The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
75
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structure length |
75
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Chain Sequence |
MMKLGLVRFSMLLALALVVLAIVVQMAVTMVLHGQVESIDVIRSIFFGLLITPWAVYFLSVVVEQLEESRQRLSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Membrane domain structures of three classes of histidine kinase receptors by cell-free expression and rapid NMR analysis.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Aerobic respiration control sensor protein arcB
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| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
21
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| structure length |
75
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| sequence length |
75
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| ec nomenclature |
ec
2.7.13.3: Histidine kinase. |
| pdb deposition date | 2010-01-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF18415 | HKR_ArcB_TM | Histidine kinase receptor ArcB trans-membrane domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | His Kinase A (phosphoacceptor) domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KSD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OXS A; 5CA1 B; 1WP7 A; 5KLV H; 3HKB A; 5A9G A; 4DV2 O; 3RYF A; 3J81 N; 1GN4 A; 3PJS K; 1PL0 A; 4GCZ A; 1YI2 V; 1FXV A; 2OTJ V; 1FFX A; 1F7Y A; 4AQY B; 3U10 A; 3ICX A; 3ZRS A; 1OCC C; 3CCR V; 3AG7 A; 3JCU Z; 4JI1 B; 3LSS A; 5L3F A; 1WPX A; 2P06 A; 2XAS A; 1XL6 A; 2IW5 A; 2A06 H; 3E8G A; 3GWO A; 2VQF O; 3G67 A; 2CTP A; 2JVD A; 4OX9 O; 2ETN A; 1OCZ B; 3QVN A; 1Q3E A; 3JAK A; 1CPY A; 1I08 A; 3KCY A; 1QVG U; 3ZHU A; 4HNA B; 5H6Q A; 4TV9 A; 2NR5 A; 4DV1 B; 1N33 O; 4FM2 A; 4B3M O; 5BR8 B; 4FFB B; 3JSN A; 4DV3 B; 3OEH G; 4FFK A; 2QWQ B; 4FZ0 A; 4JAU A; 4LF5 O; 4Z2W A; 3THO A; 3OUF A; 4QE9 A; 2IJI A; 1FYJ A; 5FPR A; 5LOV A; 5D5P A; 4DUY B; 4FLX A; 1Q5O A; 4UCT A; 4HAM A; 4HYO A; 3SYO A; 1L1F A; 2FL4 A; 3WG7 B; 1F4N A; 4YIO A; 3ZMU A; 5B3S B; 3ABL C; 1TVK B; 5D5Q A; 4DR1 B; 4GLX A; 2HVJ C; 3LDD A; 3K59 A; 1KP3 A; 3JAL B; 4WFG A; 4WFF A; 3FAV B; 3BFR A; 5LHG A; 5B5E Z; 2IM9 A; 3KCX A; 1FXH A; 4LF6 B; 4DUZ B; 3G6E V; 4X1I A; 2RN9 A; 3BCC H; 4X1Y A; 3STL C; 1AI4 A; 2ZQM A; 4O4L A; 2LFR A; 1XBL A; 1UPG A; 1YDX A; 2EUL A; 3CX5 F; 2EIK B; 2XND G; 1RPR A; 2UXC B; 1FPO A; 1MZF A; 3K79 A; 4UCS A; 1LNQ A; 2IJJ A; 4RUF A; 4JI3 B; 4DR3 O; 2UUC O; 2G38 A; 1AI7 A; 2K9P A; 4XDK A; 1FKA O; 1NU1 H; 2B5U A; 2HP8 A; 1EN6 A; 4YY3 B; 3CRR A; 2CE4 A; 1XUQ A; 1PM9 A; 4DR5 B; 2Y0I A; 2P67 A; 5LXT B; 2DYR B; 3FKS G; 1XMO B; 3H9V A; 1R73 A; 2LJ2 A; 3ETQ A; 3L73 H; 2Q69 A; 2ZDI A; 4X62 B; 1SA0 A; 2C2A A; 2YEV A; 3OEE G; 4XDJ A; 3K0D A; 2BTO A; 3K58 A; 4AQY O; 2RDC A; 1NH2 B; 4U3F H; 1JR9 A; 3JAT B; 5CA0 A; 4JI1 O; 5LMN B; 4DV5 B; 2EJR A; 1OCO B; 5IWA B; 1SQQ H; 4J80 A; 1OCR B; 1BMF G; 1S77 D; 2GV9 A; 4MTO A; 4ZOL A; 2P4K A; 1VQO V; 3CCV V; 4FJC C; 3OTF A; 3CCJ V; 4FLU A; 3CJH A; 4MSW C; 4TUY B; 4DV1 O; 4NKG B; 5BR8 O; 3BVO A; 1M1K W; 3CE2 A; 4DV3 O; 4LWS B; 3IGA C; 1K33 A; 3TXQ A; 3FYI B; 1V55 C; 4NYK A; 1K3E A; 4MVO A; 1OV9 A; 3QO7 A; 5J2U A; 1GM7 A; 1SQP H; 2D3O W; 3IAY A; 2YUA A; 3SYC A; 2P5O A; 4LR3 A; 4DR1 O; 4L8J A; 1KQS U; 5JQG B; 3SDL A; 3CWB H; 5LYJ B; 1N4C A; 4YHH O; 2DYS C; 3A0H Z; 3RGB A; 5IJ0 A; 4JI7 B; 4BAY A; 5KHI A; 4AIL C; 4N23 A; 3JYC A; 4W4K A; 1SZX A; 2ZIN A; 2JJ1 G; 4DV0 B; 3A8T A; 4LF6 O; 4DUZ O; 2LQT A; 2IH3 C; 5IYZ B; 5HFL A; 5IJ9 B; 1HWY A; 4LFC B; 1NJI W; 4GKK O; 1VQ5 V; 2DQ3 A; 2QM4 A; 3W7U A; 1MG1 A; 4JI5 B; 2GTS A; 1OHH G; 4LNU A; 4PI0 A; 3TGU H; 3TJT A; 3ZHS A; 3LNM B; 2UXC O; 5KX5 A; 1XIL A; 4JI3 O; 4G27 B; 5H2F Z; 2PTM A; 2CGO A; 1U96 A; 3SPJ A; 2PUS A; 5KAF Z; 1P7G A; 5LXT A; 4YY3 O; 3T1H B; 1NBM G; 1I94 O; 1I7F A; 4DR5 O; 4FM1 A; 2UXD O; 1R6T A; 1KMI Z; 2YIC A; 3K06 A; 1XMO O; 3SPI A; 4JI8 B; 3AG3 C; 3JAW B; 4X62 O; 1Y74 A; 3JAT A; 4OGQ B; 4JYY A; 4UCR A; 1E79 G; 3ABL B; 4X20 B; 1S72 V; 3M7M X; 1R1B A; 2GDS A; 5IY5 C; 3CSX A; 3L70 H; 1XHX A; 5LMN O; 4QE7 A; 5LA6 A; 3B4S A; 2IH1 C; 2ZE6 A; 4DV5 O; 1NR1 A; 4I50 B; 5BY1 A; 1MSD A; 3MAQ A; 4PI2 A; 2RCV A; 5CBH A; 3IC9 A; 3BAA A; 2B1G A; 1VQ7 V; 2RJZ A; 3L72 H; 4X66 B; 5KA6 A; 2F4V B; 1Q86 W; 3ABM C; 3AEI A; 2WLJ A; 3ZIA G; 1PNK A; 4QIW F; 5JH7 A; 3G4S V; 4CC6 A; 2ZR3 A; 2QA4 V; 2N74 A; 1BQZ A; 3ZMS A; 3CC7 V; 1JVM A; 4CZZ A; 1KUQ A; 4BIO A; 1HDJ A; 4NXN B; 5LYJ A; 2Y69 C; 1Q43 A; 1AP6 A; 4RUE A; 1ROP A; 1SS3 A; 3KZI Z; 3SYQ A; 4U3J A; 1RSO A; 1MOF A; 1V54 C; 1YJ9 V; 1IUR A; 2ZXW C; 4YJ3 B; 2KG7 A; 2W0F C; 2ZDI C; 3D8C A; 4GX5 A; 3T2M A; 3CPW U; 4O4I A; 2JGD A; 5IYZ A; 4QPJ A; 3JD1 A; 5LMU B; 4RWU A; 4DV0 O; 2Q9L A; 3T1C A; 1JJ2 U; 3ZCC A; 3S3X A; 2XAF A; 1L0L H; 2CGN A; 3LSQ A; 4DR7 B; 4LFC O; 1YIT V; 2K1E A; 4E2L A; 1QR9 A; 3JAR A; 3F7Y C; 4UB8 Z; 1PNL A; 2BTQ B; 2QGN A; 3AG1 C; 4K3A A; 1LR1 A; 1J95 A; 2VRZ A; 5KHJ A; 1SES A; 2ZT9 B; 4J7K A; 3E35 A; 3E89 A; 4RO2 A; 5EIB D; 3FX7 A; 3WG7 C; 1CEZ A; 2OYQ A; 4UCU A; 2BE3 A; 1AR4 A; 2NN4 A; 3QO8 A; 1EFR G; 2OIG A; 1US6 A; 2YXY A; 5ITZ B; 5JCO A; 4X20 A; 4NXM O; 4JI8 O; 1N32 B; 5BZB A; 2CH7 B; 1OZ0 A; 2ZE5 A; 1NH2 D; 1R3J C; 2Q7H A; 4PDL A; 1DLB A; 1M57 C; 3HKE A; 3OT7 A; 4OPH A; 2ZM6 B; 3O65 A; 3RYF B; 2HEP A; 2EBO A; 3T4Z A; 5CBF A; 4LF9 B; 1WJZ A; 5LHH A; 5IDJ A; 2IJK A; 2DE0 X; 4EFB A; 5EC1 C; 1FFX B; 4DV6 B; 3MD0 A; 5HFM A; 2X6B A; 2ARH A; 2PI4 A; 2EIK C; 1AI5 A; 2QWN B; 4K8Z A; 4TQD A; 4X66 O; 2QWR B; 4UFZ A; 2N04 A; 3W7X A; 3ZED A; 5KHK A; 2B9Z A; 3H1L H; 1VEW A; 4XDL A; 3JAK B; 2VS0 A; 5KA5 A; 1K4D C; 2OWO A; 4TV9 B; 3RYC A; 1FS0 G; 3OD4 A; 4YJ3 A; 2F95 B; 3L74 H; 1HNW B; 3ABK C; 2R9A A; 5LOV B; 3P3P A; 4ABM A; 2Z5U A; 2Q4P A; 4MW8 A; 3HB3 B; 3CCQ V; 5EZY A; 4ASU G; 3J7A U; 2R70 A; 3UO2 A; 3AG3 B; 3B77 A; 5CB4 B; 3I55 V; 3L75 H; 5LMU O; 3QO5 A; 2P7T C; 2IBZ H; 3VQV A; 3OMN B; 1EZV H; 4DR7 O; 4JI2 B; 1D5N A; 1JFF A; 2Z3Y A; 1R3L C; 4GX2 A; 4IT5 A; 3WB1 A; 1E1R G; 4X1I B; 1Q6I A; 1IXB A; 1K5Q A; 1M56 C; 1H2S B; 1GO3 F; 4O4L B; 3ABM B; 1BE3 H; 3ZHR A; 3CC2 V; 4IL6 Z; 1VAR A; 3BHP A; 2EIN C; 2P6J A; 2DQ0 A; 2JRI A; 3MDS A; 3RBZ A; 2CH7 A; 3STZ C; 5K1P A; 2QTS A; 5GTI Z; 3K0G A; 1U97 A; 2QKC A; 4NB5 A; 3DTU B; 1N32 O; 4B7K A; 2XUM A; 1BT8 A; 2DOS A; 2Y69 B; 3HR0 A; 3OFN G; 5EK0 A; 3TK1 A; 2ZM6 O; 4CH4 A; 2FTK A; 3CMA V; 1N8R W; 4G2K A; 4B3S O; 1H2N A; 1V54 B; 4LF9 O; 2ZXW B; 1M9N A; 2GHY A; 1YTF B; 3JAS A; 1SA0 B; 2YEV B; 1DK1 A; 2W6J G; 4CS3 A; 4DK1 A; 4GYC B; 1XDC A; 3E86 A; 1VQ9 V; 2X6A A; 4DV6 O; 2CTQ A; 2YXL A; 1SQG A; 1EZJ A; 2LO1 A; 2FKX A; 3VQW A; 5CA0 B; 4EKW A; 2JJ2 G; 1DGS A; 2F1M A; 3SJQ C; 2YS8 A; 3ZHT A; 4F6E A; 3ZX6 A; 4ZOL B; 2ZE8 A; 3APO A; 3GB7 C; 5KUK A; 3CHX A; 3AG1 B; 4TSF G; 1VF7 A; 1PL4 A; 1XMQ O; 1KBH A; 3CJH B; 1ZAU A; 5B1O A; 1JOY A; 2HG5 C; 4J10 A; 2ZE7 A; 1JQ0 A; 4UCV A; 3T1Y B; 5L3G A; 1HNW O; 3I5D A; 4IYH A; 5LP6 A; 5E1A C; 1THZ A; 1O9G A; 2DWE C; 1S0V A; 2QWP B; 5CB4 A; 5JCO C; 5K1X A; 3OUS A; 5J2U B; 4P30 A; 2Q6A A; 4FZ1 A; 4HBN A; 5JVD A; 4YHH B; 3JD4 A; 1L8D A; 1H8H G; 3CRQ A; 4MTX A; 1YSC A; 1M57 B; 3JD2 A; 2LP7 A; 1NTM H; 5IJ0 B; 5EBW C; 4FLY A; 4JI2 O; 2UUB B; 4LP8 A; 4LF8 O; 4LF7 B; 2A79 B; 1SQF A; 4JAA A; 4GKK B; 2BCC H; 4JZ2 A; 2A9H A; 1JMK C; 1Q81 W; 1KB9 F; 4K0K O; 4O4H A; 2AW9 A; 4JPR A; 4X1K A; 1W59 A; 5GW7 A; 4CC5 A; 4X64 B; 5FL7 G; 2HLD G; 2M7W A; 2QSA A; 4LNU B; 4O4J A; 3CCL V; 4B3T B; 1FD9 A; 1SF9 A; 4FLZ A; 5KX5 B; 3D3Q A; 1I94 B; 1NI8 A; 1IZ3 A; 5FNV A; 1YZB A; 3RT3 C; 3AK2 A; 2JIZ G; 4YXW G; 4JYC A; 2UXD B; 2F93 B; 3WB0 A; 4TOI A; 1BSM A; 4CH3 A; 1LUW A; 4IIJ A; 1PV0 A; 2GTA A; 1VF6 A; 3ABK B; 1W2B U; 2YIA A; 1YEW A; 2JS5 A; 4PDV A; 3MHS C; 1EBO A; 3CRA A; 4I7Z B; 1GH6 A; 1Y74 B; 1R3K C; 4PDM A; 2JGU A; 5CMU A; 1ZL8 B; 2CTR A; 4O2B A; 3Q4H A; 2EJ7 A; 1PD3 A; 5LA6 B; 4WCE V; 4CH6 A; 3LSU A; 4P9P A; 3B8M A; 4BIU A; 5F2V O; 3FFQ A; 4YIP A; 1HNZ B; 2P90 A; 1E1Q G; 4GZR B; 4ZIB A; 3RWR D; 3ZRW B; 1YJN V; 5KMG A; 1M56 B; 3K5L A; 1G4Y B; 4H33 A; 3K5O A; 5LHI A; 1XQ8 A; 3T1Y O; 2IU0 A; 2AGA A; 4LFA O; 3G6B A; 5JH7 B; 4B3R O; 2EIN B; 2E75 B; 3IJ4 A; 5EYP A; 4ZHQ A; 1SKV A; 2WPD G; 1YJW V; 2ODM A; 2EIJ C; 3R65 A; 5H9C A; 1ZX3 A; 4U3J B; 1RSO B; 2V1D A; 3OAA G; 4DYL A; 1XNQ B; 3FB6 C; 2KG7 B; 1G1X B; 5TIS Z; 2L6L A; 4TWK A; 4O4I B; 2UUB O; 1SER A; 2JGD B; 4JTD B; 2KSD A; 3JD0 A; 2OCH A; 1QLE B; 4LF7 O; 4MTG A; 5DM6 V; 1XHZ A; 2BOC C; 2N05 A; 4CS2 A; 4P2Z A; 2XAQ A; 2DMX A; 1WB7 A; 1K9M W; 2JEU A; 5BMV A; 2HHH O; 3JAM N; 5L3C A; 4X64 O; 4H13 B; 4LCU C; 5KHH A; 2WA3 A; 2CTW A; 4YJ2 A; 5B1A C; 1B3Q A; 4ZI7 A; 4B3T O; 1K92 A; 1I5Y A; 3JAR B; 2JS3 A; 3SJA C; 2GSM B; 1IVS A; 2M6Y A; 1NQT A; 4ICG A; 3K57 A; 5LL6 Y; 3ZHV A; 3IC7 A; 1K34 A; 1HP8 A; 2NNU A; 1L0N H; 2XAJ A; 4CH5 A; 3BY6 A; 5H6R A; 3X2Q C; 3CCS V; 4NXM B; 1KC8 W; 1WP8 A; 4IYI A; 4MVZ A; 4UUJ C; 1N34 B; 3FB7 C; 1YTF D; 1BL8 A; 4LH6 A; 2KQX A; 1XRE A; 3TXS A; 1XOU A; 2F43 G; 1YVW A; 1B04 A; 4NTX A; 1AVM A; 1ZL8 A; 3RYH A; 4DW1 A; 3EHB B; 2HKO A; 3HKE B; 4TV8 A; 1Q7Y W; 3SR2 C; 2PGG A; 3L9D A; 1GM9 A; 1K7D A; 1NKD A; 2V4D A; 4EB6 B; 1KU9 A; 4WBN B; 3N2K A; 4DO2 A; 2WLH A; 3CXH F; 2CUG A; 3ZRW A; 1RPO A; 3BA8 A; 4PEL A; 3SGI A; 1HNZ O; 1Q8I A; 2F23 A; 1VMG A; 1QHT A; 1AB3 A; 3EVK A; 1DF4 A; 3K03 A; 4MT8 A; 4KXR A; 1WB8 A; 3WFV A; 2ZR2 A; 1XI1 A; 5CN0 A; 4FIP C; 3EXA A; 3LNN A; 4R7C A; 3H1J H; 3ETE A; 1FJG B; 2YIB A; 4MVU A; 1NS1 A; 4IHJ A; 3E8F A; 1Q90 D; 4F4L A; 3RYC B; 4PDR A; 2B1I A; 4B08 A; 1AR1 B; 4GUN A; 4DXW A; 1VF6 C; 4JAS A; 2QDO A; 3CC4 V; 3P3N A; 2OIE A; 1XNQ O; 2AXT Z; 1WNS A; 3D36 A; 3RFR A; 1FAF A; 5EZY B; 3P30 A; 3ZMV A; 4ZKI A; 5L3B A; 2ZNI A; 1HW7 A; 2WAM A; 1ZSP A; 2XTA A; 4JYA B; 3ZN0 A; 1P7B A; 4J11 A; 2XAG A; 3KG2 A; 3ML0 A; 3RN4 A; 5LGN A; 3D3I A; 3JD3 A; 1VQP V; 1JFF B; 1MA1 A; 3B40 A; 3E8B A; 1F4M A; 4EFE A; 3OMI B; 3K5N A; 1AI6 A; 2BSK A; 2L35 A; 2E5L O; 3E22 A; 2X7R B; 2LW7 A; 4DR4 B; 3OR7 C; 1AJN A; 1DF5 A; 2AHY A; 1TUB B; 1Z5W A; 2JDI G; 4LFB B; 1YIJ V; 1IXM A; 1Y76 A; 4MTF A; 1N34 O; 3G80 A; 1WA8 A; 2WA4 A; 3C3T A; 4QNH B; 3I56 V; 4RQF A; 1GMG A; 4KFM A; 1G6U A; 3UT5 B; 4B3S B; 4KP4 A; 4EB6 A; 4QGP A; 2AHZ A; 3UM7 A; 4WBN A; 4IGG A; 1R3I C; 2QEX V; 2EIJ B; 4JV5 B; 1V9P A; 2YSU B; 4OPA A; 5EBL C; 1H2L A; 1IBL O; 1PNM A; 3JAS B; 4P9O A; 1IBK O; 4PA7 A; 1QCE A; 4G28 B; 1SQB H; 2H94 A; 1Q6H A; 2IJH A; 4J7J A; 4BR6 A; 2QM8 A; 1UJW B; 4RAI A; 2PY5 A; 2Q8V A; 2KKW A; 3DC5 A; 2A0L A; 3K08 A; 4LC1 A; 1QBZ A; 2WLI A; 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