The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
50
|
structure length |
50
|
Chain Sequence |
DEAQFKECYDTCHKECSDKGNGFTFCEMKCDTDCSVKDVKEKLENYKPKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR Solution Structure of Ole e 6, a Major Allergen from Olive Tree Pollen.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Allergen
|
| source organism |
Olea europaea
|
| molecule keywords |
Pollen allergen Ole e 6
|
| total genus |
14
|
| structure length |
50
|
| sequence length |
50
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF09253 | Ole-e-6 | Pollen allergen ole e 6 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Pollen allergen ole e 6 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SS3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1E1Q G; 3IC9 A; 4FZ0 A; 5KUM A; 3SGI A; 4GX0 A; 3ZJZ A; 3L73 H; 2Y69 B; 4JV5 B; 1XOU A; 1YCI A; 2HEP A; 5DEC A; 1WPB A; 3MDS A; 5IJ9 A; 5KA6 A; 2FYU H; 4RAI A; 2HJD A; 1NS1 A; 1WP7 A; 3ML0 A; 3ASN C; 1R3L C; 3A0B Z; 3K9A A; 3K57 A; 3M8A A; 1VMG A; 3C3T A; 3T1C A; 1A32 A; 3CCV V; 4YJ3 B; 2VQE O; 4TUY B; 2CGO A; 1U96 A; 2WPD G; 3K0D A; 1GM8 A; 2EIL C; 3TCU A; 3OGI B; 4JI0 O; 3CCQ V; 1MMM A; 3CJH B; 4OX9 O; 3A0R A; 1XL6 A; 3RYC A; 3T2M A; 4ZOL B; 3H1H H; 1Q6U A; 4KHP B; 1TGO A; 1JVM A; 4Z1V A; 1M90 W; 3CCE V; 2V7Q G; 3W7U A; 3EHB B; 2P6J A; 2IBZ H; 1XHZ A; 1YHQ V; 3BAB A; 4EB6 B; 3JD2 A; 3CSX A; 5L3G A; 2JJ2 G; 3B40 A; 3GWO A; 3P3N A; 1XMO B; 3D36 A; 2FL4 A; 4PA4 A; 3JAR B; 3ASN B; 3IGA C; 3ZRW B; 5L3D A; 3HKB A; 3L72 H; 1Q8I A; 4O4J B; 2HP8 A; 3ZN1 A; 1MZE A; 2GDS A; 2EIL B; 5CA0 A; 4DV7 O; 1DLB A; 3AK3 A; 5LGN A; 3FB5 C; 5KHH A; 4I5S A; 1I7F A; 3ICX A; 2YC0 A; 5BZB A; 3MD0 A; 1WP8 A; 1SQB H; 2JS3 A; 4ZI7 A; 3JCZ A; 2WLN A; 3JAS B; 5IYD O; 1Q5O A; 2CTR A; 4I4T A; 4TWK A; 1B6Q A; 5EIB D; 1ZX3 A; 4IT5 A; 3NXS A; 3N2G B; 1SF9 A; 4CH5 A; 2E5L B; 1FXK A; 1NI8 A; 2EUL A; 2UXN A; 4AQY O; 1R73 A; 2UUB B; 3OEH G; 3ZS8 C; 4DUZ O; 3OD4 A; 3K3W A; 1R3I C; 1QCE A; 1P84 F; 1SQP H; 3UQ8 A; 3ETD A; 4MW8 A; 4R6Z A; 5GON A; 3E89 A; 2A7W A; 4NXN B; 2GV9 A; 3F5T A; 5EBL C; 3DC6 A; 1YTF B; 5LP6 C; 2Q0A A; 4BIO A; 2QJ1 A; 4W4L A; 3HKE A; 4O2A A; 2Q5Z A; 5K1P A; 1AB3 A; 4PI0 A; 3CYO A; 3L75 H; 1ZTE A; 1YDX A; 2A9H A; 2AW9 A; 1KYO F; 1OZ0 A; 4GX2 A; 2B5U A; 2FML A; 4PDM A; 2VS0 A; 2LFS A; 4N21 A; 5EYP B; 3RVY A; 2QM7 A; 5KHJ A; 3O9O A; 1N32 O; 2ZE8 A; 4GKJ O; 2CK3 G; 3KCX A; 1M56 C; 3SR2 C; 1MZF A; 1VIB A; 1WNS A; 3DC5 A; 2JVD A; 3I56 V; 1XUQ A; 2F23 A; 2KQX A; 1SA0 B; 3A0H Z; 5FL7 G; 4TV9 A; 3OUS A; 3WB0 A; 1EFR G; 3TGU H; 1W2B U; 4FFB A; 3CMA V; 5LP6 B; 1ZUQ A; 4K0K B; 4UV9 A; 2V1D A; 1SES A; 3ZHU A; 1HNX O; 2R72 A; 1Q81 W; 2BOB C; 1K73 W; 2IU3 A; 1Y6X A; 3BY6 A; 1M5I A; 4GT1 A; 4IHJ B; 1AI5 A; 2EZP A; 2RCV A; 2VWK A; 2YS8 A; 3SJC C; 1SC5 B; 2X0L A; 1TA8 A; 3AG4 C; 1QVF U; 1L0L H; 1XIL A; 4QNH B; 2XND G; 4H13 B; 2QTS A; 4JYA O; 4JI8 B; 3MHH C; 1M56 B; 2HKO A; 3LDD A; 2HLD G; 2ZE6 A; 1WLE A; 4O4H A; 3O65 A; 2JGD B; 3W7W A; 1OCO C; 4RO2 A; 2DQ0 A; 2X6A A; 1K5Q A; 3AG7 A; 4QE7 A; 1WB8 A; 1V9P A; 3UO3 A; 1SET A; 1PKX A; 1TUE B; 1W59 A; 3OAA G; 4RQE A; 1EM1 A; 2PGG A; 3ZMV A; 3T4D A; 3VQX A; 1GN6 A; 2W0X A; 5LGU A; 2ILM A; 2LQT A; 3JD4 A; 4BW5 A; 4LF8 O; 3CHX A; 4NTW A; 4UB6 Z; 3AG4 B; 1G6U A; 2X6B A; 4QE9 A; 4LF9 B; 1DTO A; 1BHB A; 1KQS U; 3FKS G; 1BMF G; 3CXC U; 2QWR B; 4TUY A; 1RFY A; 5FNV B; 4C7U A; 1OCZ C; 4FK5 C; 2JJ1 G; 3SPH A; 5LGT A; 3OTO O; 1IBK B; 4YJ2 B; 4DR2 B; 3FAV B; 4DUY B; 2EX3 A; 1OCO B; 3CJH A; 4KP4 A; 1NVP D; 2ZCE A; 2NR5 A; 2B1I A; 4ZHQ B; 5BMV A; 3BHP A; 2ZT9 B; 4BAY A; 1IX9 A; 5EBM C; 2PI4 A; 2GTS A; 2QDO A; 1FKA O; 4EB6 A; 4DV6 B; 5JH7 B; 4WFG A; 2IM9 A; 3MHS C; 4DV0 O; 1U97 A; 3CX5 F; 1VQP V; 1LUW A; 1I08 A; 3TJT A; 1EN6 A; 2HFE C; 4F6R A; 2D3O W; 2BOC C; 4E2L A; 2QWQ B; 5KAF Z; 4WFA V; 4JV5 O; 4X62 B; 4LF5 B; 1HW7 A; 4AHC A; 1VQL V; 1H8H G; 4FM1 A; 1CEZ A; 1P4R A; 4NR1 A; 1FPO A; 1MA1 A; 5KUK A; 1OCZ B; 3CE2 A; 4X1K B; 2QKC A; 2W6I G; 5HFM A; 4RUE A; 4AI8 A; 5FLX N; 1S5L Z; 3ZRX A; 1K4D C; 1K8A W; 4DR1 B; 4JTC B; 4DR5 B; 3C90 A; 4DR7 O; 4J42 A; 2XAF A; 3JAS A; 1IXB A; 4LFA O; 4ASU G; 4DUZ B; 1JCH A; 2Q6A A; 4WF9 V; 3CPW U; 2UXD B; 4O4L B; 1MSD A; 1H2M A; 4XDJ A; 2WLK A; 4MTG A; 1B3Q A; 3RYH B; 5B3S C; 4EFE A; 5LYJ B; 5CA1 A; 2WWW A; 3SYC A; 4HZ3 A; 3ZMT A; 1PNL A; 4J7J A; 5AG2 A; 2LP7 A; 2F66 C; 4XDL A; 1SQG A; 4P9O A; 5J2T B; 3K79 A; 4I7Z B; 3ZMU A; 3BRC A; 3RFR A; 1ZSP A; 4JZG A; 2CH7 B; 3I5D A; 1AI6 A; 4D6T H; 4CS4 A; 5EYP A; 3ABU A; 4UVA A; 3RVZ A; 3GVM A; 4FJC C; 4F4L A; 2KG7 B; 3JAW B; 1YEW A; 4X89 A; 3SPI A; 1SA0 A; 5B3S B; 5IE9 A; 3D8C A; 4J10 A; 5IYZ B; 2RN9 A; 4CC5 A; 2ZQM A; 4DV4 O; 2QKA A; 2M6Y A; 3Q4H B; 2PZS A; 3U11 A; 1XI1 A; 1TVK B; 4ZIB A; 2E5L O; 2OIE A; 4LNU B; 1H2K A; 2Q8V A; 4B7E A; 4UCO A; 3ASO C; 4I0X B; 4IHJ A; 4J9Y B; 4JI3 O; 2UUB O; 3B8N A; 3E22 B; 3CCJ V; 1F4M A; 2YXL A; 2B9Z A; 4DK0 A; 3ZHS A; 1RP3 B; 4CH3 A; 3F7Y C; 1R6K A; 2FKX A; 1GM7 A; 5F2V O; 4NXN O; 2YIA A; 1K5S A; 1VQ9 V; 3ZMS A; 2HR3 A; 2ZIO A; 1SQQ H; 2QE7 G; 1K9M W; 2YXY A; 4P2Z A; 4PD4 F; 1H2S B; 5K1X A; 3J81 N; 4JI4 B; 1R6T A; 1XHX A; 3OFN G; 4B08 A; 3SPC A; 4QJF B; 4J7Z A; 2HVK C; 1Q86 W; 2G38 A; 4E4E A; 3CRM A; 3OMN B; 2WLL B; 5CBH A; 5JJN B; 3JAT B; 3G4S V; 3ZRV A; 4JF3 A; 3L70 H; 1GMG A; 3ASO B; 3P32 A; 2Q0O C; 1Y76 B; 3SJA C; 1K34 A; 2IH3 C; 2BSK B; 1KUQ A; 3TK1 A; 4IGG A; 2P4V A; 2Q9L A; 3LDC A; 4H0L B; 1S76 D; 4XBF A; 3H1L H; 3JD1 A; 5LOV B; 1DF5 A; 4U3F H; 4K0K O; 1KP2 A; 5JCO C; 2ZNJ A; 5FNV A; 4X66 B; 4YJ2 A; 1N33 B; 5GW7 A; 1R3J C; 4J9Z B; 1AP5 A; 5JQG B; 1CXZ B; 1FFX B; 1GO3 F; 1NKD A; 2DOS A; 5LA6 B; 5J2U A; 1PD3 A; 2P90 A; 4UV8 A; 1QR9 A; 5LMU O; 1RPR A; 4BR6 A; 4ABM A; 3CRQ A; 4H33 A; 2ZR3 A; 3OTF A; 4JI8 O; 3ZHQ A; 2CUG A; 4J41 A; 1I5X A; 1IBL B; 2Q73 A; 2JDI G; 5GTH Z; 1YZB A; 3F5W C; 4KUM A; 5KHG A; 5L3E A; 4FLU A; 1CPY A; 2D2C B; 5IWA B; 1URF A; 3E2E A; 1FJG O; 1O9G A; 5EC1 C; 3BA8 A; 1PPJ H; 4DR7 B; 4X1K A; 1QLE C; 2QR4 A; 2A79 B; 4LFA B; 2AGA A; 1MG1 A; 3K04 A; 4MW3 A; 4LF9 O; 4LF7 O; 1G1X B; 5LL6 Y; 4WFF A; 1B04 A; 2ITC C; 3LDE A; 2E74 B; 2PY5 A; 1HNW O; 1KB9 F; 5CB4 A; 1YSC A; 4FVM A; 4JZ2 A; 1IBK O; 4DR2 O; 4DUY O; 2CAZ C; 3THO A; 2XAG A; 3RYF B; 3RYI A; 4JYC A; 1XNR B; 4OXS A; 1NTM H; 1UFI A; 3QO8 A; 3IFX A; 2BTQ B; 3JD0 A; 2LO1 A; 1H2L A; 1QLE B; 5EC2 C; 4DV6 O; 5H6R A; 3SPG A; 4RQF A; 3APO A; 4WBN B; 5J2T A; 1X59 A; 2ODM A; 4GZR B; 3CEI A; 4KFM A; 4JI5 B; 3KZI Z; 5JJJ B; 4PHZ A; 1JPX A; 1IBM B; 2QGN A; 4B3S B; 2RDC A; 1KC8 W; 1YIT V; 3A8T A; 1QLN A; 1AJQ A; 1OCR C; 3LSQ A; 4X62 O; 4LF5 O; 4Q20 A; 2A3Q A; 2YIC A; 3KKY A; 5C8Y B; 3H01 A; 2IW5 A; 1JA8 A; 1H8E G; 1GRJ A; 3JAW A; 2VQF B; 3B09 A; 4DV4 B; 4I9Q A; 4UVB A; 2CE4 A; 4DR1 O; 4DR5 O; 5FPO A; 5IYZ A; 2GUZ B; 4DW0 A; 2WLI B; 1KMI Z; 2F4V B; 3FYI B; 4LFB B; 3B4S A; 4O2B B; 3CCS V; 4JI3 B; 2PUS A; 3F7V C; 3ABK C; 4X20 B; 1VQO V; 1TVK A; 2YDE A; 4F6E A; 2UXD O; 4X65 B; 1JJO A; 4I0X A; 3RGB A; 3H1K H; 1Q43 A; 3H1I H; 1PP9 H; 1K4C C; 5JVD B; 4NB5 A; 3G71 V; 4DK1 A; 3JD3 A; 3AG2 C; 1OCR B; 5KMG A; 5L3C A; 2M7W A; 3CRR A; 3DSQ A; 5E79 Z; 1F7Y A; 4MTX A; 4MVU A; 4B3R O; 4DV3 O; 1KKD A; 1M93 A; 4UFZ A; 4I9W A; 3J80 N; 1TAE A; 5D5Q A; 1NH2 B; 3RW0 A; 4DV1 O; 3ABK B; 2WLL A; 5H2F Z; 5JJE B; 5LXT B; 4Q6G A; 1LUV A; 4IYI A; 1BCC H; 2ZXW C; 2AXT Z; 3QVN A; 3PN1 A; 1VQM V; 1S0V A; 1BQ0 A; 4WFB V; 5A9G A; 3LUT B; 2R70 A; 2XUM A; 1Y76 A; 1N8R W; 2KSD A; 1XEQ A; 2YIB A; 1R3K C; 3VQV A; 2BSK A; 1QBZ A; 4LFC O; 1PNK A; 3K0G A; 3QF7 A; 3OT7 A; 2VRZ A; 1WN7 A; 2LGW A; 2EIK C; 3AG2 B; 1Z2G A; 3QG5 A; 5LOV A; 3FFQ A; 2H94 A; 4PI2 A; 3K5L A; 5LHI A; 1NJI W; 1SKV A; 3QO7 A; 1SS3 A; 3H9V A; 4MTO A; 4X88 A; 4NXM O; 5LMU B; 3D3I A; 5JQG A; 4H37 A; 3K58 A; 5A2Q N; 1G4Y B; 3BAA A; 1Y74 B; 1P7G A; 4U3J B; 3QTC A; 2Y4U A; 2UXB B; 2ZDI C; 5LA6 A; 1DK1 A; 1KKC A; 3CC2 V; 4LBE C; 2DWE C; 1KU9 A; 4FM0 A; 3OMI B; 2ZXW B; 4TV8 B; 5IY5 C; 4GUN A; 1XQ8 A; 1Z5W A; 4L8J A; 1NBM G; 4I55 B; 1ZL8 B; 2LGQ A; 2OCC C; 2MK3 A; 1FJG B; 1V54 C; 4JI4 O; 1GN4 A; 1HDJ A; 4GLX A; 2OTJ V; 1GK9 A; 2Y0I A; 4HBN A; 2EIK B; 1BS3 A; 2L35 A; 4L87 A; 4NTY A; 4RUF A; 2DE0 X; 3M99 B; 4UCV A; 4JI7 B; 4UCR A; 2ETN A; 1BSM A; 3CRC A; 4X9Q A; 3S3X A; 1VF6 C; 2LW7 A; 3STL C; 4LF7 B; 4MVO A; 1VQ4 V; 4YXW G; 2QKS A; 4WFE A; 4YJ3 A; 4PDR A; 4A5U B; 3RBZ A; 1HNW B; 2RJZ A; 3N27 A; 3OGC C; 4XDK A; 5IY5 B; 4ZOL A; 3CD6 V; 4LH7 A; 1WJZ A; 1D5N A; 4PEL A; 3RWR D; 2AHY A; 2OCC B; 1BHA A; 5DM6 V; 4X66 O; 3MAQ A; 1V54 B; 3AK2 A; 4UB8 Z; 1N33 O; 1JMK C; 3RYF A; 4MVM A; 1S72 V; 2XOK G; 1GN2 A; 4PV1 B; 2A06 H; 2KKW A; 2AZ0 A; 3J7A U; 1AR1 B; 3CC4 V; 4X1I B; 5EK0 A; 3RN4 A; 3LSS A; 3ETQ A; 3JAR A; 4LWS B; 4YIO A; 2HHH B; 4IIJ B; 3ZRW A; 1N36 B; 5KLV H; 1XNQ O; 1IBL O; 4O4J A; 1NR1 A; 2EIJ C; 2UUA B; 2DYS C; 2P06 A; 1HR0 B; 3ZN0 A; 3WB2 A; 2PF4 E; 4O4I B; 3CC7 V; 1Q6I A; 5IWA O; 2IJH A; 1IXM A; 2EJ7 A; 4FLW A; 3CCL V; 5KX5 B; 3S3W A; 3ZBH A; 5C8Y A; 3D3Q A; 4BW9 A; 3UM7 A; 1QNM A; 3WU2 Z; 4CZZ A; 3R65 A; 5H9C A; 3UO2 A; 3N2G A; 4J11 A; 2WA4 A; 4JYB A; 4TOI A; 2WLI A; 1AI4 A; 4O2B A; 2GHY A; 3TXS A; 3K5O A; 1E1R G; 4HAM A; 1AJP A; 5D5P A; 3FX7 A; 3CRA A; 3QNE A; 2Q4P A; 2EIJ B; 2DYS B; 2ARH A; 3G67 A; 4OPH A; 4CS2 A; 3BFR A; 1GKF A; 2QWN B; 5JVD A; 1XNR O; 1H2G A; 3K03 A; 3TET A; 5EZY B; 4B3R B; 2QSA A; 3T1H B; 4DV3 B; 1S3J A; 1OJH A; 4JGS A; 2QEX V; 1HNZ O; 3SPJ A; 4I50 B; 2EBO A; 3SYQ A; 2Z5U A; 5B66 Z; 2X6C A; 5GTI Z; 4DV1 B; 3CB2 A; 4JPR A; 4WCE V; 3FB8 C; 4GKK O; 3HKC B; 4MS2 A; 2ITD C; 1N4C A; 1YI2 V; 4LF6 O; 4JI5 O; 1X4T A; 5B1O A; 2RMK B; 3JAL B; 1IBM O; 2LJ2 A; 4GCZ A; 4B3S O; 3E35 A; 1OV9 A; 3FYE B; 1TUB B; 1MAB G; 2ZR2 A; 4DV2 B; 5LXT A; 4LFC B; 2YIB D; 3CCR V; 3TXQ A; 1F4N A; 2RQ6 A; 3CP1 A; 2ATK C; 4KXR A; 1NTK H; 5LP6 A; 2VQF O; 4R7C A; 1IZ3 A; 4DV5 B; 3W7X A; 4G28 B; 4H44 B; 2DMX A; 1PL0 A; 2Z0A A; 2CGN A; 4J7K A; 2F4V O; 4NXM B; 4LFB O; 4PJ0 Z; 4BIZ A; 4CBC A; 1VP7 A; 1UPG A; 4TSF G; 3CXH F; 3OR7 C; 1N34 B; 4JTA B; 1FFT B; 4X65 O; 1H2N A; 1SRY A; 2Y48 A; 1WA8 B; 3BVO A; 3JAK B; 3UCS C; 4NYK A; 1Y74 A; 4U3J A; 2ZM6 B; 5HFL A; 5LHH A; 5FPR A; 1J95 A; 2IJJ A; 2ZD9 A; 1EN4 A; 1N0N A; 3L71 H; 2JGD A; 3FB7 C; 5EBW C; 2F93 B; 3EXA A; 3HKE B; 4X8A A; 4O2A B; 4AIL C; 2FB5 A; 4MTF A; 1Q82 W; 4I55 A; 1ZL8 A; 4JAV A; 1M9N A; 2ZE5 A; 2N74 A; 3OUF A; 4J80 A; 3SJQ C; 1BE3 H; 2E76 B; 2UXC B; 5TIS Z; 1KD1 W; 4FIP C; 2JS5 A; 2WLH A; 2F1M A; 2ZNI A; 1AJN A; 3X2Q C; 5B1N A; 1VQ6 V; 4HNA B; 1YF2 A; 1ORQ C; 1K33 A; 2CTQ A; 1T5E A; 3AG3 C; 1RM1 C; 4IL6 Z; 3W7S A; 4YHH B; 2NNU A; 1E79 G; 2P5O A; 4B3M B; 3SYP A; 4CH6 A; 3W7T A; 4DRX B; 2AZ2 A; 3ZHT A; 4BWA A; 2ZDI A; 1M57 C; 3B2E E; 3U10 A; 4CC6 A; 5BR8 B; 2P4K A; 1LR1 A; 3ABM C; 3FAV A; 4HYO A; 2WSS G; 3JCU Z; 4ZHQ A; 2DWD C; 2ZE7 A; 1JJ2 U; 3ABT A; 2P7T C; 3NR7 A; 3RT3 C; 4MSW C; 2YID A; 4PA7 A; 4Z1M G; 1YJ9 V; 4PDL A; 4MVZ A; 1BZK A; 3HKD B; 4FLT A; 4X1I A; 2UXB O; 1ZWI C; 2FTK A; 5JH7 A; 3X2Q B; 4EKW A; 1XNQ B; 2QA4 V; 4JI2 B; 3AG3 B; 3ZHR A; 1RM1 B; 4LWS A; 1NQT A; 1VF6 A; 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