The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
68
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structure length |
68
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Chain Sequence |
MPQKDPCQKQACEIQKCLQANSYMESKCQAVIQELRKCCAQYPKGRSVVCSGFEKEEEENLTRKSASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of human p8MTCP1, a cysteine-rich protein encoded by the MTCP1 oncogene, reveals a new alpha-helical assembly motif.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Cysteine motif
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
HU-P8
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| total genus |
34
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| structure length |
68
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| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-08-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08991 | MTCP1 | Mature-T-Cell Proliferation I type |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | CytochromE C oxidase copper chaperone |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LQT A; 2LGQ A; 1U96 A; 1Z2G A; 1HP8 A; 2HP8 A; 2RNB A; 2RN9 A; 1U97 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BHA A; 1VQP V; 4LF5 O; 1NBM G; 4GKK O; 2ZR2 A; 1Q43 A; 1EFR G; 1WB8 A; 3APO A; 1UPG A; 5IYC O; 2EIK B; 4JI6 O; 5LMN O; 5H6Q A; 4CS3 A; 1J95 A; 1J5E B; 3CCS V; 5B1B B; 4WFA V; 5KMG A; 2KG7 B; 4X88 A; 5FPO A; 2X7R B; 4DR2 B; 1KD1 W; 1MAB G; 4XDK A; 4QNH B; 5KHK A; 1NKD A; 2LQT A; 4JAV A; 2ZE7 A; 2AXT Z; 3LDD A; 3ZRW A; 4G2K A; 1EM1 A; 1X4T A; 2E75 B; 4NXM O; 4JYC A; 1SQQ H; 3SYA A; 1I5X A; 1GMG A; 3JD3 A; 1SQF A; 4DV6 O; 1RM1 C; 3ZIA G; 1FXH A; 4YJ2 B; 2LP7 A; 3ZMT A; 2FTK A; 4GKJ O; 1TVK B; 2WSS G; 3FB6 C; 5H5N A; 4DV4 O; 1N4C A; 5H2F Z; 4J11 A; 1K4C C; 1S3J A; 4UCR A; 2GDS A; 3RGB A; 5BMV A; 4MVR A; 1AR5 A; 5L3B A; 5F2V O; 4PEL A; 3H1I H; 2WLJ A; 4ICG A; 2Y69 C; 2OWO A; 3CPW U; 3OMI B; 4FLU A; 3AK1 A; 1GK9 A; 2W0F C; 3GWO A; 2NR5 A; 2YIC A; 2EJ7 A; 1XDC A; 1NI8 A; 5CA0 A; 4ZOL B; 4JI7 B; 2R9R B; 2ARH A; 3RVZ A; 3TGU H; 4UFZ A; 3JD2 A; 3Q4H B; 4UB6 Z; 3ZN1 A; 5KX5 B; 4LF7 O; 3T1H O; 2ZDI C; 4UCV A; 3JD1 A; 5BR8 O; 2PTM A; 3CRC A; 1LUV A; 4IIJ B; 5KUK A; 1FXK A; 3FYI B; 3HKB A; 2E5L O; 3TXS A; 5EYP A; 1GN3 A; 3E22 B; 4I55 A; 4FJC C; 2UUB B; 1GM9 A; 1XL4 A; 3LUT B; 1MSD A; 1PNM A; 1BHB A; 4EFE A; 1AP6 A; 4FLV A; 4EFB A; 4PD4 F; 4PJ0 Z; 1XIL A; 2F23 A; 3ASN B; 2BTO A; 4P2Z A; 2P06 A; 1H2M A; 1Q6H A; 5CB4 A; 4ZI7 A; 4QE9 A; 3ZHV A; 4X1I A; 3L75 H; 1H2K A; 2DQ0 A; 1VP7 A; 2XT9 A; 4YY3 B; 3SGI A; 3ZMV A; 4XDL A; 4B3T O; 5L3E A; 2BOB C; 2UXB B; 1AI7 A; 1FD9 A; 4GUN A; 3HKE A; 3X2Q B; 1FKA O; 1BMF G; 4JTA B; 3IJ4 A; 4DR3 B; 4AQY O; 4JYA O; 1P4R A; 2BTQ A; 3OAA G; 1AI5 A; 2Q73 A; 1XNQ B; 2QKA A; 5KA6 A; 2DW4 A; 1VQL V; 4RWU A; 4RQE A; 5CA1 B; 4F6E A; 4TUY B; 3M8A A; 2HVK C; 3CCQ V; 2E74 B; 3JD4 A; 3T1Y O; 1PL4 A; 5LL6 Y; 2F93 B; 5LMU O; 1N32 B; 1SRY A; 3WB2 A; 1YXB A; 4LF6 B; 4LP8 A; 2CGN A; 2ITD C; 4MW3 A; 4MTO A; 1YIT V; 1NT2 B; 2GV9 A; 2Q7E A; 3BPZ A; 3AEI A; 1Q6I A; 3SYC A; 3B8N A; 5ITZ A; 2ZIO A; 2Y4U A; 1YJW V; 3OGI B; 3CMA V; 4R50 A; 1IXM A; 2CK3 G; 1N33 O; 1Y6X A; 4OXS A; 4B3M O; 2YC0 A; 3RYI B; 3KKY A; 3JAT A; 4YJ3 A; 1YDX A; 3W7W A; 1FPO A; 5DEC A; 3CCM V; 3CRM A; 5J2T B; 4DV2 B; 3VOU A; 2CH7 A; 4JI0 B; 2HG5 C; 2JVD A; 1IBM B; 1JFF B; 2PY5 A; 4JZG A; 4IIJ A; 2CGO A; 4HAM A; 4JI4 B; 2KKW A; 4UCT A; 2ZE6 A; 4JAS A; 3K5L A; 4QE7 A; 1KU9 A; 4B3S B; 4DUZ O; 3E22 A; 1Q90 D; 3MDS A; 4LF5 B; 4NR1 A; 3OUF A; 4BWA A; 4DXW A; 5JVD A; 3L71 H; 4GKK B; 4GZR B; 4PDV A; 4JI6 B; 1IBL O; 5LMN B; 3BY6 A; 3BCC H; 4LH7 A; 1F51 A; 4MVQ A; 2W0X A; 3K5M A; 2KSD A; 3AG3 B; 3ZBH A; 1RFY A; 3SYO A; 1SQP H; 4I9Q A; 1LR1 A; 4LNU B; 4DRX B; 1Q7Y W; 2Z5U A; 3TK1 A; 4FIP C; 4NXM B; 2YIA A; 5LYJ B; 4F6R A; 2H8P C; 1NU1 H; 3WU2 Z; 1GH6 A; 4DV6 B; 4BW9 A; 2UXC O; 1VMG A; 1Y74 B; 2QSA A; 2IJI A; 3A0B Z; 4GKJ B; 4D6T H; 5CBG A; 4R6Z A; 5L3F A; 4DV4 B; 4L87 A; 2B1G A; 4LCU C; 1U96 A; 2WLL B; 4MS2 A; 3RN4 A; 3SDL A; 2JEX A; 2GUZ B; 4BR6 A; 4E4E A; 1QLE B; 2QTS A; 4AHC A; 1P84 F; 4X20 B; 1UJW B; 4R7C A; 4JI2 O; 2AZ0 A; 1P7G A; 5LA6 A; 1G8M A; 1N0N A; 3ETD A; 1F7Y A; 1AJN A; 2QWN B; 1HWY A; 1VF6 C; 2QM4 A; 1MOF A; 1FXK C; 4LF7 B; 3E86 A; 2F43 G; 4ZIB A; 4I4T B; 4UXN A; 3E35 A; 1OV9 A; 4UCS A; 5BR8 B; 1CEZ A; 3CHX A; 1B3Q A; 2X6B A; 1E1R G; 2E5L B; 3FFQ A; 4LF8 O; 2DWD C; 4RO2 A; 1HW7 A; 1TUB B; 1S5L Z; 2DQ3 A; 5B1A B; 4DV7 O; 4MTG A; 5L3C A; 4NTW A; 1R3I C; 1NR1 A; 2ZM6 O; 1FAF A; 3BVO A; 1COW G; 5TIS Z; 1L0N H; 5IE9 A; 5J2T A; 1V55 C; 2D2C B; 4UB8 Z; 4FK5 C; 4DV0 B; 4K8X A; 1TA8 A; 2YS8 A; 1VIB A; 3SPJ A; 2OYQ A; 1IBK O; 4O2B A; 1H8H G; 1GAX A; 4CH5 A; 2XAG A; 4C7U A; 4Q20 A; 5IJ9 A; 3QO7 A; 1ENV A; 1SQX H; 3EXA A; 5BZB A; 5IJ0 A; 5C93 A; 1XNR B; 3JCZ A; 3KCY A; 1ZWI C; 1W0J G; 3CE2 A; 1XMQ B; 4X1Y B; 3M7M X; 2XAQ A; 2LFS A; 2MK3 A; 5JCO A; 1V54 B; 1UFI A; 1BT8 A; 4EEQ A; 2VQE O; 1H2N A; 4MVO A; 3U11 A; 4DRX A; 2BSK A; 4DR5 O; 3SJA C; 4OPA A; 5CN0 A; 4DR6 O; 5D5Q A; 4X65 O; 3GB7 C; 3T1Y B; 5LMU B; 1YJN V; 3SR2 C; 1Y74 A; 4LWS A; 4DV3 B; 4O4L B; 3I55 V; 4O4J B; 1NH2 B; 1ROP A; 1NVP D; 1F4N A; 3JAM N; 2QE7 G; 2GUZ A; 3CXH F; 5GW7 A; 1NS1 A; 4NTY A; 4KHP O; 4QPJ A; 4JAU A; 1NTK H; 1WP7 A; 1N33 B; 4B3M B; 3E8F A; 4BAY A; 1HNZ O; 2ZE8 A; 1HNW O; 1P7B A; 2EBO A; 1RP3 B; 1OCZ C; 3SPH A; 1CP9 A; 5IYZ B; 2G38 A; 3FX7 A; 3G6E V; 1W59 A; 1OZ0 A; 3B8M A; 4DUZ B; 4PV1 B; 1TUE B; 2YXY A; 2LJ2 A; 2XAS A; 4GYC B; 2OTJ V; 2IJH A; 2YI9 A; 3E2E A; 3QG5 A; 4JTC B; 2HFE C; 2Y0I A; 3ICX A; 2F1M A; 1IBL B; 2DE0 X; 3BHP A; 1BQZ A; 2KQX A; 5KA5 A; 4HBN A; 3I5D A; 2ETN A; 2W6J G; 5JH7 A; 1Z5W A; 4J7Z A; 2PYJ A; 2ILM A; 4FLY A; 2WLI A; 3N2K A; 5LXT B; 4ZHQ A; 4CH6 A; 2RMK B; 3L73 H; 3CRA A; 4EKW A; 4H44 B; 4DW0 A; 1S77 D; 2IBZ H; 3CRQ A; 3LSU A; 3W7U A; 3QO5 A; 2Z0A A; 5EBL C; 1WA8 A; 5CMU A; 2JEU A; 2UXC B; 1K9M W; 3ETG A; 4EB6 B; 3CP1 A; 3CCV V; 1F4M A; 3DC6 A; 4I9W A; 3LSQ A; 4FFB B; 3ZX6 A; 3OMA B; 4RUF A; 3JAW A; 3D36 A; 4B08 A; 2GHY A; 1FFX B; 5FL7 G; 4WFB V; 1L8D A; 4CS4 A; 2UUA O; 1BE3 H; 4W4K A; 1FXV A; 4J41 A; 1R3K C; 4OX9 B; 1SF9 A; 4H13 B; 1Y67 A; 2VQF O; 4PDR A; 2Q7G A; 3ZRS A; 4XDJ A; 2JS5 A; 2ZE5 A; 4O4L A; 1WAZ A; 3RYC B; 4LF8 B; 3G6B A; 3N2G A; 1ZL8 B; 4PA4 A; 1GN4 A; 2K1E A; 3BAA A; 1JX9 A; 3OEE G; 4DV5 O; 4DV7 B; 1OCO C; 1K3E A; 4IHJ A; 2LGW A; 3WB1 A; 2ZM6 B; 2OCC B; 3W7T A; 1H8E G; 1SET A; 5K1X A; 2QTO A; 3E8H A; 5LP6 C; 1M9N A; 3P32 A; 1Y76 A; 1PD3 A; 1QVG U; 1OCR B; 1YTF D; 2EIN B; 3QO8 A; 1PKX A; 2EIM C; 4DR4 O; 3K0G A; 1YHQ V; 3IGA C; 5EZY A; 1V55 B; 3FAV B; 1IBK B; 1K5Q A; 4HZ3 A; 3CCJ V; 2JJ1 G; 5IY5 B; 4UCO A; 4FLX A; 4O4H B; 3H1L H; 3K03 A; 3ABL C; 3U10 A; 3RBZ A; 3T2M A; 2UXN A; 4DUY O; 2AW9 A; 4G27 B; 4TV9 A; 2LFR A; 2Q7H A; 3W7S A; 5DED A; 4DO2 A; 2VQE B; 2XHB A; 1CPY A; 4DW1 A; 5HFM A; 3SJC C; 3SJQ C; 2JRI A; 3TJT A; 4DR6 B; 2DN9 A; 1KQS U; 4I50 A; 4X65 B; 3ASO C; 3HR0 A; 4ZKI A; 1VF5 B; 3ZJZ A; 4X62 O; 4JYB A; 4TQF A; 3K59 A; 2YDE A; 1ZLZ A; 2QDO A; 1R3J C; 3OM3 B; 1YEW A; 1SA0 B; 1JJ2 U; 1Z5V A; 3JAR A; 2A3Q A; 3ABK C; 3D8C A; 4KHP B; 5GTH Z; 4QGP A; 5LOV B; 1FFX A; 1SQG A; 2F95 B; 1PNL A; 4WFH A; 1AR1 B; 1RSO B; 3RVY A; 5FNV B; 3CC2 V; 3MAQ A; 4RUE A; 1MA1 A; 4IGG A; 1KMI Z; 3AK3 A; 4I0X B; 4NXN O; 1W2B U; 4GX1 A; 2UU9 O; 3HKD B; 2YID A; 3ZHT A; 1WP8 A; 4MTX A; 5J9P C; 4FM2 A; 2ZXW C; 4X64 O; 4B3R O; 4TWK A; 1OCZ B; 3JAK B; 5EC1 C; 3F5T A; 3ZRV A; 1ARO P; 3UM7 A; 1B04 A; 4GCZ A; 4U7O A; 5J2U B; 4Z2W A; 3CX5 F; 1R6K A; 4QJF B; 1FYJ A; 2UXX A; 1W0K G; 2Y4T A; 4NB5 A; 1AVM A; 2HP8 A; 1WN7 A; 1QVF U; 1K97 A; 4R8C A; 1QNM A; 3BFR A; 3OUS A; 3UQ8 A; 4DV1 O; 4TV8 B; 3RYH B; 3AG2 B; 1YF2 A; 2KG7 A; 3ZMZ A; 2Q5Z A; 1K34 A; 3M99 B; 2P6J A; 4O4H A; 4CBC A; 2NN4 A; 1K5S A; 1B6Q A; 2Q69 A; 3VQV A; 3JAL B; 3MHS C; 3OR7 C; 1SS3 A; 3A2F A; 2EJR A; 4N21 A; 4X89 A; 4F4L A; 3K0D A; 5E79 Z; 1JCH A; 4WF9 V; 5JJE B; 3FB7 C; 3D36 C; 4FVM A; 4FM1 A; 2YI8 A; 4YJ2 A; 3OTF A; 1URF A; 3VQY A; 1BZK A; 1TVK A; 1LNQ A; 5KHG A; 2UUA B; 2M6Y A; 4NYK A; 4PA6 A; 1VEW A; 1I7F A; 4P9P A; 2ZT9 B; 4WFF A; 3BA8 A; 1S72 V; 2H3O A; 4O4I B; 2VQF B; 4E2L A; 1AI6 A; 3FB8 C; 4K3A A; 1AIL A; 1Q81 W; 1XUQ A; 1Q8I A; 3A0R A; 4X66 O; 2HEP A; 1US6 A; 4ZBM A; 4D7S A; 5KHI A; 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3RYI A; 1WJZ A; 2N05 A; 2YIB A; 3QNE A; 4X64 B; 2RCV A; 2EZO A; 3RW0 A; 4B3R B; 3NR7 A; 2VWJ A; 2QM7 A; 3L74 H; 2LGQ A; 1AP5 A; 2R9A A; 1SER A; 2AGA A; 3K57 A; 5AG2 A; 1CXZ B; 3SPG A; 2N74 A; 5B5E Z; 1JFF A; 2ZXW B; 2QGN A; 5L3D A; 4FMT A; 3GWK C; 4OPH A; 1XMO O; 3J80 N; 3P3N A; 4BIZ A; 1D5A A; 4AIL C; 4B3T B; 2EIK C; 3AG1 C; 1R3L C; 3G71 V; 5LBQ A; 2YSU B; 3K08 A; 2GTA A; 5LGT A; 5IWA O; 4AQY B; 1RPO A; 3L9D A; 4JYA B; 5B1B C; 3K5N A; 3IC9 A; 1K33 A; 3OE7 G; 4JI8 O; 2ZNI A; 4FFK A; 4MSW C; 3A8T A; 3HKC B; 4J7J A; 1JA8 A; 3H1H H; 3PN1 A; 2YUA A; 3A0H Z; 3EFF K; 4UCU A; 3RT3 C; 2OIG A; 2IW5 A; 3JAS A; 3D3I A; 1M57 C; 1K92 A; 4LFA O; 3P3P A; 3NXS A; 4DK0 A; 1F23 A; 2JDI G; 4LNU A; 4GX0 A; 2R70 A; 1NVP B; 1E79 G; 3C3S A; 5LYJ A; 3CWB H; 2CTR A; 2A0L A; 1GKF A; 1OJH A; 3CD6 V; 4KFM A; 3F7V C; 4TQD A; 2WLL A; 3CJH B; 3UO3 A; 5IYB O; 2EUL A; 1VQ5 V; 3BRC A; 3S3X A; 2JIZ G; 2HKO A; 4U7N A; 1XHX A; 1Y66 A; 4X66 B; 4X20 A; 1GN2 A; 5LHI A; 1VQ6 V; 1QBZ A; 4J42 A; 1DTO A; 3S3W A; 4NTX A; 4FM0 A; 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