The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
80
|
structure length |
80
|
Chain Sequence |
GNGSTITFDELQGLVNSTVTQAILFGVRSGAAALTLIVVWITSRSRKTPIFIINQVSLFLIILHSALYFKYLLSNYSSVT
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of a double transmembrane fragment of a G-protein-coupled receptor in micelles.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Pheromone alpha factor receptor
|
| molecule tags |
Membrane protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
24
|
| structure length |
80
|
| sequence length |
80
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Pheromone alpha factor receptor. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K9P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4I5S A; 2DWE C; 2AXT Z; 4BIZ A; 1Y74 B; 3E86 A; 4FFB A; 3E8F A; 4IYI A; 2C2A A; 4HAM A; 3K08 A; 2B5U A; 1EFR G; 2ZNJ A; 4RO2 A; 3CCQ V; 1SQV H; 5KA5 A; 2Q8V A; 2YDE A; 2QGN A; 2DOS A; 1SQX H; 4B3M B; 1HNZ O; 3ZHU A; 4EFE A; 3ZN0 A; 4DR4 O; 2P4V A; 2ARH A; 4MW8 A; 3ABL C; 2P67 A; 1R6T A; 4NXN O; 3JD1 A; 1L8D A; 5F2V O; 3J7A U; 1NT2 B; 1Z5W A; 2CGN A; 5TIS Z; 2PYL A; 5LP6 C; 2QWQ B; 4DR4 B; 4JI0 O; 4IYH A; 1KC8 W; 4LF9 O; 1M90 W; 2LW1 A; 3W7S A; 4NTY A; 3BCC H; 1YDX A; 3P3P A; 2YEV A; 2FB5 A; 2P06 A; 5B1A C; 1K5S A; 4EEQ A; 4FM1 A; 5KX5 B; 3L71 H; 3M8A A; 1GMG A; 3RYF A; 3TCU A; 2HKO A; 5CA1 A; 1KB9 F; 3G6B A; 2OTJ V; 2QTS A; 1K3E A; 1J95 A; 5FPO A; 1R3I C; 2CH7 A; 3AEI A; 4RUE A; 1D5A A; 1PNL A; 2E3C A; 4LF9 B; 3HB3 B; 1WA8 A; 2FKX A; 4J11 A; 1Y76 A; 4XDL A; 5DED A; 3K3W A; 3LSQ A; 4IIJ A; 4J9Z B; 1O9H A; 4DV4 O; 1H8E G; 3DGE A; 3CRQ A; 4MS2 A; 4JI4 O; 1Q7Y W; 5CBF A; 2YIB A; 3N2K B; 4K0K O; 2XAH A; 3QG5 A; 5GW7 A; 1H8H G; 4I50 A; 1M9N A; 4CS3 A; 2CTW A; 3T1H B; 1VQP V; 4X89 A; 4DK0 A; 3K5N A; 4Z1M G; 1Q82 W; 2P5O A; 4GX0 A; 4LFC B; 1AJQ A; 2JRI A; 4FM0 A; 3E8G A; 1L1F A; 1MOF A; 4RQF A; 1XHZ A; 1ZWI C; 2FTK A; 4UVB A; 4TV8 A; 1K9M W; 1PNK A; 1EZV H; 5ITZ A; 3OTF A; 1XDC A; 3ETQ A; 2XAQ A; 4N23 A; 4FJC C; 4EB6 A; 4UB6 Z; 4PA7 A; 4H0L B; 1YCI A; 4KP4 A; 3SPG A; 4JI6 B; 3ZS8 C; 2A7W A; 1IBM B; 1EM1 A; 2ODM A; 3CJH B; 4MVQ A; 4UVC A; 1K73 W; 3VQY A; 1MA1 A; 4DR6 O; 4QPJ A; 2P7T C; 3Q4H A; 5L3B A; 1NTZ H; 3CMA V; 2WLI B; 2W0X A; 4AIL C; 4JI1 O; 3U0Z A; 4UCT A; 1WAZ A; 3OMN B; 4QE9 A; 2K9P A; 5B66 Z; 4FFB B; 1COW G; 4XBF A; 1NBM G; 4LH7 A; 1FPO A; 5FL7 G; 1R1B A; 2ZDI A; 4JAS A; 3SPJ A; 3I56 V; 5JCO A; 2X6A A; 4DV5 O; 1QBZ A; 3CWB H; 3D8C A; 3IJ4 A; 3ABK C; 4RUF A; 2Q68 A; 1AVM A; 5L3G A; 3FX7 A; 2VWK A; 5C93 A; 1AI6 A; 1LUV A; 3SPH A; 2PY5 A; 1NTK H; 1H2M A; 1GN2 A; 1K92 A; 3ABU A; 2CDY A; 2QWN B; 3SGI A; 4JYY A; 4PEL A; 1BZK A; 4ZBM A; 3F7V C; 5LOV A; 1V9P A; 1KUQ A; 1UFI A; 3TXQ A; 1HP8 A; 5B1B C; 2UXD B; 1R73 A; 1AB3 A; 4RWU A; 4WFH A; 2IJK A; 5CMU A; 5LMN O; 3ZHS A; 4H13 B; 2Q7G A; 4D7S A; 2F95 B; 4QJF B; 1XEQ A; 5K1P A; 3JD3 A; 2YEV B; 4IGG A; 4O4I A; 4PD4 F; 1FD9 A; 4LF7 B; 2WA4 A; 3A8T A; 3RYF B; 1S5L Z; 1GTO A; 1UJW B; 5CA1 B; 1BL8 A; 2PUS A; 1OCR C; 3JD0 A; 5KAI Z; 4LWS A; 3L73 H; 3AG2 C; 4HZ3 A; 1WA8 B; 4CZZ A; 1Y76 B; 1KP2 A; 4IIJ B; 1EBO A; 2R72 A; 4Z2W A; 3ZMS A; 4O4L A; 3OEH G; 4MT8 A; 4X1Y A; 2GTS A; 2EIN C; 5LGT A; 4JV5 O; 4GYC B; 1YZB A; 4PHZ A; 4I50 B; 1I7F A; 2X7R B; 3IC9 A; 4J41 A; 1Q43 A; 5JJN B; 3EHB B; 3BY6 A; 1KMI Z; 2YI8 A; 3H01 A; 1Q86 W; 1UPG A; 2UUA B; 1K5Q A; 2OCC C; 3CSX A; 4KUM A; 1NQT A; 2F93 B; 4O4H A; 4X64 B; 4PA4 A; 5ITZ B; 3S3X A; 4FLX A; 2N74 A; 4NXM O; 3E83 A; 5H6Q A; 4EB6 B; 2AW9 A; 3JAT A; 1JA8 A; 4OPH A; 4JZ2 A; 3RBZ A; 1JPX A; 4WBN A; 4DUY O; 4UXN A; 2RMK B; 3MD0 A; 3EFF K; 3Q4H B; 2JK5 C; 3EVK A; 4TSF G; 1AP6 A; 1NKD A; 4DK1 A; 3JYC A; 2QA4 V; 1S76 D; 3LDC A; 1N36 B; 3RT3 C; 4YIO A; 3UCS C; 3BRC A; 4F4L A; 3OTO B; 2WLK A; 1Q3E A; 2ZKO A; 1CEZ A; 3C3T A; 1SS3 A; 1B06 A; 5KUK A; 1NU1 H; 1QR8 A; 3LNN A; 2KB1 A; 1I5X A; 4OXS A; 4UVA A; 4AQY O; 3WG7 C; 1JMK C; 1QR9 A; 4JTA B; 2OIG A; 2PI5 A; 1HNX O; 1N33 O; 1HW7 A; 1AR5 A; 1YXB A; 5LOV B; 4U3J A; 2XAG A; 2WSS G; 5BR8 B; 1R3J C; 4U7O A; 3B8M A; 3U10 A; 1GN4 A; 3OFN G; 1FXK A; 4I4T A; 3C3S A; 3WFV A; 5IY5 C; 4X65 O; 2IJI A; 1A32 A; 4W4K A; 3FKS G; 2UUB B; 4O4I B; 3SJC C; 3CRC A; 3CCU V; 1N32 B; 1RM1 B; 3B77 A; 3UT5 A; 2UXX A; 3ABM C; 3GWO A; 2OIE A; 2Y48 A; 2PF4 E; 5D5P A; 1N8R W; 4A5U B; 3HR0 A; 1RPR A; 2UXN A; 2YIA A; 2B1I A; 4LWS B; 3CC7 V; 1E79 G; 2JGU A; 3D3I A; 2ZXW C; 4AI8 A; 4CH6 A; 2Q4P A; 2CTR A; 2HP8 A; 4O4L B; 5EYP A; 5AG2 A; 4WFE A; 4GKJ O; 4LNU A; 1K8A W; 3ZJZ A; 3K03 A; 3M7M X; 1MNG A; 1SQP H; 1N0J A; 1VEW A; 4LFB B; 2UXC O; 3DTU B; 3LDD A; 4PDR A; 2GV9 A; 1L0L H; 1M5I A; 2AZ2 A; 4GUN A; 4UCS A; 3I5D A; 1H2N A; 2CTQ A; 2BOB C; 1H38 A; 3BA8 A; 2E5L B; 4P30 A; 2RN9 A; 1SQG A; 1SQQ H; 2YS8 A; 4GX5 A; 4JAA A; 2VQF O; 2Z0A A; 2XTA A; 1NVP D; 5BY1 A; 3ETG A; 1BHB A; 2QM8 A; 5KAF Z; 2W0F C; 5CN0 A; 5DEC A; 4I9Q A; 2JGD A; 3JAT B; 3HKB A; 1XMO O; 3RFR A; 1VQK V; 2PTM A; 4WBN B; 1QLN A; 1LUW A; 2EIM C; 1Q6I A; 4ZI7 A; 4JAV A; 1TA8 A; 1LR1 A; 4X9Q A; 4LF4 O; 3VQV A; 2MW2 B; 4DV0 O; 1VF6 C; 1NS1 A; 1ZSP A; 5B1O A; 1Y67 A; 5E79 Z; 1HWY A; 1OZ0 A; 4X66 B; 1U96 A; 4TT3 G; 3AG3 B; 4JZG A; 1KP3 A; 3GB7 C; 4DR1 O; 1QQC A; 3B4S A; 4ZOL A; 1M56 B; 4LF4 B; 4DV0 B; 1OJH A; 4JTD B; 3A0B Z; 1ZLZ A; 3DXR A; 4DR5 O; 2YIC A; 3RWR D; 1XNQ O; 2EIK B; 2P22 C; 2W6J G; 4LP8 A; 3AG4 C; 3T4Z A; 3SPI A; 3CRA A; 3OAA G; 3G71 V; 1BMF G; 4DR1 B; 4DV3 B; 3DC5 A; 2WLL A; 2NLJ C; 5CB4 B; 4OX9 B; 3CEI A; 3B09 A; 1P7G A; 1IDS A; 3D36 A; 3W7X A; 4WFF A; 3E8B A; 2A9H A; 4P9O A; 3H1I H; 3CXC U; 5EBM C; 1RP3 B; 2EIL B; 4PJ0 Z; 4U3J B; 3FB5 C; 1NJI W; 1MMM A; 3I55 V; 4QE7 A; 3P3N A; 4JI8 O; 3ZX6 A; 5CA3 A; 1FXK B; 1WNS A; 4I4T B; 2UU9 B; 4ZKI A; 5L3F A; 3K58 A; 1BE3 H; 3UT5 B; 1T5E A; 1VIB A; 3CC4 V; 4BR6 A; 2VWJ A; 1FS0 G; 3G80 A; 5EBL C; 2YXH A; 3RYC A; 1EN6 A; 2ZIO A; 3E8H A; 1GH6 A; 1Y66 A; 4IT5 A; 3QO5 A; 3D3Q A; 4R6Z A; 1DLB A; 2F4V O; 2YXL A; 4UV8 A; 5EYP B; 1ARO P; 3NR7 A; 4LNU B; 1PPJ H; 1HNZ B; 1WB8 A; 4WF9 V; 4PI0 A; 1M57 B; 3ZMU A; 2EJR A; 4UCU A; 1OCZ B; 2F23 A; 4TV9 A; 4NXN B; 2LP7 A; 2F4V B; 3K59 A; 4F6R A; 5J9P C; 1JCH A; 1JQ0 A; 3TGU H; 5L3D A; 3RVY A; 3L9D A; 4HYO A; 4U7N A; 1G4Y B; 5K1X A; 3ASO C; 1U97 A; 1NH2 D; 4PDV A; 4JI0 B; 1OCC B; 1VQ9 V; 3FB7 C; 1D5N A; 3OT7 A; 5H6R A; 3H9V A; 1VQ8 V; 3OUF A; 4NR1 A; 1KU9 A; 2QTO A; 3ASN C; 2NR5 A; 1H2G A; 1LNQ A; 2JGD B; 1HNW O; 2JEU A; 5LXT A; 3HKB B; 5IJ0 A; 3RYH B; 1QLE B; 2A06 H; 3CE2 A; 1B04 A; 3R66 A; 3CD6 V; 4ZI7 B; 1I0H A; 1WP7 A; 4R7C A; 1EZJ A; 1SES A; 2IH1 C; 2KSD A; 2P6J A; 4DV4 B; 1XL6 A; 4PA3 A; 2ZM6 O; 2RCV A; 4JI4 B; 2ATK C; 5HFL A; 3ZIA G; 3CCE V; 4LFA O; 2IH3 C; 1BT8 A; 3K0G A; 3K06 A; 1F51 A; 4K0K B; 1RFY A; 4ZOL B; 2LGW A; 4MTG A; 1V55 B; 1IBL O; 4MSW C; 3DXR B; 3N27 A; 3W7T A; 5E1A C; 2QJ1 A; 1IBK O; 1Y6X A; 1BQZ A; 3STL C; 4DR7 O; 1BCC H; 1KD1 W; 2JJ2 G; 1N0N A; 2AHY A; 1AI7 A; 2ZM6 B; 1FXV A; 1AJP A; 3JAL A; 3P30 A; 1VMG A; 2LFR A; 1I08 A; 2F66 C; 2WLL B; 2Z3Y A; 1VF5 B; 1Z2G A; 2Z5U A; 4DV2 O; 2Y4T A; 1GKF A; 2LQT A; 1CPY A; 2E76 B; 2QWO B; 4YJ3 A; 2YI9 A; 2LW7 A; 1TUB A; 5IT9 N; 4J7Z A; 1BSM A; 3L74 H; 4CS2 A; 4Q6G A; 2WAM A; 4GT1 A; 1VQM V; 1ZAU A; 1YJ9 V; 3BEH A; 2EZO A; 4DR6 B; 3ML0 A; 1XIL A; 5IWA O; 3LNM B; 3H1J H; 4GLX A; 1BQ0 A; 3X2Q B; 1M93 A; 1Y4M A; 3RW0 A; 5H9C A; 2EX3 A; 4L8J A; 4GX2 A; 4JYA O; 1QHT A; 4JI1 B; 1YTF D; 2JDI G; 2DYS B; 4PV1 B; 2WLM A; 2DWD C; 1SF9 A; 3RYC B; 5IYZ A; 5LGN A; 4B3R O; 2HLD G; 5IWA B; 3MDS A; 1PM9 A; 3A0R A; 5A2Q N; 1GO3 F; 4UB8 Z; 5GON B; 2RQ6 A; 4JYA B; 4MVU A; 4DV5 B; 4BIU A; 4LF8 O; 1PD3 A; 5C8Y A; 1ZX3 A; 4FZ1 A; 2A3Q A; 2YSU B; 1EN5 A; 3K9A A; 1DGS A; 4HNA A; 3FB8 C; 4TV9 B; 4KHP O; 3ETE A; 1J5E O; 4D6T H; 5FLX N; 3RN4 A; 3K79 A; 3L75 H; 4F6R B; 3G4S V; 5JVD A; 3K5L A; 4F6E A; 2BTO A; 4LF8 B; 4E4E A; 3SYO A; 2VQE O; 1WN7 A; 2YXY A; 1WLE A; 1VQ4 V; 4JI3 O; 4FK5 C; 5LMN B; 1IX9 A; 1Q6U A; 4ZIB A; 3O65 A; 4LF6 O; 2LJ2 A; 5LXT B; 4WFG A; 5IJ0 B; 2HG5 C; 1FJG O; 3JSL A; 1PKX A; 2VRZ A; 3CCV V; 1GM8 A; 3AG1 B; 4WFA V; 2OYQ A; 1BS3 A; 4KL1 A; 1XNR O; 2ZE7 A; 5JJE B; 4FLT A; 1JFF A; 2RNB A; 2GDS A; 2JS5 A; 2ZNI A; 4QGP A; 1S5H C; 4L87 A; 2QR4 A; 3B8N A; 5LP6 A; 3IAY A; 1WJZ A; 3HKE A; 1VQO V; 4DXW A; 4EFB A; 4JV5 B; 2HHH O; 4JI2 O; 3CHX A; 2XT9 A; 3N2G A; 2DQ3 A; 2XND G; 3SYA A; 3BHP A; 1YIT V; 4LF5 O; 4K8X A; 4WCE V; 4B7K A; 3OMI B; 4P9P A; 4N21 A; 1GM9 A; 3RGB A; 2XOK G; 1VP7 A; 2HEP A; 4PI2 A; 2ITD C; 3JAL B; 3CRM A; 3OR7 C; 4WFB V; 1BGY H; 5KLV H; 4J7K A; 2ADP A; 2UUC O; 3JAM N; 4LF5 B; 2KQX A; 5LYJ A; 1NVP B; 4YJ3 B; 2ZE5 A; 2EIJ B; 4FVM A; 3ZN1 A; 4NXM B; 2AZ0 A; 3M99 B; 3QO8 A; 1TUB B; 1NTM H; 4O4J B; 3KG2 A; 4I0X B; 1E1R G; 2NN4 A; 2R70 A; 4Q20 A; 4K35 A; 4DUY B; 2QM7 A; 2X6B A; 2OWO A; 4H33 A; 1H2K A; 4TUY B; 1N34 O; 3W7W A; 4O2A A; 2IM9 A; 1RPO A; 1I94 O; 1OCO B; 1F7Y A; 1ENV A; 2CGO A; 1X59 A; 2K1E A; 3E89 A; 5CB4 A; 1V54 B; 5IYC O; 5IYZ B; 1P84 F; 2QWP B; 3OM3 B; 1MG1 A; 4JI7 O; 4JYB A; 2X0L A; 2ZIN A; 4MVO A; 2Y69 B; 4YIP A; 5KMG A; 4PDL A; 1H2L A; 2ZE6 A; 5C8Y B; 2DYR B; 3OMA B; 4NYK A; 4X88 A; 3TXS A; 2EUL A; 1R3K C; 4AQY B; 4DV6 O; 4HNA B; 1SA0 B; 2Q6A A; 2RJZ A; 4FZ0 A; 1SER A; 1HNX B; 1N33 B; 1GM7 A; 1TUE B; 1QVF U; 1E1Q G; 4DUZ O; 5JVD B; 5B5E Z; 4MTO A; 3K57 A; 1NR7 A; 2HJD A; 3UM7 A; 3ZHQ A; 3CC2 V; 2L35 A; 4X65 B; 4JTC B; 1YF2 A; 4QPK A; 5IDJ A; 2R9R B; 2O57 A; 3AK3 A; 3CXH F; 5CA0 B; 2Q7E A; 4JPR A; 4X20 A; 3F7Y C; 3QTC A; 4GKK O; 1YJW V; 2HVK C; 2YIB D; 2RDC A; 2UXB O; 3ABL B; 4CH3 A; 1IXB A; 1FKA O; 3JAK A; 3KKY A; 4BW9 A; 3U11 A; 1YVW A; 1JVM A; 3F5T A; 1JFF B; 4D7T A; 3S3W A; 4ZHQ B; 1SQB H; 3ZHV A; 1PL0 A; 5LP6 B; 3HKE B; 4GKJ B; 4GKK B; 4MTX A; 3A2F A; 2M6Y A; 4BW5 A; 5LBQ A; 2ZT9 B; 4IL6 Z; 3N2G B; 2YC0 A; 5L3C A; 5B1A B; 4TWK A; 2UXC B; 2LO1 A; 1HR0 O; 4JI5 O; 1FXH A; 1CP9 A; 1W2B U; 2IW5 A; 4I9W A; 1GN6 A; 4TOI A; 3SYP A; 5DN6 G; 3MHH C; 1FAF A; 2JEX A; 5IJ9 A; 1MZF A; 4I55 A; 3RYH A; 4MVS A; 2LFS A; 2VQF B; 4YHH O; 2YID A; 2QSA A; 1K4C C; 5LYJ B; 5D5Q A; 1IXM A; 4X62 O; 1OV9 A; 2Q73 A; 4R8C A; 1H2S B; 4DV7 O; 3HKC A; 5LMU O; 1XMO B; 4DR2 O; 3T1Y O; 4OPA A; 4BWA A; 3FAV A; 5KUM A; 1KBH A; 2G38 A; 4DRX B; 1FFX A; 1XMQ O; 4C7U A; 1VQ7 V; 3ABT A; 2XAJ A; 4O2A B; 2QKA A; 4NKG B; 4J42 A; 1S3J A; 1VQ6 V; 4K3A A; 4DO2 A; 3OW2 U; 2F43 G; 2ZDI C; 4DYL A; 5JCO C; 1AP5 A; 1F4N A; 4YJ2 A; 4DR5 B; 4QIW F; 4YY3 O; 3UO3 A; 1XNQ B; 4LBE C; 3TJT A; 1SRY A; 3H1K H; 2GHY A; 5KMG B; 1WPX A; 2R9I A; 1VAR A; 4B3T O; 4X1K A; 4RQE A; 4GX1 A; 1ORQ C; 2N04 A; 5FPR A; 1DK1 A; 1XRE A; 3LSU A; 4BIO A; 3K0D A; 1X4T A; 2Y0I A; 3CYO A; 2R9A A; 3HPL C; 2Q0A A; 4FIP C; 2QM4 A; 4UCO A; 4B3M O; 4LH6 A; 1AIL A; 2HR3 A; 1KQS U; 5B3S C; 4JI8 B; 5JH7 A; 1F4M A; 3FFQ A; 1R6K A; 4FPP A; 1RM1 C; 1MSW D; 5JWP A; 1WPB A; 1R6N A; 1Q8I A; 3ABK B; 4YXW G; 5J2T B; 4X20 B; 3QO7 A; 1KYO F; 2XUM A; 5DM6 V; 5GON A; 4J7J A; 3UQ8 A; 4X1I A; 2EJ7 A; 3APQ A; 2A79 B; 3BAB A; 3JAK B; 4NTX A; 1YTF B; 5LHH A; 5EC2 C; 1I5Y A; 3FD9 A; 5LGU A; 2QKC A; 1YEW A; 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