The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
EVQQPDPMRKNWIMENMDSGVIYLLESWLKAKSQETGKEISDIFANAVEFNIVLKDWGKEKLEETNTEYQNQQRKLRKTYIEYYDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Nitrosomonas europaea
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| publication title |
X-ray crystal structure of hypothetical protein NE0241 from Nitrosomonas europaea.
rcsb |
| molecule keywords |
hypothetical protein NE0241
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| total genus |
29
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| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | NE0241-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZX3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QDO A; 3X2Q B; 3JAW B; 2CE4 A; 2XAG A; 2X7R B; 5JWP A; 3KCX A; 4IHJ A; 3B8M A; 4RUF A; 1FS0 G; 3OAA G; 4P9O A; 1QLN A; 4JGS A; 2A3Q A; 1GTO A; 3C3S A; 4L87 A; 3IC9 A; 1AR1 B; 1SQQ H; 5IYD O; 2Q0O C; 3QVN A; 2BCC H; 3RYH B; 5LL6 Y; 4LFC O; 1COW G; 4NTW A; 4DV0 B; 4TOI A; 4ABM A; 1R73 A; 5LGT A; 5CB4 A; 4MTO A; 3N27 A; 3JD2 A; 4J80 A; 1VF5 B; 4H0L B; 4J11 A; 4UB6 Z; 5IWA B; 3OW2 U; 1G4Y B; 4E2L A; 1YJW V; 3BY6 A; 2XAF A; 1HNW B; 1D5N A; 2KQX A; 4IGG A; 1JJO A; 1KC8 W; 2CDY A; 5JH7 B; 3CME V; 3ML0 A; 3CXH F; 1MNG A; 5LYJ B; 1GM7 A; 2DOS A; 2EZP A; 3E8H A; 2E5L B; 3JSL A; 1FFT B; 3OMI B; 2KSD A; 4JI0 B; 2D2C B; 2P22 C; 4QPJ A; 2ODM A; 1XL6 A; 1BE3 H; 1Y76 A; 4CZZ A; 3EXA A; 1SQG A; 5FLX N; 1IXM A; 4WBN B; 2JEU A; 4PA7 A; 3ZED A; 3K06 A; 2OCH A; 1R3J C; 3JAT A; 1S77 D; 3IC7 A; 4UVB A; 1SA0 B; 1QCE A; 3K0G A; 3BHP A; 1XHZ A; 3ABT A; 2FML A; 3UKM A; 3W7W A; 5A9G A; 1VEW A; 4U3J A; 4DV0 O; 3IJ4 A; 4TV8 B; 3SPH A; 3CCE V; 5KHI A; 5EIB D; 2CH7 A; 4EB6 B; 2Q8V A; 4NTX A; 1CEZ A; 1H2S B; 5IWA O; 5KX5 A; 2DWE C; 4LP8 A; 1FXK B; 2UXD B; 1KP2 A; 3JAM N; 2A79 B; 4BIU A; 1HNW O; 1K7D A; 3K58 A; 2RQ6 A; 4JYY A; 2AZ0 A; 3C3T A; 4FFB B; 1R3L C; 2ADQ B; 4TUY A; 4GLX A; 1R6K A; 1RSO A; 3Q4H A; 2Z0A A; 2E5L O; 1Y74 A; 1KEC A; 4JI0 O; 2NLJ C; 4JI4 B; 1G8M A; 4LF8 B; 1QLE C; 2HP8 A; 1SQV H; 2Q7G A; 2E74 B; 3ZMV A; 1X59 A; 1F51 A; 2ITD C; 2WLI A; 3K9A A; 3B8N A; 1R6T A; 4O4I A; 4LF5 B; 1AVM A; 1B3Q A; 2EUL A; 2EIM C; 1SQB H; 3CJH A; 3JAW A; 2BTO A; 2PTM A; 2FB5 A; 1YSC A; 3N2G A; 4EFE A; 2JJ1 G; 1HP8 A; 3L73 H; 4NTY A; 4WFA V; 4JI2 B; 1SZX A; 4FMT A; 1PL4 A; 4TT3 G; 2OIE A; 4P9P A; 2F43 G; 1Q81 W; 4FLT A; 2M6Y A; 2LW1 A; 4UCT A; 1S3J A; 2AHZ A; 1EM1 A; 3RYF A; 1OCO B; 2DQ3 A; 5IYC O; 2UXD O; 4OX9 B; 1NKD A; 4DK1 A; 3SYC A; 1NT2 B; 3OUF A; 1J95 A; 3BA9 A; 3D3Q A; 3OR7 C; 3A2F A; 2RNB A; 4ICG A; 1FPO A; 4TV9 A; 1IUR A; 4MVM A; 5CBF A; 2JIZ G; 3CMA V; 2VS0 A; 1PPJ H; 1JCH A; 5LYJ A; 4JI4 O; 5EBL C; 1JA8 A; 4LF8 O; 3JAK A; 1KQS U; 2DQ0 A; 4ZI7 A; 4GX1 A; 1OJH A; 2PYJ A; 3OEH G; 2FL4 A; 1NR1 A; 4TSF G; 4O4H A; 2YEV A; 4X88 A; 4LF5 O; 4PJ0 Z; 2V7Q G; 3CCJ V; 1DGS A; 4KXR A; 1ROP A; 2ZDI A; 4AHC A; 1RFY A; 1URF A; 4JI2 O; 2JDI G; 4K8X A; 3CHX A; 4EFB A; 1CP9 A; 4PD4 F; 1N34 B; 1XL4 A; 2C2A A; 4R50 A; 3QO7 A; 2AGA A; 1ZWI C; 1AR4 A; 1Y67 A; 5GON A; 3B09 A; 3AG2 B; 2KKW A; 5IYZ A; 2XAQ A; 1H2M A; 2ZXW C; 3RYC A; 1SER A; 4I9W A; 1FFX A; 2UXN A; 4KP4 A; 2GSM B; 1BT8 A; 1US6 A; 1ARO P; 1FXK C; 3UT5 B; 4FM0 A; 2Q73 A; 1ZX3 A; 1OCC B; 4WFE A; 2CUG A; 4FFB A; 1MZE A; 1F23 A; 4ZIB A; 3SPI A; 2R72 A; 4JAU A; 3T1H B; 4FZ1 A; 1JOY A; 3A0R A; 3VQV A; 1ORQ C; 3D8C A; 1G6U A; 1K5S A; 3OEE G; 3IGA C; 4B3T B; 4DR7 B; 2G38 A; 3AG7 A; 2XHB A; 2Z5U A; 3ZRV A; 1PNK A; 3O9O A; 2OYQ A; 2RCV A; 3B77 A; 2WLH A; 5LHG A; 5H5N A; 5KA6 A; 3HR0 A; 4O2B B; 3G67 A; 1FXH A; 4DR3 B; 5FPO A; 1WB8 A; 3FYI B; 1D5A A; 2QM8 A; 1AJP A; 2Q67 A; 2EX3 A; 3HKD A; 1N34 O; 3OGI B; 3NXS A; 3RN4 A; 3ASN B; 1G1X B; 1NTK H; 3U0Z A; 5KHJ A; 2JGD A; 4K3A A; 4R7C A; 4PI2 A; 3E22 A; 4MVQ A; 4PA6 A; 2W0F C; 2F4V O; 2ZE7 A; 1HNX B; 1SQX H; 5FNV A; 4PA4 A; 1YIT V; 2UUC B; 1ZAU A; 1OCO C; 3NR7 A; 5KUM A; 3TJT A; 5KUK A; 2DJV A; 1DLB A; 1NH2 B; 3L75 H; 3T1Y B; 3ZHU A; 3T1H O; 1BZK A; 1K4D C; 1HR0 B; 3THO A; 2OCC B; 1GM8 A; 1Q8I A; 2WAM A; 4B3T O; 4DR7 O; 1PP9 H; 3P3P A; 2K9P A; 1FYJ A; 3AK3 A; 3H9V A; 4FLU A; 3K59 A; 5LOV B; 4CH3 A; 3CRQ A; 4UCS A; 3WB0 A; 1GH6 A; 4I9Q A; 5JJE B; 3SYO A; 3MDS A; 1HW7 A; 3UQ8 A; 1KUQ A; 2HKO A; 3APO A; 1DF5 A; 3ABM B; 4DR3 O; 2IH3 C; 1N32 B; 1QNM A; 2DYS C; 2GTS A; 3G4S V; 2BTQ B; 3A0B Z; 1MSD A; 3ASO B; 2YI9 A; 1EBO A; 1TVK A; 1PL0 A; 4JPR A; 4IIJ A; 3WG7 C; 5L3B A; 3CYO A; 2DMX A; 2ZNI A; 3K9S A; 3KCY A; 2CGN A; 5L3C A; 4ZOL B; 3LNN A; 2UUA B; 1HNX O; 3M8A A; 1DTO A; 4IYH A; 3CCR V; 3O65 A; 1YTF B; 4MVS A; 3ETE A; 2UUC O; 1W0K G; 1M56 C; 2HVJ C; 1VF7 A; 1L0L H; 4FLW A; 3CRR A; 3HPL C; 2JK5 C; 1M93 A; 1Q43 A; 4CC6 A; 1UPG A; 3DXR A; 5D5P A; 2ZKO A; 1E79 G; 3ZCC A; 4A5U B; 3T1Y O; 3STL C; 3G71 V; 2EIL B; 5B66 Z; 5BMV B; 2XUM A; 1OCC C; 5B1B B; 4LF4 B; 1HR0 O; 1D2D A; 3M99 B; 3VQW A; 2PI5 A; 4LF6 B; 1B04 A; 5JJN B; 2EBO A; 3J81 N; 2WLL A; 4EEQ A; 4AQY B; 3P30 A; 2EIJ C; 3OR6 C; 1LUW A; 5H6Q A; 3SJB C; 4TQD A; 2N74 A; 1HNZ B; 1N32 O; 2ITC C; 1WP7 A; 3DSQ A; 4DW1 A; 2IJH A; 4X9Q A; 4WF9 V; 4O2B A; 4LCU C; 4I4T B; 1F7Y A; 1BQZ A; 4LWS B; 3JAL B; 1TA8 A; 3SPG A; 1VP7 A; 4DRX A; 4J9Y B; 3AG1 B; 5B1A B; 2UUA O; 3ASN C; 4IT5 A; 2HR3 A; 5DEC A; 3L72 H; 4NKG B; 2A9H A; 4ZKI A; 4JI1 B; 3TK1 A; 1P7B A; 1XQ8 A; 1K33 A; 1EFR G; 2X0L A; 1SQP H; 4DV7 B; 2B5U A; 1FAF A; 5JQG A; 1IVS A; 4LF4 O; 3OD4 A; 1Z2G A; 1IZ3 A; 4OGQ B; 4YY3 B; 4QGP A; 2JEX A; 1SC5 B; 2X6A A; 2YUA A; 1JFF B; 3CEI A; 3GB7 C; 4GKK B; 4J7J A; 2QE7 G; 3RGB A; 3B40 A; 2EIK B; 1R3K C; 3AEI A; 4MVR A; 1L1F A; 3RYI A; 4OPH A; 3JAR B; 3TXS A; 2PYL A; 4AQY O; 4UVA A; 3E8B A; 1BMF G; 1OZ0 A; 1VQN V; 4LF9 B; 2LJ2 A; 5LOV A; 2HEP A; 1CPY A; 1HNZ O; 1CXZ B; 1N36 B; 3K5O A; 4HZ3 A; 3RVY A; 4UVC A; 1V55 B; 3LNM B; 4RO2 A; 2F93 B; 3AG3 B; 2BTQ A; 3ASO C; 1H2G A; 2HG5 C; 1S5H C; 3WB1 A; 2F1M A; 2QEX V; 4DXW A; 1N4C A; 3CX5 F; 4RUE A; 4I55 B; 1K34 A; 4JI1 O; 1F4N A; 1IX9 A; 1M5I A; 1ZTE A; 1Q86 W; 3K04 A; 4LF7 B; 2Q68 A; 1YF2 A; 1ZL8 A; 3B2E E; 4DV7 O; 2GUZ B; 3K79 A; 2JJ2 G; 2IJI A; 2A7W A; 2JVD A; 2E75 B; 2OWO A; 4YXW G; 4YY3 O; 4GKK O; 4CC5 A; 5BMV A; 2PZS A; 3ETQ A; 2EIL C; 2EIN B; 3BVO A; 1RPO A; 2OTL V; 3TXQ A; 1MG1 A; 2YXY A; 1L8D A; 4JZG A; 5ITZ B; 4LF9 O; 5CBH A; 5E79 Z; 1NVP B; 2H8P C; 1GRJ A; 3FAV A; 4PEL A; 1XRE A; 3CCS V; 3QO8 A; 1N36 O; 2LP7 A; 2R9R B; 3H01 A; 1QHT A; 1Q6I A; 1YXB A; 4P2Z A; 4UUJ C; 4FLX A; 4X1I B; 4JI6 B; 4I4T A; 3MHS C; 1VF6 C; 3CC2 V; 4JI3 B; 1Y4M A; 3JAS B; 2CGO A; 4MW3 A; 1B6Q A; 1BCC H; 1S5L Z; 3F5W C; 5J2T A; 1E1Q G; 2Z3Y A; 1YHQ V; 3ZS8 C; 3S3W A; 2BSK B; 4Z1M G; 1AI5 A; 3FFQ A; 5B1A C; 5LMU O; 5CBG A; 1TUE B; 5C8Y B; 2XAS A; 1XNQ O; 1OCZ B; 2XAJ A; 4LF7 O; 5KMG B; 3FX7 A; 5CMU A; 1NVP D; 4O2A B; 2X6C A; 1EN4 A; 4YJ3 B; 5L3F A; 3PN1 A; 2Y0P A; 5A2Q N; 4JV5 B; 1QR8 A; 1Y66 A; 3SYQ A; 1Q7Y W; 5C93 A; 2HHH B; 1FXV A; 3ABL B; 4Q20 A; 4JYB A; 4X1K B; 5IYB O; 4I0X A; 1OCR B; 1JFF A; 4LNU A; 3L70 H; 2B1I A; 4UCV A; 3CCV V; 4H13 B; 1YEW A; 1SES A; 3CWB H; 3JAR A; 1NU1 H; 3T4Z A; 4U7O A; 2EIK C; 5EZY A; 2FKX A; 4MVU A; 5CA0 B; 4K0K B; 2O57 A; 3VBB A; 3I5D A; 3R65 A; 5BR8 B; 5BXZ A; 1ZSP A; 1VQP V; 3KZI Z; 5IJ9 A; 2OIG A; 4NXM B; 2ZIN A; 5CA1 A; 4BIZ A; 2RJZ A; 1IBL B; 3OTF A; 4GUN A; 1H2L A; 4JI6 O; 4N23 A; 4DV5 B; 3CRC A; 1KB9 F; 4JAS A; 5K1P A; 1V55 C; 4JI3 O; 3E89 A; 5LXT B; 1TGO A; 1RPR A; 4WFG A; 4QE9 A; 3CCL V; 1KKD A; 4Q6G A; 3N2K B; 3MAQ A; 3X2Q C; 2CAZ C; 4DR5 B; 3P3N A; 3BFR A; 3UCS C; 3SYA A; 3L9D A; 2L6L A; 5LHH A; 4BW9 A; 1V54 B; 3RYH A; 1JX9 A; 1GMG A; 4JYC A; 5KAF Z; 3BAB A; 3VQX A; 3OE7 G; 3IFX A; 2FTK A; 5E1A C; 1I0H A; 2IH1 C; 4FM2 A; 2XOK G; 4JV5 O; 2QGN A; 4B08 A; 1TAE A; 3ZHS A; 4K8Z A; 4G28 B; 1WPX A; 2HHH O; 1QVF U; 5EYP B; 3SYP A; 3RVZ A; 5LA6 B; 1ZLZ A; 3FB8 C; 1PNM A; 2EIN C; 5JH7 A; 3QG5 A; 4K0K O; 2P06 A; 3JYC A; 3QO5 A; 5BR8 O; 2CTP A; 3W7S A; 4OXS A; 4GT1 A; 3K57 A; 4LFA B; 4NXM O; 5IY5 B; 4EKW A; 1RP3 B; 4FLZ A; 2QWR B; 3RFR A; 1IBL O; 4GX2 A; 2Q7H A; 4LR3 A; 4DV5 O; 3VOU A; 3GVM A; 4WBN A; 2UXC B; 4I50 B; 4ZHQ B; 4X1I A; 1F4M A; 1AJN A; 4J42 A; 4JTD B; 1W0J G; 3A8T A; 4DR5 O; 1SA0 A; 1R1B A; 3T2M A; 3HKB B; 1QQC A; 1SS3 A; 3P32 A; 3CE2 A; 2OTJ V; 4Z1V A; 3BAA A; 1WP8 A; 2NN4 A; 4PDV A; 4H37 A; 2LGW A; 1W2B U; 5J2U B; 3CB2 A; 1H38 A; 4TV8 A; 4F6R B; 2K1E A; 3F5T A; 2BE3 A; 3DTU B; 4O4J B; 3I56 V; 4EB6 A; 1GKF A; 2F4V B; 1BQ0 A; 1U96 A; 1PNL A; 4J7K A; 2DE0 X; 2CTQ A; 1VQ6 V; 1FXK A; 4YIP A; 1NTM H; 1R3I C; 2V4D A; 1YDX A; 4LBE C; 4HNA B; 4B3M B; 4GZR B; 1P84 F; 3ABL C; 4FZ0 A; 2WWW A; 4UFZ A; 3E35 A; 2YIA A; 4LFA O; 4CH5 A; 1VIB A; 1QU7 A; 2PI4 A; 2AZ2 A; 4YJ2 B; 3D3I A; 2A0L A; 4LH7 A; 3JCU Z; 2QTS A; 4CS4 A; 1A32 A; 1DK1 A; 2UXC O; 1VQ4 V; 2RN9 A; 1M4U A; 4DR1 B; 1KKC A; 3ZHT A; 1SZT A; 5JVD B; 4B7E A; 4X62 B; 3APQ A; 4R6Z A; 4X66 O; 1S5J A; 2CTW A; 1I7F A; 1GN6 A; 4D7S A; 1NS1 A; 4GYC B; 2Y69 B; 1KP3 A; 2WLM A; 3I55 V; 4GKJ B; 3ZMU A; 2ILM A; 2PGG A; 3J80 N; 3H1L H; 4DW0 A; 1S72 V; 4CBC A; 1K92 A; 5KHG A; 1Z5V A; 4DO2 A; 2CK3 G; 4F4L A; 1SQF A; 2H94 A; 1YVW A; 1UJW B; 3SPC A; 3JCZ A; 3RW0 A; 4DR6 B; 4QNH B; 4B3M O; 3HKE B; 4UXN A; 1WJZ A; 1Q82 W; 1PV0 A; 3E8F A; 3SJC C; 1QBZ A; 3WB2 A; 4FPP A; 4X89 A; 5IJ0 B; 1MMM A; 1NZ6 A; 2GHY A; 2E76 B; 4P30 A; 2WA4 A; 4H33 A; 2P67 A; 1XUQ A; 4NYK A; 2E3C A; 1BHA A; 3JSN A; 1GO3 F; 4J7Z A; 3W7X A; 1Q5O A; 3VQY A; 1VQ8 V; 1O9H A; 3AK1 A; 2IM9 A; 2A06 H; 3OMA B; 3ETD A; 3LDC A; 4FIP C; 2IJK A; 4WFB V; 1M1K W; 2YIC A; 4D7T A; 5IY5 C; 4U7N A; 3OUS A; 2QKS A; 2UXX A; 4DR1 O; 4UB8 Z; 1HDJ A; 5DED A; 4ZHQ A; 4B3S B; 4X62 O; 2ZT9 B; 5JCO A; 4FJC C; 3BEH A; 1AR5 A; 5JCO C; 2AHY A; 2KG7 B; 3G80 A; 4GKJ O; 1NH2 D; 2YXH A; 1B06 A; 4UV9 A; 2Y0I A; 3S3X A; 1IDS A; 4XDK A; 3TET A; 4GCZ A; 2FYU H; 3ZBH A; 3ZRW B; 4WFH A; 5J2U A; 3HKC B; 2NNU A; 2Y48 A; 2WLJ A; 4O4J A; 4PDL A; 4D6T H; 3AG2 C; 2Q9L A; 4YHH B; 4DR6 O; 3AK2 A; 3ZMZ A; 5BY1 A; 2WLK A; 4IHJ B; 5K1X A; 4UCO A; 1SF9 A; 5AG2 A; 4QIW F; 3UT5 A; 2LFS A; 2R9A A; 3T1C A; 2QWO B; 1QR9 A; 2P4V A; 2ZE6 A; 5KLV H; 5GTI Z; 1VQM V; 4JF3 A; 2DW4 A; 5B3S B; 5CB4 B; 3LUT B; 4BWA A; 4YJ2 A; 2RMK B; 2IBZ H; 1ZUQ A; 4U3F H; 2MK3 A; 1I94 O; 4QE7 A; 1WB7 A; 1U97 A; 1PKX A; 1VQ5 V; 4KFM A; 1YTF D; 4B3S O; 1EZV H; 1YJN V; 4JZ2 A; 4X8A A; 4FK5 C; 1NI8 A; 2ETN A; 3SR2 C; 2GDS A; 4MTF A; 1RM1 B; 3CXC U; 4E4E A; 2YDE A; 1DF4 A; 4DUZ B; 1Y76 B; 5B1O A; 2IJJ A; 3ZMS A; 4O4L B; 1XI1 A; 2PF4 E; 3H1H H; 4G27 B; 1XOU A; 4YHH O; 4DV1 B; 3ABK B; 3IAY A; 2N04 A; 4GX0 A; 1Q3E A; 2H3O A; 2Y4T A; 1PM9 A; 3K03 A; 1EN6 A; 3HKE A; 4TQF A; 2P7T C; 1KMI Z; 5IJ0 A; 4YIO A; 4DR2 B; 1P4R A; 2BOB C; 2IW5 A; 1J5E B; 2CH7 B; 2ZIM A; 3CSX A; 1THZ A; 3WFV A; 1HWY A; 5KX5 B; 2OCC C; 3T4D A; 5KA5 A; 3G6B A; 3TCU A; 4JI8 B; 4RAI A; 1AP5 A; 1S76 D; 3CRM A; 1Q6U A; 4TWK A; 1K5Q A; 4TUY B; 4IYI A; 3LSU A; 5BZB A; 4QJF B; 2VQE B; 4MSW C; 3ZHV A; 1RSO B; 3Q4H B; 4DV2 B; 2VWJ A; 4UV8 A; 3W7T A; 3K5M A; 1Y74 B; 2OT5 A; 3ABM C; 1NR7 A; 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