The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
|
sequence length |
55
|
structure length |
54
|
Chain Sequence |
ASATWGAAYACENNCRKKYDLCIRCQGKWAGKRGKCAAHCIIQKNNCKGKCKKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of neurotoxin B-IV from the marine worm Cerebratulus lacteus: a helical hairpin cross-linked by disulphide bonding.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
NEUROTOXIN B-IV
|
| molecule tags |
Neurotoxin
|
| total genus |
15
|
| structure length |
54
|
| sequence length |
55
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1996-11-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07822 | Toxin_13 | Neurotoxin B-IV-like protein |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Neurotoxin B-IV-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VIB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RDC A; 2W0F C; 3OR7 C; 3FAV A; 5JJE B; 3H1H H; 1AR5 A; 4GX5 A; 4OPA A; 3OTO O; 2JGD A; 2QDO A; 1IBM B; 5IE9 A; 3CRR A; 1NH2 D; 3JAS A; 4I0X A; 1PPJ H; 5B3S B; 3DSQ A; 4MVS A; 4LF5 O; 3JAR B; 3FB6 C; 1E1R G; 1VMG A; 3RFR A; 4UVA A; 1ZUQ A; 3ETE A; 3E89 A; 1H2S B; 1NI8 A; 4OPH A; 3ZIA G; 3ZN0 A; 1LUV A; 2UU9 O; 4JI1 O; 2YIA A; 4JI4 O; 4FLT A; 4KL1 A; 2YXL A; 1Y76 B; 4HAM A; 4D7S A; 2XAH A; 4FLX A; 4P9O A; 1K4C C; 1WLE A; 4LF6 B; 4UCO A; 5LBQ A; 1IBK O; 3OEH G; 2E5L O; 2CTP A; 3JAK B; 5EC2 C; 2GBO A; 1XL6 A; 4J41 A; 4PDM A; 2GTS A; 1Y67 A; 1HNX B; 1VQN V; 1JVM A; 1Q8I A; 4CH5 A; 4X88 A; 1WPX A; 2N74 A; 5FNV B; 4GKK O; 5H9C A; 2GSM B; 1OZ0 A; 4Q20 A; 3CX5 F; 4DR2 B; 4J7K A; 1FXK A; 5ITZ A; 4KUM A; 4FMT A; 2PUS A; 1EFR G; 5EC1 C; 2JGD B; 3ZMS A; 4PI2 A; 1GK9 A; 3JAS B; 4I0X B; 5BMV B; 1IBL B; 1RM1 C; 3LDD A; 3O65 A; 5K1X A; 1IBM O; 1TAE A; 2KQX A; 2YI8 A; 5EIB D; 3UT5 B; 3KCX A; 2A0L A; 3DXR B; 3AK3 A; 1MNG A; 1XUQ A; 3N2K A; 1BHA A; 3SJB C; 5GTH Z; 3CJH B; 1Z5V A; 3BAA A; 4UCV A; 3IFX A; 4C7U A; 3K06 A; 5LP6 B; 1N33 B; 2IJI A; 1WA8 B; 5C93 A; 1VF5 B; 1HP8 A; 3JSN A; 2Q7E A; 3IJ4 A; 2XTA A; 2ZD9 A; 5IYC O; 4FLY A; 5LYJ A; 3RYI A; 2QA4 V; 5J2T A; 3T4D A; 4LF6 O; 1YJN V; 1I0H A; 2AZ2 A; 5J2U A; 3SJC C; 3JAL B; 3ZRW B; 2HJD A; 2W6I G; 3STL C; 2JVD A; 3EVK A; 2BOB C; 1XQ8 A; 4XDK A; 1TVK A; 4CBC A; 1HNX O; 5ITZ B; 2QGN A; 2EIM C; 1XBL A; 1GKF A; 2N04 A; 4UXN A; 2GUZ A; 2P67 A; 4DR2 O; 4JI0 B; 2CE4 A; 1NQT A; 4DR1 B; 3QNE A; 5JQG A; 1N0J A; 2ZT9 B; 3ZHT A; 3QO7 A; 1H2L A; 4JI7 B; 1K92 A; 3HKB A; 1MSW D; 4ZOL A; 4F6E A; 3OEE G; 2PYJ A; 3QTC A; 1GAX A; 2F43 G; 2ODM A; 4Z1M G; 4MVO A; 3T1H B; 4MVZ A; 2YDE A; 2QJ1 A; 4RWU A; 5IYB O; 3CME V; 2ARH A; 1YEW A; 3L75 H; 3SYO A; 2A3Q A; 4RQF A; 3VQX A; 5BXZ A; 4PJ0 Z; 1N33 O; 1HW7 A; 1YXB A; 3K03 A; 1K7D A; 5J2T B; 4NTY A; 1K5Q A; 4MVR A; 3SPH A; 3AG3 C; 3ASO C; 1Z5W A; 3LNM B; 3U0Z A; 2ZE6 A; 4GYC B; 2E3C A; 3SJA C; 3ABT A; 4QE9 A; 1VQM V; 3K0D A; 4GZR B; 3W7S A; 2QM7 A; 2JS5 A; 1M1K W; 3VOU A; 4TV8 B; 1RSO A; 1LUW A; 2MW2 B; 1N8R W; 1CXZ B; 1EN4 A; 3CE2 A; 3VQY A; 4FPP A; 4D6T H; 2PTM A; 2YS8 A; 4LBE C; 2GUZ B; 1QLN A; 1QBZ A; 4RUE A; 3OMA B; 4DV6 B; 1S76 D; 5CB4 A; 4O4L B; 1GRJ A; 2WAM A; 1D5N A; 2Z5U A; 4JI0 O; 3CSX A; 1CP9 A; 4DR1 O; 1JFF B; 4CH4 A; 4X8A A; 1JMK C; 1YZB A; 4JI7 O; 4LF8 B; 2OCC C; 3LSS A; 4U3J A; 4O4H B; 3D36 A; 3H1L H; 5LGT A; 1W59 A; 1S72 V; 3B77 A; 3CHX A; 1V54 C; 1AJQ A; 2CUG A; 3TJT A; 1SER A; 2R9R B; 3O9O A; 1HNZ B; 4UCS A; 2HG5 C; 2QTS A; 2RJZ A; 1J95 A; 4LFC B; 5IYZ B; 2X7R B; 2QM4 A; 2Z3Y A; 3JAW A; 4GLX A; 1FFX A; 5GTI Z; 4YHH B; 3CMA V; 2DQ3 A; 1BL8 A; 5B3S C; 1XNR B; 3R66 A; 1GM8 A; 2ZDI C; 2BE3 A; 4YJ3 A; 2JEU A; 2LO1 A; 2YEV B; 2X0L A; 5B1O A; 4PA6 A; 1HR0 B; 3JAT A; 2ZIN A; 2IJH A; 4NKG B; 3AG4 B; 2AGA A; 4EFB A; 2YIB A; 3RYF A; 1QVF U; 2NR5 A; 1IVS A; 2YSU B; 3WG7 B; 2LQT A; 2FYU H; 4DV6 O; 4FFK A; 2IJJ A; 3FB5 C; 5IJ9 B; 4JZ2 A; 2QWO B; 2F66 C; 3K0G A; 2EIN B; 1Q6U A; 2BTO A; 1PKX A; 3OR6 C; 1F4M A; 1WN7 A; 5LGN A; 4LF8 O; 4PA9 A; 2XAJ A; 3E35 A; 4R8C A; 2X6C A; 5EIB C; 4NR1 A; 4EB6 A; 4NB5 A; 3L73 H; 5IT9 N; 1LNQ A; 4K3A A; 4BIZ A; 3RYH A; 5CBG A; 4RQE A; 4B7K A; 1DF4 A; 5EZY A; 3OUF A; 1HNZ O; 2ITD C; 2UXN A; 4FLW A; 1SZT A; 5IYD O; 4IYI A; 1R73 A; 4I5S A; 1WPB A; 2Y69 B; 1J5E B; 3CCU V; 1KP3 A; 1WAZ A; 3DC5 A; 3HKD B; 3K5O A; 2WLL A; 4LFC O; 4MTX A; 5LHH A; 1BGY H; 5A2Q N; 2DOS A; 4X9Q A; 1L0N H; 1S5J A; 4YJ3 B; 4YHH O; 1KQS U; 2NNU A; 1WB7 A; 1XNR O; 2XT9 A; 1NU1 H; 3JAT B; 1RPO A; 4DV7 B; 4MW3 A; 3F5T A; 1VEW A; 3BRC A; 1JCH A; 3F7Y C; 2Q7H A; 3RVY A; 5LP6 C; 3P30 A; 1FKA O; 1HR0 O; 1IZ3 A; 5JH7 A; 3JCU Z; 4DR3 B; 1K9M W; 5FLX N; 2B9Z A; 4NVP A; 4ZBM A; 5GON B; 1PD3 A; 1V9P A; 3AG1 B; 1WP8 A; 3CRM A; 3G4S V; 3HB3 B; 4UFZ A; 1AP6 A; 2DYR B; 4NXN B; 5LA6 A; 2Q4P A; 2EIL B; 3OT7 A; 4UV9 A; 4JI3 B; 4IHJ A; 1BQ0 A; 4JAA A; 3BCC H; 3ETQ A; 4EB6 B; 5CA1 B; 2YIB D; 2ZIM A; 3GWK C; 1H8H G; 1KB9 F; 3JCZ A; 1TA8 A; 1OCO B; 3ABK B; 1XHZ A; 3BEH A; 1FXK C; 3OUS A; 1BCC H; 2Q0A A; 2QEX V; 2IH3 C; 4D7T A; 4TV9 A; 4DV5 B; 1JPX A; 1OJH A; 4I9Q A; 3F5W C; 4IIJ A; 4FM0 A; 2IU0 A; 2UUB B; 4LNU B; 3AEI A; 2DMX A; 2WLL B; 2AW9 A; 3G6B A; 1J5E O; 5DED A; 4RO2 A; 4XDJ A; 5KHK A; 5HFL A; 3VQV A; 1EN6 A; 3ZMT A; 1VQ7 V; 1XNQ B; 1VQO V; 4B3S B; 2IM9 A; 2ZE8 A; 5KUM A; 3T2M A; 4JAV A; 5BZB A; 1VF7 A; 3L74 H; 1GN4 A; 4WFG A; 4TUY A; 5H6Q A; 4DV7 O; 1Y76 A; 4LC1 A; 4B3T B; 1SC5 B; 3K08 A; 2XND G; 1SQX H; 2JK5 C; 4LWS B; 1DF5 A; 4NYK A; 4DR3 O; 3MD0 A; 3UCS C; 3FYE B; 3IGA C; 3BHP A; 3D3Q A; 1S5H C; 4PEL A; 4Z2W A; 2CH7 A; 5L3G A; 3BY6 A; 4NXN O; 4FLU A; 1JJO A; 4DUY B; 1Q6H A; 2HJF C; 4JI3 O; 3C90 A; 5FNV A; 4H37 A; 2BOC C; 1I7F A; 1ZAU A; 1FXV A; 4CS2 A; 4DV0 B; 4LH7 A; 3RYC A; 2OT5 A; 3W7T A; 5AG2 A; 4X20 A; 3L70 H; 1G6U A; 4DV5 O; 2UUB O; 5BMV A; 2EJ7 A; 1NS1 A; 2CGO A; 5LXT B; 3LDE A; 2GDS A; 1SQG A; 2ZR3 A; 1DGS A; 3UT5 A; 5IWA B; 3DXR A; 3ZMZ A; 3CC7 V; 1FAF A; 4K8Z A; 1SQV H; 2H3O A; 1PNK A; 3CJH A; 3ZHQ A; 1XNQ O; 5LP6 A; 4TUY B; 4YIO A; 4B3S O; 3JD4 A; 1QNM A; 1WA8 A; 2VQF B; 4NTX A; 4GX1 A; 1RP3 B; 2F95 B; 3OAA G; 3ZHS A; 1XOU A; 3B8N A; 4B3T O; 4I4T A; 3SR2 C; 5KX5 B; 4QPK A; 5JJN B; 1K4D C; 4PHZ A; 4JYA B; 2CH7 B; 2UXB B; 3RT3 C; 4JTA B; 1YCI A; 1AI7 A; 4GCZ A; 4YY3 B; 2F93 B; 3G80 A; 2H94 A; 2PF4 E; 2Q5Z A; 3JAL A; 2VS0 A; 3ZRW A; 4JAS A; 3KG2 A; 1ENV A; 2DWD C; 3ZMV A; 1Q6I A; 2CTW A; 4DUY O; 3RYC B; 4TQD A; 4G2K A; 2Q69 A; 3AG4 C; 3ABM B; 1R3J C; 1YVW A; 2ZCE A; 4OGQ B; 1MG1 A; 4WFB V; 2WA4 A; 4X20 B; 1GTO A; 4DV0 O; 5KLV H; 1V55 B; 4G28 B; 1WP7 A; 3WG7 C; 3H9V A; 4JI5 B; 1PV0 A; 4DO2 A; 3TET A; 4QNH B; 5D5Q A; 3KZI Z; 1KEC A; 3D36 C; 2QE7 G; 2EIN C; 1JX9 A; 3APQ A; 1M56 B; 1K97 A; 4X65 B; 2L35 A; 2P6J A; 4I55 B; 3BA9 A; 5IWA O; 1QLE B; 1Q43 A; 2HEP A; 3RWR D; 4P2Z A; 3ICX A; 1Y74 B; 2ZR2 A; 2ZXW B; 1EZJ A; 1P84 F; 2F1M A; 3FYI B; 3E22 B; 4ZHQ A; 4I4T B; 1Y6X A; 5A9G A; 2L6L A; 2VQF O; 3T4Z A; 2OTJ V; 2ZNI A; 2Y69 C; 4JYB A; 5EYP B; 3T1C A; 3AG2 B; 4UCR A; 2GHY A; 1S0V A; 2JDI G; 4I50 B; 2UXC B; 3ZED A; 2NLJ C; 1GO3 F; 4JYA O; 2UXB O; 1AB3 A; 2JIZ G; 4FM1 A; 5LGU A; 1JA8 A; 3X2Q B; 4TV8 A; 4YY3 O; 2ATK C; 3BVO A; 1B06 A; 1K5S A; 2LW1 A; 2JJ1 G; 1NKD A; 1XL4 A; 4MVM A; 1GH6 A; 4HNA A; 4NTW A; 4U7N A; 1GN2 A; 4EEQ A; 3WB2 A; 4K35 A; 4GX0 A; 4BWA A; 2N05 A; 1JR9 A; 2RNB A; 1JQ0 A; 3A0B Z; 2FL4 A; 4YXW G; 1YHQ V; 2UXX A; 4O4L A; 2AHZ A; 2QTO A; 4DR4 B; 3AG1 C; 2RQ6 A; 2KG7 B; 4LP8 A; 2BTQ B; 1JFF A; 1BHB A; 3ZHV A; 5F2V O; 2JJ2 G; 4JI5 O; 2DYR C; 4DR5 B; 1NBM G; 2NN4 A; 4PD4 F; 3U11 A; 2EIL C; 2P4V A; 4JTD B; 3CCL V; 1NJI W; 5LMN B; 1IBL O; 4O4H A; 5KMG B; 2Q6A A; 1AI4 A; 4JYY A; 1EN5 A; 4X65 O; 1FFT B; 2ADQ B; 2QKS A; 4FK5 C; 4FVM A; 4X1I B; 2UUA B; 1OCO C; 3ABK C; 4ZHQ B; 5KA6 A; 2LFS A; 1P7B A; 3OFN G; 1SES A; 2Q7G A; 3U10 A; 4Z1V A; 2DN9 A; 1VIB A; 4DXW A; 3JSL A; 2HVK C; 4AQY B; 4PV1 B; 2Q67 A; 5IYZ A; 4UB6 Z; 4F6R B; 4ZI7 B; 2PYL A; 3BPZ A; 2PZS A; 1DK1 A; 3GVM A; 2YID A; 3P3N A; 2FTK A; 2XAS A; 1N4C A; 4X1K B; 5L3B A; 2KSD A; 2UXC O; 2WLH A; 3APO A; 5B5E Z; 3VQW A; 3S3W A; 3CC4 V; 2KKW A; 4HNA B; 2YEV A; 5K1P A; 5B1B B; 5JCO A; 3G6E V; 4KHP B; 4CC6 A; 1YIJ V; 1PP9 H; 5D5P A; 2AZ0 A; 5EBM C; 4LR3 A; 3RVZ A; 3CCR V; 4TT3 G; 3W7W A; 1VQP V; 1JJ2 U; 3I55 V; 2UUC B; 1JOY A; 2WWW A; 3NXS A; 3H1J H; 5IJ9 A; 1YI2 V; 4DR4 O; 3N27 A; 4WCE V; 1AIL A; 1I5X A; 1O9H A; 2QKA A; 1S5L Z; 1OCZ B; 1OCC B; 5B1N A; 1W0K G; 2EBO A; 4DR5 O; 3B09 A; 3TK1 A; 1QVG U; 3QF7 A; 5LMN O; 3T1H O; 3D3I A; 4DR7 B; 3H1I H; 2OIE A; 3THO A; 1AI5 A; 3CB2 A; 2Q8V A; 2WPD G; 3E86 A; 3MHS C; 1TGO A; 2FB5 A; 3CXC U; 1K3E A; 4I9W A; 5KHJ A; 3L72 H; 2UUA O; 2QKC A; 1AJN A; 2C2A A; 3C3T A; 3E8H A; 3B8M A; 2ZE5 A; 3RW0 A; 4JTC B; 1N34 B; 1H2M A; 2WLI B; 1PL0 A; 4EFE A; 3HKD A; 5DM6 V; 4GX2 A; 3STZ C; 1ZL8 A; 4X62 B; 4ZIB A; 2YI9 A; 2A9H A; 1XDC A; 1VQ4 V; 1NR7 A; 4LFB B; 1S3J A; 1FPO A; 5H5N A; 4O2B A; 5KHG A; 3OTF A; 1MMM A; 3CCQ V; 4BW5 A; 2WLM A; 1YJ9 V; 2YXY A; 4X1Y B; 1U96 A; 3UKM A; 1ZLZ A; 1Q7Y W; 3P32 A; 3IC9 A; 4KHP O; 2ZNJ A; 5GON A; 1THZ A; 5EK0 A; 4IYH A; 4EKW A; 3UM7 A; 2CDY A; 2IH1 C; 2UUC O; 2Q68 A; 1KMI Z; 4BAY A; 3N2G B; 2EZO A; 2Y0P A; 1AI6 A; 5CA1 A; 4P9P A; 3CXH F; 1HDJ A; 1UPG A; 5DN6 G; 4DR7 O; 1BSM A; 1ROP A; 3A0H Z; 4ICG A; 3SGI A; 3KKY A; 5GW7 A; 1WNS A; 3ABM C; 2X6B A; 3CS5 A; 2P7T C; 2QWP B; 4GT1 A; 1PNM A; 4LNU A; 3E83 A; 3SYP A; 1FS0 G; 1TUB B; 1V55 C; 1QCE A; 2EJR A; 2ZIO A; 2D2C B; 1KD1 W; 4ASU G; 1GM7 A; 1ZL8 B; 1N34 O; 3PN1 A; 1B3Q A; 1VQL V; 3TGU H; 3I5D A; 1SQQ H; 2VWJ A; 4FM2 A; 4X62 O; 4O2B B; 5CA3 A; 1M56 C; 3K9S A; 1Q81 W; 4MVU A; 4LFB O; 2YUA A; 4G27 B; 5TIS Z; 4F4L A; 4CS3 A; 3B40 A; 2LP7 A; 4DV3 B; 2HHH B; 1Y66 A; 2ZXW C; 3K59 A; 1RPR A; 4LWS A; 4PDR A; 1LR1 A; 1HWY A; 4QJF B; 5H2F Z; 2CTQ A; 2ITC C; 4MSW C; 1Q82 W; 3AG2 C; 1W0J G; 3E8F A; 3ZRX A; 1KYO F; 5C8Y B; 2DQ0 A; 2Y4U A; 4LF7 B; 3ZCC A; 2B1G A; 1A32 A; 4UB8 Z; 2DWE C; 3X2Q C; 1VP7 A; 5KAF Z; 2M6Y A; 1VAR A; 3JD0 A; 2EIK B; 1MZE A; 4TOI A; 3UO3 A; 2A7W A; 3I56 V; 3ZMU A; 5IDJ A; 2P06 A; 2OIG A; 1XHX A; 5EBL C; 3E8B A; 4HYO A; 1YJW V; 4B3R B; 3A8T A; 1BQZ A; 2JEX A; 3C3S A; 2E74 B; 3H1K H; 1YTF B; 1NT2 B; 4GUN A; 5LXT A; 4TWK A; 5FPO A; 1Q90 D; 4UV8 A; 3QVN A; 4WF9 V; 3RN4 A; 4YJ2 B; 4Q6G A; 1R3L C; 1URF A; 3W7U A; 2LW7 A; 3OW2 U; 2YC0 A; 3JAM N; 1AJP A; 4WBN B; 2QWN B; 2YXH A; 4H44 B; 3OE7 G; 3M7M X; 5J9P C; 4DV3 O; 3CD6 V; 2A06 H; 2B1I A; 2WLK A; 5KX5 A; 4W4K A; 3TXS A; 2M7W A; 1YTF D; 2IBZ H; 3JD2 A; 4J9Y B; 2Y0I A; 1ZSP A; 1EZV H; 3HKE A; 3ASN B; 1G4Y B; 1XEQ A; 3FFQ A; 1IXB A; 3FX7 A; 3M8A A; 4N23 A; 2OCH A; 2RN9 A; 1WJZ A; 2JS3 A; 2H8P C; 4LF7 O; 1PM9 A; 3K5N A; 2FKX A; 3LUT B; 2WSS G; 5KA5 A; 1GMG A; 1EM1 A; 1QR9 A; 1HNW B; 3QG5 A; 4U3F H; 3K57 A; 4FIP C; 1SA0 B; 1L8D A; 5B1B C; 2HR3 A; 2HFE C; 4PA4 A; 5IY5 B; 3K58 A; 1GN6 A; 2Q0O C; 4UVB A; 1UFI A; 3OMN B; 1R3K C; 1SZX A; 5L3F A; 4JI8 B; 2IJK A; 3ZHU A; 1M4U A; 4B3R O; 1WB8 A; 1P7G A; 1I08 A; 2R9A A; 2RMK B; 4JI2 B; 1H38 A; 1OCZ C; 1OCC C; 4I55 A; 4J10 A; 1M93 A; 3UQ8 A; 2MK3 A; 4B3M B; 3SPJ A; 1Y74 A; 3OGC C; 1YIT V; 4LF9 B; 2KB1 A; 1N32 B; 3QO8 A; 3E22 A; 1S77 D; 3CCE V; 2AXT Z; 1OCR B; 1QHT A; 2XUM A; 5CMU A; 4AHC A; 1KKC A; 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