The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
54
|
structure length |
54
|
Chain Sequence |
SDAVQRAKEVLEEISCYPENNDAKELKRILTQPHFMALLQTHDVVAHEVYSDEA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A General Model for Preferential Hetero-oligomerization of LIN-2/7 Domains: Mechanism Underlying Directed Assembly of Supramolecular Signaling Complexes
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Caenorhabditis elegans
|
| molecule keywords |
LIN-7
|
| total genus |
14
|
| structure length |
54
|
| sequence length |
54
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2005-05-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | L27 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VF6 A; 1Y76 B; 1ZL8 A; 1Y76 A; 1ZL8 B; 1Y74 A; 1VF6 C; 1RSO B; 1Y74 B; 3B40 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DV6 O; 1RP3 B; 4FM1 A; 1B6Q A; 4B3R B; 1ZUQ A; 2ADQ B; 2Y48 A; 2LFR A; 5KHG A; 3OUF A; 3CS5 A; 1KEC A; 4GUN A; 2YS8 A; 3ZRW A; 2P90 A; 4CC5 A; 4DV1 B; 1QR8 A; 3MHH C; 3JAW B; 2R9R B; 1JA8 A; 4YJ3 B; 1SQV H; 3J81 N; 2XOK G; 5H9C A; 1OCC C; 1QR9 A; 1S0V A; 3FAV B; 2UXD B; 4U7O A; 3G71 V; 1US6 A; 1EFR G; 4LH7 A; 1MMM A; 4JI0 O; 4LF8 O; 2YI8 A; 3EFF K; 2XAH A; 2QR4 A; 4NKG B; 3RWR D; 2IU0 A; 1XMQ O; 3JAK A; 5EK0 A; 5LHI A; 4JI6 B; 4ASU G; 5CA3 A; 3I55 V; 1AB3 A; 4IHJ B; 3K9A A; 4QNH B; 2YXY A; 1M4U A; 2ZR2 A; 3DGE A; 3CCS V; 5FL7 G; 4RUF A; 4JYY A; 4GKK B; 2ILM A; 1XQ8 A; 1N36 B; 4GYC B; 2B1G A; 2E75 B; 2F4V O; 3P3P A; 1F4M A; 2GHY A; 3U10 A; 4X9Q A; 2ZM6 B; 1YTF D; 2UUB B; 2Q6A A; 5EYP B; 1VQ9 V; 4DR2 O; 2IJK A; 5KX5 B; 3HKE A; 4LH6 A; 4X1I A; 3CC4 V; 4JV5 O; 3FB5 C; 5CN0 A; 1WB8 A; 1OCR C; 2HHH O; 3CRA A; 4ZOL B; 1VMG A; 5HFM A; 5TIS Z; 1N34 B; 5J2T B; 2L35 A; 4GLX A; 4UXN A; 1K97 A; 3H1J H; 4TV8 B; 4KP4 A; 4W4K A; 5B3S C; 2JS5 A; 3M99 B; 1AI5 A; 4PJ0 Z; 2Y0I A; 5L3C A; 5BMV B; 1M93 A; 4LF7 B; 2JK5 C; 5JH7 A; 4DV7 B; 2XT9 A; 4FFB B; 5LYJ A; 2E3C A; 3KKY A; 4PA3 A; 4B3T O; 4R6Z A; 3E8F A; 2IH3 C; 1XMO O; 2UXC B; 1PNM A; 3RBZ A; 2N04 A; 3APO A; 2VWK A; 2P5O A; 3CCU V; 1FFX A; 1TUB B; 3K5O A; 4JI2 O; 2Y69 B; 1DF4 A; 2EIK B; 5FLX N; 1E1Q G; 5LXT B; 2X7R B; 1Q86 W; 4AQY O; 1N33 B; 1B04 A; 1H38 A; 1VQ7 V; 1JQ0 A; 2EIL B; 2YUA A; 1K92 A; 1VQM V; 1JFF A; 4JI3 B; 2JEX A; 1UPG A; 2F95 B; 4MVS A; 3L70 H; 1XDC A; 2UXB O; 4YIO A; 3ABM B; 5IE9 A; 3CXC U; 4RQE A; 1M90 W; 1JMK C; 1T5E A; 2QWQ B; 1ARO P; 2DN9 A; 1DTO A; 3IC9 A; 3ASO B; 2QWP B; 2EIN C; 3HKC B; 5B66 Z; 3RYC B; 3E22 A; 4U7N A; 4RO2 A; 3JAS B; 3JD1 A; 1I7F A; 1TGO A; 3OEH G; 4I9W A; 4AI8 A; 5L3B A; 3STZ C; 3E8B A; 5LP6 B; 3DXR B; 5CA0 B; 4JI7 B; 1O9G A; 3VOU A; 1SA0 B; 4LC1 A; 1E1R G; 1A32 A; 1Y66 A; 4I50 B; 2ZDI A; 4UCS A; 4ZBM A; 4FJC C; 4IIJ A; 5GTH Z; 1VF5 B; 5B1B B; 4DRX B; 3RYH A; 1GTO A; 4JYA O; 1NR1 A; 3MDS A; 4LWS A; 2IJI A; 4JF3 A; 4EB6 A; 1EN6 A; 4LFB B; 2HR3 A; 1NH2 B; 4O4H A; 4UFZ A; 5KMG A; 4BWA A; 3BA9 A; 1ZX3 A; 2EIM B; 1XIL A; 2QKS A; 2VQE B; 1FXK B; 2E74 B; 2LGQ A; 3IGA C; 3OGC C; 1AVM A; 2E5L B; 3RYI B; 3CP1 A; 4NR1 A; 4ZKI A; 4BR6 A; 5ITZ B; 4DR3 O; 2RN9 A; 3T1Y O; 1D5A A; 4XDJ A; 5IYC O; 4P9O A; 2WLI B; 1P84 F; 5JQG A; 2R9I A; 2WLJ A; 4K8X A; 3MD0 A; 1F23 A; 1QCE A; 3L9D A; 5B5E Z; 2F43 G; 3SJB C; 5LHH A; 4A5U B; 2B5U A; 1JOY A; 4OX9 B; 1P4R A; 1ZTE A; 1W2B U; 3W7X A; 3B40 A; 4E2L A; 2X6B A; 3OTO O; 1SRY A; 4GZR B; 1RM1 C; 5KHI A; 2Q0O C; 4X65 B; 4X1Y B; 1F4N A; 2NR5 A; 5IWA B; 2YIB A; 1SZT A; 1EN5 A; 1O9H A; 2JRI A; 3JAM N; 2HG5 C; 1Z5W A; 5KHJ A; 3ZED A; 3S3W A; 1K8A W; 2EJR A; 3C90 A; 1NT2 B; 2YIA A; 2ZIM A; 1HP8 A; 4PHZ A; 5JJE B; 3BHP A; 2MK3 A; 2BOC C; 3VQV A; 5JJN B; 4NTX A; 2ZE5 A; 3ZCC A; 4RUE A; 3F5T A; 3SYC A; 1WA8 B; 2UUC O; 2QSA A; 1SQF A; 2YIB D; 4I0X A; 2ITC C; 1H8E G; 1NJI W; 1KP3 A; 1MNG A; 4J10 A; 4FLW A; 4UV9 A; 4NVP A; 3E2E A; 1XBL A; 1URF A; 1YF2 A; 4YJ3 A; 1HR0 B; 5EBM C; 4O4L B; 3W7S A; 5K1P A; 3FAV A; 1OCO C; 2RDC A; 2ADP A; 4TT3 G; 4DV3 O; 4LR3 A; 2WLM A; 1WB7 A; 1L0N H; 2R9A A; 4PDL A; 2H3O A; 5IJ9 A; 4TUY B; 2P4K A; 1XNR B; 2WLL B; 5JVD B; 5BR8 O; 1BMF G; 1ZSP A; 4PA4 A; 2Q7E A; 3JCZ A; 1PD3 A; 3UM7 A; 1OV9 A; 1FS0 G; 1YZB A; 4B3S B; 1K33 A; 1N36 O; 3SJQ C; 1OCC B; 5IY5 C; 5LL6 Y; 2LO1 A; 5KHK A; 1EM1 A; 4X66 O; 4LF4 O; 4TV9 A; 4FLZ A; 1FJG O; 4QPK A; 3DSQ A; 2YDE A; 4NYK A; 1BQ0 A; 3K5N A; 5EC2 C; 5EYP A; 2UU9 B; 1R3J C; 3T4Z A; 2LW7 A; 3X2Q C; 3CCR V; 2V7Q G; 1GRJ A; 1XL6 A; 2YSU B; 2ITD C; 4ZOL A; 2ZE8 A; 4NB5 A; 5J2T A; 1YXB A; 1XRE A; 1N34 O; 3OEE G; 4JI8 B; 2Q67 A; 4TV8 A; 1XHZ A; 3S3X A; 2YC0 A; 4FLX A; 1EZV H; 4DW0 A; 4Z2W A; 2ZKO A; 3L72 H; 4DUZ O; 5BMV A; 1KKC A; 2XAQ A; 3JAT B; 3JAR B; 4JTD B; 5J2U A; 2HJD A; 1PP9 H; 1OCR B; 1AI6 A; 3I56 V; 4XDK A; 3KG2 A; 3BAA A; 4L8J A; 1S5H C; 1TUB A; 2QGN A; 2OIE A; 1N32 B; 5B3S B; 5LXT A; 4JI4 O; 3DC5 A; 1MAB G; 4KUM A; 2B1I A; 4P9P A; 3ZIA G; 3UT5 B; 3FKS G; 1VIB A; 4ICG A; 1R73 A; 5CB4 B; 3OW2 U; 3ZRS A; 3BEH A; 2ZE7 A; 3E89 A; 4I55 B; 1YDX A; 3CCV V; 2DMX A; 3W7T A; 1M57 C; 1PNK A; 1NVP D; 2P4V A; 3AG3 C; 4JYB A; 4UV8 A; 2HP8 A; 3N2G B; 3EXA A; 1SQX H; 4BAY A; 2WA3 A; 4DV0 B; 3WG7 C; 1BSM A; 3HKC A; 3OFN G; 5AG2 A; 4DR1 O; 4HAM A; 3LDD A; 3ZHV A; 4LBE C; 4DV4 O; 4I4T A; 5B1N A; 1KMI Z; 3JAS A; 4YHH B; 2C2A A; 2X6C A; 1KKD A; 4GT1 A; 5DEC A; 1EN4 A; 4LF6 B; 3K0G A; 3DXR A; 3PJS K; 1V54 C; 1M56 C; 4AIL C; 1IBM O; 1TAE A; 2N74 A; 4I50 A; 4IL6 Z; 4DRX A; 4YY3 B; 1K73 W; 4NXN B; 1FKA O; 2EIN B; 1MOF A; 4GKJ O; 4H33 A; 3B4S A; 4CS3 A; 1I0H A; 4B3M B; 4DV5 O; 2BTQ B; 1FPO A; 2ETN A; 1BHB A; 1Q3E A; 1J5E O; 1FXH A; 2BSK B; 1FXK A; 1XOU A; 5KA6 A; 3ML0 A; 3QO8 A; 4PDM A; 3RYI A; 1Q6I A; 3E8G A; 5ITZ A; 5LMU O; 4UCV A; 4LP8 A; 1SC5 B; 1S3J A; 2WLI A; 5KAF Z; 3K59 A; 1BL8 A; 3ZN1 A; 1IBK B; 4UCR A; 2LJ2 A; 4FLY A; 1QVF U; 3K08 A; 1I94 O; 2ZNI A; 1Y6X A; 1W59 A; 2DJV A; 1M1K W; 4FZ0 A; 4QGP A; 3G67 A; 4YIP A; 2YIC A; 1WPB A; 3LUT B; 1Q8I A; 3ZBH A; 4LFA O; 3R65 A; 2QWN B; 5K1X A; 2VWJ A; 2CH7 B; 4EFE A; 2OWO A; 3D3I A; 2F23 A; 2XTA A; 5LOV B; 4K8Z A; 2Q7H A; 3GB7 C; 2H94 A; 3U11 A; 4X64 O; 3OGI B; 3ZHR A; 4BIZ A; 1GO3 F; 1BQZ A; 2IBZ H; 3BAB A; 3H1K H; 4X20 A; 1JJO A; 1WAZ A; 1G1X B; 1IBL B; 4X1Y A; 2GUZ A; 3OMN B; 4JI5 B; 1M5I A; 3AG7 A; 2WWW A; 3CJH A; 2QDO A; 3RYF B; 3THO A; 4Z1M G; 2GTS A; 4MTO A; 3IC7 A; 2WLN A; 3TET A; 4Q20 A; 3AK1 A; 2QEX V; 4CH6 A; 2W0X A; 3KCX A; 3SPG A; 4MSW C; 5KUK A; 1X4T A; 4WFF A; 2VRZ A; 4KHP B; 5JCO A; 3FB8 C; 3HKB B; 4JZG A; 2OTJ V; 1RM1 B; 2WLH A; 4PA9 A; 3CC2 V; 1NU1 H; 3N27 A; 4JI1 O; 1WA8 A; 3C3S A; 1U96 A; 5LBQ A; 2Y4U A; 5JJJ B; 3AK2 A; 3TJT A; 4LFC O; 3SYP A; 4NTW A; 3E86 A; 3CWB H; 4TQF A; 2PYL A; 4X1K B; 2JJ1 G; 3HB3 B; 5LGN A; 2Y0P A; 3B8M A; 1EZJ A; 4DR7 B; 3Q4H B; 4O4L A; 2CAZ C; 4DR6 B; 5LGT A; 1P7G A; 4PV1 B; 3LDE A; 4LF5 O; 4KL1 A; 4IYH A; 2ZNJ A; 2AZ0 A; 4TUY A; 1ORQ C; 2FTK A; 5LMN B; 1Y67 A; 4NXM B; 2HFE C; 4MVM A; 1GN2 A; 1GN3 A; 4GX2 A; 3N2K B; 2ZXW C; 4QJF B; 3H1I H; 3CME V; 1Q5O A; 4O4J B; 5KA5 A; 2HLD G; 2FYU H; 2CE4 A; 5FNV A; 1OCO B; 3APQ A; 3T1C A; 1QLN A; 1TVK B; 2FB5 A; 4RWU A; 4W4L A; 1NI8 A; 4DV2 B; 1D2D A; 5LGU A; 5LA6 B; 3B8N A; 3ABK C; 2E76 B; 1L8D A; 4FK5 C; 4WBN B; 1H2N A; 4WFB V; 2OTL V; 1Y4M A; 1MA1 A; 2OCC C; 3SR2 C; 2PUS A; 2H8P C; 2VQF O; 4O2A B; 1YIT V; 2Q0A A; 2OYQ A; 1H2K A; 4K3A A; 5IY5 B; 2JDI G; 1GK9 A; 4YJ2 A; 2DWE C; 2EIJ C; 4CH5 A; 4CC6 A; 4QE9 A; 5H6R A; 1RSO A; 4FLV A; 1GKF A; 2XAJ A; 1IDS A; 1HNW O; 2WLK A; 3X2Q B; 3KCY A; 3JAT A; 3JAR A; 3P3N A; 3VQX A; 1YI2 V; 5BXZ A; 5EZY B; 1Y76 A; 2YID A; 1ZAU A; 2WA4 A; 3WB2 A; 2DYS C; 3SYO A; 2JGU A; 5IYD O; 4JZ2 A; 1VQL V; 4WFE A; 1MSD A; 1THZ A; 2P67 A; 2RCV A; 1Q6H A; 1GM8 A; 1NBM G; 5IJ0 B; 4BIO A; 1DF5 A; 1H2G A; 5C8Y A; 3UT5 A; 4DUY O; 2XHB A; 1I08 A; 3L71 H; 5CB4 A; 5B1O A; 1JX9 A; 4DYL A; 3CB2 A; 1CP9 A; 1RPR A; 2EBO A; 3QO7 A; 3AG4 C; 5D5P A; 3L73 H; 2P6J A; 2Y4T A; 5EC1 C; 1XNQ B; 2UUA O; 4MW8 A; 4K0K O; 3N2G A; 3K3W A; 4BW9 A; 3LSS A; 2PYJ A; 2DWD C; 4MVQ A; 3T4D A; 1S77 D; 1K34 A; 4NTY A; 2K1E A; 2MW2 B; 2HKO A; 1RFY A; 2QA4 V; 2YXH A; 2ZIO A; 1IXB A; 5KUM A; 1G8M A; 4EEQ A; 2Z5U A; 1SQP H; 1DK1 A; 1GN6 A; 2XAG A; 4X62 O; 1YEW A; 3BA8 A; 1M57 B; 4F6E A; 3AG3 B; 4DR4 O; 4R8C A; 1YVW A; 3KZI Z; 3T1H O; 4JAV A; 4TWK A; 3WG7 B; 4DV6 B; 1VEW A; 2YI9 A; 1YJ9 V; 2QJ1 A; 4WFG A; 3ZS8 C; 1SES A; 4O2B B; 1QVG U; 3TCU A; 4LF9 O; 5FPR A; 2A3Q A; 2WAM A; 3SYA A; 4HZ3 A; 2ZD9 A; 4B08 A; 4ZI7 B; 3K9S A; 1NTK H; 1SKV A; 1K9M W; 3HKD B; 1AR5 A; 2EUL A; 3SPI A; 1V54 B; 1F51 A; 3GVM A; 2ZR3 A; 1HNX O; 3ZRW B; 2KSD A; 4U3J A; 2PZS A; 3A8T A; 4CZZ A; 2QWO B; 1HNZ O; 4B7K A; 2HJF C; 1Y74 B; 5DED A; 4JI0 B; 4LF8 B; 3G4S V; 4DR5 O; 3G6B A; 1XMQ B; 1YTF B; 2BE3 A; 2PTM A; 2KB1 A; 1ZLZ A; 1OCZ C; 1EBO A; 5J9P C; 3D8C A; 5CMU A; 2ATK C; 2PGG A; 4O4I B; 4ABM A; 3JD0 A; 1WPX A; 2CTW A; 1IX9 A; 1W0J G; 5IYZ B; 2P22 C; 4B3R O; 2F4V B; 3ETG A; 3L75 H; 2K9P A; 1BCC H; 2A7W A; 2OT5 A; 3JAW A; 2BTO A; 2Q7G A; 1XI1 A; 4DV1 O; 1AJN A; 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3WFV A; 1FXK C; 5KAI Z; 1Q6U A; 1E79 G; 4O2A A; 4IIJ B; 1COW G; 2ZXW B; 2Q9L A; 3J80 N; 4JI3 O; 2X6A A; 4OPA A; 4B7E A; 3UCS C; 2D3O W; 5B1A C; 4JYA B; 5CA1 B; 3AG2 C; 4G28 B; 1XUQ A; 4IYI A; 2DE0 X; 1S72 V; 5L3D A; 3RYC A; 2Q8V A; 3U0Z A; 5HFL A; 3A0H Z; 3ZMU A; 3CMA V; 3ABK B; 3ZJZ A; 4KFM A; 2KG7 B; 1VF7 A; 2Z3Y A; 5LP6 A; 4J41 A; 5CA0 A; 2OCC B; 1WN7 A; 3DTU B; 1SA0 A; 4DR3 B; 5EZY A; 4KXR A; 2CTQ A; 3T1Y B; 2CGN A; 1YSC A; 1ZL8 B; 3RVY A; 4JI7 O; 1QU7 A; 2JIZ G; 2Q69 A; 2ZT9 B; 5IJ0 A; 3QVN A; 5JQG B; 3RFR A; 2A06 H; 3OT7 A; 4OPH A; 3F5W C; 2P7T C; 1OHH G; 1SQG A; 4YXW G; 3WB0 A; 1AI4 A; 1SET A; 2A9H A; 3JYC A; 3T2M A; 3ETQ A; 4ZIB A; 3G6E V; 4LFB O; 2Q4P A; 3LNN A; 4J7Z A; 3CCQ V; 4F6R B; 3OTO B; 1BS3 A; 1NKD A; 2DYS B; 1R1B A; 3CD6 V; 2VQE O; 3B77 A; 4PDV A; 1I5Y A; 2LGW A; 5JCO C; 2IJJ A; 4I5S A; 4WFH A; 2A0L A; 2E5L O; 1R3L C; 1TUE B; 1R3I C; 1NH2 D; 2AZ2 A; 3LSQ A; 3FB6 C; 3C3T A; 3QF7 A; 1CXZ B; 1VAR A; 3AG4 B; 2LP7 A; 3WU2 Z; 4XBF A; 4WF9 V; 3VBB A; 3ZMT A; 3OAA G; 5BY1 A; 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