The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
37
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
VGSVAALLTVVFYIAAVMATNLYGATFPEWFGDLSKSLYTLFQVMTLESWSMGIVRPVMNVHPNAWVFFIPFIMLTTFTVLNLFIGIIVDAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| source organism |
Magnetococcus sp.
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| publication title |
Prokaryotic NavMs channel as a structural and functional model for eukaryotic sodium channel antagonism.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ion transport protein
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| total genus |
37
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| structure length |
92
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| sequence length |
92
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-02-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3OUS A; 2WLM A; 4BW5 A; 1QLE C; 2P7T C; 3K0G A; 1OCR C; 3FB6 C; 1M57 C; 4H33 A; 2AHZ A; 3K0D A; 5EC2 C; 1OCO C; 1R3L C; 4R8C A; 3AG3 C; 5IY5 C; 4XDL A; 4TWK A; 3SPC A; 2DWD C; 2ITC C; 3T4Z A; 3ABL C; 4MTO A; 5B1B C; 3ABK C; 3IFX A; 2A9H A; 1M56 C; 2ATK C; 4PDR A; 4PDL A; 3HPL C; 1JVM A; 2HG5 C; 4X88 A; 3OR6 C; 4XDK A; 3TCU A; 1R3I C; 2EIJ C; 4MW3 A; 4MVM A; 3RBZ A; 1ORQ C; 3E8F A; 3X2Q C; 4GX1 A; 4PA3 A; 3SYC A; 5BZB A; 3E86 A; 3PJS K; 1P7B A; 4WFF A; 4MVZ A; 4R50 A; 4F4L A; 1G4Y B; 1R3J C; 2JK5 C; 5EBM C; 3LNM B; 4GX5 A; 3STZ C; 2EIN C; 3WG7 C; 3IGA C; 3E8H A; 4MVS A; 4XDJ A; 2EIL C; 4MTG A; 3T1C A; 5CBG A; 4PA6 A; 3FB7 C; 2DYR C; 5EK0 A; 5E1A C; 3SJQ C; 4R6Z A; 1BL8 A; 2BOC C; 3SPH A; 2ITD C; 2EIK C; 4R7C A; 2HVK C; 3JYC A; 4X89 A; 3FB8 C; 4P9P A; 4PDV A; 4WFH A; 2DYS C; 5EC1 C; 3F5W C; 2X6C A; 3RW0 A; 5CBF A; 4OXS A; 1LNQ A; 2W0F C; 4GX0 A; 3SYQ A; 2Q67 A; 3GB7 C; 2ZD9 A; 2QTO A; 3LDD A; 4MVR A; 4CBC A; 2HFE C; 3R65 A; 2ZXW C; 3KG2 A; 3ASN C; 1K4D C; 3E89 A; 2R9R B; 3SYP A; 4JTA B; 1XL4 A; 3T4D A; 2WLJ A; 1XL6 A; 3BEH A; 3K03 A; 4MVU A; 4LBE C; 3STL C; 2K1E A; 2X6B A; 3AG4 C; 3SPJ A; 4MVO A; 2NLJ C; 4P2Z A; 4EKW A; 3F7V C; 4RO2 A; 4HYO A; 2Q68 A; 4UUJ C; 4HZ3 A; 2HJF C; 3EFF K; 4PA4 A; 4JTC B; 2H8P C; 1R3K C; 2X6A A; 3AG1 C; 5B1A C; 3TET A; 1J95 A; 2OCC C; 4G27 B; 5KUM A; 3SYO A; 2DWE C; 3ZRS A; 1V54 C; 3F7Y C; 5KUK A; 4J9Z B; 2HVJ C; 3OR7 C; 3SPI A; 1S5H C; 1K4C C; 4MS2 A; 1OCC C; 3SYA A; 3K06 A; 2EIM C; 4KFM A; 4PA7 A; 5B3S C; 2Y69 C; 3ASO C; 4GX2 A; 4X8A A; 1KKD A; 2IH1 C; 2Q69 A; 4G28 B; 4DXW A; 5J9P C; 4PA9 A; 4WFG A; 2WLN A; 3OGC C; 4QE7 A; 2Q6A A; 2WLI A; 4WFE A; 2WLL A; 5EBL C; 5EBW C; 3VOU A; 3RVZ A; 3E8G A; 2A79 B; 3RVY A; 3SPG A; 2AHY A; 3FB5 C; 3LUT B; 2A0L A; 4MW8 A; 2YEV A; 2IH3 C; 2WLK A; 3OUF A; 4MSW C; 4P30 A; 4RUE A; 4RUF A; 2QKS A; 4QNH B; 4JTD B; 3E8B A; 1V55 C; 4RAI A; 3UKM A; 4PDM A; 2WLI B; 3LDE A; 2WLL B; 1OCZ C; 4LP8 A; 3E83 A; 4MVQ A; 3AG2 C; 2KB1 A; 3K08 A; 4J9Y B; 5CBH A; 4QE9 A; 3UM7 A; 2WLH A; 1ZWI C; 4H37 A; 3ABM C; 2BOB C; 4LCU C; 3K04 A; 4ZBM A; 4P9O A; 4I9W A; 3LDC A; 3ZJZ A; 3T2M A; 4MTF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FM0 A; 4H13 B; 4NTY A; 1FYJ A; 1CXZ B; 1N33 O; 3C3S A; 3ZN1 A; 1FS0 G; 1OV9 A; 2VQF B; 2E76 B; 4K0K O; 3E22 A; 3ABK C; 3L73 H; 3U10 A; 4CS2 A; 4O2A A; 2ADQ B; 4PDL A; 5BY1 A; 4DR6 B; 4X1I A; 4LF4 B; 1YJW V; 5DM6 V; 4PI0 A; 1XUQ A; 4U3J B; 4DR3 B; 1XNQ O; 2QWQ B; 1JJ2 U; 3A0H Z; 1N36 B; 1IBK B; 3LNM B; 4JPR A; 3W7U A; 3QNE A; 4MVS A; 1N34 B; 4MTG A; 4LFA O; 2UXB O; 5J2U B; 2NN4 A; 1YHQ V; 4R6Z A; 2P4K A; 4QPJ A; 1Y74 B; 3UT5 A; 1B04 A; 1PL0 A; 1JQ0 A; 5LA6 B; 2XTA A; 1XNR O; 3UO3 A; 1QR8 A; 2X6B A; 3JAK B; 3CRM A; 3J7A U; 4TUY A; 3CYO A; 3IC9 A; 1K73 W; 1IVS A; 2XND G; 3HKB B; 1GAX A; 2OCC C; 2YSU B; 1MOF A; 4DV5 B; 5CA0 A; 4TSF G; 1AJN A; 1PP9 H; 5B3S C; 1SA0 B; 4EFE A; 3KCY A; 3Q4H A; 3B77 A; 1KKD A; 2Q69 A; 3E2E A; 4DRX B; 4X20 B; 3JAS A; 1K92 A; 1UJW B; 4EB6 A; 4DV7 B; 3LUT B; 4LNU A; 2V1D A; 4JZ2 A; 1V9P A; 3FD9 A; 4RUF A; 2UUC B; 3UKM A; 2ZKO A; 2ILM A; 1Z5W A; 3CRA A; 4KL1 A; 1HR0 B; 1BE3 H; 3MDS A; 2OTJ V; 3N27 A; 3ZCC A; 3QO7 A; 4FZ0 A; 4DR5 O; 5CMU A; 5EC2 C; 5TIS Z; 1R73 A; 3P30 A; 3ZMT A; 1YJ9 V; 2ZDI C; 5KMG A; 1Q5O A; 3LSU A; 4UCR A; 3WB1 A; 3B2E E; 1I0H A; 3U11 A; 1FFX B; 1FPO A; 4IIJ A; 1R3I C; 4JYY A; 1ORQ C; 3A8T A; 4WCE V; 3H9V A; 2D3O W; 1D5N A; 1QBZ A; 2JK5 C; 1URF A; 3J81 N; 1Q86 W; 3K9A A; 3SDL A; 1EZJ A; 5JJJ B; 3JAT B; 3CC4 V; 2QWN B; 2P06 A; 1XHZ A; 4Q6G A; 5LGN A; 4FLY A; 4B7K A; 4R7C A; 1I5X A; 3SGI A; 4O4L B; 4JI6 O; 2DYS C; 3AG7 A; 1IZ3 A; 3F5W C; 1P84 F; 2Q7G A; 4GX0 A; 3OTO B; 4DW0 A; 3KG2 A; 4KUM A; 3FFQ A; 2KKW A; 2NLJ C; 2QKC A; 4JI7 O; 1QU7 A; 3AG1 B; 3L75 H; 4O4I B; 1KD1 W; 2H8P C; 4JGS A; 1DK1 A; 3M8A A; 3ZRS A; 2QKA A; 4PEL A; 3CXC U; 1S5H C; 4CH5 A; 1K4C C; 5KX5 A; 3CD6 V; 3IC7 A; 2OIG A; 3ASO B; 4IGG A; 4JI3 O; 5EIB C; 1GM9 A; 3VQY A; 5J9P C; 2H3O A; 4X65 B; 5LYJ A; 3JAL B; 4UVA A; 1VP7 A; 3QTC A; 5JVD B; 4J7J A; 4H44 B; 4HAM A; 3OUF A; 4DV0 B; 4DV6 B; 2KSD A; 3OMI B; 2PUS A; 4LF6 O; 4FM2 A; 3RYF A; 4Z1M G; 4I7Z B; 3DXR A; 1K97 A; 2QWR B; 4ZI7 B; 4LFC O; 4A5U B; 1M9N A; 3AG3 C; 3TJT A; 2QM8 A; 5BMV B; 4E2L A; 3JD3 A; 2EIJ B; 4J7Z A; 1NS1 A; 4LF7 B; 2JEX A; 4GX1 A; 2AW9 A; 5D5Q A; 2B5U A; 2LO1 A; 3BA9 A; 2W6I G; 4I4T A; 1K9M W; 2A7W A; 1AI5 A; 2B1I A; 4WFA V; 3WG7 C; 2JS5 A; 3OD4 A; 3FB7 C; 2YIC A; 2W0X A; 1ENV A; 1H38 A; 1EFR G; 3J80 N; 3G80 A; 5JH7 B; 3N2K B; 5LXT A; 5IWA O; 2AZ0 A; 1G1X B; 5CBF A; 1WA8 B; 2QTO A; 4NXN B; 2V7Q G; 1L8D A; 1XOU A; 1O9G A; 4IHJ B; 4JV5 O; 4JTA B; 3EXA A; 3ETQ A; 3CCJ V; 1TA8 A; 4MTX A; 2N74 A; 4I55 A; 3CJH B; 3RWR D; 2BTQ B; 2IJI A; 5B1A C; 2MW2 B; 2O57 A; 3D8C A; 4IYH A; 3F7Y C; 4J9Z B; 1RFY A; 4O4J B; 4MS2 A; 1Y66 A; 4JI4 B; 4JI1 O; 4J41 A; 3C90 A; 1F4N A; 2OYQ A; 1E79 G; 5B66 Z; 4OX9 B; 4PA9 A; 1YZB A; 1AI7 A; 5IE9 A; 2WLI A; 4WFE A; 1H2S B; 4U3J A; 5B1O A; 1NU1 H; 4P30 A; 1S5J A; 3CX5 F; 1BT8 A; 4PDM A; 5IYB O; 2XOK G; 2YUA A; 2OTL V; 4GKJ O; 4I9W A; 1QLE B; 2EZO A; 1A32 A; 2LJ2 A; 1AIL A; 2R70 A; 3WB2 A; 3K3W A; 1B3Q A; 2UUA B; 4FFB A; 1FJG O; 3FB6 C; 1M57 C; 1Y74 A; 4ASU G; 1IBL B; 1K7D A; 3SPC A; 1HNX B; 4DUY O; 4MTO A; 2E5L O; 1MA1 A; 3JSL A; 2G38 A; 3G71 V; 2YI8 A; 1P49 A; 4HBN A; 3ASN B; 3JAK A; 3BY6 A; 4FIP C; 1XHX A; 5BR8 O; 4RQE A; 3HKB A; 4F6R B; 3E8H A; 3G6B A; 1K3E A; 2P67 A; 1SQB H; 1SA0 A; 4I0X B; 2UUB O; 2HVK C; 3OFN G; 4E4E A; 3ETD A; 1HWY A; 4DV1 O; 3ZHS A; 4OXS A; 4MVR A; 4YHH B; 2YIA A; 2JIZ G; 2XT9 A; 4JYA B; 3ZHR A; 1JMK C; 3I5D A; 1JFF A; 1TUE B; 2DW4 A; 4B3T O; 4JTC B; 1R3K C; 4YJ3 B; 1N32 O; 3ABM B; 4FVM A; 3ETG A; 3D36 A; 4JI0 O; 5LBQ A; 1S0V A; 2RCV A; 1MSD A; 2Y69 C; 3DGE A; 2VQE O; 1G6U A; 2Y0P A; 4JI5 O; 3OM3 B; 4NTW A; 3JAW A; 3TXS A; 2PYJ A; 4JAU A; 5EZY B; 4JAA A; 2HR3 A; 1X59 A; 3BRC A; 1YCI A; 3JAT A; 1SS3 A; 2HLD G; 4TOI A; 1KC8 W; 2ZE5 A; 1T5E A; 3L70 H; 4H33 A; 4O4L A; 1J5E O; 2LFR A; 4C7U A; 4LF8 O; 5LMN O; 2JGD A; 1XMO B; 4XDL A; 1M56 B; 1Y6X A; 5B1B C; 1MNG A; 2PF4 E; 4X88 A; 5JQG B; 4H0L B; 3OW2 U; 5H6Q A; 4QPK A; 2YEV B; 4O4I A; 2F66 C; 4CC5 A; 1SKV A; 1KBH A; 2N05 A; 3T1C A; 2ZCE A; 5KHJ A; 4NKG B; 2WA4 A; 2Y4U A; 4LH6 A; 3RT3 C; 1FKA O; 1EBO A; 4FJC C; 1SZT A; 1BL8 A; 1ZL8 B; 2Z3Y A; 1HNW B; 4B3M B; 2QA4 V; 3ZMU A; 1YEW A; 5B3S B; 4LF4 O; 1GKF A; 5JVD A; 2Z5U A; 4YY3 O; 2KQX A; 3LDD A; 2ZXW C; 1K5S A; 4FM1 A; 4DR3 O; 2UXN A; 2YIB A; 2WLJ A; 4MVU A; 1IBK O; 5GON B; 2GV9 A; 4UCO A; 4K8Z A; 2ZE6 A; 5HFL A; 2LW7 A; 4AHC A; 4GKK B; 3RGB A; 2E75 B; 4KHP O; 4JI8 B; 3KZI Z; 5KUK A; 1OCC B; 2Z0A A; 1H2N A; 1VQ9 V; 1EN5 A; 4NXM B; 2IW5 A; 2Q9L A; 2UXC B; 5BMV A; 2XAG A; 2R72 A; 2ADP A; 3UQ8 A; 5LL6 Y; 4O4H B; 2GDS A; 1AJP A; 2A0L A; 2K9P A; 3JD0 A; 5FLX N; 4RUE A; 4LWS B; 5ITZ B; 1NTK H; 4DR1 O; 3OT7 A; 1AR5 A; 3AG2 B; 1JJO A; 2F23 A; 4MVQ A; 4J9Y B; 1M93 A; 3RYI B; 4QE9 A; 1AP5 A; 2P4V A; 3AK1 A; 5A2Q N; 1VF5 B; 2BOB C; 4LCU C; 1ZX3 A; 3FKS G; 3ZJZ A; 2ZE7 A; 4UCT A; 1JPX A; 5JH7 A; 1R6T A; 5IYD O; 2NNU A; 3N2K A; 3TGU H; 5KAI Z; 4DR2 O; 2GTA A; 1EN6 A; 3ABL C; 5DN6 G; 4DV7 O; 4ZOL B; 2V4D A; 4IHJ A; 2HG5 C; 3K58 A; 3TCU A; 1VF6 A; 4MW3 A; 5KHG A; 1KKC A; 1TVK B; 1NKD A; 3PJS K; 1P7B A; 2A3Q A; 3OMA B; 4WFF A; 2QEX V; 4DR7 B; 1HR0 O; 2F1M A; 4WBN B; 3CRC A; 3K5M A; 3U0Z A; 5EBM C; 3APQ A; 3CEI A; 2BTQ A; 2ZIM A; 2QJ1 A; 3ZHT A; 5IJ0 A; 3IGA C; 1TUB B; 4LF5 O; 1HNZ B; 4GLX A; 4PA6 A; 1NVP B; 4O4J A; 4X62 B; 2DYR C; 3MHH C; 2JGU A; 3K57 A; 2QDO A; 4J11 A; 1YIT V; 4PJ0 Z; 4FFK A; 2ZR2 A; 3LSS A; 4PV1 B; 3JYC A; 4X1K A; 1IXM A; 3TXQ A; 1WJZ A; 1RSO B; 3SR2 C; 1SQF A; 4N23 A; 4DW1 A; 3ZRV A; 3VQV A; 3THO A; 1IBM B; 3BA8 A; 3R65 A; 1K4D C; 4OPH A; 3SYP A; 3AG4 B; 4LBE C; 4MT8 A; 2VWJ A; 1N4C A; 2JRI A; 4DYL A; 1HW7 A; 5FNV B; 4J80 A; 2WA3 A; 2EJR A; 4B3R B; 2ZNI A; 4WFB V; 5GTH Z; 3BAA A; 3OTO O; 4BAY A; 1XBL A; 5L3B A; 1JX9 A; 1QNM A; 1LUV A; 2ZQM A; 2CTR A; 3H1I H; 4JI2 O; 3VOU A; 3CCL V; 1YIJ V; 1W0J G; 1DF4 A; 2QKS A; 2WSS G; 5LHI A; 4F6R A; 5IYZ B; 1AI6 A; 2L35 A; 3E83 A; 2X0L A; 1SES A; 1D5A A; 3K5N A; 4ABM A; 3MD0 A; 4CS3 A; 3BFR A; 2YS8 A; 4I0X A; 2AHZ A; 2OIE A; 4UCS A; 4X65 O; 2Q0O C; 2FL4 A; 2A9H A; 2GBO A; 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3X2Q B; 4XDK A; 4LF9 O; 5GON A; 5JJN B; 2ETN A; 5IJ9 B; 3QF7 A; 2RJZ A; 2BSK A; 3L9D A; 3CCE V; 3GWO A; 2UUA O; 4DUZ O; 1SQQ H; 3B4S A; 4UCU A; 4JAS A; 4ZHQ B; 4CH6 A; 4LFB B; 1TAE A; 1QLN A; 4AI8 A; 4UXN A; 3ML0 A; 3O65 A; 1KMI Z; 4LR3 A; 4O4H A; 3GB7 C; 3ZIA G; 3CCQ V; 1VQL V; 4CC6 A; 1RM1 C; 1Q90 D; 4DR5 B; 4LWS A; 5ITZ A; 4GYC B; 3S3X A; 2GTS A; 3JAR B; 2L6L A; 2MK3 A; 1VF7 A; 1D2D A; 4Z1V A; 3RYI A; 4LC1 A; 2Q68 A; 3UCS C; 1DGS A; 3CCM V; 5E79 Z; 1BMF G; 2M7W A; 5A9G A; 3OR7 C; 4D7T A; 2OCH A; 4YHH O; 1SER A; 2LP7 A; 4GX2 A; 4ZOL A; 4DXW A; 2WLN A; 4JYA O; 2N04 A; 1Q82 W; 1VAR A; 2YID A; 2ZT9 B; 5LOV B; 4WBN A; 2UXD B; 3T1Y O; 1S77 D; 1B6Q A; 1YTF D; 4H37 A; 4YIP A; 3CRR A; 3CXH F; 3K04 A; 4ZBM A; 4XBF A; 1RP3 B; 4UV9 A; 3HB3 B; 5GW7 A; 1MMM A; 3K0G A; 1H2M A; 1OCR C; 3HKC B; 4FLV A; 1WN7 A; 5IY5 B; 2HJD A; 2XAJ A; 3EVK A; 3TK1 A; 3VBB A; 4JI7 B; 1RSO A; 2LGW A; 3D36 C; 1CPY A; 3T4Z A; 1XDC A; 1S72 V; 4LH7 A; 4JYB A; 4OGQ B; 4MVM A; 2OWO A; 3DSQ A; 4G2K A; 3E22 B; 4GZR B; 3BAB A; 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