The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
EVQQPDPMRKNWIMENMDSGVIYLLESWLKAKSQETGKEISDIFANAVEFNIVLKDWGKEKLEETNTEYQNQQRKLRKTYIEYYDR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray crystal structure of hypothetical protein NE0241 from Nitrosomonas europaea.
rcsb |
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Nitrosomonas europaea
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| molecule keywords |
hypothetical protein NE0241
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| total genus |
29
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| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | NE0241-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZX3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1E1Q G; 1H2G A; 4E2L A; 1PNM A; 3WB1 A; 2X6B A; 2UUB O; 2BSK B; 3A0B Z; 2Y48 A; 1VQK V; 1ZL8 B; 5JVD A; 4X88 A; 5HFM A; 2Z5U A; 1N32 B; 2GV9 A; 3UKM A; 4LWS B; 2UUC O; 1XEQ A; 5L3C A; 4MT8 A; 1IBL O; 3LDE A; 4Q6G A; 4H0L B; 3ZHU A; 3BAB A; 2P67 A; 1BQ0 A; 1QQC A; 5IJ0 A; 3AG4 B; 4LBE C; 4DUY B; 3ABK B; 4NXM B; 3TK1 A; 4DV3 B; 2VQF O; 2UXD B; 3D36 A; 2HVK C; 1WJZ A; 3FX7 A; 3OGI B; 1VQL V; 2CGN A; 3OR7 C; 2ZE6 A; 4YJ2 A; 2DYR B; 4RAI A; 1UPG A; 3RYH B; 3ETD A; 2EIK B; 1B3Q A; 1K97 A; 2FYU H; 3M7M X; 5B66 Z; 3JAR A; 1S76 D; 1JJO A; 1SER A; 1BQZ A; 3OAA G; 2F93 B; 3SYA A; 2PYL A; 3JCZ A; 5KHI A; 4NR1 A; 1SQX H; 4FLY A; 3K03 A; 4EFB A; 5IE9 A; 1M5I A; 1HNW O; 1PNL A; 3EXA A; 4DV1 B; 5BR8 O; 1Y66 A; 4DV2 O; 4U3F H; 3B40 A; 1G4Y B; 4JYC A; 1MA1 A; 4UCU A; 2RJZ A; 4DV7 B; 3ZHQ A; 2F43 G; 4RWU A; 4DXW A; 2Q69 A; 2ZIO A; 4B3S O; 4CS3 A; 2X6C A; 2P4V A; 1I5Y A; 1VQ9 V; 2JK5 C; 2KKW A; 3UQ8 A; 2NR5 A; 1YSC A; 5EYP A; 1KEC A; 1BCC H; 1FFT B; 5CB4 B; 4H13 B; 3BCC H; 4HBN A; 1VF6 A; 2WLJ A; 4GKJ O; 4YXW G; 1TAE A; 1RFY A; 2CDY A; 2YDE A; 1FJG B; 1MSW D; 4X1Y A; 1O9H A; 1TA8 A; 2A06 H; 3ZHS A; 1RM1 C; 4DV0 O; 3UT5 A; 3O9O A; 1Q5O A; 4U7N A; 5C93 A; 1GK9 A; 2EIM B; 4IL6 Z; 5IYC O; 2DN9 A; 1SQQ H; 4JI5 O; 4YIO A; 4LF6 B; 1M90 W; 1KUQ A; 1QHT A; 1N33 O; 1RPO A; 3F5W C; 3LDD A; 3BY6 A; 2AW9 A; 4FIP C; 3ZMU A; 2QM7 A; 3OW2 U; 1H8E G; 3KKY A; 1URF A; 3BA9 A; 3CCR V; 4I0X A; 1JR9 A; 2JJ1 G; 2F95 B; 4FLT A; 4G2K A; 2IU3 A; 2DE0 X; 3L71 H; 5LA6 B; 2LFR A; 4LH7 A; 3HPL C; 4PDL A; 1DTO A; 4IT5 A; 4O2A A; 4JV5 O; 1Q81 W; 4DR3 O; 4DR2 B; 5LOV A; 1SA0 A; 3W7W A; 4GLX A; 5EIB D; 1HR0 B; 1K34 A; 4JAA A; 5C8Y A; 2WPD G; 3C3T A; 5EBL C; 2BOB C; 5LMU O; 4LFB B; 4CBC A; 3EVK A; 1CPY A; 3RYI A; 5JQG B; 4K8Z A; 2CK3 G; 3JYC A; 3ZCC A; 1P7B A; 4CH4 A; 1PNK A; 1Q6I A; 3FAV B; 2WA3 A; 3CB2 A; 4YY3 B; 4YJ3 B; 4MTX A; 1HW7 A; 5K1P A; 4PA6 A; 3K5N A; 4NVP A; 2IJJ A; 3E8F A; 2DQ0 A; 4DV4 O; 4DV5 O; 4D7S A; 1XHZ A; 2GTA A; 3CYO A; 3PN1 A; 2JEX A; 3OMN B; 4O4I A; 1V55 C; 4NB5 A; 2GBO A; 3AEI A; 4JI3 O; 1WA8 B; 1YTF D; 4UB8 Z; 4KHP O; 2YC0 A; 4W4K A; 1PL4 A; 1H2N A; 1QLN A; 3QTC A; 2UUA B; 2EIL C; 2QM4 A; 1Q6U A; 2C2A A; 4JGS A; 1VQ8 V; 3CWB H; 1MMM A; 3WFV A; 3H9V A; 3SJA C; 1YI2 V; 1V54 C; 5LBQ A; 5F2V O; 1OCC C; 1NBM G; 4UCS A; 1IDS A; 4O4J A; 1SQB H; 3SPC A; 2D3O W; 3CRA A; 1BGY H; 1ZX3 A; 3ZMT A; 1QLE C; 3T1H O; 1S72 V; 1NTK H; 4AHC A; 2Q4P A; 2MK3 A; 1MAB G; 2ZR2 A; 2RDC A; 3BRC A; 1S3J A; 2LFS A; 1AIL A; 1SES A; 5CA0 B; 1EFR G; 4QPJ A; 4J11 A; 3ML0 A; 4X1I A; 4DUY O; 2ZDI A; 4NXM O; 4JI2 B; 3JAL A; 1AR1 B; 1X4T A; 1JX9 A; 4ABM A; 4JAV A; 3BA8 A; 5H6R A; 3RVY A; 3H01 A; 5KAI Z; 2OIG A; 3E83 A; 2OTJ V; 1OCO B; 4UVB A; 4OXS A; 1XHX A; 4LWS A; 2UXN A; 4J10 A; 1KD1 W; 3HKB B; 1N4C A; 2AHZ A; 1K73 W; 4NXN O; 3L9D A; 1NI8 A; 1F51 A; 3JAS A; 1YF2 A; 2E5L B; 5IY5 B; 3SYO A; 1I0H A; 2QJ1 A; 2P4K A; 5L3E A; 2EJR A; 4JPR A; 3IGA C; 2CE4 A; 4FVM A; 4XBF A; 3WB0 A; 3RYH A; 4DV7 O; 5B1B B; 4UCO A; 3HKC B; 2A9H A; 3SYC A; 1D5A A; 3SDL A; 3TGU H; 3SR2 C; 5GON B; 2E3C A; 2HVJ C; 4ICG A; 3C3S A; 4GX2 A; 2PZS A; 4JYB A; 5KUM A; 4PDR A; 1AI5 A; 1Y76 B; 4JYA B; 4R8C A; 3SPH A; 4TV9 B; 5FL7 G; 1KP3 A; 1M57 C; 3OR6 C; 3CP1 A; 3H1K H; 1GTO A; 4QE7 A; 4HAM A; 4TV8 A; 1ORQ C; 5DM6 V; 4I9W A; 4QNH B; 4LF7 B; 1FXK C; 4GT1 A; 1BHB A; 1K33 A; 1L0N H; 4IHJ B; 1VP7 A; 4NKG B; 2O57 A; 5JVD B; 1RPR A; 1DLB A; 1S5J A; 4X9Q A; 4LF6 O; 3RFR A; 2ADP A; 3G4S V; 2YIA A; 4WFB V; 3D3Q A; 1I5X A; 1PL0 A; 4FLX A; 3F7V C; 4NTW A; 1KMI Z; 1SZX A; 2EIN B; 4WCE V; 1S77 D; 2IU0 A; 3K59 A; 4DR1 O; 1YDX A; 1L8D A; 3JAW A; 2PF4 E; 4R6Z A; 4K0K O; 1RP3 B; 5IJ0 B; 2P22 C; 2PGG A; 4P9P A; 4UFZ A; 3DSQ A; 3GWO A; 4GKK B; 3QF7 A; 3OT7 A; 1V9P A; 4LF8 B; 2YIC A; 4BAY A; 4PV1 B; 1H2M A; 1IBL B; 2P7T C; 2QEX V; 4YJ2 B; 1PKX A; 3STL C; 2KG7 A; 3D3I A; 3JAR B; 3JD4 A; 2IBZ H; 4K35 A; 2XAH A; 3CD6 V; 4D7T A; 5JJN B; 3OMI B; 3ZRS A; 5LHG A; 1Q6H A; 3VQV A; 1U96 A; 5H2F Z; 4A5U B; 1GAX A; 1HDJ A; 4O2B B; 3P32 A; 4UVA A; 2WLI B; 3T4Z A; 1EM1 A; 2HHH O; 1K9M W; 5LGN A; 3F7Y C; 1K7D A; 1Q8I A; 5E79 Z; 3AG4 C; 4FK5 C; 3TXS A; 3ABK C; 3ABM B; 1HNW B; 4WF9 V; 5BR8 B; 3E22 A; 5EYP B; 3SPJ A; 3ZMS A; 4KUM A; 2LQT A; 1UJW B; 1E1R G; 3OGC C; 4UV9 A; 1GN2 A; 2YIB A; 4PEL A; 2UUA O; 2B1I A; 1QBZ A; 2K9P A; 1R6T A; 1AP5 A; 3B8N A; 2DYR C; 4GCZ A; 5IWA B; 5JCO C; 3E89 A; 4X1Y B; 2EIK C; 5AG2 A; 2Y69 C; 3CCS V; 1F7Y A; 3UT5 B; 4BIU A; 1VQP V; 4B3M O; 2R9R B; 1PV0 A; 4LF5 B; 3BAA A; 3KCY A; 2JS3 A; 3ASO B; 4GKJ B; 3J7A U; 2X0L A; 1GM7 A; 4MW8 A; 4JI8 B; 4JYY A; 3K9A A; 5KHJ A; 4JI2 O; 2Q67 A; 1F23 A; 1GH6 A; 4TWK A; 2OIE A; 2ODM A; 2IH3 C; 1KP2 A; 2B9Z A; 2EBO A; 4I0X B; 2XAG A; 1OCR B; 4ZBM A; 4XDL A; 1I94 B; 5JWP A; 3ABL B; 4O2A B; 5IYD O; 1KB9 F; 5DN6 G; 2CTP A; 5LOV B; 1SA0 B; 3MDS A; 3QG5 A; 5C8Y B; 3CE2 A; 5J9P C; 2E5L O; 3OUF A; 4Z1V A; 3WU2 Z; 3RYI B; 2ITD C; 4KXR A; 1YHQ V; 1S0V A; 1VQM V; 4GX0 A; 3R65 A; 4JV5 B; 1FS0 G; 1FKA O; 2ZQM A; 4QJF B; 3K06 A; 5LMU B; 2H8P C; 4EKW A; 4E4E A; 3E35 A; 4AI8 A; 4UB6 Z; 1EBO A; 2EUL A; 1E79 G; 4O4I B; 3EHB B; 1GM8 A; 3RYC A; 4JYA O; 1R6K A; 2XAJ A; 1Y67 A; 1W2B U; 3E8B A; 3QO8 A; 3B77 A; 2L6L A; 1K5Q A; 1MZF A; 2UXC B; 4FZ0 A; 4JZ2 A; 2Q0O C; 2JJ2 G; 1PP9 H; 1YTF B; 4QGP A; 3AG7 A; 2AGA A; 4JI3 B; 3VQW A; 2YID A; 4KHP B; 4O4J B; 4DW1 A; 3BVO A; 1YZB A; 3ASN B; 4TSF G; 1SET A; 1F4N A; 2JGD A; 4PJ0 Z; 4DYL A; 3NXS A; 4NYK A; 2QKS A; 2JDI G; 2P5O A; 2A7W A; 4X1I B; 2WAM A; 4TT3 G; 3K0D A; 4IHJ A; 3EFF K; 3I5D A; 3JAL B; 2N05 A; 5GTI Z; 1IUR A; 4NTX A; 1AI7 A; 4GKK O; 4JAS A; 4LF8 O; 3FKS G; 5BMV A; 3T1H B; 1NVP D; 3ZRV A; 2UXB B; 4GZR B; 3ZN0 A; 3E8H A; 1XUQ A; 4QE9 A; 2N04 A; 4LF4 O; 2AZ0 A; 2WLN A; 3K5M A; 1PPJ H; 4LH6 A; 5JJJ B; 3HB3 B; 3JAS B; 4BW9 A; 3J81 N; 3AG1 B; 1YCI A; 4JTA B; 5KUK A; 1CEZ A; 3VQY A; 3PJS K; 2LW1 A; 3SYQ A; 2PTM A; 1Y74 B; 3P3P A; 2P90 A; 2HFE C; 1VQN V; 2Q8V A; 4FLW A; 4NXN B; 2Y4T A; 4H44 B; 3RVZ A; 4RQF A; 2FML A; 4FZ1 A; 1WP7 A; 1TGO A; 1IX9 A; 2NLJ C; 1NTZ H; 2RNB A; 4MVU A; 4FJC C; 5LXT B; 1OCO C; 3U0Z A; 4UCR A; 4CH5 A; 4O2B A; 2WLI A; 3ETQ A; 4TV8 B; 5IWA O; 1I7F A; 2WLK A; 3CEI A; 3T2M A; 4B08 A; 4EB6 A; 2LO1 A; 2V4D A; 5IY5 C; 2CTQ A; 5IYZ A; 1N8R W; 4FLV A; 1Y4M A; 1VQO V; 1F4M A; 4CC6 A; 4LF5 O; 4KFM A; 2A79 B; 2EX3 A; 4UUJ C; 2QGN A; 2DYS B; 2YEV B; 1OHH G; 3B2E E; 3U11 A; 4JI8 O; 4PI0 A; 1AI6 A; 1AR4 A; 3JAW B; 5B1B C; 3N2G A; 1XNQ O; 2PUS A; 4FPP A; 1ENV A; 1NS1 A; 3AK3 A; 4FFK A; 1ZSP A; 2EZO A; 1YJ9 V; 4XDK A; 3A2F A; 3CCM V; 2XT9 A; 3RW0 A; 1I94 O; 4DR1 B; 5BZB A; 2YS8 A; 2Q0A A; 5B1A B; 1DK1 A; 2XHB A; 4H33 A; 2KG7 B; 4K0K B; 4J41 A; 4N23 A; 3SPG A; 3KZI Z; 4D6T H; 2R70 A; 3E2E A; 1ZTE A; 1ZUQ A; 4CS2 A; 3ZMV A; 4UCT A; 1ZWI C; 3H1L H; 1Z5W A; 4X64 O; 2F4V O; 4RQE A; 5HFL A; 1BL8 A; 1LNQ A; 3JSL A; 2IJH A; 2EIN C; 4X20 A; 3APO A; 1IXM A; 1DF4 A; 4ASU G; 1VF7 A; 2H3O A; 3UO2 A; 2QM8 A; 3CMA V; 1K92 A; 1VQ7 V; 2XAS A; 3ZX6 A; 1JQ0 A; 1WP8 A; 3RGB A; 1AI4 A; 3E22 B; 3D36 C; 1MSD A; 4OPA A; 3L75 H; 1XOU A; 3NR7 A; 4QPK A; 1EN4 A; 1SS3 A; 1UFI A; 4FMT A; 2HHH B; 3G80 A; 3F5T A; 2HEP A; 2UXC O; 2Z0A A; 3C90 A; 1YJN V; 4ZOL A; 2YXY A; 5EBW C; 3QVN A; 5K1X A; 1JVM A; 3AK2 A; 4JAU A; 2W6J G; 2AZ2 A; 1CP9 A; 3E8G A; 4PA3 A; 3BEH A; 4O4H A; 1NKD A; 1GM9 A; 3OE7 G; 5E1A C; 3K9S A; 5JH7 A; 3GB7 C; 3N2K A; 3W7S A; 1N0J A; 2Q6A A; 4B3M B; 5FPR A; 3ABM C; 4LF9 B; 3FYE B; 3LNM B; 1XL4 A; 4X62 B; 3QO7 A; 3P30 A; 3UM7 A; 2UXB O; 1GN6 A; 1NT2 B; 1VF6 C; 2XAQ A; 3GVM A; 2ZD9 A; 4G28 B; 2ATK C; 4ZIB A; 2DWD C; 1N0N A; 2EIJ B; 4AQY B; 2CH7 A; 1BE3 H; 1OCZ B; 3ASO C; 4LFC B; 5CN0 A; 4JI6 B; 3STZ C; 1YIJ V; 1BZK A; 1SC5 B; 2ZE8 A; 5KAF Z; 2MW2 B; 1IVS A; 2RMK B; 2QA4 V; 2CTW A; 2QR4 A; 4DUZ O; 2AHY A; 5LHH A; 2K1E A; 3S3W A; 4RO2 A; 3CPW U; 3T4D A; 3RYC B; 3K04 A; 1Y74 A; 1OCR C; 1YVW A; 2R9I A; 4X66 B; 2KB1 A; 2Q5Z A; 1HNX O; 3ABL C; 1XRE A; 3H1H H; 4ZKI A; 3CXC U; 4KP4 A; 2JVD A; 2RN9 A; 2GHY A; 4W4L A; 1DGS A; 4I7Z B; 4DR7 B; 5KMG A; 1S5L Z; 3ABT A; 4JZG A; 5LXT A; 3RBZ A; 2VS0 A; 2NNU A; 5LP6 A; 2OTL V; 4WFA V; 3ZRW A; 4PI2 A; 2LJ2 A; 2CAZ C; 1RM1 B; 2JGD B; 4DK1 A; 3JAT A; 4OX9 O; 5EIB C; 1WAZ A; 2DOS A; 4DRX A; 4J80 A; 5GW7 A; 2QTO A; 2LP7 A; 1QVF U; 3JAK A; 2VRZ A; 1XNR O; 5BMV B; 3RWR D; 1SZT A; 5CMU A; 5BXZ A; 2YEV A; 4J7J A; 1NH2 D; 2ZKO A; 4N21 A; 4MTG A; 3AG3 C; 1L0L H; 3Q4H A; 5ITZ A; 4O4L A; 4G27 B; 3LSS A; 3W7U A; 3BHP A; 3AG2 C; 4WFH A; 3CME V; 2ZXW B; 1K4C C; 3MD0 A; 2F66 C; 5LGU A; 4JI0 O; 2ZM6 B; 1NVP B; 1FYJ A; 4JI7 O; 2PYJ A; 3TET A; 4TOI A; 3HKD A; 1EN6 A; 3L73 H; 4LF4 B; 2JEU A; 4FFB A; 3APQ A; 1HP8 A; 1JOY A; 3JCU Z; 3JD1 A; 2QWO B; 4LC1 A; 4TQF A; 1W59 A; 2ILM A; 4B3T O; 3MHH C; 1TUE B; 2W0X A; 2ZDI C; 1WPX A; 2HJD A; 2Q68 A; 3SJQ C; 3U10 A; 1BS3 A; 4TUY A; 4J9Z B; 3FD9 A; 4WFG A; 2HLD G; 2E74 B; 1Q82 W; 2BOC C; 4FM1 A; 3ZHV A; 2E76 B; 3DXR B; 1XMO B; 1W0K G; 1SQV H; 1X59 A; 3AG1 C; 4EB6 B; 5LHI A; 5IYZ B; 5J2U A; 2HR3 A; 3CS5 A; 5B3S B; 4MVO A; 2G38 A; 3JSN A; 4EEQ A; 4H37 A; 2D2C B; 4RUE A; 1IXB A; 4B7E A; 4X8A A; 3N2G B; 4CZZ A; 1ZLZ A; 4CS4 A; 3DTU B; 4UV8 A; 1JFF A; 5D5P A; 1Q43 A; 2LGQ A; 4LR3 A; 4LF9 O; 1QR8 A; 2CGO A; 3T1Y B; 4YHH O; 4X62 O; 1FD9 A; 4JTD B; 3FB6 C; 3DC6 A; 4LNU A; 1KU9 A; 4DK0 A; 1H2L A; 2JS5 A; 1XNQ B; 2L35 A; 4J9Y B; 5B5E Z; 5KX5 A; 2OCC B; 2R72 A; 3MHS C; 2GDS A; 1M1K W; 1AB3 A; 3K0G A; 1AR5 A; 2ARH A; 4DR6 O; 4AQY O; 1D2D A; 4IIJ A; 1QCE A; 5CBG A; 1R3L C; 4LFC O; 2JGU A; 4JI6 O; 4LFA O; 2Z3Y A; 3JD2 A; 2DYS C; 2P06 A; 4X20 B; 2RCV A; 4BWA A; 1JCH A; 3A8T A; 2QWQ B; 3IAY A; 1U97 A; 1LUW A; 1QU7 A; 2EIM C; 4P2Z A; 4DO2 A; 4C7U A; 4X64 B; 1IBM B; 2Q7G A; 3JAM N; 2WLL A; 2ZNI A; 2F4V B; 3CX5 F; 4X66 O; 3THO A; 4FLZ A; 1YEW A; 2ZIN A; 2ETN A; 2ZIM A; 5B1A C; 1IBK B; 4U3J A; 1MG1 A; 3WB2 A; 2RQ6 A; 5EZY A; 1GRJ A; 4J42 A; 1I08 A; 4ZOL B; 2X7R B; 2Q7E A; 4DR7 O; 2Q73 A; 1P49 A; 5H6Q A; 4B7K A; 4NTY A; 5LYJ A; 3GWK C; 1M93 A; 2YI8 A; 2P6J A; 5KHG A; 3VQX A; 3H1J H; 4O4H B; 3ICX A; 2WLM A; 4J7K A; 3CJH A; 2W0F C; 5JH7 B; 2CTR A; 1R73 A; 3N2K B; 3JD3 A; 5GTH Z; 3K5O A; 1NZ6 A; 4X65 O; 1FAF A; 3FB8 C; 4I4T A; 2HJF C; 3CC4 V; 1YIT V; 5A9G A; 1N36 O; 2IM9 A; 4MVS A; 2UU9 O; 4DV6 B; 5KA6 A; 2JRI A; 1Q7Y W; 3CRM A; 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