB5 A; 2EZO A; 1M5I A; 2HHH O; 2EUL A; 4JZG A; 1YEW A; 5BXZ A; 1CP9 A; 1FS0 G; 1AR4 A; 4X1K A; 4FFB A; 4J11 A; 2ZT9 B; 4DR4 O; 3DC5 A; 3H1L H; 5KA6 A; 3CCL V; 1V54 C; 4MVR A; 1QLE C; 4Q20 A; 2FKX A; 3ZHT A; 1SA0 A; 4DV4 O; 4NXN O; 1HNX B; 5C8Y B; 3E8G A; 4KHP B; 4TUY A; 4RAI A; 3JYC A; 3HPL C; 5FPR A; 4GX5 A; 4X1I B; 5KHI A; 2ATK C; 3T1C A; 3T4Z A; 1K33 A; 3X2Q C; 3JAL A; 4DR1 O; 3OD4 A; 3W7W A; 1PL4 A; 4FMT A; 3UQ8 A; 3DXR A; 4CH4 A; 4UV8 A; 5EYP A; 3RYI A; 1NH2 B; 4YXW G; 4DYL A; 2P06 A; 2A9H A; 2DMX A; 4EFB A; 2BSK B; 3JAT A; 5LGT A; 2OIE A; 2P67 A; 4LH6 A; 3JD2 A; 4DV7 O; 1MG1 A; 5EZY A; 1FFX B; 3ML0 A; 3HKE B; 3LNN A; 2WWW A; 4DV5 B; 4PA9 A; 4GZR B; 5LA6 A; 2R72 A; 1QR8 A; 5DM6 V; 1K7D A; 4ABM A; 4O2A B; 4RQF A; 2D2C B; 2WPD G; 3RVZ A; 4JI5 O; 3LDC A; 1N36 O; 1H2M A; 1PL0 A; 1XI1 A; 1Z2G A; 1Z5V A; 5DED A; 3N2G B; 1CXZ B; 5FL7 G; 5L3G A; 1NTK H; 4DV2 B; 3CJH B; 1LNQ A; 4J42 A; 2R9A A; 4IL6 Z; 3O65 A; 1FFT B; 1SKV A; 1VQN V; 3T1H O; 1WA8 B; 4X20 A; 3OEE G; 4HNA A; 4MT8 A; 2KQX A; 1XRE A; 2EIM B; 3SPI A; 1RPR A; 3TJT A; 3N27 A; 1MZF A; 1X59 A; 2ZR3 A; 2VS0 A; 3JAW A; 2QE7 G; 1JPX A; 3AG3 C; 3OGI B; 3U10 A; 4MVO A; 4MW8 A; 2ZCE A; 1HR0 B; 4DXW A; 1IXM A; 3C3T A; 1OCC B; 2ZM6 B; 4DO2 A; 1QVF U; 4MVQ A; 3L75 H; 4ZHQ B; 2LFS A; 2BE3 A; 5JH7 A; 2KSD A; 3QVN A; 1US6 A; 4MVM A; 1ZSP A; 2JEU A; 2ZXW C; 1JA8 A; 2ADP A; 3LDD A; 3P3P A; 2HJF C; 2ODM A; 3AK3 A; 2WLN A; 1YDX A; 4K35 A; 5B5E Z; 1MMM A; 4P2Z A; 1GM7 A; 5IJ9 B; 4IYI A; 1R3J C; 2F93 B; 1ENV A; 2LP7 A; 3FAV B; 2JGU A; 1K9M W; 2VRZ A; 4I0X B; 4B08 A; 4EEQ A; 3RYC B; 3FYE B; 1JFF A; 1XL4 A; 3KCY A; 1HNZ B; 2GBO A; 1NT2 B; 3OAA G; 4NVP A; 4QNH B; 1Q6H A; 4H0L B; 2E5L B; 4ICG A; 4TV8 A; 5JJJ B; 3ZHQ A; 4GX0 A; 4E2L A; 5FLX N; 3L73 H; 5B1O A; 1P7B A; 5K1X A; 1F7Y A; 3R66 A; 2QKS A; 1VQ6 V; 1LR1 A; 5EC1 C; 3BAA A; 1Q43 A; 3H1J H; 4LF7 B; 3J7A U; 1L1F A; 1YIT V; 4I7Z B; 1HP8 A; 2CE4 A; 2F4V B; 3C3S A; 5CB4 B; 4LNU A; 2JJ1 G; 2VWJ A; 1VQ4 V; 3B2E E; 3CHX A; 1NQT A; 3WB2 A; 3GVM A; 4X1K B; 3U0Z A; 1DLB A; 4DR2 B; 2X0L A; 1VQP V; 5B3S B; 4FLZ A; 4I4T A; 1GK9 A; 2B5U A; 1KBH A; 3CC4 V; 3K03 A; 4IYH A; 2Q8V A; 3ZMZ A; 1ROP A; 4GX1 A; 4KHP O; 1Q82 W; 3K06 A; 1K8A W; 3ZRV A; 2OCH A; 4JI8 B; 1H2G A; 2GHY A; 4HYO A; 4FLT A; 2Q68 A; 4JV5 B; 3DSQ A; 4IT5 A; 4BWA A; 2QGN A; 3Q4H A; 2JGD A; 1N34 O; 1TGO A; 2EIJ B; 5L3B A; 3DXR B; 3CCE V; 4O4L A; 1Q90 D; 4JAA A; 1OCO C; 5EYP B; 3RBZ A; 3IJ4 A; 3RYI B; 2Q7G A; 4LF5 B; 3CMA V; 2RNB A; 1VQO V; 2PI5 A; 3JD1 A; 3UO2 A; 3D3I A; 3E8H A; 2EIK B; 2HJD A; 3S3X A; 2RMK B; 5EZY B; 2LW1 A; 4NXM B; 4DV5 O; 1OCR B; 5JJE B; 4FLX A; 4E4E A; 1N32 B; 3SGI A; 4LFB B; 5F2V O; 4B3M B; 3JCZ A; 5H5N A; 4H33 A; 3ZRW B; 1VF7 A; 4G28 B; 1M93 A; 1Q81 W; 4Z1V A; 4DV2 O; 5LBQ A; 4JI4 B; 1ZUQ A; 1P84 F; 3K3W A; 2CGO A; 4R8C A; 3G71 V; 2Y0P A; 1FJG B; 4HAM A; 4LWS A; 5BY1 A; 3RYH B; 5B1A C; 3D36 C; 3ZMS A; 4KFM A; 2CH7 A; 4X20 B; 1W59 A; 4HNA B; 1RSO B; 1TA8 A; 5L3C A; 2B9Z A; 3EHB B; 3K58 A; 4UVA A; 1GAX A; 2OCC C; 1MA1 A; 4LFC B; 3SYQ A; 3SR2 C; 1TAE A; 4PDV A; 3JAW B; 3FFQ A; 2DYS B; 3OEH G; 2A3Q A; 2QM7 A; 3JAK B; 1I08 A; 3CRR A; 1HR0 O; 2ZM6 O; 1XNR B; 2F95 B; 4J10 A; 4UCU A; 1H2L A; 5EBW C; 3ABM B; 1NTM H; 3K04 A; 1U96 A; 1ZX3 A; 5LGU A; 1YTF D; 2WA3 A; 2F1M A; 1OV9 A; 4MTX A; 4LH7 A; 3STL C; 5KHG A; 1L8D A; 3ZJZ A; 1Q7Y W; 1XL6 A; 1D2D A; 2XAF A; 4WCE V; 5IY5 C; 3CRM A; 2JK5 C; 2PI4 A; 2P90 A; 2UUA B; 2P22 C; 1R6T A; 2HFE C; 3AG2 B; 3AG4 B; 3B77 A; 3DC6 A; 4NTX A; 5LP6 C; 3KZI Z; 1GTO A; 3H1H H; 1MSD A; 2JEX A; 3HKB A; 1Y74 A; 5GTH Z; 3WFV A; 2W0F C; 1S3J A; 3UKM A; 2IH3 C; 5JCO A; 4I50 B; 1JFF B; 4I55 B; 1HNZ O; 2KKW A; 2YI9 A; 4JAU A; 3NXS A; 3TK1 A; 5CBH A; 3ETG A; 3RYF A; 1W2B U; 1AVM A; 3ABU A; 5DEC A; 2AZ0 A; 1VIB A; 5ITZ A; 1FXH A; 2E5L O; 1GKF A; 4FZ0 A; 5CA0 B; 4FLV A; 1NKD A; 3TCU A; 1WLE A; 5L3E A; 2H3O A; 1G1X B; 4LF7 O; 3QNE A; 1ZTE A; 2B1I A; 2HG5 C; 3RVY A; 2Y4U A; 2F4V O; 3D8C A; 4X66 B; 3ZN0 A; 4TV9 A; 3SYC A; 4X65 B; 4Z1M G; 2F23 A; 5J2U A; 2PF4 E; 3O9O A; 2JS3 A; 3FD9 A; 3CC2 V; 1N8R W; 1TVK A; 4QIW F; 3P32 A; 2QDO A; 1GH6 A; 3OMA B; 3A8T A; 2UXC B; 2YDE A; 2YIB A; 1PNK A; 5KMG A; 3ABT A; 4LR3 A; 4RO2 A; 4JI8 O; 1OJH A; 2Q69 A; 4JV5 O; 3CRA A; 2EJ7 A; 1JMK C; 4PHZ A; 4N23 A; 3B09 A; 1GRJ A; 1I94 B; 1AIL A; 1VP7 A; 1D5N A; 4DW0 A; 1GM9 A; 2Q67 A; 1YI2 V; 4O4J A; 1XMQ B; 3ABK B; 3OUF A; 1Y76 A; 5E1A C; 3I55 V; 4PEL A; 4F6R B; 4WFA V; 2YEV A; 4MW3 A; 1WJZ A; 5IJ9 A; 3DGE A; 4WFF A; 4UB8 Z; 5LMU B; 3FKS G; 3OR6 C; 4EFE A; 3J81 N; 3JAR B; 4J7J A; 4NXM O; 1V9P A; 3E2E A; 5LYJ A; 2D3O W; 2X6B A; 1SZT A; 1IBL B; 3AK1 A; 4WBN A; 3E22 B; 3RN4 A; 4FIP C; 2BTQ A; 3K59 A; 1N32 O; 4LFB O; 1WAZ A; 1V54 B; 4KP4 A; 2CK3 G; 4B3M O; 2IBZ H; 3E86 A; 3MHH C; 2VQF O; 2ITC C; 2BTO A; 1S76 D; 1Z5W A; 4BW5 A; 3K0G A; 1PD3 A; 4NR1 A; 4U3J B; 4JI4 O; 2R9R B; 2JVD A; 4DRX B; 3F5W C; 3CSX A; 1FJG O; 1N33 B; 3FYI B; 3ETE A; 1O9G A; 4PDR A; 1XBL A; 2CH7 B; 4CS2 A; 3AEI A; 5BZB A; 4LF9 B; 4P30 A; 3VQY A; 2LGW A; 5B1B B; 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