The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
70
|
structure length |
70
|
Chain Sequence |
EEEELVDPLTTIREHCEQTEKCVKARERLELCDARVSSRSHTEEQCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNKLK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Electron Transfer by Domain Movement in Cytochrome Bc1
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
UBIQUINOL-CYTOCHROME-C REDUCTASE COMPLEX CORE PROTEIN I, MIT
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| total genus |
21
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| chains with identical sequence |
U
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-04-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SQX H; 1NTK H; 1SQV H; 3L71 H; 1BGY H; 3CWB H; 2IBZ H; 3L75 H; 3L74 H; 3L70 H; 4D6T H; 3H1H H; 1PPJ H; 3H1L H; 1L0N H; 1SQQ H; 1NTM H; 1EZV H; 1P84 F; 1KYO F; 3CX5 F; 1L0L H; 3TGU H; 5KLV H; 1BE3 H; 3H1I H; 1KB9 F; 1SQP H; 3H1K H; 1NU1 H; 1SQB H; 4PD4 F; 3L73 H; 1NTZ H; 2A06 H; 3H1J H; 3CXH F; 1PP9 H; 4U3F H; 3L72 H; 2BCC H; 3BCC H; 1BCC H; 2FYU H; #chains in the Genus database with same CATH topology 4C7U A; 2F66 C; 4FMT A; 4UB8 Z; 1IBM O; 1PL4 A; 3FYE B; 5LL6 Y; 4D6T H; 5EIB D; 4J9Z B; 3F5T A; 5IJ9 B; 1MMM A; 3ZRW B; 2D3O W; 4DW1 A; 1JOY A; 4K35 A; 1OCZ B; 5JVD A; 2WSS G; 2OIG A; 5IYZ B; 3ABL B; 2AXT Z; 3FYI B; 1VAR A; 3HB3 B; 3I56 V; 4GLX A; 4I0X B; 1BT8 A; 3K57 A; 4J42 A; 5GTH Z; 2QWP B; 4I55 B; 3ZCC A; 1QLE C; 2JDI G; 3N2K A; 4FFB A; 3ZHQ A; 3OR7 C; 1IXM A; 4HYO A; 1XMQ O; 2Y69 B; 1S5H C; 4X89 A; 4DYL A; 1R6K A; 2ZXW C; 3CE2 A; 5IY5 C; 2QWO B; 1N36 O; 2ADP A; 1QLN A; 4YY3 B; 2ATK C; 3TJT A; 1IBK B; 5LGU A; 3DC6 A; 1GN3 A; 4ZOL A; 2ZM6 O; 2UU9 B; 1PNM A; 3PJS K; 4LNU A; 1US6 A; 5CA3 A; 4DR7 O; 1IVS A; 4NB5 A; 3T1Y O; 2PY5 A; 3RYH B; 3CD6 V; 1L8D A; 1VQ6 V; 3HKC A; 5GON A; 5L3E A; 3O65 A; 4O2A A; 2DWD C; 5LMN B; 4LFA O; 4ZI7 A; 2EZP A; 1K92 A; 2VWJ A; 2YIB D; 1ZTE A; 1WN7 A; 5KHK A; 2X6C A; 2V1D A; 4R7C A; 4GKJ B; 3SPC A; 3I55 V; 5BMV A; 1OCC C; 1JFF A; 2OT5 A; 1MA1 A; 3H1J H; 1XBL A; 3LDD A; 4U3J A; 5K1X A; 4OXS A; 1QCE A; 2ARH A; 5CB4 A; 1DF4 A; 4X64 B; 1E1R G; 3E22 A; 4PJ0 Z; 4FLZ A; 2FKX A; 5B1O A; 2NLJ C; 1YDX A; 1WA8 A; 1JR9 A; 1YXB A; 1VP7 A; 1JA8 A; 1N0J A; 2LFS A; 2NR5 A; 4YIP A; 1BZK A; 3K5N A; 1M56 B; 4B3S B; 5AG2 A; 1AJN A; 2YXH A; 2YEV B; 2XUM A; 1QHT A; 3OM3 B; 1M5I A; 1TGO A; 1XL6 A; 1TUB B; 4D7S A; 2IH1 C; 4L8J A; 3IC7 A; 2VQF O; 1SRY A; 1U96 A; 4JF3 A; 4TV8 A; 3K9A A; 4FPP A; 4X8A A; 1K33 A; 4MSW C; 4KHP O; 4PI2 A; 2ZCE A; 5KUM A; 4TUY B; 5IWA O; 3H1I H; 5L3B A; 4G2K A; 1SQP H; 1QNM A; 1Q81 W; 4H44 B; 3X2Q B; 1JVM A; 3FB6 C; 2AZ2 A; 3A0H Z; 3OMI B; 3JD2 A; 4JTD B; 4GCZ A; 4TT3 G; 1AIL A; 2YC0 A; 3FX7 A; 2JIZ G; 3D3I A; 4MVM A; 4QJF B; 5GTI Z; 2CTR A; 4X1K B; 3AG2 B; 1Z5V A; 3JAW B; 4RUF A; 4EFB A; 1BMF G; 1GK9 A; 4ASU G; 3OR6 C; 3JAR A; 4FM0 A; 1N0N A; 2A06 H; 1Y74 B; 2EX3 A; 2CTP A; 1AR5 A; 1K34 A; 4BIU A; 1FS0 G; 2F43 G; 2HVK C; 2Y4T A; 4DRX B; 1VEW A; 4O4L A; 3JAS B; 4CH4 A; 1K5S A; 3E8F A; 1R1B A; 2LGQ A; 1NJI W; 5DED A; 3UCS C; 1NH2 B; 1IUR A; 5CA1 A; 3T2M A; 4YY3 O; 2NNU A; 4IIJ B; 4J11 A; 4JI5 B; 1ZLZ A; 3OGC C; 5EC2 C; 1GN2 A; 3L72 H; 2Q6A A; 1IBK O; 2ADQ B; 1ZSP A; 3H01 A; 4JAS A; 3CPW U; 3P30 A; 4GUN A; 1CEZ A; 3FB5 C; 2UU9 O; 2YIC A; 2UUC B; 2E75 B; 1R6N A; 3HKB A; 1EN4 A; 1M4U A; 2WA3 A; 2CH7 B; 3CJH A; 4JI3 O; 2EZO A; 3F5W C; 2OTL V; 3F7V C; 4ZHQ B; 3M7M X; 3N27 A; 3OT7 A; 4NXN O; 3K59 A; 3T1C A; 1B06 A; 4LF5 B; 4RUE A; 5IJ0 B; 1HW7 A; 3RW0 A; 4QPK A; 1QQC A; 2XAF A; 4RQF A; 1D5A A; 2BSK A; 3ZMV A; 1LUV A; 3JYC A; 1KP2 A; 2DYR B; 4DR4 B; 2FTK A; 4LF4 O; 1Q90 D; 5IYD O; 1VMG A; 2ZIM A; 2Q7H A; 5CBF A; 2ZE8 A; 3NXS A; 3JD4 A; 5KHI A; 1J5E B; 2KG7 A; 1MAB G; 4JYA O; 3N2G B; 5KX5 A; 1KUQ A; 3C3S A; 4FLX A; 5L3D A; 3ZIA G; 3ZRS A; 1EBO A; 2JVD A; 3O9O A; 4K8Z A; 3CRR A; 1GTO A; 4DXW A; 4B3S O; 2AZ0 A; 3CCS V; 3BA8 A; 2LGW A; 3U11 A; 2UXC B; 2HG5 C; 3ABK B; 4DO2 A; 2EIN C; 5J2T A; 3HKD B; 1BL8 A; 1SQV H; 4X66 B; 1H2N A; 5LA6 A; 4X1I A; 4GX2 A; 1FYJ A; 4EB6 B; 1XDC A; 2QA4 V; 3K03 A; 4BW5 A; 2QM4 A; 1H38 A; 1XRE A; 1IDS A; 3SYO A; 3D36 A; 3FAV B; 3D8C A; 4HNA B; 3B2E E; 1NBM G; 4UCT A; 1YF2 A; 3OMA B; 2Y4U A; 1Q86 W; 4Q6G A; 1J95 A; 4F6R B; 1XI1 A; 3DXR A; 4MVO A; 3MD0 A; 3MAQ A; 2HR3 A; 2ITD C; 5IYC O; 1V9P A; 3WB2 A; 2M7W A; 1NKD A; 4ICG A; 5LP6 B; 3A0R A; 5B1A B; 3VQY A; 3OEE G; 2MW2 B; 3SYA A; 2B5U A; 3RWR D; 4ZBM A; 2QKS A; 2WLH A; 4R50 A; 2HEP A; 1FPO A; 5IDJ A; 4NXM B; 3JAL A; 4A5U B; 5LOV A; 4JI5 O; 4D7T A; 3KCX A; 4JGS A; 2BOC C; 2M6Y A; 4CC5 A; 2YIB A; 2E76 B; 3SR2 C; 3CRM A; 2UUA O; 1G1X B; 3AK3 A; 2EIJ B; 3H1L H; 4G27 B; 2WPD G; 4WBN A; 1D2D A; 3E8B A; 2W6J G; 1SZX A; 3EXA A; 1NH2 D; 4DR2 B; 1K8A W; 4LFC B; 2X6A A; 4I4T B; 3GWK C; 3BAA A; 4O2B A; 1YI2 V; 2QWR B; 3KKY A; 2RQ6 A; 2QEX V; 3BA9 A; 4I5S A; 3JAK B; 4KP4 A; 3J81 N; 1NZ6 A; 4UB6 Z; 1N32 O; 2ZE6 A; 4BR6 A; 3RGB A; 5H5N A; 3H9V A; 1EM1 A; 4DUZ B; 5LYJ B; 4TSF G; 1V54 B; 1N4C A; 4PDL A; 2EIK C; 1J5E O; 3E35 A; 1WAZ A; 3UQ8 A; 3SJQ C; 1AI6 A; 2ZR2 A; 3JD1 A; 4K0K B; 1H2G A; 3QO8 A; 1L0L H; 1SQF A; 2DN9 A; 5C8Y A; 5EIB C; 3W7T A; 4DV1 O; 4TV9 B; 2WLI B; 2EIM C; 1YTF B; 3SJA C; 4JTA B; 3KG2 A; 4OPA A; 4I50 B; 3W7U A; 3K06 A; 2DWE C; 3JAM N; 1JPX A; 1HNW B; 1TVK A; 4LWS A; 4YJ3 B; 3AG7 A; 1MNG A; 1KYO F; 3OUF A; 3D36 C; 1W0K G; 2XT9 A; 4IYI A; 1KQS U; 1XHZ A; 1Q6H A; 3QG5 A; 2BOB C; 2RNB A; 2CGN A; 1SET A; 4B7E A; 3VQV A; 1ARO P; 2DYS B; 3L74 H; 5EC1 C; 4GKK O; 4WFB V; 3AG1 C; 1HNZ B; 1SQG A; 3JAT A; 3RYI B; 1EZV H; 5IJ9 A; 4FZ1 A; 4WCE V; 3TGU H; 4JI1 B; 3ASN B; 5B5E Z; 3K0G A; 5IYZ A; 3OAA G; 1PP9 H; 4LH7 A; 4MVU A; 1R3L C; 1QVG U; 1N8R W; 1BGY H; 3ETD A; 4UCS A; 4YJ2 B; 2YID A; 4I55 A; 4QGP A; 1KEC A; 1XL4 A; 2XAS A; 3SYQ A; 3CEI A; 3RVZ A; 5LHG A; 4AQY B; 5KAI Z; 1OZ0 A; 1Z5W A; 4UCV A; 3ZMS A; 5JWP A; 2YS8 A; 4JYB A; 5DN6 G; 4O4J A; 1H2L A; 1NI8 A; 1M57 C; 1PV0 A; 1FFX B; 4QPJ A; 1RSO B; 2EJ7 A; 4DR2 O; 3RYH A; 2RCV A; 2V7Q G; 1YJN V; 1Y76 A; 4QNH B; 4JI0 B; 4MS2 A; 4JZ2 A; 2QJ1 A; 1KC8 W; 2ZXW B; 5IY5 B; 1V55 B; 1YJW V; 3Q4H B; 1XEQ A; 3DC5 A; 3PN1 A; 2QE7 G; 2HHH B; 2LQT A; 3MHS C; 2QR4 A; 3UO2 A; 1YJ9 V; 2EUL A; 4JI8 B; 1SQQ H; 3J7A U; 3U10 A; 5IE9 A; 2F4V B; 3ABM B; 4DUZ O; 3A8T A; 3TXQ A; 3ZJZ A; 5EYP A; 1H2K A; 2CTQ A; 3BAB A; 2Q5Z A; 2IJK A; 2ZNI A; 5LMU B; 1FJG O; 1URF A; 4IGG A; 4DV6 B; 2FYU H; 4GX5 A; 3HPL C; 1Y4M A; 4RQE A; 4OGQ B; 4DV4 B; 1E1Q G; 4LCU C; 4I9Q A; 4LF7 B; 4FLW A; 4CH5 A; 3A2F A; 2ZNJ A; 2YSU B; 2P7T C; 5FNV A; 5H2F Z; 1OJH A; 5CA0 A; 3APO A; 4LR3 A; 2Q8V A; 2YEV A; 2EIL C; 1WJZ A; 2R72 A; 2ZT9 B; 1TUB A; 4PA4 A; 1OCO B; 4DR3 O; 4JI2 O; 2OCC C; 1HNW O; 1PNK A; 1AJQ A; 1I08 A; 4ZIB A; 3FD9 A; 1YZB A; 4TUY A; 4CC6 A; 4JV5 O; 3BRC A; 2ZE7 A; 4MTG A; 4PA6 A; 5LXT B; 1YTF D; 3ZHS A; 2GUZ B; 1OCZ C; 1PNL A; 4DUY B; 2KSD A; 3LSS A; 3ABL C; 4MTX A; 2Q69 A; 1XUQ A; 3K5O A; 1HNZ O; 1AP5 A; 2QKA A; 4IYH A; 4X1K A; 2Y48 A; 3JAW A; 4F4L A; 1HR0 B; 4X1Y B; 1Y74 A; 2XAG A; 2YDE A; 1NR7 A; 3ETG A; 2Y69 C; 3C90 A; 4DRX A; 2AHY A; 2E3C A; 2GTA A; 3NR7 A; 2DMX A; 4L87 A; 2QDO A; 2BE3 A; 4AQY O; 5H6Q A; 4PEL A; 1HDJ A; 1HNX O; 4MVZ A; 1XQ8 A; 4RWU A; 4IIJ A; 3ZHU A; 3AG3 B; 1AP6 A; 2QTO A; 3N2K B; 4FFB B; 4IHJ B; 4FLV A; 2P4V A; 1JMK C; 1GKF A; 2VQE O; 3WG7 B; 2LO1 A; 4FFK A; 2LP7 A; 1CXZ B; 2JJ1 G; 2IU0 A; 1S3J A; 1FXV A; 2CH7 A; 3STZ C; 1NTZ H; 3CCJ V; 5E1A C; 1AVM A; 3B09 A; 4NTW A; 1L1F A; 3RFR A; 4J80 A; 5JQG B; 3SPJ A; 2F95 B; 3ZHV A; 2L35 A; 2Y0P A; 1CPY A; 3AK1 A; 4J10 A; 5IJ0 A; 2HHH O; 1GN4 A; 3G6B A; 4JI8 O; 2WLL B; 2WLJ A; 3HKC B; 2FL4 A; 4K3A A; 2ZQM A; 1YEW A; 4CS4 A; 1YSC A; 5LMU O; 1M9N A; 3CC7 V; 1ORQ C; 2BCC H; 3JCZ A; 1R3J C; 5BZB A; 1VQK V; 2Q73 A; 2HKO A; 2UXD B; 1XNQ B; 3CP1 A; 4EFE A; 3E86 A; 1DK1 A; 2H94 A; 5B1B B; 1MSD A; 4XDL A; 4LF7 O; 1R73 A; 3GB7 C; 3SGI A; 3OTO B; 1JFF B; 1LR1 A; 2XAQ A; 4UCR A; 4CS2 A; 3E22 B; 2P6J A; 1OCR B; 2WAM A; 1UFI A; 1PD3 A; 1I94 B; 4LFB B; 5JCO A; 4UV9 A; 3CCR V; 4MTO A; 3HKD A; 1AI5 A; 3RT3 C; 3E8H A; 1F23 A; 4NVP A; 1NS1 A; 3X2Q C; 1GM7 A; 3EVK A; 5CMU A; 2QGN A; 5KHJ A; 1G6U A; 4O4I B; 1KU9 A; 2WWW A; 3RYF B; 2NN4 A; 3ASO B; 4G28 B; 5LMN O; 4Z2W A; 2EJR A; 3AG2 C; 5EBW C; 1JJO A; 4TV8 B; 4NTX A; 5FLX N; 1K3E A; 2A79 B; 4H13 B; 1XHX A; 5DM6 V; 4HNA A; 1K4D C; 2HVJ C; 3RBZ A; 4GKJ O; 4P9P A; 5KAF Z; 3VBB A; 5KLV H; 1M90 W; 4F6R A; 3K79 A; 1JQ0 A; 5JJJ B; 2LFR A; 4XDK A; 4X64 O; 1KD1 W; 4HAM A; 2B9Z A; 3M99 B; 3CRC A; 5IYB O; 3CME V; 4DV0 B; 4MW3 A; 1AB3 A; 2LW7 A; 2A9H A; 1FAF A; 5LHI A; 3JAR B; 1YVW A; 2YXY A; 4FK5 C; 2ZR3 A; 2GBO A; 3SJB C; 2ZIN A; 1QR9 A; 1I0H A; 1B6Q A; 2GSM B; 4ABM A; 4AIL C; 1XNR B; 3ML0 A; 5H6R A; 2PTM A; 3MDS A; 3L71 H; 1IZ3 A; 2BTQ A; 2DJV A; 2H8P C; 4E2L A; 2ZDI A; 3LNN A; 3OGI B; 4J9Y B; 4QIW F; 5CA1 B; 4OX9 B; 4BAY A; 5BXZ A; 3CCE V; 2G38 A; 4WFH A; 2A3Q A; 5EBL C; 4WFE A; 2DYR C; 1P49 A; 3JSN A; 4I4T A; 2P06 A; 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2R9I A; 1T5E A; 3ZRX A; 1IBM B; 3CS5 A; 3ZS8 C; 2DQ3 A; 4LP8 A; 2K1E A; 2PZS A; 3APQ A; 4TWK A; 4YJ2 A; 2W0F C; 3DXR B; 3CXC U; 2XND G; 2CDY A; 2HFE C; 3LSQ A; 4DV3 B; 2ZDI C; 2QM8 A; 2EIJ C; 3BEH A; 2UXC O; 5FL7 G; 2IJH A; 1H2S B; 2CE4 A; 1XNR O; 4GYC B; 3QTC A; 5EZY B; 3IJ4 A; 1N34 B; 5EK0 A; 5E79 Z; 4X66 O; 3BY6 A; 4DK1 A; 1R3K C; 3CCM V; 1UJW B; 5JH7 B; 4OX9 O; 2C2A A; 4DV2 B; 4FZ0 A; 4LBE C; 5L3G A; 3B8M A; 1WP8 A; 1KB9 F; 3T1H B; 5JJN B; 3E89 A; 3FKS G; 1KKD A; 3G4S V; 1DGS A; 4Q20 A; 5D5P A; 4X62 B; 2GDS A; 1P7B A; 2A7W A; 5ITZ B; 1WP7 A; 3H1H H; 1W2B U; 1V54 C; 4WBN B; 1GM8 A; 4EEQ A; 3Q4H A; 1L0N H; 3ICX A; 4AI8 A; 4DR7 B; 2QKC A; 3K9S A; 2Q0A A; 3CX5 F; 3ZRW A; 4BW9 A; 4X9Q A; 3H1K H; 3WU2 Z; 4KFM A; 5CBH A; 3OTF A; 4N23 A; 1GMG A; 2JJ2 G; 3ETE A; 1P7G A; 4TOI A; 3OW2 U; 3K04 A; 4YHH O; 5A9G A; 4MTF A; 4I0X A; 2PUS A; 4H37 A; 2B1G A; 5TIS Z; 3RYC B; 3OE7 G; 3E83 A; 4WF9 V; 2H3O A; 1N33 O; 2IJJ A; 1PL0 A; 5DEC A; 1KBH A; 5C93 A; 4NXM O; 4E4E A; 4LC1 A; 1JJ2 U; 2P67 A; 3P3N A; 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