The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
72
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structure length |
72
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Chain Sequence |
NPCLSESDASTRCLDENNYDRERCSTYFLRYKNCRRFWNSIVMQRRKNGVKPFMPTAAERDEILRAVGNMPY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural characterization of CHCHD5 and CHCHD7: Two atypical human twin CX(9)C proteins.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protei
|
| molecule tags |
Unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
24
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-03-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | CytochromE C oxidase copper chaperone |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HP8 A; 2LQT A; 2RN9 A; 2HP8 A; 2LGQ A; 1Z2G A; 1U97 A; 2RNB A; 1U96 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OD4 A; 2Y4T A; 4TT3 G; 1O9G A; 4KHP O; 4RQF A; 1NKD A; 5FNV A; 1SES A; 2DMX A; 2UUB O; 1NH2 B; 2ZM6 O; 1SF9 A; 3ETD A; 3OTF A; 1F4M A; 5L3B A; 4CS4 A; 2Z0A A; 4X66 O; 1IBM O; 1A32 A; 2IJJ A; 2UUA O; 2CTQ A; 1RM1 B; 1Z5W A; 5IDJ A; 3UO3 A; 1XL6 A; 3B4S A; 2A0L A; 5IJ9 B; 4FZ1 A; 3G80 A; 2R70 A; 2OTJ V; 4KUM A; 2DYR B; 3E83 A; 3Q4H B; 4EKW A; 3L73 H; 2UUC O; 4TV8 A; 1ZSP A; 4LR3 A; 3A0R A; 4A5U B; 4MW3 A; 2ZDI C; 1H2S B; 2YDE A; 2EIN B; 1WLE A; 3RYI A; 3CCQ V; 2KSD A; 3G71 V; 2GV9 A; 3T1Y O; 3E8G A; 3SJB C; 2GBO A; 2RQ6 A; 2P22 C; 2RN9 A; 2ZR2 A; 3APQ A; 4JPR A; 4JI8 O; 2DYS B; 2X6C A; 1QLN A; 1EFR G; 2QWQ B; 3LNN A; 3CRQ A; 4HYO A; 2JEX A; 2HLD G; 3SYQ A; 1S0V A; 2Y0P A; 1BQ0 A; 2D2C B; 4CH5 A; 4XDJ A; 4BAY A; 3EFF K; 1I08 A; 1VIB A; 3QG5 A; 3KG2 A; 1OCC B; 3STZ C; 3UT5 A; 4PHZ A; 2HVK C; 4J42 A; 4EFB A; 3OMA B; 4RAI A; 4DR1 O; 3CCL V; 1D2D A; 1N34 O; 5CA0 B; 1YXB A; 3PN1 A; 3SPH A; 1R3L C; 1AI7 A; 1VF5 B; 1XMQ B; 4O4H B; 1YJN V; 2A3Q A; 3D36 A; 3RN4 A; 4RWU A; 1N33 O; 2KG7 A; 4JI3 O; 4BW5 A; 2EIL B; 2BCC H; 4JI0 O; 4UCO A; 4OXS A; 5J2U A; 1SQX H; 2QR4 A; 2K1E A; 3ZJZ A; 4X20 B; 2JJ1 G; 2LGQ A; 3F5W C; 1SQV H; 1NTK H; 2P6J A; 4JYA B; 1EZJ A; 4GX0 A; 1HP8 A; 2YXH A; 3RYH B; 4L87 A; 4X65 B; 2BSK A; 5H6Q A; 4NTW A; 4JI7 B; 4BWA A; 1PV0 A; 2WA4 A; 1PL4 A; 2ILM A; 1TUB B; 3ZMV A; 4DYL A; 4RO2 A; 4FLV A; 1NTM H; 3IC9 A; 4UV9 A; 5K1P A; 4R6Z A; 3X2Q C; 3CPW U; 1VF6 C; 4UXN A; 5KHH A; 1Q86 W; 5FPO A; 1E1Q G; 3LSQ A; 1IXB A; 3L70 H; 3OMI B; 3CRR A; 1M4U A; 4DR6 O; 3N2K A; 3T2M A; 1H2N A; 2WPD G; 1H8H G; 3CCM V; 3M7M X; 1DTO A; 4BIO A; 1JA8 A; 1QU7 A; 5EC2 C; 4DR5 B; 3JSL A; 3ASN B; 3TK1 A; 3TJT A; 2X7R B; 2A06 H; 4J41 A; 5IYD O; 4I50 A; 1EN5 A; 1GM9 A; 5AG2 A; 1OCO C; 3VQV A; 3RFR A; 5IJ0 B; 2CE4 A; 4JI2 B; 4G2K A; 5FPR A; 5CBF A; 4I5S A; 4O4J A; 2IW5 A; 4QPK A; 3CCJ V; 2E74 B; 1GM8 A; 1OV9 A; 2K9P A; 4LFC O; 2Y69 B; 2PY5 A; 1I7F A; 3CRM A; 1XI1 A; 3SJC C; 3W7X A; 1K5Q A; 5JQG B; 2Q68 A; 4JI5 B; 1PPJ H; 1GKF A; 4MVM A; 5CA3 A; 1KC8 W; 4NXM O; 2UXN A; 5KLV H; 4O4I B; 1K97 A; 5LMN B; 2BTO A; 1MA1 A; 4F6R B; 1HNX O; 2Q7E A; 3TXS A; 2XAH A; 1OCC C; 5J2U B; 4PA6 A; 3L74 H; 1WAZ A; 3ZCC A; 2BTQ A; 4QNH B; 4WFH A; 5B1B C; 1K7D A; 4OPA A; 3ZMS A; 1AIL A; 4I0X B; 4JTD B; 1S76 D; 4DV0 O; 1NI8 A; 3BHP A; 1JQ0 A; 4DRX A; 4LF8 O; 4FLZ A; 1TVK A; 3ICX A; 4DR7 O; 3K5O A; 4YJ3 B; 2YUA A; 2F66 C; 4HBN A; 2XAQ A; 1MSW D; 3WG7 B; 4P9O A; 3J80 N; 2QKS A; 1DGS A; 2OCH A; 2JVD A; 1K5S A; 1K9M W; 2QA4 V; 2N05 A; 3N2K B; 4WFF A; 4CS2 A; 4DV7 B; 3UO2 A; 2DQ3 A; 1D5N A; 1EBO A; 5BR8 B; 3ABL B; 1ZAU A; 4UB8 Z; 4IYH A; 1FXV A; 2WLI B; 2ZXW C; 3E8B A; 4AHC A; 5LXT A; 3HKE A; 3HPL C; 2OCC C; 4U3F H; 1L0N H; 4E4E A; 4IYI A; 4D7S A; 3VQX A; 1VQ9 V; 2FB5 A; 4FVM A; 4ZHQ A; 5B3S C; 5KAF Z; 3RGB A; 3E22 A; 5D5Q A; 3UCS C; 2Q4P A; 1QHT A; 2B1I A; 2F43 G; 3SYP A; 2EIK B; 5JVD B; 5KUK A; 4CC5 A; 1WP8 A; 3ASN C; 1KYO F; 4J80 A; 2W0X A; 5CB4 B; 3PJS K; 4I4T B; 3THO A; 1ZX3 A; 4PA4 A; 2LW1 A; 3JCU Z; 1VQL V; 2AZ2 A; 3SGI A; 2HHH O; 2YI9 A; 3APO A; 1AR4 A; 2JIZ G; 1R3K C; 3BEH A; 3C3S A; 4JI4 B; 4KHP B; 2GHY A; 4NTY A; 4O4L B; 2PZS A; 2QJ1 A; 2HG5 C; 2JGD A; 4DUY B; 4LNU A; 1TAE A; 3T1C A; 2ZM6 B; 4X66 B; 1IBM B; 4U7O A; 2ZE6 A; 3ZMU A; 2UUA B; 1Q3E A; 3KZI Z; 4H0L B; 3D36 C; 4ABM A; 1F51 A; 3NXS A; 4FIP C; 4ZOL B; 3OFN G; 4JGS A; 4MVZ A; 1Q43 A; 5LA6 A; 3I5D A; 1ORQ C; 4PA7 A; 1V54 B; 2Q7G A; 3GWK C; 3VQW A; 1YSC A; 4DK1 A; 2YXY A; 1WB8 A; 3ABM B; 2CGO A; 1MMM A; 1K92 A; 3F7Y C; 4CC6 A; 2ZD9 A; 5B1A C; 4HNA A; 1ZTE A; 3CB2 A; 1NR7 A; 1W2B U; 3CC4 V; 5LHH A; 1XL4 A; 4MS2 A; 1AI6 A; 4TV9 A; 1HWY A; 3MAQ A; 4P9P A; 3G67 A; 4YIP A; 1FPO A; 2UXC B; 1R73 A; 2VWJ A; 5CMU A; 5LOV A; 4K0K B; 3HKE B; 1Y76 B; 4UB6 Z; 3K9A A; 1JFF A; 2LJ2 A; 4DK0 A; 4YY3 B; 1H2G A; 3UQ8 A; 1UFI A; 1SA0 A; 1GK9 A; 1XUQ A; 3ABK C; 3FYI B; 1N34 B; 2Z5U A; 3CYO A; 3SDL A; 5CBG A; 1IDS A; 4CS3 A; 1HNW O; 1WA8 B; 1OZ0 A; 1AI4 A; 1JJ2 U; 2IBZ H; 1Y6X A; 4B3M O; 5J2T A; 4I9W A; 4X1K B; 1YEW A; 2Y4U A; 3IJ4 A; 4YIO A; 1N33 B; 3CC2 V; 4IHJ A; 2HEP A; 4JI3 B; 2KQX A; 3CCU V; 4JI0 B; 2OT5 A; 3AG4 C; 3QO5 A; 1IUR A; 1BSM A; 3M99 B; 2F23 A; 1NU1 H; 3W7U A; 3TGU H; 2JRI A; 1Q6U A; 3E8F A; 5LHI A; 4GX1 A; 1M9N A; 3OM3 B; 4R7C A; 4FM0 A; 2EUL A; 1XHZ A; 3ZS8 C; 2HKO A; 2QE7 G; 4IIJ A; 1AP6 A; 2B5U A; 1P4R A; 1KQS U; 1NS1 A; 2XAS A; 1NTZ H; 4OGQ B; 1RPO A; 3B8M A; 5C8Y A; 2YI8 A; 3FB5 C; 4RQE A; 4PD4 F; 3J81 N; 4DR6 B; 3AK2 A; 3JAL A; 3CX5 F; 3U11 A; 5KX5 A; 4AQY O; 3K5L A; 2MK3 A; 3CRC A; 3OW2 U; 2BE3 A; 1YHQ V; 2WLL A; 2FL4 A; 1DF5 A; 3CMA V; 2F4V O; 1U97 A; 3CJH A; 3RBZ A; 5LBQ A; 4BW9 A; 5IWA B; 1VP7 A; 4X64 B; 2HFE C; 2G38 A; 2ZE5 A; 1HNZ B; 1JFF B; 3K58 A; 1KP2 A; 2XND G; 4I55 A; 1JR9 A; 4LF4 O; 1WB7 A; 1SA0 B; 3K0G A; 1GN2 A; 4LFC B; 2FKX A; 1Z5V A; 4O2A A; 3N27 A; 4GKK O; 3KKY A; 3JAS B; 5GTI Z; 4NXM B; 3CXH F; 4YXW G; 3BA8 A; 2LGW A; 4JYC A; 3U0Z A; 5KMG A; 3FFQ A; 3OEH G; 1PNK A; 3L71 H; 2PYJ A; 3AG7 A; 3X2Q B; 3EHB B; 4DV2 O; 5LP6 A; 4LF9 B; 2UXD B; 3DXR A; 1IVS A; 4O2B A; 1XOU A; 2Q7H A; 4FFB A; 4B3T O; 2CAZ C; 4U3J B; 2ZIM A; 2DJV A; 2VRZ A; 5LHG A; 2QKC A; 3RYC A; 3AG3 C; 4LF7 O; 1QBZ A; 2ZE7 A; 4GUN A; 4LF8 B; 3SPG A; 4UCU A; 4DV5 B; 1K4D C; 3RVZ A; 3F7V C; 2R9R B; 3BCC H; 1L1F A; 1B06 A; 3HKD B; 2OIE A; 2LFR A; 1OCO B; 5KHJ A; 2PTM A; 1YI2 V; 2OTL V; 4JTA B; 2IJI A; 4JF3 A; 5JWP A; 1J5E O; 1CPY A; 4E2L A; 4MSW C; 4JAU A; 1EN4 A; 4AI8 A; 4WBN B; 4K8X A; 2ADQ B; 2ITD C; 2VQF O; 1NT2 B; 1H2L A; 4LF6 O; 1NH2 D; 5EZY B; 4NVP A; 3DTU B; 2ADP A; 1HR0 O; 1H2K A; 4JTC B; 2YIA A; 4B3R B; 1S5L Z; 4J9Z B; 3BRC A; 3MHS C; 4JAA A; 5B5E Z; 4FZ0 A; 4FLX A; 3JAM N; 2OIG A; 5KUM A; 4R8C A; 4JV5 O; 1AP5 A; 3JAW B; 2KKW A; 4B08 A; 2HVJ C; 2PYL A; 3H9V A; 1PM9 A; 4LWS B; 4J10 A; 5B1B B; 1VQ6 V; 1KUQ A; 2WLN A; 2XAG A; 3OTO O; 1P7G A; 1VQP V; 4DXW A; 4I9Q A; 1N32 O; 4B7K A; 1LR1 A; 2C2A A; 5A9G A; 1HDJ A; 3HKC A; 1BL8 A; 2HHH B; 1W0K G; 3CD6 V; 2EIM C; 1CXZ B; 3JCZ A; 2Z3Y A; 2E75 B; 4WF9 V; 3K08 A; 4TWK A; 3K5M A; 5FNV B; 1I0H A; 4TSF G; 5LP6 B; 5KAI Z; 3OE7 G; 5JCO A; 4WFB V; 2DW4 A; 1PP9 H; 2BOC C; 3LSS A; 3A2F A; 1SER A; 3CWB H; 5DN6 G; 5J9P C; 5CBH A; 2XAF A; 3ZHR A; 2JEU A; 1ZWI C; 4WFA V; 2ZE8 A; 4Q20 A; 3IAY A; 3JAR A; 3LUT B; 5GW7 A; 5DED A; 5IYB O; 2F1M A; 5L3D A; 1KKC A; 4YJ2 A; 3BFR A; 4FK5 C; 4TV8 B; 2QM7 A; 2ZXW B; 2ZIO A; 3KCY A; 4LFA B; 1WPX A; 3RYI B; 1IXM A; 3QO7 A; 3K3W A; 1ZL8 A; 3I56 V; 2OCC B; 3E2E A; 3T1H B; 3O9O A; 4JZ2 A; 5B3S B; 2QTS A; 3ZRW A; 4LH6 A; 4J7K A; 4P30 A; 4MW8 A; 2ZIN A; 2PI4 A; 1Q5O A; 4QPJ A; 3ABU A; 4MVO A; 3CS5 A; 3AK3 A; 1VEW A; 4FM2 A; 2PI5 A; 4W4K A; 4DO2 A; 1XNR B; 2NR5 A; 3LDE A; 1IZ3 A; 3P32 A; 2IU3 A; 4X1I A; 1L0L H; 1FXK A; 4Z1M G; 1PNL A; 2AXT Z; 4JYY A; 2W0F C; 3UT5 B; 1S77 D; 1XDC A; 2MW2 B; 4UCV A; 2AZ0 A; 4DV4 O; 3BAA A; 1XNQ O; 2HP8 A; 3BY6 A; 4FLT A; 3VOU A; 4D6T H; 4MVS A; 1F7Y A; 3HB3 B; 4QIW F; 3D3I A; 3M8A A; 1MSD A; 1HNW B; 1QLE B; 4I7Z B; 4ZI7 A; 3N2G A; 3G6B A; 4JYB A; 5HFL A; 4AIL C; 4PEL A; 4B3M B; 1N4C A; 3D8C A; 2KG7 B; 1FJG O; 3K9S A; 5JH7 A; 2RDC A; 1SRY A; 4B3S O; 4QE7 A; 4EB6 A; 2UXB B; 2CTR A; 1VQM V; 2PGG A; 2BOB C; 2ZR3 A; 2P5O A; 2RNB A; 2XAJ A; 4LH7 A; 5TIS Z; 1KKD A; 1YJ9 V; 1XEQ A; 1M5I A; 1WP7 A; 5K1X A; 2P06 A; 5B1A B; 3W7W A; 4KFM A; 2BSK B; 1BHA A; 2QTO A; 2Q67 A; 5CA1 A; 2NN4 A; 1Y74 A; 1L8D A; 2Q6A A; 3W7T A; 1R6T A; 2JK5 C; 1JX9 A; 2ZNJ A; 4K3A A; 2YIB D; 4YJ2 B; 5GON A; 3RW0 A; 3RWR D; 1M57 C; 3OR7 C; 1D5A A; 3JD0 A; 4FM1 A; 5LP6 C; 3JAT A; 3R65 A; 4L8J A; 2WLJ A; 2A7W A; 2ATK C; 1K3E A; 1QR8 A; 4JZG A; 3A0B Z; 2EJR A; 4LC1 A; 2O57 A; 3ABK B; 3ZRV A; 1Q6H A; 2IH3 C; 5H9C A; 2CTP A; 4UCR A; 3S3X A; 2QM8 A; 3SPJ A; 1G6U A; 4X1Y A; 5FL7 G; 2Q69 A; 3AG1 C; 2W6J G; 3UKM A; 2GSM B; 4I50 B; 4GX2 A; 5E79 Z; 1EZV H; 2LQT A; 4DW1 A; 2QEX V; 3AG4 B; 2QDO A; 5B66 Z; 4O4J B; 1H8E G; 2QWO B; 2WLM A; 4LF4 B; 1COW G; 3QF7 A; 3GB7 C; 3JSN A; 5IYC O; 1OHH G; 2CK3 G; 4LCU C; 4Z2W A; 4GKK B; 2RJZ A; 3N2G B; 2DE0 X; 1GTO A; 1DLB A; 4TUY A; 3ML0 A; 3IFX A; 5IYZ A; 4PDM A; 3K57 A; 3JAK A; 1GN3 A; 1TGO A; 3EXA A; 2XTA A; 1BT8 A; 2VS0 A; 1FFX A; 4PDL A; 4JAV A; 4WCE V; 2BTQ B; 2UUB B; 3A8T A; 3SJA C; 3K06 A; 2H8P C; 5A2Q N; 1FFT B; 3FD9 A; 1X59 A; 1QLE C; 3QNE A; 3B40 A; 4PJ0 Z; 5JJN B; 1M93 A; 3B09 A; 4DRX B; 5CA1 B; 5EBM C; 1TVK B; 4FPP A; 4PV1 B; 1E79 G; 4GKJ O; 5EYP A; 1NVP D; 1QVG U; 2UUC B; 1VAR A; 1ENV A; 4DR3 O; 4GX5 A; 4G28 B; 5ITZ A; 2AW9 A; 5JCO C; 2UU9 O; 2GTA A; 3T1Y B; 1IBL O; 1BMF G; 5LMU O; 1J5E B; 2DWD C; 1NJI W; 3ZHU A; 3P3N A; 2VQF B; 3JD3 A; 1VQ8 V; 2ETN A; 4JI8 B; 2E5L O; 2GUZ A; 1HR0 B; 2QSA A; 1I94 O; 1M90 W; 4X62 O; 4X89 A; 3H1I H; 5LXT B; 3S3W A; 3JD4 A; 1G4Y B; 1V9P A; 3LNM B; 4DR5 O; 4ZHQ B; 4ZBM A; 4HAM A; 1VQ7 V; 5B1O A; 1WJZ A; 3D3Q A; 3E22 B; 2B9Z A; 1P49 A; 5GTH Z; 2QM4 A; 2QKA A; 4DR1 B; 4FLU A; 1V55 C; 3B77 A; 3CCV V; 1F23 A; 2EZO A; 1HW7 A; 2WLK A; 1ZLZ A; 4OPH A; 3STL C; 4JI2 O; 4WFE A; 3OTO B; 1Q7Y W; 3AG3 B; 1QVF U; 5DEC A; 1N32 B; 2LW7 A; 2WLH A; 2YID A; 2F93 B; 4PI2 A; 1QQC A; 1FXK C; 3ASO C; 1W0J G; 1AB3 A; 3HKB A; 1KB9 F; 5LGT A; 2JGD B; 3ABT A; 4LNU B; 4DV1 O; 1VQ5 V; 5BMV A; 3FB6 C; 1AJP A; 1XIL A; 3CE2 A; 3RYF A; 5KA5 A; 4NTX A; 1NZ6 A; 2UXX A; 1K73 W; 1VQK V; 2RMK B; 3E8H A; 5EIB D; 2V1D A; 1Q6I A; 2CGN A; 1MOF A; 2M7W A; 4LFB O; 4JI6 O; 1VQN V; 1J95 A; 1SET A; 4DW0 A; 1PNM A; 2WAM A; 5LA6 B; 2VWK A; 4W4L A; 1N36 O; 1N0J A; 1S5H C; 2IH1 C; 5FLX N; 4Z1V A; 4DR2 O; 1FKA O; 2R72 A; 4GLX A; 1H2M A; 1Y67 A; 4J9Y B; 4MVU A; 3ZN1 A; 3MHH C; 3K79 A; 5KHI A; 5ITZ B; 1S5J A; 2LO1 A; 5IJ9 A; 3Q4H A; 2EBO A; 4MVQ A; 3OT7 A; 3FB8 C; 3SR2 C; 2AHY A; 4HNA B; 3FKS G; 3QO8 A; 3MD0 A; 4TV9 B; 4EFE A; 5JJJ B; 2DOS A; 2JDI G; 2EJ7 A; 3H1K H; 1SQQ H; 4N21 A; 1Y4M A; 1K8A W; 1E1R G; 1PL0 A; 1XBL A; 3L9D A; 3WFV A; 3TET A; 1P7B A; 5LOV B; 1Z2G A; 1U96 A; 2WA3 A; 2EIM B; 1WNS A; 1RFY A; 4DV4 B; 1XNQ B; 4BIU A; 4MTG A; 4JAS A; 1SQP H; 2EIJ C; 3O65 A; 5L3E A; 1BS3 A; 5H6R A; 3ZBH A; 1BE3 H; 1S3J A; 3ZMZ A; 1K34 A; 3DGE A; 5J2T B; 3RT3 C; 4IHJ B; 1O9H A; 1FJG B; 2L35 A; 5CA0 A; 2LFS A; 4LBE C; 1HNX B; 3QVN A; 5L3C A; 4DR4 O; 2HJD A; 3OUF A; 1SQG A; 2QGN A; 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