The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
LGLERDVSRAVELLERLQRSGELPPQKLQALQRVLQSRFCSAIREVYEQLYDTLDIT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A unified assembly mode revealed by the structures of tetrameric L27 domain complexes formed by mLin-2/mLin-7 and Patj/Pals1 scaffold proteins.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
lin 7 homolog b
|
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
22
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| chains with identical sequence |
C
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | L27 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y74 B; 1ZL8 B; 3B40 A; 1VF6 A; 1RSO B; 1Y76 A; 1VF6 C; 1Y74 A; 1ZL8 A; 1Y76 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DV6 B; 4LFB O; 2P67 A; 3CCM V; 4AQY B; 2X6C A; 4GKJ B; 4DRX A; 2VWK A; 4DUY O; 1X59 A; 4I50 A; 1I5X A; 5GTI Z; 4UCT A; 4Z1M G; 4DV5 B; 4UCR A; 2XT9 A; 4RUE A; 3A8T A; 2FML A; 2H8P C; 1BE3 H; 3IFX A; 3N2G A; 3H1K H; 2UXB B; 1Q82 W; 4FLV A; 1VQL V; 3CRQ A; 4ABM A; 5LGN A; 1URF A; 1EZV H; 3QVN A; 3FYE B; 4QGP A; 1S5L Z; 3K59 A; 2P06 A; 1K3E A; 1U96 A; 4UV9 A; 5AG2 A; 1KD1 W; 1NR7 A; 4ZHQ A; 2IM9 A; 2DYS B; 4CS3 A; 1N34 O; 4DR1 O; 4KHP O; 1AP6 A; 4ICG A; 1Q90 D; 2WA3 A; 1I94 B; 3JAR B; 1VQ8 V; 5ITZ B; 4O2B B; 1ZSP A; 2AGA A; 5LGT A; 1V54 B; 2RJZ A; 4FM2 A; 1AI5 A; 3RVY A; 4DV3 B; 4YJ2 A; 1EN5 A; 1WLE A; 2DE0 X; 3D8C A; 5A2Q N; 4LH6 A; 1K33 A; 2P22 C; 3ZN1 A; 3NXS A; 1NTZ H; 3QTC A; 3HKD A; 1BSM A; 1YXB A; 4FMT A; 4DRX B; 1KKD A; 3ABU A; 4I50 B; 2CAZ C; 2PI5 A; 4L8J A; 1KYO F; 4GCZ A; 3QF7 A; 4JYA B; 1QU7 A; 4TOI A; 1VF6 A; 5H5N A; 2W0X A; 3N2G B; 1EN6 A; 3LDD A; 1HR0 O; 1YVW A; 2ARH A; 3CCR V; 2BE3 A; 3CD6 V; 4FZ1 A; 2Q9L A; 1HWY A; 3LUT B; 1HNZ O; 3ICX A; 4X8A A; 3ZN0 A; 3E35 A; 2V4D A; 3OE7 G; 5B1B C; 4ZHQ B; 2OCC C; 1GMG A; 2CGO A; 2QWR B; 3CYO A; 3IAY A; 2JEU A; 4MW8 A; 2NN4 A; 3G6E V; 3SPH A; 4U3F H; 1JCH A; 5DM6 V; 2EIN B; 1BHB A; 3ZHU A; 3HKB A; 2WAM A; 3WU2 Z; 5DED A; 4LF9 O; 4YJ2 B; 2JRI A; 4YY3 O; 4B3T O; 4YIP A; 3G67 A; 5CA3 A; 4J10 A; 3RGB A; 2UUB O; 3AG7 A; 3HKD B; 3ABK B; 5JQG A; 2HHH B; 3STZ C; 1Q86 W; 1MZF A; 4JV5 B; 3H1L H; 3H1H H; 1ZX3 A; 5GTH Z; 5L3D A; 1SES A; 3AG1 B; 5LHI A; 3SJA C; 4DR7 O; 1ZWI C; 1VQ4 V; 4LFA B; 5L3F A; 4D7S A; 3DGE A; 1JJ2 U; 4A5U B; 3E2E A; 1AI6 A; 1US6 A; 5LYJ A; 1N32 B; 2E3C A; 1Q8I A; 4FLW A; 2HKO A; 3G80 A; 1HNX B; 1H8H G; 5LHH A; 2AW9 A; 4J7K A; 5JH7 A; 2A06 H; 4GX1 A; 1Q6I A; 3W7X A; 3FAV A; 1S5H C; 3I56 V; 1MAB G; 1WB7 A; 3J7A U; 1GTO A; 4LC1 A; 1GO3 F; 5LOV A; 3CMA V; 3K03 A; 3SJQ C; 3JD4 A; 4LWS A; 5BMV A; 4B3M B; 4XDK A; 4Q6G A; 1JMK C; 3HKB B; 4JI3 B; 4YHH B; 3CCJ V; 1VIB A; 3E83 A; 4W4K A; 2AZ0 A; 4CS2 A; 1XNR O; 1LUV A; 5JQG B; 1R6K A; 1F7Y A; 1FPO A; 1GM8 A; 3M8A A; 2ADP A; 1KUQ A; 1JA8 A; 1IUR A; 2CTW A; 4HAM A; 3K9A A; 3O65 A; 4B3R O; 2R72 A; 4QE9 A; 4JI4 O; 1VQ5 V; 1D5N A; 3L9D A; 5IDJ A; 3AG3 B; 2Q68 A; 1M57 B; 1FKA O; 4Z2W A; 4UFZ A; 1R1B A; 4K35 A; 1TVK A; 3M7M X; 2XAJ A; 1G1X B; 5LYJ B; 5KHK A; 1Q43 A; 2X6A A; 4RWU A; 1G8M A; 3P3N A; 2RNB A; 4F6R A; 1NS1 A; 5EK0 A; 5JJJ B; 3UO3 A; 3JAK A; 5JH7 B; 5L3G A; 2OTJ V; 1PPJ H; 5IY5 B; 3FAV B; 4NYK A; 2A79 B; 3HB3 B; 3ABL C; 5LOV B; 4LWS B; 1JVM A; 5BMV B; 1JFF A; 5D5Q A; 2H94 A; 3CEI A; 1OCO B; 4LNU A; 3D3I A; 4GUN A; 2B5U A; 4B7K A; 1OCC C; 1N36 O; 3DC5 A; 2YXL A; 2EIM B; 2GTS A; 3QO7 A; 2M7W A; 3QO5 A; 5EYP A; 1YJW V; 1H2M A; 4HZ3 A; 2DWD C; 2Y69 C; 1QR8 A; 3K9S A; 2PY5 A; 3SPC A; 3WG7 C; 4DK1 A; 4LBE C; 4RAI A; 1YSC A; 2XHB A; 4JI2 O; 4G2K A; 1F4M A; 1XL6 A; 3R66 A; 4LF7 O; 2R9A A; 4DR3 B; 1NZ6 A; 3TET A; 5LMU B; 1UFI A; 2PF4 E; 4D6T H; 1SER A; 2X0L A; 3OAA G; 4BAY A; 4MVM A; 1TVK B; 3SPG A; 1VQN V; 1VP7 A; 3E22 A; 2Q5Z A; 1XMQ O; 1BQZ A; 1N0N A; 3E8G A; 2XAG A; 4F6R B; 2QKA A; 3CSX A; 4JAU A; 4DUZ B; 3LNM B; 3JAK B; 4IHJ A; 2V1D A; 1XUQ A; 4EFB A; 4DV2 O; 1V55 B; 4FIP C; 2QSA A; 4ZOL A; 2DWE C; 3RVZ A; 4X88 A; 4OX9 O; 1JFF B; 2HJF C; 2DN9 A; 4LNU B; 1NR1 A; 3W7U A; 1L0L H; 5B1N A; 3OUF A; 4DV1 O; 1F4N A; 1GKF A; 1SET A; 3JAL A; 2DOS A; 4P9P A; 5CB4 A; 1GN4 A; 4IIJ A; 1KEC A; 1KKC A; 3LDE A; 4DV0 O; 5EYP B; 1YF2 A; 3CP1 A; 4JI0 O; 4MVZ A; 1Q6U A; 5IWA B; 4HYO A; 4WFA V; 3AG2 C; 1XEQ A; 2WLH A; 5KMG A; 3H1I H; 4QPK A; 5DEC A; 1Q5O A; 4MSW C; 1GM7 A; 4WF9 V; 3FKS G; 4X65 B; 2UUA B; 3SR2 C; 4LF5 B; 1IXB A; 4JI6 O; 2YSU B; 1H38 A; 4F4L A; 2Q0O C; 1Y6X A; 5E79 Z; 2ZDI A; 3E22 B; 4EKW A; 2P4V A; 2M6Y A; 1SQF A; 1Z5W A; 2ITD C; 4P9O A; 2EIN C; 3MHS C; 1RPR A; 4JI7 O; 4DO2 A; 4IHJ B; 1J95 A; 1BZK A; 1AI7 A; 3P3P A; 2WLJ A; 4WCE V; 3LDC A; 2CH7 A; 1NKD A; 3H01 A; 3TK1 A; 1K8A W; 4NVP A; 1PNM A; 1B06 A; 4ZOL B; 3ABK C; 3UM7 A; 3OTO B; 4RQF A; 3JAL B; 5CN0 A; 3DTU B; 1XMO O; 1VF6 C; 3OMA B; 5CB4 B; 1VF5 B; 2GBO A; 3OM3 B; 2KG7 A; 1NTK H; 4IIJ B; 5KA6 A; 1GN6 A; 1AR4 A; 4PEL A; 1RM1 B; 1YCI A; 5FPR A; 3CE2 A; 1L8D A; 4WFB V; 2D3O W; 5JJE B; 1P49 A; 2A7W A; 3E8H A; 5KMG B; 2DQ0 A; 2WA4 A; 1IBM B; 4GX5 A; 4JGS A; 1AR5 A; 1VQO V; 4I4T A; 3SPI A; 2VQE B; 2YXY A; 3RYI A; 1K9M W; 5BR8 B; 1R73 A; 3IC7 A; 5CA1 A; 4JZ2 A; 4R50 A; 2DW4 A; 2GDS A; 2F4V B; 4YJ3 A; 4JF3 A; 4J42 A; 5DN6 G; 3CCU V; 4KFM A; 4X89 A; 3SDL A; 1SS3 A; 2BOB C; 2EIK C; 3OR7 C; 4TQF A; 3U10 A; 1N33 O; 2CH7 B; 3ZS8 C; 2P90 A; 1SC5 B; 4J7J A; 4UVB A; 4YXW G; 4MTX A; 5KHI A; 3LSQ A; 2CGN A; 2UXD O; 5F2V O; 1QCE A; 2A0L A; 2ZE5 A; 3JCZ A; 2ADQ B; 4LFB B; 1S72 V; 1ENV A; 4UUJ C; 4KUM A; 4UB6 Z; 5A9G A; 4DUY B; 3OT7 A; 1SQB H; 2KG7 B; 4DR6 O; 2HVJ C; 4L87 A; 4JI8 O; 4LF4 B; 1YJN V; 4JTC B; 5B1A C; 4EB6 A; 5KHG A; 2ZM6 B; 4I4T B; 3I5D A; 3RYI B; 1MNG A; 3HKC A; 3SJC C; 2P5O A; 4X64 O; 2DMX A; 2EX3 A; 2GSM B; 5CA1 B; 2N04 A; 5JCO C; 1Q3E A; 4H44 B; 3ZIA G; 3B09 A; 3SJB C; 4UCO A; 4YJ3 B; 2N74 A; 4CH4 A; 2PGG A; 3CC7 V; 3FYI B; 1QQC A; 2ZQM A; 2ODM A; 1FD9 A; 4KHP B; 3B2E E; 5EBL C; 4NXN O; 3MD0 A; 1SZT A; 4GT1 A; 2BTO A; 3ETE A; 4MS2 A; 4MVU A; 4DR4 O; 2XAH A; 4J9Y B; 2Q73 A; 2QTO A; 2Y48 A; 4O4J A; 2XAS A; 3B4S A; 2VQF B; 4H33 A; 3G4S V; 3FX7 A; 4ZBM A; 1SRY A; 3STL C; 4KL1 A; 3ZRW A; 1H2K A; 2ZIO A; 1QLE C; 4O4H A; 1ORQ C; 2UXN A; 1GH6 A; 1O9H A; 5FNV A; 1J5E O; 4EB6 B; 3JD1 A; 5L3E A; 4CZZ A; 5C8Y A; 1FYJ A; 3HKC B; 2QEX V; 4LP8 A; 2CTR A; 3C3S A; 2GTA A; 2JJ2 G; 2ZIM A; 4GKJ O; 1GN2 A; 3GWK C; 1HNZ B; 3RW0 A; 3SYP A; 3CB2 A; 4NXM O; 1V55 C; 1VQ6 V; 2JGU A; 1WN7 A; 2AXT Z; 4TV9 A; 4IYI A; 3D36 A; 3ASN B; 2Y4T A; 1YIT V; 3TJT A; 2YUA A; 3KCY A; 3MDS A; 3T4Z A; 3CME V; 4NTX A; 2HLD G; 1PNK A; 2IJJ A; 4PDL A; 2WLM A; 4DXW A; 5CBG A; 3JAM N; 5LHG A; 2HP8 A; 3ETG A; 3CCE V; 3X2Q C; 4G28 B; 5H9C A; 3W7T A; 4LF9 B; 1RPO A; 4YY3 B; 4B3T B; 4O4J B; 1XDC A; 4QJF B; 4NTW A; 2UUB B; 2X7R B; 2ZE7 A; 1RP3 B; 2XAF A; 2JGD A; 2QWO B; 1W2B U; 4JAV A; 5BY1 A; 2ZE6 A; 3ZRW B; 5IYC O; 2OIG A; 2EBO A; 2Z0A A; 4O4H B; 3RFR A; 2EIL C; 5FNV B; 4IT5 A; 1H2N A; 3CCV V; 4DV3 O; 4B3S B; 1B3Q A; 5C8Y B; 3BA9 A; 3K0D A; 2BTQ A; 1THZ A; 1AJN A; 1PM9 A; 3K04 A; 1EBO A; 5LP6 A; 5IYD O; 1GAX A; 3OGC C; 4EFE A; 4JI5 B; 4TV9 B; 1QR9 A; 3ABM B; 1HDJ A; 2CTP A; 1R3I C; 2RDC A; 4LFC O; 1MA1 A; 1FXK C; 3ZHQ A; 3P32 A; 2WLK A; 1K4C C; 1YTF D; 5KAF Z; 4PA4 A; 1IBL B; 3OGI B; 3ZHV A; 3EFF K; 4BIZ A; 2HFE C; 1UPG A; 1M5I A; 2YIB A; 1TUB A; 1TA8 A; 2DJV A; 1RM1 C; 2R9I A; 4PD4 F; 2EJR A; 1ZAU A; 2DYR B; 1VQP V; 4DW1 A; 5J2U A; 1XNR B; 2QWN B; 1LR1 A; 3RYF A; 4LF6 O; 2WWW A; 5B3S B; 2LW1 A; 3KG2 A; 1PP9 H; 3VQY A; 2JGD B; 1I5Y A; 1NT2 B; 3OMI B; 2JVD A; 3G71 V; 1LNQ A; 5LGU A; 4X20 A; 1XNQ B; 2B9Z A; 2QM4 A; 3SYC A; 4X1K A; 5LMN O; 2JEX A; 2BTQ B; 1F51 A; 4WBN A; 1VEW A; 3K79 A; 2EZP A; 1GM9 A; 5LP6 B; 2A3Q A; 2Z3Y A; 3BVO A; 4J7Z A; 4DV4 O; 3H1J H; 5LL6 Y; 4E4E A; 2FL4 A; 4AI8 A; 5HFL A; 1S0V A; 5KUM A; 3JAW A; 2WLN A; 2ZIN A; 1WPX A; 1WP7 A; 1KMI Z; 1TUB B; 3ZJZ A; 3GWO A; 3FB6 C; 3JD2 A; 1Y67 A; 2PYJ A; 2OTL V; 1HNX O; 1OCR C; 1QBZ A; 3EVK A; 5J2U B; 1FFT B; 2AHY A; 4RUF A; 4BWA A; 2ZXW B; 3RYF B; 3UT5 A; 5CMU A; 1PL0 A; 4JZG A; 4PA9 A; 4IYH A; 1M9N A; 1SKV A; 3JSL A; 3T4D A; 4JI2 B; 1AB3 A; 4B7E A; 4LF7 B; 1Y76 A; 3UQ8 A; 4X20 B; 4JI1 O; 5L3B A; 4XDL A; 1NBM G; 4X1K B; 2FB5 A; 2QWQ B; 1BCC H; 3FD9 A; 5H6Q A; 2QM8 A; 1ZLZ A; 4E2L A; 4WBN B; 3ZMT A; 1XMQ B; 4DR5 O; 1QVG U; 4PDM A; 1NH2 B; 1Z5V A; 3K5L A; 1P4R A; 4H0L B; 2QR4 A; 2JS5 A; 1H8E G; 2Q8V A; 1W59 A; 4KXR A; 2X6B A; 3VOU A; 1K34 A; 3JAW B; 2OIE A; 3RYH A; 4TV8 A; 2UXX A; 2E76 B; 4OX9 B; 3C3T A; 3IGA C; 2DYS C; 3K57 A; 2WSS G; 3CRR A; 1DGS A; 1AJQ A; 4DV1 B; 1YTF B; 1BMF G; 2UUC B; 4QPJ A; 1YDX A; 4UXN A; 4LF8 B; 1G6U A; 1U97 A; 4JAS A; 4DV0 B; 3RT3 C; 1BL8 A; 1MOF A; 1TUE B; 2LQT A; 3UT5 B; 4JI0 B; 1S5J A; 4TSF G; 3CCQ V; 5C93 A; 1V54 C; 3ASO B; 4QIW F; 2FTK A; 3OFN G; 1RFY A; 3U11 A; 2KSD A; 1Y76 B; 4DV7 O; 3BHP A; 1K7D A; 2GHY A; 2VRZ A; 3Q4H A; 4JI6 B; 4FFB A; 3OEE G; 4O4L A; 4UCS A; 1FAF A; 4JYB A; 4Q20 A; 3I55 V; 4DR2 O; 3APO A; 2UXC O; 1V9P A; 2PI4 A; 1E79 G; 1NU1 H; 3T2M A; 3SYA A; 3BY6 A; 2Q6A A; 3RN4 A; 4I9Q A; 3A2F A; 4JI7 B; 2QA4 V; 4I0X A; 5EBM C; 5EIB D; 1IZ3 A; 1NJI W; 2IH1 C; 1X4T A; 3ETD A; 4O2A A; 3RYH B; 3ZX6 A; 4TV8 B; 3R65 A; 5B1O A; 1YHQ V; 1BT8 A; 2Y4U A; 1HNW O; 4X62 B; 2P6J A; 1K97 A; 4DUZ O; 4GZR B; 1ARO P; 1XMO B; 3ZCC A; 3ZMS A; 2B1G A; 4UVC A; 3CHX A; 5B1B B; 2YI8 A; 2OCC B; 1EM1 A; 4UB8 Z; 4X66 B; 1YEW A; 1N8R W; 1ROP A; 2W0F C; 2ZR2 A; 4UV8 A; 1SA0 A; 2IJK A; 1NVP B; 3K58 A; 3Q4H B; 4NR1 A; 2ZKO A; 3BAA A; 4FFB B; 4O4L B; 2Q67 A; 3F7V C; 2QGN A; 2XUM A; 3ZRX A; 3ZMU A; 3AEI A; 3TCU A; 2GV9 A; 3AG1 C; 4WFG A; 1SZX A; 3DXR A; 2ETN A; 5IE9 A; 1L1F A; 1CXZ B; 3AK2 A; 2Y0P A; 4RO2 A; 4I0X B; 4DW0 A; 2JIZ G; 1OV9 A; 4GYC B; 4X65 O; 4R8C A; 4O2A B; 1BHA A; 4CH6 A; 1Y74 A; 1VQ7 V; 1IBK O; 1GRJ A; 5L3C A; 2UXD B; 1VQ9 V; 1FFX A; 1YIJ V; 5B66 Z; 2Q0A A; 5CA0 A; 2VWJ A; 3RYC A; 3N27 A; 1NI8 A; 1P84 F; 4DR6 B; 4BW5 A; 1R6N A; 3A0B Z; 2LP7 A; 3QO8 A; 4PA6 A; 1P7B A; 1YJ9 V; 2RMK B; 4FLZ A; 5KHH A; 5FLX N; 2YEV A; 4FM1 A; 4GKK O; 4XBF A; 1SQV H; 3CC4 V; 3T1H O; 2JK5 C; 1SA0 B; 4OPA A; 3FB5 C; 2QKC A; 3CRC A; 3LSU A; 4X64 B; 4FM0 A; 2HJD A; 2KB1 A; 1IDS A; 2W6J G; 4FLY A; 3BFR A; 2B1I A; 2F95 B; 3DXR B; 1JQ0 A; 3AG3 C; 2CTQ A; 1M57 C; 1OZ0 A; 4DYL A; 1K5S A; 3UO2 A; 2W6I G; 3B8M A; 2XTA A; 3P30 A; 2VQE O; 1AJP A; 3THO A; 3BRC A; 1DF4 A; 3CS5 A; 3ZRV A; 4NXN B; 3FB7 C; 1FJG O; 2Q4P A; 1DF5 A; 3VBB A; 2LJ2 A; 1Q6H A; 1OJH A; 2PZS A; 1Y74 B; 2YI9 A; 3J80 N; 2LO1 A; 5JVD A; 2F4V O; 1FFX B; 5IY5 C; 3K08 A; 5CA0 B; 4XDJ A; 3RYC B; 2F43 G; 4FLU A; 4N21 A; 3SGI A; 1KC8 W; 3L75 H; 4K0K O; 3OR6 C; 5LA6 A; 2YEV B; 4FJC C; 4PA3 A; 2CK3 G; 5E1A C; 1OCO C; 1N34 B; 2BSK A; 4DR1 B; 4FZ0 A; 1QLN A; 1MMM A; 4FFK A; 5B5E Z; 2EIM C; 1M4U A; 4UCU A; 5KLV H; 3QNE A; 2UU9 O; 4WFF A; 3ABL B; 1MSW D; 2Q7E A; 1Y4M A; 4TQD A; 3HPL C; 2PYL A; 2CUG A; 1JOY A; 1VQM V; 5EZY A; 2XND G; 1FXV A; 4R6Z A; 2IU3 A; 3ZRS A; 1OCC B; 4NXM B; 3KZI Z; 2ZT9 B; 2QWP B; 2NNU A; 1NQT A; 5BXZ A; 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