The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
|
sequence length |
69
|
structure length |
69
|
Chain Sequence |
SQQKIQAAEAELDLVTDMFNKLVNNCYKKCINTSYSEGELNKNESSCLDRCVAKYFETNVQVGENMQKM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural and functional requirements for activity of the Tim9-Tim10 complex in mitochondrial protein import
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein transport
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule keywords |
Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9
|
| total genus |
24
|
| structure length |
69
|
| sequence length |
69
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-07-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF02953 | zf-Tim10_DDP | Tim10/DDP family zinc finger |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim13 like domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CJH B; 2BSK A; 3DXR B; 3CJH A; 3DXR A; 2BSK B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4L8J A; 1H2L A; 3D3Q A; 4FM2 A; 4X20 A; 3X2Q C; 1SF9 A; 3ZHT A; 1ZLZ A; 3FYI B; 4NKG B; 1MMM A; 2Q7H A; 5LMU O; 2K9P A; 5IYZ A; 4U3J A; 1WB8 A; 4CH5 A; 3JD1 A; 1OCR B; 1OCC C; 3JCU Z; 1N8R W; 1XUQ A; 4IYI A; 4LF8 O; 3MD0 A; 4B3M B; 3CRA A; 1THZ A; 4I5S A; 3ZHR A; 5FNV B; 2CH7 A; 3VQV A; 3RW0 A; 3LUT B; 5J2U B; 5IYD O; 4JYC A; 1SA0 A; 4LR3 A; 1JJO A; 2IJH A; 1K33 A; 2DW4 A; 4F4L A; 2DOS A; 1JOY A; 2WLN A; 1N34 O; 2QE7 G; 3RBZ A; 1M1K W; 4MVS A; 1Q6U A; 3UT5 B; 4MW8 A; 4LBE C; 1UFI A; 2R70 A; 3ZMS A; 2ATK C; 3K04 A; 3PJS K; 2UUB B; 3DSQ A; 4QNH B; 2JVD A; 4DUZ O; 3WB2 A; 4QPK A; 3TXS A; 3KCY A; 5EC2 C; 1S72 V; 1OCO C; 1MOF A; 2DQ3 A; 5EYP B; 1VQ9 V; 3L71 H; 5LYJ B; 3BA9 A; 3TCU A; 2FB5 A; 3U0Z A; 5JQG B; 3APQ A; 3RYI B; 1SZT A; 1WLE A; 1OJH A; 1TGO A; 4X89 A; 4BIO A; 1G4Y B; 3JD2 A; 3ETE A; 4QIW F; 4O2A B; 4D6T H; 4LH7 A; 3BAB A; 2Y69 C; 2E3C A; 5A9G A; 1COW G; 2IU0 A; 4I50 A; 4B3R B; 1CP9 A; 5B1N A; 2FYU H; 1GH6 A; 3ZN1 A; 1VAR A; 1HWY A; 1SQV H; 2BCC H; 3AEI A; 2NNU A; 2KB1 A; 3CWB H; 4GZR B; 4FLZ A; 2HEP A; 4UV8 A; 2XAQ A; 1SER A; 2DYR C; 4R8C A; 3AG2 B; 2IBZ H; 4I55 B; 4B3S O; 3PN1 A; 1RPR A; 2E75 B; 4LNU B; 4DYL A; 2Q4P A; 4JAU A; 4N21 A; 4K8X A; 1R6K A; 3UO2 A; 1JJ2 U; 1K92 A; 2CTQ A; 4X65 O; 3ZX6 A; 3ETG A; 4HNA A; 1K9M W; 4X20 B; 1LR1 A; 5IY5 B; 1AI5 A; 1ZWI C; 4BW9 A; 1ZAU A; 5IYZ B; 4U3J B; 4G2K A; 1W59 A; 1FPO A; 4FLV A; 3L72 H; 5E1A C; 2ZIO A; 5KLV H; 5CA0 A; 4LF6 O; 1H2N A; 5FLX N; 3SPC A; 4DK0 A; 2IH1 C; 3X2Q B; 1GN6 A; 1YJ9 V; 1RPO A; 4NTY A; 3UKM A; 1KQS U; 3E8H A; 3K5O A; 4RO2 A; 2CH7 B; 3FAV A; 3BHP A; 1OCC B; 1A32 A; 3K0G A; 2ZIM A; 2XOK G; 1ZL8 A; 5H6R A; 4JI2 B; 4X64 B; 1QVF U; 4FFK A; 3JAM N; 4UV9 A; 2QWP B; 5J2T A; 1SS3 A; 4DUY O; 1GN3 A; 5LA6 A; 5LGT A; 2CGN A; 1H8H G; 2KG7 A; 2ZT9 B; 1WPX A; 3SJQ C; 2Q73 A; 2WLL A; 1ORQ C; 2LW7 A; 2R72 A; 1PKX A; 3CEI A; 3R65 A; 3LSS A; 4PA6 A; 3TGU H; 1UPG A; 3J81 N; 3RN4 A; 4KP4 A; 2LO1 A; 5HFL A; 3SGI A; 4GYC B; 4JAV A; 1RM1 C; 4LF5 O; 3QF7 A; 4EB6 A; 4X1Y A; 1BS3 A; 1R3L C; 1WP7 A; 2ZNI A; 1WNS A; 2DQ0 A; 2D2C B; 5IT9 N; 4YY3 O; 3VQX A; 1NS1 A; 3CD6 V; 3S3X A; 4FLW A; 4YXW G; 1N0N A; 4UUJ C; 2WA3 A; 4DV2 O; 3JCZ A; 2XAH A; 3NXS A; 4JI1 O; 5JJJ B; 4OPA A; 4FMT A; 2F4V O; 4KHP B; 4MW3 A; 3OMI B; 2E76 B; 4I50 B; 3B40 A; 2NLJ C; 4UB6 Z; 4H13 B; 3OE7 G; 2FKX A; 4PDM A; 4WFF A; 1F4M A; 5LL6 Y; 5KUM A; 2HFE C; 2Y69 B; 1S77 D; 2IM9 A; 4DRX A; 5L3E A; 1S76 D; 2P5O A; 2DJV A; 3UM7 A; 1XHX A; 1KBH A; 1Y66 A; 5CN0 A; 5IDJ A; 2EIK C; 1Y67 A; 2WLJ A; 4DV5 O; 4RAI A; 3HKB A; 1K5S A; 4J9Y B; 1FYJ A; 2GBO A; 1FXH A; 4RQE A; 4WCE V; 4W4L A; 2ZNJ A; 2DYR B; 4B7E A; 5IE9 A; 4X62 O; 3CJH A; 1DK1 A; 4LFA O; 1Z5V A; 4X1I A; 2YXY A; 3SPH A; 2QSA A; 2YXH A; 3JD4 A; 4HNA B; 2UUC O; 4O4L A; 1OCZ C; 5AG2 A; 4O4I B; 4W4K A; 3APO A; 4RWU A; 1XDC A; 2AXT Z; 4UB8 Z; 3C3S A; 1N36 B; 3STL C; 5CBG A; 4F6R B; 1HR0 B; 2Y4U A; 2QWN B; 1R3K C; 3OFN G; 1FXK A; 2CUG A; 3E2E A; 3T1H B; 1IBK B; 2QEX V; 2FML A; 1NT2 B; 5B3S C; 4JPR A; 2ZR3 A; 4TWK A; 4UCS A; 1HNX B; 3IC7 A; 2FTK A; 3AG3 B; 1H2M A; 1F4N A; 4JZG A; 3ZN0 A; 4UVB A; 3WB1 A; 4PHZ A; 1ZL8 B; 1K3E A; 1PM9 A; 3CS5 A; 4P9O A; 5CBH A; 4ZOL B; 2GTA A; 5CB4 A; 1B6Q A; 2EJR A; 4JI8 B; 1KKD A; 1LUW A; 5J2T B; 2LJ2 A; 3AG1 C; 2V7Q G; 2XUM A; 4LFB B; 2WLI A; 2KG7 B; 2AZ2 A; 4CZZ A; 2P67 A; 3W7T A; 3SJB C; 1FJG B; 4RQF A; 1HW7 A; 2WLL B; 2EIM C; 3E8F A; 4UFZ A; 5ITZ B; 1QVG U; 2YEV A; 1LNQ A; 4ZIB A; 1YXB A; 3B09 A; 2HHH B; 4DR1 B; 1MZF A; 2DYS C; 3A0R A; 1O9G A; 4X1Y B; 4J80 A; 2ZXW C; 3SPI A; 4IT5 A; 3RYC B; 2K1E A; 3ABU A; 1VF6 C; 2P4K A; 1R1B A; 5KMG A; 4GX1 A; 2UXC B; 1BGY H; 2WPD G; 3HR0 A; 3RYF A; 1TVK A; 1HNZ B; 4YJ3 A; 3VBB A; 4H44 B; 5EK0 A; 2YC0 A; 3P32 A; 4UCR A; 1NVP D; 3SYA A; 2XAG A; 3VOU A; 1EZV H; 4ABM A; 3HKD A; 4FLX A; 5JCO C; 3A2F A; 1KP2 A; 2XAJ A; 5IJ9 A; 1P7G A; 1PV0 A; 2RNB A; 5KHI A; 4JYA O; 4DRX B; 2UUA B; 2GSM B; 3T1Y B; 3KG2 A; 1AR1 B; 3K3W A; 1XMO B; 5LOV A; 1N0J A; 4QPJ A; 1MG1 A; 1IBM B; 3QVN A; 3K5N A; 4LCU C; 3HKB B; 4XDL A; 1J5E B; 4DV1 O; 1FKA O; 1KP3 A; 1VQ5 V; 2HJF C; 5LMN B; 3CJH B; 3A8T A; 2CDY A; 4X1I B; 4NXM O; 4I0X B; 2WLH A; 3L9D A; 3AK2 A; 3OR7 C; 1U96 A; 4O4L B; 1YCI A; 2VQF B; 3CCR V; 5FPR A; 3P3N A; 3ABK B; 3OUF A; 1VQN V; 1K7D A; 3JAS A; 1Q86 W; 5FNV A; 1Q5O A; 1AVM A; 5J9P C; 5J2U A; 1YIJ V; 4NR1 A; 1OCZ B; 3QO7 A; 1FXK B; 5LP6 C; 1R6N A; 3CCU V; 1L1F A; 4LF9 B; 3F5T A; 4HZ3 A; 4JZ2 A; 4DV7 O; 4DXW A; 2E5L B; 3C90 A; 1XL4 A; 4OXS A; 2GV9 A; 1TUB B; 3UT5 A; 4FZ1 A; 3H9V A; 4LF4 B; 4G27 B; 4JV5 O; 4JGS A; 2H94 A; 5EC1 C; 4J41 A; 1GMG A; 1MSW D; 1XNR B; 5B3S B; 3JD3 A; 1V54 C; 1OZ0 A; 3DTU B; 1S0V A; 3ZRX A; 1BL8 A; 2WLI B; 1N4C A; 5EYP A; 1JMK C; 3CMA V; 2PYL A; 5LYJ A; 2YIB D; 2CTP A; 3RYI A; 4LF7 B; 1NJI W; 5B1O A; 4GKJ O; 2P6J A; 1GAX A; 2ODM A; 3ABT A; 2AW9 A; 2UXB O; 3CHX A; 1E79 G; 1SKV A; 3CCJ V; 4J42 A; 1R6T A; 3HB3 B; 5K1P A; 1IX9 A; 5GTH Z; 2QA4 V; 2WWW A; 4B3T B; 1N32 O; 3BEH A; 3ZIA G; 2EIM B; 4JI7 B; 1AI4 A; 4CS2 A; 1PP9 H; 5KMG B; 1B3Q A; 1XMQ B; 4X66 O; 2W0X A; 1D2D A; 2FL4 A; 2DYS B; 1U97 A; 1V55 B; 3GWK C; 1TVK B; 4TSF G; 2ZXW B; 5CA1 B; 4YJ3 B; 2MK3 A; 1VP7 A; 3JAT A; 1VF7 A; 4H33 A; 1QNM A; 3HKD B; 2ZDI C; 4O4H B; 4I55 A; 5IJ9 B; 2QWR B; 1KD1 W; 4XDK A; 4GLX A; 5K1X A; 3FB5 C; 1F7Y A; 3ABL C; 4QJF B; 2UXD O; 5LOV B; 1AI6 A; 1KYO F; 4JI6 B; 4E4E A; 5GON B; 4CS3 A; 3IFX A; 3JAR A; 2EZP A; 2ZCE A; 1M4U A; 4B3M O; 2XAS A; 3CXC U; 1XHZ A; 3D36 C; 1SC5 B; 1SRY A; 2ZE6 A; 2BOC C; 3N2K A; 5GW7 A; 3EVK A; 3G67 A; 3JAS B; 3ZED A; 1WPB A; 3BPZ A; 5E79 Z; 4WF9 V; 2XND G; 1IBL B; 2ZM6 B; 4CS4 A; 2KQX A; 4EKW A; 3JAW B; 2CE4 A; 4XBF A; 2H8P C; 1S5L Z; 1DF5 A; 1L8D A; 1X59 A; 4R6Z A; 1AB3 A; 2UUB O; 2YSU B; 2RMK B; 4IHJ A; 1H2S B; 1Q81 W; 1N33 B; 2QTS A; 5EIB D; 1WJZ A; 1T5E A; 1NVP B; 4MVU A; 3QTC A; 3ASO B; 1MAB G; 4FLT A; 3WU2 Z; 2R9A A; 3FX7 A; 2QDO A; 1B06 A; 5LXT B; 1RSO A; 4MTX A; 1V54 B; 1JCH A; 1VEW A; 3CX5 F; 1IXB A; 3NR7 A; 5KA6 A; 4UCT A; 2AGA A; 1YTF D; 2JDI G; 4B3R O; 1QR8 A; 4MTG A; 2RQ6 A; 2HP8 A; 5H2F Z; 1MZE A; 4PI0 A; 3N2G A; 2Q7E A; 3IC9 A; 4DV4 B; 3ASN C; 2A06 H; 3T2M A; 5LGN A; 4PDR A; 1KUQ A; 3JAT B; 2YID A; 2CAZ C; 4JI5 B; 3ZJZ A; 1W0K G; 5EIB C; 4OPH A; 2HKO A; 3MHH C; 1F51 A; 5H5N A; 1ZTE A; 2R9I A; 3ZBH A; 4ZKI A; 2QWO B; 4PEL A; 3ZRW A; 1BQZ A; 3STZ C; 4AQY B; 4AI8 A; 2Q0O C; 5D5P A; 4MTO A; 2W0F C; 4AHC A; 3T4D A; 3JAR B; 3QO8 A; 1VF5 B; 3DC6 A; 3CRM A; 2CK3 G; 4O4I A; 3ZHU A; 4BIZ A; 2VQE B; 3ABL B; 2Q68 A; 3T1C A; 2YIA A; 1AI7 A; 1XL6 A; 2M7W A; 4F6R A; 1I08 A; 3CCL V; 1PL0 A; 3N2K B; 1J95 A; 4GX5 A; 4EEQ A; 2Q69 A; 3JSL A; 5DED A; 3ZMV A; 2QKS A; 4GX0 A; 3LDD A; 3LDC A; 1K34 A; 4JI2 O; 3ZHV A; 2DMX A; 1GRJ A; 4X64 O; 1Q90 D; 5H9C A; 2EX3 A; 4LFC B; 3FB8 C; 4P2Z A; 1E1Q G; 3U10 A; 4ZOL A; 3B4S A; 2YIC A; 2PY5 A; 4IHJ B; 5LBQ A; 1PPJ H; 5C8Y B; 2YXL A; 2LFS A; 3U11 A; 4NTX A; 4JTD B; 3RVY A; 1GO3 F; 3MAQ A; 2YS8 A; 5ITZ A; 4NTW A; 2B1I A; 2OTL V; 1BQ0 A; 3CE2 A; 2EIN C; 3WG7 C; 2QKA A; 4J11 A; 4DV6 B; 2Q0A A; 4FIP C; 3DXR A; 1KKC A; 1M93 A; 4CC6 A; 1RSO B; 2JS3 A; 5JH7 B; 1MSD A; 3FB7 C; 1WB7 A; 4DR4 B; 3OR6 C; 3G4S V; 1AR4 A; 3RYC A; 2JRI A; 1OCO B; 4NVP A; 1H38 A; 1Y76 B; 4KHP O; 1NR7 A; 1BE3 H; 4FVM A; 5BY1 A; 4JF3 A; 2ITD C; 4LWS A; 1JQ0 A; 2HJD A; 3N2G B; 3ZMZ A; 4X8A A; 4BWA A; 3GB7 C; 1YSC A; 3F7Y C; 3SYC A; 4Z1V A; 5BMV B; 1NTK H; 2W6I G; 1UJW B; 2BTO A; 2Z0A A; 2B1G A; 1FFT B; 4CBC A; 1XIL A; 5LHH A; 4F6E A; 1NKD A; 4PJ0 Z; 5EBW C; 1AP6 A; 1XI1 A; 3H01 A; 3G71 V; 2WA4 A; 2QWQ B; 3B8M A; 4I9Q A; 4IGG A; 1GN4 A; 3ZRW B; 4DV3 B; 4KL1 A; 4I0X A; 4YIO A; 4YHH O; 3EXA A; 3VQW A; 2VWK A; 2LP7 A; 1JPX A; 1N36 O; 2JGD A; 3K59 A; 4IL6 Z; 1VQ4 V; 3ETD A; 3E8G A; 1EN4 A; 1HNW B; 2X6B A; 1HR0 O; 1I5X A; 3IGA C; 4FJC C; 4KFM A; 3CME V; 1BHB A; 4TV9 A; 5EZY B; 3O65 A; 5KUK A; 3T1H O; 4DO2 A; 1IBK O; 3W7U A; 3OGI B; 4WFG A; 3HKE A; 1HNX O; 2A3Q A; 3OEE G; 1IUR A; 3P30 A; 2QM4 A; 4OX9 B; 2IU3 A; 1VQM V; 1YTF B; 1TUB A; 3BRC A; 4FFB B; 2GUZ A; 1SQP H; 2JEU A; 4ZHQ A; 4JI8 O; 2ZE5 A; 4K35 A; 2WAM A; 3ZMT A; 2IJK A; 2YDE A; 4EFE A; 4P9P A; 3L75 H; 1W2B U; 4LFB O; 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2JGD B; 2OT5 A; 4K0K B; 4BAY A; 3E35 A; 4TV9 B; 4DV1 B; 4JI3 B; 4LF9 O; 3J7A U; 2AHZ A; 4PDV A; 3JAW A; 2OIE A; 5IWA B; 5KHJ A; 2E5L O; 2RDC A; 3HKE B; 3D8C A; 4J7K A; 1DF4 A; 3HKC A; 1Q6H A; 4LF4 O; 3A0H Z; 4JI4 B; 3OD4 A; 1WA8 B; 2XHB A; 2CTR A; 1IDS A; 3OAA G; 2RCV A; 3SYO A; 2GUZ B; 2OCH A; 3RVZ A; 2LW1 A; 2XAF A; 5BR8 B; 4ZHQ B; 5LHG A; 1XNR O; 1YI2 V; 5JWP A; 5LP6 A; 3A0B Z; 3ZCC A; 4MSW C; 2QGN A; 4UCO A; 4TV8 B; 5KHG A; 2ZD9 A; 1AJP A; 1G6U A; 3KZI Z; 2Y4T A; 4DR3 B; 4LF7 O; 3L74 H; 3SR2 C; 3C3T A; 3RYH A; 3UQ8 A; 1PNL A; 4LP8 A; 3Q4H B; 1QHT A; 5L3D A; 4ICG A; 2OTJ V; 5LXT A; 2PYJ A; 2PTM A; 2F93 B; 3W7X A; 2V4D A; 4B3T O; 1YHQ V; 3AG1 B; 3CB2 A; 1OHH G; 2A7W A; 4JI7 O; 1D5A A; 1FFX A; 4O2B A; 1Y74 A; 3CCE V; 1XMQ O; 4FLY A; 1SQF A; 5JVD B; 2RJZ A; 1MNG A; 2Y0I A; 5CA3 A; 4E2L A; 1I94 B; 1QCE A; 2UU9 B; 3SYP A; 4FM1 A; 2IH3 C; 4DR2 B; 3N27 A; 1P84 F; 2ZKO A; 1GM7 A; 3BVO A; 3JYC A; 5IJ0 A; 5BXZ A; 4L87 A; 2KKW A; 4QE9 A; 3OGC C; 2QM7 A; 4U3F H; 3EFF K; 1EN6 A; 3AG2 C; 2Q6A A; 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