The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
50
|
structure length |
50
|
Chain Sequence |
DEAQFKECYDTCHKECSDKGNGFTFCEMKCDTDCSVKDVKEKLENYKPKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR Solution Structure of Ole e 6, a Major Allergen from Olive Tree Pollen.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Allergen
|
| source organism |
Olea europaea
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| molecule keywords |
Pollen allergen Ole e 6
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| total genus |
14
|
| structure length |
50
|
| sequence length |
50
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF09253 | Ole-e-6 | Pollen allergen ole e 6 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Pollen allergen ole e 6 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SS3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2UUB O; 2HHH B; 3SPI A; 1L0N H; 3A0R A; 1P7B A; 4LNU A; 1N36 O; 3KCY A; 3H1H H; 2UUB B; 2ZR2 A; 3G80 A; 2YID A; 2ZKO A; 1DGS A; 3G67 A; 5ITZ B; 4I7Z B; 1EZV H; 4UVB A; 5EZY A; 1Q6U A; 3CHX A; 1N36 B; 2N74 A; 2W0F C; 2L6L A; 2JGD A; 4RWU A; 1U96 A; 2YI8 A; 3OMN B; 5B1B C; 5JVD A; 1J95 A; 3K58 A; 3JAL B; 1GN4 A; 4NXN O; 1FJG O; 1OHH G; 5E79 Z; 2PY5 A; 2P22 C; 2ZM6 O; 3HB3 B; 1AJQ A; 1MOF A; 4NXN B; 1FJG B; 4EB6 B; 1EM1 A; 2RDC A; 1AR1 B; 2WA4 A; 5DEC A; 2ZM6 B; 4CS3 A; 1NKD A; 2WLJ A; 1YTF D; 3FB6 C; 3Q4H B; 3SYC A; 2PTM A; 5K1X A; 4BR6 A; 2PGG A; 1SZX A; 5LL6 Y; 4JV5 O; 3QG5 A; 1SQQ H; 2B1I A; 5LA6 A; 3OM3 B; 4JV5 B; 1QR8 A; 4EKW A; 3H1L H; 5B66 Z; 2XUM A; 4NR1 A; 2FYU H; 1QR9 A; 5EYP A; 4DV4 O; 2C2A A; 4MVM A; 1MSD A; 4BWA A; 1FYJ A; 1HDJ A; 1BS3 A; 1VF6 C; 3CCJ V; 4OPH A; 4PA6 A; 3FX7 A; 4DV4 B; 2QWO B; 1TUB B; 2F66 C; 3TK1 A; 3RYH A; 3CRR A; 1YTF B; 4JTC B; 1H2N A; 4K8Z A; 1VQN V; 2LO1 A; 4DV7 O; 5EBM C; 2P5O A; 4BIZ A; 3B09 A; 3BRC A; 2P4K A; 3EVK A; 2QSA A; 4JPR A; 5IJ9 B; 1NR1 A; 4DV7 B; 5JJN B; 4KHP O; 1SQV H; 1WP8 A; 5CA3 A; 5FNV B; 1VQ6 V; 2V7Q G; 3K79 A; 1XIL A; 4KHP B; 1NS1 A; 5IWA O; 1PM9 A; 3K06 A; 1VQM V; 4LFB O; 2B9Z A; 4FVM A; 4QNH B; 1VQ9 V; 4JZ2 A; 4UVC A; 4I55 B; 5IWA B; 5LHH A; 4LFB B; 2ZQM A; 1M9N A; 3L75 H; 4DO2 A; 4TV8 A; 2Z3Y A; 2XAF A; 3CMA V; 1NI8 A; 2F93 B; 1Y6X A; 1K33 A; 4X9Q A; 4CH3 A; 2CTP A; 3K9A A; 1AP6 A; 1TVK A; 3W7T A; 4FLZ A; 2HG5 C; 4O4J A; 4LC1 A; 4PDV A; 2DOS A; 5LYJ A; 4CC5 A; 5JQG B; 2EIJ B; 4PJ0 Z; 3H1K H; 4CH6 A; 2XND G; 3SYQ A; 3N27 A; 3UQ8 A; 2EX3 A; 3ZRS A; 4PDR A; 1I5Y A; 5B1A B; 5JJE B; 3ICX A; 1KBH A; 1BZK A; 3CCU V; 1FXV A; 4DK0 A; 3SJQ C; 1XBL A; 5JCO C; 1VMG A; 4KFM A; 1KQS U; 3ZBH A; 4L87 A; 3AG3 C; 2W0X A; 4LH7 A; 2CTR A; 2Q7H A; 2IM9 A; 4MVZ A; 1Y74 B; 1OCC B; 1JJO A; 3T4Z A; 2BE3 A; 5ITZ A; 4Z1V A; 1SER A; 1Q6H A; 3ZRW B; 2GSM B; 4QE9 A; 4DV6 O; 1Y76 B; 4MTX A; 2Q69 A; 1Q86 W; 3JAL A; 3CJH B; 1GM8 A; 3F5W C; 2JJ2 G; 4ZOL B; 4J80 A; 3QO5 A; 4QGP A; 2OWO A; 1W59 A; 4DV6 B; 1LNQ A; 2OIG A; 4HBN A; 4JAV A; 3ETQ A; 1GRJ A; 3LDD A; 1S5J A; 4MVR A; 4EB6 A; 5EIB D; 3ZMU A; 3BAA A; 3CC7 V; 1MMM A; 1P49 A; 2OCH A; 4PHZ A; 4MW3 A; 4DR5 O; 3Q4H A; 1I08 A; 1FS0 G; 3JAS B; 2JRI A; 3ZHU A; 4X1Y B; 3CXC U; 3N2K B; 4DR5 B; 5CBH A; 3E8H A; 1XHZ A; 1V54 B; 4BIU A; 3W7U A; 2R72 A; 5FPO A; 1H8E G; 4L8J A; 4PI2 A; 2P6J A; 2KG7 B; 2ZXW B; 2FB5 A; 3ASN B; 3JAW B; 4DV1 O; 1QVG U; 1WNS A; 1THZ A; 1NTM H; 4LH6 A; 3B2E E; 4B7K A; 1TUB A; 3K0D A; 4DV1 B; 1JR9 A; 2Y4U A; 4O2B B; 1N4C A; 3P3P A; 1S5L Z; 4FPP A; 1M57 C; 1FXK B; 4DR1 O; 1SF9 A; 2JS5 A; 4B7E A; 5IJ9 A; 2ITC C; 4DR1 B; 4IT5 A; 4JAS A; 1SES A; 5FNV A; 1TUE B; 3BFR A; 4FLX A; 1VQ7 V; 2ZDI A; 1JFF B; 4DR7 O; 4DUY O; 5LP6 C; 1R3K C; 2JJ1 G; 1RFY A; 3WB2 A; 2CDY A; 4DR7 B; 1AR5 A; 4DUY B; 1BSM A; 4I55 A; 1EN6 A; 3F7V C; 5H9C A; 2LGQ A; 1UJW B; 2YUA A; 4LF9 O; 2AHY A; 3LSU A; 2VWK A; 1EN4 A; 1CXZ B; 4D7S A; 4LF9 B; 1H2K A; 1B04 A; 2P67 A; 2GDS A; 2FTK A; 5KMG B; 2WAM A; 5IY5 C; 5JQG A; 1BHB A; 2R9I A; 3EHB B; 3ABK B; 3B40 A; 2QM4 A; 1V55 B; 4X66 O; 2UXC O; 1B6Q A; 4YJ3 A; 2EIL B; 5L3F A; 3J81 N; 5B3S C; 4DW0 A; 5FPR A; 4X66 B; 2UXC B; 2A0L A; 5KHI A; 1Q5O A; 4FLW A; 2AGA A; 1I7F A; 2H94 A; 1Y74 A; 1AP5 A; 2IU3 A; 2GTA A; 4ICG A; 4QPJ A; 5CA1 B; 4LF7 O; 4ASU G; 4G28 B; 3ZS8 C; 3ZRW A; 3FYE B; 5DM6 V; 1VQO V; 1L1F A; 1SET A; 2EIM C; 2JEX A; 3B8M A; 4LF7 B; 3S3X A; 1E1Q G; 2VWJ A; 1Y76 A; 3P30 A; 1XMQ O; 4R50 A; 3L9D A; 3CJH A; 2WA3 A; 4ZOL A; 3JCZ A; 4CC6 A; 1F4M A; 2NLJ C; 4JI3 O; 2CK3 G; 5LBQ A; 1XMQ B; 4J10 A; 1Q81 W; 1YEW A; 3U0Z A; 3CCL V; 2FKX A; 2AW9 A; 1F7Y A; 4JI3 B; 5JWP A; 3AG1 C; 4GX1 A; 4UCV A; 2CTW A; 2OT5 A; 3B77 A; 3OR6 C; 5GTH Z; 3SJC C; 2LW7 A; 1SA0 A; 2DWE C; 3JAS A; 4NTX A; 2XTA A; 2DYR C; 3N2K A; 2ZIM A; 5A9G A; 1GTO A; 2AHZ A; 4HNA B; 1ZX3 A; 2VQF O; 2KG7 A; 2YS8 A; 3SJB C; 3JAW A; 1IXM A; 1AJN A; 2VQF B; 1D2D A; 4J41 A; 2LP7 A; 3JAT B; 1N34 O; 2ILM A; 2IW5 A; 4O2B A; 2EBO A; 4NTY A; 1N34 B; 1GH6 A; 2DJV A; 5GTI Z; 3D3I A; 4F6R A; 1WN7 A; 2ZE5 A; 1BMF G; 2R9A A; 1HW7 A; 3ZHQ A; 3F5T A; 3K3W A; 3RYI B; 2GUZ B; 4OGQ B; 1KKC A; 2P06 A; 1YJW V; 3G6E V; 4PDM A; 5EBL C; 5KA6 A; 2QTO A; 1W0J G; 1JFF A; 2EJR A; 4YIP A; 1WB8 A; 4O4I B; 4YHH O; 4A5U B; 4JAU A; 2WLK A; 4PI0 A; 1OZ0 A; 3K59 A; 1K8A W; 2IJH A; 4KP4 A; 3ML0 A; 4FJC C; 4YHH B; 3QO8 A; 5JH7 B; 1XNR O; 2XHB A; 3PN1 A; 1K34 A; 1Q8I A; 4PA3 A; 3CWB H; 2ZCE A; 2E75 B; 4B3S O; 4TQF A; 1KUQ A; 4DXW A; 1XNR B; 1MNG A; 1RPR A; 3CSX A; 4N23 A; 3KG2 A; 3ZMT A; 3K5O A; 3R66 A; 4B3S B; 2UUC O; 1TVK B; 2Q67 A; 4GT1 A; 2UUA O; 1XHX A; 2M6Y A; 5KMG A; 4JTA B; 1FD9 A; 2UUC B; 4H37 A; 2FL4 A; 2VRZ A; 1ZL8 B; 2UUA B; 3AK3 A; 2ADP A; 3BHP A; 4XDK A; 2CGO A; 3WG7 C; 1LUW A; 1JPX A; 4DV3 O; 2CH7 B; 3VQY A; 4JI5 O; 2QJ1 A; 2KB1 A; 3OE7 G; 1EZJ A; 3CP1 A; 4RQF A; 2HJD A; 1RPO A; 2QDO A; 4DV3 B; 4JI5 B; 4KL1 A; 1M56 B; 2MW2 B; 1I94 O; 2WSS G; 2Z5U A; 3ETE A; 1K9M W; 3T4D A; 1QLN A; 5HFL A; 1AJP A; 4JI2 O; 4UV8 A; 1I94 B; 5CA1 A; 3AG4 B; 4GKK O; 3CYO A; 3LNN A; 3X2Q C; 2EZO A; 2HP8 A; 3WU2 Z; 2OCC B; 2EZP A; 2UU9 O; 1XUQ A; 4CH4 A; 3STZ C; 4JI2 B; 1S0V A; 4GKK B; 1NT2 B; 3T1H O; 3G6B A; 2QKC A; 3ETD A; 2DYS C; 2UU9 B; 1XL4 A; 1Q43 A; 1R3I C; 1SZT A; 4O4L B; 1CPY A; 1AVM A; 1XQ8 A; 3T1H B; 1G6U A; 1SQF A; 3PJS K; 3VOU A; 3LDC A; 1N8R W; 5J2T B; 4MTF A; 4AQY O; 2Q0A A; 4Q6G A; 5GW7 A; 1DLB A; 3R65 A; 3ZIA G; 1OCO B; 1OJH A; 1IBL O; 3LUT B; 1SQG A; 4X62 O; 4AQY B; 2F4V O; 1P4R A; 4UCU A; 4FLV A; 4LP8 A; 2OTL V; 1ARO P; 4FLY A; 1OCR B; 5H6Q A; 4DR3 O; 1IBL B; 2F4V B; 4X62 B; 4FFB B; 1PP9 H; 2RNB A; 1Z5W A; 3ETG A; 1B06 A; 1GM9 A; 1YZB A; 2CE4 A; 4DR3 B; 4HNA A; 2RN9 A; 4GCZ A; 3AK2 A; 4IIJ B; 4AHC A; 3E35 A; 3SJA C; 4UVA A; 4FM1 A; 2NNU A; 5IJ0 B; 1X59 A; 3W7X A; 2JS3 A; 3UO2 A; 3T2M A; 3L71 H; 4I9Q A; 3JAK B; 4LF5 O; 4X20 B; 1J5E O; 3JAT A; 3BY6 A; 4P30 A; 3ASO B; 4JYY A; 4JYB A; 3UM7 A; 4D7T A; 4LF5 B; 4MTG A; 2Q0O C; 3K57 A; 3OGI B; 4DW1 A; 1J5E B; 1NR7 A; 3LSS A; 1GN6 A; 3E83 A; 3D8C A; 1SQX H; 4DV0 O; 1BCC H; 2IH1 C; 4UB8 Z; 1IBM O; 1GK9 A; 2BTQ B; 3OMI B; 1I5X A; 3RYI A; 4DV0 B; 2GUZ A; 2OIE A; 1HR0 O; 1VAR A; 3AK1 A; 1IBM B; 2X0L A; 1YI2 V; 1GO3 F; 2LJ2 A; 2HVJ C; 1BQZ A; 1VQ8 V; 4O4I A; 1IVS A; 4U7N A; 4WFF A; 1NVP D; 3SYA A; 1HR0 B; 3OD4 A; 4TT3 G; 4XDL A; 2YIC A; 3OUF A; 5KLV H; 1QU7 A; 4BIO A; 2X6B A; 5TIS Z; 3OEE G; 3ZMV A; 4AIL C; 2ZIN A; 1AR4 A; 4WFA V; 4DV5 O; 1MSW D; 5JH7 A; 1M4U A; 4MT8 A; 2DWD C; 2E76 B; 1K7D A; 4WFH A; 5L3C A; 3A8T A; 4DV5 B; 3IC9 A; 5KHG A; 4IGG A; 4MVS A; 1M5I A; 4CH5 A; 3ZHR A; 5K1P A; 3SPG A; 1RSO B; 3A0H Z; 3CRM A; 2YEV B; 1NVP B; 2Y48 A; 1ZL8 A; 4WFB V; 5KHK A; 1WP7 A; 3ZMS A; 1GM7 A; 4FLT A; 1Z5V A; 4F4L A; 5KAF Z; 2YXY A; 4FIP C; 2CH7 A; 2ZE6 A; 4DRX B; 4YJ3 B; 4DUZ O; 3E2E A; 3CEI A; 3K9S A; 3JAR B; 2HLD G; 4HAM A; 4H33 A; 3CRC A; 1K5Q A; 2YXH A; 4JI1 O; 4UCS A; 4DUZ B; 1QLE B; 4TOI A; 1H38 A; 4FM0 A; 1CEZ A; 2O57 A; 3EXA A; 3M7M X; 2F95 B; 4JI1 B; 1L8D A; 1M90 W; 5LHG A; 4J7Z A; 2JEU A; 3OUS A; 4WBN B; 4FZ0 A; 4J11 A; 4LWS A; 1QCE A; 3E8G A; 2CAZ C; 2B5U A; 3QO7 A; 1SRY A; 3KZI Z; 3CRQ A; 3D3Q A; 1PL4 A; 2QGN A; 1W2B U; 4O4L A; 3DXR B; 1PKX A; 5LXT B; 3U11 A; 5J2T A; 1FFT B; 3GB7 C; 3JCU Z; 2XAS A; 2PYL A; 1MZF A; 1JQ0 A; 2JK5 C; 3TXS A; 1SC5 B; 3RYC A; 5KA5 A; 2UXX A; 5LOV B; 2ZDI C; 3HKC B; 1SA0 B; 3E22 B; 1Q82 W; 4O4H B; 3ZRV A; 3HKD B; 4FFB A; 2AXT Z; 2Y69 B; 3DTU B; 1PNL A; 1IZ3 A; 3FB5 C; 4IIJ A; 1H2G A; 2NN4 A; 1XDC A; 4JI8 O; 4X65 O; 4RQE A; 5IJ0 A; 4MTO A; 1ENV A; 4TWK A; 3ABU A; 1VIB A; 3NXS A; 3JAK A; 4JI8 B; 4X20 A; 4X65 B; 1PD3 A; 2GHY A; 1VQ4 V; 1KKD A; 1KEC A; 2QWN B; 2Q4P A; 2IU0 A; 1PNM A; 3H9V A; 4CZZ A; 4X89 A; 4I5S A; 2EIJ C; 2EUL A; 4AI8 A; 4F6R B; 3ABL B; 4QPK A; 3JYC A; 4CS2 A; 2BTQ A; 5B1A C; 1K4D C; 4N21 A; 4OX9 O; 1ROP A; 5EC2 C; 1FXH A; 2R9R B; 3TGU H; 2PF4 E; 2GV9 A; 5IE9 A; 3JD1 A; 4OX9 B; 1QLE C; 1R3L C; 3SPH A; 1Q3E A; 3ZJZ A; 1OCC C; 1RP3 B; 2A7W A; 4J42 A; 2V1D A; 2EIK B; 3K08 A; 1AI6 A; 3GWO A; 4QE7 A; 3G71 V; 3LSQ A; 4CS4 A; 1Q6I A; 1S76 D; 1O9G A; 2DQ3 A; 3KCX A; 4IYH A; 1BE3 H; 1SS3 A; 2LGW A; 1XOU A; 3DC5 A; 3UKM A; 4BAY A; 4JYA O; 2E3C A; 2PUS A; 4UCO A; 2CGN A; 1YIT V; 1RSO A; 2YEV A; 1YCI A; 4JI6 O; 2UXB O; 2ZIO A; 2YC0 A; 1OV9 A; 1IXB A; 5B1O A; 4JYA B; 5IYC O; 3JAM N; 4FM2 A; 3SDL A; 5CBF A; 3IJ4 A; 4EEQ A; 3I5D A; 1SQB H; 5DED A; 4JI6 B; 2UXB B; 4DRX A; 5LHI A; 1ZWI C; 1S3J A; 2IJI A; 3BPZ A; 1S5H C; 5CN0 A; 3JAR A; 4EFB A; 3QNE A; 1V54 C; 1OCZ B; 3AG2 B; 4I50 B; 4P9P A; 2QWP B; 3UO3 A; 1PV0 A; 2M7W A; 2ZXW C; 3ASN C; 2E5L O; 4KXR A; 1VP7 A; 1I0H A; 4PA9 A; 4WBN A; 3I55 V; 1TAE A; 3C3S A; 5EIB C; 1H2L A; 4CBC A; 2E5L B; 2Z0A A; 1EBO A; 4PEL A; 3RVY A; 1FAF A; 4JI0 O; 4J7K A; 1O9H A; 3O65 A; 2HR3 A; 3DXR A; 4NXM O; 4ZKI A; 4JI0 B; 1FXK C; 1E79 G; 4NVP A; 5LXT A; 1H8H G; 2WWW A; 5D5P A; 1D5N A; 1VF5 B; 2QR4 A; 4O2A B; 2H8P C; 3MDS A; 5CMU A; 1NTK H; 3RYF A; 4NXM B; 3CPW U; 1KYO F; 3RGB A; 3SR2 C; 1GKF A; 3RBZ A; 1K97 A; 3CME V; 4UV9 A; 4B3M O; 1JJ2 U; 5LOV A; 4UCT A; 3HKC A; 5DN6 G; 1JX9 A; 1N0J A; 3E22 A; 4J9Z B; 4WF9 V; 5H5N A; 5CBG A; 4PD4 F; 4DR4 O; 4K3A A; 3BA9 A; 4O4H A; 4B3M B; 2Q68 A; 2Y4T A; 3HKD A; 4JI7 O; 1N33 O; 1DF5 A; 3B8N A; 3TET A; 1F23 A; 4HYO A; 1S77 D; 1AB3 A; 4DR4 B; 1AI5 A; 3JSN A; 3JD3 A; 1CP9 A; 4DK1 A; 2Y0P A; 4JI7 B; 1N33 B; 4LBE C; 1JVM A; 2KSD A; 1IDS A; 4UCR A; 3OFN G; 2QKS A; 3ABM B; 5LMU O; 4E2L A; 1VQK V; 3NR7 A; 4LF8 O; 1XL6 A; 1P7G A; 4B3T O; 2HKO A; 3RN4 A; 5FL7 G; 5IYZ B; 1G4Y B; 2L35 A; 5LMU B; 3JD0 A; 4LF8 B; 1Y4M A; 2WLN A; 2QWQ B; 4B3T B; 5HFM A; 3OTF A; 3W7S A; 1A32 A; 2IH3 C; 2XAQ A; 4U7O A; 3THO A; 3WB1 A; 1VF7 A; 4DR2 O; 1JMK C; 5B5E Z; 3ABK C; 1N32 O; 2A06 H; 1V55 C; 3H01 A; 3K5N A; 1NTZ H; 4DR2 B; 3LNM B; 5JJJ B; 3FKS G; 2ZD9 A; 2EIL C; 2KKW A; 3OW2 U; 3CCS V; 1N32 B; 2OYQ A; 1G8M A; 5B1B B; 2UXD O; 2RMK B; 3H1I H; 4B08 A; 5BY1 A; 4RUF A; 2QTS A; 2UXD B; 4X88 A; 4JYC A; 3RW0 A; 5J9P C; 4X64 O; 1IBK B; 2WLH A; 2P90 A; 1JOY A; 1GMG A; 4OXS A; 1IUR A; 5L3E A; 2A9H A; 4FZ1 A; 3L72 H; 4GYC B; 4X64 B; 5AG2 A; 3AEI A; 4U3J B; 5LGT A; 2VQE O; 3QVN A; 4B3R O; 2DN9 A; 1XRE A; 1Y66 A; 3K0G A; 3CB2 A; 3SPC A; 3CE2 A; 1V9P A; 2VQE B; 3SYO A; 3TXQ A; 4B3R B; 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