The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
63
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structure length |
63
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Chain Sequence |
CSTVSPGVLAGIVVGDLVLTVLIALAVYFLGRLGTAEVLGIISIVLVATVLKTIVLIPFLEQN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The structural basis for intramembrane assembly of an activating immunoreceptor complex.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
DAP12-NKG2C_TM
|
| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
19
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | YojJ-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WP7 A; 2L35 A; 4FZ0 A; 3S3W A; 3S3X A; 4NTW A; 4NTY A; 3IJ4 A; 2FB5 A; 1WP8 A; 2QTS A; 4FZ1 A; 4NYK A; 3N27 A; 4NTX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DE0 X; 2UXD B; 4PA4 A; 2MW2 B; 3BVO A; 4K8Z A; 2P4V A; 4G28 B; 3F5T A; 3P32 A; 1S0V A; 1JQ0 A; 1NVP D; 1YJW V; 3RYH A; 2GUZ B; 5BXZ A; 1KUQ A; 5KHJ A; 2UXB B; 1XMQ O; 3JAL A; 1Q8I A; 1TGO A; 3U10 A; 3K08 A; 2IW5 A; 1YIT V; 3UO3 A; 1AI6 A; 4OX9 O; 4FLZ A; 1XHX A; 2NR5 A; 2DYR B; 1DLB A; 1GMG A; 4O4H B; 5LHH A; 3H01 A; 3ZMS A; 4MVR A; 4JI7 O; 3E2E A; 2Q67 A; 1IBM B; 3ZRV A; 5JJN B; 1M56 C; 4U7O A; 3K57 A; 4WFA V; 2EIK B; 2QM7 A; 4P30 A; 1N33 O; 4D6T H; 3QF7 A; 1SQF A; 2E76 B; 5IJ9 B; 4ZOL B; 2PI4 A; 1VQM V; 3TXS A; 1YXB A; 1VEW A; 1AJP A; 4LH7 A; 1KYO F; 3N2K A; 3T1Y O; 1D2D A; 1EFR G; 1YIJ V; 2QWP B; 4UCT A; 3HKD A; 4ZHQ B; 4DV2 B; 1FD9 A; 1NKD A; 4XDL A; 2WLI B; 1SQG A; 2HLD G; 2OCC B; 3ZRS A; 3AG1 C; 4DUY O; 4LF7 B; 4FZ1 A; 2DW4 A; 3QNE A; 5B1A C; 3K5N A; 2ZKO A; 1QVF U; 2UUB B; 2Q0O C; 4PV1 B; 4CS3 A; 1V9P A; 3VQX A; 3LSU A; 4UFZ A; 3L70 H; 1J5E O; 2EIN B; 2EJR A; 5B1B B; 2L6L A; 2IJK A; 4DR7 O; 5JCO A; 3KZI Z; 2YXL A; 4O4I B; 3BA9 A; 3CYO A; 3Q4H B; 1WP7 A; 2EJ7 A; 1HNZ B; 3MD0 A; 4J11 A; 4L87 A; 3CCV V; 4QNH B; 3FB8 C; 4DR1 B; 2Q4P A; 4NR1 A; 3ZJZ A; 3E8F A; 5IYZ B; 1GKF A; 1IUR A; 1VQL V; 1S5L Z; 3OTO B; 4B3T O; 1I7F A; 5C8Y A; 3LDD A; 3W7S A; 1GH6 A; 1KKD A; 1Z5W A; 1SC5 B; 4DV4 B; 1QLE C; 1W0K G; 4QJF B; 1B06 A; 2YIC A; 3UKM A; 3H1H H; 4U7N A; 4EB6 A; 5CA0 B; 3NR7 A; 3CCQ V; 5LYJ A; 4J9Z B; 2BTO A; 1G1X B; 4DV0 B; 3CRC A; 1NH2 D; 1K3E A; 3RFR A; 4X1K B; 3A0R A; 2E74 B; 4H44 B; 4JI3 O; 1K8A W; 5LOV B; 5KX5 B; 3CCU V; 1I94 O; 1CXZ B; 3IC7 A; 1KB9 F; 3KKY A; 4KL1 A; 1QR8 A; 2YS8 A; 4U3J B; 1FKA O; 5B1N A; 5B3S B; 5JWP A; 2GTS A; 4J7J A; 3CB2 A; 4EFE A; 4LF6 O; 4H37 A; 4FLX A; 3AK3 A; 4DV7 B; 3R65 A; 4EFB A; 1ENV A; 3EFF K; 3OW2 U; 2JS5 A; 2Q68 A; 2UUA B; 4DR3 O; 3CRQ A; 1D5N A; 2GDS A; 1W0J G; 1EZV H; 2QSA A; 3L75 H; 1WPX A; 3RYF A; 4JI1 B; 2VWK A; 3LDE A; 2ZE6 A; 2WA4 A; 4D7S A; 3CWB H; 2R9R B; 3SJB C; 1N0N A; 1M57 B; 2P4K A; 3K5L A; 4AIL C; 2F66 C; 4EEQ A; 1AR4 A; 5KAI Z; 1S5H C; 4PDL A; 1YEW A; 4DK1 A; 1X4T A; 4WFB V; 1ZSP A; 5LA6 B; 2X6C A; 5L3D A; 2Q5Z A; 2LO1 A; 4CC5 A; 4FFB A; 3JD2 A; 3SPC A; 4DV1 O; 1Q43 A; 4DUZ B; 2UU9 O; 4B3M O; 4JI0 B; 4X62 B; 4JTC B; 4LH6 A; 3BEH A; 1AB3 A; 3WG7 C; 1G8M A; 3E35 A; 4BIU A; 2WSS G; 4X8A A; 1WNS A; 2LFS A; 2W6I G; 1XEQ A; 5LP6 A; 5E79 Z; 4RUF A; 4JI8 O; 3GWO A; 2M7W A; 1L1F A; 2B9Z A; 2CGO A; 4JI6 O; 3HPL C; 3S3W A; 2A3Q A; 4J9Y B; 4QGP A; 3CC4 V; 4PA7 A; 2PTM A; 4FMT A; 2RNB A; 4AQY O; 4IHJ B; 1US6 A; 2JGD B; 2HVK C; 3SPI A; 3RGB A; 1DF4 A; 1TUE B; 2QWO B; 3JD1 A; 4B3R B; 2L35 A; 3E22 A; 1U97 A; 1K5Q A; 2RMK B; 4F4L A; 1H8E G; 1OHH G; 2QKA A; 2WLL B; 2GHY A; 1R1B A; 3ZRW B; 5KHI A; 3IC9 A; 3MHS C; 1OCC C; 1KD1 W; 1RM1 C; 1I5Y A; 4X20 A; 3E8G A; 3ABL C; 1QQC A; 4E2L A; 2VQE O; 2XUM A; 1VMG A; 1URF A; 2N04 A; 3EHB B; 4O2B B; 5IE9 A; 3QO7 A; 1TUB B; 1EN4 A; 2P22 C; 2XOK G; 1JX9 A; 1GN4 A; 3SYP A; 3I56 V; 5L3C A; 2X0L A; 1X59 A; 2QTS A; 5JQG A; 4MTO A; 4FM0 A; 2UXD O; 3K06 A; 3W7U A; 3KCX A; 1N34 B; 4O4J B; 1WA8 A; 1Q6I A; 4LFA B; 4IGG A; 2AHY A; 3B4S A; 2AZ0 A; 3CMA V; 1FXV A; 5B5E Z; 1F7Y A; 2PY5 A; 1ARO P; 3PN1 A; 2JRI A; 2FML A; 3FB5 C; 2FKX A; 4RO2 A; 5A2Q N; 2BOC C; 4OPA A; 2R70 A; 5CB4 A; 3UT5 B; 2YEV A; 2Y4T A; 3JAT A; 1GM9 A; 1YI2 V; 3WB1 A; 3JAK A; 4HNA B; 1KC8 W; 3FYI B; 1I5X A; 1HDJ A; 3OMA B; 1WPB A; 4X64 B; 1BQZ A; 4FLW A; 4IYH A; 1GO3 F; 1WB8 A; 5H6R A; 3RYH B; 1W59 A; 2Q7E A; 1IBL B; 3UCS C; 1NJI W; 1I94 B; 3JAL B; 1IBM O; 2PYJ A; 3JSN A; 1VQ6 V; 4I5S A; 2IBZ H; 1V54 C; 3AG2 C; 2WPD G; 1SKV A; 5L3G A; 4A5U B; 1WB7 A; 5KUK A; 4L8J A; 2YI9 A; 3ASN C; 3LNN A; 2EIJ B; 3A8T A; 4WFE A; 1SQQ H; 4IIJ A; 4RQF A; 3DXR A; 3EVK A; 1QCE A; 1QBZ A; 1PKX A; 4MVZ A; 1Q90 D; 1XBL A; 3LNM B; 2EX3 A; 1N32 B; 3APQ A; 4CH5 A; 4GX2 A; 4PHZ A; 3CEI A; 3DC6 A; 3ABK B; 2BTQ A; 3JSL A; 4CC6 A; 4DV2 O; 2HR3 A; 1O9G A; 3FB6 C; 1NH2 B; 5CMU A; 3ZHR A; 2Q9L A; 1VF6 A; 2QWR B; 3ZHQ A; 4BIZ A; 4LF7 O; 5IT9 N; 1RSO B; 5EIB C; 1XI1 A; 1COW G; 1VF7 A; 3AG4 B; 4TUY A; 2UUB O; 4FVM A; 3B2E E; 1S72 V; 2X6A A; 3CD6 V; 5HFL A; 3FAV A; 3T1C A; 5KHK A; 3HKD B; 4GX5 A; 4MTG A; 1S76 D; 3SJC C; 4X66 B; 1CEZ A; 4JAA A; 4TQF A; 4YHH B; 3HKB B; 2B5U A; 3LSS A; 4H33 A; 4NXM O; 1HNZ O; 4BR6 A; 1V55 B; 2E5L B; 3F7V C; 4DR1 O; 2Y69 B; 4O2A A; 1Q81 W; 4GKK B; 2M6Y A; 4DV5 B; 2EIK C; 1FFX A; 1MMM A; 1Y74 B; 2IJI A; 5JVD B; 3K5O A; 1NU1 H; 1XUQ A; 4GX1 A; 1IBK B; 3OTO O; 3OTF A; 3SYO A; 2KB1 A; 2P06 A; 4P9P A; 1GN3 A; 1Y4M A; 3CE2 A; 1PNL A; 2OT5 A; 1BHA A; 2UUC B; 4DV4 O; 1RP3 B; 5GTH Z; 3CC2 V; 1S77 D; 4I50 A; 1S3J A; 4PEL A; 2IJJ A; 3L71 H; 5JJJ B; 1OJH A; 2VQF B; 3AG7 A; 1Q82 W; 4DV0 O; 4I4T A; 3RYC B; 4UCO A; 3QG5 A; 2YIA A; 3WU2 Z; 2JDI G; 2HHH B; 4Z1V A; 4UUJ C; 1GTO A; 1HR0 O; 4HBN A; 2Q6A A; 3JYC A; 2EIL B; 2Z0A A; 2IM9 A; 1XNQ O; 3G6B A; 1AR5 A; 4YIP A; 4DR4 B; 5LYJ B; 1ZTE A; 4DV7 O; 2AZ2 A; 2F4V B; 4RUE A; 3CJH A; 2UUA O; 2QR4 A; 4DRX A; 1OV9 A; 2EIN C; 4TWK A; 3CPW U; 5B1B C; 3CXH F; 1IXB A; 4JYY A; 5CA3 A; 3ABM B; 2G38 A; 2LFR A; 5JJE B; 4JI1 O; 4LF9 B; 4JI2 B; 3WFV A; 2OWO A; 5EZY A; 1BHB A; 1FPO A; 4IL6 Z; 2A0L A; 2BOB C; 1FAF A; 1PM9 A; 3RBZ A; 3K5M A; 3CME V; 1MZE A; 4PA9 A; 4O4L A; 4QE7 A; 2YUA A; 4UVB A; 2A06 H; 5IJ0 A; 4MVO A; 2DWD C; 1PV0 A; 3OAA G; 3TCU A; 4DUZ O; 2YIB A; 1BCC H; 1RFY A; 4ZBM A; 4JI0 O; 4X62 O; 1VQ7 V; 1JCH A; 3IFX A; 3IGA C; 4DK0 A; 1OCR B; 1XQ8 A; 3M7M X; 2HKO A; 3EXA A; 4TV8 A; 4PI2 A; 3ZHS A; 3L9D A; 4GYC B; 4TT3 G; 4LWS B; 2EIM C; 1GRJ A; 4B3S B; 3OUF A; 4BW5 A; 4DW0 A; 2Z5U A; 2YSU B; 3FB7 C; 5B3S C; 3B77 A; 5FPR A; 3T2M A; 2V4D A; 3K03 A; 3AK1 A; 1JVM A; 1F51 A; 3ZMZ A; 3G4S V; 2XAG A; 3J80 N; 2PYL A; 3KG2 A; 4E4E A; 2FTK A; 3AK2 A; 4YJ2 A; 5J2U B; 4LF8 B; 4B3R O; 2DYS B; 3TET A; 1YTF D; 4B7K A; 2ZNJ A; 2GV9 A; 2ATK C; 1GM8 A; 1VQ4 V; 2R9I A; 1M57 C; 2CTW A; 3CCL V; 3BCC H; 2K1E A; 3UQ8 A; 1K4D C; 3CCJ V; 3A0H Z; 5BR8 B; 4UXN A; 4D7T A; 5B1O A; 1KQS U; 1G4Y B; 2CGN A; 3ZRX A; 3CP1 A; 1K73 W; 4MT8 A; 1NT2 B; 2XAH A; 3F5W C; 1HNW B; 1KP3 A; 3WB0 A; 5LXT A; 1ZL8 B; 1YJ9 V; 2AHZ A; 2RQ6 A; 4JAV A; 1OZ0 A; 4X20 B; 3DTU B; 1SA0 B; 1JFF A; 1F23 A; 3S3X A; 2IJH A; 5K1P A; 3TK1 A; 4MW8 A; 1QVG U; 2ITD C; 2YIB D; 4F6R A; 1XL4 A; 1IZ3 A; 2XND G; 3K9A A; 1N34 O; 3FYE B; 4NXM B; 4LFA O; 1FFT B; 3LDC A; 3DGE A; 4K0K B; 4FM2 A; 3QVN A; 2BSK A; 1E1Q G; 1IVS A; 3JAM N; 4DW1 A; 3HKE A; 1MSD A; 4MTF A; 3B8N A; 4J42 A; 2QDO A; 5JH7 A; 1SER A; 3AEI A; 3FX7 A; 1CPY A; 5ITZ B; 2QGN A; 4FLT A; 2H94 A; 5KMG A; 2QKS A; 3BA8 A; 2N74 A; 3ZBH A; 1FXK B; 3O65 A; 1VAR A; 1QHT A; 3ETQ A; 4X64 O; 1Z5V A; 1G6U A; 2D2C B; 4FFK A; 3TXQ A; 4FJC C; 1M1K W; 4G27 B; 4GX0 A; 1NBM G; 5CB4 B; 3CXC U; 1IBL O; 3PJS K; 2FB5 A; 4JAU A; 2QA4 V; 3JAT B; 1HR0 B; 3JCU Z; 3JAK B; 4CS4 A; 1Y76 B; 1NTZ H; 2DQ0 A; 1XNQ B; 5H9C A; 4R50 A; 1XNR O; 2KQX A; 3OR6 C; 1NZ6 A; 3STL C; 3X2Q B; 2ADP A; 4DV6 B; 1GN2 A; 1TVK A; 4UCR A; 2CH7 A; 4OPH A; 1W2B U; 4UCV A; 2FYU H; 4TV9 B; 1K5S A; 3ML0 A; 2QWN B; 1VQP V; 5EC2 C; 1N36 B; 1SQX H; 4FPP A; 2YDE A; 1N32 O; 4FZ0 A; 2EZO A; 1ZAU A; 5DM6 V; 4X9Q A; 1VP7 A; 1VQ8 V; 1UFI A; 4JV5 B; 2CE4 A; 1VQ5 V; 2QTO A; 1ROP A; 1DGS A; 1SZX A; 3JAR A; 5CA1 B; 4JPR A; 3OGI B; 2PUS A; 4LC1 A; 5KUM A; 1WAZ A; 4IIJ B; 4XDK A; 1H2N A; 5BZB A; 1YDX A; 4GCZ A; 1MA1 A; 1H38 A; 2LW1 A; 3VOU A; 4X65 B; 2KG7 A; 1O9H A; 3NXS A; 4MTX A; 4PA3 A; 4X66 O; 4JYA B; 1UPG A; 4YHH O; 2QEX V; 1THZ A; 4O4H A; 3U11 A; 4PD4 F; 2E5L O; 3C3T A; 4GKK O; 4Z1M G; 2Q7G A; 4DV5 O; 4LF5 O; 2QE7 G; 3H1K H; 4J7K A; 4UB8 Z; 1YHQ V; 3ZN0 A; 5FNV B; 5CBF A; 1HNX B; 1PL0 A; 2ITC C; 3U0Z A; 1K4C C; 1IBK O; 2WLH A; 3B40 A; 3RW0 A; 2DJV A; 1NVP B; 4DR2 B; 3N2G B; 2UUC O; 5IJ9 A; 2EIJ C; 5BMV A; 3JD0 A; 3UO2 A; 1M9N A; 2EUL A; 4JTA B; 4WFF A; 4JZ2 A; 2FL4 A; 2XAF A; 4J10 A; 3RYI B; 1FFX B; 2VQF O; 4YJ3 B; 1AR1 B; 1LNQ A; 2N05 A; 3P3P A; 2F93 B; 5TIS Z; 2EBO A; 3ABK C; 2HHH O; 5LL6 Y; 1F4N A; 4R7C A; 2B1G A; 3W7W A; 4WCE V; 1HP8 A; 4I50 B; 4K3A A; 2Z3Y A; 3F7Y C; 1QLE B; 2WLI A; 2JVD A; 2YXY A; 3B09 A; 4YXW G; 1SQV H; 3SDL A; 4DR4 O; 3AG4 C; 4NXN B; 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1PD3 A; 4LFC B; 3ZHV A; 2XTA A; 3VQW A; 4LFB B; 1SES A; 3D8C A; 2DWE C; 2NN4 A; 5BR8 O; 3SJQ C; 3ZMU A; 4JYC A; 4CH6 A; 5LA6 A; 1CP9 A; 4LF4 B; 3MDS A; 1NR1 A; 4CS2 A; 3N2K B; 4IYI A; 3FD9 A; 1HNW O; 2JEX A; 5L3B A; 1SQP H; 1NTM H; 3OE7 G; 3ABL B; 2ODM A; 1OCR C; 2DYR C; 1KU9 A; 1BZK A; 3K58 A; 4K0K O; 3ZMT A; 4LCU C; 1ZWI C; 4LF5 B; 1QLN A; 4IHJ A; 1JFF B; 4MS2 A; 1E1R G; 3K59 A; 2CDY A; 4DXW A; 5BY1 A; 2DYS C; 3G6E V; 4WBN A; 1I08 A; 5EYP A; 1KBH A; 1Z2G A; 1VQ9 V; 4JYB A; 2PZS A; 4NVP A; 1NS1 A; 5C8Y B; 4BWA A; 2XAS A; 5IDJ A; 2Q73 A; 2P5O A; 5KMG B; 3HR0 A; 4KUM A; 2OCC C; 1PNM A; 2IU3 A; 3FKS G; 3T4D A; 1SS3 A; 2DQ3 A; 4EB6 B; 3MAQ A; 2F23 A; 1Q6H A; 4DV6 O; 2HP8 A; 3AG3 B; 1TUB A; 5CN0 A; 2B1I A; 1K9M W; 1P4R A; 2WLK A; 4JAS A; 4TQD A; 1SZT A; 4IT5 A; 3P30 A; 1H2L A; 1AJN A; 1Y6X A; 1ORQ C; 2RJZ A; 3T4Z A; 1Q5O A; 2W0F C; 3B8M A; 1N36 O; 4W4K A; 3VQY A; 1BGY H; 4CBC A; 1YF2 A; 1BSM A; 1TVK B; 2QKC A; 4JV5 O; 4NYK A; 1XL6 A; 3THO A; 5GW7 A; 3RYF B; 1AJQ A; 1MOF A; 4PA6 A; 3ABU A; 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