The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
42
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structure length |
42
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Chain Sequence |
MKHLSDELLIESYFKAKELNLSPEFIELIEKEIQRRSLTHKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase/transferase inhibitor
|
| source organism |
Geobacillus stearothermophilus
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| publication title |
How to switch off a histidine kinase: crystal structure of Geobacillus stearothermophilus KinB with the inhibitor Sda
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Sporulation kinase B
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| total genus |
17
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| structure length |
42
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| sequence length |
42
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Sporulation inhibitor A |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D36 C; 1PV0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3E22 A; 2YIC A; 4O4L A; 4TWK A; 3B40 A; 5GON B; 3WG7 C; 2ZE5 A; 5IYZ B; 1US6 A; 4KUM A; 3WB2 A; 4DR1 O; 5JH7 A; 1KKD A; 4FK5 C; 5LXT A; 1SC5 B; 4PA4 A; 1F23 A; 3K9S A; 1IUR A; 3Q4H A; 1SQP H; 3GVM A; 3G71 V; 1YXB A; 1M1K W; 1M57 B; 1O9G A; 1YCI A; 5C8Y A; 4WFG A; 1M56 C; 3LSQ A; 4U3F H; 3DXR A; 4CS2 A; 1G1X B; 4JI4 O; 4X1I A; 4FM0 A; 4PI0 A; 5BMV B; 3CXC U; 2JS3 A; 2EIN B; 2ZE8 A; 2YIA A; 4FM1 A; 5IT9 N; 4RAI A; 4TSF G; 5B1B B; 4LF9 O; 5L3C A; 4H13 B; 4JI4 B; 1CEZ A; 2F23 A; 5B1A B; 4QPK A; 1KMI Z; 1OCZ C; 1PPJ H; 2BCC H; 2EIJ B; 1SQX H; 3JD3 A; 5KHG A; 1O9H A; 1YDX A; 3CCM V; 4I9Q A; 3HB3 B; 3AK1 A; 4LF4 O; 3BHP A; 3F7V C; 5LHG A; 1P7B A; 4ICG A; 3JAW A; 2QM8 A; 3JAR A; 2ADQ B; 2Q73 A; 1Z2G A; 2F1M A; 4X9Q A; 1Q43 A; 3W7T A; 4DV2 B; 3BFR A; 3HKC B; 1PP9 H; 1ZL8 A; 4F6R B; 3SYQ A; 4GKK O; 5L3B A; 2MW2 B; 2Q7G A; 1OCO C; 3K03 A; 3RVZ A; 4GX1 A; 2XAG A; 1L8D A; 4GKK B; 3OTF A; 1FPO A; 1SA0 B; 4UCR A; 1K3E A; 4DV7 O; 3VQW A; 4PDR A; 2HHH O; 1XHZ A; 1ZUQ A; 1FXK B; 3GWO A; 3K5O A; 3AK3 A; 3HKE B; 4GX2 A; 4DV7 B; 3CCQ V; 2HHH B; 1VQ6 V; 3JD1 A; 2JEX A; 5E1A C; 3RYC A; 1S3J A; 3DC6 A; 3G4S V; 3RYF B; 4NTY A; 2RJZ A; 2W0X A; 2GTA A; 4JI0 O; 1UFI A; 5CB4 B; 3N2G A; 1HDJ A; 3T2M A; 1U97 A; 1Y67 A; 1ROP A; 1YSC A; 1WA8 B; 4JI0 B; 5GTH Z; 1QCE A; 5LYJ B; 4K3A A; 1SS3 A; 3OMA B; 1EFR G; 4DV5 O; 5EIB D; 1SQB H; 1V54 C; 3TJT A; 1FAF A; 5KMG B; 2R9R B; 2YI8 A; 4DV5 B; 2YXL A; 1VQ7 V; 3JAS A; 4WBN A; 1PL4 A; 3CME V; 4JI5 O; 5DEC A; 2DWD C; 1Q86 W; 1K7D A; 5JWP A; 4X1K A; 4GZR B; 5JQG A; 4X89 A; 3K5N A; 1M56 B; 3GWK C; 1K9M W; 2GBO A; 2OIE A; 3OUF A; 4WFE A; 2HVK C; 4J9Y B; 1ZTE A; 1R3I C; 2GDS A; 2YID A; 2ZDI C; 4O2B B; 1FFX B; 3ZHS A; 2UXB O; 3TET A; 1Q5O A; 5KA6 A; 3K04 A; 1EM1 A; 4L8J A; 2VQE O; 1RM1 C; 4B3R O; 3ABL B; 1NVP D; 4YJ3 A; 5EC1 C; 1S76 D; 4ZHQ B; 2JGU A; 2A0L A; 1KYO F; 2BSK B; 5L3F A; 3CXH F; 2QKC A; 1IZ3 A; 3H9V A; 4FFB A; 1R3K C; 4I50 A; 4DR7 O; 3HPL C; 4DV6 O; 2Y0I A; 2WLM A; 4KL1 A; 3N27 A; 2V4D A; 3LSU A; 4R6Z A; 5BXZ A; 3JSL A; 1M5I A; 4DV6 B; 1OCO B; 3CCV V; 4EB6 A; 3LSS A; 2HFE C; 1AI4 A; 3QO5 A; 3E86 A; 1I7F A; 1V55 C; 4RUE A; 5IY5 B; 2PY5 A; 5K1X A; 2OTL V; 4O4H A; 4UXN A; 2WLH A; 5IE9 A; 1QHT A; 3ZMT A; 4PA3 A; 3W7S A; 2EZO A; 5JJN B; 1ZAU A; 2XOK G; 5E79 Z; 4MW8 A; 4LFB O; 2OT5 A; 2YXH A; 4ASU G; 1NH2 B; 2D2C B; 1VF6 A; 5EZY B; 1VF5 B; 4LFB B; 1Q81 W; 3KCX A; 4X88 A; 1VQO V; 2F95 B; 3H01 A; 4LP8 A; 3BRC A; 1BSM A; 3JAM N; 1PM9 A; 3U10 A; 5EYP B; 1ZSP A; 1KU9 A; 2OTJ V; 1NS1 A; 1JFF A; 3D36 C; 1XMO O; 4I0X B; 4B3T O; 4A5U B; 2PTM A; 1NI8 A; 1YZB A; 1QBZ A; 3K5L A; 1VAR A; 1XMO B; 1S77 D; 1QU7 A; 4B3T B; 5FNV B; 2L35 A; 4AIL C; 5ITZ B; 2Q7E A; 2DJV A; 3IGA C; 1JQ0 A; 2B1G A; 1AR1 B; 3ZHU A; 4HYO A; 1FYJ A; 3SR2 C; 1DK1 A; 3ZHV A; 1M93 A; 2YIB D; 4XDJ A; 3M99 B; 1X4T A; 4P9O A; 1GH6 A; 4GX5 A; 1Z5W A; 4AHC A; 3E8B A; 1AI5 A; 1PKX A; 3O65 A; 4GKJ O; 2IU0 A; 2RMK B; 3H1J H; 4I7Z B; 4JI3 B; 1RM1 B; 2ZKO A; 5L3G A; 3B77 A; 4P2Z A; 2LP7 A; 1RSO B; 1NVP B; 2LGW A; 3W7W A; 4GKJ B; 1YJ9 V; 5D5Q A; 2DMX A; 1BGY H; 1M9N A; 3BY6 A; 4QE9 A; 2BTQ B; 1XL4 A; 4UCT A; 5EBL C; 5CBF A; 1E1Q G; 3G6B A; 2QWO B; 2K1E A; 4MVM A; 3KCY A; 4TOI A; 1F51 A; 5LOV A; 1WPB A; 2XAQ A; 3ZHQ A; 3OUS A; 3A0H Z; 1JA8 A; 3RYH A; 5DED A; 2LJ2 A; 1FXV A; 2QTS A; 4U3J B; 1Q6U A; 3I56 V; 1K92 A; 3IAY A; 4MSW C; 3ZMU A; 2JVD A; 3ASN C; 2ZXW C; 1XIL A; 5GON A; 3CX5 F; 1NQT A; 5IYZ A; 5JJE B; 1KEC A; 3K59 A; 3OEH G; 1WP7 A; 2HJF C; 3B8M A; 4E2L A; 2NLJ C; 1XNR O; 2XT9 A; 1Q90 D; 4RQE A; 4UCO A; 3ZRV A; 1H38 A; 2CGN A; 4XDL A; 2JRI A; 5B3S B; 1XNR B; 1AR5 A; 2GSM B; 1HNW O; 5H6Q A; 1G8M A; 2DQ3 A; 1IX9 A; 4YIP A; 5A2Q N; 1HNW B; 1N4C A; 5J2U A; 4MVR A; 3OFN G; 4JAS A; 3CB2 A; 2Q9L A; 3OAA G; 1TA8 A; 1NBM G; 4CS4 A; 4EKW A; 4DV1 O; 3B4S A; 4H33 A; 1XNQ O; 4MS2 A; 1VQM V; 3APQ A; 1P84 F; 1NTM H; 5CA3 A; 4I9W A; 3ZMS A; 1FS0 G; 2L6L A; 1H2M A; 4J10 A; 3K0D A; 5KHJ A; 4Q20 A; 4JAU A; 1TVK A; 3QO8 A; 3FD9 A; 3M7M X; 4FVM A; 2CK3 G; 5JCO C; 3ABK C; 1RFY A; 4O4I B; 4FLT A; 4EFE A; 2Q5Z A; 3QTC A; 1HWY A; 1Q6I A; 3RYI B; 4UUJ C; 4LNU B; 2KSD A; 1XBL A; 3TXS A; 1Q6H A; 4BAY A; 1AVM A; 2AW9 A; 3BAB A; 1QLN A; 1MNG A; 5B1A C; 3SYO A; 1QR8 A; 2DE0 X; 1JVM A; 1XRE A; 2R9A A; 3H1I H; 4LWS A; 2QSA A; 4JAA A; 4YJ2 B; 3LDC A; 3L71 H; 4R8C A; 4BW5 A; 2V7Q G; 2KB1 A; 4HAM A; 3RYF A; 2IBZ H; 2ITC C; 5CB4 A; 4FLY A; 3LUT B; 1NR1 A; 1WA8 A; 2WLI B; 2Q0A A; 5LYJ A; 1MSD A; 3ASN B; 2EIL B; 4FPP A; 5EBW C; 3I55 V; 1GN2 A; 4MW3 A; 4UCS A; 2N05 A; 5KMG A; 3K3W A; 3JCU Z; 4PDL A; 1GMG A; 3CC2 V; 3BA8 A; 2RNB A; 1SES A; 4NXN O; 4W4L A; 2E76 B; 2UU9 O; 1FXK C; 5B5E Z; 1TGO A; 4J41 A; 5H6R A; 2QTO A; 3T4Z A; 4MTX A; 4CZZ A; 1IBL O; 2UU9 B; 2ITD C; 3L75 H; 5JVD A; 2ZIN A; 4DV0 O; 1S72 V; 1BS3 A; 1L0N H; 1PNK A; 3VQV A; 3VBB A; 2WLJ A; 4LC1 A; 1IBL B; 3NXS A; 1EN4 A; 2FYU H; 4DV4 O; 1J5E O; 4TV8 B; 4DV0 B; 4G28 B; 2EIM B; 1BHB A; 5KAF Z; 2D3O W; 4O2B A; 3CRC A; 4TT3 G; 4JZ2 A; 5LA6 B; 4DK0 A; 4DV4 B; 2CAZ C; 3CCR V; 2ATK C; 4CH4 A; 4CBC A; 4O2A A; 5D5P A; 3UKM A; 2P6J A; 1P49 A; 4TUY B; 3CRR A; 5KHK A; 2QM7 A; 5IJ9 B; 1D2D A; 2JDI G; 4D7T A; 4ZHQ A; 1UJW B; 4BIU A; 4WFB V; 3T4D A; 1H2K A; 2DYS C; 2X6B A; 2Z3Y A; 1MG1 A; 2QR4 A; 3J81 N; 2BSK A; 3QO7 A; 1F7Y A; 1BZK A; 2ZNI A; 4MVZ A; 5F2V O; 1Q3E A; 1N36 B; 4ZBM A; 5KX5 A; 1AI7 A; 4NTW A; 1SQG A; 4K8X A; 1NJI W; 3IC9 A; 2PZS A; 2IM9 A; 3ABK B; 4JI7 O; 3VQX A; 3L70 H; 5CBH A; 2Q8V A; 2ZQM A; 3E8H A; 3CRA A; 4JI7 B; 3H1K H; 3OD4 A; 1B06 A; 4NYK A; 2W6J G; 1YHQ V; 3AG2 C; 3WB1 A; 3CMA V; 4PHZ A; 5EK0 A; 3SPH A; 2N74 A; 3ABL C; 2A3Q A; 2M6Y A; 4J7Z A; 2DOS A; 4P9P A; 2EX3 A; 5BR8 O; 4DK1 A; 2ZR3 A; 3RFR A; 1THZ A; 5J2T B; 1A32 A; 4DV2 O; 1G6U A; 4CC5 A; 5BR8 B; 4NTX A; 2R70 A; 3JAK B; 2QDO A; 2RDC A; 5EZY A; 4H44 B; 2IW5 A; 3A0B Z; 2RCV A; 4I5S A; 4HNA B; 3FAV B; 3CSX A; 4Z1V A; 3F5T A; 1ZWI C; 3IC7 A; 3CC4 V; 2HG5 C; 1ENV A; 2CTP A; 4KP4 A; 2PF4 E; 4QJF B; 2A06 H; 5IY5 C; 5HFM A; 2PI4 A; 1KP2 A; 3N2K B; 5FNV A; 4JI1 O; 5ITZ A; 4Z2W A; 3S3W A; 2HKO A; 1SQV H; 3EVK A; 1BHA A; 5EC2 C; 1IDS A; 4JI1 B; 4XDK A; 5IYB O; 1YI2 V; 2YUA A; 2CE4 A; 2YI9 A; 1Q8I A; 3OM3 B; 4LFC O; 1COW G; 2ZDI A; 1L1F A; 3MHS C; 1XQ8 A; 1YVW A; 4LFC B; 3CJH B; 3P30 A; 1WPX A; 1YEW A; 1QQC A; 1GN3 A; 2ODM A; 3FB7 C; 5EIB C; 3U11 A; 2Y48 A; 4J9Z B; 1HW7 A; 3RN4 A; 4FIP C; 1Y76 B; 4DR5 O; 2UXN A; 4C7U A; 2DN9 A; 2DYS B; 2WA3 A; 2BTQ A; 4DW0 A; 4DXW A; 3FB8 C; 4G2K A; 1WJZ A; 3AG4 C; 3FKS G; 4DR5 B; 1LNQ A; 1R6T A; 2IJH A; 1S5L Z; 2DW4 A; 3RWR D; 3ZED A; 1R1B A; 4WCE V; 2W0F C; 2ZM6 O; 1KD1 W; 2X6A A; 1RPO A; 3GB7 C; 2UUA O; 2CH7 B; 2ZM6 B; 1VQL V; 2VRZ A; 3IJ4 A; 4AI8 A; 2PYJ A; 3F5W C; 1Q7Y W; 2UUA B; 4GYC B; 4JI6 O; 3NR7 A; 2Q68 A; 1NKD A; 3AG2 B; 1I5X A; 1OHH G; 4JF3 A; 1BT8 A; 2UXD O; 4YY3 O; 3UT5 B; 2IJK A; 1QVG U; 4JI6 B; 4PV1 B; 1YTF D; 2UXD B; 2CGO A; 2Q6A A; 4YY3 B; 4P30 A; 1B6Q A; 5LP6 C; 3OMI B; 1SQQ H; 2Q69 A; 4O4L B; 5JJJ B; 4I55 A; 5CMU A; 3K08 A; 4D7S A; 1IBM B; 1NU1 H; 2ZCE A; 2WWW A; 2WLK A; 4X1Y B; 1GM8 A; 1VQN V; 4ABM A; 3K57 A; 5LMN O; 2P67 A; 1KC8 W; 3T1C A; 2P5O A; 2Y4T A; 1XMQ O; 5L3D A; 3D36 A; 1VP7 A; 1GRJ A; 5LMN B; 3PN1 A; 2GUZ B; 5FPO A; 1XMQ B; 1GAX A; 3FYI B; 2EIK B; 3DXR B; 4MVS A; 2ZT9 B; 3R66 A; 5B3S C; 2P4V A; 2Q4P A; 4CH6 A; 4MTG A; 3K79 A; 4O4I A; 4FLZ A; 4NB5 A; 1X59 A; 4QE7 A; 3F7Y C; 2VWJ A; 4X8A A; 1XI1 A; 2FTK A; 3OMN B; 4DYL A; 4PA6 A; 2LFR A; 2JJ2 G; 2Q0O C; 1U96 A; 3MAQ A; 4DUY B; 3AG4 B; 2NNU A; 4LFA B; 1MOF A; 2KQX A; 4IIJ A; 2ZNJ A; 2CDY A; 3BEH A; 1M4U A; 3ZRX A; 4JI2 B; 4DRX B; 4UVB A; 5LBQ A; 4DR6 B; 2K9P A; 2W6I G; 2WLI A; 4D6T H; 2LGQ A; 1N32 B; 2H8P C; 3SGI A; 1BL8 A; 4JI3 O; 1CP9 A; 1R3L C; 1YF2 A; 3SJQ C; 2PGG A; 3A2F A; 3APO A; 3RYC B; 2WLN A; 3ZRW B; 3TCU A; 3ZMZ A; 5DN6 G; 1W0J G; 2IH3 C; 4HZ3 A; 5KUM A; 3ZIA G; 2Y4U A; 4EEQ A; 1VQK V; 3N2G B; 1GTO A; 5FLX N; 3E8F A; 4KHP O; 2IJJ A; 4ZIB A; 5A9G A; 5LP6 B; 4FM2 A; 2A9H A; 3JAL B; 1S0V A; 1NR7 A; 2OCC B; 4MVQ A; 4OX9 O; 4OPH A; 4GLX A; 3ABM C; 2CTR A; 1VF7 A; 1FXH A; 2JIZ G; 4KHP B; 2JK5 C; 4TV8 A; 1XOU A; 1ZX3 A; 4OX9 B; 5BZB A; 1KQS U; 2KKW A; 1NTZ H; 5LA6 A; 3SPJ A; 2UXX A; 2ADP A; 3ASO C; 3CHX A; 2B1I A; 1JOY A; 2ZR2 A; 5CBG A; 2EIL C; 4WBN B; 1SZX A; 3D3I A; 2VS0 A; 5IJ9 A; 1Z5V A; 3SYC A; 2P22 C; 2JJ1 G; 4XBF A; 4X1K B; 1I08 A; 1N33 O; 1AP6 A; 3JD4 A; 1WN7 A; 3E8G A; 2HJD A; 2R9I A; 4UCV A; 1N33 B; 4ZOL B; 2WA4 A; 3CS5 A; 3ZMV A; 2LO1 A; 1HR0 O; 2VQF O; 4UFZ A; 5JCO A; 2HLD G; 3SJB C; 3WB0 A; 1M90 W; 1ZLZ A; 1PD3 A; 1YIT V; 3C3T A; 1HR0 B; 2VQF B; 4NXM B; 4YJ3 B; 5BMV A; 4PJ0 Z; 4PI2 A; 2EIM C; 4IHJ B; 2ZE7 A; 3A8T A; 3UCS C; 3G67 A; 3QG5 A; 1J95 A; 1JPX A; 4CC6 A; 3CD6 V; 3D8C A; 2ZIM A; 2X7R B; 4NKG B; 4DUZ O; 3OTO B; 4MVO A; 4LF5 O; 1S5H C; 1BMF G; 1K97 A; 5TIS Z; 4DUZ B; 1LR1 A; 3JAK A; 4H37 A; 3MDS A; 4F4L A; 4EB6 B; 4K8Z A; 4LF5 B; 3OW2 U; 2V1D A; 2QA4 V; 2BE3 A; 3HKC A; 4F6R A; 2BTO A; 2HR3 A; 3AG1 C; 4N21 A; 5KA5 A; 4E4E A; 5H5N A; 1QR9 A; 1Q82 W; 1EZJ A; 4NR1 A; 2EJ7 A; 1H2G A; 1SA0 A; 3RT3 C; 3AEI A; 2QWN B; 4J7K A; 2YXY A; 2E74 B; 2OIG A; 1Y6X A; 1UPG A; 3EFF K; 1B3Q A; 1FXK A; 2AHY A; 2M7W A; 2JS5 A; 3QF7 A; 2QWP B; 3O9O A; 3N2K A; 4GCZ A; 3HKE A; 4B08 A; 3OEE G; 3K5M A; 1B04 A; 3WFV A; 3BCC H; 3D3Q A; 5KHI A; 4X20 B; 3ABM B; 2Q7H A; 1AJQ A; 3W7U A; 4I4T B; 4LBE C; 2HEP A; 4DV3 O; 1KB9 F; 1KBH A; 1JFF B; 4BW9 A; 1W2B U; 2P06 A; 2N04 A; 4DV3 B; 2Y69 B; 2YEV B; 3ASO B; 4JYC A; 4UV8 A; 3WU2 Z; 4JTD B; 4LH6 A; 1LUV A; 5CA1 B; 3JSN A; 4JYA B; 2EZP A; 1Y74 B; 2WLL B; 3I5D A; 1QVF U; 2OYQ A; 3H1H H; 3JAT B; 5IJ0 B; 5GTI Z; 1K73 W; 1F4M A; 4BWA A; 4DR2 B; 2QWQ B; 1HP8 A; 1FJG O; 1RPR A; 1N34 O; 4JV5 B; 3UO3 A; 5IYD O; 1FKA O; 2F4V O; 4PEL A; 1FJG B; 1PL0 A; 4IYI A; 1N34 B; 3J80 N; 4RUF A; 1AB3 A; 4EFB A; 5J9P C; 1EN5 A; 2F4V B; 5LGN A; 3HKD B; 1GM9 A; 3EHB B; 1FFX A; 4RQF A; 1MZF A; 4JGS A; 1K33 A; 3E89 A; 4JTA B; 3TXQ A; 2UXC O; 4DO2 A; 1WB7 A; 1W0K G; 3UT5 A; 2QGN A; 4QPJ A; 5IDJ A; 2UUB O; 2UXC B; 1TUB B; 2B5U A; 2LW7 A; 3G6E V; 3E83 A; 1N36 O; 1I94 O; 4B7E A; 5IYC O; 4BR6 A; 3J7A U; 2IJI A; 3JD2 A; 2UUB B; 4B7K A; 3LDD A; 2EJR A; 4FLW A; 4UVC A; 1I94 B; 1XHX A; 4ZI7 B; 1VQ5 V; 3AG1 B; 4MT8 A; 3RGB A; 4BIZ A; 3ML0 A; 3ZCC A; 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