The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
50
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structure length |
50
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Chain Sequence |
DEAQFKECYDTCHKECSDKGNGFTFCEMKCDTDCSVKDVKEKLENYKPKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR Solution Structure of Ole e 6, a Major Allergen from Olive Tree Pollen.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Pollen allergen Ole e 6
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| molecule tags |
Allergen
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| source organism |
Olea europaea
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| total genus |
14
|
| structure length |
50
|
| sequence length |
50
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF09253 | Ole-e-6 | Pollen allergen ole e 6 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Pollen allergen ole e 6 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SS3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1R3I C; 5EIB C; 3OTO B; 1U97 A; 3K5M A; 3EFF K; 1MMM A; 3K0G A; 2YXH A; 4FVM A; 4I7Z B; 3E8H A; 2RJZ A; 3R65 A; 1M56 B; 2GBO A; 4P2Z A; 4WCE V; 3K9A A; 4DV0 O; 1RFY A; 1XL6 A; 1FXK C; 2Q7E A; 2HJF C; 4DR4 O; 4GX1 A; 1SQG A; 4J80 A; 1QLN A; 1TUB A; 2K9P A; 5KUM A; 4RQE A; 3U11 A; 3BA9 A; 2IH3 C; 4FPP A; 1K92 A; 4NKG B; 2Q0A A; 2Y0I A; 3O9O A; 4Q20 A; 3APQ A; 1FFX A; 5KA5 A; 2UXD O; 4L8J A; 4DW1 A; 1FJG O; 2VS0 A; 1UPG A; 2F1M A; 1VQP V; 3UM7 A; 4FLU A; 4F4L A; 4LF4 O; 4I50 A; 4JF3 A; 1EN6 A; 2P4K A; 1XOU A; 3RYF B; 4TSF G; 2RN9 A; 5C8Y B; 4WFF A; 2OT5 A; 2DJV A; 3P3N A; 3CXC U; 5J2T B; 3F5T A; 4JAV A; 2KG7 A; 4IYH A; 5B5E Z; 1E1R G; 3CS5 A; 3WB2 A; 2E5L B; 3J7A U; 1VAR A; 1K4C C; 3MAQ A; 1XI1 A; 1ZWI C; 1WNS A; 4JZG A; 3P32 A; 5B1A C; 1KB9 F; 3ZS8 C; 1HNW O; 3E83 A; 1TAE A; 3TJT A; 2ZCE A; 3R66 A; 5LGN A; 4FM1 A; 2ZR3 A; 4MT8 A; 2L35 A; 4DV1 O; 3QG5 A; 5D5P A; 3K5L A; 3SYA A; 4DR1 O; 3G67 A; 4PI2 A; 1WAZ A; 4EFB A; 5D5Q A; 4CZZ A; 2M6Y A; 3IAY A; 3RN4 A; 4OX9 O; 3CPW U; 1FAF A; 4LF7 B; 2WLM A; 4WF9 V; 4UB8 Z; 4N23 A; 2F43 G; 4DK1 A; 1KEC A; 4BIU A; 2BTO A; 4PA4 A; 5J9P C; 2PF4 E; 4RO2 A; 4DR3 B; 5JJJ B; 4HYO A; 3FKS G; 2IU0 A; 2A9H A; 4DV2 O; 1XNR O; 4TV8 B; 4LFC O; 3OEH G; 3AG4 B; 1HW7 A; 5CA1 B; 3CC4 V; 2OTJ V; 3X2Q B; 5CBH A; 2RDC A; 3QO5 A; 5GW7 A; 2CUG A; 2JEU A; 5IDJ A; 2X6A A; 1JQ0 A; 3CD6 V; 2LFR A; 4MSW C; 1YZB A; 4JTC B; 2JS5 A; 1YJN V; 4P30 A; 1BHA A; 1V55 B; 3ZRV A; 3HKB B; 3ETE A; 1NU1 H; 3RVY A; 1F4M A; 2VWK A; 2A7W A; 1NVP D; 1VF6 A; 1VQ4 V; 3LSS A; 2EIJ C; 4UVB A; 1L0N H; 3ZMV A; 1L8D A; 2XAF A; 3W7X A; 4DR7 B; 4JAU A; 2B5U A; 5LA6 B; 1YVW A; 2X6C A; 3E8B A; 1K5S A; 4MW3 A; 3MHH C; 4WFA V; 2DYS B; 3CX5 F; 1RSO A; 1I94 O; 4DYL A; 5CN0 A; 3W7S A; 1YIJ V; 2HVJ C; 3HKC A; 3N2G A; 4Z2W A; 3TCU A; 2H8P C; 4IIJ A; 4TQD A; 1AI6 A; 2JGU A; 2JEX A; 1DGS A; 3K5O A; 4MS2 A; 1YJW V; 4JYC A; 4CH4 A; 2DQ3 A; 4DV7 B; 2YIA A; 4LF5 O; 4BWA A; 3OAA G; 3A0H Z; 3CCM V; 3FB7 C; 4YHH B; 2WLH A; 3ZMU A; 3JAL B; 2QE7 G; 3AG7 A; 3I5D A; 2QKS A; 4ZHQ A; 4FLZ A; 2YID A; 2XAQ A; 3GB7 C; 1HR0 O; 1O9G A; 4RQF A; 1J95 A; 2BSK B; 4UCS A; 2YIB A; 4FLT A; 4OPH A; 4HNA A; 4AIL C; 4PA3 A; 1AB3 A; 4JYA O; 2RCV A; 1UFI A; 1URF A; 5BXZ A; 3G6B A; 1WN7 A; 1H8E G; 2WSS G; 3L71 H; 5K1X A; 3RGB A; 1KBH A; 3AK1 A; 4X1K B; 3JD1 A; 3CJH B; 1IZ3 A; 4UV9 A; 5LMU B; 1GM9 A; 5JJN B; 5EBW C; 4CS2 A; 1BS3 A; 3AG2 B; 1GN4 A; 3PN1 A; 4LH6 A; 4U7N A; 4X20 A; 2Q6A A; 1N32 O; 4HZ3 A; 1XNQ B; 3W7W A; 1H38 A; 4DV3 O; 5JCO C; 2Q0O C; 4K0K O; 3LDC A; 1M9N A; 4O2A B; 2EIL B; 4YJ3 B; 4QE7 A; 2EIM B; 4I5S A; 1VQ5 V; 1PL0 A; 4EB6 A; 1H2L A; 2WWW A; 1GRJ A; 4CC5 A; 2EJ7 A; 3T1C A; 2PYJ A; 1SER A; 1NT2 B; 5LXT A; 5LOV A; 5EC1 C; 4Z1V A; 4GZR B; 4X62 O; 1VMG A; 1XMO O; 1JJ2 U; 5IYB O; 3ZMT A; 4LF9 B; 1KU9 A; 4B08 A; 1YXB A; 4MVM A; 1Q90 D; 2XT9 A; 2ZXW B; 4MTF A; 4WFB V; 2QM7 A; 1NJI W; 1GK9 A; 3ZJZ A; 4GLX A; 2PI4 A; 1K73 W; 4X1I B; 4PA9 A; 3B2E E; 2BE3 A; 3T1H O; 4JTD B; 1EFR G; 4FLY A; 3OR7 C; 1US6 A; 5IWA B; 3CCJ V; 3K79 A; 3OUS A; 2VQE O; 1OCZ C; 4PD4 F; 1SQX H; 1FKA O; 4YIP A; 1P4R A; 5B66 Z; 3J80 N; 2YC0 A; 3JD3 A; 4IGG A; 1MZF A; 4UB6 Z; 1D2D A; 2UUA B; 4NB5 A; 3CE2 A; 4AI8 A; 2IBZ H; 1U96 A; 1IBK B; 3CRA A; 1V55 C; 1YSC A; 1VF6 C; 3CCS V; 4UCU A; 1EN4 A; 5BMV B; 1BMF G; 2B1I A; 1R73 A; 4GX2 A; 2E3C A; 4U3J B; 1T5E A; 3ZMS A; 5JVD A; 3SPI A; 1K3E A; 1IBM O; 2BTQ A; 4O4J B; 4GCZ A; 2RNB A; 3K5N A; 4TOI A; 4J10 A; 2ZQM A; 1R3J C; 4X1Y B; 1S5H C; 2AHZ A; 1ZTE A; 2EIK B; 3VOU A; 3BRC A; 3FAV A; 4PDV A; 3SPC A; 2ZD9 A; 4BW9 A; 1M4U A; 3HB3 B; 4MTX A; 2IW5 A; 3F7V C; 1B04 A; 2B1G A; 1NR1 A; 3L9D A; 3T4Z A; 1QR9 A; 2E76 B; 4LF6 O; 4LBE C; 1P7B A; 4B3M B; 3JAT B; 1FXK B; 3B77 A; 4O2B A; 1HNX O; 1YI2 V; 3RYI A; 3A8T A; 4JI8 B; 2G38 A; 4KP4 A; 1PP9 H; 1H2S B; 4D6T H; 3AK2 A; 4X64 O; 1XHZ A; 4XDJ A; 1Y76 A; 1K34 A; 3LNM B; 1KP3 A; 4JI5 O; 2P5O A; 1K8A W; 3K9S A; 1W0J G; 1H2M A; 4IYI A; 5A2Q N; 4GX5 A; 2R9I A; 5KAF Z; 2UXC O; 4O4I B; 3BY6 A; 2FKX A; 3ETG A; 2JS3 A; 1XBL A; 1EZJ A; 3QO8 A; 4LH7 A; 4DR6 O; 3F7Y C; 3ASO C; 3L72 H; 3AG2 C; 3ZHV A; 3OFN G; 3EXA A; 1ENV A; 3OTF A; 3CHX A; 4JYB A; 1B3Q A; 3VQX A; 1D5N A; 2F4V B; 5EK0 A; 3T2M A; 5LYJ A; 1S72 V; 1CEZ A; 2AXT Z; 1R6N A; 3CRM A; 4ZOL B; 4W4L A; 1AIL A; 4U3F H; 5CA0 B; 5LMN B; 3P30 A; 4LFB B; 4JI3 O; 3ABK C; 2EIL C; 5B1A B; 5ITZ A; 3MHS C; 4CH6 A; 1ROP A; 2EIM C; 2XAS A; 3DXR B; 4TT3 G; 4NTY A; 4YY3 B; 4X65 B; 3DXR A; 2BOB C; 4WBN A; 3ABM B; 1K4D C; 3O65 A; 4DUZ B; 4EEQ A; 2NN4 A; 3ZX6 A; 3WU2 Z; 1BCC H; 3ABT A; 1H2K A; 1TGO A; 3B4S A; 1Y4M A; 1J5E O; 4TWK A; 5B1O A; 2AZ2 A; 1N33 O; 4ZI7 B; 4DV5 O; 4JI0 O; 4ZI7 A; 2Z0A A; 3E22 B; 2UUB B; 2ZIM A; 3ASN C; 5FL7 G; 2WLL B; 1AI7 A; 4TV9 B; 4KHP O; 4DV6 O; 2UU9 B; 4F6R A; 3OMA B; 2ZKO A; 3OTO O; 1P7G A; 2X6B A; 5CBG A; 3UT5 A; 2CAZ C; 2IM9 A; 2NR5 A; 3JAR A; 4DO2 A; 3OR6 C; 1SES A; 2UXN A; 2ETN A; 4DR2 B; 1Z5V A; 1BSM A; 1NBM G; 4NXN O; 4Z1M G; 2Q5Z A; 4JI7 B; 1G4Y B; 1Q6U A; 2Q73 A; 2LGW A; 2LP7 A; 5L3B A; 1CP9 A; 5JQG A; 2ZE5 A; 3CMA V; 1WB8 A; 4QIW F; 4BIO A; 2QR4 A; 3TET A; 1X4T A; 1GN3 A; 4NTW A; 2EIJ B; 3H1I H; 2AZ0 A; 5H6Q A; 4AHC A; 3E86 A; 4QGP A; 2Z3Y A; 3AEI A; 1SZT A; 1L0L H; 3OGC C; 2VWJ A; 1LR1 A; 4DUY B; 3CCE V; 4JI1 B; 2KQX A; 2DW4 A; 1ZLZ A; 2XHB A; 4LFA B; 1O9H A; 2YSU B; 1DF5 A; 2NLJ C; 4EKW A; 1JMK C; 2P67 A; 2DOS A; 4DK0 A; 3CXH F; 4E2L A; 1RPO A; 1ZX3 A; 5LP6 A; 5LGU A; 4NYK A; 1I5Y A; 1TUB B; 4BR6 A; 2QGN A; 4D7S A; 1PNL A; 5EIB D; 3JD2 A; 3AG3 B; 1FXV A; 1EM1 A; 4CS3 A; 3IGA C; 4H33 A; 3M8A A; 1AI4 A; 3SPH A; 5K1P A; 1COW G; 1N8R W; 1JX9 A; 3DC6 A; 2L6L A; 1FFX B; 3HKD A; 2CTW A; 1KMI Z; 2LGQ A; 3WB0 A; 1GKF A; 4JI4 O; 1QU7 A; 3SJC C; 2A0L A; 2AGA A; 4JI6 B; 4BIZ A; 4I50 B; 5F2V O; 3Q4H A; 4G27 B; 2A3Q A; 1GM7 A; 3EVK A; 4GKJ O; 4LF7 O; 3JD0 A; 1IDS A; 4G2K A; 4FZ1 A; 2QSA A; 2QWP B; 3UO3 A; 2KG7 B; 1I7F A; 4XDK A; 5B3S C; 4AQY B; 3CSX A; 2VQF B; 3SYP A; 1VIB A; 2GTA A; 4B3R O; 3H1H H; 3L75 H; 3UQ8 A; 1BZK A; 1EN5 A; 4DR3 O; 2Q7H A; 2EX3 A; 2HEP A; 4UCR A; 4KL1 A; 3I55 V; 1AVM A; 4LWS A; 5C93 A; 3U0Z A; 1S5J A; 2WLJ A; 1VQK V; 3RFR A; 1XEQ A; 4X88 A; 3ABM C; 2JGD A; 1N36 O; 1E1Q G; 3ZED A; 1QNM A; 4L87 A; 1ARO P; 5GON A; 4DV0 B; 4UFZ A; 4UXN A; 3CRC A; 5FNV A; 3JAW A; 3STZ C; 3S3X A; 2JDI G; 3TK1 A; 1I5X A; 5AG2 A; 1WPX A; 4J9Y B; 4DR7 O; 5BZB A; 3DGE A; 1H2G A; 5IJ9 A; 3FYE B; 3KZI Z; 1S5L Z; 1RM1 C; 2UXD B; 1FJG B; 3STL C; 2DN9 A; 2V4D A; 1XDC A; 1OCZ B; 1NS1 A; 5L3D A; 1NI8 A; 4LF4 B; 2JJ2 G; 3ZN0 A; 3N2K A; 5DN6 G; 5LHG A; 4JZ2 A; 1JR9 A; 1NTK H; 4LC1 A; 5KHJ A; 5IYZ A; 3ZRX A; 5H5N A; 3ETQ A; 3DTU B; 1BE3 H; 4MVZ A; 3ZHS A; 4NXM B; 2HG5 C; 3D3Q A; 4YHH O; 3B09 A; 3JD4 A; 5JH7 A; 1V54 B; 2Q4P A; 3JAK A; 1BT8 A; 1HNW B; 4QJF B; 3D8C A; 2ZNJ A; 3KKY A; 2F23 A; 1VQ6 V; 2P06 A; 1MSW D; 1BHB A; 1RSO B; 3RYC A; 4JGS A; 1GMG A; 3P3P A; 2YUA A; 2OIG A; 4DV1 B; 3HKC B; 3N2G B; 2UUC O; 4IIJ B; 3TGU H; 3RBZ A; 2ODM A; 1OHH G; 1NR7 A; 4DW0 A; 3AG1 C; 4ABM A; 2FL4 A; 4PA7 A; 4ZBM A; 5LP6 C; 1BQ0 A; 2MK3 A; 1VQ9 V; 4ZHQ B; 2N05 A; 4K35 A; 3MD0 A; 3UKM A; 4U7O A; 3ZRW A; 3FYI B; 4DV2 B; 4LFC B; 5LL6 Y; 3AG3 C; 3SYO A; 4DV4 B; 1M1K W; 3LNN A; 3E8F A; 1QCE A; 4HNA B; 3J81 N; 1Q86 W; 3K3W A; 2OYQ A; 4CH5 A; 2YEV A; 4LNU A; 3K57 A; 1MSD A; 1XMQ B; 3M99 B; 1MG1 A; 4MVO A; 5KHI A; 2E74 B; 1Y74 A; 4LF9 O; 3ZCC A; 2PYL A; 3OUF A; 3G71 V; 2GSM B; 3ASO B; 3CCV V; 4X20 B; 1AJN A; 2C2A A; 4B3T B; 1MOF A; 5IWA O; 4LF8 O; 4FLX A; 1YCI A; 2QM4 A; 4N21 A; 4TQF A; 4O4L A; 1SQF A; 3FB6 C; 1OCO C; 3A2F A; 2BOC C; 4W4K A; 1AP5 A; 3ZN1 A; 1OV9 A; 3ABL B; 1EBO A; 3ABK B; 4UCV A; 3RT3 C; 2PTM A; 4E4E A; 4EB6 B; 2Y69 B; 2PUS A; 2GV9 A; 4LF5 B; 3RVZ A; 1QLE B; 2UUA O; 1XUQ A; 3DSQ A; 5FLX N; 5LXT B; 5LOV B; 1IBK O; 5DED A; 2BCC H; 5EYP A; 2HR3 A; 3OEE G; 2GUZ A; 2X7R B; 1PPJ H; 1GH6 A; 1K33 A; 1MA1 A; 1HR0 B; 3OGI B; 1PV0 A; 2YS8 A; 1R3L C; 1XQ8 A; 3ASN B; 1QQC A; 1SC5 B; 2ITC C; 2XTA A; 1XIL A; 3UCS C; 4JYA B; 2DQ0 A; 3T1Y O; 2LW1 A; 4HAM A; 3JYC A; 2WLI A; 4XBF A; 2HJD A; 3CCQ V; 5CMU A; 1SQP H; 2P22 C; 1N32 B; 3CYO A; 2F95 B; 4BW5 A; 3H1K H; 2A06 H; 4DV3 B; 1GAX A; 1JCH A; 4GUN A; 5CB4 A; 1GTO A; 4JI8 O; 1JOY A; 1SF9 A; 5JVD B; 1V54 C; 2BTQ B; 1AP6 A; 5L3F A; 3BVO A; 3T4D A; 3BHP A; 2V7Q G; 1A32 A; 1N34 O; 1HNZ B; 2OWO A; 3FAV B; 5GTH Z; 1GN2 A; 2UXB O; 4IL6 Z; 3VQW A; 2IJK A; 2ZR2 A; 2WAM A; 2WPD G; 4X62 B; 4J7Z A; 4IHJ A; 1XMO B; 3K08 A; 3CCL V; 4OGQ B; 2WLN A; 1Y67 A; 1S77 D; 2EZO A; 3WB1 A; 1NH2 B; 1FS0 G; 1M57 C; 2O57 A; 5L3E A; 3T1H B; 3NXS A; 2ZM6 B; 4XDL A; 4O2B B; 4DR5 O; 3ZHQ A; 3GWO A; 3OD4 A; 3RYI B; 1H8H G; 3BPZ A; 2JK5 C; 1V9P A; 2VQE B; 1SA0 A; 4R6Z A; 4YIO A; 2DYR C; 4YY3 O; 2W6J G; 1IBL B; 1Y76 B; 3E35 A; 3TXS A; 2WA4 A; 4QE9 A; 4PHZ A; 4DUZ O; 2CTR A; 3OMN B; 3K06 A; 3SJB C; 4P9O A; 2H94 A; 4CH3 A; 3JSL A; 1IX9 A; 1YEW A; 4JI2 O; 1KD1 W; 2YIB D; 4DRX A; 3ZIA G; 1IUR A; 3WG7 C; 1K9M W; 2ZT9 B; 1FYJ A; 1IBM B; 4I9Q A; 2AW9 A; 1TVK A; 4GKK O; 5B3S B; 2UUB O; 2CH7 A; 1ZL8 A; 5LYJ B; 2DE0 X; 2CK3 G; 3LSU A; 5IY5 C; 2EBO A; 3CCU V; 3UO2 A; 3CEI A; 5ITZ B; 4MVU A; 2H3O A; 3ABL C; 2ARH A; 3KG2 A; 4B3S O; 1YIT V; 4WBN B; 4DR2 O; 3DC5 A; 3FB5 C; 2Y69 C; 4JV5 O; 1SZX A; 1QLE C; 3SPJ A; 4LF6 B; 1HDJ A; 4JI7 O; 1Y6X A; 2R72 A; 4R7C A; 1ORQ C; 3QTC A; 4I4T A; 4X66 O; 5DM6 V; 1HNX B; 2M7W A; 3TXQ A; 1PM9 A; 2P6J A; 2XAJ A; 2VRZ A; 3CB2 A; 1VF5 B; 2RQ6 A; 5EC2 C; 1K7D A; 2CGO A; 1NQT A; 2ADP A; 2GDS A; 3IC9 A; 3KCX A; 3L74 H; 2MW2 B; 3NR7 A; 4PDR A; 1FXH A; 2Q69 A; 4JI5 B; 1TUE B; 3KCY A; 4I0X A; 1RM1 B; 2FYU H; 4F6R B; 3H1J H; 1KKC A; 4DUY O; 4LFA O; 1IXM A; 4OPA A; 3THO A; 2UXC B; 4CS4 A; 1FFT B; 3UT5 B; 4KFM A; 2DWD C; 2PY5 A; 3JAR B; 5BR8 B; 5KMG A; 2QWQ B; 2ZE7 A; 1KC8 W; 1S0V A; 5J2U A; 3HPL C; 4G28 B; 1JFF A; 2K1E A; 1XHX A; 2RMK B; 5IJ0 A; 1BGY H; 2D3O W; 5JQG B; 3GWK C; 5JWP A; 1GN6 A; 1FD9 A; 4H13 B; 4X9Q A; 3JAS A; 4I9W A; 4JI3 B; 2KSD A; 4TUY A; 1Q81 W; 1JPX A; 1WA8 A; 3RYH A; 3SDL A; 5KHK A; 1G1X B; 4K3A A; 1QVF U; 4Q6G A; 5KLV H; 2CGN A; 4QPK A; 1OCC B; 2X0L A; 1MZE A; 1NTZ H; 4JI6 O; 2PI5 A; 2B9Z A; 4YJ2 B; 3SGI A; 3APO A; 3ZBH A; 1CPY A; 4YJ2 A; 4PI0 A; 1J5E B; 3AG1 B; 1F7Y A; 1OZ0 A; 5CA3 A; 1Q82 W; 2HFE C; 4I55 A; 5LHI A; 1DK1 A; 3OMI B; 1MAB G; 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