The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
94
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structure length |
94
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Chain Sequence |
GSSGSSGMALEQTLKKDWYSILGADPSANMSDLKQKYQKLILLYHPDKQSADVPAGTMEECMQKFIEIDQAWKILGNEETKKKYDLQRSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Soluiotn structure of J-domain of mouse DnaJ like protein
rcsb |
| molecule keywords |
1700030A21Rik protein
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| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
14
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| structure length |
94
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| sequence length |
94
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-29 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QWR B; 2CTP A; 2KQX A; 1FPO A; 3BVO A; 4RWU A; 2CTQ A; 4J80 A; 2M6Y A; 2QWN B; 2PF4 E; 2QWO B; 1XBL A; 2GUZ A; 2CTW A; 2L6L A; 2LO1 A; 1N4C A; 2N05 A; 3AG7 A; 2QSA A; 2CUG A; 2EJ7 A; 1GH6 A; 2QWP B; 3UCS C; 1FAF A; 4IT5 A; 2N04 A; 1BQ0 A; 2GUZ B; 2YS8 A; 3APQ A; 1NZ6 A; 2QWQ B; 4J7Z A; 2Y4T A; 1BQZ A; 1WJZ A; 1IUR A; 2YUA A; 3UO3 A; 2Y4U A; 3UO2 A; 2DN9 A; 3APO A; 2OCH A; 1HDJ A; 2DMX A; 2CTR A; 2LGW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JFF A; 5LOV A; 4X64 B; 1B3Q A; 1KP2 A; 2FYU H; 1XDC A; 4U7N A; 5JCO A; 4DRX B; 2JJ2 G; 2YSU B; 5DN6 G; 2ZKO A; 4JV5 O; 1AI5 A; 2ADQ B; 2EIL C; 2CDY A; 1GTO A; 2PTM A; 2GHY A; 3QG5 A; 5EIB D; 1FJG O; 2Y4U A; 4BR6 A; 1Y4M A; 1EM1 A; 3T1H O; 4LF9 B; 2CTP A; 3AG3 C; 2AXT Z; 4O4L A; 2GUZ A; 2ZDI C; 1I7F A; 4K0K B; 2W6J G; 5LXT B; 1OHH G; 1VF7 A; 4B3R B; 1VEW A; 4DR7 O; 1SQV H; 4FFK A; 2RDC A; 2YUA A; 3CCM V; 1KBH A; 2HFE C; 1K4C C; 5J2U B; 3G6E V; 4LC1 A; 2K9P A; 4LH6 A; 4NTX A; 4QPK A; 4J9Z B; 4BWA A; 4DV2 B; 4CS3 A; 1R3L C; 3CCV V; 5KHI A; 3AK1 A; 3RWR D; 1SQB H; 1IBL B; 3W7X A; 3W7W A; 3W7U A; 1E79 G; 1FXK C; 3OAA G; 4P9P A; 1T5E A; 3WFV A; 5LP6 A; 1XNQ O; 3WG7 C; 5CA1 A; 1BQ0 A; 3T4Z A; 3U10 A; 1K34 A; 2YXH A; 2BE3 A; 4DUZ O; 1Q86 W; 3TK1 A; 2QKC A; 2QM8 A; 4X65 O; 3WB1 A; 5J2T A; 3K04 A; 4WBN A; 2BSK B; 5EBW C; 3AG4 B; 1XOU A; 3FB5 C; 1XNR O; 3JAS A; 4NR1 A; 2Y69 C; 1IXM A; 2ZE5 A; 4GX5 A; 4TQF A; 3S3X A; 3CCL V; 1US6 A; 1N4C A; 1FAF A; 1GH6 A; 1YZB A; 2C2A A; 5IWA B; 5BXZ A; 1L8D A; 4R50 A; 3RW0 A; 2WLN A; 3DSQ A; 3ZJZ A; 2LW7 A; 4MTX A; 4DR1 O; 4X1K A; 2XAG A; 1TUB B; 2EZP A; 1H2L A; 2XAQ A; 4PJ0 Z; 3CMA V; 5GON A; 3B8M A; 3SDL A; 5KUK A; 5CA3 A; 3D36 C; 1SC5 B; 1GM8 A; 1ZSP A; 3ABL C; 3K03 A; 4AQY O; 3D3Q A; 4UVB A; 4NXM B; 2Z5U A; 3JCU Z; 2BOB C; 1KEC A; 2H94 A; 2Z0A A; 3CRM A; 2ZDI A; 4JI7 B; 4YIO A; 4WFG A; 1JR9 A; 4LF6 B; 3CHX A; 1RSO A; 3ZRW A; 4F6R A; 2ZD9 A; 5IJ0 B; 1KMI Z; 1RP3 B; 3MD0 A; 1PV0 A; 2PYJ A; 4ZOL B; 3T1H B; 1F4M A; 4TQD A; 5B1A B; 1RPO A; 2DWD C; 4P9O A; 4KHP B; 4JF3 A; 4GX1 A; 2Y4T A; 4WCE V; 3ETQ A; 5CB4 B; 1EN4 A; 1WAZ A; 1KB9 F; 2YI8 A; 5IYC O; 1R3J C; 2Q0O C; 3G71 V; 2Q7H A; 1DF4 A; 4R8C A; 4DR4 O; 3B4S A; 5EYP A; 1DTO A; 3DGE A; 3FB6 C; 1OJH A; 4FM0 A; 2X6B A; 1AP6 A; 2FB5 A; 3RGB A; 2HG5 C; 1U96 A; 4LCU C; 2DYR C; 1THZ A; 2YI9 A; 4DR5 O; 1UJW B; 4IIJ B; 1FXV A; 2ETN A; 3H1I H; 2PZS A; 4Q6G A; 3BA8 A; 3K59 A; 4CH6 A; 1VMG A; 2RJZ A; 4DV0 B; 4U3J B; 3L70 H; 3E2E A; 4EB6 B; 2W0X A; 2HEP A; 2ZR2 A; 5CBG A; 1OV9 A; 1VQ5 V; 2ZIM A; 1H2N A; 3UQ8 A; 5DM6 V; 4DW1 A; 1KC8 W; 2WLI B; 3I56 V; 3AG1 B; 4RUF A; 1WJZ A; 1EN5 A; 1IX9 A; 4P2Z A; 1URF A; 4I0X A; 3CJH A; 2VWJ A; 2OT5 A; 1VAR A; 1R3K C; 1H2K A; 3D36 A; 4I55 B; 4YJ2 A; 2L35 A; 1QVG U; 2QSA A; 4R7C A; 4OGQ B; 4Z1V A; 4X66 O; 4DR6 B; 3E89 A; 2XAS A; 4IYH A; 2WA4 A; 5LMN O; 4NVP A; 2RQ6 A; 1TAE A; 3ASN C; 1NBM G; 3FYI B; 5TIS Z; 1S77 D; 4TV8 A; 3TET A; 3CXH F; 2EJR A; 3GWK C; 3BVO A; 3R66 A; 4O2B B; 4J80 A; 2JEU A; 3H1K H; 2XAH A; 4BIZ A; 2LO1 A; 2ZM6 B; 5LHI A; 1ZTE A; 5FNV B; 2P4K A; 2JS5 A; 3LNM B; 2OIE A; 3AG2 B; 1MSD A; 4TSF G; 1WPX A; 1KYO F; 2YIC A; 3JSL A; 4UXN A; 1GM9 A; 5EC2 C; 1Q6I A; 3ML0 A; 5L3E A; 3RYC A; 1BE3 H; 1HWY A; 4PDR A; 4ZBM A; 3F7V C; 2YXY A; 4YHH B; 2Q7E A; 1MOF A; 4JI3 B; 3Q4H A; 5JH7 B; 4F6E A; 4JI6 B; 2OYQ A; 3B40 A; 4DUY O; 3UT5 A; 1N36 B; 1XEQ A; 4GKJ O; 4QNH B; 1FFX A; 2IU3 A; 1PKX A; 2QDO A; 1AP5 A; 3RN4 A; 3WB0 A; 4LF5 B; 5K1X A; 1LUV A; 4DV4 O; 3STZ C; 2Q4P A; 1MSW D; 1YF2 A; 2IJK A; 3P3N A; 2V7Q G; 4RUE A; 3ZBH A; 1I08 A; 2OCC B; 3OR6 C; 1VQN V; 2WLM A; 4X1I B; 5H9C A; 1R6K A; 3T1Y B; 3K9S A; 1J95 A; 3OGI B; 5ITZ A; 3BAA A; 4LFA B; 2VQE O; 1K3E A; 1R6N A; 3TCU A; 1IBM O; 2HKO A; 2F43 G; 4G28 B; 1M9N A; 4PHZ A; 4WFB V; 5IYB O; 1EFR G; 3SYQ A; 1PL4 A; 1Z5V A; 3CCS V; 2WLL B; 3HKE A; 1ZLZ A; 2DN9 A; 2AHZ A; 1SRY A; 2B9Z A; 3JAT B; 3D8C A; 3STL C; 3W7T A; 1WA8 A; 4GZR B; 3N2G B; 4JTD B; 4JYA O; 2YS8 A; 1PNL A; 1NZ6 A; 4MVS A; 1NH2 D; 3HKC B; 4J41 A; 2X6A A; 1V55 B; 1WNS A; 1OCZ B; 5E1A C; 3K3W A; 4IGG A; 2VS0 A; 2ZE8 A; 1Q82 W; 2OWO A; 1VQ6 V; 2YEV A; 1NTK H; 4LF7 O; 4WF9 V; 4DV6 O; 1GAX A; 4DV7 O; 1XBL A; 4D7S A; 4BIU A; 1AJN A; 3JD3 A; 4BW5 A; 1LUW A; 1O9H A; 1A32 A; 2LP7 A; 4MVQ A; 4OPA A; 1QCE A; 3CX5 F; 4NXN B; 4ABM A; 3H1H H; 1SS3 A; 1YCI A; 5L3F A; 3HKD A; 4LWS A; 1YJ9 V; 2CUG A; 5L3B A; 3BRC A; 2YC0 A; 4YY3 O; 1BGY H; 4JI2 B; 1HNX B; 2DOS A; 2VWK A; 5B1B C; 3KCY A; 2QE7 G; 1W59 A; 4KP4 A; 3RBZ A; 4ZHQ B; 3W7S A; 3LDE A; 2KSD A; 1Y74 B; 5IY5 C; 1NTZ H; 2Y48 A; 1AI7 A; 4O2A A; 2Q8V A; 4LNU A; 5L3C A; 2PF4 E; 4PA7 A; 3DTU B; 3FAV A; 1R1B A; 4NTY A; 3ABM C; 2AGA A; 3CXC U; 3R65 A; 1OCC C; 1D5A A; 4X1Y B; 4HNA B; 1VQL V; 2ILM A; 5EIB C; 1GN4 A; 2FTK A; 2DMX A; 4J9Y B; 2E75 B; 3ETD A; 2HLD G; 4DR3 B; 3ZMZ A; 2P5O A; 2YXL A; 3JYC A; 1EN6 A; 3G80 A; 1XL4 A; 3DXR A; 2VQF O; 4DV5 O; 1EZV H; 2CH7 A; 3RYF B; 4GUN A; 4X20 B; 4I7Z B; 1K7D A; 1NS1 A; 2R72 A; 3NR7 A; 1L1F A; 3F5W C; 1N32 B; 3TXS A; 1BT8 A; 2QKS A; 3CP1 A; 2JS3 A; 3RFR A; 3SPH A; 1NI8 A; 2KQX A; 4FLT A; 5IYD O; 3JAL B; 2L6L A; 3DC5 A; 1AIL A; 4Q20 A; 5KAF Z; 1BSM A; 1SQP H; 1ARO P; 2P6J A; 1H2M A; 2PYL A; 5J9P C; 4QIW F; 4UCT A; 3C3T A; 3TXQ A; 3RYI B; 2Y0I A; 2HHH O; 3JAR A; 1M1K W; 3RVZ A; 2UUC O; 5FL7 G; 3B2E E; 2LQT A; 1NKD A; 4I4T A; 4KL1 A; 5KHJ A; 1K8A W; 1JFF B; 3H9V A; 4FLW A; 1Z5W A; 3C3S A; 3LSS A; 5LBQ A; 5B1O A; 2ZIO A; 3L71 H; 3CCE V; 2XHB A; 2QEX V; 4GCZ A; 1BQZ A; 4KXR A; 4EFB A; 4BIO A; 1HNW O; 5FLX N; 4JPR A; 2X6C A; 4FM1 A; 4ASU G; 4L87 A; 1F7Y A; 1SER A; 3CWB H; 2GUZ B; 1KP3 A; 1MZE A; 4YY3 B; 3ZHV A; 1M4U A; 2X0L A; 1SZX A; 4B3S O; 4TT3 G; 4MVZ A; 4EEQ A; 5IYZ A; 3FB8 C; 4PDV A; 3D3I A; 4DR2 O; 3BEH A; 3E22 A; 3AG4 C; 4JZG A; 2E74 B; 5KX5 B; 2IJH A; 5LGU A; 2ZNJ A; 2P4V A; 1E1Q G; 3BCC H; 4G2K A; 3JAW A; 5C8Y A; 4IHJ A; 2MK3 A; 2IJI A; 2DYS B; 3SYP A; 2RNB A; 1ZL8 B; 1K92 A; 3OEE G; 3MHH C; 3CPW U; 2IM9 A; 2UU9 B; 1N33 B; 1JCH A; 4NB5 A; 3E86 A; 5EC1 C; 4HBN A; 4EFE A; 2YIB D; 3AK3 A; 4B7K A; 2EIK B; 4DW0 A; 1YHQ V; 5DEC A; 1HP8 A; 1SKV A; 2GTA A; 1Q90 D; 4DXW A; 5J2T B; 4WBN B; 2QM4 A; 4LH7 A; 4TV9 B; 1H8H G; 3S3W A; 1SA0 B; 3F7Y C; 2UXB O; 2A79 B; 2UXC O; 3K0D A; 1R73 A; 4B3M O; 4PEL A; 3SR2 C; 5BR8 O; 3TGU H; 1OCO C; 3X2Q C; 5JQG B; 4JGS A; 5B1A C; 3CC4 V; 2HHH B; 3HB3 B; 2IH1 C; 4W4L A; 3N2K A; 4KUM A; 1FPO A; 2CTQ A; 4JI0 O; 2NR5 A; 1U97 A; 1B04 A; 4CH5 A; 5GON B; 2CGN A; 2BCC H; 4GX0 A; 4E2L A; 3FFQ A; 5JWP A; 3LUT B; 3M99 B; 3ZHR A; 4PI0 A; 2Y0P A; 1IUR A; 4DO2 A; 3ZRW B; 5KHK A; 1KD1 W; 5LMU O; 1KU9 A; 1AI4 A; 3ETE A; 2XAF A; 3SJC C; 4CZZ A; 1HR0 B; 1FYJ A; 2B1I A; 4PA4 A; 3CD6 V; 2QWN B; 4IL6 Z; 1P49 A; 5BMV B; 2QTO A; 1S5L Z; 1K5Q A; 1GO3 F; 4JAU A; 4IT5 A; 4NYK A; 2AZ2 A; 1HNZ O; 1QQC A; 3L73 H; 5LHH A; 5CA0 A; 3A2F A; 4JV5 B; 1FFT B; 1Y6X A; 3UO3 A; 4O4J A; 1FJG B; 1G1X B; 2JVD A; 3OEH G; 4J11 A; 1AB3 A; 2D2C B; 3ZMV A; 5LHG A; 1Q43 A; 1G8M A; 3QO7 A; 4X8A A; 3T2M A; 2QKA A; 1TUB A; 1XRE A; 4DR7 B; 2O57 A; 3OR7 C; 3KZI Z; 1I94 O; 1DK1 A; 3K08 A; 4OPH A; 1VQK V; 3CYO A; 1GN2 A; 1Q6U A; 3CCR V; 1MA1 A; 3H1J H; 2HJF C; 1QU7 A; 3ASO B; 4B3T O; 2Q7G A; 1FXK A; 4UUJ C; 3THO A; 3ZRS A; 5EBM C; 3OM3 B; 2CAZ C; 1GM7 A; 3HKB B; 2CGO A; 1E1R G; 1Q6H A; 4L8J A; 1Y66 A; 5B66 Z; 4K8X A; 4CS2 A; 2IU0 A; 2AZ0 A; 2HVJ C; 3ABL B; 1XNQ B; 1IDS A; 2LFR A; 4DUZ B; 4I9W A; 3CC7 V; 2A9H A; 1Y76 A; 4X65 B; 4FLY A; 1VQ8 V; 4PDL A; 4K35 A; 4JYC A; 2OIG A; 4YJ3 B; 4TV8 B; 1XNR B; 3SYO A; 2EIM C; 1O9G A; 3FKS G; 2ZCE A; 1TVK A; 1X4T A; 2GTS A; 3OMA B; 4JI1 O; 1M90 W; 5LL6 Y; 3QNE A; 4MW3 A; 2R9I A; 5LYJ B; 1TGO A; 1YJW V; 2ODM A; 3K58 A; 5B1N A; 4ZI7 A; 4DR1 B; 3SJA C; 3DC6 A; 1K97 A; 4MT8 A; 3CS5 A; 3RYC B; 5EZY B; 5KLV H; 2OCC C; 1AJQ A; 2WLH A; 2WLI A; 3SGI A; 3HR0 A; 3ZN1 A; 4FLV A; 4AQY B; 1RM1 B; 3JD2 A; 4FZ1 A; 1P84 F; 2HP8 A; 3CB2 A; 2R9A A; 3P3P A; 3CC2 V; 1IVS A; 2UUB O; 2BTQ A; 2DYR B; 1MAB G; 1N8R W; 2K1E A; 2ZXW B; 4I9Q A; 4YXW G; 4LF4 O; 2LFS A; 1SQG A; 5IDJ A; 4LF8 O; 4B08 A; 4UFZ A; 1IBK O; 1YIT V; 1D2D A; 3LSU A; 3E35 A; 3EXA A; 4J42 A; 1GMG A; 2E3C A; 1Z2G A; 2EX3 A; 4OX9 O; 5KHH A; 1BL8 A; 2WSS G; 5B3S B; 3ABK B; 4QE9 A; 4DV3 O; 4AI8 A; 4DR4 B; 1Q81 W; 3PN1 A; 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4DV4 B; 4DV3 B; 2Z3Y A; 3ABU A; 2WPD G; 4QGP A; 4MVR A; 4O4I B; 3DXR B; 3OD4 A; 4GLX A; 1CP9 A; 1F23 A; 3L75 H; 4LF9 O; 1PPJ H; 2RN9 A; 5H5N A; 1B06 A; 1V54 B; 3JD1 A; 3B09 A; 3CRA A; 4BW9 A; 4K0K O; 2W6I G; 4UCU A; 3U11 A; 2VQE B; 4TUY A; 1DF5 A; 2QWP B; 1IBM B; 2Q69 A; 3TJT A; 3ZMS A; 4ZHQ A; 4B3R O; 2Q68 A; 1NVP D; 2P06 A; 1Y74 A; 3MDS A; 4DK1 A; 3T4D A; 5KUM A; 5H6Q A; 4UVC A; 5IJ9 A; 1XL6 A; 2H3O A; 3P32 A; 4D6T H; 1XHZ A; 1NJI W; 1VP7 A; 2CTR A; 2N74 A; 5EK0 A; 3JAR B; 1QVF U; 1F4N A; 2ITC C; 4QJF B; 4MS2 A; 2Q9L A; 1CPY A; 3VBB A; 4XDK A; 3U0Z A; 4DV2 O; 4I4T B; 3A8T A; 3IC9 A; 3OT7 A; 2JK5 C; 4G27 B; 1YEW A; 1TA8 A; 3K06 A; 4O4H B; 4JYA B; 1IBL O; 1CXZ B; 3ZHU A; 1H38 A; 4JI8 O; 5D5Q A; 2AHY A; 1M56 B; 4PDM A; 2A0L A; 1F51 A; 3K57 A; 2CTW A; 5LOV B; 4DV6 B; 4LF7 B; 4DV7 B; 3J81 N; 4X20 A; 4I50 A; 5FPO A; 3J80 N; 1UPG A; 3ABM B; 3RYH A; 2DYS C; 2ZQM A; 4MTO A; 3BFR A; 2Q67 A; 1L0N H; 3LSQ A; 3A0H Z; 4UV8 A; 2RMK B; 4MVO A; 5FPR A; 3E8B A; 3JAL A; 4MVM A; 2EIN B; 3A0R A; 2QWR B; 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