The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
46
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structure length |
46
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Chain Sequence |
MRKLSDELLIESYFKATEMNLNRDFIELIENEIKRRSLGHIISVSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure and mechanism of Sda: an inhibitor of the histidine kinases that regulate initiation of sporulation in Bacillus subtilis
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Sda
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Bacillus subtilis
|
| total genus |
13
|
| structure length |
46
|
| sequence length |
46
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-06-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08970 | Sda | Sporulation inhibitor A |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Sporulation inhibitor A |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D36 C; 1PV0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1H38 A; 4QE9 A; 2OT5 A; 5LGT A; 2GTA A; 3VQW A; 2QKC A; 4DV4 O; 4K8Z A; 3JAR B; 3SPI A; 3TCU A; 1ZL8 A; 3HKB B; 1I0H A; 4PI0 A; 3AG1 B; 3CCE V; 2LJ2 A; 2BTQ A; 3JD3 A; 1KUQ A; 3B8N A; 3BY6 A; 1HNZ O; 1HDJ A; 1UJW B; 4JI7 O; 3L73 H; 4RWU A; 2DOS A; 3APQ A; 4DV1 B; 2LW1 A; 4UXN A; 1Q6I A; 3RW0 A; 2JIZ G; 3ZRS A; 5CBH A; 1Z2G A; 2UUC O; 2KG7 A; 4KFM A; 3T1Y B; 3OGC C; 2G38 A; 2HVJ C; 3CEI A; 4JI2 O; 3STL C; 1GN2 A; 2BOC C; 3IFX A; 2F93 B; 1AIL A; 2AGA A; 3L9D A; 4DV0 B; 4JV5 B; 2PY5 A; 3ZHT A; 4P9O A; 4LFA O; 1X59 A; 4NB5 A; 1IXM A; 4OPH A; 3LDD A; 4H13 B; 5C93 A; 2E5L B; 1S77 D; 3LDC A; 4I0X A; 4DUZ O; 1E1Q G; 4HYO A; 4TV9 B; 3JAW B; 3JCU Z; 5EBW C; 3DC5 A; 4BIO A; 4ZI7 A; 2CK3 G; 4O4L B; 3BPZ A; 1EZV H; 1Y4M A; 3JD0 A; 2QWR B; 2WLI B; 1D2D A; 1FXV A; 1QLE B; 2ZD9 A; 1XNQ B; 2QM8 A; 4DR4 O; 4IIJ B; 3TET A; 1L1F A; 2ADQ B; 1PNM A; 2RDC A; 3GVM A; 1ZL8 B; 4ZHQ B; 4X66 O; 2ZT9 B; 1NTK H; 4JF3 A; 4BR6 A; 1M57 B; 1GK9 A; 3WG7 C; 4GX5 A; 2DN9 A; 4TQF A; 1VP7 A; 1E1R G; 2Y0P A; 3ABT A; 3AG3 C; 3OUS A; 5LMU O; 1AJP A; 4MSW C; 3SPH A; 2WLL A; 1HR0 O; 3RVZ A; 5B3S B; 2UXB O; 4TT3 G; 4DV5 O; 3UKM A; 5JCO C; 4LFC O; 1BL8 A; 4JI4 O; 1XNR O; 2OWO A; 2CDY A; 3O9O A; 3U0Z A; 5LHH A; 2E76 B; 2IW5 A; 4J9Y B; 4OXS A; 4LWS B; 2M6Y A; 1NU1 H; 3F7Y C; 3EVK A; 4RO2 A; 2N74 A; 4JTC B; 4PDL A; 5LYJ A; 4AIL C; 4RQF A; 4J11 A; 3OE7 G; 2ZR2 A; 4WFH A; 2Z0A A; 3QO8 A; 2UXD O; 1WNS A; 5CA0 A; 5IY5 B; 1JJ2 U; 3SPC A; 1P84 F; 4NTY A; 1WLE A; 3ABL B; 2L6L A; 3CSX A; 2EIJ B; 3T1H B; 3K0G A; 4O2B A; 4R8C A; 1VQK V; 1XHZ A; 2H3O A; 2QKA A; 3QO7 A; 3CCU V; 1D5N A; 2N05 A; 2P06 A; 4YJ2 A; 2UU9 B; 1QVF U; 1HNW O; 5IJ0 A; 4JI8 B; 1GO3 F; 1IBM B; 3GB7 C; 2B1G A; 2QWO B; 3BEH A; 4I55 A; 1JX9 A; 3RYC B; 1ZSP A; 3ASN C; 3FYI B; 2ZE8 A; 2Z5U A; 4J9Z B; 2AW9 A; 4GZR B; 4DYL A; 3RFR A; 1XMO O; 4PA4 A; 3K5L A; 2HKO A; 1W59 A; 1AP6 A; 4DV3 O; 1J5E B; 4MVU A; 3IJ4 A; 5AG2 A; 5GTH Z; 2LGQ A; 3H1K H; 3AG4 B; 4DV0 O; 2UXN A; 2CH7 A; 3OTO B; 4CS3 A; 1FKA O; 4X1Y B; 2V1D A; 1GAX A; 4B3S B; 4FK5 C; 3CC4 V; 5LYJ B; 4DW0 A; 4DR2 B; 2IJH A; 4RUF A; 4H0L B; 1R3J C; 2W0X A; 4IHJ B; 2ZE6 A; 1JQ0 A; 2OCC C; 2QGN A; 1JFF A; 3JAL A; 4O2A A; 3BAB A; 4KHP B; 1NVP B; 4UCS A; 4J10 A; 2GBO A; 2A79 B; 4WFE A; 4RQE A; 2PZS A; 3U11 A; 1YSC A; 5FPR A; 2CTW A; 5H6R A; 1Z5W A; 2QWP B; 1F4N A; 4GYC B; 5K1P A; 4FFB B; 5GON B; 3DTU B; 4NXN B; 3ETG A; 2Q0A A; 3EXA A; 5LHG A; 2PYJ A; 5EZY A; 3AG1 C; 5IJ0 B; 1M4U A; 1DF4 A; 4J7Z A; 4I55 B; 3JYC A; 1XOU A; 4LR3 A; 3J80 N; 2XOK G; 3DC6 A; 3J81 N; 4CC5 A; 2JK5 C; 3D3Q A; 1PKX A; 1XBL A; 2XTA A; 3TXQ A; 1TUB B; 4YHH B; 4LF6 B; 1R1B A; 2Q0O C; 3IGA C; 2WSS G; 1H2M A; 3A0B Z; 2F4V O; 1PPJ H; 2YI9 A; 3FKS G; 3CP1 A; 3TK1 A; 3E8B A; 3FB8 C; 1S5L Z; 2WWW A; 1MSD A; 1FXK A; 5J2U A; 2EIL B; 2HEP A; 3RYH B; 1Q5O A; 1V9P A; 3VOU A; 4BIU A; 1VIB A; 3D8C A; 3OFN G; 5JCO A; 1TA8 A; 1K7D A; 1LR1 A; 2ZDI C; 5LMN O; 1YI2 V; 4JAA A; 2AZ0 A; 1QLE C; 4DXW A; 1M5I A; 1L0L H; 4JZ2 A; 4TSF G; 4I9Q A; 4B3M B; 4LNU B; 3K03 A; 1R6T A; 2WLH A; 2KB1 A; 3A2F A; 5LBQ A; 4TWK A; 5EZY B; 5H2F Z; 1M57 C; 4DRX A; 4ZKI A; 3GWO A; 1NZ6 A; 3OUF A; 4HNA A; 3OR7 C; 1RPO A; 3HKE A; 3W7S A; 1FXH A; 1NTZ H; 1BQZ A; 5LL6 Y; 4X20 A; 5KA6 A; 2ITC C; 5LXT A; 2EZP A; 4JI6 B; 1YTF D; 4FLZ A; 3FYE B; 3JAT B; 5B3S C; 2YEV A; 4C7U A; 1BE3 H; 4H44 B; 1N32 B; 1WAZ A; 5KLV H; 5LGN A; 4DV7 B; 1SQB H; 4JYA O; 2JDI G; 4LF4 O; 3OTO O; 2JVD A; 2ZXW B; 1WB7 A; 5C8Y B; 1SKV A; 4GLX A; 1MOF A; 4GUN A; 2Y4T A; 1OZ0 A; 3H01 A; 4O4J A; 3OAA G; 3A0H Z; 2HHH B; 2C2A A; 3ZJZ A; 5KMG A; 3CME V; 4UCR A; 1SQQ H; 4DV4 B; 4O4I B; 1FXK B; 3ZHR A; 1SET A; 4WFB V; 1RFY A; 4MTG A; 1RSO A; 5IY5 C; 1K34 A; 1N0N A; 4TV8 A; 4EB6 A; 1HNZ B; 3ABL C; 2DE0 X; 2UUB O; 2R72 A; 1BT8 A; 3G80 A; 4DW1 A; 4X64 O; 4JI7 B; 2RQ6 A; 3ZMZ A; 1KKD A; 2EIJ C; 5GTI Z; 4H37 A; 3W7W A; 2DJV A; 4F6R B; 4QIW F; 3D36 C; 4KP4 A; 2JEU A; 1MZE A; 2UUC B; 1XL6 A; 4IYH A; 4PJ0 Z; 1GTO A; 2DQ0 A; 3ZHU A; 5F2V O; 4JI2 B; 3BVO A; 4DRX B; 1NQT A; 2JGU A; 4JPR A; 3ZN1 A; 5GW7 A; 4GKK O; 1LNQ A; 4YIO A; 5JQG B; 4WBN B; 3DXR A; 3CMA V; 4OGQ B; 4YHH O; 4DUZ B; 1K92 A; 1IX9 A; 4PA7 A; 4FLT A; 1VQO V; 1OCZ B; 2Q67 A; 2YXY A; 2N04 A; 4LH7 A; 3AG4 C; 4FZ0 A; 4LF8 B; 2RCV A; 4HBN A; 2EUL A; 2MK3 A; 3SYQ A; 3AEI A; 3JAR A; 3OD4 A; 1WA8 B; 1URF A; 4WFF A; 1SZX A; 3ABK B; 3HKB A; 4B3T B; 4X1K B; 4EEQ A; 3SPJ A; 4DR4 B; 1QVG U; 2YXH A; 1QCE A; 1R6K A; 4X66 B; 1FFX B; 4YXW G; 1YEW A; 2Q68 A; 3ZRW B; 3H1H H; 2KKW A; 3M8A A; 3WB0 A; 3ZCC A; 4MVZ A; 2HR3 A; 4G2K A; 3C90 A; 4PV1 B; 1RPR A; 2ZIN A; 5IYZ B; 1Y66 A; 3ZHV A; 2ILM A; 4MVO A; 1IVS A; 3E22 B; 4XBF A; 1HR0 B; 4QPK A; 2UXB B; 2Q7E A; 4DV5 B; 1MNG A; 4LFC B; 4JI4 B; 1XNR B; 3R65 A; 3OM3 B; 3S3X A; 1SQF A; 2WLJ A; 4JYY A; 2Q9L A; 4X9Q A; 4AHC A; 1N33 B; 2BOB C; 3SYA A; 4TQD A; 2A06 H; 1YCI A; 4DR6 O; 3PJS K; 4FLX A; 2RJZ A; 1XIL A; 3CRC A; 3DXR B; 2CTP A; 4Q6G A; 4TV9 A; 3JAW A; 2CTR A; 1S3J A; 1XI1 A; 3CCL V; 4O4L A; 4UV9 A; 5B1A B; 1CEZ A; 1MSW D; 1H8H G; 2UXD B; 2ZDI A; 2CGN A; 1ENV A; 2QR4 A; 2Y4U A; 2HHH O; 5JVD B; 2WLI A; 3B40 A; 1K5Q A; 5FL7 G; 3HPL C; 3FB7 C; 4IIJ A; 1LUV A; 2Q4P A; 4ZBM A; 1O9G A; 3G6B A; 3ABM B; 4I4T A; 4ZHQ A; 3K0D A; 1VQP V; 1Q7Y W; 4FLY A; 3LNN A; 1FYJ A; 1Q43 A; 4NTX A; 1WN7 A; 3SJA C; 2EIL C; 4CH5 A; 1HNW B; 2QSA A; 5L3D A; 1AI6 A; 1GM7 A; 1KYO F; 1L0N H; 1WPX A; 3X2Q C; 3KCY A; 1W2B U; 1HW7 A; 5K1X A; 5EIB C; 3CC2 V; 2EJR A; 5B1B B; 1GMG A; 3HKD B; 4IT5 A; 1XMO B; 4LWS A; 1GM9 A; 4JAU A; 1B3Q A; 1G8M A; 3ZED A; 4JI1 O; 5DN6 G; 3JSL A; 4DV3 B; 2OTL V; 3CB2 A; 4NYK A; 3P30 A; 1J95 A; 4X62 O; 2F23 A; 1FAF A; 5BXZ A; 2HLD G; 2Y69 C; 2Q7H A; 5D5Q A; 2K1E A; 2EJ7 A; 2VQF O; 3Q4H B; 3CPW U; 2DQ3 A; 2NN4 A; 3BCC H; 4PI2 A; 4LF8 O; 3MDS A; 1I5Y A; 1EN6 A; 3E8H A; 1KMI Z; 4B3R O; 3VQX A; 3JCZ A; 3JAS A; 4B3T O; 3ZHQ A; 3D36 A; 2UXC O; 3L75 H; 1AI7 A; 4I4T B; 3OMA B; 3CXH F; 3LSS A; 4NKG B; 1ZLZ A; 1FXK C; 2X6A A; 1IXB A; 2BSK B; 3RYC A; 2GDS A; 2XAQ A; 3QG5 A; 2LW7 A; 5IYC O; 1Y76 B; 3ASO B; 3I55 V; 3K04 A; 3CRM A; 2H8P C; 3ETD A; 3IC7 A; 4UCV A; 1N34 O; 3ETQ A; 1BS3 A; 1YHQ V; 1N33 O; 5H6Q A; 1AJQ A; 4GX0 A; 1H2L A; 2YDE A; 4FJC C; 4X1Y A; 2Q5Z A; 1BQ0 A; 4UCO A; 2A3Q A; 1YTF B; 1M56 B; 3MHS C; 4IHJ A; 2F4V B; 4MVQ A; 1MG1 A; 3CX5 F; 5EBM C; 3S3W A; 1KBH A; 4B08 A; 3OEE G; 4JTA B; 1OCZ C; 1YVW A; 2LFR A; 1M9N A; 4NR1 A; 3KZI Z; 3JAS B; 5LHI A; 4FFB A; 5GON A; 4FM0 A; 5CN0 A; 4G27 B; 1XMQ O; 5LMN B; 5KAF Z; 4J41 A; 1DLB A; 3BAA A; 4KL1 A; 5EBL C; 4KXR A; 4PHZ A; 3ABK C; 2NLJ C; 5TIS Z; 4BW5 A; 2JJ1 G; 4OX9 O; 5B66 Z; 3W7T A; 3FFQ A; 1HNX O; 1JVM A; 1IBK O; 2FB5 A; 4MS2 A; 2R9R B; 1DK1 A; 4IGG A; 2YIB D; 2D2C B; 3T1C A; 2BTO A; 3T4D A; 1EN5 A; 2P4K A; 1NTM H; 3AG2 B; 2ZNJ A; 1JR9 A; 3W7U A; 4JI5 O; 1VAR A; 4I9W A; 1ZX3 A; 1TUB A; 2VS0 A; 2EBO A; 4GX2 A; 4GKJ B; 2O57 A; 2R9I A; 3OW2 U; 3AK1 A; 5IDJ A; 5IT9 N; 4JYA B; 1XQ8 A; 3CCS V; 4LF4 B; 4L8J A; 1TUE B; 2ZIM A; 4EFE A; 3ZMT A; 3QO5 A; 4IYI A; 3E86 A; 1F7Y A; 2LP7 A; 5J2T B; 5CBF A; 3K79 A; 1H2N A; 2YS8 A; 1U96 A; 2HVK C; 5L3G A; 5EC2 C; 1KEC A; 2OTJ V; 1PL4 A; 1SER A; 2IH3 C; 3RYH A; 3BFR A; 1D5A A; 3NR7 A; 2VWK A; 3ZBH A; 1M1K W; 2R9A A; 3A0R A; 1QQC A; 2XAH A; 5B1A C; 4E4E A; 3K59 A; 4Z2W A; 2YID A; 4FM2 A; 4H33 A; 1MA1 A; 2UUB B; 1P49 A; 4X64 B; 3ML0 A; 4DR5 O; 3H1J H; 2DYR B; 1OCO B; 4LNU A; 1NI8 A; 3ABM C; 3FB6 C; 1JMK C; 1DF5 A; 1GN3 A; 1TGO A; 5H5N A; 4ZIB A; 5BZB A; 1WPB A; 4OPA A; 2QWN B; 1I08 A; 4UV8 A; 1ZAU A; 3OR6 C; 1ZTE A; 1OCC B; 4X89 A; 3JAT A; 2PI5 A; 4JI0 O; 1BHB A; 2JGD B; 1OV9 A; 2XAF A; 1PNK A; 1Y74 B; 4GKK B; 2HJD A; 2EIN B; 4Z1V A; 2P7T C; 5JH7 B; 3G6E V; 3SYP A; 5B1B C; 3UO2 A; 1JCH A; 3H1I H; 5BY1 A; 5C8Y A; 3F7V C; 4J80 A; 3CHX A; 2EIK B; 1JA8 A; 4UVC A; 4U7N A; 3EFF K; 2PYL A; 2LO1 A; 4XDJ A; 4AI8 A; 5FPO A; 2BE3 A; 3VQY A; 2V4D A; 4JAV A; 1OCR B; 4O4I A; 2OCH A; 1BMF G; 2JS3 A; 3CXC U; 3FAV B; 1I7F A; 4X88 A; 2GSM B; 1I5X A; 4R6Z A; 1V54 B; 3T2M A; 4EFB A; 2W0F C; 2Q69 A; 3CRA A; 2QDO A; 3CS5 A; 3N2K A; 1H2S B; 3TJT A; 1MMM A; 2ATK C; 4F6R A; 2HG5 C; 3CRQ A; 3U10 A; 2WLK A; 2CUG A; 1SQV H; 4DUY O; 4Z1M G; 2ZE5 A; 2RMK B; 2QEX V; 2OIE A; 4ICG A; 5CB4 B; 2DW4 A; 1P4R A; 2LGW A; 5JQG A; 4WBN A; 2HP8 A; 2QA4 V; 2IU0 A; 4DR6 B; 5J9P C; 2IJJ A; 3ASO C; 1QNM A; 3K57 A; 4FM1 A; 4GKJ O; 2E75 B; 1YZB A; 4D6T H; 1GRJ A; 1G4Y B; 4EKW A; 3ZRV A; 3LNM B; 5L3B A; 4Q20 A; 1S5J A; 1ZWI C; 1Y67 A; 4A5U B; 1WP7 A; 1WA8 A; 1TAE A; 5DEC A; 2X0L A; 3QVN A; 2IJK A; 2XND G; 4CBC A; 4X1K A; 4FZ1 A; 4UB8 Z; 1M56 C; 4W4L A; 2E3C A; 2ADP A; 4UCT A; 1M90 W; 1FFX A; 2AHY A; 3RYF B; 2LQT A; 3G67 A; 3ZRW A; 2ETN A; 3QTC A; 2YIC A; 1BCC H; 5IJ9 B; 4TOI A; 5LP6 B; 2ODM A; 5IYZ A; 4DR3 O; 3N2K B; 3E22 A; 3WG7 B; 1UFI A; 1KP2 A; 4QPJ A; 3OMN B; 3MHH C; 3P3N A; 4CH3 A; 2HJF C; 4P2Z A; 2Q7G A; 1H2G A; 1S72 V; 1SQG A; 4U7O A; 4JI1 B; 1YXB A; 1FJG O; 1VF7 A; 1K9M W; 5JWP A; 4DR1 O; 4RUE A; 4L87 A; 4CH6 A; 1I94 O; 3ZIA G; 4X62 B; 5FLX N; 3AG2 C; 4DO2 A; 3HB3 B; 2UUA O; 2ZNI A; 3B8M A; 2QM7 A; 2VQF B; 4LP8 A; 1NKD A; 5JVD A; 4LF5 O; 4K0K O; 1BSM A; 2NNU A; 5KHH A; 1R3I C; 4B3R B; 3RBZ A; 1G1X B; 2W6J G; 3FX7 A; 4PDM A; 1LUW A; 1Q6H A; 4I50 B; 2K9P A; 3JD4 A; 2B1I A; 2WPD G; 4K35 A; 3SJB C; 3SR2 C; 1FFT B; 3ZHS A; 2UXC B; 2GV9 A; 3B09 A; 1QR8 A; 2YXL A; 4GCZ A; 2F43 G; 5DED A; 1KKC A; 2YUA A; 3SJQ C; 1TVK B; 4BW9 A; 1HP8 A; 1YJN V; 3OT7 A; 1NT2 B; 2CE4 A; 2ZKO A; 3RT3 C; 3HKD A; 3N2G B; 1K3E A; 2XAJ A; 3C3T A; 1AP5 A; 5JJN B; 2DYR C; 3BRC A; 4CC6 A; 1SA0 B; 2EIM B; 1OCO C; 4MW3 A; 1SQP H; 5JJJ B; 1N34 B; 2EX3 A; 3DGE A; 3UM7 A; 4LFB O; 1PD3 A; 3LSQ A; 4FLW A; 1QR9 A; 2FYU H; 3WU2 Z; 1Q81 W; 3CD6 V; 4P9P A; 2ZIO A; 2M7W A; 1OCC C; 3Q4H A; 4K3A A; 2DMX A; 2JEX A; 2IM9 A; 3JAK A; 1VQN V; 2EIN C; 2QTO A; 1YJ9 V; 3AK3 A; 2UXX A; 1H2K A; 3HKC B; 1NH2 D; 2Z3Y A; 2EIK C; 2OCC B; 4LF9 B; 1F4M A; 4PEL A; 2BCC H; 1VQ7 V; 5KX5 B; 3RN4 A; 1WB8 A; 5LA6 B; 3APO A; 5E79 Z; 3CC7 V; 1BGY H; 1XMQ B; 5FNV B; 3B77 A; 4WCE V; 4NXM O; 3ZS8 C; 1OCR C; 5ITZ B; 4DV2 B; 3O65 A; 1F23 A; 1X4T A; 1K8A W; 1S76 D; 4AQY O; 3OGI B; 2BSK A; 4OX9 B; 5EIB D; 3RGB A; 4UB6 Z; 1HNX B; 1IBK B; 1V54 C; 1Y76 A; 4UVB A; 3RVY A; 4NTW A; 2JS5 A; 2XUM A; 4JI3 O; 1CXZ B; 4JZG A; 4O4H A; 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