The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
32
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
PATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ionic interactions of Ba2+ blockades in the MthK K+ channel
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel MthK
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| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
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| total genus |
32
|
| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-05-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1KKD A; 3RVY A; 5EBM C; 3T4Z A; 4BW5 A; 2R9R B; 2WLK A; 3AG2 C; 3SYO A; 3WG7 C; 4CBC A; 3UKM A; 3ABM C; 3LUT B; 4PA3 A; 3K06 A; 4MSW C; 5KUK A; 5EK0 A; 2NLJ C; 3UM7 A; 1R3J C; 2WLM A; 4P2Z A; 4WFH A; 5EBW C; 2HVJ C; 4JTA B; 2HJF C; 3OR6 C; 5CBG A; 4X89 A; 3RW0 A; 1K4D C; 4MVO A; 2X6B A; 3STL C; 3AG3 C; 3GB7 C; 1S5H C; 4JTC B; 2Q67 A; 3LDC A; 3ASN C; 3X2Q C; 5B3S C; 4PA7 A; 4QE7 A; 3SYA A; 4J9Y B; 2EIK C; 2ITD C; 3ZRS A; 4OXS A; 2QKS A; 3HPL C; 4P9O A; 4PDV A; 3SJQ C; 3ZJZ A; 4GX2 A; 3RVZ A; 3ABL C; 3ASO C; 3KG2 A; 3SPH A; 2A79 B; 4LCU C; 2HFE C; 2X6C A; 4R7C A; 4RO2 A; 1JVM A; 3AG4 C; 1BL8 A; 3F7Y C; 4WFG A; 3K08 A; 3R65 A; 3E8B A; 3IGA C; 3T2M A; 2EIM C; 4MVZ A; 4PDR A; 3SPI A; 4G28 B; 4MVU A; 2A0L A; 2ZD9 A; 3SPG A; 2WLJ A; 1OCZ C; 2ZXW C; 4MS2 A; 3SPJ A; 2DYS C; 4MVQ A; 1V54 C; 2IH1 C; 3TET A; 1XL4 A; 1J95 A; 4MW8 A; 4X8A A; 3SPC A; 4KFM A; 4LP8 A; 2WLL A; 4WFE A; 1ORQ C; 2Q6A A; 4R50 A; 5KUM A; 3F5W C; 4LBE C; 5EC1 C; 3LDD A; 4HZ3 A; 2KB1 A; 5BZB A; 3K0G A; 5CBH A; 4PA4 A; 3VOU A; 5J9P C; 5CBF A; 4JTD B; 4GX1 A; 1QLE C; 2X6A A; 4H33 A; 3K0D A; 3SYC A; 4PDM A; 2EIL C; 2WLI A; 4P9P A; 4XDJ A; 4RUF A; 3E8H A; 1M57 C; 3FB7 C; 4TWK A; 4R6Z A; 1M56 C; 2AHZ A; 5B1A C; 2EIJ C; 4MVM A; 4PA6 A; 3OR7 C; 1LNQ A; 4F4L A; 1XL6 A; 1R3L C; 3E8G A; 1R3I C; 2HVK C; 4R8C A; 3IFX A; 3TCU A; 2BOC C; 4DXW A; 4MW3 A; 2DWD C; 4RAI A; 2DWE C; 4G27 B; 2Y69 C; 3T1C A; 1G4Y B; 1OCR C; 5EC2 C; 4P30 A; 5B1B C; 4QE9 A; 2BOB C; 1OCC C; 4WFF A; 3E83 A; 3T4D A; 1OCO C; 1K4C C; 3SYP A; 3EFF K; 1ZWI C; 3OUS A; 3E8F A; 3K03 A; 3PJS K; 2H8P C; 5EBL C; 4EKW A; 4UUJ C; 3STZ C; 2Q68 A; 2WLN A; 4H37 A; 2WLL B; 3E86 A; 1R3K C; 1P7B A; 3LDE A; 2HG5 C; 3FB6 C; 4QNH B; 3AG1 C; 2AHY A; 2P7T C; 3BEH A; 4HYO A; 3ABK C; 3FB5 C; 3JYC A; 2JK5 C; 2ATK C; 4PA9 A; 2A9H A; 4PDL A; 5E1A C; 4X88 A; 3E89 A; 4MVR A; 4J9Z B; 4MTF A; 4GX0 A; 4XDK A; 4GX5 A; 2OCC C; 3RBZ A; 2WLI B; 3OUF A; 4XDL A; 2W0F C; 4I9W A; 4MTG A; 2YEV A; 2ITC C; 3F7V C; 2IH3 C; 3FB8 C; 2EIN C; 3K04 A; 2Q69 A; 2WLH A; 4MTO A; 1V55 C; 4MVS A; 5IY5 C; 3OGC C; 4RUE A; 4ZBM A; 2QTO A; 3LNM B; 3SYQ A; 2DYR C; 2K1E A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DK1 A; 1KKD A; 4JF3 A; 3AG2 C; 1L0L H; 3ZRW A; 4B3S O; 5AG2 A; 3DXR B; 2YXH A; 2BSK B; 4B08 A; 1MZE A; 2HJF C; 4DR1 O; 1NTZ H; 2RMK B; 5GTH Z; 3B77 A; 4JTC B; 1HNW B; 4UVC A; 2N05 A; 1H2G A; 2K9P A; 3CHX A; 4AI8 A; 1SA0 A; 2A79 B; 3ZMZ A; 2X6C A; 1NR1 A; 1R6N A; 2FL4 A; 1FXK B; 2HEP A; 3AG4 C; 5K1X A; 1AB3 A; 3CCM V; 1O9H A; 2VWK A; 1GH6 A; 4JI2 O; 2VQF B; 2DYS C; 4NXN O; 1VQL V; 4TV8 B; 1NVP B; 1I5Y A; 1YF2 A; 2HHH O; 4LBE C; 3OM3 B; 3B09 A; 1WAZ A; 3L73 H; 4FZ0 A; 5IY5 B; 2XUM A; 1HW7 A; 1LUW A; 3WB2 A; 4HBN A; 3JCU Z; 3ASO B; 3N2K A; 1NBM G; 1IVS A; 4DV2 B; 2R9A A; 4BW9 A; 2EZO A; 4IT5 A; 4FLZ A; 3THO A; 1XL6 A; 2HVK C; 3TCU A; 2YIB D; 1I08 A; 5LP6 B; 1TUB B; 2OYQ A; 4I4T A; 4J80 A; 1MMM A; 4LF4 O; 4LNU A; 1XNR B; 3SJA C; 1KMI Z; 3M99 B; 2G38 A; 2P22 C; 3R66 A; 1HNW O; 2OT5 A; 2CH7 B; 4JI8 O; 3BVO A; 4GX5 A; 4Z1V A; 1GN6 A; 4LWS B; 1KUQ A; 3BFR A; 2ZCE A; 1YVW A; 2QTO A; 2LO1 A; 2VQF O; 3MD0 A; 3RVY A; 2R9R B; 1O9G A; 5EZY A; 4GT1 A; 3SYO A; 3DC5 A; 4RWU A; 3JD2 A; 2JDI G; 4DO2 A; 4FPP A; 3JAM N; 3TXS A; 3RYH B; 1AR4 A; 1I94 O; 3VQX A; 3GVM A; 1FS0 G; 1E1R G; 3HKC B; 4F6R B; 5KMG A; 1QU7 A; 3X2Q C; 1NT2 B; 4QE7 A; 4X1I B; 2A06 H; 2IW5 A; 4DUY O; 3ZRS A; 2Y0P A; 1TAE A; 1OZ0 A; 5CA0 B; 3KG2 A; 5LYJ B; 3C90 A; 1NH2 D; 4DK0 A; 3H1J H; 1FXH A; 2Z3Y A; 1YIJ V; 2F66 C; 2LGQ A; 2JS3 A; 2UU9 B; 1XUQ A; 1AR1 B; 4R50 A; 1ZTE A; 4FIP C; 5EC1 C; 2UUB B; 2XAF A; 4LF7 O; 3D3I A; 2RDC A; 1BSM A; 2EIL C; 4P9P A; 1JR9 A; 4XDJ A; 4LF9 O; 4FZ1 A; 4TWK A; 3WG7 B; 2AHZ A; 3AK1 A; 3ETE A; 1MG1 A; 1HNZ O; 1XDC A; 2ZDI A; 2OTJ V; 3W7W A; 2IJH A; 4K8X A; 5JJN B; 1Y4M A; 4JI1 B; 2ZDI C; 4FK5 C; 3QO7 A; 4DRX B; 3M8A A; 4EKW A; 2P67 A; 1AP5 A; 1PNM A; 2QWQ B; 1NZ6 A; 1BQ0 A; 5BMV B; 3OTO B; 4DW1 A; 1M57 B; 1SKV A; 4BIO A; 3CCS V; 4LFB B; 1ZL8 A; 3RBZ A; 1Y66 A; 1E1Q G; 1RM1 B; 2Q69 A; 2DOS A; 1OCR B; 1IZ3 A; 4IIJ A; 1IUR A; 5CN0 A; 1JPX A; 3BAB A; 4LFC O; 1I7F A; 4EFE A; 1K5Q A; 2LFR A; 2UU9 O; 1Y76 A; 5IYD O; 2IU3 A; 5IYC O; 1ENV A; 2LJ2 A; 3MHH C; 2V1D A; 4ZOL B; 4JAA A; 2L35 A; 4TUY B; 2YI8 A; 1QVG U; 4OXS A; 1M1K W; 4OGQ B; 4B3M O; 4JYA B; 2YID A; 3JD3 A; 3UT5 B; 5LXT A; 4LCU C; 3D8C A; 3ZN0 A; 4PDR A; 2UXB B; 4FM2 A; 3AG1 B; 2ZXW C; 2IH1 C; 3TET A; 3ZS8 C; 3JAK B; 4O4J A; 1AJN A; 3OTO O; 3F5W C; 4HZ3 A; 1ZAU A; 1VQO V; 2Y4T A; 1R1B A; 1TVK A; 2VS0 A; 2WWW A; 4LFB O; 1SQP H; 2PGG A; 4Z1M G; 3E22 A; 4A5U B; 1M90 W; 1NU1 H; 4RUF A; 3AG2 B; 4FJC C; 2AXT Z; 5HFL A; 4F4L A; 5KX5 B; 2AGA A; 4R8C A; 1Q5O A; 1OCZ B; 2M7W A; 2DQ0 A; 3A0R A; 5EIB C; 2F4V O; 3H01 A; 3DXR A; 2VWJ A; 1OCO C; 3OGI B; 5CB4 B; 2CE4 A; 1ZWI C; 2BSK A; 2H8P C; 3IJ4 A; 3JD1 A; 2QR4 A; 3T1H O; 1L1F A; 3ETQ A; 1P7B A; 4KHP B; 2Q7H A; 3LSU A; 2WAM A; 3F5T A; 4ZKI A; 2ZR2 A; 1MZF A; 4J9Z B; 4JYA O; 2FML A; 4NTX A; 1FXK A; 2GTA A; 2UXB O; 4UVB A; 5B66 Z; 1E79 G; 2GTS A; 4AQY B; 4XBF A; 1FXK C; 1AR5 A; 1BGY H; 4NVP A; 1FYJ A; 4TV8 A; 3AG7 A; 1BHA A; 3CC7 V; 5DN6 G; 1K3E A; 1CP9 A; 1AJQ A; 1SZX A; 1ARO P; 4LF5 B; 4TT3 G; 2JJ2 G; 1XHZ A; 1VQN V; 2JJ1 G; 2A7W A; 3OR6 C; 3ETD A; 2CTQ A; 4X89 A; 4JI7 O; 3JCZ A; 1M5I A; 2AZ2 A; 4I9Q A; 4J7Z A; 3AEI A; 4PA7 A; 4UCU A; 4DV1 O; 1FFT B; 1YCI A; 3ASO C; 4EB6 B; 1NQT A; 2UXN A; 5LP6 A; 1TUB A; 2GDS A; 4OX9 B; 5EIB D; 1J5E B; 5L3F A; 1QHT A; 4JAU A; 4PJ0 Z; 3JAS B; 3HR0 A; 1GAX A; 2QWN B; 3SPC A; 1SQV H; 4LP8 A; 1BHB A; 5JCO A; 2A3Q A; 4K35 A; 3OAA G; 2P90 A; 3G4S V; 1EFR G; 1DK1 A; 1SQX H; 1QBZ A; 1IBL B; 2CH7 A; 4PA4 A; 2LP7 A; 5JCO C; 3B8M A; 2CTW A; 4LWS A; 4Q20 A; 1NTK H; 1MNG A; 5KHJ A; 5LA6 B; 2ZNJ A; 2R72 A; 5IWA O; 3CC2 V; 4AQY O; 1VQK V; 3ZMU A; 3I55 V; 1Z5V A; 5LBQ A; 4N23 A; 4WFF A; 1WB8 A; 1WNS A; 1Y67 A; 3B2E E; 1EN5 A; 3EFF K; 4LF5 O; 4JYB A; 4UV8 A; 5BR8 O; 3RYH A; 4G2K A; 3O65 A; 3HKC A; 5B1N A; 4F6R A; 3FB6 C; 1P4R A; 3LSQ A; 4X1I A; 2PYL A; 3ICX A; 4O2A B; 1GO3 F; 2E5L B; 5CA0 A; 5LYJ A; 4J11 A; 1WP7 A; 4I9W A; 2BCC H; 2UUA O; 3OFN G; 4DR7 O; 1W59 A; 4ZBM A; 1IBK B; 3LNM B; 4KP4 A; 1MAB G; 1EM1 A; 2ZT9 B; 2HJD A; 5LL6 Y; 2EIL B; 4WBN B; 4TSF G; 1R3J C; 3ABK B; 1IBL O; 2HVJ C; 4CS4 A; 5CBG A; 1S5H C; 5EYP B; 1B06 A; 3RYF B; 2CGN A; 5D5P A; 5L3B A; 2EIN B; 3WFV A; 3ZJZ A; 1OV9 A; 3JD0 A; 5JWP A; 1AIL A; 2DYR B; 2WA4 A; 3EXA A; 2HFE C; 1Q3E A; 1PL0 A; 2LGW A; 2YEV B; 1EN6 A; 2A0L A; 2WLJ A; 3T1Y B; 1RFY A; 4DRX A; 3ABT A; 5BMV A; 4O4L B; 3H1H H; 5JJJ B; 1N32 B; 2ARH A; 5CA3 A; 5J9P C; 2E5L O; 1G6U A; 2FTK A; 1XMO B; 3CWB H; 4GKK B; 5L3G A; 4YHH B; 1M57 C; 4R6Z A; 2WPD G; 2JS5 A; 2PY5 A; 5H6R A; 4GCZ A; 1BMF G; 2JGD B; 1WA8 B; 5FL7 G; 1RM1 C; 1UFI A; 3CRR A; 5IJ9 B; 1G4Y B; 1OCR C; 5B1B C; 3ZED A; 4B3S B; 4X62 O; 3ZRX A; 3SYP A; 3OEH G; 1FKA O; 1KU9 A; 2IJK A; 4DR1 B; 4ZOL A; 1YZB A; 1AJP A; 1PPJ H; 1QLE B; 4QNH B; 3O9O A; 4TUY A; 1K34 A; 4LH6 A; 1JJ2 U; 2RCV A; 5J2U B; 1HWY A; 4MTF A; 1V9P A; 5JVD B; 1U97 A; 3UT5 A; 3K5M A; 1GM9 A; 4XDL A; 4UCR A; 3K04 A; 3FB8 C; 1YHQ V; 4DR6 O; 3FD9 A; 2RJZ A; 5KA6 A; 4IL6 Z; 4JI2 B; 3TGU H; 1H2S B; 4CH4 A; 3APO A; 4CBC A; 3J81 N; 3FAV B; 2XTA A; 3JAK A; 2GHY A; 3G6E V; 5KUK A; 2JRI A; 5EK0 A; 4CH6 A; 2B1G A; 1XMO O; 2YIB A; 1K4D C; 4GKK O; 1A32 A; 4YHH O; 4DV7 B; 4NTW A; 1PNK A; 5KX5 A; 2W0X A; 1OCO B; 1XEQ A; 3SPH A; 4RO2 A; 3MAQ A; 2F23 A; 3L72 H; 2Y4U A; 3SPI A; 5CB4 A; 2GSM B; 1KBH A; 1OCZ C; 4MS2 A; 3CCJ V; 1YIT V; 4IGG A; 4ASU G; 3QG5 A; 4UV9 A; 5FNV B; 4LF4 B; 1JA8 A; 3K9A A; 1F23 A; 1F4M A; 3JAL B; 4JI8 B; 2OWO A; 1QR8 A; 3P32 A; 4PDM A; 3UO3 A; 4YY3 B; 2MK3 A; 1HR0 O; 3FB7 C; 3OR7 C; 1VF5 B; 1NS1 A; 4GLX A; 3IFX A; 3T1C A; 2UXD O; 5EC2 C; 1L0N H; 1PL4 A; 1YSC A; 1K4C C; 3OUS A; 3E8F A; 4QJF B; 3ZHV A; 2CUG A; 1I94 B; 4DV3 B; 1RPR A; 3LDE A; 4U7N A; 4YJ3 B; 4O4H A; 1VQ7 V; 5D5Q A; 4FMT A; 2UUC B; 4YIO A; 4DV7 O; 3FYE B; 4PA9 A; 1QLN A; 4DUY B; 4FFB B; 1VQ4 V; 4GUN A; 4WFA V; 3RFR A; 2C2A A; 4EB6 A; 1X4T A; 3K3W A; 2WLH A; 2E76 B; 3JAS A; 4LC1 A; 1SZT A; 5LMN B; 3BCC H; 3HB3 B; 2WLK A; 4W4K A; 1B6Q A; 2DN9 A; 1SQG A; 4CC5 A; 1XRE A; 4MSW C; 1VQM V; 4CH5 A; 1B3Q A; 4LF7 B; 2HLD G; 3JSL A; 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2X6B A; 3OE7 G; 4PEL A; 4QGP A; 1KQS U; 2XAQ A; 3LSS A; 2ZKO A; 5JJE B; 4U3F H; 3SYA A; 5B1B B; 1GKF A; 2JGD A; 2EZP A; 1WA8 A; 3J80 N; 4F6E A; 5IJ9 A; 1VIB A; 1CEZ A; 1K33 A; 2Q4P A; 2F4V B; 3T2M A; 1KEC A; 4G28 B; 4MVU A; 1EZV H; 4DR4 O; 2D2C B; 2PUS A; 3SJC C; 3T1H B; 4FM1 A; 1P84 F; 2QE7 G; 1WPB A; 3OMI B; 3K5O A; 3GWK C; 5J2U A; 2GUZ B; 2EIK B; 2CDY A; 4JTD B; 3CXC U; 1QLE C; 4X1K B; 5JVD A; 4H33 A; 1IXB A; 4C7U A; 4ZI7 B; 1THZ A; 1KD1 W; 4PA6 A; 1K92 A; 1R3I C; 5CA1 B; 3FAV A; 3KCX A; 1V54 B; 1VF7 A; 3E35 A; 3J7A U; 3HKD B; 1XNQ O; 3D36 C; 4UUJ C; 2WA3 A; 2ZE8 A; 5JH7 B; 3UQ8 A; 3DTU B; 4JI7 B; 2QTS A; 2F43 G; 1R73 A; 3H1I H; 2EIJ B; 4DV1 B; 1DF4 A; 4GX0 A; 5LHH A; 2DE0 X; 1K7D A; 2O57 A; 3A0H Z; 3L9D A; 3U10 A; 2Q73 A; 3P30 A; 4WCE V; 5FNV A; 1MSW D; 5L3E A; 1IDS A; 3TK1 A; 1YDX A; 3SR2 C; 3JAL A; 5EBW C; 3K5L A; 1SES A; 3CCE V; 1NR7 A; 4IYI A; 2Q67 A; 1G1X B; 5IWA B; 2DJV A; 3KKY A; 1FAF A; 3HKE B; 1Z5W A; 3K9S A; 3R65 A; 3L74 H; 5BR8 B; 1W2B U; 3S3W A; 4X8A A; 1BQZ A; 1SF9 A; 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