The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
71
|
structure length |
71
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Chain Sequence |
GMVKETTYYDVLGVKPNATQEELKKAYRKLALKYHPDKNPNEGEKFKQISQAYEVLSDAKKRELYDKGGEQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
NMR structure of the protein BC008182, DNAJ homolog from Homo sapiens
rcsb |
| molecule keywords |
DnaJ homolog subfamily A member 1
|
| total genus |
22
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| structure length |
71
|
| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CTP A; 1BQ0 A; 1N4C A; 1GH6 A; 2GUZ A; 2DMX A; 2L6L A; 2CTR A; 1FAF A; 1WJZ A; 2QWR B; 2OCH A; 2LGW A; 1FPO A; 1NZ6 A; 1HDJ A; 2CTW A; 3BVO A; 2EJ7 A; 4RWU A; 2N04 A; 2QWN B; 4IT5 A; 3AG7 A; 1XBL A; 2YS8 A; 2N05 A; 2CTQ A; 2DN9 A; 2QWQ B; 2Y4U A; 3APO A; 2Y4T A; 3UO2 A; 1IUR A; 2QSA A; 3UO3 A; 2YUA A; 3APQ A; 1BQZ A; 4J80 A; 3UCS C; 4J7Z A; 2KQX A; 2M6Y A; 2LO1 A; 2PF4 E; 2QWP B; 2CUG A; 2QWO B; 2GUZ B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4P2Z A; 1EBO A; 4AI8 A; 2IM9 A; 3JAT A; 3ASN C; 1WB7 A; 2FML A; 3CRM A; 4LF6 B; 1IUR A; 2LJ2 A; 4IYI A; 3SYC A; 4LF8 B; 1M1K W; 3FAV A; 1JPX A; 4HNA B; 2AXT Z; 5CMU A; 5CA1 A; 4FLX A; 1L1F A; 4PI2 A; 5FNV A; 3FB5 C; 3ETQ A; 3B77 A; 3KCY A; 1VF7 A; 2HG5 C; 4DXW A; 2N04 A; 1MSD A; 1VQ4 V; 1R3I C; 2RJZ A; 5L3B A; 1JFF A; 4D6T H; 3ZN0 A; 3RYI B; 5JJE B; 1U96 A; 5HFM A; 4DR7 O; 4DV4 O; 4DV3 B; 3EHB B; 4MTG A; 4DR5 O; 1AR5 A; 2BOB C; 3N2G B; 4RO2 A; 4RQE A; 1XEQ A; 2IJK A; 3UT5 A; 1PPJ H; 3FD9 A; 4J11 A; 4DUZ B; 2DWD C; 1M56 B; 4E4E A; 4FMT A; 4JI4 O; 2Q5Z A; 2MK3 A; 3B2E E; 4QIW F; 3KCX A; 1ZLZ A; 3G4S V; 4UCV A; 1FKA O; 3HKC A; 1KP2 A; 1I5X A; 1RPR A; 2ZXW B; 3OAA G; 4H13 B; 1YJ9 V; 2X6C A; 1WPB A; 4B7K A; 1VQO V; 4X9Q A; 1F4M A; 2KB1 A; 4GKK O; 3EFF K; 3UO3 A; 3CCS V; 3MD0 A; 1GN3 A; 4MVS A; 1P7B A; 2CUG A; 2EIK C; 1SER A; 4HNA A; 1H2L A; 2DQ0 A; 1M9N A; 4IGG A; 2UU9 O; 4KHP B; 2CTW A; 1DLB A; 3VOU A; 5C93 A; 2WA4 A; 5KUK A; 4ZHQ B; 4LF4 B; 3ZCC A; 2IU0 A; 1UJW B; 3RYI A; 3CMA V; 3CE2 A; 4GYC B; 2LW1 A; 1GH6 A; 2RNB A; 2GHY A; 4DR4 O; 4I55 A; 1B3Q A; 4O4H B; 4QJF B; 4UVC A; 3H9V A; 5JJN B; 2CE4 A; 3OMI B; 2GSM B; 3N2G A; 4PD4 F; 3ZN1 A; 1EZV H; 2XAG A; 1M56 C; 4JYA B; 1D5A A; 1B6Q A; 3OGC C; 2Y69 B; 1DGS A; 1WPX A; 3ASO B; 1EN6 A; 1SQP H; 4MVR A; 1UFI A; 5LOV B; 3SR2 C; 2QGN A; 5LXT B; 1QCE A; 2KKW A; 2QWN B; 5B1B C; 3AG7 A; 5B5E Z; 2DYS B; 2JJ1 G; 2PI4 A; 1BHA A; 2XUM A; 1CEZ A; 3DC5 A; 4YJ3 B; 4O4I B; 3WB2 A; 2KSD A; 3DC6 A; 1VAR A; 4L87 A; 1GM7 A; 2Q68 A; 2PZS A; 5LYJ B; 5TIS Z; 3D8C A; 5GW7 A; 1NJI W; 1S5H C; 3AG2 C; 4DV2 O; 3ZIA G; 1GM9 A; 4ZHQ A; 3CRQ A; 3H1L H; 3E8F A; 3JAR B; 3QO8 A; 2HHH O; 2Q67 A; 2UXC O; 3ABT A; 2YEV B; 3DXR B; 2DW4 A; 3DSQ A; 2XND G; 1MOF A; 3FB7 C; 5KX5 B; 4I0X A; 3KZI Z; 5L3F A; 3JD2 A; 2LQT A; 2W6I G; 4O4H A; 1URF A; 2JJ2 G; 1I7F A; 2YI9 A; 5K1P A; 3EVK A; 4JI1 O; 3U0Z A; 1QHT A; 1FS0 G; 2EZP A; 1XUQ A; 4P30 A; 3CPW U; 2DYR B; 5KA5 A; 3CXC U; 1MNG A; 1V9P A; 4FFK A; 3RYH B; 1Y4M A; 5DED A; 2EIL C; 5CBF A; 2EIJ B; 4G28 B; 3MHS C; 2HKO A; 1JOY A; 2B5U A; 3T2M A; 1BHB A; 4LFB O; 5KHK A; 1VQ8 V; 3BHP A; 3H1K H; 1IBM B; 1PL0 A; 4RWU A; 1M90 W; 1N32 O; 3BCC H; 3ML0 A; 3JD4 A; 3WB0 A; 3I56 V; 2DE0 X; 1E1R G; 4PI0 A; 4MS2 A; 5IYZ B; 4UXN A; 1K92 A; 1GN2 A; 2WLL B; 4UCO A; 2YI8 A; 2E3C A; 2CAZ C; 4MVZ A; 1JQ0 A; 3O65 A; 1WAZ A; 4LR3 A; 5EC1 C; 1N8R W; 4J9Y B; 4Q6G A; 2R9I A; 5LYJ A; 3SDL A; 1XRE A; 4PV1 B; 2BSK A; 3J81 N; 2YIB D; 4JYB A; 2ADP A; 4H44 B; 1XHZ A; 4NVP A; 4NR1 A; 4DRX A; 3UO2 A; 3JAR A; 5B1A B; 3RBZ A; 2E75 B; 3K79 A; 2PY5 A; 4DR2 O; 4X89 A; 3ZHT A; 4TWK A; 4U3J B; 1NH2 D; 5D5P A; 3JAL B; 3L70 H; 4CZZ A; 1K8A W; 1KD1 W; 2AZ2 A; 3ZHS A; 2ZIO A; 4TSF G; 2ZR2 A; 4FLT A; 2IJH A; 4MVQ A; 4DR5 B; 4CS3 A; 2EIJ C; 2X7R B; 4DV5 O; 1AB3 A; 3RYH A; 2HP8 A; 1QLE C; 1JJ2 U; 4U7N A; 4YHH O; 1HR0 B; 5H5N A; 2ZT9 B; 4JI4 B; 4JAA A; 3ZED A; 5CA0 B; 4ZOL B; 2F23 A; 1NR1 A; 1BQZ A; 1H2M A; 1BMF G; 1A32 A; 1S5J A; 5LBQ A; 3QF7 A; 3OEH G; 2GTS A; 1EFR G; 3SJC C; 2CK3 G; 2L6L A; 1B04 A; 4B3R O; 4GKK B; 5BR8 O; 4BIZ A; 4YIP A; 2DQ3 A; 4H37 A; 4YY3 B; 5EC2 C; 5B1A C; 4RQF A; 4JGS A; 1YTF D; 1SQX H; 4UUJ C; 1AI6 A; 3HKD A; 3G6B A; 3LSS A; 1BL8 A; 3SJB C; 1W0J G; 2Q7G A; 4I4T A; 1SZT A; 2IJJ A; 4U3J A; 4B3M O; 3JAL A; 2UUA O; 2Z5U A; 1YI2 V; 2P4K A; 2ZIN A; 1FPO A; 1IZ3 A; 2ODM A; 1O9G A; 3UQ8 A; 3JAS B; 2ZIM A; 3X2Q B; 5LP6 C; 4DR4 B; 5E1A C; 5LP6 A; 4GX2 A; 1H38 A; 4XDK A; 4Z1M G; 1Z5V A; 4PDV A; 3RGB A; 3T1Y O; 2CTP A; 3AG3 B; 2O57 A; 3E35 A; 4K0K O; 1VQK V; 3JD3 A; 2ITC C; 2EJR A; 3QVN A; 1TUE B; 1YJN V; 1BS3 A; 5H9C A; 3CEI A; 3W7W A; 3ICX A; 1UPG A; 3NR7 A; 5CA0 A; 2GBO A; 2QTO A; 2JDI G; 4I7Z B; 3RVY A; 3OFN G; 3K5N A; 1YSC A; 2PGG A; 2RQ6 A; 4B7E A; 1EN4 A; 4PA9 A; 2IW5 A; 2Q7E A; 2HJD A; 1FAF A; 4OGQ B; 2QWR B; 3CJH B; 1SQF A; 5EK0 A; 1R3L C; 3C90 A; 1KKD A; 3H1J H; 1VEW A; 4JV5 O; 2CGO A; 1IX9 A; 4DV2 B; 3LUT B; 5DM6 V; 3QTC A; 5B1O A; 5KUM A; 2V7Q G; 3JAK B; 4JAU A; 1XBL A; 4R50 A; 1GRJ A; 2HHH B; 2UXC B; 1WP8 A; 5J9P C; 3X2Q C; 3B4S A; 3GVM A; 5A9G A; 2IJI A; 2ZR3 A; 1XI1 A; 3JAS A; 1W2B U; 3MHH C; 2FYU H; 1V55 C; 3AG3 C; 4FLW A; 4JI1 B; 2GUZ B; 1YIJ V; 3B8M A; 2E74 B; 2JGD B; 1GTO A; 2P90 A; 1BCC H; 5J2T A; 4QPJ A; 4J10 A; 2JIZ G; 2ZD9 A; 3ASN B; 4EFE A; 1Z2G A; 3SGI A; 3OEE G; 1Z5W A; 4XBF A; 3D3Q A; 5IJ9 B; 4XDJ A; 3AK3 A; 3FAV B; 1NU1 H; 3IFX A; 4KL1 A; 3OR7 C; 4QE7 A; 1N32 B; 3K03 A; 4UCT A; 2M7W A; 4JF3 A; 3CJH A; 3CRR A; 3CME V; 3A0R A; 3RWR D; 3CRA A; 3CYO A; 2V1D A; 1JFF B; 3L74 H; 3LNN A; 4Q20 A; 3G6E V; 2W0F C; 2QKC A; 4NXM O; 4DUY O; 3K5L A; 1M57 B; 3FX7 A; 3JAK A; 2YID A; 5EZY A; 2JEX A; 3RYF B; 1HNZ B; 1K9M W; 2ZM6 O; 2R72 A; 1E1Q G; 4F6E A; 4DR2 B; 1DF5 A; 4JAS A; 4JI6 O; 3L73 H; 1GMG A; 2JGU A; 1OV9 A; 3DGE A; 4G2K A; 4FJC C; 1OCZ B; 2JK5 C; 1P49 A; 2HEP A; 3N2K B; 1J95 A; 2B1I A; 2UUC B; 2F95 B; 2GUZ A; 4P9O A; 2JGD A; 2OTL V; 1YHQ V; 3HKC B; 1L0N H; 5KAF Z; 3ZMV A; 5H6R A; 4DV5 B; 3GWO A; 3RFR A; 4BWA A; 2DN9 A; 1VQP V; 1AP6 A; 4B3T O; 4F4L A; 2UXN A; 2CDY A; 5IJ9 A; 3BA8 A; 3F5T A; 3CC4 V; 1PD3 A; 1K4D C; 5JVD A; 2OIG A; 2H3O A; 1H8H G; 4YXW G; 5DN6 G; 2EIK B; 1DK1 A; 3CSX A; 2YIC A; 4BR6 A; 1FD9 A; 4MVU A; 2JVD A; 1G1X B; 1RP3 B; 3K57 A; 4LF5 O; 1Q7Y W; 1M57 C; 1R6N A; 2YC0 A; 3L9D A; 1M93 A; 5BR8 B; 2F4V O; 2UXD O; 3RN4 A; 2QA4 V; 3TCU A; 2Y0P A; 4FPP A; 2Q73 A; 1RM1 B; 3AG4 B; 4I55 B; 4TV8 B; 1OCO C; 3RYF A; 4PA7 A; 4GX5 A; 5KHJ A; 3S3X A; 1Y74 B; 1X59 A; 3IGA C; 1TUB B; 1OCZ C; 4WCE V; 1R1B A; 1PP9 H; 4B3M B; 2UUA B; 1IVS A; 3W7T A; 2ARH A; 2RDC A; 2Z0A A; 4CC6 A; 3ZBH A; 3J80 N; 2YXL A; 3N2K A; 4NTW A; 4LFC O; 5IYB O; 5LGU A; 4JI2 O; 2WLI B; 1N36 O; 4AQY O; 4QGP A; 3T1Y B; 4CS2 A; 2A79 B; 1PNK A; 4FZ1 A; 3QG5 A; 3CCM V; 1R3K C; 5B1B B; 4K0K B; 1W0K G; 5JQG B; 1PNL A; 2D3O W; 4J42 A; 2LW7 A; 5B66 Z; 2YDE A; 1HW7 A; 3JAM N; 4WFA V; 3ZHV A; 5LMU O; 3FB8 C; 2P06 A; 1SC5 B; 3AG2 B; 2H8P C; 3OW2 U; 4R7C A; 4DYL A; 3OUS A; 1AVM A; 1AJN A; 4MT8 A; 5EIB D; 2RCV A; 1XOU A; 3A0B Z; 3E8G A; 4CH6 A; 4DV0 O; 1RM1 C; 3AG4 C; 4I0X B; 3B09 A; 1ROP A; 4JTA B; 4JV5 B; 1Q8I A; 5LL6 Y; 3E2E A; 2OIE A; 4TV8 A; 4KP4 A; 3TJT A; 2PTM A; 4X64 O; 1SS3 A; 2R70 A; 1Y74 A; 4DO2 A; 4FVM A; 4LF9 O; 1TUB A; 1Q81 W; 4MW3 A; 5CBG A; 2VQF O; 5LHI A; 1CXZ B; 1WNS A; 3SPH A; 3JSN A; 2FTK A; 1SRY A; 3ETG A; 2EIL B; 2R9R B; 2F43 G; 1N33 O; 1SQB H; 1OCC B; 3T1H O; 3HR0 A; 1Q43 A; 1PL4 A; 4CH5 A; 4OX9 O; 3DTU B; 1G8M A; 1YZB A; 1SZX A; 2WLI A; 4HAM A; 1BGY H; 1XIL A; 2FL4 A; 3RYC B; 1GK9 A; 1FYJ A; 1ZSP A; 5E79 Z; 4DV1 O; 4UV8 A; 1K5S A; 2P4V A; 3P3N A; 4TQF A; 1O9H A; 5JQG A; 2OCC B; 2PF4 E; 3EXA A; 1N4C A; 1YXB A; 4GKJ O; 2BSK B; 4K8X A; 1QU7 A; 1H2G A; 2Q6A A; 3K5O A; 2QKS A; 1Q6I A; 4DRX B; 2VQE B; 4ZKI A; 2P67 A; 1K5Q A; 2EZO A; 1XMO O; 2WLM A; 4U3F H; 1IBK O; 4X65 O; 4DR6 O; 1ZUQ A; 3OT7 A; 4JI8 O; 1S0V A; 4JI7 O; 2OCH A; 4DUY B; 1IBL O; 3ZMS A; 1XL6 A; 2CGN A; 1NQT A; 3OTO O; 1SQG A; 4XDL A; 4D7S A; 1HNX O; 3JSL A; 4FIP C; 1RFY A; 2BTO A; 1OCC C; 3M8A A; 1QLE B; 1AIL A; 4LBE C; 1XMQ O; 1KU9 A; 4I9Q A; 5ITZ B; 2BCC H; 3U11 A; 1K33 A; 3HPL C; 3CCQ V; 4I5S A; 2K9P A; 3KG2 A; 4JZG A; 1RSO B; 3RYC A; 1HP8 A; 1NH2 B; 3FB6 C; 4LFA O; 1QR8 A; 4FLZ A; 2XAQ A; 2OCC C; 2LP7 A; 3O9O A; 3OMN B; 4J7Z A; 4CC5 A; 3CCL V; 1JMK C; 1VIB A; 3ZHR A; 3K0D A; 3OR6 C; 2UUB O; 4B3T B; 5F2V O; 1TVK A; 4PJ0 Z; 1PNM A; 2EJ7 A; 4IT5 A; 1V54 B; 4WF9 V; 2N74 A; 2N05 A; 2ZQM A; 5IYD O; 1GM8 A; 5B3S B; 4DV7 O; 3H1I H; 3HKD B; 4OPH A; 1F51 A; 2HFE C; 4LWS B; 5IYC O; 4GX0 A; 1MG1 A; 2EIN C; 4I4T B; 4UCU A; 4X62 O; 4EFB A; 1Y6X A; 4LF5 B; 4O2B B; 3JAW B; 5AG2 A; 2ZE6 A; 2UXD B; 2F4V B; 3ETD A; 4DR7 B; 4DV4 B; 5LP6 B; 4IYH A; 2AGA A; 2B9Z A; 4ABM A; 2M6Y A; 1OJH A; 4PA4 A; 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1VF6 A; 4KUM A; 1NI8 A; 1XNR O; 3ZS8 C; 3FYE B; 5KMG A; 4LH6 A; 4KHP O; 4F6R B; 2QSA A; 4ZIB A; 1JX9 A; 5IE9 A; 2Q4P A; 4LF4 O; 2PYJ A; 5IJ0 A; 2ZDI C; 3FKS G; 3E22 A; 5EZY B; 1OZ0 A; 2ADQ B; 2ZDI A; 1HNW O; 3F5W C; 4C7U A; 2EBO A; 4LF7 O; 2AZ0 A; 1VQ6 V; 4NYK A; 2WA3 A; 4AIL C; 1FJG O; 1Q90 D; 2CH7 B; 1IBK B; 4HYO A; 4DR6 B; 5EYP A; 5KHG A; 2D2C B; 3CCU V; 4JI8 B; 3SYP A; 4JI7 B; 4FLV A; 2A7W A; 4WFF A; 1FXH A; 1IBL B; 3J7A U; 1I08 A; 1ZX3 A; 3LSU A; 4BW5 A; 4WFB V; 5BMV A; 3SYO A; 1K97 A; 4JYA O; 5JWP A; 3OTO B; 2ITD C; 3BVO A; 1HNX B; 1ORQ C; 4J7K A; 4CH4 A; 3SPG A; 2P7T C; 4HBN A; 1I94 O; 1P7G A; 4R6Z A; 2X6B A; 1FXK C; 1XMQ B; 1S76 D; 4LFB B; 1Q5O A; 2IBZ H; 1S72 V; 1B06 A; 3A0H Z; 5JVD B; 1FXK A; 3OGI B; 1FFX A; 2JS3 A; 4MTX A; 4ZI7 B; 4U7O A; 3PJS K; 4JYY A; 5KLV H; 2CTR A; 4FK5 C; 4LFA B; 3CB2 A; 1WJZ A; 4FM0 A; 4FFB A; 2X6A A; 3IJ4 A; 3PN1 A; 2ILM A; 1MZE A; 3F7V C; 2UUB B; 4LNU B; 3LDC A; 4JI0 O; 3SPI A; 4F6R A; 1ENV A; 4JYC A; 1SA0 B; 3UM7 A; 2HJF C; 4BIU A; 3T4Z A; 1M5I A; 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