The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
|
| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Bos taurus
|
| total genus |
30
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QSA A; 3APQ A; 1IUR A; 1GH6 A; 2M6Y A; 1N4C A; 2QWN B; 3UCS C; 2CUG A; 2Y4U A; 2CTP A; 1HDJ A; 3UO2 A; 2Y4T A; 2L6L A; 2LGW A; 2LO1 A; 2EJ7 A; 2DMX A; 2QWO B; 3AG7 A; 4IT5 A; 4RWU A; 1BQZ A; 2N04 A; 2GUZ A; 2YUA A; 2YS8 A; 1XBL A; 2DN9 A; 2QWQ B; 2CTQ A; 2CTW A; 2N05 A; 2QWR B; 2PF4 E; 2KQX A; 3APO A; 3BVO A; 4J7Z A; 2CTR A; 3UO3 A; 2QWP B; 4J80 A; 1FAF A; 1NZ6 A; 2GUZ B; 1BQ0 A; 2OCH A; 1FPO A; 1WJZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2Q4P A; 4DR4 O; 1JJO A; 3SYQ A; 1K8A W; 1VP7 A; 1BGY H; 2MK3 A; 4X64 O; 3C3T A; 2D2C B; 3CJH B; 1QLE B; 5H6Q A; 1S3J A; 4LF7 O; 5CMU A; 3DXR B; 3EXA A; 2WLI A; 2W0X A; 4DV3 O; 1TVK A; 3RYI B; 4B7K A; 1T5E A; 5EIB C; 5CA1 B; 3AG2 B; 1EM1 A; 2EIJ C; 3CXC U; 5B1A B; 5LYJ B; 1Q90 D; 2RMK B; 4RQE A; 1Q82 W; 3CMA V; 1ZTE A; 2VQF B; 2C2A A; 2QEX V; 3A2F A; 2DN9 A; 3JSN A; 1VQL V; 1SET A; 2Y69 C; 4O2B A; 1E1Q G; 1I94 B; 1B3Q A; 2CAZ C; 3CJH A; 4KL1 A; 3KCY A; 3ZHQ A; 1TUB A; 4DW1 A; 4JAU A; 1M56 B; 2NR5 A; 4MSW C; 1HNX O; 1AP6 A; 1LNQ A; 3B40 A; 1M5I A; 3FB7 C; 2MW2 B; 5LOV A; 4R50 A; 2P5O A; 4GKK B; 3SJA C; 2JGU A; 4IYH A; 4NTX A; 3Q4H B; 5LYJ A; 3JD1 A; 3CX5 F; 3AG2 C; 1J5E B; 5EBL C; 5LMU O; 1BE3 H; 2F66 C; 4YXW G; 1WA8 B; 4DRX A; 5L3G A; 4I50 B; 3WB2 A; 1GN3 A; 4JTD B; 2EIM B; 2R9R B; 2DYR B; 5CN0 A; 3QO5 A; 1F4N A; 3JD0 A; 3BAA A; 1XNQ O; 3T1C A; 1B6Q A; 1XMO B; 4F4L A; 2A7W A; 3ZN0 A; 1PL0 A; 3OE7 G; 1RM1 B; 1XI1 A; 2GUZ A; 4JGS A; 2LGQ A; 1VQ8 V; 3CME V; 3SPJ A; 5EYP A; 1G8M A; 1WA8 A; 3LSQ A; 3L70 H; 3BEH A; 2OTL V; 5H5N A; 3F7Y C; 4GT1 A; 4YJ2 B; 4QJF B; 4JAA A; 5KA5 A; 4UFZ A; 4DV4 B; 3E8B A; 2UXD B; 2L6L A; 2Y0P A; 3AG1 B; 2XND G; 1VQK V; 2E76 B; 2ETN A; 2E5L B; 2AXT Z; 1OZ0 A; 1YZB A; 1XL4 A; 1XHZ A; 3HKB B; 5B66 Z; 2UXC O; 2YXY A; 2YIB D; 4ZHQ B; 1HNZ B; 1N0N A; 4OGQ B; 1XL6 A; 1VQM V; 1FAF A; 1R73 A; 5LA6 A; 4TT3 G; 5KHK A; 1THZ A; 1OCC C; 1GK9 A; 1QLN A; 1ENV A; 3OEE G; 3RT3 C; 4JYC A; 5L3D A; 1RM1 C; 1Y74 B; 3BA8 A; 3ZRV A; 5A9G A; 3ETD A; 1N33 B; 4DV1 O; 3AG3 B; 3OD4 A; 2RQ6 A; 1VQN V; 4Q6G A; 1GM7 A; 2HP8 A; 3K03 A; 4FJC C; 2QWR B; 5KHH A; 2DWD C; 2UUB O; 1KP2 A; 2HR3 A; 5HFL A; 4CC6 A; 3HKB A; 2X7R B; 4H13 B; 4I0X B; 4I7Z B; 4CS4 A; 3RBZ A; 5L3B A; 3NR7 A; 2P4K A; 2JDI G; 2B5U A; 2QTS A; 3AG4 C; 4WFF A; 2DJV A; 3HB3 B; 2UXN A; 1KMI Z; 4MTX A; 2Q0O C; 1R3J C; 3QO7 A; 3T4Z A; 1NT2 B; 5DED A; 4LNU A; 3QO8 A; 4MVZ A; 3RYH A; 5LHG A; 4XDJ A; 4DR6 B; 2NNU A; 2Y4U A; 4DK0 A; 2AZ0 A; 2UXX A; 4X8A A; 4LH6 A; 1RP3 B; 2LGW A; 2LO1 A; 4UVA A; 2BOB C; 4U3F H; 1V55 B; 1H2L A; 4DK1 A; 1U96 A; 1K73 W; 1YHQ V; 4JI3 O; 2H8P C; 3NXS A; 4BIZ A; 4LCU C; 1IBM B; 4J7K A; 2JRI A; 4JI1 B; 1SQB H; 5E1A C; 3E22 B; 2EUL A; 5IYZ A; 4LF8 B; 2Z5U A; 2GBO A; 3ABK C; 1IBM O; 1FFT B; 2AHZ A; 4BAY A; 4LF4 B; 2ZE6 A; 1WP7 A; 4LFC B; 3G80 A; 2Q9L A; 2Q7G A; 1US6 A; 4LF9 O; 4DR5 O; 1P49 A; 1S5J A; 3RFR A; 5AG2 A; 1H2K A; 4LF4 O; 3MHS C; 3E8G A; 1SC5 B; 3JD2 A; 1UFI A; 3OTO O; 3EVK A; 5KHG A; 3WU2 Z; 2WLN A; 3W7U A; 1V55 C; 2EIK B; 4UCV A; 3E2E A; 3ZHS A; 4IL6 Z; 4K0K B; 3LDC A; 2JIZ G; 3I5D A; 2ZM6 B; 1HW7 A; 1FXV A; 1FXK A; 1M57 B; 2XAS A; 1QR8 A; 4UCO A; 4FLT A; 4AQY O; 2UUC B; 3OFN G; 3J80 N; 2QWN B; 5CA0 A; 1KKC A; 1V54 C; 3QTC A; 4K0K O; 1FXK C; 2CH7 A; 3DSQ A; 3GVM A; 2Y48 A; 3O9O A; 2N04 A; 4UVC A; 5GON B; 5EZY A; 1JPX A; 1N34 B; 4WF9 V; 1VQ7 V; 1FKA O; 2BTQ B; 3APO A; 3ABL C; 5BMV B; 4LF6 O; 4PA4 A; 1PPJ H; 1JMK C; 3IAY A; 4X1K B; 3TXS A; 4DW0 A; 1N34 O; 5BR8 B; 1IBK B; 3EHB B; 1XMQ O; 1Y67 A; 2A3Q A; 5KUK A; 1VQ6 V; 4LR3 A; 2GHY A; 2Q8V A; 2EZO A; 1PV0 A; 1W0J G; 4QE7 A; 5LP6 A; 1AJQ A; 4BW9 A; 3ETG A; 2UXB O; 4JZG A; 2WLL B; 4UVB A; 5BY1 A; 2KQX A; 4EKW A; 4B3R B; 5JWP A; 5LP6 C; 3CB2 A; 2PI4 A; 2IW5 A; 4CH5 A; 4WBN B; 2JEX A; 1BS3 A; 4PDL A; 4WFG A; 1NR1 A; 1Y4M A; 2JS5 A; 3U10 A; 5BMV A; 4O4I B; 2RJZ A; 2ZNI A; 3N2K B; 4OPH A; 3VQW A; 2JEU A; 4YIP A; 3KCX A; 1YCI A; 4N21 A; 2RDC A; 1AIL A; 2P22 C; 3GWO A; 2P06 A; 2X6A A; 5J2U B; 4PEL A; 5F2V O; 3CRQ A; 2WLL A; 1KBH A; 3CS5 A; 2QKA A; 5B1N A; 4J9Z B; 2P7T C; 4O4H A; 3FYE B; 4Z2W A; 3BY6 A; 3D36 A; 4FPP A; 1Q8I A; 2ADQ B; 1EZJ A; 4KUM A; 3N2K A; 5KAF Z; 1K3E A; 3L72 H; 2AGA A; 5KX5 B; 4YJ3 B; 4DUY O; 1I08 A; 1S72 V; 2VWK A; 2ZIO A; 3W7T A; 4JI6 O; 2XAQ A; 3ZHU A; 4U7N A; 5LBQ A; 3I55 V; 3CYO A; 3K59 A; 4PI0 A; 1HNW B; 4O2A A; 2HKO A; 5B5E Z; 1D5N A; 3JAW B; 4X89 A; 4H37 A; 3FX7 A; 1DF5 A; 1OJH A; 3JAT A; 5B3S C; 2GTS A; 3STZ C; 4TQD A; 4MVM A; 1MNG A; 1WAZ A; 1X4T A; 1VQ5 V; 3CSX A; 1K7D A; 1M1K W; 4YJ3 A; 5C93 A; 2ZIN A; 3BVO A; 1XNR B; 3F5T A; 1IXB A; 3RYC A; 3FAV B; 1EN6 A; 2LFS A; 3SJC C; 4MT8 A; 4DR3 B; 1GMG A; 1G6U A; 4MW3 A; 4MTG A; 4ZI7 A; 4J41 A; 4UB6 Z; 1K5S A; 3KZI Z; 2BOC C; 2ZXW C; 1KQS U; 1KYO F; 4B3T B; 2DYS B; 2QWQ B; 2OIE A; 4JAS A; 4LF5 B; 1SZX A; 5L3F A; 5LXT B; 2PI5 A; 2YIB A; 1B04 A; 4J80 A; 4TV9 B; 4X65 B; 4B3M O; 4JI7 O; 3E8H A; 3OMI B; 2M7W A; 1GH6 A; 1S5L Z; 2OCC C; 2P6J A; 2QM7 A; 1SRY A; 2P90 A; 4QIW F; 3CWB H; 3F7V C; 1K34 A; 3ASN C; 2ZR3 A; 2IBZ H; 3UQ8 A; 2F23 A; 4DV6 O; 4IIJ A; 4DV2 B; 3OGI B; 3M7M X; 4ZOL A; 3P30 A; 1WB8 A; 5KA6 A; 3JAR B; 3K5L A; 1Q81 W; 1I5X A; 3A0H Z; 3HKE B; 4PDM A; 5GTI Z; 4RAI A; 3M8A A; 1BL8 A; 4DV0 B; 2VRZ A; 3IGA C; 5JH7 B; 3AK3 A; 2JVD A; 1WN7 A; 2Q68 A; 1CPY A; 1XQ8 A; 3J81 N; 1NVP B; 1R6T A; 5IDJ A; 4GX1 A; 3ZHT A; 1QU7 A; 4TV9 A; 5KHI A; 1W2B U; 1CXZ B; 2DWE C; 4DR7 B; 3ABM B; 2NN4 A; 4FLU A; 3SPI A; 1F4M A; 3QVN A; 4CC5 A; 3AG7 A; 1WP8 A; 5J2T B; 1YTF B; 3P3N A; 4MS2 A; 4GKJ B; 3TCU A; 4I5S A; 4UCS A; 4FFK A; 4OPA A; 1VEW A; 4X1I A; 2IH1 C; 1DLB A; 1CP9 A; 2IU3 A; 2YID A; 2KSD A; 3C3S A; 4GCZ A; 1XDC A; 3H1L H; 4GX0 A; 4RUE A; 1QQC A; 4X20 B; 1OCR B; 4AI8 A; 2A0L A; 3ZN1 A; 4FM1 A; 4JAV A; 2VS0 A; 3RYF A; 3QG5 A; 2CDY A; 2F93 B; 3DTU B; 4LF7 B; 4DUZ O; 4IYI A; 1NU1 H; 5IYD O; 4NXM O; 2PGG A; 1K4D C; 1SA0 A; 1WLE A; 4DV3 B; 2Q6A A; 1W59 A; 2YXL A; 1TA8 A; 2PF4 E; 1Q86 W; 2F95 B; 3MHH C; 2N74 A; 3IJ4 A; 4UV9 A; 5ITZ A; 1L0L H; 4QNH B; 4J7J A; 1R6N A; 3WB0 A; 2BSK A; 3W7X A; 2JJ1 G; 3P32 A; 1P7B A; 3ASO C; 2FTK A; 5B1O A; 1FJG O; 5CBG A; 2JGD B; 1OCR C; 2QJ1 A; 4DO2 A; 4OX9 O; 4MW8 A; 1HNX B; 4I9Q A; 3BCC H; 4NXN B; 2PUS A; 3K5N A; 2Z3Y A; 4H44 B; 3SDL A; 4X1Y B; 4UV8 A; 4JTC B; 3E86 A; 4I9W A; 4HNA B; 4W4K A; 3DXR A; 4CS2 A; 4QPJ A; 3SPC A; 2X6C A; 4NXN O; 1QLE C; 3H1I H; 2CE4 A; 3WB1 A; 3RYI A; 1P7G A; 1NS1 A; 5CA1 A; 5LMU B; 2K1E A; 2YIC A; 4EFE A; 2WPD G; 2V4D A; 3HKC B; 4ZKI A; 2QKS A; 2A06 H; 4BWA A; 3D3Q A; 1MG1 A; 5B1A C; 2CUG A; 5FPO A; 2YSU B; 3TK1 A; 1Q7Y W; 4J9Y B; 3VQX A; 1P84 F; 3G6B A; 3ZHR A; 4X1Y A; 1XNQ B; 2B9Z A; 3FB6 C; 5B1B B; 3K57 A; 1SQF A; 4ZBM A; 3ETE A; 3UO3 A; 3BA9 A; 4B08 A; 1Q6H A; 1YJW V; 3CCJ V; 4O4L B; 4FLV A; 1M56 C; 3JCU Z; 3UCS C; 3Q4H A; 1K9M W; 2DOS A; 2HG5 C; 4E2L A; 2LJ2 A; 2O57 A; 3OUF A; 2R72 A; 3SYO A; 5IJ9 B; 3TGU H; 2XHB A; 2XAG A; 2UUA O; 2CGO A; 5IJ0 B; 4EB6 B; 1LUW A; 4I50 A; 1MOF A; 1N36 O; 3OR7 C; 3JCZ A; 4JV5 O; 5KMG B; 4LBE C; 1IBL B; 1BT8 A; 1MZE A; 2UXC B; 3SR2 C; 4K8Z A; 1IDS A; 2PTM A; 4O4L A; 2UU9 O; 1AI7 A; 2VQE B; 4A5U B; 2EIM C; 4WFB V; 1IBL O; 5B1B C; 3T4D A; 4RQF A; 3B77 A; 4D6T H; 2DYR C; 4WFE A; 4ASU G; 2ITD C; 4Z1M G; 4P2Z A; 3CRM A; 4DV1 B; 2OT5 A; 4KFM A; 4R6Z A; 1NJI W; 2VQE O; 3LSU A; 1ZWI C; 1ZSP A; 4EEQ A; 4GZR B; 2UUB B; 4BIO A; 4YJ2 A; 4QGP A; 5C8Y B; 1SQQ H; 4DYL A; 1KEC A; 1F23 A; 1YSC A; 2W6J G; 4LWS B; 1PKX A; 3APQ A; 1IUR A; 5LGU A; 2B1G A; 5JCO C; 2EIN B; 4I4T B; 4ABM A; 1JJ2 U; 4P9P A; 3AG1 C; 4ZHQ A; 2HVJ C; 4MTO A; 1R3L C; 1M9N A; 2CTQ A; 3VQV A; 4DR1 O; 3FFQ A; 1BHA A; 5J9P C; 3CXH F; 1AI5 A; 1Y74 A; 3VBB A; 1F51 A; 4YY3 B; 1Q6I A; 1YXB A; 4KHP B; 3AG3 C; 5C8Y A; 5D5P A; 4JI3 B; 4PDR A; 5FLX N; 4WCE V; 4RWU A; 4YY3 O; 3CRA A; 4KHP O; 2XT9 A; 1NVP D; 3W7S A; 2IH3 C; 2ATK C; 2ZR2 A; 4I0X A; 4IGG A; 1UPG A; 2XAF A; 2FYU H; 2YEV B; 3DC6 A; 3ZMS A; 5CBH A; 2WLJ A; 2EIN C; 4H33 A; 1PL4 A; 1L8D A; 1VF7 A; 1H2N A; 2Q0A A; 4LF9 B; 3DGE A; 3CCE V; 4DR5 B; 1GM9 A; 1IX9 A; 1YTF D; 3LSS A; 5LMN B; 2YUA A; 1O9H A; 3CE2 A; 4GX5 A; 3U0Z A; 1NH2 B; 1NBM G; 5TIS Z; 3OTO B; 5FNV B; 1N32 O; 2RN9 A; 5LMN O; 2E74 B; 4CH4 A; 3LDD A; 3HKD B; 1WB7 A; 1K5Q A; 1YI2 V; 1AJP A; 1E1R G; 4CH6 A; 2HJD A; 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4JI6 B; 3RGB A; 5CB4 B; 4BIU A; 1M90 W; 3SYA A; 5K1X A; 1Q6U A; 2XAJ A; 3ETQ A; 1K92 A; 5IYC O; 4HBN A; 5J2U A; 1OCZ B; 3K04 A; 4JI0 B; 4L8J A; 3B09 A; 1BQ0 A; 4FZ0 A; 2DW4 A; 3IFX A; 1D2D A; 4FIP C; 4XDK A; 2XOK G; 1QBZ A; 3X2Q C; 3BPZ A; 4JI0 O; 1KC8 W; 2QTO A; 2YI9 A; 1JX9 A; 1VQO V; 1G4Y B; 5KX5 A; 4JI4 O; 1NTZ H; 4XBF A; 2LFR A; 1WPX A; 4PHZ A; 1SQP H; 3ABT A; 3ZMT A; 3A8T A; 4MVS A; 3K5O A; 1Z5W A; 2AHY A; 2DE0 X; 5JQG B; 3W7W A; 1B06 A; 2IJI A; 3ZIA G; 4B3M B; 1OCZ C; 3JAW A; 3CCS V; 4JI7 B; 5E79 Z; 1K33 A; 1SQG A; 5DEC A; 4C7U A; 2RNB A; 4IHJ B; 1Q5O A; 2ZDI A; 5HFM A; 2OCH A; 4DV6 B; 2A79 B; 4JI5 O; 3UM7 A; 2ZDI C; 2FB5 A; 3MDS A; 4EFB A; 3JAM N; 1KP3 A; 3IC7 A; 3ZMV A; 3FAV A; 1KKD A; 3PN1 A; 2BTO A; 3L74 H; 4DR2 O; 5JQG A; 3VQY A; 3C90 A; 2XAH A; 1E79 G; 5CA3 A; 2Q73 A; 4FM0 A; 3GWK C; 5EBM C; 4F6R B; 5H6R A; 1HWY A; 4KP4 A; 4NTY A; 2PZS A; 4JI2 O; 4WFH A; 1ZL8 B; 5LXT A; 3CC4 V; 4B3S O; 3JYC A; 2DYS C; 1HR0 O; 2E3C A; 3G4S V; 1H8H G; 4X66 B; 4F6E A; 1H8E G; 3ZX6 A; 3H01 A; 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