The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
22
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sequence length |
68
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structure length |
68
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Chain Sequence |
EELVDPLTTIREHCEQTEKCVKARERLELCDARVSSRSHTEEQCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNKLK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Rational Design of Highly Potent and Slow-Binding Cytochrome bc1 Inhibitor as Fungicide by Computational Substitution Optimization
doi rcsb |
| molecule tags |
Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
|
| molecule keywords |
Mitochondrial ubiquinol-cytochrome-c reductase complex core
|
| total genus |
22
|
| structure length |
68
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| sequence length |
68
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| chains with identical sequence |
U
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-07-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| H | PF02320 | UCR_hinge | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BGY H; 1NTK H; 3TGU H; 3CX5 F; 2BCC H; 1BCC H; 3L73 H; 3H1J H; 4PD4 F; 1NTZ H; 3L74 H; 1P84 F; 1L0N H; 3H1H H; 1L0L H; 3L72 H; 3L71 H; 1SQQ H; 1NTM H; 4U3F H; 5KLV H; 1PP9 H; 1KB9 F; 1SQV H; 1SQX H; 1EZV H; 3H1K H; 3H1L H; 2IBZ H; 2A06 H; 1SQP H; 4D6T H; 1KYO F; 3CXH F; 1BE3 H; 1SQB H; 1NU1 H; 3H1I H; 1PPJ H; 3CWB H; 3BCC H; 3L70 H; 2FYU H; 3L75 H; #chains in the Genus database with same CATH topology 4PA3 A; 1NVP B; 1WB8 A; 1N33 O; 2K1E A; 4UVA A; 3G6B A; 3GWO A; 4UB6 Z; 3B2E E; 3KZI Z; 2GV9 A; 4K0K O; 1VP7 A; 5JJJ B; 2CTP A; 5CA0 B; 5HFL A; 1XQ8 A; 1VF5 B; 3R66 A; 3SPG A; 3CRR A; 4I4T A; 1WN7 A; 2Q7G A; 3TET A; 2CTQ A; 5LGN A; 4MTF A; 2XND G; 5LP6 C; 5C93 A; 3SYO A; 1G6U A; 4Z1V A; 1RFY A; 3E8G A; 5DEC A; 2YIA A; 4YHH B; 4LWS B; 4W4L A; 4P30 A; 1K8A W; 5IWA O; 4X62 B; 1K73 W; 1H2L A; 1Z2G A; 1BQZ A; 5J9P C; 1D5N A; 4J7J A; 4NVP A; 1V54 C; 3ZMU A; 4DR3 O; 2M6Y A; 1ZSP A; 2LGQ A; 2RQ6 A; 2Z5U A; 3ABM C; 3OE7 G; 4AQY O; 1K4D C; 1I7F A; 3K5L A; 3SPJ A; 5CB4 A; 1BSM A; 2WLL A; 1ZTE A; 1BE3 H; 3SJQ C; 4TT3 G; 2ITC C; 1XDC A; 4UUJ C; 1EM1 A; 1FS0 G; 1R3K C; 1FFX B; 2ZE6 A; 3THO A; 3K5M A; 3CRM A; 3X2Q B; 3AEI A; 2EZP A; 3DXR A; 2X6C A; 4J10 A; 1WB7 A; 2QTS A; 1M4U A; 3CCL V; 1DGS A; 4WFE A; 4I50 B; 2ZE5 A; 4ICG A; 5LXT A; 3FYE B; 1RSO B; 4JI5 B; 2YXL A; 1HNZ O; 1H2S B; 5EBL C; 4BWA A; 3BVO A; 3F7Y C; 5BMV A; 2A3Q A; 3E86 A; 4D7T A; 5CA1 A; 3N2K B; 3C3S A; 1XMO B; 4F4L A; 1S0V A; 3VQW A; 1I94 O; 3HR0 A; 2P7T C; 2L6L A; 4FLT A; 4JAV A; 1K5Q A; 3NR7 A; 3BAA A; 1M5I A; 2XAQ A; 1YHQ V; 4B3S B; 4QE9 A; 2RN9 A; 2F66 C; 4LFC B; 1K3E A; 1Q81 W; 3G4S V; 4CH3 A; 1Y74 A; 3K08 A; 4JV5 O; 3CRQ A; 4TUY B; 3LUT B; 1H2K A; 4WCE V; 3F7V C; 4DR4 O; 1K7D A; 2P4K A; 2NN4 A; 3ZHS A; 1F7Y A; 1R6T A; 2WLN A; 3KCY A; 4X1K A; 3U10 A; 4GKK O; 1D5A A; 3EFF K; 1PNM A; 3OMI B; 1R3J C; 2QA4 V; 1YIT V; 1URF A; 3SYP A; 2UU9 O; 4WFF A; 3JAW B; 3HKD B; 2JGD B; 1YZB A; 4B3R B; 3OFN G; 4Z1M G; 2YIC A; 1P7B A; 3UT5 A; 2F1M A; 4LR3 A; 1K33 A; 4LFB B; 2ZD9 A; 3RW0 A; 3N2G B; 4DV2 B; 1XNR B; 1HNW O; 1M57 B; 4DUY B; 3L73 H; 1VQ7 V; 4X66 O; 1DLB A; 3T1Y B; 3SYQ A; 4XBF A; 4JYA B; 4JI2 O; 3JAM N; 4RAI A; 3A2F A; 5KHG A; 5LGU A; 2IJI A; 4P9O A; 4PDR A; 4I4T B; 3A0R A; 4QGP A; 1VQ9 V; 2E5L O; 3E8B A; 1TGO A; 1OCC B; 4JI0 O; 1HDJ A; 1NI8 A; 4QNH B; 2DN9 A; 4F6R A; 3ML0 A; 5JCO C; 3B8N A; 1P84 F; 5LHH A; 5FNV A; 1OCZ B; 5EYP A; 3OW2 U; 3CCM V; 4UFZ A; 2EIM C; 2EZO A; 3M7M X; 3BEH A; 2HR3 A; 3B4S A; 4ZBM A; 1N0N A; 4OPH A; 5BZB A; 1O9G A; 2E76 B; 3OTF A; 1VQ5 V; 1N32 O; 2PYJ A; 2R9R B; 1IXM A; 1NR1 A; 4FZ0 A; 2Q67 A; 1WPX A; 3RYH A; 3BA8 A; 2EUL A; 1F51 A; 1Q43 A; 3E35 A; 4CS4 A; 4QJF B; 2Y69 B; 3D8C A; 2B9Z A; 1OCR B; 4DRX A; 3T1H B; 4DR5 O; 5CB4 B; 3I56 V; 3HPL C; 2WLL B; 4I0X A; 2ZM6 O; 1QVF U; 4LF9 B; 4X1Y A; 3BCC H; 1N8R W; 4UCO A; 5B5E Z; 2N05 A; 4GZR B; 1LNQ A; 3OD4 A; 4RUE A; 3KCX A; 4J80 A; 5A9G A; 3DXR B; 2R72 A; 2Y48 A; 3F5W C; 2QKA A; 1FPO A; 5DED A; 3R65 A; 1WP8 A; 5FPO A; 2UUA O; 3J80 N; 4YJ3 A; 5LXT B; 1VQM V; 4MVZ A; 4TSF G; 1MNG A; 5BMV B; 2CH7 A; 1N36 O; 2QJ1 A; 5IE9 A; 1ARO P; 5CA1 B; 4PD4 F; 3SJA C; 5BR8 O; 1SRY A; 4DV6 O; 1XNQ O; 3SJC C; 2VWK A; 4JI4 B; 4X89 A; 1YJ9 V; 2YIB A; 2Y69 C; 5KA5 A; 3B40 A; 1OCR C; 3CC7 V; 1UFI A; 2EIN C; 1M90 W; 1CEZ A; 1Y74 B; 1EBO A; 2Q73 A; 4O4J A; 4JI6 B; 1G1X B; 3JAS A; 3CRA A; 1QNM A; 1ENV A; 4FVM A; 1THZ A; 4B3T O; 4AI8 A; 2YID A; 3MHS C; 4FJC C; 5C8Y A; 4X64 B; 5ITZ A; 1HNX O; 3QO5 A; 4U7O A; 1PNK A; 4D6T H; 2O57 A; 3D3I A; 4X1K B; 5LP6 A; 1AI5 A; 4K0K B; 4DV3 O; 2ZCE A; 2BOB C; 4O2B A; 1E1Q G; 1K92 A; 1RM1 C; 1GO3 F; 3C3T A; 5L3C A; 2OYQ A; 4DYL A; 3CCV V; 1BS3 A; 3UT5 B; 4O2A A; 5IY5 B; 3VQY A; 1Y6X A; 2RJZ A; 3OMA B; 4PHZ A; 3N27 A; 2YXY A; 4CH5 A; 2AXT Z; 3LNN A; 3OEH G; 1AB3 A; 2YUA A; 1IBK O; 3CHX A; 5KAI Z; 1S5J A; 1AR4 A; 4NXN B; 1AI6 A; 1L1F A; 1NTM H; 1QCE A; 1GM8 A; 2DOS A; 4DK0 A; 1PNL A; 4CC6 A; 2V4D A; 4OX9 O; 1S5L Z; 1SZX A; 3NXS A; 4TWK A; 2D3O W; 4K8Z A; 4GUN A; 3QNE A; 1Z5W A; 4F6R B; 5B1A B; 3P30 A; 5L3E A; 1VQP V; 5L3D A; 2Z0A A; 3ASN C; 1KKC A; 5FNV B; 4P2Z A; 3OEE G; 5EYP B; 3F5T A; 1FD9 A; 4JI1 O; 1S5H C; 3T1C A; 2HLD G; 3CP1 A; 4PEL A; 3HKE A; 3RWR D; 3CWB H; 2OIG A; 4X9Q A; 5J2U A; 3ABT A; 4DR1 O; 3RYH B; 3ZMZ A; 4J42 A; 5H6Q A; 3ZRV A; 3IJ4 A; 4EKW A; 3C90 A; 1P4R A; 2QM7 A; 4DRX B; 4JI8 O; 4J7Z A; 1Q86 W; 4DR7 O; 2ZE7 A; 3WB0 A; 4BAY A; 4I0X B; 1Y76 A; 2P5O A; 2F93 B; 4X1Y B; 3CPW U; 2EJR A; 3IC7 A; 2UXB B; 5B1A C; 3BHP A; 2Q68 A; 2CGN A; 2XTA A; 4EB6 A; 4J7K A; 4IHJ A; 4TV9 A; 2DJV A; 5KLV H; 4DR2 O; 4KP4 A; 4YJ3 B; 3OTO B; 4NB5 A; 2CH7 B; 4JV5 B; 3LDE A; 3RN4 A; 5JJN B; 4PDV A; 4DV0 B; 1XMQ O; 1Q90 D; 2EIL B; 1FXK A; 3GB7 C; 3JAK A; 1X59 A; 2QWR B; 3P3N A; 1YXB A; 2LGW A; 3JD3 A; 3UO3 A; 3RYF A; 2FTK A; 4FLW A; 2HJD A; 4L8J A; 1EN6 A; 1ZLZ A; 3WB2 A; 1YCI A; 3A8T A; 1GMG A; 3JAS B; 5BXZ A; 3CRC A; 4JTC B; 3ZN1 A; 4J41 A; 1NZ6 A; 3OGI B; 2UUC O; 4UCR A; 2WSS G; 3RVY A; 1S72 V; 1HR0 B; 3ZRW A; 5C8Y B; 5ITZ B; 1GTO A; 2DWE C; 2H94 A; 2HVK C; 1OHH G; 1Y67 A; 2N74 A; 1GN6 A; 2YXH A; 1KYO F; 4PA9 A; 5LP6 B; 3CC2 V; 1EN5 A; 2F4V O; 1NBM G; 4FIP C; 4O2B B; 1FXH A; 2HP8 A; 3SDL A; 2R9A A; 4UCS A; 3SR2 C; 2LP7 A; 1KEC A; 1SC5 B; 2EIL C; 2GTA A; 4O2A B; 4LF8 B; 4K35 A; 4JTD B; 4DR6 O; 2P67 A; 4TQF A; 4K3A A; 4Q20 A; 4FM0 A; 4FLZ A; 4GX1 A; 4DK1 A; 1V54 B; 4BW9 A; 5JVD A; 2YDE A; 1AJQ A; 3K58 A; 2DE0 X; 1NT2 B; 4WBN A; 3ABM B; 2B1I A; 1S3J A; 2A79 B; 1SER A; 4X65 B; 1VQ4 V; 4KFM A; 4P9P A; 4X20 A; 2NR5 A; 2X6A A; 2RMK B; 2WA3 A; 4LCU C; 1L8D A; 1ROP A; 2ZXW B; 2IW5 A; 2PF4 E; 1YTF D; 4YY3 O; 4KHP O; 1YF2 A; 2B5U A; 2LJ2 A; 1JPX A; 4LF4 B; 4G28 B; 2UXD O; 3U11 A; 1SQV H; 4CH4 A; 2OCH A; 2UUB O; 3HKE B; 1BZK A; 1XL4 A; 3SJB C; 4MVQ A; 4JYY A; 5J2U B; 3K03 A; 2WA4 A; 1NH2 D; 3STZ C; 4GCZ A; 4OPA A; 3KG2 A; 1WP7 A; 1Q6U A; 4CBC A; 2F23 A; 5D5Q A; 4AHC A; 2OCC C; 1Y76 B; 5LA6 A; 4OXS A; 4MS2 A; 1TUE B; 4FLV A; 2HHH O; 3ZRS A; 5AG2 A; 2EX3 A; 1IBL O; 2ZXW C; 1EN4 A; 3FB5 C; 1L0N H; 3SPC A; 2HVJ C; 4EB6 B; 5J2T A; 4DUZ O; 3L72 H; 5H6R A; 4IHJ B; 4TV9 B; 5K1P A; 2FB5 A; 1TAE A; 4EFE A; 1NQT A; 1FJG O; 2HEP A; 2HKO A; 2ILM A; 1PL0 A; 3B09 A; 3G71 V; 2GHY A; 4GLX A; 4HZ3 A; 3H9V A; 5IYB O; 1SF9 A; 1FXK B; 5B1B B; 3JAK B; 1SQQ H; 4U7N A; 4JZG A; 3ETE A; 3W7X A; 2GDS A; 1BHA A; 1OV9 A; 2CK3 G; 4LF6 B; 3H1K H; 3RYF B; 4ZIB A; 1FFT B; 4LF7 B; 3CXH F; 2DYR C; 3T4D A; 1IX9 A; 4LP8 A; 3BPZ A; 4X88 A; 1Q8I A; 5CBH A; 4DV7 O; 2QKC A; 1OJH A; 4DV5 O; 5LMU B; 1JA8 A; 2UXC O; 2DWD C; 4QIW F; 3JAL A; 1PP9 H; 2OT5 A; 1QVG U; 3ZRW B; 2XAJ A; 1ZWI C; 1VAR A; 5LOV A; 2IH3 C; 3H1I H; 3LSQ A; 1N34 B; 3OM3 B; 2G38 A; 2H3O A; 5LYJ A; 4GKJ O; 4FM1 A; 3TJT A; 2WPD G; 2HFE C; 1TUB A; 4HBN A; 3RT3 C; 1P7G A; 3L9D A; 2IH1 C; 1FAF A; 2QM8 A; 1FXK C; 2QR4 A; 5B1B C; 1YIJ V; 1MA1 A; 2EIM B; 1NH2 B; 5TIS Z; 3ZHV A; 4JF3 A; 1JQ0 A; 4FLY A; 1D2D A; 5JVD B; 1M56 C; 3FD9 A; 4HYO A; 4WBN B; 2E74 B; 3ZHT A; 3IFX A; 3UCS C; 1IBM O; 4G27 B; 1F4N A; 2QWN B; 3PN1 A; 4A5U B; 4X20 B; 2FKX A; 2EIJ C; 3D36 C; 1VF6 A; 2EBO A; 1CP9 A; 1JFF A; 1GH6 A; 1JR9 A; 3CJH A; 2LO1 A; 3CX5 F; 1COW G; 1XL6 A; 4LFA B; 3ABL C; 4YIP A; 4H44 B; 5LL6 Y; 3TK1 A; 2WLI A; 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