The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
43
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sequence length |
103
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structure length |
103
|
Chain Sequence |
SALHWRAAGAATVLLVIVLLAGSYLAVLAERGAPGAQLITYPRALWWSVSTATTVGYGDLYPVTLWGRCVAVVVMVAGITSFGLVTAALATWFVGREQERRGH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of KcsA mutant
rcsb |
| molecule keywords |
FAB-A
|
| molecule tags |
Membrane protein
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| source organism |
Streptomyces lividans
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| total genus |
43
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| structure length |
103
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| sequence length |
103
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF07885 | Ion_trans_2 | Ion channel |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3SYQ A; 5E1A C; 2EIM C; 2QKS A; 4MVR A; 2A0L A; 5EK0 A; 2EIJ C; 3STZ C; 1ORQ C; 3F7V C; 5EC2 C; 5CBH A; 2ITD C; 2HJF C; 1R3K C; 3AG4 C; 5KUM A; 4PA3 A; 1R3I C; 3FB7 C; 4WFH A; 3AG2 C; 2Q69 A; 4MSW C; 4PDR A; 2WLJ A; 4TWK A; 1R3J C; 4PA4 A; 3UKM A; 3E8F A; 3SYC A; 5CBG A; 1OCR C; 2EIN C; 2HVK C; 4PA9 A; 3AG3 C; 2A79 B; 4R50 A; 1G4Y B; 1XL6 A; 4MVU A; 3RBZ A; 3T4Z A; 5BZB A; 4HYO A; 3OUS A; 4BW5 A; 2WLH A; 3OUF A; 4RO2 A; 2HFE C; 2YEV A; 5EBW C; 3SPH A; 4QNH B; 3X2Q C; 3T1C A; 5IY5 C; 4LCU C; 4PDL A; 4J9Z B; 2Y69 C; 3E83 A; 4MVS A; 2IH1 C; 4RUF A; 2R9R B; 2WLK A; 3RVZ A; 3RW0 A; 3SPG A; 4KFM A; 2AHZ A; 3E8G A; 4PDM A; 1R3L C; 4XDL A; 2WLN A; 3LDE A; 3RVY A; 1V55 C; 3K04 A; 4J9Y B; 3IGA C; 3E8H A; 3SYO A; 3OR6 C; 2X6B A; 2DYR C; 2AHY A; 4G27 B; 3ZJZ A; 2DYS C; 4P9O A; 3LNM B; 5B3S C; 2DWD C; 2W0F C; 4XDJ A; 4P9P A; 4X8A A; 4MW8 A; 3BEH A; 3ABM C; 3SYP A; 4P30 A; 4I9W A; 2ATK C; 4EKW A; 1QLE C; 2QTO A; 5EC1 C; 3OR7 C; 3TET A; 5J9P C; 1OCC C; 3F7Y C; 1BL8 A; 4PA6 A; 2ZD9 A; 3AG1 C; 3ASN C; 4MVZ A; 4OXS A; 4MTF A; 4MW3 A; 3SYA A; 5EBL C; 4QE9 A; 3WG7 C; 2ITC C; 3LDD A; 3ASO C; 2NLJ C; 1OCZ C; 2IH3 C; 3FB8 C; 3HPL C; 4JTC B; 4UUJ C; 3E86 A; 4MTO A; 1OCO C; 4QE7 A; 4CBC A; 4F4L A; 3T4D A; 4PDV A; 1KKD A; 4JTA B; 4H37 A; 3E8B A; 3TCU A; 1M56 C; 1P7B A; 2WLI B; 3EFF K; 3K0G A; 4GX0 A; 1JVM A; 3K0D A; 3STL C; 3JYC A; 4DXW A; 3FB5 C; 2WLM A; 3KG2 A; 3VOU A; 3ABK C; 4R7C A; 4RAI A; 4LP8 A; 2Q6A A; 3T2M A; 3UM7 A; 1XL4 A; 2BOB C; 3IFX A; 4H33 A; 2KB1 A; 3R65 A; 4MVM A; 2ZXW C; 4LBE C; 2Q67 A; 2H8P C; 4GX1 A; 3ABL C; 4XDK A; 3SPI A; 3LUT B; 4WFF A; 4HZ3 A; 4ZBM A; 1S5H C; 2WLI A; 4R8C A; 4X89 A; 1M57 C; 2HG5 C; 4X88 A; 1LNQ A; 2K1E A; 3K06 A; 5B1A C; 2WLL B; 3SJQ C; 4MVQ A; 2BOC C; 3FB6 C; 3SPJ A; 5EBM C; 4G28 B; 2JK5 C; 5CBF A; 1V54 C; 2HVJ C; 2X6C A; 3E89 A; 1K4C C; 3GB7 C; 2EIL C; 3LDC A; 2P7T C; 4WFE A; 2EIK C; 3PJS K; 4GX2 A; 3ZRS A; 2Q68 A; 4R6Z A; 1ZWI C; 2OCC C; 3K03 A; 4GX5 A; 4JTD B; 2X6A A; 4P2Z A; 4WFG A; 1K4D C; 4MS2 A; 4MTG A; 3SPC A; 2A9H A; 1J95 A; 4RUE A; 5B1B C; 2WLL A; 4PA7 A; 3F5W C; 3OGC C; 5KUK A; 2DWE C; 4MVO A; 3K08 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OTF A; 5GTI Z; 3FFQ A; 1F23 A; 5LGU A; 4JPR A; 1YDX A; 3OFN G; 2ITD C; 2JEU A; 3ZED A; 4DUZ O; 5IYC O; 1AI5 A; 4LNU A; 3LSU A; 1QR8 A; 4AIL C; 1VQL V; 5KHH A; 3JAL A; 3AG3 C; 1Z5W A; 2RCV A; 4QGP A; 4LF9 B; 2P4K A; 5EBW C; 4BW9 A; 4X20 A; 4JI3 B; 2Q4P A; 1Y66 A; 5D5P A; 5JVD B; 3CC2 V; 5KX5 B; 5B1N A; 4YJ2 B; 1SS3 A; 4OGQ B; 2ZCE A; 1NVP D; 2GUZ B; 1I08 A; 2RDC A; 4OPA A; 1KUQ A; 3OR7 C; 1HNZ O; 1YJ9 V; 5CB4 B; 1PPJ H; 2ZD9 A; 3JAT B; 3D36 A; 1IDS A; 3ASO C; 3ZS8 C; 4MTO A; 3E22 A; 1Q82 W; 5BMV B; 1X59 A; 4JTA B; 4ZI7 A; 2QKA A; 1WB7 A; 4QPK A; 3ZRW A; 1YHQ V; 1FXK C; 5LHI A; 2DMX A; 2LGW A; 3JAM N; 4YJ3 A; 4LP8 A; 5J2T A; 4O4I A; 1M90 W; 3K59 A; 1NS1 A; 1BZK A; 3K58 A; 1M57 C; 4EFE A; 2YI9 A; 3GWK C; 2XAG A; 4AQY O; 4O4L A; 3FB6 C; 1F51 A; 4J10 A; 4UCR A; 3E35 A; 4FM1 A; 1OCR B; 3BCC H; 2Q68 A; 3K03 A; 3CCJ V; 4U7N A; 1D5N A; 2EJR A; 3CX5 F; 2A9H A; 5FNV B; 3DXR A; 3GVM A; 3GWO A; 2ZM6 B; 2Q7E A; 3ZIA G; 4I50 B; 2AZ0 A; 4DR5 B; 1U96 A; 4PA3 A; 1GH6 A; 2VS0 A; 4WFH A; 4DR7 B; 4J7Z A; 4F6R B; 2DYS B; 1GRJ A; 1L0L H; 1BHA A; 3FAV A; 1K7D A; 4RWU A; 4FVM A; 5B66 Z; 5CBG A; 5GON B; 4H13 B; 3CE2 A; 1Z2G A; 3K9A A; 4RO2 A; 3N2K B; 5KMG A; 1MSD A; 2EX3 A; 4WBN A; 4X66 O; 4DYL A; 1TA8 A; 1YCI A; 2Z0A A; 4I55 A; 5F2V O; 2UU9 B; 4JI5 B; 4AHC A; 4X65 O; 2QWQ B; 1XI1 A; 1KEC A; 4JI2 B; 1FXH A; 3BAA A; 1AI4 A; 2F23 A; 4P30 A; 5CA0 B; 4EKW A; 1XMQ B; 2Y48 A; 4Q20 A; 2W6J G; 3OMI B; 3K5M A; 4O2A A; 1OCZ C; 1PM9 A; 2QDO A; 4IHJ B; 4O2B A; 1I5Y A; 3CRC A; 2EBO A; 4LWS A; 4QE7 A; 1HNX B; 3QO5 A; 4JV5 O; 1KKD A; 3ZMU A; 2ZKO A; 1S5J A; 3H01 A; 3QF7 A; 3HKB A; 3JYC A; 5B1B B; 3ML0 A; 4DW1 A; 1HR0 O; 2FB5 A; 5LP6 A; 2ODM A; 3HKE A; 2KB1 A; 4XDK A; 2LW1 A; 2VQF B; 4FJC C; 4LFA O; 4B08 A; 4HZ3 A; 1FYJ A; 2BTQ A; 4D6T H; 4W4L A; 3CSX A; 4KHP O; 3ABU A; 5JCO C; 2LJ2 A; 2CTR A; 3E89 A; 1TVK A; 4LR3 A; 2EZP A; 4GT1 A; 1E1R G; 3K5N A; 4XBF A; 5H6Q A; 3FX7 A; 2YI8 A; 5JH7 A; 4CC6 A; 2UXB B; 4O4H B; 3DSQ A; 3AK3 A; 3W7X A; 2L35 A; 1NR7 A; 3HR0 A; 3S3W A; 4EEQ A; 3AG2 C; 1ZSP A; 3U11 A; 5IYZ A; 2YXL A; 1K3E A; 2BCC H; 5FPR A; 3RYH A; 5LA6 B; 1R73 A; 1YTF B; 3HKC A; 1F7Y A; 4QNH B; 5C93 A; 1W59 A; 1N0J A; 4TSF G; 3E83 A; 1AR5 A; 3SPG A; 4DV1 O; 1KB9 F; 4B3M O; 1P7G A; 4QJF B; 1JCH A; 4FMT A; 4I7Z B; 1MMM A; 3G71 V; 1YEW A; 1IXB A; 3E8H A; 4X1K A; 5BR8 B; 4TUY B; 3L71 H; 2LP7 A; 4CS2 A; 2YIA A; 1GM7 A; 1SZX A; 3B4S A; 2Q7G A; 1VQK V; 1N36 B; 1Y76 A; 1WJZ A; 3F5T A; 4QE9 A; 3WG7 C; 3CRR A; 3ZN0 A; 4CBC A; 3ZRX A; 2OCC B; 3JAK B; 2JGD A; 3QO8 A; 3L9D A; 1WPX A; 1JMK C; 4JZ2 A; 3D36 C; 1Y6X A; 4UCU A; 1DF5 A; 3JD1 A; 1PL4 A; 3G80 A; 4UVA A; 1PKX A; 2H8P C; 3APO A; 5EIB C; 3SPI A; 5IJ0 B; 1O9G A; 5IJ9 B; 1THZ A; 1MG1 A; 2B5U A; 1V54 C; 3T1Y O; 4WFE A; 5KA5 A; 4BR6 A; 1NJI W; 4JTD B; 4I50 A; 4LFC B; 2R70 A; 3CXH F; 2AZ2 A; 2ARH A; 2HHH O; 1J95 A; 3SJC C; 2ZNJ A; 2EIM C; 4JAU A; 3RYF B; 4Z1M G; 3CRQ A; 5DN6 G; 4I0X A; 3RWR D; 4K0K B; 4D7T A; 4J7J A; 1SQG A; 4MSW C; 5LGN A; 2ZIO A; 2ZDI A; 2HR3 A; 1RM1 B; 4L8J A; 1J5E O; 2A79 B; 1XBL A; 4X62 O; 3OUS A; 4BW5 A; 1M93 A; 1M9N A; 3A0B Z; 2HFE C; 2UXD B; 4J80 A; 1E79 G; 2Y69 C; 4MVS A; 2A7W A; 3U0Z A; 5EYP A; 4LFB B; 2UXX A; 5KHI A; 3LDE A; 3FKS G; 1IBK B; 1V55 C; 1K73 W; 1MSW D; 3SYO A; 1VQ4 V; 4JI7 B; 4G27 B; 3IJ4 A; 1Y74 B; 4LH6 A; 3O9O A; 1DF4 A; 4X8A A; 1YVW A; 4UFZ A; 4ASU G; 4B3R B; 1QHT A; 3CB2 A; 2YXH A; 2ZE5 A; 2E5L B; 1OCC C; 3F7Y C; 1BL8 A; 4J11 A; 2ILM A; 4MW3 A; 1XNR O; 4DR2 O; 3I5D A; 1L1F A; 4H37 A; 2HJD A; 5BY1 A; 4JAV A; 2N74 A; 4DV2 B; 1Z5V A; 4F6E A; 1G1X B; 4JI0 O; 1KQS U; 3G4S V; 2V7Q G; 1NTK H; 3UT5 B; 4GCZ A; 1SC5 B; 3WB2 A; 1XMO O; 4LF4 O; 1CP9 A; 5B1O A; 4PEL A; 3BHP A; 1GAX A; 3ZN1 A; 5JQG A; 3RN4 A; 5L3B A; 4G28 B; 4JYB A; 3CJH B; 4DV5 B; 5LP6 C; 4JI1 B; 1OZ0 A; 4B7E A; 4I9Q A; 1S77 D; 1JFF A; 1AP6 A; 4R6Z A; 3OW2 U; 5H5N A; 2WA3 A; 1H8E G; 2IJK A; 2UUA O; 1XNQ O; 2DWE C; 1NKD A; 3K08 A; 3JSN A; 2ZIN A; 5DM6 V; 1W0J G; 4IL6 Z; 4LF7 B; 2OCH A; 2LO1 A; 2CTP A; 3PN1 A; 5CBH A; 2K9P A; 4MTX A; 2OIG A; 2N05 A; 1ZL8 B; 4UB6 Z; 1Q86 W; 4EB6 B; 3D8C A; 4PDR A; 3CC4 V; 5AG2 A; 3MHS C; 1GN6 A; 1SER A; 1X4T A; 1WA8 B; 1AR4 A; 1G4Y B; 2CH7 A; 4MVU A; 1FJG O; 3B40 A; 2ADP A; 3SPH A; 4GLX A; 1AJP A; 1TUB B; 3MHH C; 4J9Z B; 3VQX A; 3RW0 A; 1I5X A; 5LHG A; 2DQ0 A; 1SRY A; 4DR6 O; 2OTJ V; 2P06 A; 3JAR A; 3RVY A; 2IJH A; 2D2C B; 4I4T B; 3BPZ A; 4DV7 B; 1JQ0 A; 1XIL A; 1KYO F; 2ATK C; 3SGI A; 5C8Y A; 3SR2 C; 2JS3 A; 1E1Q G; 3OEE G; 4A5U B; 4DUZ B; 5KLV H; 4FLW A; 3SYA A; 1VQP V; 5IYD O; 1I94 B; 1JX9 A; 2LGQ A; 3CCL V; 4OX9 O; 3T4D A; 3HKD A; 1GM9 A; 2F95 B; 2XAH A; 3ZMZ A; 3H9V A; 5CMU A; 3AEI A; 3STL C; 3TXS A; 4ZIB A; 2JRI A; 1QR9 A; 4N21 A; 2WA4 A; 1GO3 F; 4JI4 B; 3JAW B; 2JVD A; 1ZUQ A; 2ZXW C; 3C3S A; 4DR1 O; 1VQ9 V; 1WLE A; 3K5L A; 4KL1 A; 3UO3 A; 3SPJ A; 2YUA A; 1YJW V; 1SQF A; 2QWP B; 5LL6 Y; 2KQX A; 4FLZ A; 3OAA G; 4B7K A; 2VWK A; 1IBL B; 1ZTE A; 5IY5 B; 1G6U A; 2F4V O; 2ZE7 A; 3AG4 C; 5KUM A; 1KD1 W; 3FB7 C; 4JGS A; 2ZIM A; 3JAS A; 1TAE A; 2QTS A; 4QPJ A; 1NQT A; 1QNM A; 1BSM A; 4JI8 O; 1SQX H; 1XL6 A; 3JD3 A; 3T4Z A; 4AQY B; 3A0H Z; 2YEV A; 2GBO A; 2IH1 C; 2B1G A; 1N0N A; 1FD9 A; 1WNS A; 2CE4 A; 4DR4 O; 3ABK B; 5CA1 B; 1YIT V; 1S72 V; 4ZOL A; 5LYJ A; 5B3S C; 2DWD C; 5LOV A; 3ABL B; 4FK5 C; 4X1I B; 3R66 A; 4DUY O; 4UCS A; 4YY3 B; 4DRX A; 3ZHS A; 2QM4 A; 3CCM V; 1VF5 B; 4HBN A; 2NN4 A; 3KZI Z; 3OM3 B; 4NVP A; 1XL4 A; 1TUE B; 1QQC A; 1S0V A; 4ZHQ A; 1H8H G; 4BWA A; 2B9Z A; 3GB7 C; 2EIL C; 3W7U A; 3J80 N; 1TGO A; 1GM8 A; 1ZWI C; 3ZRV A; 3NXS A; 4MS2 A; 1PV0 A; 5JWP A; 1Q8I A; 3CWB H; 4GX0 A; 3CCE V; 4YIO A; 3AG7 A; 2P90 A; 2UUB O; 3IC7 A; 1AB3 A; 2DN9 A; 1KP3 A; 1HNW B; 4RQF A; 3UCS C; 4UCO A; 1FS0 G; 4X64 O; 4FPP A; 1DK1 A; 3OTO O; 2XT9 A; 1H2L A; 2EIN C; 2HVK C; 4PA9 A; 4LFA B; 3K57 A; 4NXM B; 4DV6 O; 3BRC A; 2BSK A; 1OV9 A; 4ZKI A; 2YXY A; 4IIJ B; 2ZT9 B; 4K3A A; 3X2Q C; 1K9M W; 4WFA V; 5KHJ A; 5B5E Z; 4JYA B; 2KG7 A; 4FFK A; 2IU3 A; 4PDM A; 5IDJ A; 1FFT B; 4J9Y B; 1BGY H; 3RYC B; 4P9P A; 3ABM C; 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1CEZ A; 4YJ2 A; 2Q0O C; 3SDL A; 1YZB A; 1DGS A; 2GUZ A; 3W7T A; 3TCU A; 4CS3 A; 1M56 C; 2WLI B; 1L8D A; 1RSO B; 4D7S A; 5CB4 A; 5KA6 A; 2UU9 O; 3JAT A; 1MZF A; 4RAI A; 2Q6A A; 3X2Q B; 3P3P A; 2F93 B; 4JI2 O; 5BMV A; 4K8Z A; 5DEC A; 4NR1 A; 1KC8 W; 2DJV A; 4UVB A; 4NTY A; 3CYO A; 3OMA B; 3Q4H B; 4BAY A; 2QM7 A; 1XMQ O; 4DV0 B; 1VMG A; 2ETN A; 3O65 A; 1K92 A; 2JK5 C; 3LSQ A; 1AJQ A; 1R6K A; 2DQ3 A; 1JR9 A; 2CTQ A; 1PNL A; 1HNX O; 1SQB H; 1VF7 A; 3JCU Z; 4LF5 B; 4HNA B; 1AJN A; 3OGC C; 4E2L A; 4CZZ A; 3M99 B; 1HWY A; 4GUN A; 2QWN B; 4TV8 B; 2Y0P A; 4MVR A; 5EK0 A; 5KAF Z; 2VQF O; 3MDS A; 5FNV A; 1FFX B; 2CAZ C; 4TQF A; 4PI2 A; 4UVC A; 2XAJ A; 2OIE A; 4DO2 A; 2VQE B; 2EJ7 A; 2E74 B; 5LXT B; 3IAY A; 1OCZ B; 4F6R A; 1YF2 A; 3T1C A; 3B2E E; 3ETQ A; 2UXB O; 5BXZ A; 2QGN A; 5GON A; 2X7R B; 4IGG A; 4UB8 Z; 2E3C A; 1EZJ A; 4DV4 B; 4PV1 B; 3OR6 C; 3N2K A; 4P9O A; 1NR1 A; 4NTX A; 1BE3 H; 1WP8 A; 4TV9 B; 4I9W A; 1SA0 B; 4KP4 A; 5EC1 C; 2FML A; 1F4N A; 2AW9 A; 3AG1 C; 3ASN C; 3CEI A; 1N32 B; 2NLJ C; 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