The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
71
|
structure length |
71
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Chain Sequence |
GMVKETTYYDVLGVKPNATQEELKKAYRKLALKYHPDKNPNEGEKFKQISQAYEVLSDAKKRELYDKGGEQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
NMR structure of the protein BC008182, DNAJ homolog from Homo sapiens
rcsb |
| molecule keywords |
DnaJ homolog subfamily A member 1
|
| total genus |
22
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| structure length |
71
|
| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2OCH A; 3UO2 A; 2QSA A; 2CUG A; 4RWU A; 3APO A; 2QWN B; 2CTP A; 3UO3 A; 2KQX A; 2DN9 A; 2EJ7 A; 2YS8 A; 2Y4T A; 2YUA A; 3APQ A; 3AG7 A; 1FAF A; 2Y4U A; 4J7Z A; 1FPO A; 1WJZ A; 1XBL A; 1N4C A; 2CTQ A; 1HDJ A; 1GH6 A; 2CTR A; 3BVO A; 3UCS C; 2LGW A; 2GUZ A; 1NZ6 A; 2N05 A; 2LO1 A; 2QWP B; 2PF4 E; 2DMX A; 2GUZ B; 2N04 A; 1IUR A; 2CTW A; 2QWO B; 2L6L A; 2QWQ B; 4IT5 A; 1BQ0 A; 4J80 A; 2M6Y A; 2QWR B; 1BQZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OUF A; 2CUG A; 1ORQ C; 2IH3 C; 3SJA C; 1S76 D; 3SJB C; 1T5E A; 5JCO A; 3T1C A; 1WA8 A; 5KMG B; 3BA8 A; 3W7X A; 1ZAU A; 4DV6 O; 1JJ2 U; 2YDE A; 4K0K O; 3L75 H; 1NKD A; 2QWP B; 3JAS A; 1QR8 A; 1IZ3 A; 2QKS A; 4TQD A; 1HR0 O; 4LFC O; 1BQZ A; 2ZDI A; 5E79 Z; 4TV9 B; 1RSO A; 2L35 A; 5L3G A; 4I50 A; 1Q5O A; 5GTI Z; 4GKK O; 1M93 A; 1XOU A; 3WB2 A; 3ETG A; 2M7W A; 3SPC A; 1KBH A; 2R72 A; 5LOV A; 1XL4 A; 4OPA A; 2XAF A; 5LYJ A; 2OWO A; 1YCI A; 3UT5 A; 4YHH O; 2NR5 A; 1NT2 B; 1J5E O; 2UXD O; 4DO2 A; 3IFX A; 1FAF A; 5KAI Z; 1CEZ A; 1E79 G; 3RWR D; 1MNG A; 5EBW C; 4EB6 B; 4WFB V; 4YY3 O; 2VQF O; 4X64 B; 4FLY A; 5L3E A; 3E83 A; 3ZMT A; 4TUY A; 4O4L B; 4I0X B; 2YI9 A; 4P2Z A; 5LHH A; 3LNM B; 4E2L A; 4DR1 O; 2B1G A; 2UXB B; 5EZY B; 3IJ4 A; 1MSD A; 3W7W A; 4HZ3 A; 1YTF B; 2XAJ A; 2UXC B; 2Z5U A; 2KG7 B; 2A0L A; 5B1O A; 4QNH B; 5DN6 G; 2F66 C; 5IJ9 B; 3P32 A; 1Q7Y W; 3CSX A; 2ZE7 A; 1FXK B; 2WLJ A; 5EYP B; 2LFS A; 5B1A C; 2YSU B; 3K5L A; 3ZED A; 3CEI A; 4NXN B; 3CCU V; 4R8C A; 1LUW A; 2DYR B; 2JS3 A; 5JQG A; 2Q0O C; 4DRX B; 2IU0 A; 4JI3 B; 1QVF U; 3K04 A; 1QLE B; 1H8H G; 1V55 B; 5JCO C; 2FYU H; 2H94 A; 1AR1 B; 1LUV A; 3D36 A; 2M6Y A; 3SYP A; 1ZSP A; 3JAR A; 2VRZ A; 4GKJ O; 2Q0A A; 1ARO P; 2YUA A; 4KXR A; 3CYO A; 2ZDI C; 3ZX6 A; 1H2L A; 1PNK A; 3TK1 A; 3CCV V; 4JI8 O; 3HPL C; 4LNU B; 3CC7 V; 3FAV B; 3E2E A; 4LC1 A; 3QNE A; 3D3Q A; 1GH6 A; 2EIJ C; 5LGU A; 4DUY O; 5IE9 A; 1O9H A; 1MSW D; 2VWJ A; 1WB8 A; 2NNU A; 3WG7 C; 2E74 B; 4JZG A; 3TXQ A; 4JI4 O; 3W7U A; 5D5P A; 2AZ0 A; 4NYK A; 5C8Y A; 2XHB A; 4MTO A; 4RAI A; 3LUT B; 1KU9 A; 5DEC A; 2Q73 A; 4QIW F; 3Q4H B; 3JAL A; 1E1R G; 5L3F A; 1IBM B; 2UUA B; 1YIT V; 3CCL V; 5LMN B; 2N05 A; 3RVZ A; 3CC2 V; 3CPW U; 1VQP V; 5KA5 A; 2Y0P A; 1AR5 A; 3ASO C; 3K57 A; 1GK9 A; 1HWY A; 2WLM A; 4W4L A; 2VQE O; 1XNR B; 3B40 A; 4EEQ A; 2HVK C; 5CA1 B; 3BFR A; 4U3F H; 1Q82 W; 1QQC A; 2KB1 A; 3F5T A; 2JVD A; 1FJG O; 4MVO A; 1D5A A; 1JCH A; 4TSF G; 2E5L O; 4B3M O; 1PNM A; 1ZWI C; 4N21 A; 1MZE A; 4PA3 A; 4O4J B; 1Q6U A; 5LMN O; 2YIB D; 1Y76 A; 3FB6 C; 4ASU G; 1B06 A; 4JF3 A; 1QCE A; 4X66 B; 3SPI A; 2Y0I A; 3LDC A; 3LSU A; 1TVK A; 1DF4 A; 3BAA A; 1SC5 B; 2ITC C; 4QPK A; 2W0X A; 4X1K B; 5KLV H; 2GSM B; 3E8G A; 4LH6 A; 1H2N A; 4XDJ A; 2WWW A; 1S0V A; 1L1F A; 3KKY A; 3ZMV A; 3CCJ V; 2HP8 A; 1XMO O; 3FB8 C; 1YDX A; 4X65 B; 2OCC C; 5LXT B; 1NS1 A; 1HNW B; 3CRA A; 2HJD A; 4DUZ B; 3FFQ A; 1NI8 A; 2CGN A; 3ZMZ A; 1OCO C; 3L70 H; 3ETE A; 4I9W A; 5IYZ B; 3JAW A; 1SQG A; 3AEI A; 2JDI G; 1DF5 A; 2QM4 A; 1RP3 B; 4LF9 B; 2EIN C; 1VQL V; 1QU7 A; 1X59 A; 4UB8 Z; 5KHG A; 1EFR G; 3K0G A; 2DWD C; 4FLT A; 1U96 A; 2JEX A; 2YID A; 1BCC H; 1HNZ B; 3D36 C; 1HNX B; 4MVQ A; 2R9R B; 4DR7 O; 1WA8 B; 3G4S V; 1VMG A; 2XAG A; 4CC6 A; 1Q90 D; 4MTX A; 3ZCC A; 4X64 O; 3RYI B; 1I94 B; 3EXA A; 3JAS B; 3AK3 A; 3E8B A; 4LFA B; 1HW7 A; 2OTL V; 1IXM A; 4MVU A; 4X88 A; 4MVS A; 1RSO B; 2XT9 A; 4HNA A; 3MAQ A; 4I50 B; 3OGC C; 3C3T A; 1R3K C; 3R66 A; 4PI2 A; 1TUE B; 2K1E A; 2ZE5 A; 3CD6 V; 2EIJ B; 1XNQ O; 4X20 A; 1N34 B; 3WG7 B; 5HFM A; 5LOV B; 3SR2 C; 4ICG A; 3CX5 F; 4EKW A; 4MSW C; 2HR3 A; 1IUR A; 4CH6 A; 2QWO B; 2BTQ A; 5LYJ B; 4LF5 B; 2DOS A; 3UT5 B; 3EFF K; 4KUM A; 2WLK A; 3RGB A; 3FB7 C; 4GX5 A; 5EZY A; 3VBB A; 3K59 A; 1VQ4 V; 1H2K A; 2KG7 A; 3TET A; 4LF6 B; 5LHI A; 3ASO B; 4K3A A; 4X62 B; 3SPH A; 2QWQ B; 1FXV A; 3T2M A; 5IJ9 A; 4TUY B; 2WPD G; 1YIJ V; 2JS5 A; 3T1Y O; 2GDS A; 3OW2 U; 2JJ1 G; 2Q8V A; 1YSC A; 3EHB B; 5BZB A; 1BZK A; 4JI3 O; 4UCU A; 2EBO A; 3BRC A; 1E1Q G; 1BS3 A; 1US6 A; 2NN4 A; 4AI8 A; 2Q9L A; 1QR9 A; 2YXY A; 1YI2 V; 1YTF D; 3B09 A; 5KHI A; 2PI5 A; 3U10 A; 4IYI A; 3E22 A; 4J9Z B; 3E89 A; 1M56 C; 4FM2 A; 1KEC A; 2FML A; 2Z0A A; 1PL4 A; 2LW1 A; 3HKD B; 3RFR A; 1AI5 A; 1SQQ H; 2LJ2 A; 4HAM A; 1ZX3 A; 1VF7 A; 5IY5 C; 2OCC B; 3SYQ A; 4MS2 A; 1K33 A; 2P06 A; 4JAA A; 3NR7 A; 1GN3 A; 3S3W A; 2DE0 X; 3JYC A; 2HG5 C; 1OCO B; 3RW0 A; 2F43 G; 3SYO A; 1M9N A; 5JQG B; 4D7S A; 2FTK A; 3CCE V; 2MW2 B; 2EIN B; 1N0J A; 1GM7 A; 3J81 N; 2UUA O; 2CDY A; 2RMK B; 1SA0 A; 4JGS A; 4J9Y B; 3VQX A; 4BAY A; 1KQS U; 2QKA A; 1H38 A; 1PNL A; 2LQT A; 4AQY B; 4G28 B; 3P30 A; 3AG3 C; 2RDC A; 3JAR B; 1VEW A; 1N32 O; 1AP6 A; 3N2K A; 5KHH A; 1YEW A; 5EBL C; 2WLN A; 1RFY A; 1YF2 A; 5DM6 V; 4YJ3 A; 1K4C C; 2JEU A; 3F7Y C; 1K5S A; 1EZV H; 1H8E G; 1Z5W A; 1XHX A; 2B5U A; 4RQE A; 1H2S B; 3ASN C; 2EUL A; 1G4Y B; 4DR3 B; 1GAX A; 4PA7 A; 5GON A; 3APO A; 5EBM C; 1AIL A; 5C8Y B; 1YJN V; 4JV5 O; 3L71 H; 1ZUQ A; 2YXL A; 2H8P C; 4X66 O; 2WSS G; 4JI7 B; 3TXS A; 1FPO A; 1HP8 A; 1BE3 H; 3JAL B; 1XMQ B; 3IGA C; 5H9C A; 4NTY A; 2YEV A; 1JFF A; 5LBQ A; 4B3R B; 5L3D A; 3D3I A; 1PPJ H; 3CWB H; 3UO2 A; 4X65 O; 4GYC B; 1Z5V A; 1WNS A; 2V1D A; 3A2F A; 2YIA A; 1VQN V; 3OTO B; 4TWK A; 4JI1 B; 1EN6 A; 1YZB A; 2QDO A; 3PJS K; 4B7K A; 2Q69 A; 4P9O A; 4Z1V A; 1SQF A; 1S5J A; 2OYQ A; 1YVW A; 4PDV A; 2PF4 E; 5GTH Z; 3RYC A; 4MVZ A; 1CXZ B; 4PDR A; 3SGI A; 2BOB C; 1NR1 A; 4BWA A; 1Y76 B; 2N74 A; 4I55 A; 2HEP A; 1ZL8 A; 1HNZ O; 4DV3 O; 1HNX O; 1MAB G; 5B1B C; 1THZ A; 1VIB A; 1Y66 A; 1TVK B; 1V9P A; 2EIK C; 3K5N A; 2Q67 A; 4PA6 A; 1RPO A; 5JVD A; 3WFV A; 4QJF B; 1M56 B; 1OCC C; 3BHP A; 4LF4 B; 2DJV A; 1K92 A; 3JD0 A; 3JAK A; 2ZIO A; 3N27 A; 3ZS8 C; 4X8A A; 2IU3 A; 1BSM A; 3L72 H; 4U7O A; 5IY5 B; 1N34 O; 5BXZ A; 3JAW B; 4UFZ A; 4FM0 A; 3RYI A; 3L9D A; 2CTW A; 4K35 A; 4LF5 O; 2IJH A; 3JD3 A; 3HKB A; 1GMG A; 4X1I A; 1M5I A; 1SS3 A; 3H1H H; 2YS8 A; 4DW1 A; 4PJ0 Z; 4DXW A; 1H2G A; 2XTA A; 2LP7 A; 3CXH F; 3AG3 B; 2PGG A; 3SPG A; 1JA8 A; 4DR4 O; 2F1M A; 1AVM A; 2ODM A; 5LA6 B; 3OR7 C; 3CXC U; 3K9S A; 1SRY A; 1TUB A; 2Y4T A; 4HNA B; 1PM9 A; 1X4T A; 1BHA A; 1OCR C; 4YXW G; 5J2T A; 4JYC A; 4IHJ A; 3ASN B; 4X20 B; 1F23 A; 2CK3 G; 2ZM6 B; 4FLU A; 2P7T C; 4G27 B; 4JAV A; 2BTQ B; 1Q6H A; 3K79 A; 3STL C; 5AG2 A; 4P9P A; 4B3S B; 2ARH A; 2X6C A; 1XIL A; 3WB1 A; 2AHY A; 3ZMU A; 1I7F A; 3VQV A; 4UV8 A; 5D5Q A; 4ZHQ A; 4DV0 B; 3ZRX A; 3QF7 A; 1JOY A; 1EN4 A; 4JZ2 A; 3KCY A; 1AJP A; 3G67 A; 1R3I C; 1S72 V; 1SQV H; 5H6R A; 2JJ2 G; 5IYD O; 4CH4 A; 4HBN A; 2QTS A; 4B7E A; 4I4T A; 3CHX A; 1Q6I A; 4PA4 A; 1NH2 D; 2DQ3 A; 1K3E A; 4DR6 B; 3HKD A; 4DV7 B; 4RUE A; 3W7T A; 3ZHR A; 2W6J G; 1F7Y A; 2VS0 A; 2N04 A; 4FFK A; 4AQY O; 4R50 A; 5EIB D; 3VQY A; 4LFB O; 4KFM A; 1TA8 A; 3ZRW A; 3E22 B; 5B1B B; 2UUB O; 3JSL A; 1S77 D; 2EIK B; 1IBL B; 1BT8 A; 4WFG A; 1KKC A; 4UCS A; 3VOU A; 2F4V B; 5KX5 B; 1OCC B; 2CTQ A; 4FK5 C; 4GLX A; 1VP7 A; 1K97 A; 2CTR A; 1AJQ A; 1L0N H; 3PN1 A; 4BW5 A; 1L0L H; 4DR3 O; 4OX9 O; 3A0B Z; 4XDK A; 3SJC C; 1Y67 A; 2ZT9 B; 4JI7 O; 5LGN A; 4LF8 B; 1R73 A; 5C93 A; 4UVA A; 2ZXW C; 2IM9 A; 1N33 B; 1XMQ O; 1K4D C; 3QTC A; 3E86 A; 2HVJ C; 2LGW A; 4HYO A; 1I5X A; 1SA0 B; 4B3R O; 2QSA A; 4MW8 A; 1SF9 A; 4D7T A; 1EBO A; 3OTO O; 1WP8 A; 4JI1 O; 2WA4 A; 3N2K B; 3ABL C; 3ZIA G; 3RYH A; 3E8F A; 1QHT A; 4YJ3 B; 5EC2 C; 3KCX A; 1EN5 A; 4ZIB A; 4JI2 B; 2QJ1 A; 4OGQ B; 1XI1 A; 5GON B; 3JAM N; 1OCR B; 1KP3 A; 2EIM C; 4PI0 A; 4JAU A; 4WCE V; 2JGU A; 3AK2 A; 3JCZ A; 2DQ0 A; 1W2B U; 4LWS A; 2FB5 A; 1W0J G; 2YEV B; 4CH5 A; 4JI5 B; 1JFF B; 5EIB C; 2CE4 A; 4A5U B; 4LF4 O; 3SYC A; 4NB5 A; 2AGA A; 2RCV A; 2XAQ A; 3DXR A; 4UUJ C; 3FB5 C; 4U3J A; 5KA6 A; 4U7N A; 4PEL A; 5CBF A; 4XDL A; 3U0Z A; 3C90 A; 2RQ6 A; 1VF5 B; 2QWR B; 2BTO A; 4MTF A; 1P4R A; 3RYC B; 2A3Q A; 1FS0 G; 1LR1 A; 3ABM C; 2CTP A; 3STZ C; 3R65 A; 3OD4 A; 4I55 B; 1ZL8 B; 2JGD A; 4GT1 A; 1CP9 A; 1R3L C; 2B9Z A; 2P4K A; 4FIP C; 5B1A B; 4IIJ A; 2QKC A; 2RJZ A; 1N4C A; 2HLD G; 2MK3 A; 3F5W C; 3CJH A; 2RNB A; 3M99 B; 4FJC C; 5JVD B; 4NXM B; 2Q68 A; 3HR0 A; 1WN7 A; 1RPR A; 1GM8 A; 2IW5 A; 1NTK H; 4W4K A; 2WLH A; 3JAK B; 3ZHT A; 2QA4 V; 1IX9 A; 4PV1 B; 4PDL A; 4ZI7 A; 1KKD A; 1B3Q A; 3K3W A; 1N8R W; 4UCR A; 3A0H Z; 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1M1K W; 3JD2 A; 2A79 B; 1FKA O; 3G6E V; 2EX3 A; 3ZRW B; 1GN2 A; 4KP4 A; 2LW7 A; 5B3S C; 3G80 A; 3LDD A; 4WFA V; 2JRI A; 2Y4U A; 3AK1 A; 1SES A; 2XAH A; 1IBM O; 4GX0 A; 5KUM A; 3W7S A; 3OUS A; 4FZ1 A; 4JI2 O; 4GX2 A; 5LGT A; 1VQ5 V; 5FNV A; 3G71 V; 2EJ7 A; 3LSQ A; 1XNR O; 2WLL A; 5GW7 A; 3H9V A; 1SZT A; 1K5Q A; 2EIL C; 3M8A A; 2FKX A; 1EM1 A; 3CC4 V; 2WLI A; 4B08 A; 3K58 A; 4R6Z A; 2EJR A; 3WU2 Z; 2DYS B; 3GWO A; 1AR4 A; 2E75 B; 2R9A A; 2AW9 A; 2PTM A; 1V54 B; 4J42 A; 1S5H C; 3OT7 A; 5B66 Z; 5A2Q N; 1R1B A; 3H01 A; 2HHH B; 1KC8 W; 3ICX A; 1MZF A; 2G38 A; 4JTD B; 4ABM A; 3RYH B; 3JD4 A; 1HDJ A; 3ABT A; 3OM3 B; 4BIU A; 1VF6 C; 2E3C A; 4X1Y A; 3CP1 A; 3K03 A; 2UU9 B; 2X0L A; 1SQX H; 2P6J A; 3DSQ A; 3X2Q C; 2KQX A; 2ZD9 A; 4UCO A; 3FKS G; 5LMU B; 1HNW O; 4DV1 B; 4JI8 B; 1KD1 W; 3H1I H; 4DUZ O; 1FFT B; 4J10 A; 3IC7 A; 1VQO V; 3ABK C; 3JSN A; 4DUY B; 1D5N A; 1TGO A; 1WLE A; 3CS5 A; 4LBE C; 4ZOL A; 4NXM O; 4LWS B; 4JI4 B; 4LF9 O; 2K9P A; 1BQ0 A; 1BGY H; 1NTM H; 5E1A C; 1UFI A; 4DYL A; 2IJI A; 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