The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
231
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structure length |
231
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Chain Sequence |
IMPQHDQLHRYLFENFAVRGELVTVSETLQQILENHDYPQPVKNVLAELLVATSLLTATLKFDGDITVQLQGDGPMNLAVINGNNNQQMRGVARVQGEIPENADLKTLVGNGYVVITITPSEGERYQGVVGLEGDTLAADLEDYFMRSEELPTRLFIRTGDVDGKPAAGGMLLQVMPAQNAQQDDFDHLATLTETIKTEELLTLPANEVLWRLYHEEEVTVYDPQDVEFKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of monomeric hsp33
rcsb |
| molecule keywords |
33 kDa chaperonin
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| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
53
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| structure length |
231
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| sequence length |
231
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | helix hairpin bin | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(bab) Sandwich | Hsp33 domain | Hsp33 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VZY A; 3M7M X; 1VQ0 A; 1HW7 A; 1I7F A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WN7 A; 1BGY H; 1VQM V; 1Q5O A; 1YEW A; 3B40 A; 4DV6 O; 3G67 A; 3FB6 C; 2XAG A; 3E2E A; 3HKE A; 3JD3 A; 4NYK A; 4O4J A; 4R50 A; 3MAQ A; 2IH1 C; 2QTS A; 4J7J A; 4LH6 A; 1W2B U; 4TQF A; 1PL4 A; 1BCC H; 5EC2 C; 1SC5 B; 4KFM A; 4ABM A; 4OXS A; 1SQB H; 2WLL A; 4FJC C; 4DR1 B; 3PN1 A; 1OHH G; 2HEP A; 2JK5 C; 2OCC C; 3D8C A; 2R9R B; 2DYR B; 3ZJZ A; 1M57 B; 1XNR B; 3KKY A; 2HFE C; 2F23 A; 3ZRX A; 3DC5 A; 2ZR3 A; 5JQG B; 5B1A C; 5CA1 B; 3JAL B; 4RO2 A; 1MG1 A; 3HKD B; 4BIO A; 3CMA V; 3SDL A; 3K79 A; 1NZ6 A; 1VF7 A; 1B3Q A; 3CCS V; 4AHC A; 3CRA A; 2JRI A; 4QE7 A; 4J10 A; 2WLI A; 2CH7 B; 4OPH A; 1KQS U; 2FML A; 3L9D A; 2CTQ A; 1AB3 A; 4O4H B; 1W0J G; 2N05 A; 1BSM A; 1QHT A; 4NTW A; 3CCV V; 4MVO A; 1XMO B; 3SYC A; 1ZAU A; 1URF A; 2QJ1 A; 3W7S A; 1YTF B; 4B7E A; 2RQ6 A; 4JV5 O; 1ZUQ A; 4HYO A; 1VQN V; 4EEQ A; 3RGB A; 4DV1 B; 4LF7 O; 2ZKO A; 1XQ8 A; 1SS3 A; 2WLJ A; 4QE9 A; 5C8Y A; 1BL8 A; 2DOS A; 1FJG B; 3HKC B; 3IJ4 A; 3QO7 A; 1E1Q G; 1NTK H; 4GX0 A; 4PDV A; 1BS3 A; 5LMN B; 2DWD C; 2JS5 A; 4DK0 A; 1XI1 A; 2P06 A; 4TQD A; 1OCZ C; 3HKB A; 2HHH B; 3VOU A; 3TCU A; 3LSU A; 4LF8 B; 2C2A A; 3OTO O; 4AI8 A; 4HAM A; 3UCS C; 1RP3 B; 3J7A U; 2Q67 A; 3ZRW A; 3Q4H A; 2YSU B; 2EIK B; 2PY5 A; 1XMQ B; 2UU9 O; 4B3S O; 2HG5 C; 4IL6 Z; 4J41 A; 1XHX A; 2Q69 A; 1FPO A; 2YI8 A; 1MAB G; 4K35 A; 2UXD O; 3NXS A; 1RM1 C; 1N34 O; 1ZL8 A; 4W4L A; 5IYD O; 5L3C A; 1SQV H; 1N0N A; 1ZSP A; 1NR7 A; 1XDC A; 3IAY A; 3RYI B; 2P22 C; 4UV8 A; 4ZBM A; 1Q6I A; 1VQ0 A; 4GLX A; 2JIZ G; 1NT2 B; 4F6R A; 2UXC O; 1PL0 A; 3AG2 C; 2BTQ A; 1ARO P; 4DK1 A; 1MA1 A; 4O2B B; 3BVO A; 3CCE V; 2CTR A; 2F93 B; 3HPL C; 1TVK B; 1NVP D; 4TV9 A; 2YXY A; 3RVZ A; 1JR9 A; 5LMU O; 3CCU V; 4UB6 Z; 4R8C A; 4WBN A; 4WFH A; 1XHZ A; 2H8P C; 2JVD A; 3OT7 A; 3H1K H; 4PA3 A; 5KA6 A; 4FLZ A; 2LO1 A; 5BMV B; 1WP8 A; 4LF4 O; 3E8B A; 4WFB V; 2YI9 A; 2NNU A; 5LGN A; 1GN4 A; 1RSO A; 3LSQ A; 3SGI A; 3TK1 A; 2D3O W; 4PDM A; 2IH3 C; 3ABL C; 5DED A; 1Y76 B; 3DC6 A; 1LUW A; 3RVY A; 4LF7 B; 3K58 A; 5KMG A; 1FXK A; 1NJI W; 5EZY B; 3J81 N; 2XOK G; 1H2M A; 3AG3 C; 4B08 A; 1NTM H; 4B3T O; 4I0X A; 5KHJ A; 1HNW O; 3AK3 A; 5KUK A; 1TGO A; 3G4S V; 3K5N A; 3SR2 C; 2A79 B; 4QGP A; 4J11 A; 5LGU A; 2AGA A; 1OCC C; 4A5U B; 4XBF A; 3BY6 A; 1AR4 A; 2UU9 B; 4KHP O; 3ZMT A; 1AP6 A; 5LXT A; 2GUZ A; 2Q8V A; 3KCX A; 3DGE A; 2D2C B; 3H1L H; 1O9G A; 2UXD B; 1R3J C; 3F5T A; 5KLV H; 4MVZ A; 3SYP A; 3KZI Z; 1KUQ A; 2Q73 A; 4GKK B; 1G1X B; 1FFX A; 1SQX H; 2EZO A; 1YZB A; 1TAE A; 4G2K A; 4DRX B; 5GON B; 1V54 C; 2WLM A; 4JYC A; 1L1F A; 4UCO A; 2N74 A; 5JWP A; 2BSK A; 2FTK A; 4GCZ A; 4FM2 A; 2UXC B; 4H44 B; 3E89 A; 1JOY A; 2ADP A; 1NS1 A; 2RJZ A; 3RYF B; 2OCH A; 4DR2 O; 3TGU H; 4LF9 B; 4WFE A; 4X1I B; 5BXZ A; 2IU3 A; 1VZY A; 5J2U A; 3ABU A; 5LMU B; 1M56 C; 2EIM B; 2B1I A; 2A9H A; 3BRC A; 2XAQ A; 5IT9 N; 5L3B A; 4U7N A; 3SJQ C; 4JI3 O; 2BOB C; 2YEV B; 3B8N A; 5C93 A; 1J5E O; 2IW5 A; 3VQW A; 2HKO A; 3EVK A; 3GWK C; 4LF4 B; 4Z2W A; 4DW1 A; 4D7T A; 2F4V O; 5FPR A; 4JI8 O; 4EB6 A; 5JJE B; 4E4E A; 1N36 B; 2XAJ A; 1DLB A; 2ZNI A; 2Q5Z A; 1ZTE A; 4X20 A; 5LHG A; 1THZ A; 2M6Y A; 4MSW C; 1EBO A; 1Y67 A; 4PDR A; 3O9O A; 4I9Q A; 4D7S A; 2MK3 A; 3AG1 C; 3IFX A; 3RYC B; 1WA8 A; 5KX5 A; 3CRC A; 4LFA O; 5L3G A; 3ZMS A; 1OCO B; 3L75 H; 1XUQ A; 3JD0 A; 3B8M A; 5B66 Z; 4B3T B; 4LH7 A; 1HNW B; 3A0R A; 1SKV A; 1FXH A; 2BTO A; 3MDS A; 5H6Q A; 1S77 D; 1BQZ A; 5IYZ B; 1KEC A; 4XDK A; 4DV0 O; 1IXM A; 4H33 A; 2F43 G; 4KHP B; 1AJN A; 4GX2 A; 4MT8 A; 1IBL B; 1S3J A; 3N27 A; 3OE7 G; 4UVC A; 2Q68 A; 1GRJ A; 1H2S B; 1GN2 A; 1RFY A; 3JAS A; 1N33 O; 5B1B B; 4JI5 O; 5B1A B; 3WU2 Z; 3H1J H; 4DV2 O; 1K7D A; 1JX9 A; 3C3S A; 1XRE A; 5BY1 A; 3E8H A; 1NKD A; 1EN6 A; 4BAY A; 3FAV A; 1R3L C; 4QIW F; 1GTO A; 2PTM A; 1IBM O; 1G8M A; 4XDL A; 2LW1 A; 3SJC C; 1RPO A; 5DEC A; 2CGN A; 1Y66 A; 5K1P A; 5A2Q N; 1QR9 A; 3ZS8 C; 1JPX A; 3CJH A; 4X89 A; 4J42 A; 3SPH A; 4DR2 B; 4IHJ B; 3ICX A; 4MVM A; 4MTX A; 4I50 A; 4FFB B; 3EHB B; 3U10 A; 3B77 A; 3L72 H; 1BHA A; 2ZDI C; 2ZE6 A; 1P49 A; 4ICG A; 4X64 O; 4K0K B; 1PPJ H; 5B5E Z; 1YJN V; 3SPG A; 1YJ9 V; 1QNM A; 3B09 A; 4ZOL A; 1J5E B; 1DTO A; 5F2V O; 4DXW A; 2F4V B; 4I55 B; 4JI8 B; 3M7M X; 4LR3 A; 5GTH Z; 2Y4U A; 1YSC A; 3SYQ A; 4RQF A; 3RWR D; 4DYL A; 1TA8 A; 4LWS A; 1MSW D; 3OR7 C; 3WB2 A; 5IWA O; 3ASN C; 3E22 A; 4D6T H; 1OCZ B; 4JI7 O; 4Z1V A; 2L35 A; 4H37 A; 3B2E E; 4TV8 B; 1Y74 A; 1N4C A; 1FS0 G; 3CE2 A; 2YIC A; 3JAW A; 5E1A C; 1MOF A; 5H5N A; 1KD1 W; 4LFA B; 2ZE5 A; 5AG2 A; 1GN3 A; 1HNX O; 2RNB A; 1BQ0 A; 4YJ3 A; 1K9M W; 1DGS A; 4PJ0 Z; 3WG7 B; 2ZIO A; 1QLN A; 1RM1 B; 5LP6 A; 2QWN B; 2LJ2 A; 4NXN O; 3F7V C; 2JJ2 G; 2L6L A; 2R9I A; 2M7W A; 4FLU A; 3DXR B; 3JD4 A; 4DV0 B; 4LNU B; 1WNS A; 3MHS C; 2KG7 A; 2X7R B; 2Q4P A; 1M9N A; 1KP2 A; 4JI4 O; 4YIO A; 2ZM6 O; 1MNG A; 2EBO A; 2EX3 A; 3AG2 B; 1VQ4 V; 1SZT A; 4XDJ A; 2WAM A; 2DE0 X; 2ZXW C; 5EBW C; 4JI5 B; 5JVD B; 2QM8 A; 1FFT B; 2EUL A; 4IYI A; 2LGW A; 3FYE B; 2ZD9 A; 4BIZ A; 4EFB A; 2WA4 A; 4YHH O; 2QE7 G; 1V9P A; 4DV2 B; 4B3R B; 4H0L B; 3UT5 A; 1T5E A; 3K9S A; 5H9C A; 3E83 A; 5JH7 A; 5ITZ A; 4DUY O; 1R6K A; 1NI8 A; 4LF6 O; 1Q8I A; 2OTJ V; 3T2M A; 2Q0A A; 3FFQ A; 2JGU A; 4I4T B; 5H2F Z; 5IJ9 A; 2YID A; 1I0H A; 4FK5 C; 4UXN A; 3ABK C; 4TT3 G; 2AZ0 A; 3N2G A; 1EN5 A; 1JA8 A; 4O4L A; 4DR3 O; 3ABL B; 4IYH A; 1HR0 O; 2HP8 A; 2P67 A; 2E5L O; 3KCY A; 3OMN B; 1MMM A; 2OT5 A; 3FX7 A; 3RBZ A; 1WB7 A; 5L3F A; 1P4R A; 5JJN B; 4R7C A; 4MW8 A; 1ZWI C; 4BW5 A; 1K4C C; 4HBN A; 4RWU A; 3AG3 B; 2WLI B; 1COW G; 5JCO A; 3VQY A; 3D36 C; 1GH6 A; 4KXR A; 3SPC A; 5IWA B; 5CA1 A; 3JAL A; 3T1H B; 4AIL C; 4HNA A; 1H38 A; 4JI7 B; 3G80 A; 3HKD A; 4U3J B; 1VQ5 V; 1OCC B; 3FB7 C; 2X6B A; 4EKW A; 1QR8 A; 2WPD G; 1AI7 A; 3T4Z A; 1HNZ B; 2V1D A; 3THO A; 4JZG A; 4K8X A; 3ETE A; 3OGC C; 1R73 A; 2CH7 A; 1HNX B; 1R6T A; 2CUG A; 1S72 V; 5LGT A; 2AHZ A; 4BWA A; 1XEQ A; 5C8Y B; 1F7Y A; 1FYJ A; 4EFE A; 5EBM C; 1R1B A; 4YY3 O; 4DR4 O; 2A06 H; 1ORQ C; 4JPR A; 1B04 A; 3ZMV A; 3ZHU A; 2PYL A; 3OM3 B; 2K9P A; 4NXN B; 3HKB B; 2F1M A; 2IU0 A; 3DSQ A; 3UQ8 A; 1X59 A; 3SJB C; 1EZJ A; 1UJW B; 2GV9 A; 2ZM6 B; 3K03 A; 3HKC A; 4DR5 O; 4JYA O; 3ZMU A; 4CZZ A; 2VWJ A; 1CEZ A; 3PJS K; 3JAR B; 3H9V A; 3IC7 A; 2JDI G; 5LP6 C; 5K1X A; 2JJ1 G; 1NR1 A; 1M56 B; 1I5X A; 1KMI Z; 1Q6H A; 4DV6 B; 4NVP A; 2QA4 V; 4KUM A; 4X1Y B; 4UCT A; 1JJO A; 4LP8 A; 2QR4 A; 1TUB B; 3E8F A; 5KA5 A; 4OGQ B; 4OX9 O; 4LF6 B; 2QEX V; 5KHG A; 2ILM A; 3JAT B; 3ZIA G; 5IY5 C; 1AR1 B; 3ABT A; 1SER A; 3H01 A; 2QKS A; 4LFB O; 1VF5 B; 3GWO A; 3ZN0 A; 3RYH B; 1IBK O; 4TV9 B; 3LDC A; 3T1Y O; 3C90 A; 2E5L B; 3RYI A; 5KAI Z; 1SZX A; 1P84 F; 4CC6 A; 3AG1 B; 4LFC O; 1VQO V; 1TUE B; 2HR3 A; 2GTA A; 4O2B A; 2OWO A; 4IGG A; 1Z5W A; 2H94 A; 2PGG A; 4BR6 A; 1TVK A; 3CCR V; 3OMI B; 4B3M O; 3K3W A; 4TWK A; 2GDS A; 2V7Q G; 4NXM O; 4X1K B; 2P4V A; 1RSO B; 1XL6 A; 2RDC A; 1AP5 A; 3JCU Z; 4W4K A; 4MTO A; 1F4N A; 5J2T A; 5HFL A; 2GBO A; 3G6B A; 5KHH A; 1PNM A; 1ENV A; 5BMV A; 4ZI7 B; 3CD6 V; 1BZK A; 4DUZ O; 2YUA A; 4JV5 B; 2UUB O; 5LYJ A; 3STZ C; 3OGI B; 2JGD B; 3TET A; 1Q86 W; 3OMA B; 2DYS C; 3JYC A; 2HJF C; 4YY3 B; 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1BT8 A; 1QVF U; 3OR6 C; 3RT3 C; 4LF5 O; 2X6A A; 3GB7 C; 2UUB B; 1F4M A; 3K59 A; 1N32 O; 4MW3 A; 5TIS Z; 1VQ7 V; 1JCH A; 3JSL A; 5BR8 O; 4GZR B; 3ZHS A; 5EYP B; 3R66 A; 1KB9 F; 3CYO A; 3FD9 A; 3ZX6 A; 5KHI A; 2P5O A; 2A7W A; 1Q43 A; 5FPO A; 1A32 A; 4PI2 A; 1JJ2 U; 3RYC A; 4YJ2 B; 1NVP B; 3JSN A; 4UCS A; 1OZ0 A; 3N2K A; 4P9P A; 4WFG A; 1WP7 A; 5CB4 B; 1H8E G; 1L8D A; 1VQ8 V; 2YIA A; 3F7Y C; 4JI1 O; 4X9Q A; 3CRR A; 2OCC B; 5DM6 V; 1FXK C; 3JAS B; 1O9H A; 2QWR B; 4FPP A; 2PI5 A; 1SQG A; 5CA0 B; 4AQY O; 3H1I H; 1SES A; 3K9A A; 2IJK A; 2PF4 E; 1MZE A; 3UO2 A; 1I94 O; 1YDX A; 4BW9 A; 1H2N A; 4JTA B; 4DR7 B; 3OTF A; 1PKX A; 5B3S C; 2ADQ B; 3SPJ A; 1QLE C; 1US6 A; 2W0X A; 5KUM A; 3OEE G; 1I7F A; 2Q7H A; 2UXB O; 2A3Q A; 1Z5V A; 1CPY A; 3WB0 A; 5LOV A; 2LFS A; 3VBB A; 2IM9 A; 4IIJ B; 4O4I B; 2PZS A; 1JFF B; 4LBE C; 2K1E A; 3CJH B; 2KQX A; 1VAR A; 1EM1 A; 2LP7 A; 3QTC A; 1XNQ O; 2JEX A; 3M99 B; 1WJZ A; 4GKJ B; 3T1C A; 1FXV A; 4L8J A; 3W7T A; 3UKM A; 4JI3 B; 2KKW A; 4X65 O; 1FD9 A; 1AJP A; 4ZOL B; 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