The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
64
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structure length |
60
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Chain Sequence |
MMTKKERIAIQRSMAEEALGKLKAIRQLCGAEDSDMQEVEIWTNRIKELEDWLWGESPIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Shewanella oneidensis
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| publication title |
Structure of SO2669 protein from Shewanella onedensis Mr-1, a singleton of unknown functions.
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein SO2669
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| total genus |
24
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| structure length |
60
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| sequence length |
64
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | SO2669-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2NR5 A; 2ODM A; 2GBO A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5L3G A; 3K0G A; 5J9P C; 1XOU A; 1WB8 A; 2BSK B; 3R65 A; 2ZE8 A; 4FLW A; 4O4H B; 5D5P A; 2KG7 B; 1PNM A; 5FNV A; 2JGD A; 2QE7 G; 4JI1 O; 5B1A C; 4LP8 A; 4UFZ A; 4F6R A; 2HFE C; 5IYD O; 5KUK A; 1RP3 B; 2LGW A; 3RYI B; 1AB3 A; 2FTK A; 4DW0 A; 2RN9 A; 4QE9 A; 3NXS A; 5GON A; 3L70 H; 5EZY B; 1MSD A; 4R7C A; 3SJQ C; 4KHP B; 2QM8 A; 4JZ2 A; 5EIB D; 1Q6U A; 4I5S A; 3JAR A; 4K0K B; 2ZKO A; 4JYA O; 3AEI A; 2XT9 A; 5LP6 C; 3F5W C; 5K1X A; 2RMK B; 3HR0 A; 5LHG A; 4EFB A; 4GKK B; 2ZE7 A; 1Q43 A; 3ASN C; 1FYJ A; 1NTZ H; 1KQS U; 3G6B A; 2GUZ A; 2UU9 O; 4PHZ A; 1BMF G; 4FFB A; 1KYO F; 5IJ0 B; 4FK5 C; 1K4D C; 4RQF A; 3CJH A; 3H1H H; 3J7A U; 1BT8 A; 4N23 A; 4O4J B; 4UV8 A; 1NJI W; 3T1Y O; 2Y69 C; 1W0K G; 3FYE B; 3J80 N; 4ZKI A; 5KAF Z; 4ZOL B; 4JI0 O; 3UM7 A; 3GVM A; 4CBC A; 1YSC A; 2AHY A; 3IJ4 A; 2CK3 G; 3OEE G; 4LFC B; 2W0F C; 3SR2 C; 3IGA C; 5KHK A; 1XMO B; 5JVD B; 1SZX A; 1CPY A; 4D6T H; 2F43 G; 3QG5 A; 2QGN A; 2XOK G; 1TAE A; 3SGI A; 3BAB A; 2OTL V; 3N27 A; 4J7Z A; 1PL0 A; 4DYL A; 1QVG U; 4DO2 A; 5H5N A; 3K5N A; 1NR1 A; 3OD4 A; 5JCO C; 1S3J A; 3OUS A; 5IYB O; 3ABM B; 1K33 A; 1VF7 A; 1EN4 A; 4GX2 A; 1H2S B; 1FXV A; 3EHB B; 3W7W A; 1QR8 A; 2LQT A; 1IBM O; 1GM9 A; 3CX5 F; 2PUS A; 4I4T A; 4CZZ A; 1KB9 F; 3H01 A; 5JH7 B; 3BPZ A; 4KHP O; 4CS3 A; 2N04 A; 1EM1 A; 1M9N A; 2CTR A; 2L6L A; 3FD9 A; 3RYH A; 3P3N A; 1QLN A; 3A0H Z; 2YID A; 3CCL V; 3H1K H; 4K0K O; 2DE0 X; 4FLZ A; 1GMG A; 1I5Y A; 4YY3 B; 4TV8 B; 4QPK A; 3HKE B; 4EEQ A; 4CC5 A; 2PI5 A; 4TOI A; 3RN4 A; 4DV2 B; 3T1H B; 3BFR A; 1NI8 A; 1VQ8 V; 1EFR G; 1QLE C; 5L3D A; 4X1Y B; 3G71 V; 3SPC A; 1NZ6 A; 2BE3 A; 3FB7 C; 3K5O A; 3K5L A; 2HVK C; 3QO8 A; 5LMN O; 4PDL A; 4LBE C; 5KHG A; 3CRC A; 1HNZ O; 2UUB O; 2YEV A; 3N2K B; 1F7Y A; 3RFR A; 1M57 B; 3SJA C; 4DRX B; 5KX5 B; 2WSS G; 1VQ5 V; 4UB6 Z; 1K8A W; 4JTA B; 2N05 A; 1H38 A; 4U7N A; 2G38 A; 5LXT B; 4K35 A; 1NH2 D; 4TUY A; 3OMA B; 1BE3 H; 2NNU A; 3E83 A; 4B3T O; 3UCS C; 1VAR A; 2GBO A; 1SQQ H; 3E8F A; 5EBL C; 2CUG A; 1FFX B; 2W6J G; 3SPI A; 4RWU A; 2JRI A; 3BHP A; 1M56 C; 4FLU A; 4NXM B; 1Q90 D; 1QNM A; 4HYO A; 4LF7 B; 1FXK B; 4LFC O; 3BCC H; 1NTM H; 3OEH G; 1NVP D; 3WB2 A; 1AVM A; 2V4D A; 3CCS V; 3C3T A; 2Q4P A; 1KP2 A; 1XMO O; 3RVY A; 3B09 A; 4X64 B; 4LC1 A; 5CA0 B; 2LJ2 A; 1SKV A; 1AIL A; 5LHI A; 4Z1M G; 2ADP A; 2B1G A; 2IM9 A; 2X7R B; 3HPL C; 3G4S V; 2QKC A; 4ZHQ B; 1WA8 B; 3TK1 A; 4DV5 B; 3CHX A; 4GCZ A; 2XAS A; 2ZXW C; 2IJI A; 3W7S A; 4TWK A; 4I50 B; 4B3S B; 4YJ2 A; 4YJ3 A; 3OTO B; 1BQZ A; 1N4C A; 1MA1 A; 4IHJ B; 2LFR A; 4NVP A; 2WA3 A; 4JAU A; 1JCH A; 2DMX A; 2KQX A; 4G2K A; 5LP6 B; 4PI0 A; 2YI8 A; 4E4E A; 1Q7Y W; 2OT5 A; 4YY3 O; 3L71 H; 2WPD G; 4X62 B; 4JAA A; 2VS0 A; 4J41 A; 2UXX A; 4FMT A; 5CBH A; 4DV2 O; 3T1H O; 4BW5 A; 2LO1 A; 3ABK B; 4B3R B; 2R9I A; 3O9O A; 4BIU A; 1IUR A; 3BA9 A; 4DUY O; 2EIL C; 5KA6 A; 1OCZ C; 4I55 A; 3H9V A; 1BQ0 A; 5BR8 B; 4LWS A; 1H2N A; 1S5J A; 3RYC B; 3SYP A; 1XHX A; 4MVU A; 3B77 A; 3JAW A; 4DR6 O; 3PJS K; 2ZIO A; 3JCZ A; 1K5Q A; 2PY5 A; 2ILM A; 1BZK A; 3DXR A; 2LP7 A; 2VQF B; 3K5M A; 2Y69 B; 4FLT A; 4O2A A; 2PYJ A; 1EZJ A; 4LFB B; 3RYF B; 1RSO A; 3ZHR A; 5IYZ B; 2JK5 C; 1Z5V A; 2YIA A; 3E89 A; 4PV1 B; 2MW2 B; 4NXM O; 3ZHS A; 1WP7 A; 4X1K A; 1S77 D; 2PZS A; 4JI2 B; 4LF7 O; 2QDO A; 4MW8 A; 2PGG A; 2EJR A; 4WFF A; 5IJ9 A; 4U3J B; 1XL6 A; 4F6E A; 5BMV A; 2YXL A; 4X64 O; 2F93 B; 1JVM A; 3SYA A; 1H2G A; 4G28 B; 3MHH C; 3UT5 B; 3JAM N; 1ENV A; 2P90 A; 2P6J A; 3LDC A; 4DV5 O; 4UVB A; 5EBM C; 1JJO A; 2YIB A; 4O4I B; 5EC2 C; 1VQ6 V; 5J2U A; 1N36 B; 4QJF B; 2NN4 A; 1JMK C; 3ZN1 A; 4B3S O; 2B1I A; 4J9Y B; 5LMU B; 3OTO O; 2FL4 A; 2D3O W; 4FLX A; 3ZS8 C; 3QTC A; 2A06 H; 4DW1 A; 4O2B B; 5J2T A; 3OT7 A; 2RQ6 A; 3C3S A; 3W7X A; 2M7W A; 3ZJZ A; 2DN9 A; 2VWJ A; 4C7U A; 4X62 O; 2HG5 C; 1R73 A; 2PTM A; 4BW9 A; 4MVM A; 4B3R O; 2OIE A; 4JGS A; 4LNU B; 2EX3 A; 2Q7H A; 1B3Q A; 1Y66 A; 2HJF C; 3UO3 A; 1GRJ A; 5BR8 O; 1ZUQ A; 2PI4 A; 4UCT A; 2DYR C; 5C8Y A; 3W7U A; 2HP8 A; 3K58 A; 3KZI Z; 1VP7 A; 1AJP A; 2IH1 C; 4GLX A; 3THO A; 4LR3 A; 2YXH A; 2ZNI A; 2HHH O; 4DV7 B; 1X59 A; 2VQF O; 2ZDI A; 3KCY A; 5CA1 A; 3FKS G; 1OCR C; 3CPW U; 3BY6 A; 2XUM A; 4A5U B; 3HKB B; 1F4N A; 2WLL B; 4JI2 O; 4JI5 B; 1M1K W; 3CWB H; 1YVW A; 2E75 B; 4RQE A; 5ITZ A; 1O9G A; 3RWR D; 4FZ0 A; 4JI1 B; 2YI9 A; 1RPO A; 4ICG A; 3IC9 A; 4KXR A; 1WPB A; 5LL6 Y; 3D3Q A; 1WLE A; 3SYO A; 5CA3 A; 1L0L H; 1EN5 A; 2DW4 A; 2Q0A A; 1KMI Z; 2DOS A; 1YJW V; 4I9Q A; 2WLI A; 2HLD G; 4JYB A; 3ZMV A; 2Q73 A; 4AI8 A; 4JYA B; 4ZI7 A; 3M99 B; 4LFA O; 4CH3 A; 1V55 B; 1SS3 A; 4BWA A; 4YIP A; 5KHH A; 3ETE A; 5GTH Z; 4D7S A; 2DQ3 A; 5B1N A; 4CS4 A; 1GN2 A; 4UCR A; 3KKY A; 3ABL B; 5FNV B; 2ZIM A; 1EN6 A; 4DV6 B; 3CC7 V; 1BSM A; 4R50 A; 2UU9 B; 2LW7 A; 3HKC B; 2P67 A; 1KC8 W; 2LFS A; 1COW G; 2OTJ V; 4PEL A; 4TSF G; 5GON B; 5IY5 B; 4WFB V; 1VQO V; 4N21 A; 1WNS A; 2QM4 A; 4PA7 A; 3CRQ A; 1NBM G; 2ZIN A; 3JSL A; 3AG1 B; 3ASO C; 3CB2 A; 3JAR B; 2YIC A; 2FB5 A; 5L3B A; 1P84 F; 1PL4 A; 2V7Q G; 4DV7 O; 3TET A; 2K9P A; 4OPH A; 3E2E A; 1B04 A; 3L74 H; 4WFE A; 2JVD A; 1LR1 A; 4W4K A; 4WBN A; 2R70 A; 3P32 A; 1G8M A; 1TVK A; 1R6N A; 2OWO A; 1O9H A; 4UUJ C; 2UXD B; 3BA8 A; 1Y74 A; 4JI5 O; 5HFL A; 3BVO A; 4MS2 A; 3WG7 B; 4CH6 A; 3JAT A; 1SES A; 1K97 A; 1H8E G; 4Z1V A; 4FFB B; 1VIB A; 3E22 A; 4OGQ B; 3DC6 A; 4JI6 O; 1NVP B; 2BOB C; 3K0D A; 3CJH B; 4OX9 O; 3B8M A; 2IBZ H; 1YF2 A; 2QWO B; 4EB6 A; 2B9Z A; 3K3W A; 3JAS B; 4TQF A; 1HNW B; 1YJN V; 2QR4 A; 1TUB A; 1IBM B; 4HNA B; 3CE2 A; 4IYI A; 2LGQ A; 3TXQ A; 1YEW A; 4B7K A; 4HZ3 A; 3A0R A; 4FZ1 A; 1S76 D; 5JJN B; 3A2F A; 2JJ1 G; 5B1B C; 3QVN A; 3CS5 A; 1W2B U; 4MTO A; 1DGS A; 3LSQ A; 4MVO A; 3IAY A; 3JD2 A; 4LF4 B; 2BCC H; 4DR1 O; 2EIN C; 3AK1 A; 4I0X A; 1URF A; 2P06 A; 3OMI B; 4E2L A; 2EIM C; 2QWQ B; 4DV4 B; 5LMN B; 4DV6 O; 3C90 A; 1RM1 B; 5LHH A; 2FKX A; 3AG3 B; 2QTS A; 4CC6 A; 1HNZ B; 5KMG B; 2UUB B; 1FJG O; 3E86 A; 1XL4 A; 2E3C A; 3WB1 A; 1HWY A; 4I4T B; 1IX9 A; 5L3E A; 3LDE A; 3CXH F; 1KD1 W; 4FM2 A; 3AG4 B; 1XUQ A; 3VQW A; 1V54 B; 4X89 A; 4B3T B; 1VQK V; 1SA0 A; 2CAZ C; 2RCV A; 3CMA V; 4W4L A; 3OAA G; 2ZR2 A; 2F66 C; 4YHH B; 2O57 A; 1R3K C; 1NT2 B; 4QE7 A; 2Y48 A; 2AW9 A; 1H2L A; 1OZ0 A; 4L8J A; 1U96 A; 4JPR A; 2AZ2 A; 2UXD O; 1YDX A; 5EZY A; 1N0N A; 2D2C B; 3L72 H; 3K03 A; 3JAK A; 1IXB A; 4DR5 O; 2GTS A; 3VQY A; 1PM9 A; 4IIJ B; 5EBW C; 3UQ8 A; 3CRR A; 5GTI Z; 5FPO A; 3BAA A; 3H1I H; 2OIG A; 2GSM B; 1HNW O; 2CTP A; 4TUY B; 1OCO B; 4GUN A; 5FL7 G; 1PD3 A; 4H37 A; 1ZL8 A; 2NR5 A; 4P9O A; 1KBH A; 1OCC B; 2IJK A; 1VQP V; 2ZDI C; 1SQF A; 2OCC C; 4H44 B; 4LCU C; 1N0J A; 2B5U A; 3JAL B; 5IJ0 A; 4LF4 O; 4P9P A; 1IVS A; 1ZSP A; 5H9C A; 1K3E A; 3RW0 A; 2W0X A; 2WLH A; 2IW5 A; 3SJC C; 3ZX6 A; 4DUY B; 2GDS A; 1ZLZ A; 1IXM A; 2ZCE A; 4DV4 O; 3K08 A; 2ITC C; 1FPO A; 4DK0 A; 2UUA B; 5H6Q A; 2DYS C; 1VQ4 V; 4DR6 B; 4YJ2 B; 3SPG A; 4J42 A; 4YJ3 B; 1H8H G; 5BY1 A; 1PV0 A; 4KFM A; 5CB4 A; 3AG2 C; 3T4Z A; 3VOU A; 3JD4 A; 4UXN A; 1KP3 A; 4CS2 A; 2EZO A; 1Y6X A; 2EBO A; 5TIS Z; 2ZE6 A; 2EIJ B; 4HAM A; 2JS3 A; 4YHH O; 1I94 B; 5GW7 A; 1K34 A; 2QKS A; 1AP6 A; 4RUF A; 2YDE A; 3UO2 A; 2RJZ A; 1CXZ B; 1UJW B; 3P3P A; 4I55 B; 1Q6I A; 4LWS B; 1QU7 A; 4NTY A; 3ZMS A; 1UFI A; 5B3S C; 5DN6 G; 3OE7 G; 3OFN G; 4J7J A; 5B1A B; 4Z2W A; 4NB5 A; 1GN6 A; 2R9R B; 3APO A; 2IH3 C; 2K1E A; 3DXR B; 5A2Q N; 3ZRW A; 1S5L Z; 4O2A B; 1UPG A; 2Q68 A; 3FFQ A; 4MTG A; 4P30 A; 1YTF D; 4DR7 O; 4MVZ A; 2X6A A; 1J5E B; 3CD6 V; 1XEQ A; 4X1K B; 1F4M A; 2L35 A; 3AK2 A; 2AXT Z; 1FAF A; 3N2K A; 1OV9 A; 2Q9L A; 4PA6 A; 5IJ9 B; 5BMV B; 1F51 A; 3SYC A; 1N34 B; 2Q8V A; 3ASN B; 3DTU B; 1FXH A; 1JOY A; 2EZP A; 2MK3 A; 4MTX A; 1FFX A; 1Y4M A; 1G1X B; 1S5H C; 2UUA O; 1FXK A; 5J2U B; 2HKO A; 3MD0 A; 3WFV A; 2OYQ A; 1SQX H; 1Z2G A; 1XI1 A; 2HHH B; 1I5X A; 3ZMT A; 4LF9 O; 1TA8 A; 2Y0P A; 4BIO A; 2QTO A; 4LF5 B; 4NXN B; 4JTC B; 1JA8 A; 5E79 Z; 2UXN A; 2VWK A; 2ETN A; 3DC5 A; 2QWP B; 1I94 O; 5EK0 A; 4DXW A; 4UB8 Z; 3CXC U; 1SQG A; 1I0H A; 3ZHV A; 3CP1 A; 3M8A A; 4PA9 A; 1KU9 A; 2FML A; 2KSD A; 1Q86 W; 1NTK H; 1D2D A; 5LOV A; 1US6 A; 3KCX A; 3N2G A; 1AI6 A; 1AI7 A; 3QO5 A; 2VRZ A; 4P2Z A; 1M90 W; 5C8Y B; 4IHJ A; 1L1F A; 1I08 A; 1VEW A; 2BTQ A; 1Y76 A; 1GM7 A; 4DV0 B; 3IFX A; 4XDJ A; 4BAY A; 1BCC H; 4X20 A; 1XRE A; 3CME V; 2A0L A; 2JDI G; 4PJ0 Z; 1Z5W A; 4O4L A; 4J11 A; 4X8A A; 4U7O A; 1JQ0 A; 5CA1 B; 5IDJ A; 3LUT B; 1N8R W; 3I55 V; 5CBG A; 1G6U A; 2QKA A; 1OJH A; 3FAV A; 1R3J C; 5AG2 A; 4Q20 A; 4LFA B; 4JYY A; 1J5E O; 3JCU Z; 1SQV H; 1SZT A; 3RYC A; 1E1R G; 2Y0I A; 4JI3 O; 3JYC A; 1JPX A; 4GYC B; 4PDV A; 5LGT A; 2UUC O; 1QLE B; 4QIW F; 5ITZ B; 4TV9 A; 2WAM A; 1N34 O; 3Q4H A; 1DF5 A; 5IWA B; 3JD0 A; 4R6Z A; 3WB0 A; 1BL8 A; 1H2M A; 3ZHU A; 2Q67 A; 5IYZ A; 1SER A; 4FIP C; 1R6T A; 2RNB A; 4OXS A; 3PN1 A; 2E5L B; 1S72 V; 2IJJ A; 3S3X A; 5JJE B; 3AG2 B; 3APQ A; 2WLJ A; 4CH5 A; 4IYH A; 1XNR B; 4ZI7 B; 2A7W A; 3OUF A; 1M56 B; 5D5Q A; 4JAS A; 1N32 B; 1TGO A; 1YZB A; 5EYP B; 3MHS C; 4LF5 O; 4NXN O; 1SC5 B; 1VMG A; 1KKC A; 1G4Y B; 2CE4 A; 3H1L H; 2KB1 A; 3OGC C; 5B5E Z; 5E1A C; 2ZE5 A; 3ETQ A; 4JI6 B; 3RT3 C; 4OX9 B; 2YUA A; 4BR6 A; 1SET A; 3T2M A; 2ZXW B; 1SQP H; 5CN0 A; 1ORQ C; 4DV0 O; 2Y4T A; 4D7T A; 4UVC A; 2F95 B; 3STZ C; 5LA6 A; 4WFH A; 3B4S A; 2HJD A; 5KUM A; 2WLK A; 3BEH A; 1BGY H; 4WBN B; 4FVM A; 1D5N A; 2EJ7 A; 1WP8 A; 1LNQ A; 1TVK B; 3E8B A; 2HVJ C; 2F4V B; 1PNK A; 2CH7 A; 1Q82 W; 4JV5 O; 4MVS A; 4DR1 B; 3ABM C; 4B7E A; 1Y74 B; 3VQX A; 2Z3Y A; 4WFG A; 1YXB A; 3JAT B; 2YIB D; 2RDC A; 2Y4U A; 2EIL B; 4JTD B; 3E22 B; 1MZF A; 1OCZ B; 1WAZ A; 2JGD B; 1YI2 V; 2A79 B; 3E8G A; 3F7Y C; 5IWA O; 4F6R B; 1IZ3 A; 1K92 A; 4HBN A; 5JQG A; 2Q69 A; 3SYQ A; 4EB6 B; 1FJG B; 3OMN B; 2XAF A; 2QA4 V; 4BIZ A; 1VF6 C; 2PYL A; 1TUB B; 3TJT A; 1VQN V; 3MDS A; 4EFE A; 1PNL A; 4NKG B; 2XAQ A; 2E5L O; 1WPX A; 1ROP A; 4KL1 A; 3U10 A; 2GHY A; 4LF6 B; 2DQ0 A; 2IU0 A; 2VQE B; 3QO7 A; 1P7B A; 2JEX A; 1XNR O; 1JR9 A; 4MVR A; 4JF3 A; 2ZT9 B; 1N32 O; 1M57 C; 1HR0 B; 3X2Q C; 4I0X B; 2X0L A; 3CCV V; 4DK1 A; 3ETG A; 1W0J G; 1K4C C; 3CSX A; 3LNN A; 1AR4 A; 4KP4 A; 1P4R A; 1D5A A; 2GUZ B; 5B66 Z; 1XQ8 A; 2DWD C; 4DR5 B; 1IBK O; 2C2A A; 1OHH G; 3WU2 Z; 5L3F A; 1GAX A; 5FLX N; 4PDR A; 1FXK C; 3HKD A; 4LH6 A; 2JEU A; 4GX5 A; 3ZHQ A; 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