The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
88
|
structure length |
88
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKNKSPDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of J-domain from human DnaJ subfamily B menber 9
rcsb |
| molecule keywords |
DnaJ homolog subfamily B member 9
|
| molecule tags |
Chaperone
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
17
|
| structure length |
88
|
| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QWR B; 1WJZ A; 2QWN B; 2CTQ A; 1FPO A; 2KQX A; 2N05 A; 2PF4 E; 3BVO A; 2CTW A; 1FAF A; 2Y4U A; 2Y4T A; 1GH6 A; 3UCS C; 2CTP A; 2L6L A; 2CTR A; 2YUA A; 4IT5 A; 2YS8 A; 3APO A; 2GUZ B; 2GUZ A; 1N4C A; 2QSA A; 2QWP B; 2OCH A; 1NZ6 A; 3APQ A; 3UO2 A; 1XBL A; 2M6Y A; 2DN9 A; 2EJ7 A; 2DMX A; 1BQZ A; 2QWQ B; 2QWO B; 1BQ0 A; 1HDJ A; 3AG7 A; 2N04 A; 4J7Z A; 2LGW A; 3UO3 A; 4RWU A; 2LO1 A; 1IUR A; 2CUG A; 4J80 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2YI9 A; 1NI8 A; 4H13 B; 2Y4T A; 4PA9 A; 3E83 A; 1Y76 A; 3DC5 A; 3KG2 A; 2HJD A; 4KP4 A; 1YJW V; 4MVU A; 5B1A B; 4BIZ A; 1YIJ V; 4I55 B; 4BIO A; 4DV2 O; 2G38 A; 4ZI7 A; 1I5Y A; 2EIM C; 4R8C A; 2IM9 A; 1WN7 A; 2JGU A; 3BVO A; 3QTC A; 3H1J H; 1JFF A; 4JI1 B; 2EIK C; 2KKW A; 3K06 A; 2H94 A; 3HKB A; 2BTQ B; 3W7T A; 3APQ A; 1DGS A; 4JI4 B; 4YIP A; 2QKC A; 3JAW A; 4KHP O; 3W7X A; 5EYP B; 3ABT A; 1YVW A; 3G71 V; 5H6Q A; 2AGA A; 1WJZ A; 1PD3 A; 4X1Y A; 5KA6 A; 1OJH A; 2IW5 A; 1ZAU A; 4BAY A; 2RNB A; 4X65 O; 1SKV A; 2JJ2 G; 2LP7 A; 4LBE C; 4JI5 B; 4GCZ A; 2B1I A; 5DM6 V; 2EIL B; 2EZP A; 4GZR B; 2XHB A; 5CN0 A; 4CC6 A; 2P06 A; 2F66 C; 1FJG B; 2JDI G; 1MG1 A; 3JAK B; 4K35 A; 2UXN A; 1AIL A; 1GN2 A; 4JAU A; 5CBF A; 1R6T A; 1QHT A; 5BR8 O; 4BIU A; 4DK1 A; 4FLX A; 1QBZ A; 3OD4 A; 3L72 H; 5EBM C; 3K08 A; 1LUV A; 1SES A; 1V55 B; 4KFM A; 4I50 B; 4LR3 A; 3F7Y C; 2KG7 B; 1XMO B; 5L3F A; 4ZIB A; 2JGD A; 1Y67 A; 2EBO A; 2HVK C; 2KB1 A; 4YHH O; 3SGI A; 1QLE C; 1HNX O; 1Y74 A; 5B3S B; 1XBL A; 3UT5 A; 1JJO A; 3SPJ A; 5KHH A; 1Q43 A; 4I0X B; 4X62 B; 4Z1V A; 2C2A A; 1RSO B; 1SQB H; 3D3Q A; 2AXT Z; 4DUZ O; 4I5S A; 3SDL A; 1WA8 A; 3ZMS A; 4UVC A; 1SQF A; 5DEC A; 5LXT A; 5J9P C; 5FL7 G; 1SER A; 3IGA C; 5B5E Z; 4GLX A; 5A2Q N; 1VQ4 V; 1H8H G; 4DV6 B; 4K0K O; 1S5L Z; 4CH3 A; 3QF7 A; 5GTH Z; 3M99 B; 4O4J B; 4X66 B; 4J41 A; 5KMG B; 2YXH A; 1Y6X A; 3CCM V; 3FX7 A; 5L3G A; 2UXC O; 3OW2 U; 3E22 A; 3RYC B; 1FAF A; 4X1I B; 3ZHQ A; 4X8A A; 2IH3 C; 1K5Q A; 1E79 G; 4QNH B; 3LSU A; 1NJI W; 5ITZ B; 2QKS A; 3SPC A; 3M7M X; 4OGQ B; 2E5L B; 2GSM B; 1MAB G; 1AI6 A; 1EN5 A; 2VWJ A; 3K0G A; 4B3T B; 4DR6 O; 4MTO A; 4UV9 A; 1QVF U; 2PTM A; 1VQ6 V; 4HZ3 A; 3LDE A; 5JQG B; 1Q6I A; 2ZE8 A; 3AG2 C; 5IY5 C; 2DWE C; 4MTX A; 3ASN B; 4PDR A; 4DO2 A; 3CCU V; 4HNA B; 1S5H C; 3KKY A; 4LH7 A; 3WB2 A; 1YCI A; 5JH7 A; 4LF9 B; 2EZO A; 5E79 Z; 2Y0P A; 2LJ2 A; 5LMN B; 1YIT V; 5L3D A; 1R3K C; 3B8N A; 1F4M A; 1JPX A; 2BTO A; 1XNR O; 2F93 B; 2DQ3 A; 4TT3 G; 3N27 A; 1M5I A; 2JVD A; 3X2Q B; 4Z1M G; 4UV8 A; 4B7E A; 1ORQ C; 2YS8 A; 1ZL8 B; 5C8Y B; 2LW1 A; 2PUS A; 4FLZ A; 4IGG A; 1XMQ O; 2A9H A; 3UO2 A; 5JJN B; 1K33 A; 2Z5U A; 3WFV A; 3ZRS A; 3QG5 A; 4NYK A; 2NR5 A; 2Q4P A; 1AP5 A; 1GKF A; 1N33 B; 3PJS K; 2BSK B; 2EIM B; 3UCS C; 4J11 A; 2NN4 A; 2YSU B; 3BAB A; 3H1L H; 3OMN B; 3ZRW A; 3BFR A; 1AI4 A; 2EIK B; 4DR2 B; 3ZHV A; 5LA6 B; 3B4S A; 1FFX B; 3VOU A; 2XAG A; 4YJ3 B; 3G80 A; 4X20 A; 2WSS G; 4AQY O; 2UUA B; 1VF6 C; 2JIZ G; 1S0V A; 3G6B A; 1FPO A; 1M56 C; 1AR1 B; 4DV2 B; 5EZY A; 1I5X A; 4FMT A; 2R9A A; 5IWA B; 1QQC A; 5IE9 A; 4RUE A; 3CX5 F; 4U3J B; 1N32 B; 2CAZ C; 4TV8 A; 4F6R A; 1Q90 D; 1GN6 A; 3K9S A; 3OMI B; 3ABM C; 3T1Y O; 4JTD B; 3NXS A; 1MA1 A; 1QLN A; 4LP8 A; 1HW7 A; 2H8P C; 2WLL A; 1L0N H; 5D5P A; 3LDC A; 3HKD B; 3FAV B; 3H9V A; 3L74 H; 1VIB A; 1Z5W A; 2ZDI A; 1CPY A; 3S3X A; 4PA4 A; 3LNN A; 2LFS A; 4E2L A; 1NH2 D; 4JZ2 A; 2PF4 E; 4ZHQ A; 3CCJ V; 1SQQ H; 4WBN A; 3GVM A; 2FML A; 4CC5 A; 2DOS A; 3JAS A; 4PDM A; 1F23 A; 3GB7 C; 3LSS A; 1NR1 A; 2XUM A; 3TXS A; 1TVK A; 5CA1 A; 1QLE B; 2ZE5 A; 3SYC A; 1UPG A; 1BL8 A; 2HEP A; 3MHH C; 5HFL A; 4FZ0 A; 4G27 B; 3KCY A; 4JI4 O; 1CP9 A; 4K8X A; 3Q4H A; 3CME V; 3BA8 A; 3RT3 C; 4KXR A; 3WU2 Z; 3N2G B; 5CB4 B; 1Q8I A; 3CE2 A; 2ZE6 A; 3AG1 C; 5CA0 B; 2WLN A; 3ZRX A; 2CK3 G; 4C7U A; 1MMM A; 4P30 A; 4AI8 A; 1SS3 A; 1I94 B; 3CC2 V; 1AJP A; 4IHJ B; 1EFR G; 1M90 W; 1IBK B; 1K8A W; 1P49 A; 4KL1 A; 1AR5 A; 4LWS B; 4MT8 A; 1DF5 A; 1L0L H; 4AIL C; 1DK1 A; 4LFA O; 1XI1 A; 4P9O A; 3GWK C; 1FJG O; 3JAT B; 3CYO A; 2V4D A; 3RWR D; 1P7G A; 4MTF A; 2H3O A; 3HKE B; 5LP6 A; 5IYD O; 3O65 A; 4K0K B; 3A0B Z; 4BW5 A; 2XAF A; 4TQD A; 1RPO A; 5F2V O; 4O2A B; 5A9G A; 4DRX B; 1AB3 A; 2UXC B; 3BEH A; 4NXN B; 4EFE A; 2F95 B; 4JV5 B; 4MVR A; 4FZ1 A; 3ZCC A; 2HHH B; 1MZF A; 1MOF A; 3AG2 B; 3UM7 A; 2FTK A; 3QNE A; 4UCT A; 4CBC A; 1AJQ A; 5GTI Z; 4GX2 A; 3LDD A; 3K5M A; 1XUQ A; 1KKC A; 1ZX3 A; 3ZN1 A; 2YC0 A; 4X62 O; 1GAX A; 2Q0A A; 2RN9 A; 2BOB C; 2B9Z A; 3AG4 C; 3RYH B; 1YI2 V; 1RFY A; 2QWO B; 3JSN A; 1P7B A; 4FM0 A; 4K8Z A; 2NLJ C; 3K04 A; 4DYL A; 2HR3 A; 2WLJ A; 4MVM A; 1BT8 A; 1QR8 A; 3IC7 A; 5JCO A; 4FM2 A; 1FFT B; 1SA0 A; 4CZZ A; 3DC6 A; 2JS5 A; 2Q9L A; 4LF5 B; 3BHP A; 3PN1 A; 5J2U B; 3BCC H; 2Z3Y A; 1OCO C; 3I5D A; 5KHG A; 2HG5 C; 1COW G; 1S3J A; 1XNR B; 2QJ1 A; 1Q82 W; 1RPR A; 2R70 A; 2Q7G A; 2P67 A; 2AHY A; 2QM4 A; 1I08 A; 4Q6G A; 4WFF A; 3CCV V; 2CE4 A; 3E89 A; 5DED A; 2E5L O; 2QDO A; 2YEV B; 4UVB A; 4UUJ C; 2CTP A; 2X6B A; 5B66 Z; 3OE7 G; 2R9R B; 1M56 B; 4EB6 A; 4B3T O; 5BMV A; 3JAL B; 4GKJ B; 2GV9 A; 4GT1 A; 2Z0A A; 2HJF C; 4ZOL B; 1ARO P; 1NQT A; 1BQ0 A; 4DK0 A; 1K3E A; 3FFQ A; 3SYQ A; 1X4T A; 2CDY A; 4O4L A; 2QWN B; 1NVP B; 3CRQ A; 3L70 H; 1Z2G A; 1VQM V; 4LF9 O; 3L75 H; 3T4Z A; 5LOV B; 2UUB O; 5LMN O; 2ZR3 A; 4MS2 A; 1YJ9 V; 2ARH A; 1GRJ A; 3ASO C; 4DR4 O; 4LNU B; 5EBL C; 2FKX A; 4DV3 B; 1YJN V; 3RGB A; 2LW7 A; 1VF7 A; 1P4R A; 3N2K B; 4BW9 A; 2E75 B; 1TA8 A; 4MW8 A; 4IIJ B; 1FYJ A; 1EM1 A; 1GN4 A; 4LF8 B; 3ASN C; 2W6I G; 3OR7 C; 2N74 A; 1N33 O; 1Q5O A; 5FPR A; 1D2D A; 3JAR B; 2JK5 C; 3TGU H; 1G6U A; 4FFK A; 3ML0 A; 4FLV A; 1NKD A; 1EZV H; 4DR2 O; 4FK5 C; 3IAY A; 4O4I A; 4U7N A; 3BY6 A; 5LHH A; 4DUY B; 4JAV A; 1H2L A; 1N0N A; 5KLV H; 1XRE A; 2UUA O; 2X6C A; 2RCV A; 3HKC B; 2DW4 A; 3E86 A; 2Q73 A; 3D8C A; 1Q6U A; 2PY5 A; 1SQG A; 4UCS A; 5GW7 A; 3HB3 B; 1VP7 A; 1OCR C; 3AG1 B; 2PYJ A; 2Q69 A; 1DF4 A; 1Y4M A; 1SC5 B; 4MW3 A; 5IWA O; 3KCX A; 4DV0 B; 1N32 O; 2N05 A; 4GUN A; 3P32 A; 3A0H Z; 4H33 A; 4UCV A; 2GUZ B; 1QCE A; 3QO8 A; 3ZMZ A; 4LC1 A; 1YSC A; 2EIJ B; 5KX5 A; 4X89 A; 5IJ0 B; 4U3F H; 3DXR B; 3VQV A; 4J10 A; 5EK0 A; 2ADP A; 2WLI A; 4MVQ A; 1ENV A; 2IJJ A; 1AJN A; 2IU0 A; 3WB0 A; 3J7A U; 3D36 C; 1WAZ A; 1BSM A; 1TUE B; 3P3P A; 4JI3 B; 1QNM A; 2BOC C; 2IJK A; 4I7Z B; 4IYH A; 3W7S A; 2JS3 A; 3OUS A; 4TUY B; 4PD4 F; 4RWU A; 2DYR C; 4LFA B; 2M7W A; 4CS3 A; 3LUT B; 4XDK A; 5EIB D; 4TV9 A; 3CJH A; 1LNQ A; 4RUF A; 1O9H A; 3AG3 B; 3SJQ C; 3BPZ A; 1HDJ A; 3AG4 B; 3MD0 A; 1VQP V; 3K3W A; 3TK1 A; 3BA9 A; 1N8R W; 3JSL A; 4GYC B; 3MDS A; 2QA4 V; 3CCQ V; 2F4V O; 1SQV H; 1GTO A; 1I94 O; 3JD0 A; 4NXM B; 4UCR A; 1IBK O; 1TAE A; 1TUB B; 4UB8 Z; 2R9I A; 1OCO B; 2ITD C; 1E1Q G; 3ZHS A; 5IJ9 A; 1NBM G; 4RO2 A; 4FFB B; 2ILM A; 4GX5 A; 3ABU A; 4U7O A; 1HWY A; 2LQT A; 1JR9 A; 4X1K B; 4IT5 A; 4JI8 O; 1ZTE A; 5E1A C; 1M93 A; 4JI6 B; 4H0L B; 3STZ C; 1N36 B; 2JRI A; 1YXB A; 1GK9 A; 4J7Z A; 4NXN O; 1U97 A; 1WNS A; 5IYZ B; 4JV5 O; 5KHJ A; 2HHH O; 2Y48 A; 2P90 A; 3E8G A; 2Q7E A; 1H2M A; 3GWO A; 4O4H B; 2CH7 A; 1MSD A; 1PM9 A; 1B04 A; 3FB8 C; 3T2M A; 3L73 H; 1VQO V; 1HP8 A; 3ASO B; 2JJ1 G; 5J2T B; 4O2B B; 4NVP A; 5H5N A; 1FD9 A; 4FLW A; 2Q8V A; 3QO5 A; 5LYJ A; 3RYF B; 1U96 A; 3CD6 V; 2JEX A; 4ICG A; 1VEW A; 3SYA A; 4JYC A; 5LGU A; 4N23 A; 4AHC A; 2GHY A; 3K5O A; 1WLE A; 4LF5 O; 2W0F C; 2EJR A; 2QM8 A; 2UUB B; 4OX9 O; 2VRZ A; 4YJ2 B; 2ZIM A; 2ZKO A; 4DR4 B; 1W59 A; 4JI7 B; 2AZ0 A; 5FNV A; 3IJ4 A; 1Q86 W; 4JAA A; 1VQL V; 5EBW C; 3CRR A; 3RYI B; 4FVM A; 3C3S A; 2GTA A; 3IC9 A; 4I4T A; 2IBZ H; 1OCR B; 1PP9 H; 4JTA B; 2UUC B; 3SJB C; 2A06 H; 3AK2 A; 2OWO A; 3UKM A; 4GKJ O; 2PI5 A; 4TOI A; 1QU7 A; 3TXQ A; 1VQ8 V; 1AI7 A; 1VAR A; 1Q3E A; 1NH2 B; 4UFZ A; 1IZ3 A; 1R1B A; 4F4L A; 4I55 A; 1D5N A; 1SZX A; 2ZM6 B; 3G6E V; 1JX9 A; 3CEI A; 4NR1 A; 5H6R A; 1HR0 B; 2P5O A; 1JJ2 U; 4DV3 O; 3K59 A; 2YIA A; 2WLH A; 3ZMU A; 5LL6 Y; 2BTQ A; 1CXZ B; 4YY3 B; 1W0K G; 1W2B U; 2LFR A; 3NR7 A; 4GX1 A; 3CXH F; 4UXN A; 3DSQ A; 1PNK A; 2VQE B; 1KKD A; 4LF8 O; 2X0L A; 3OTF A; 5EYP A; 2DYR B; 3K03 A; 2QR4 A; 4XDJ A; 1FXK A; 4TQF A; 3H1K H; 5JVD B; 1OCZ C; 1SQX H; 4TSF G; 1CEZ A; 4QGP A; 1BMF G; 4BR6 A; 3CPW U; 1K7D A; 4EEQ A; 4JAS A; 2DN9 A; 4DUY O; 4A5U B; 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4UCO A; 2V1D A; 3S3W A; 4TV9 B; 3SJA C; 4JYA B; 3AG3 C; 5JQG A; 2ZDI C; 3CSX A; 1NZ6 A; 1XNQ B; 3EHB B; 1MZE A; 1JMK C; 4HNA A; 3ETD A; 3CRA A; 4WCE V; 4JI6 O; 3A0R A; 2CUG A; 4FIP C; 4HYO A; 2JGD B; 3TJT A; 1N36 O; 2YXL A; 2YUA A; 1KP2 A; 4WFH A; 4GKK B; 1ZL8 A; 5C8Y A; 2F43 G; 2Q67 A; 4OX9 B; 1Y74 B; 3UT5 B; 2K9P A; 3H1H H; 2LGW A; 5JJE B; 4QPK A; 5JWP A; 1L1F A; 1WA8 B; 4PJ0 Z; 1K4C C; 5LXT B; 4CH4 A; 2BSK A; 2GTS A; 4IL6 Z; 1XHX A; 1M57 C; 1WP7 A; 1EZJ A; 1BE3 H; 4OPH A; 4E4E A; 1I7F A; 5B1O A; 4J7J A; 2X7R B; 3EVK A; 2XAJ A; 3CRM A; 2BE3 A; 5LA6 A; 1FFX A; 1BGY H; 4JZG A; 1YEW A; 3E22 B; 4YJ3 A; 1VQK V; 4HBN A; 4G2K A; 2ZE7 A; 1NTZ H; 2CTW A; 3ETQ A; 2IU3 A; 4YXW G; 2UXX A; 5KAI Z; 2CGO A; 4DR3 O; 1UFI A; 3E8H A; 1OCZ B; 5LP6 C; 4JI7 O; 1SET A; 2W0X A; 1BHB A; 1IXB A; 3LSQ A; 4EFB A; 2AZ2 A; 3SR2 C; 2ZNJ A; 4DR7 O; 1IX9 A; 3CRC A; 2Y4U A; 2UU9 B; 5CA3 A; 2B5U A; 2UUC O; 2YDE A; 1R6K A; 1V9P A; 3ZHR A; 4FM1 A; 3HKD A; 1VQ9 V; 3FAV A; 5JH7 B; 1HNW B; 3OUF A; 4PA3 A; 2N04 A; 3CXC U; 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