The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
43
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sequence length |
103
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structure length |
103
|
Chain Sequence |
SALHWRAAGAATVLLVIVLLAGSYLAVLAERGAPGAQLITYPRALWWSVSTATTVGYGDLYPVTLWGRCVAVVVMVAGITSFGLVTAALATWFVGREQERRGH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of KcsA mutant
rcsb |
| molecule tags |
Membrane protein
|
| source organism |
Streptomyces lividans
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| molecule keywords |
FAB-A
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| total genus |
43
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| structure length |
103
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| sequence length |
103
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF07885 | Ion_trans_2 | Ion channel |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2A79 B; 3K08 A; 3LDD A; 4WFG A; 3SYO A; 2AHY A; 3FB7 C; 4MVZ A; 1K4D C; 3ABL C; 1K4C C; 4QE7 A; 3F5W C; 2HG5 C; 3LNM B; 2ATK C; 2X6A A; 4MW3 A; 1QLE C; 5EBM C; 4MVO A; 3RW0 A; 2QTO A; 4TWK A; 2IH3 C; 3JYC A; 3K0G A; 2IH1 C; 4P2Z A; 3RVY A; 3K06 A; 2WLH A; 3LDE A; 4F4L A; 4RUF A; 3X2Q C; 1OCR C; 3SYA A; 3ZJZ A; 1BL8 A; 5EBW C; 4DXW A; 3TET A; 3OUF A; 4GX2 A; 4KFM A; 2BOB C; 4H37 A; 4EKW A; 4J9Y B; 3OGC C; 5EC2 C; 2WLI A; 1ORQ C; 2HVJ C; 3UKM A; 3E8F A; 4WFE A; 3SPC A; 3HPL C; 4P9O A; 2R9R B; 1V55 C; 3SPJ A; 4P9P A; 2W0F C; 2HVK C; 3E8B A; 3EFF K; 3K0D A; 4MVS A; 2WLJ A; 4WFH A; 3SPG A; 3TCU A; 2EIJ C; 4QNH B; 2EIL C; 4GX1 A; 4GX5 A; 3SYP A; 3F7Y C; 3LUT B; 3T4Z A; 5CBF A; 4PDM A; 3STL C; 1M57 C; 5EK0 A; 3AG2 C; 3ABK C; 5BZB A; 2WLL B; 2X6C A; 3K04 A; 4ZBM A; 4MSW C; 2OCC C; 3BEH A; 3IGA C; 1R3L C; 1R3I C; 2H8P C; 2ZXW C; 4PA7 A; 3PJS K; 4JTA B; 4I9W A; 4MW8 A; 4MS2 A; 4RUE A; 4X8A A; 3WG7 C; 3ZRS A; 2Q68 A; 2EIM C; 4MTG A; 5E1A C; 3ASN C; 5J9P C; 5KUM A; 3UM7 A; 3FB6 C; 3GB7 C; 3E8H A; 1G4Y B; 3E83 A; 4XDJ A; 2Q67 A; 1R3J C; 3FB5 C; 2WLM A; 3ASO C; 2DYR C; 2ITC C; 4UUJ C; 1OCO C; 2EIN C; 1JVM A; 5B1A C; 4R6Z A; 4GX0 A; 4PDV A; 2BOC C; 2P7T C; 2X6B A; 4G28 B; 4MTF A; 2A0L A; 2DWE C; 2WLN A; 3E89 A; 3IFX A; 1LNQ A; 3F7V C; 4X89 A; 2JK5 C; 4LBE C; 3T2M A; 4PA4 A; 4MTO A; 4R7C A; 2WLI B; 3RVZ A; 3SPH A; 4CBC A; 2ZD9 A; 4P30 A; 1KKD A; 3T1C A; 1J95 A; 4LP8 A; 1XL4 A; 2YEV A; 3R65 A; 2Y69 C; 2NLJ C; 4MVQ A; 1S5H C; 4PDR A; 3STZ C; 4JTC B; 3KG2 A; 3AG1 C; 4JTD B; 3K03 A; 3OR6 C; 2A9H A; 5B3S C; 3SYQ A; 2HFE C; 4RAI A; 2DYS C; 2DWD C; 3AG3 C; 3SPI A; 5EBL C; 4RO2 A; 2ITD C; 5CBH A; 4PA9 A; 3RBZ A; 3FB8 C; 4G27 B; 5CBG A; 4MVU A; 2EIK C; 5KUK A; 1XL6 A; 3ABM C; 3OUS A; 4OXS A; 4PA3 A; 4XDL A; 2KB1 A; 4XDK A; 4BW5 A; 4QE9 A; 5B1B C; 5IY5 C; 3OR7 C; 3T4D A; 4HYO A; 4MVR A; 3LDC A; 2K1E A; 4H33 A; 3E86 A; 4J9Z B; 3E8G A; 1R3K C; 4X88 A; 4R8C A; 3VOU A; 2QKS A; 4MVM A; 4PA6 A; 3SJQ C; 1OCC C; 1V54 C; 2WLK A; 1M56 C; 2Q69 A; 1P7B A; 4R50 A; 1OCZ C; 4WFF A; 4LCU C; 2Q6A A; 1ZWI C; 2WLL A; 4PDL A; 2HJF C; 5EC1 C; 3SYC A; 4HZ3 A; 3AG4 C; 2AHZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4LC1 A; 5FPR A; 1Q6I A; 4DV3 B; 3J7A U; 4NVP A; 1OCR B; 1R6N A; 2DMX A; 1PNK A; 2AXT Z; 3B2E E; 4FLU A; 4JGS A; 2RQ6 A; 2V1D A; 5GON A; 2IH1 C; 2JDI G; 4P2Z A; 3L74 H; 1X4T A; 3BY6 A; 4DR1 B; 4N23 A; 2K9P A; 2BOB C; 1S77 D; 1M57 B; 4O4I A; 1WJZ A; 1K9M W; 1ORQ C; 4UVA A; 4WFE A; 1IBK O; 1X59 A; 1CXZ B; 1YTF B; 2XAG A; 3SJC C; 3CSX A; 1AR4 A; 3T1Y B; 3HKC B; 5KHG A; 2YIB D; 2NN4 A; 1EZJ A; 1OV9 A; 4ZIB A; 2RJZ A; 1R3I C; 2QWP B; 2QWR B; 3JAW A; 1S5L Z; 2H94 A; 4PD4 F; 2Q7G A; 4DW1 A; 5J9P C; 1MMM A; 5IWA O; 2YI8 A; 4HBN A; 1XUQ A; 4R6Z A; 3ZMU A; 4PDV A; 1XHZ A; 5LXT B; 4DUZ B; 1VAR A; 4FM0 A; 1BT8 A; 2JK5 C; 4DR4 O; 2UUA O; 2N04 A; 4DV4 B; 4EFB A; 4D7T A; 2JEX A; 1JFF A; 1XNR O; 1AP5 A; 3K03 A; 2A9H A; 4KP4 A; 5DN6 G; 1H8H G; 4DV1 O; 1VQ8 V; 2P4K A; 3FB8 C; 5DEC A; 2EIK C; 5LYJ A; 3TJT A; 1I5X A; 4I5S A; 4QE9 A; 4DW0 A; 4UB8 Z; 4LF4 B; 3GWK C; 3MHS C; 4LF6 B; 1GK9 A; 3N2G B; 4X20 B; 3DTU B; 2R72 A; 3K5M A; 1F4M A; 3CC4 V; 4O4H A; 2LP7 A; 2Y48 A; 4DV5 O; 2IM9 A; 2YXL A; 3KCY A; 4FFK A; 2LJ2 A; 3ZMZ A; 3K0G A; 5JQG B; 4JI2 O; 4ZOL A; 1WA8 A; 3X2Q C; 4NYK A; 3JAS A; 4LFB B; 3AK1 A; 3CJH A; 1GN2 A; 1JJ2 U; 4X66 O; 2Z3Y A; 5EC2 C; 3ZMT A; 4ABM A; 1VQP V; 3CCQ V; 3Q4H A; 4Z2W A; 4D7S A; 4DV2 B; 1Y4M A; 3JSL A; 2EIL C; 3FAV A; 2UXC O; 2CE4 A; 2ZE6 A; 2WA4 A; 3ASO B; 4AQY O; 4BIU A; 4X1I A; 5CN0 A; 5F2V O; 4JI5 B; 5J2U B; 5DED A; 2P5O A; 4GCZ A; 3AK3 A; 1WB7 A; 4ZKI A; 3JD1 A; 2VQF O; 4I7Z B; 3H1H H; 4PI0 A; 2CK3 G; 3CCL V; 2WLI B; 3OFN G; 2W0X A; 1PV0 A; 2JGD B; 1XL4 A; 1GMG A; 4I0X A; 1F4N A; 3CCM V; 1P7G A; 3ZMS A; 3SPI A; 5BR8 O; 3KKY A; 3ICX A; 4I55 B; 3JAR B; 3ML0 A; 4BAY A; 2Q7H A; 3HKE A; 5EZY B; 4TV9 B; 1R73 A; 1FD9 A; 1FJG B; 3EHB B; 1R6K A; 1IBM O; 1NS1 A; 1HR0 O; 3ASN C; 2AZ2 A; 3E22 A; 4QE7 A; 3CCJ V; 2RMK B; 5BMV B; 5LP6 B; 3UO3 A; 2QTS A; 4PI2 A; 2KSD A; 2P22 C; 2F1M A; 4FLY A; 4TWK A; 4LF7 B; 3RVY A; 4CS2 A; 3DXR A; 3F5T A; 2XAJ A; 1EN6 A; 4I50 A; 4DR2 B; 2EX3 A; 4PEL A; 1KC8 W; 3HPL C; 3CRC A; 1HNW O; 3SPJ A; 4DV3 O; 4WFH A; 2ZCE A; 3O9O A; 4GKJ O; 2EIM B; 4DR3 B; 3QO8 A; 5KX5 B; 1Y74 B; 3STL C; 4NTY A; 2VWJ A; 4ZBM A; 1TA8 A; 5GTH Z; 4FM2 A; 4JYC A; 4DR1 O; 1YXB A; 2QR4 A; 3IC9 A; 4F6R A; 4ZI7 A; 2N74 A; 4DUY B; 1XMO O; 1PKX A; 5GON B; 3J80 N; 1RP3 B; 4FLW A; 1DLB A; 4BR6 A; 3ETD A; 4HAM A; 2F93 B; 2ZT9 B; 3WB1 A; 4DRX A; 3G80 A; 4O4I B; 2GV9 A; 5L3E A; 3FX7 A; 1BHA A; 1K92 A; 1WP8 A; 3SJB C; 3W7S A; 1JX9 A; 1Y67 A; 3ZRV A; 2B5U A; 1F7Y A; 3RYF A; 2HEP A; 3QNE A; 4UV9 A; 2YUA A; 4YHH O; 2OIE A; 3AG7 A; 5CBH A; 5IJ0 A; 3RBZ A; 3VQX A; 1NTM H; 4OXS A; 1JR9 A; 1UPG A; 3JAW B; 5LMU O; 4U7N A; 1VP7 A; 2PGG A; 2K1E A; 5FPO A; 3E8G A; 2QDO A; 3VOU A; 2LO1 A; 4LH6 A; 5KAI Z; 1P7B A; 5EC1 C; 5LHG A; 4JAV A; 4DV4 O; 2Q73 A; 2LW1 A; 4MVZ A; 1NH2 D; 3CCE V; 1K3E A; 1ARO P; 2FB5 A; 5KA5 A; 4X1K A; 1SQF A; 2CDY A; 4FZ1 A; 1GN6 A; 4UCS A; 2LQT A; 5B1A B; 1JFF B; 2Q4P A; 1HWY A; 1MNG A; 3ETQ A; 3OUF A; 3GVM A; 4LF4 O; 2F95 B; 3H01 A; 1I0H A; 2XHB A; 1Y66 A; 1GAX A; 1QR9 A; 5LYJ B; 4IIJ A; 2ADP A; 1SA0 A; 3K0D A; 2FTK A; 5LL6 Y; 1WN7 A; 3TCU A; 3B8N A; 1BZK A; 2LW7 A; 3EVK A; 3CHX A; 1UJW B; 2OT5 A; 5K1X A; 1DTO A; 1PL0 A; 3QO5 A; 3M7M X; 1JQ0 A; 4O4H B; 3PJS K; 3S3W A; 4NXN B; 2PTM A; 5LP6 C; 5L3D A; 3G4S V; 1VQM V; 1N8R W; 3A0B Z; 1K33 A; 3FYI B; 3FB6 C; 1KD1 W; 3E83 A; 2D2C B; 1QCE A; 4BW9 A; 2WLM A; 1P84 F; 1OCZ B; 1HDJ A; 4ZOL B; 1WA8 B; 2Z5U A; 5L3F A; 1N4C A; 3BA8 A; 3JAS B; 5CA0 A; 3CXH F; 3IFX A; 3CJH B; 2F66 C; 1M1K W; 1XQ8 A; 3SPH A; 3UO2 A; 4TQD A; 3Q4H B; 3SDL A; 2HJD A; 3BA9 A; 4J10 A; 4JI7 B; 3BCC H; 3P3N A; 3FAV B; 1GTO A; 4JI5 O; 2VQE O; 2QWN B; 3G71 V; 4YIO A; 4RO2 A; 1FPO A; 1U97 A; 4OPA A; 4RWU A; 5L3C A; 4X1I B; 3ABM C; 4XDL A; 4IL6 Z; 2DW4 A; 4BW5 A; 3G6E V; 4B3T B; 3OMA B; 4XDJ A; 1I94 B; 4DV0 B; 3VQY A; 3C3T A; 2AHY A; 4WCE V; 4JYB A; 3D3I A; 3ABT A; 1K4C C; 4ICG A; 2X0L A; 2ZDI A; 3CYO A; 4B7K A; 1GM8 A; 5GW7 A; 1COW G; 5BY1 A; 2JS5 A; 1U96 A; 3JYC A; 1CP9 A; 2YIA A; 1KU9 A; 1FXK A; 4I0X B; 1FJG O; 1N33 B; 1IXB A; 3CEI A; 3HKE B; 1NBM G; 4FLV A; 1NTK H; 3OT7 A; 4CC5 A; 1I08 A; 3PN1 A; 1I5Y A; 1AJQ A; 3E22 B; 1NH2 B; 4JI3 B; 4H44 B; 1H2S B; 3JCU Z; 5IJ9 A; 2EUL A; 2UU9 O; 3JD0 A; 4IHJ A; 1TVK A; 3SR2 C; 2XAS A; 3FKS G; 1H8E G; 3TXQ A; 4B3M B; 1IVS A; 4LWS A; 3UT5 A; 4OX9 B; 5B1A C; 5KLV H; 3DXR B; 4JAU A; 1CEZ A; 2YIB A; 4G28 B; 1M9N A; 1L0N H; 2A7W A; 3U10 A; 4X89 A; 1SQX H; 5L3G A; 4NKG B; 3OMI B; 2ZD9 A; 4E2L A; 3CPW U; 2DQ3 A; 4LFA B; 2YEV A; 1SZT A; 1S5H C; 1RSO A; 3STZ C; 4FFB A; 4CS4 A; 2ZIO A; 1GKF A; 4KL1 A; 3WB2 A; 4DUY O; 1VQ7 V; 3CC7 V; 5EBL C; 4FLX A; 5CBG A; 3CRQ A; 4PA3 A; 1DF5 A; 2CGO A; 1N32 O; 5B1B C; 4F6R B; 4ZI7 B; 1YDX A; 5LOV A; 1XEQ A; 3K5L A; 1Q6U A; 1IDS A; 2Q69 A; 1OCZ C; 2BCC H; 3SYO A; 2UUB O; 4CS3 A; 5A9G A; 3X2Q B; 1O9G A; 2ARH A; 4B7E A; 4DRX B; 3P30 A; 4GZR B; 1QLE C; 4JI0 B; 1YSC A; 2Z0A A; 2UXD O; 3LDE A; 3SGI A; 4NR1 A; 4FLT A; 1W59 A; 3THO A; 2EIL B; 4DXW A; 3TET A; 3RYF B; 1BSM A; 1L8D A; 2E76 B; 2HR3 A; 1ZTE A; 1RM1 C; 5IJ0 B; 3K5N A; 3SPC A; 3MHH C; 2KG7 A; 2E5L B; 1DGS A; 3ZCC A; 3VQW A; 3ZRX A; 1URF A; 2GSM B; 2YIC A; 3I56 V; 5BZB A; 1H38 A; 1DF4 A; 1ROP A; 2XAH A; 3OMN B; 1N0J A; 3MD0 A; 4X1K B; 3OW2 U; 2R70 A; 2Q67 A; 2UXX A; 3B8M A; 4K3A A; 1MSW D; 2VRZ A; 1AR5 A; 4WFA V; 4K8Z A; 2X6B A; 3CWB H; 4FVM A; 2OYQ A; 4LF5 B; 1AVM A; 3ABU A; 3WB0 A; 3E2E A; 3L73 H; 1QR8 A; 4EB6 A; 4J11 A; 4IIJ B; 1NJI W; 1SA0 B; 2ZE5 A; 4NXN O; 2IW5 A; 2HFE C; 2XUM A; 3ZIA G; 1DK1 A; 4RQE A; 5JH7 A; 3K57 A; 2R9A A; 3ASN B; 1XMQ B; 4LNU A; 4EEQ A; 4IGG A; 4MVR A; 4R8C A; 3SJQ C; 2WLK A; 1M56 C; 3K3W A; 2CH7 A; 3CS5 A; 5EIB D; 4EFE A; 4W4K A; 3K08 A; 2IJH A; 1VQO V; 2BTO A; 1Q6H A; 5CA0 B; 1JJO A; 3ABL C; 2ATK C; 2X6A A; 3OTO B; 5KMG A; 4MVO A; 1RFY A; 2AZ0 A; 3H9V A; 4RUF A; 4JV5 O; 5EBW C; 2V4D A; 4DR7 B; 2MW2 B; 4EKW A; 3G67 A; 2GUZ A; 1FAF A; 2IU0 A; 4P9O A; 1I94 O; 4DV0 O; 2WPD G; 3E8B A; 1Q3E A; 3N2K A; 4LR3 A; 3AG1 B; 1IBL B; 5C8Y A; 3HKD A; 2IJI A; 4MSW C; 1W0J G; 2OCH A; 4PHZ A; 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2JRI A; 1R3L C; 5GTI Z; 3OD4 A; 4X64 O; 4RUE A; 1GH6 A; 3RYI A; 5KA6 A; 1HNZ B; 1GN3 A; 1AB3 A; 4U3J A; 4K0K B; 2HHH B; 3UM7 A; 1VF7 A; 2WSS G; 1ZSP A; 1HNX B; 1SQG A; 1Q8I A; 2BOC C; 4DYL A; 2ZM6 B; 3L71 H; 2YS8 A; 1IX9 A; 4MTO A; 4R7C A; 3CCS V; 1G6U A; 5LHH A; 2KG7 B; 4J41 A; 3JD4 A; 2GTS A; 3ABM B; 4X9Q A; 3AG1 C; 1NKD A; 3MAQ A; 1H2N A; 4RAI A; 1WNS A; 2PI5 A; 5KUK A; 2ZKO A; 2ZDI C; 5EYP A; 1QVF U; 1NR7 A; 2W6I G; 3T1Y O; 2JEU A; 4X88 A; 1TGO A; 4J9Z B; 1NR1 A; 1H2G A; 5L3B A; 4NXM B; 2KKW A; 3CE2 A; 3AG4 C; 1FXK C; 2JS3 A; 5H6Q A; 4WFB V; 5IYC O; 5B1O A; 1JA8 A; 4LH7 A; 4YIP A; 3F5W C; 5JJJ B; 3NR7 A; 1FKA O; 2A06 H; 4EB6 B; 1BE3 H; 3O65 A; 3I5D A; 1XMQ O; 1MZF A; 4DUZ O; 5KHJ A; 1THZ A; 3ZHQ A; 2YC0 A; 5JH7 B; 4DR6 B; 1YCI A; 4LNU B; 1NI8 A; 1NT2 B; 4U3F H; 2WLJ A; 3SPG A; 4QNH B; 1R1B A; 1XOU A; 2YXH A; 4JI8 B; 3OTO O; 3OGI B; 4JYA B; 2CH7 B; 2X6C A; 2OCC C; 1FXH A; 4O4L A; 1GN4 A; 2B1G A; 3W7X A; 4MTG A; 1QLN A; 4LF6 O; 4DR7 O; 3E8H A; 1G4Y B; 3RGB A; 5KMG B; 5DM6 V; 1ZUQ A; 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