The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
71
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structure length |
71
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Chain Sequence |
GMVKETTYYDVLGVKPNATQEELKKAYRKLALKYHPDKNPNEGEKFKQISQAYEVLSDAKKRELYDKGGEQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR structure of the protein BC008182, DNAJ homolog from Homo sapiens
rcsb |
| molecule keywords |
DnaJ homolog subfamily A member 1
|
| molecule tags |
Chaperone
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
22
|
| structure length |
71
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| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-01-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2Y4U A; 1WJZ A; 2CTP A; 1FPO A; 2DMX A; 2QSA A; 3APQ A; 3UO2 A; 2LO1 A; 2N05 A; 2CTR A; 1NZ6 A; 1BQZ A; 1N4C A; 2Y4T A; 3UO3 A; 3UCS C; 2OCH A; 2EJ7 A; 3BVO A; 2QWR B; 2N04 A; 4RWU A; 2QWQ B; 1IUR A; 2GUZ A; 2GUZ B; 1GH6 A; 2CTQ A; 2KQX A; 4J7Z A; 1HDJ A; 2M6Y A; 3AG7 A; 3APO A; 1BQ0 A; 2PF4 E; 2QWN B; 2YUA A; 2YS8 A; 1XBL A; 2CUG A; 4IT5 A; 2QWO B; 2CTW A; 2L6L A; 1FAF A; 4J80 A; 2LGW A; 2DN9 A; 2QWP B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1AR1 B; 1OCR C; 3LNM B; 1HNW O; 3DXR A; 1K73 W; 4DK1 A; 2F4V O; 3CRM A; 1TAE A; 4J9Y B; 1VQ8 V; 2P67 A; 1BMF G; 2WLH A; 3RT3 C; 1AI4 A; 1AJN A; 4FVM A; 4CS3 A; 1MZE A; 2EZO A; 4J7K A; 4EEQ A; 2JK5 C; 5LGT A; 2DMX A; 1Q8I A; 2AHY A; 2EJR A; 5JQG A; 1AJQ A; 1AJP A; 4IHJ B; 1E79 G; 1PNM A; 4JYA B; 4GT1 A; 4NYK A; 2DQ3 A; 1GMG A; 2PI4 A; 1XIL A; 2NR5 A; 3G4S V; 2UU9 O; 4DR1 B; 2D3O W; 5LOV B; 4B3M O; 1YI2 V; 1SA0 A; 1SER A; 3OM3 B; 1ZSP A; 2ITC C; 2F4V B; 4LFB O; 5BZB A; 3L74 H; 2QM7 A; 1PP9 H; 3N27 A; 1JPX A; 3JYC A; 1FFX B; 2K9P A; 1AR4 A; 3UO3 A; 1GM7 A; 1UFI A; 3CCU V; 4JTA B; 4D7T A; 4NTX A; 1WA8 B; 3JAL B; 1V55 B; 1TVK B; 3IJ4 A; 3S3X A; 2GBO A; 2AW9 A; 3BY6 A; 3FAV B; 1QCE A; 2OT5 A; 2W6I G; 4X62 O; 3E86 A; 2X6A A; 3AG3 B; 4I7Z B; 3CC4 V; 5JH7 A; 5LMN B; 2DYR C; 2KSD A; 1HNX O; 2IJH A; 3ETE A; 3TXQ A; 2PI5 A; 2VWK A; 1BGY H; 1SS3 A; 1B3Q A; 1Q43 A; 5KHI A; 1I5X A; 2EIM B; 2ITD C; 4UFZ A; 4I0X B; 1F4M A; 4QE9 A; 4TWK A; 5IY5 C; 3QO5 A; 1UJW B; 2WLL B; 1WP7 A; 4E2L A; 4JI0 O; 1K33 A; 1KP3 A; 1OCO B; 2Y0P A; 2A79 B; 4B3T O; 4YIO A; 1SF9 A; 4JI4 O; 5B5E Z; 1FD9 A; 4W4L A; 3ABM C; 5CBH A; 5JVD A; 5JVD B; 2PUS A; 5LMU O; 2EIJ B; 1AI5 A; 4G28 B; 3HKE A; 1N32 B; 3HKE B; 1Y66 A; 1VQO V; 1JJ2 U; 5KLV H; 2N04 A; 5EYP A; 4BAY A; 2ZXW B; 2Q0O C; 2YIB D; 5LGU A; 4FLY A; 1SQQ H; 2F66 C; 4JV5 O; 2BTQ A; 2BTQ B; 2MK3 A; 3R66 A; 5GON A; 5GON B; 3G80 A; 1YJN V; 4CZZ A; 5IWA B; 1YDX A; 4TV8 A; 3ZMZ A; 5LBQ A; 4H0L B; 4KXR A; 3CP1 A; 4BIU A; 1OJH A; 4TQF A; 4ICG A; 5KUM A; 1BSM A; 1QHT A; 4X1Y A; 2JVD A; 4X1Y B; 5EIB C; 3U10 A; 3WG7 C; 4PA7 A; 1VEW A; 3AG2 B; 4YY3 O; 3BAA A; 1KYO F; 1VQM V; 1SES A; 3ZS8 C; 1WAZ A; 3RBZ A; 2LW7 A; 3SDL A; 1ARO P; 3G67 A; 4FLV A; 1YEW A; 4DRX A; 4OGQ B; 2LQT A; 4PA3 A; 3T1Y O; 4UV8 A; 4WFA V; 4X65 B; 5B3S B; 4BIO A; 4X1I A; 3DTU B; 4X1I B; 1U97 A; 3AG7 A; 3CWB H; 3OD4 A; 4DR6 B; 3AG4 B; 1K4C C; 4IT5 A; 3LDD A; 5LGN A; 5FPR A; 1KKC A; 1QR8 A; 1HNZ B; 1VQ7 V; 3JAK A; 4X64 B; 3S3W A; 3JAK B; 1M56 C; 5CN0 A; 5IE9 A; 4WBN A; 2HP8 A; 4WBN B; 1RM1 C; 3L73 H; 5KMG B; 3OGI B; 5K1P A; 3SPC A; 1AI6 A; 1JFF B; 3X2Q B; 2EZP A; 4PHZ A; 4YXW G; 1MNG A; 5GW7 A; 1B06 A; 2OTL V; 4PEL A; 2UXD O; 3CC2 V; 4AQY O; 1I08 A; 3JAR A; 3T1Y B; 1FXK B; 4LFA O; 3AEI A; 4MT8 A; 4ZHQ A; 4ZHQ B; 2X0L A; 3K5L A; 5LL6 Y; 2EIL C; 2CGN A; 5EC1 C; 1Q90 D; 4UVC A; 3STL C; 4JTC B; 1JX9 A; 3WB0 A; 4NVP A; 1K7D A; 1R3L C; 4KHP O; 3CCM V; 3CCS V; 3JSL A; 2QDO A; 2PY5 A; 4MVR A; 1CPY A; 2N74 A; 2Q68 A; 3FB7 C; 2UUA O; 1Y4M A; 3D3Q A; 2BE3 A; 2Q69 A; 3BEH A; 1IUR A; 3OTO O; 1IXM A; 4Q20 A; 1XOU A; 2UXB O; 2QM4 A; 4PA4 A; 2AXT Z; 2Q0A A; 2A7W A; 4AQY B; 5LHI A; 2Q7G A; 3B8N A; 4NXN O; 1YTF D; 2EIN B; 1MSD A; 3D36 C; 1Z2G A; 4I55 A; 3E8F A; 3E2E A; 5EC2 C; 1GTO A; 3ICX A; 3L71 H; 2RDC A; 1QBZ A; 2B9Z A; 2EIK B; 2JRI A; 3T1C A; 1KP2 A; 3QO8 A; 1XBL A; 4O2A A; 2EIM C; 4O2A B; 3VQX A; 3OFN G; 1YJW V; 1P4R A; 5B66 Z; 4KHP B; 5KUK A; 3ETG A; 1K5S A; 1XMO O; 4LF8 O; 2YDE A; 4O4I B; 2ETN A; 1OCC C; 3WFV A; 4IGG A; 1RSO B; 1N0J A; 2P06 A; 4BIZ A; 4X89 A; 4O4J A; 2UUB O; 4O4J B; 3JAS A; 1PV0 A; 3JAS B; 1EN4 A; 1LR1 A; 2UXB B; 4AHC A; 2KQX A; 1IZ3 A; 3JD3 A; 3ABK B; 3JAW B; 4NXN B; 2JGD A; 1TUE B; 1OCR B; 5D5Q A; 2Q67 A; 5H2F Z; 2XAG A; 1A32 A; 2EIJ C; 5A2Q N; 3T1H O; 1J95 A; 5KHH A; 2ZE5 A; 2BOC C; 1J5E O; 2AGA A; 3OEE G; 1H2G A; 2ZXW C; 5ITZ A; 3B77 A; 4ABM A; 4FM1 A; 1Y76 B; 2YXH A; 4DV6 B; 2HEP A; 1H2M A; 2XOK G; 1S0V A; 2ZD9 A; 2DYS B; 2OIE A; 5CBF A; 4JI2 B; 4EB6 A; 4EB6 B; 2AZ0 A; 4MTO A; 2HLD G; 4OXS A; 1K8A W; 2YI8 A; 4MTF A; 4LF7 O; 1NH2 B; 5EBW C; 1SZX A; 1F51 A; 1B6Q A; 1XNQ B; 1S77 D; 4XDJ A; 4K8X A; 3OGC C; 4GCZ A; 4DV7 B; 3PJS K; 3AG2 C; 2R9A A; 5J2U A; 3T1H B; 4GKJ B; 5J2U B; 3SYP A; 4JAA A; 2EBO A; 1NVP D; 1N4C A; 1D5A A; 4R50 A; 1YJ9 V; 2HHH O; 1JR9 A; 4DV3 O; 4GKK O; 2HJF C; 3NXS A; 5LXT B; 3F5W C; 4MVZ A; 3B09 A; 5B3S C; 2ZDI C; 1F7Y A; 1RPR A; 2ADP A; 2V7Q G; 4LF5 B; 3AG4 C; 2RMK B; 4LFC O; 2P4K A; 3H1J H; 1K9M W; 1GM9 A; 2YI9 A; 5L3G A; 1GN6 A; 3CD6 V; 4LF7 B; 2DYR B; 4CS2 A; 3CCE V; 3JSN A; 3BVO A; 2QA4 V; 1S72 V; 4RO2 A; 2DJV A; 5BXZ A; 1XNR O; 1BL8 A; 3HKD A; 3KCX A; 1K4D C; 4B08 A; 3K5N A; 4Z1V A; 2HHH B; 3RN4 A; 2F1M A; 5D5P A; 5IY5 B; 3CCQ V; 3ZMV A; 2WPD G; 4TV9 A; 1FXK C; 3FB6 C; 1NS1 A; 4OX9 O; 3K04 A; 4LF9 O; 4DV0 B; 3F5T A; 1L1F A; 4RWU A; 3ML0 A; 2YID A; 1K92 A; 4DR2 O; 3DGE A; 1PPJ H; 3HR0 A; 1G1X B; 2QKC A; 1HP8 A; 5H6R A; 3H01 A; 4FMT A; 3CYO A; 1X59 A; 3CPW U; 4LWS B; 2VQF O; 2W0F C; 4RUF A; 1RFY A; 4X8A A; 1L0N H; 1N36 B; 3ZMS A; 3T4D A; 4XDK A; 1TGO A; 5IJ9 A; 3ZRS A; 3RW0 A; 5IJ9 B; 4CH6 A; 2Q9L A; 3WB1 A; 2FL4 A; 5H9C A; 4LF4 B; 1G4Y B; 1H2S B; 4UCV A; 4KUM A; 2PTM A; 3CE2 A; 1KBH A; 3ASN C; 2ZR2 A; 3ZHR A; 2EIN C; 4F4L A; 4LF9 B; 1S5J A; 4DUZ O; 2EJ7 A; 1XMQ B; 3CRR A; 2YXY A; 1R6T A; 2B1G A; 1P84 F; 2H3O A; 4F6R A; 4F6R B; 3WG7 B; 4TOI A; 2ZIN A; 3VQY A; 5EBM C; 4IYI A; 4HAM A; 1ZL8 A; 1KEC A; 4UCT A; 1ZL8 B; 4TUY A; 1P49 A; 4C7U A; 5LA6 B; 4JYY A; 3K0G A; 2A3Q A; 3LDC A; 4N23 A; 4O2B B; 3O65 A; 1Z5W A; 3E8H A; 4GX5 A; 4LH6 A; 5L3E A; 1N8R W; 2GTA A; 3P3N A; 1JVM A; 2UXC O; 1SQF A; 5CA1 A; 1XL4 A; 4JYA O; 5CA1 B; 2HKO A; 3ZED A; 2JS3 A; 1I94 B; 4W4K A; 3E22 B; 2XHB A; 4DR1 O; 2R9I A; 1EN5 A; 2IU3 A; 5KX5 B; 1M90 W; 3W7S A; 4DUZ B; 1JOY A; 4RUE A; 5HFL A; 1M56 B; 1BQZ A; 3SPH A; 4U7O A; 1RM1 B; 1N34 B; 3SYC A; 1OV9 A; 2CH7 A; 2CH7 B; 3ZMU A; 4J11 A; 4IYH A; 4TSF G; 3FFQ A; 2QEX V; 2DYS C; 1WB8 A; 2CTR A; 1JJO A; 2YSU B; 4WFE A; 4IHJ A; 2UXC B; 5IYB O; 1Q5O A; 2Q6A A; 2EIL B; 5LMN O; 1GH6 A; 3D3I A; 4NKG B; 1HDJ A; 5LOV A; 3O9O A; 3K3W A; 3UQ8 A; 1BS3 A; 1SET A; 4DV1 B; 1PNK A; 2P90 A; 3BPZ A; 1FFX A; 4LP8 A; 1PM9 A; 2OCH A; 4PDR A; 3TXS A; 3TJT A; 1NU1 H; 1WA8 A; 2E75 B; 4R6Z A; 4MVQ A; 2PGG A; 3JAL A; 1DF5 A; 3K03 A; 4XBF A; 3ZRX A; 1TVK A; 2LW1 A; 4ZI7 A; 4ZI7 B; 1EZV H; 5J2T A; 5J2T B; 1LUW A; 1FFT B; 2JGU A; 5B1B C; 3FAV A; 4FJC C; 1WJZ A; 3J81 N; 3Q4H A; 3Q4H B; 3D36 A; 3CC7 V; 3OUS A; 1FYJ A; 5A9G A; 5E79 Z; 2ZQM A; 2FB5 A; 1N32 O; 4MSW C; 3LSS A; 4LH7 A; 2WWW A; 3SYO A; 3IAY A; 3FYI B; 2WLK A; 3E83 A; 4I50 A; 4I50 B; 4I0X A; 1Q81 W; 5E1A C; 1OCC B; 5C8Y B; 4FLZ A; 3G6E V; 2UXX A; 4DR3 O; 2HG5 C; 5IWA O; 5IYD O; 2WLL A; 4FM2 A; 5KAI Z; 2LJ2 A; 3K5O A; 3HB3 B; 4P9P A; 2PZS A; 1HWY A; 1KC8 W; 4DR7 O; 3K79 A; 5CB4 A; 5CB4 B; 3BCC H; 1K34 A; 5B1O A; 2XAF A; 4YHH O; 1CP9 A; 4PDV A; 3JAM N; 3RYI A; 4EFB A; 3RYI B; 1SQP H; 1QVG U; 1U96 A; 1NKD A; 5GTI Z; 4NXM B; 4G2K A; 2CAZ C; 3THO A; 1YIJ V; 2A9H A; 4X65 O; 1AVM A; 3BAB A; 2F43 G; 1DTO A; 2RN9 A; 4J10 A; 4DR6 O; 3IFX A; 4DR3 B; 1ZTE A; 2YXL A; 1FJG O; 4JZG A; 2QGN A; 1HNZ O; 2FTK A; 5IDJ A; 5B1N A; 1ZAU A; 4X64 O; 5BY1 A; 2GUZ A; 4DR7 B; 2GUZ B; 2ATK C; 1IBK B; 1M93 A; 1AP5 A; 5CA0 A; 2ZE7 A; 5CA0 B; 3FB5 C; 2YUA A; 1IX9 A; 4JZ2 A; 3K9A A; 5EIB D; 4AI8 A; 4YHH B; 5KA5 A; 4DXW A; 3CB2 A; 4JAV A; 4U7N A; 4ZIB A; 5AG2 A; 4GUN A; 4DYL A; 2KKW A; 1R6K A; 4TT3 G; 1BHB A; 1XUQ A; 2ZDI A; 4KL1 A; 1Y67 A; 2B1I A; 1URF A; 1AP6 A; 2Z3Y A; 4N21 A; 2DN9 A; 2XUM A; 3TCU A; 3MD0 A; 2ARH A; 1L8D A; 4DR5 B; 1FJG B; 1ORQ C; 3OR7 C; 2JS5 A; 1EM1 A; 1ZUQ A; 4NTW A; 2E3C A; 5KMG A; 4AIL C; 2VS0 A; 3AK3 A; 1JFF A; 2QE7 G; 3G71 V; 4KP4 A; 2PF4 E; 4DW0 A; 5L3D A; 5LHG A; 1OCZ C; 4X66 B; 5EK0 A; 3IC9 A; 5C93 A; 1VQ4 V; 3CX5 F; 2DE0 X; 2CTP A; 3K59 A; 4EKW A; 4QE7 A; 2KB1 A; 2OCC C; 1FXK A; 4LF6 B; 1KD1 W; 1P7B A; 2Q7H A; 2Y48 A; 1R3J C; 3KG2 A; 2WLJ A; 1N0N A; 1Q3E A; 2HFE C; 3LUT B; 1V9P A; 3APQ A; 1QLE C; 3SYA A; 2PYJ A; 3SJQ C; 1GN4 A; 5EZY A; 5EZY B; 1EN6 A; 3U0Z A; 1NTK H; 2WLN A; 3SYQ A; 4CBC A; 1F23 A; 2CE4 A; 1IBL B; 1N33 B; 1X4T A; 3ASN B; 3SPJ A; 4WF9 V; 1O9G A; 1M57 C; 2ZIM A; 3W7U A; 3R65 A; 3TGU H; 2ZCE A; 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2YIC A; 4JYC A; 3K9S A; 3UCS C; 3ZHU A; 1JCH A; 1XL6 A; 2ZT9 B; 4WFB V; 5LXT A; 5CMU A; 4DV0 O; 3ZRW A; 3APO A; 3OMA B; 3ZRW B; 1XQ8 A; 1FXH A; 2P22 C; 3VBB A; 3VQV A; 2XAJ A; 3UM7 A; 3SPI A; 5B1B B; 1PL4 A; 1H2K A; 2E5L B; 3H1L H; 4PDM A; 1ZLZ A; 1QNM A; 4MTX A; 3CEI A; 4MVU A; 3ZHS A; 3QVN A; 3AG1 C; 4BWA A; 4CC6 A; 3ZCC A; 2IW5 A; 2LP7 A; 1WN7 A; 3ZX6 A; 1N36 O; 3JAT B; 3SJC C; 3OW2 U; 5JWP A; 2QWP B; 4K35 A; 4LF4 O; 1ZWI C; 1VF6 C; 3LDE A; 1D2D A; 2QM8 A; 3EXA A; 1NQT A; 4JI7 B; 3NR7 A; 2YC0 A; 3H9V A; 2XTA A; 3K08 A; 5LP6 C; 1W2B U; 4R8C A; 1WNS A; 3C3S A; 1XMQ O; 4EFE A; 3ZRV A; 4Q6G A; 1EZJ A; 2JEU A; 4YIP A; 1Y6X A; 2Q4P A; 4B7K A; 2VWJ A; 1PL0 A; 4FM0 A; 3RYF B; 4OPA A; 2Y4T A; 4LWS A; 4U3F H; 2ZKO A; 4DK0 A; 1NTM H; 3ZHT A; 4DV4 O; 3K5M A; 3K58 A; 4BW9 A; 1NBM G; 1NI8 A; 1XHZ A; 2XND G; 4JI6 B; 4I9Q A; 2G38 A; 1I94 O; 3ZHV A; 1B04 A; 2X6C A; 4IIJ B; 4IL6 Z; 4JI5 B; 2YIB A; 3BHP A; 2Y69 C; 1YIT V; 3CCV V; 3KCY A; 1M9N A; 2UXN A; 4ZBM A; 1N34 O; 1BQ0 A; 4L87 A; 3JD1 A; 3L75 H; 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