The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
42
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structure length |
42
|
Chain Sequence |
MKHLSDELLIESYFKAKELNLSPEFIELIEKEIQRRSLTHKI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
How to switch off a histidine kinase: crystal structure of Geobacillus stearothermophilus KinB with the inhibitor Sda
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase/transferase inhibitor
|
| source organism |
Geobacillus stearothermophilus
|
| molecule keywords |
Sporulation kinase B
|
| total genus |
17
|
| structure length |
42
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| sequence length |
42
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Sporulation inhibitor A |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PV0 A; 3D36 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M1K W; 1FYJ A; 3CC2 V; 5LMN B; 1FJG O; 4Z1M G; 3E8B A; 3NR7 A; 4YJ3 A; 2VQF B; 1I7F A; 3W7T A; 3UQ8 A; 4LBE C; 2YIB D; 5B3S B; 4IHJ A; 4F6R A; 3ABU A; 4DR4 O; 3D36 C; 1S5H C; 2QTS A; 4U7N A; 1JJ2 U; 1S77 D; 5L3D A; 1V55 C; 1FAF A; 5LA6 A; 4PI2 A; 4DR3 B; 3T1Y O; 4TQF A; 1UFI A; 5L3F A; 5EYP A; 5CBG A; 3BA8 A; 2ZM6 O; 1YTF D; 4ASU G; 3M8A A; 3AK1 A; 1S76 D; 3ZBH A; 2JRI A; 1BE3 H; 1IBM O; 1GKF A; 2PTM A; 4H33 A; 4DV2 O; 5AG2 A; 2EIM C; 1NR1 A; 4PDV A; 3HR0 A; 3L73 H; 1QCE A; 1FKA O; 2WLK A; 5IWA O; 4DR1 O; 5ITZ B; 2Y4T A; 5EBW C; 4BR6 A; 4JYA O; 2QKC A; 1TUE B; 2ZR2 A; 1WPX A; 3I5D A; 5LP6 A; 4LF7 O; 3K57 A; 1YHQ V; 4GX1 A; 1GO3 F; 3FB5 C; 2LFS A; 2CTP A; 3K79 A; 4MSW C; 4FM2 A; 1S3J A; 1Y67 A; 3RYI A; 4UCR A; 3Q4H B; 4LNU A; 2ADQ B; 1YIT V; 1AP5 A; 4O2A B; 1M57 B; 1WJZ A; 1AB3 A; 1BQ0 A; 4WFB V; 1TA8 A; 3OTO B; 4TV8 B; 5IDJ A; 3BVO A; 3B8N A; 1IBK B; 4NR1 A; 3JAK A; 1VAR A; 2Q67 A; 1ARO P; 1WB7 A; 4DRX B; 5JH7 B; 1SC5 B; 2L6L A; 4HZ3 A; 4J80 A; 2PI4 A; 2NR5 A; 1H2K A; 2E5L O; 2OTL V; 1SQP H; 5CA1 A; 5FLX N; 1QQC A; 3ABL C; 5B1B C; 3RFR A; 1N34 O; 1JFF A; 5KUM A; 1GMG A; 2B1I A; 2ATK C; 3HB3 B; 2QJ1 A; 1KU9 A; 2O57 A; 2EJR A; 1SRY A; 4KL1 A; 4X20 A; 4YJ2 A; 3ZRV A; 1BGY H; 1F4N A; 1K34 A; 1V55 B; 5LL6 Y; 1M93 A; 4B3M B; 2OWO A; 1VQ9 V; 3OE7 G; 1YJW V; 1TAE A; 2PF4 E; 1BHB A; 1R6K A; 4WFH A; 1FS0 G; 2L35 A; 2UXB O; 3ZRW B; 1GN4 A; 1IBM B; 1TVK B; 4FLZ A; 3JCZ A; 2Z5U A; 4DV2 B; 1EN4 A; 2EIM B; 1R6N A; 2RQ6 A; 4NYK A; 2GUZ B; 3TCU A; 1QR8 A; 1IVS A; 5LXT A; 4C7U A; 1QLE C; 4LWS B; 3K0G A; 4JI6 B; 4JI0 O; 5BY1 A; 2F23 A; 3BRC A; 1G1X B; 4YY3 O; 2E76 B; 1OCC C; 1ZL8 B; 4O4L B; 2IJH A; 1SKV A; 4I55 B; 3E22 A; 3W7S A; 3I56 V; 2UXX A; 4X64 B; 1VQ8 V; 2FYU H; 1Y4M A; 3RN4 A; 5KHG A; 1P4R A; 1HWY A; 4PA7 A; 1X59 A; 4MS2 A; 5L3G A; 4PDL A; 1SQX H; 1URF A; 1WA8 B; 2Q7H A; 4FLW A; 1M5I A; 3CRR A; 1NH2 D; 4DK1 A; 3OMA B; 3L9D A; 3K06 A; 4P9P A; 2ITC C; 4QGP A; 1HNZ O; 1DK1 A; 1WP8 A; 3C90 A; 3GWO A; 3CX5 F; 3F5T A; 4B3R O; 4H37 A; 4O4H B; 2DQ0 A; 3OM3 B; 2AHZ A; 2KB1 A; 3ABL B; 5B1B B; 1B3Q A; 2LW7 A; 4U3J A; 3RVY A; 4TUY B; 2AZ0 A; 5J2T B; 3ZHR A; 5GTH Z; 2HHH O; 2ZR3 A; 1XBL A; 2PZS A; 4JI3 O; 4H0L B; 4LF9 O; 5B5E Z; 3SPJ A; 5LHH A; 3HKD A; 4MW8 A; 3CXC U; 2KQX A; 2P06 A; 1EN5 A; 1NT2 B; 1MZE A; 3N27 A; 2DYR C; 1Q5O A; 4R50 A; 4G27 B; 4PI0 A; 3ASN C; 4UB8 Z; 4JTA B; 4Q20 A; 1QLE B; 1CP9 A; 4QJF B; 1OCC B; 4N23 A; 4IIJ A; 5JVD A; 1YXB A; 3L75 H; 1X4T A; 2W6I G; 3ZMS A; 2P4V A; 4K8Z A; 4LF4 B; 1RP3 B; 1R3L C; 4Q6G A; 5EK0 A; 2KG7 A; 2ODM A; 2FML A; 5KMG B; 4UB6 Z; 4YJ3 B; 2RJZ A; 3CCE V; 3GB7 C; 4IHJ B; 4F6R B; 4ZIB A; 3CEI A; 5L3B A; 3CSX A; 2Q7E A; 2NNU A; 1Q6H A; 3BCC H; 4QPK A; 2ILM A; 2N05 A; 1VQM V; 2PY5 A; 1K5Q A; 3B8M A; 2EBO A; 5EYP B; 1I94 O; 4DW1 A; 3JD4 A; 2CGN A; 3KCY A; 4WCE V; 1XNQ B; 2DWD C; 2QWP B; 4BWA A; 1K8A W; 2ZE5 A; 3OMI B; 3ZHV A; 3ETG A; 1YEW A; 1LUW A; 5JWP A; 3T4Z A; 5LMU B; 4DK0 A; 1VF5 B; 2B5U A; 1IXB A; 1Y6X A; 4X66 O; 3FB6 C; 1F23 A; 2EIN C; 4K35 A; 1JOY A; 2A7W A; 1BHA A; 1JCH A; 3L71 H; 4GYC B; 4GCZ A; 4TV9 A; 1BQZ A; 5HFL A; 4AIL C; 2DYR B; 1H38 A; 4JZG A; 2E3C A; 5JJJ B; 5KAI Z; 1M90 W; 4LNU B; 4P30 A; 3ASN B; 5L3C A; 3QNE A; 3UO3 A; 4WFG A; 3M7M X; 1I0H A; 2WLL B; 4RUF A; 2UXN A; 1AJN A; 3KG2 A; 5FPR A; 4MTF A; 4UV8 A; 4CH5 A; 1XMQ O; 2QM8 A; 3GWK C; 4JTD B; 1SQV H; 4WBN B; 4OXS A; 2XND G; 4LFC B; 3X2Q C; 5BXZ A; 4J9Z B; 1H2M A; 2WLN A; 2A3Q A; 3L74 H; 5JJE B; 4DR2 O; 4FLX A; 1SZX A; 4X62 O; 5CA1 B; 1OHH G; 1JVM A; 2Y4U A; 1KBH A; 4I0X A; 3H9V A; 2OIG A; 1JFF B; 3CD6 V; 4YXW G; 4L87 A; 5IJ9 A; 4LFB B; 1E1R G; 4I7Z B; 1Y74 A; 3SYO A; 5H6R A; 3IGA C; 3U11 A; 3N2K B; 1VP7 A; 3H1J H; 2B9Z A; 5BZB A; 3RYH A; 2XHB A; 1Q7Y W; 2V7Q G; 1THZ A; 1P7G A; 2ZE7 A; 2IU3 A; 4JI8 B; 3A0B Z; 4MVS A; 2D2C B; 1R73 A; 4DYL A; 3ABT A; 3SJC C; 3ZMV A; 4UVB A; 1KP2 A; 2DYS C; 3GVM A; 3M99 B; 3OUF A; 3LNM B; 4AI8 A; 3AG2 C; 4ZI7 A; 2ZKO A; 1I08 A; 2EIN B; 4J7J A; 1GM8 A; 4DR7 B; 1QVF U; 3JAL B; 3QO7 A; 4JAU A; 2F4V O; 4EEQ A; 2JEU A; 4UV9 A; 2XT9 A; 5CA0 B; 4WF9 V; 3J80 N; 1KEC A; 4BW9 A; 3E89 A; 5GON A; 2M7W A; 4XDJ A; 3B77 A; 3RBZ A; 2FL4 A; 3T1H O; 2RN9 A; 1SZT A; 4CH4 A; 1N4C A; 3LNN A; 4B3T B; 3QO5 A; 3JAS A; 1RPR A; 3OEH G; 1WN7 A; 2P90 A; 5LMN O; 4DV4 O; 1VQ6 V; 1MMM A; 2HJD A; 1K73 W; 2EJ7 A; 1N33 B; 3U10 A; 4MVO A; 2VQF O; 4XDL A; 3CCR V; 5DEC A; 1R3I C; 3X2Q B; 5A9G A; 5IT9 N; 1WNS A; 1CXZ B; 2HKO A; 2ZIO A; 4CH6 A; 1U96 A; 1GTO A; 2GHY A; 1F51 A; 5JCO A; 4DR5 O; 2IM9 A; 4DR3 O; 3ZS8 C; 1H2G A; 4FFB A; 1JMK C; 4MVR A; 4G2K A; 5A2Q N; 3ETE A; 2YIB A; 2OCH A; 2QWO B; 4JZ2 A; 1EFR G; 1PD3 A; 3R65 A; 3W7W A; 1HNW B; 3HPL C; 1SES A; 1O9H A; 1H8E G; 2UUC B; 3EHB B; 2A79 B; 2IJK A; 3L70 H; 2IJJ A; 2UUB B; 3W7X A; 5E79 Z; 5EZY A; 1NS1 A; 3HKD B; 2GDS A; 4D7S A; 2IW5 A; 2QE7 G; 4F4L A; 3CB2 A; 3K5N A; 2QWN B; 4NXM B; 1J95 A; 3JD3 A; 2WSS G; 4J7K A; 2HG5 C; 4TQD A; 2DWE C; 4EB6 B; 4DUZ B; 1SQG A; 3EVK A; 4LF8 B; 1D5A A; 1AR1 B; 1E1Q G; 2LFR A; 2DYS B; 5KX5 B; 3E83 A; 3AG2 B; 1SA0 A; 4LF6 B; 1NTM H; 1Y76 A; 3A0R A; 3K9A A; 2YXH A; 5B66 Z; 3G4S V; 4FLT A; 2ZNI A; 1K33 A; 2Q68 A; 2ARH A; 5EIB C; 3THO A; 2ZDI C; 3UT5 A; 2XAS A; 3K59 A; 3OGC C; 3OTO O; 4J7Z A; 1IBK O; 2H8P C; 1ORQ C; 3ZED A; 2HR3 A; 3OR7 C; 3K5M A; 2OYQ A; 4HNA B; 2CE4 A; 5KHJ A; 1MSW D; 4DV4 B; 3FKS G; 3STL C; 4X1Y B; 4JAV A; 4FLY A; 2PYJ A; 2LQT A; 2YS8 A; 2YEV A; 1H2L A; 4GX5 A; 2Q5Z A; 4CZZ A; 1Q8I A; 3QVN A; 1GH6 A; 4DR5 B; 2OTJ V; 3ASO C; 3EFF K; 3IJ4 A; 3LSU A; 4KUM A; 1SER A; 3KKY A; 4B3M O; 5KAF Z; 1Q86 W; 5CB4 B; 4FPP A; 3DC6 A; 2ZCE A; 4O2B A; 2ZIN A; 3BAB A; 2GBO A; 3CRA A; 4JAA A; 1JR9 A; 4TV9 B; 4AQY B; 4JAS A; 5H5N A; 2NLJ C; 4D7T A; 1XI1 A; 4UVC A; 4JI6 O; 2XAH A; 4IL6 Z; 2P4K A; 1FPO A; 3OW2 U; 5H9C A; 3K9S A; 1VQ5 V; 2UUA B; 3JSN A; 4CC6 A; 2EUL A; 3AG4 C; 2WLI B; 2WA4 A; 4X64 O; 1K97 A; 5K1P A; 3FD9 A; 4GKK B; 1XEQ A; 5IYC O; 1V54 C; 1FD9 A; 2JJ1 G; 5H6Q A; 3RW0 A; 1EZJ A; 3K04 A; 1J5E B; 3RYF A; 3SR2 C; 4H13 B; 2QGN A; 3CME V; 3T4D A; 4DV6 B; 3CCV V; 1PL0 A; 4I4T A; 2XTA A; 2ZQM A; 3HKB A; 2EIJ C; 3SPC A; 3HKC A; 2ZXW C; 4U7O A; 2HP8 A; 3SPH A; 1Q6I A; 1Y74 B; 1W0K G; 2DN9 A; 1XNR B; 3MHS C; 2K9P A; 2N74 A; 4UVA A; 5CN0 A; 3ICX A; 2JK5 C; 2X0L A; 2F66 C; 3RYH B; 3JAR B; 4P9O A; 4B7E A; 4KFM A; 1RM1 B; 3ASO B; 2GTS A; 1RPO A; 1NZ6 A; 3LDE A; 3MHH C; 5F2V O; 4X89 A; 3DC5 A; 3N2G A; 4JTC B; 1L8D A; 4O4J A; 3ZX6 A; 2D3O W; 1ZAU A; 4MTG A; 2W6J G; 4NXN B; 2V1D A; 3JD2 A; 1IX9 A; 2LP7 A; 1L1F A; 4DV3 B; 2IBZ H; 4I50 A; 1FXK A; 1VF6 A; 1NI8 A; 4IGG A; 1AI5 A; 4EKW A; 3QTC A; 3R66 A; 4X1K A; 4ZHQ A; 5LYJ B; 4RWU A; 5LHG A; 3F5W C; 3JAW A; 1XHX A; 4GZR B; 1RSO B; 3APQ A; 3CYO A; 2BTQ A; 5GON B; 1M9N A; 4ICG A; 3QG5 A; 3AG4 B; 4LF4 O; 4D6T H; 3ZRS A; 2OCC C; 2OIE A; 5FNV A; 1GN2 A; 2Q0O C; 1AP6 A; 5BMV A; 4MTX A; 2IJI A; 2X7R B; 3JAM N; 1SET A; 4BIZ A; 1V54 B; 1YIJ V; 2EIL C; 3UKM A; 4G28 B; 1PP9 H; 5K1X A; 1AI4 A; 4OGQ B; 3I55 V; 1NKD A; 2AZ2 A; 3CJH A; 4ZOL A; 1TUB B; 5EBL C; 1AI6 A; 3UCS C; 2YXL A; 3DSQ A; 2EIJ B; 2ZXW B; 4PDM A; 2F95 B; 1KQS U; 5IY5 C; 2ETN A; 4DW0 A; 1NU1 H; 1Q90 D; 5KHK A; 1BCC H; 4MVZ A; 1XNQ O; 5LGU A; 4FZ1 A; 4UCO A; 4NTY A; 4DV0 O; 4Z2W A; 5GW7 A; 5KLV H; 1FXH A; 5GTI Z; 5LMU O; 1QU7 A; 3SDL A; 2E75 B; 5IYD O; 4DV7 O; 4X1I A; 3QF7 A; 3SYC A; 5LP6 C; 1MSD A; 4JV5 B; 1BT8 A; 4F6E A; 3LSQ A; 1JJO A; 1SA0 B; 3LDC A; 3OT7 A; 4I5S A; 3OFN G; 3BEH A; 1Y76 B; 3FYE B; 2WA3 A; 4HYO A; 4FIP C; 4JYB A; 5IYZ B; 4J41 A; 2QDO A; 1VQO V; 1G6U A; 3P32 A; 2DOS A; 4CC5 A; 3ZHT A; 2DW4 A; 1AVM A; 1XL6 A; 3K5O A; 5LOV A; 4PDR A; 1KMI Z; 4LFC O; 3ETQ A; 1V9P A; 4DV1 B; 4K0K B; 5DN6 G; 2CH7 A; 1ROP A; 5C93 A; 2OCC B; 3JCU Z; 2GTA A; 3ZHQ A; 2WLH A; 1IXM A; 1PNK A; 2H3O A; 1K7D A; 4IYI A; 2Y0P A; 1DF5 A; 1AIL A; 5J2U A; 1NVP B; 4XBF A; 1I5Y A; 1WP7 A; 3HKE A; 4LF5 B; 2EIL B; 3RT3 C; 1PV0 A; 3CRQ A; 3IC7 A; 4LFB O; 1FFX A; 3VQX A; 3MAQ A; 1N0J A; 4FLU A; 5LBQ A; 3H1L H; 5LA6 B; 2KSD A; 3VBB A; 5LGT A; 1MG1 A; 3C3T A; 1SF9 A; 1JQ0 A; 4O2B B; 1CEZ A; 5IY5 B; 2DMX A; 4JI8 O; 4B3S B; 5HFM A; 3DTU B; 3L72 H; 4KXR A; 1K3E A; 1VF6 C; 4DV0 B; 2P67 A; 5CBH A; 4B08 A; 2LJ2 A; 1ZUQ A; 1N32 B; 1M4U A; 3ML0 A; 2R72 A; 3QO8 A; 1P84 F; 4DV7 B; 1OCO C; 2Y48 A; 4DR7 O; 2QTO A; 4J42 A; 1D2D A; 1F7Y A; 1SQB H; 5LP6 B; 1Z2G A; 1HW7 A; 1Q3E A; 2LGW A; 1COW G; 3SYQ A; 1IZ3 A; 2CUG A; 2Q73 A; 3OTF A; 3RYI B; 1A32 A; 3J81 N; 3ABM C; 4NTW A; 1TGO A; 3S3X A; 4DV5 B; 2YSU B; 3H1H H; 4PHZ A; 4B3T O; 1H2N A; 1HR0 B; 1AI7 A; 4KHP B; 1LUV A; 1KD1 W; 3JAK B; 1OCZ C; 1YJ9 V; 1N33 O; 1Q6U A; 3ABK C; 4I4T B; 1YDX A; 2YDE A; 4XDK A; 3FB8 C; 1KB9 F; 5IJ0 A; 3WU2 Z; 1BSM A; 4IT5 A; 1N36 B; 1NH2 B; 5KA6 A; 2JGU A; 1DGS A; 4JI2 B; 5KHI A; 3Q4H A; 1S72 V; 3B4S A; 3WB2 A; 3G6B A; 4K8X A; 4LFA B; 3OMN B; 3AEI A; 4O2A A; 1T5E A; 2F43 G; 3JAT A; 1HNW O; 4X20 B; 4YJ2 B; 3ZMZ A; 3D3I A; 2AW9 A; 2UUC O; 2UUB O; 1HP8 A; 1S0V A; 3FAV A; 4DRX A; 3N2G B; 1MZF A; 5JH7 A; 5LGN A; 1ZLZ A; 1MNG A; 3SJQ C; 4JI7 B; 3OGI B; 4NXM O; 2JGD A; 3ETD A; 1FXV A; 3O9O A; 4PA3 A; 4PJ0 Z; 3G6E V; 3SJB C; 4DUZ O; 1GRJ A; 1H2S B; 4LF8 O; 1QHT A; 3SGI A; 1OCR C; 5D5Q A; 2PYL A; 4X1K B; 4ZHQ B; 5LXT B; 1BZK A; 4X65 B; 4OPA A; 4LF6 O; 3D36 A; 2KKW A; 4QIW F; 1OCO B; 1BS3 A; 1KKC A; 4O4I A; 3CWB H; 4E2L A; 5CMU A; 4ZKI A; 4GKJ B; 3E22 B; 1SQQ H; 4DO2 A; 3F7Y C; 5FNV B; 3OD4 A; 3G67 A; 1L0L H; 3TGU H; 3C3S A; 5KA5 A; 3VQW A; 1DTO A; 2QM4 A; 4WFA V; 5BMV B; 3WB1 A; 1TVK A; 3ABM B; 1VQK V; 1Q82 W; 2QEX V; 1F4M A; 4DR6 B; 4LP8 A; 3S3W A; 1OCZ B; 4CH3 A; 2JJ2 G; 2Z0A A; 3IC9 A; 5H2F Z; 3CJH B; 1EN6 A; 3ABK B; 4A5U B; 1ZL8 A; 3UO2 A; 5EIB D; 3OEE G; 3OAA G; 3K08 A; 2ZE8 A; 4J9Y B; 1AJQ A; 3W7U A; 1QR9 A; 2P7T C; 1Q81 W; 3D3Q A; 5IYB O; 2YI9 A; 4U3J B; 2HJF C; 1PPJ H; 4LR3 A; 3OUS A; 3B09 A; 1IBL O; 1PM9 A; 3CPW U; 4WFF A; 2RMK B; 4JI1 B; 4YIP A; 1VIB A; 2FTK A; 1CPY A; 3BA9 A; 4AQY O; 2IU0 A; 3K5L A; 4JPR A; 1S5L Z; 2R9I A; 4UCV A; 3AK3 A; 2UXC B; 4JI4 B; 1G4Y B; 4GLX A; 3FYI B; 3VQV A; 3ZIA G; 1VEW A; 2UUA O; 1OCR B; 4JI5 B; 4TUY A; 2FB5 A; 4JYC A; 5EC2 C; 4RQF A; 4IIJ B; 2UXD B; 3BPZ A; 5JVD B; 2XAF A; 1R3J C; 4UCU A; 1I5X A; 4WFE A; 5LOV B; 4RAI A; 1YVW A; 4GKK O; 3RYC A; 2CH7 B; 2E74 B; 4RO2 A; 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