The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
40
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sequence length |
90
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structure length |
90
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Chain Sequence |
NAMAEIKITPEELERIAGNFKNAAGEAQSQINRLEGDINSLEGQWAGATQAKFRGQFIQSKQAMQQYIPILEGISTDLKRIADKFRNTDN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The crystal structure of a secreted protein EsxB (Mutant E54Q) from Bacillus anthracis str. Sterne
rcsb |
| molecule tags |
Unknown function
|
| source organism |
Bacillus anthracis
|
| molecule keywords |
secreted protein EsxB
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| total genus |
40
|
| structure length |
90
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| sequence length |
90
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-02-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF06013 | WXG100 | Proteins of 100 residues with WXG |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | HP0062-like domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GTS A; 4J7J A; 4W4L A; 4J10 A; 3FX7 A; 4IYH A; 4W4K A; 4KXR A; 4J41 A; 4J11 A; 2G38 A; 4J7K A; 4IYI A; 4J42 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3F7Y C; 3JCU Z; 1YVW A; 3RYF B; 4IHJ A; 2GHY A; 3F7V C; 1K4C C; 2E5L B; 1NH2 B; 2UXD B; 1IDS A; 4LH7 A; 4EFE A; 2CGO A; 1M1K W; 2HHH O; 3I56 V; 4ZHQ A; 4MTG A; 4WFE A; 5FPO A; 2VWJ A; 3RVY A; 1FPO A; 4X20 B; 2QTO A; 3GWO A; 4B3M O; 1M56 C; 3CCQ V; 2QEX V; 2EZP A; 2CDY A; 3OGC C; 2OYQ A; 2BOB C; 4H37 A; 3ZED A; 2PY5 A; 5BMV B; 5IYZ A; 2XND G; 2ZKO A; 1Q6U A; 4X64 B; 1GH6 A; 2IJH A; 1Y76 A; 4BW9 A; 4DR1 B; 2QM8 A; 4JI3 O; 3W7U A; 5LP6 A; 3ZN0 A; 4FLT A; 3LDC A; 1RM1 C; 1SET A; 1OCR C; 4I9W A; 2DMX A; 2JGU A; 3ZHS A; 3SJA C; 4DK1 A; 4PA7 A; 2A06 H; 4TT3 G; 2MW2 B; 4IHJ B; 4AHC A; 4RAI A; 3CRA A; 1H38 A; 5H9C A; 4ZBM A; 1G6U A; 4JPR A; 4WBN A; 3OTO O; 4ABM A; 2HKO A; 4ZHQ B; 3KG2 A; 4GX2 A; 2H94 A; 4G27 B; 1AI7 A; 3FB6 C; 4DV2 B; 3ZMT A; 2OTL V; 2JK5 C; 4H44 B; 4O4L A; 3ZN1 A; 4MVQ A; 2X7R B; 3N2G A; 3RBZ A; 4U3F H; 5EC2 C; 5JJJ B; 1VQP V; 1Y74 A; 4GKJ O; 2Q5Z A; 1IBM B; 2EIM B; 2GUZ A; 4MVZ A; 5IYZ B; 2QKS A; 3UO3 A; 1JJ2 U; 4X1I A; 1Y76 B; 5GW7 A; 4U7O A; 3K5L A; 1N32 O; 1VAR A; 1ZUQ A; 1F51 A; 3X2Q C; 4O4J A; 1X4T A; 4PJ0 Z; 5LP6 B; 4N23 A; 1AB3 A; 2Y69 B; 3HB3 B; 1KB9 F; 1TVK B; 4LF7 O; 2NLJ C; 3ZHT A; 1YF2 A; 4CH3 A; 3RYI A; 4NTY A; 1ARO P; 3OMI B; 3HR0 A; 3E86 A; 2YSU B; 5KA6 A; 4WBN B; 2A79 B; 1U97 A; 2ODM A; 1PNM A; 3QO8 A; 2OCC C; 1ZLZ A; 1MAB G; 2OT5 A; 4PD4 F; 1NBM G; 2ZCE A; 2IJJ A; 2ADQ B; 2ZE8 A; 4ZOL A; 3ZRW A; 3N2G B; 2B5U A; 5CBH A; 5CB4 A; 1Y74 B; 2OWO A; 4F4L A; 1GN2 A; 5LBQ A; 1GTO A; 2UXN A; 2GUZ B; 4X66 B; 2YUA A; 3OR7 C; 4UVA A; 1URF A; 1H2K A; 3ABL B; 4X62 O; 2YS8 A; 4X1I B; 1NQT A; 5IWA B; 5L3B A; 1O9G A; 3QG5 A; 4PDM A; 5KUK A; 2UUC O; 1BL8 A; 3CS5 A; 4O4J B; 5KAI Z; 4I4T A; 5E1A C; 2L35 A; 5CBF A; 4MT8 A; 2EIL B; 4EB6 A; 4Q20 A; 1R3I C; 3CP1 A; 4JAV A; 4TV9 A; 3RYI B; 4UCO A; 5B66 Z; 4GCZ A; 1J5E B; 3OEE G; 2D2C B; 2GDS A; 2FTK A; 2RDC A; 1WJZ A; 3WU2 Z; 2DYS C; 2YEV A; 5EIB C; 4Z1V A; 3CCV V; 2CUG A; 3RT3 C; 5EBL C; 3CWB H; 2HJF C; 2P4V A; 3G71 V; 5LMN B; 4JI1 O; 1EM1 A; 4ZOL B; 4JV5 O; 1BE3 H; 3ZRW B; 3CCM V; 2OIE A; 1GN6 A; 4K3A A; 5CB4 B; 1XIL A; 1I0H A; 3OMN B; 1EN5 A; 3I55 V; 1YCI A; 4XDJ A; 1A32 A; 4I50 A; 3TCU A; 1XNR O; 4FZ1 A; 5HFL A; 4I0X A; 2BTQ A; 3CSX A; 4JI0 B; 3E8F A; 1DLB A; 3VQX A; 4X9Q A; 4I4T B; 1M93 A; 4EB6 B; 3JAM N; 4DR7 O; 4TV9 B; 3SPG A; 3J7A U; 2YI9 A; 3H1I H; 1VQM V; 2WSS G; 3AEI A; 2YEV B; 1M57 B; 4O4I A; 4FM2 A; 2P67 A; 3ZRX A; 4MVO A; 2BCC H; 5B3S B; 4UVC A; 3CEI A; 1P7B A; 1VQ8 V; 1BT8 A; 2EIJ C; 3T1Y O; 4IYH A; 5KUM A; 4LF4 B; 2DJV A; 1FFT B; 2BTO A; 1XMQ B; 5LMU B; 4I50 B; 5FLX N; 3CRC A; 4LF6 B; 4QE9 A; 4UUJ C; 4I0X B; 2ZR2 A; 2BTQ B; 2XT9 A; 4RQF A; 3AG4 C; 2JRI A; 4FLY A; 3QO5 A; 4FPP A; 4Z2W A; 2UUA O; 3EXA A; 4PV1 B; 1S76 D; 1KU9 A; 1RP3 B; 1HNX B; 4LF8 O; 1SQG A; 4YHH O; 3IAY A; 2ZT9 B; 1XUQ A; 5D5Q A; 4ZKI A; 2CK3 G; 3T1H B; 1AI5 A; 1F4M A; 3SPI A; 3RN4 A; 4KUM A; 3ZMV A; 4O4I B; 1CP9 A; 4QJF B; 1VF7 A; 4DYL A; 4KFM A; 3BFR A; 3W7S A; 5GTH Z; 4LF9 B; 3TXS A; 3CRM A; 1H2N A; 1ZTE A; 3G6B A; 2E3C A; 4QE7 A; 3J81 N; 4DUY B; 1AJP A; 3THO A; 3UKM A; 5KX5 A; 4DR6 O; 3BCC H; 3BVO A; 4EKW A; 5EYP A; 4GX5 A; 1IXB A; 1YJW V; 3ZBH A; 2DW4 A; 2VS0 A; 3CHX A; 2P90 A; 4BR6 A; 2HR3 A; 1K97 A; 3HKC A; 2Y48 A; 1WPB A; 2O57 A; 5IYD O; 2F43 G; 1Y66 A; 2Q7G A; 4JZG A; 2AHZ A; 1Y67 A; 3K5O A; 2N74 A; 3MAQ A; 5DED A; 2R72 A; 1Z5V A; 5J2T A; 4MVM A; 4YIO A; 5LYJ A; 1VQ6 V; 2AW9 A; 4J41 A; 1FYJ A; 1COW G; 1XRE A; 4PI2 A; 4H13 B; 4JAU A; 3LSQ A; 4DR2 B; 1SQP H; 4NKG B; 2Q7E A; 4WFF A; 2YIA A; 2Q69 A; 2C2A A; 2ZE5 A; 3G4S V; 1PNK A; 5CMU A; 3U10 A; 5KX5 B; 4O4H A; 4NTW A; 3DGE A; 5IY5 B; 4K8Z A; 5EYP B; 1DF5 A; 1WPX A; 1PL0 A; 4JI5 B; 3ETQ A; 4UFZ A; 3ZMS A; 1U96 A; 3SPH A; 1B04 A; 4ASU G; 2YIB A; 1S72 V; 1IBL O; 2JS3 A; 2E5L O; 3HKC B; 3T1C A; 2UXD O; 1XL6 A; 4B3T B; 1GAX A; 1LUV A; 3DSQ A; 4R8C A; 5AG2 A; 4JI6 B; 3TET A; 2PI4 A; 4NXM B; 5KHG A; 4TV8 A; 5J2T B; 1G1X B; 4AI8 A; 4DV1 B; 1HW7 A; 3FX7 A; 2PTM A; 4J11 A; 1EN4 A; 3ZRV A; 3E8G A; 4LCU C; 1BMF G; 1MMM A; 3DC6 A; 3ABM B; 3ZS8 C; 4FLV A; 5CBG A; 3DTU B; 4DV6 B; 1XMO O; 3SDL A; 4UV9 A; 1YIJ V; 3KKY A; 2M7W A; 3TJT A; 4P9P A; 4X64 O; 4DR1 O; 1H2L A; 1YI2 V; 1Q82 W; 3KCX A; 4O4H B; 4B3R B; 3AG2 B; 1Q86 W; 3K57 A; 3RYH A; 4BAY A; 1PPJ H; 2DQ0 A; 2QWQ B; 2F4V O; 3WFV A; 1VEW A; 1YTF B; 3CC4 V; 4L87 A; 3E35 A; 5FL7 G; 1I08 A; 5EIB D; 4LC1 A; 4FLW A; 4TV8 B; 1IUR A; 4W4L A; 4NYK A; 3SYC A; 4DV2 O; 1BHB A; 2R70 A; 3A8T A; 4DW1 A; 4JTA B; 1IBM O; 1SQB H; 2ZR3 A; 3VQW A; 1RSO A; 4YJ2 A; 2EIM C; 1YDX A; 5BR8 B; 2LGW A; 4UV8 A; 5HFM A; 3VBB A; 1XNQ B; 1LUW A; 1PV0 A; 1I5X A; 1R3K C; 2XAS A; 2WLL A; 4HZ3 A; 4N21 A; 2Y69 C; 3RYH B; 2WLM A; 5EZY A; 5E79 Z; 1Z5W A; 3ETE A; 2HP8 A; 4DV5 B; 1XHX A; 3OE7 G; 1VQK V; 4I5S A; 3OAA G; 2RN9 A; 1SQX H; 4I7Z B; 3JD1 A; 4X20 A; 2DYR C; 2LQT A; 4YXW G; 3W7T A; 3CB2 A; 1AR1 B; 1FFX A; 1BSM A; 4FLX A; 1Q3E A; 1WB8 A; 3H01 A; 2VWK A; 4J7K A; 1N0N A; 4X66 O; 1I7F A; 1RSO B; 4YJ2 B; 3RFR A; 2W0X A; 3ABK C; 3JAR A; 2EIN B; 1EBO A; 5IWA O; 3ABL C; 4OPH A; 4DV4 B; 4FLU A; 2CTP A; 2WLL B; 2YIB D; 2UXB B; 1NVP B; 4Z1M G; 5EZY B; 1ENV A; 2FML A; 2HEP A; 1S5L Z; 2EIL C; 2KB1 A; 1J5E O; 4X8A A; 3L74 H; 1AJN A; 2ZXW B; 4HNA A; 3ASO B; 1OV9 A; 2UUB B; 2G38 A; 2WLK A; 3SPJ A; 1L8D A; 1H2M A; 5LMN O; 1NJI W; 4OX9 B; 1JJO A; 1K5S A; 1PD3 A; 1TA8 A; 1FFX B; 4NTX A; 2QWO B; 3A0R A; 2ZDI A; 5DN6 G; 1US6 A; 4FFK A; 3O9O A; 1IVS A; 2GTA A; 3SGI A; 4IGG A; 3W7W A; 3E8B A; 3VQV A; 1SF9 A; 3JAR B; 1W59 A; 5L3E A; 3K59 A; 1TVK A; 1IBK B; 2ITC C; 2RQ6 A; 3CYO A; 5L3G A; 1SZX A; 3TGU H; 5CA1 A; 4WFH A; 1D2D A; 2EBO A; 4J7Z A; 1PNL A; 2CTQ A; 2JVD A; 1K3E A; 2WWW A; 2XAQ A; 2RNB A; 1K33 A; 4HNA B; 3M8A A; 3ETG A; 3F5W C; 1M57 C; 5IYC O; 2FKX A; 1VQ7 V; 4FVM A; 2Q0O C; 1FAF A; 3GVM A; 5B3S C; 1FJG B; 3PN1 A; 3D36 A; 4LF4 O; 1KEC A; 3HPL C; 5KHI A; 3PJS K; 1XMQ O; 5LMU O; 1S0V A; 3IJ4 A; 2ZQM A; 3JD4 A; 1YJN V; 4LF6 O; 1FXK A; 1SES A; 4DR5 O; 3OEH G; 4K0K B; 1B06 A; 1N8R W; 2AZ2 A; 1L1F A; 1R6N A; 2X6C A; 1FS0 G; 2Y0I A; 4O2A A; 1HNX O; 2ZM6 B; 4FIP C; 4DR3 O; 2A9H A; 3CX5 F; 1NH2 D; 5CA1 B; 4H0L B; 1YSC A; 1NKD A; 1SKV A; 3JAS A; 3AK1 A; 1K9M W; 3O65 A; 3OTF A; 4LP8 A; 3T1H O; 5FNV A; 5C8Y A; 3JAK A; 4JZ2 A; 2DYR B; 3CCS V; 1OHH G; 2CTR A; 3K3W A; 4JI4 B; 1IX9 A; 5JCO A; 2Q67 A; 5BXZ A; 3OUS A; 4WCE V; 3K5M A; 4EEQ A; 4K8X A; 4LF9 O; 4UCT A; 2DN9 A; 1H8H G; 2UXX A; 5BY1 A; 3BHP A; 3H1J H; 4DUY O; 2LFR A; 2P7T C; 3ABK B; 4X65 B; 2RCV A; 3ASN B; 2QGN A; 3C3T A; 3FAV A; 3RWR D; 4IIJ A; 3SR2 C; 1FXK B; 3AK2 A; 3BY6 A; 3ZCC A; 2ZNJ A; 3LDD A; 3BPZ A; 3ZHR A; 4O2A B; 1Q5O A; 4A5U B; 4IL6 Z; 3U0Z A; 3B40 A; 4D6T H; 4YY3 B; 1MZE A; 1R1B A; 1BGY H; 3JAS B; 2YI8 A; 2YID A; 4FJC C; 5LL6 Y; 4J9Y B; 5D5P A; 5FNV B; 3R65 A; 1IXM A; 5C8Y B; 3K9A A; 3JAK B; 3BA8 A; 3OT7 A; 1Q7Y W; 5EBW C; 1JQ0 A; 2DWD C; 3UM7 A; 2E75 B; 4DR2 O; 3K0G A; 5B1B B; 1ZX3 A; 2WA4 A; 3APQ A; 1O9H A; 4NB5 A; 1E1R G; 4B7K A; 2LO1 A; 4BIO A; 1CXZ B; 3OD4 A; 3QTC A; 4PA6 A; 3WG7 B; 5KHJ A; 3I5D A; 2GTS A; 3FAV B; 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5J2U A; 2BSK B; 3OMA B; 1IZ3 A; 2N05 A; 1KYO F; 3B8M A; 1QNM A; 1K92 A; 4JTD B; 4LF5 B; 3STZ C; 4DK0 A; 5LOV A; 1H2S B; 4PHZ A; 2LGQ A; 3HKE A; 1OCC B; 1PL4 A; 3S3X A; 2XAH A; 2NN4 A; 1MG1 A; 1YZB A; 1HP8 A; 3JAL B; 3T2M A; 1JPX A; 4TWK A; 3AG1 B; 5GON A; 1AP6 A; 5H5N A; 4UB8 Z; 2CGN A; 5H2F Z; 1I94 B; 3TK1 A; 4ZI7 B; 2D3O W; 4X88 A; 4DV3 B; 1K73 W; 1CEZ A; 1V54 B; 1FXV A; 2YXL A; 2Z3Y A; 3IFX A; 2VRZ A; 1OZ0 A; 4DV4 O; 2EIN C; 2F23 A; 1JCH A; 5B1O A; 2UXB O; 4ZIB A; 2XAG A; 2GV9 A; 2ILM A; 4AQY B; 4UCU A; 4TUY A; 1KD1 W; 4R6Z A; 1GK9 A; 2QA4 V; 3JAW A; 2KG7 A; 4I55 A; 1AP5 A; 5J2U B; 3D3I A; 1RPR A; 5CN0 A; 2R9I A; 5CA3 A; 4JTC B; 2XUM A; 1GKF A; 5JWP A; 3K5N A; 3C3S A; 2UUB O; 2ETN A; 4P2Z A; 5LOV B; 2XOK G; 3L75 H; 2ZXW C; 3K9S A; 4PA3 A; 4LFB B; 3ASO C; 3RVZ A; 1WP7 A; 3K03 A; 3HKE B; 4OX9 O; 3ZX6 A; 3CXC U; 1JFF A; 4JI7 B; 1KKD A; 5GON B; 2DOS A; 1K7D A; 3SPC A; 1N36 B; 4BIU A; 2IW5 A; 4JYC A; 2IBZ H; 3FD9 A; 2ARH A; 3SJB C; 2QR4 A; 2Z5U A; 4MTX A; 5IT9 N; 1WN7 A; 3AG7 A; 1IBK O; 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