The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
231
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structure length |
231
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Chain Sequence |
IMPQHDQLHRYLFENFAVRGELVTVSETLQQILENHDYPQPVKNVLAELLVATSLLTATLKFDGDITVQLQGDGPMNLAVINGNNNQQMRGVARVQGEIPENADLKTLVGNGYVVITITPSEGERYQGVVGLEGDTLAADLEDYFMRSEELPTRLFIRTGDVDGKPAAGGMLLQVMPAQNAQQDDFDHLATLTETIKTEELLTLPANEVLWRLYHEEEVTVYDPQDVEFKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of monomeric hsp33
rcsb |
| molecule keywords |
33 kDa chaperonin
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| molecule tags |
Chaperone
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| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
53
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| structure length |
231
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| sequence length |
231
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | helix hairpin bin | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(bab) Sandwich | Hsp33 domain | Hsp33 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VZY A; 1VQ0 A; 1HW7 A; 1I7F A; 3M7M X; #chains in the Genus database with same CATH topology 4LF4 B; 2IBZ H; 1FPO A; 1ZWI C; 5H6Q A; 4ZOL A; 3JAL B; 3ZHU A; 1SQP H; 3WB2 A; 3BAA A; 1Q7Y W; 2QKA A; 5BR8 O; 5FNV B; 2GUZ A; 3ZMS A; 3OUS A; 1K3E A; 1RM1 C; 2EIN B; 4XDL A; 3CC7 V; 2DWE C; 2ATK C; 1AIL A; 5EZY A; 1WPB A; 3E8G A; 4UCS A; 2YIB A; 2XTA A; 2FB5 A; 5LXT B; 3ZHQ A; 1QLE B; 1K8A W; 4YJ3 B; 4O4L A; 2LO1 A; 3QO5 A; 3AK1 A; 3UT5 A; 2P90 A; 2HHH O; 2OWO A; 5FLX N; 2FYU H; 3MHS C; 2KKW A; 2WLL B; 4JV5 B; 3OMI B; 3W7U A; 3AG3 C; 1BQ0 A; 1VQK V; 4E2L A; 2UUA O; 5IWA B; 3PN1 A; 4X62 O; 4TV8 A; 4O2B B; 1HNZ O; 3DXR A; 5AG2 A; 4MS2 A; 2N04 A; 4O4H A; 1PP9 H; 2YIC A; 4ICG A; 4I5S A; 4J80 A; 2ZIO A; 1OHH G; 3G67 A; 3RGB A; 4DV2 B; 1P7B A; 1GTO A; 4DUY O; 4Z1V A; 4NXN B; 5FPO A; 3K57 A; 2F93 B; 4X64 B; 4UV9 A; 3QF7 A; 5GTI Z; 3FFQ A; 4DV7 B; 1DF5 A; 4WBN A; 2FL4 A; 5CA1 B; 4I7Z B; 1AP5 A; 1NS1 A; 2ARH A; 2GTS A; 2N74 A; 2YXY A; 3FB7 C; 5KA5 A; 5KX5 A; 1FXK A; 3IFX A; 2ZDI C; 1AJQ A; 3ASN C; 3A8T A; 2B1I A; 2BSK B; 1QVG U; 5BXZ A; 5LHG A; 2YIA A; 2QTO A; 1IBK O; 2F1M A; 3SPJ A; 3T2M A; 1L0N H; 5EK0 A; 4X1K A; 2YXL A; 2CH7 B; 3E22 B; 4B3T O; 1K33 A; 4N23 A; 2HG5 C; 2WLN A; 3SPH A; 2UXX A; 1WB7 A; 4JYA O; 4I50 B; 2EJR A; 2FTK A; 3W7W A; 1IZ3 A; 2LP7 A; 3VQV A; 1K92 A; 1Q90 D; 2W6J G; 1SQG A; 3TJT A; 1YHQ V; 4OX9 B; 4DV3 O; 1XL4 A; 5KHK A; 1D5A A; 1OCZ C; 1GKF A; 1N36 B; 4JI6 O; 3JAM N; 1GRJ A; 1SES A; 3WG7 B; 4LF6 O; 5K1P A; 2WLH A; 1WPX A; 2ZCE A; 3ABK B; 4J9Z B; 1T5E A; 2NN4 A; 2LW7 A; 2WSS G; 5CA0 B; 1VF6 A; 1PNK A; 1YCI A; 1WB8 A; 2WLI A; 4C7U A; 3CCE V; 3JAR B; 2HVJ C; 4LBE C; 1U97 A; 2XAS A; 2QWO B; 1IBL O; 2JDI G; 3W7T A; 3CC2 V; 1YVW A; 3G80 A; 2UXN A; 4IYH A; 3OGC C; 1AR4 A; 3IGA C; 4ZI7 B; 4FK5 C; 4D6T H; 5LYJ B; 3ASO C; 4KXR A; 1SET A; 2RCV A; 4DV5 B; 3F5T A; 2UUB O; 2KSD A; 1I5X A; 2BTQ A; 1YZB A; 3DTU B; 1QHT A; 1HNW O; 5B3S C; 1QU7 A; 4AI8 A; 3U10 A; 5L3B A; 2XHB A; 1JFF A; 1H8E G; 1HR0 O; 4PDV A; 3ETG A; 2ZT9 B; 4I0X A; 2RMK B; 2BE3 A; 4LFA B; 3F5W C; 1SQQ H; 4DR3 O; 3D3I A; 1EN6 A; 4WFH A; 4DV0 O; 4MTF A; 5LOV B; 3K04 A; 1IBM O; 1SQX H; 3H01 A; 5IYD O; 2WWW A; 1BHB A; 4K0K B; 3LSS A; 4UB6 Z; 1U96 A; 2Q69 A; 4FFB B; 4LF8 O; 2RQ6 A; 2V1D A; 4LR3 A; 2PF4 E; 2IJI A; 3RYF A; 4JI4 O; 4IGG A; 1GMG A; 3P32 A; 5LHI A; 1DF4 A; 5B1O A; 4I55 A; 3CSX A; 1F4M A; 1KU9 A; 1AP6 A; 2Y4T A; 2DYS B; 2X6C A; 5JH7 A; 2HEP A; 2CTW A; 4FLX A; 3T4Z A; 3OT7 A; 4IIJ B; 3RYI B; 5LGN A; 4LFC O; 1GO3 F; 3LDC A; 3T1H O; 3BHP A; 4XDJ A; 3AEI A; 3CS5 A; 4D7S A; 1DTO A; 4J7K A; 1FYJ A; 4U3F H; 3QVN A; 1PL0 A; 1KB9 F; 4DV6 B; 4PA7 A; 1MSD A; 2GBO A; 5BMV B; 1VQ5 V; 4IT5 A; 1XBL A; 2OCH A; 2VWJ A; 4GYC B; 2KQX A; 3UQ8 A; 4IYI A; 4K35 A; 2QEX V; 1N0J A; 4CH6 A; 2CDY A; 4B3R B; 3CCQ V; 5LA6 A; 1AJN A; 1TUB B; 2Q6A A; 5CBF A; 1QLE C; 4MTO A; 5IJ0 B; 3JCU Z; 4I4T B; 1N34 B; 4X89 A; 2B5U A; 5LP6 B; 1ZAU A; 1LUW A; 2L35 A; 2YS8 A; 4Z2W A; 4ZKI A; 5JJN B; 1FAF A; 2Y69 C; 4KHP O; 3HB3 B; 2C2A A; 3QNE A; 4GKK B; 3ZHR A; 2OTJ V; 4LF7 B; 2F4V O; 1YIJ V; 4CC6 A; 3BAB A; 1BS3 A; 4U7O A; 5J9P C; 4X8A A; 4LF5 B; 2Z3Y A; 3RWR D; 1FJG B; 2F23 A; 1X4T A; 5KHJ A; 4Q20 A; 4PDL A; 5CN0 A; 1A32 A; 3ZX6 A; 1TVK A; 2A3Q A; 2E76 B; 4PA9 A; 2DYR C; 4KFM A; 2W0F C; 1SER A; 1PNM A; 1K7D A; 2EZP A; 1YEW A; 4FM0 A; 1R6N A; 2UXC O; 3H1H H; 3N2K A; 1JJ2 U; 1G8M A; 4X1Y B; 4RWU A; 3JD1 A; 5DM6 V; 1Q3E A; 2HP8 A; 2ZQM A; 4B3M B; 3JAT B; 1EZJ A; 2P67 A; 2Q8V A; 1K4D C; 4JI2 O; 4O4I A; 5B1A C; 3APQ A; 1M93 A; 1Y66 A; 1MMM A; 4X66 O; 1OCC B; 1MSW D; 3JCZ A; 2PUS A; 3FYE B; 3I56 V; 4X9Q A; 1GM7 A; 3CJH B; 2B1G A; 2ZM6 O; 2XUM A; 3QG5 A; 4QPJ A; 4JAA A; 3SPG A; 3CXH F; 1V55 C; 1IVS A; 1AR1 B; 5CA3 A; 5BR8 B; 1WA8 A; 4H33 A; 1KP3 A; 3WFV A; 2QM4 A; 3UKM A; 4LWS A; 1M1K W; 5D5P A; 4TV9 A; 2E74 B; 1QVF U; 2ZXW B; 3THO A; 1G1X B; 1XL6 A; 3K9S A; 4FFK A; 2GUZ B; 5IDJ A; 1YIT V; 1OJH A; 4DV4 B; 4DK1 A; 1Q82 W; 3G6E V; 2AW9 A; 4X88 A; 3J7A U; 1Q86 W; 1FKA O; 4UCO A; 1Y76 B; 5EZY B; 2HHH B; 4JI3 O; 2KB1 A; 3RVY A; 3AG2 C; 2VRZ A; 4O4L B; 5D5Q A; 4EFE A; 4WFB V; 3K5N A; 5JJE B; 1QBZ A; 2PTM A; 3X2Q B; 5DN6 G; 2UUA B; 2CTQ A; 2IM9 A; 4X62 B; 1SZT A; 1HNZ B; 2UU9 O; 2Q0A A; 2IJH A; 4L87 A; 2PY5 A; 1YJN V; 3A0B Z; 2ZE5 A; 1K4C C; 4GX0 A; 4RQE A; 3FX7 A; 1NTK H; 2MK3 A; 3H1K H; 2EX3 A; 4TV8 B; 3DXR B; 3HKD A; 1XOU A; 5KAF Z; 2PZS A; 4O4H B; 4DUY B; 2A7W A; 4YIO A; 3S3X A; 4B7K A; 3QO7 A; 1Y4M A; 4NKG B; 4GKJ O; 1MG1 A; 3CP1 A; 2M6Y A; 3CMA V; 1J5E B; 1S76 D; 3OW2 U; 1IUR A; 1JOY A; 2Q73 A; 1F7Y A; 2WAM A; 5L3F A; 3AK3 A; 2YI9 A; 3CRC A; 1H8H G; 2EBO A; 3ZMV A; 1KMI Z; 1I08 A; 1FXK B; 5IE9 A; 4B3T B; 1Q43 A; 1COW G; 3OGI B; 3HKB A; 4HNA A; 2UXB O; 2LQT A; 1VQ9 V; 3RYH B; 3LDE A; 4CS2 A; 1VQL V; 4CS3 A; 3OR6 C; 3O9O A; 1XUQ A; 5GTH Z; 1P7G A; 1VQ6 V; 3K58 A; 1XHX A; 2YIB D; 5JQG A; 5F2V O; 2DOS A; 4DV3 B; 4DW0 A; 4LH6 A; 1OV9 A; 4JI6 B; 3T1C A; 4LF6 B; 1NT2 B; 2Y4U A; 1I5Y A; 1GM9 A; 1WP8 A; 2OCC B; 1FXH A; 1HDJ A; 4NR1 A; 4IL6 Z; 2P7T C; 4JYB A; 2JS3 A; 1Z2G A; 4XDK A; 5E1A C; 1Y74 A; 2EIL B; 3DGE A; 3E89 A; 5L3D A; 1GN6 A; 1OCO B; 3FD9 A; 3L72 H; 2ZDI A; 4GX5 A; 3CEI A; 3SPI A; 1YI2 V; 1Q6U A; 2QE7 G; 3LDD A; 4JAS A; 5LP6 C; 4E4E A; 3QO8 A; 2UUB B; 2L6L A; 2KG7 B; 3BVO A; 2DJV A; 1HNW B; 1K5S A; 4LFB O; 5KUK A; 3ABU A; 3SGI A; 4Z1M G; 3E8H A; 1AI6 A; 2BTQ B; 2X7R B; 4X1I A; 3ZCC A; 1HR0 B; 1KYO F; 1ROP A; 4N21 A; 1SA0 A; 4DR6 O; 2ZIN A; 2VQF O; 4DR3 B; 4B08 A; 2JGD A; 4DV0 B; 4DR2 B; 4PA6 A; 2PYJ A; 4F6E A; 4I0X B; 1IBM B; 3WU2 Z; 2QWP B; 3K0D A; 2VWK A; 2ZNJ A; 4YHH O; 2CGN A; 3RN4 A; 1PD3 A; 2QTS A; 2ITC C; 3OMN B; 3CCR V; 1Z5W A; 5LMN O; 1Q6I A; 2QDO A; 3AG1 B; 3OM3 B; 4NTX A; 1VF7 A; 3AK2 A; 2NLJ C; 3U0Z A; 4LC1 A; 1MNG A; 4MVZ A; 1AI4 A; 1AJP A; 5A2Q N; 3CCJ V; 3BFR A; 1IDS A; 2EIM B; 3ZHS A; 5J2U A; 3RYF B; 4YJ2 A; 3BA9 A; 5E79 Z; 5IY5 C; 4LFC B; 4I55 B; 2E3C A; 4UUJ C; 3SYC A; 1XMO O; 3T1H B; 1IXB A; 5EYP A; 1BT8 A; 2LFS A; 3EVK A; 5LMU B; 4JI1 O; 4DR5 O; 2UXD O; 1UJW B; 3IAY A; 3CRR A; 4PV1 B; 2IJK A; 4RUF A; 4JI7 O; 2Q7G A; 1W0K G; 5H2F Z; 4H44 B; 5CBG A; 3CX5 F; 4BIO A; 1TA8 A; 3ZRV A; 3RVZ A; 1WN7 A; 1LR1 A; 2BCC H; 5J2T A; 2H3O A; 5EBM C; 1MA1 A; 3FYI B; 1M90 W; 4FIP C; 2EIK B; 2QKS A; 4NTY A; 2LFR A; 3JSN A; 3FAV A; 3CCL V; 2YXH A; 3UCS C; 1NR7 A; 3CRQ A; 4DR1 O; 3BY6 A; 4KHP B; 4NVP A; 1R6K A; 4PA4 A; 4FM1 A; 1US6 A; 4FLV A; 5LA6 B; 2PYL A; 1E1R G; 1URF A; 2F4V B; 1VIB A; 3N2G A; 4FZ1 A; 1IX9 A; 4RO2 A; 4B7E A; 4YY3 O; 4AQY O; 2DQ3 A; 5IJ9 A; 3T1Y O; 2WPD G; 4MVU A; 5KAI Z; 4EEQ A; 1S77 D; 3C90 A; 1QNM A; 1XDC A; 3CCV V; 1QLN A; 5FPR A; 5C8Y A; 3CE2 A; 4TQF A; 2CAZ C; 2ZE6 A; 2IU3 A; 4JYC A; 1BL8 A; 3GB7 C; 5EC1 C; 1B06 A; 2JJ1 G; 4QNH B; 1PPJ H; 3W7S A; 2R9I A; 3S3W A; 3R66 A; 2PI4 A; 4ZHQ A; 1TVK B; 4UCU A; 3W7X A; 3DC5 A; 3VOU A; 4F6R A; 4DW1 A; 5LHH A; 5IT9 N; 3MAQ A; 4CH3 A; 4DRX A; 2AHY A; 2CTR A; 1R3L C; 1V54 B; 1XNQ O; 1N33 B; 3B40 A; 3N2K B; 2R70 A; 3N27 A; 2P06 A; 2EIJ B; 2LJ2 A; 3TXS A; 4MW8 A; 1WP7 A; 5IYB O; 4X66 B; 1Z5V A; 3K9A A; 4IHJ A; 1M56 C; 1G6U A; 2N05 A; 3ZMT A; 2WLL A; 1BQZ A; 3J80 N; 1H2M A; 3OAA G; 4DUZ O; 4O4I B; 4FZ0 A; 4P2Z A; 1FFX A; 1P4R A; 2PGG A; 2R72 A; 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4Q6G A; 3TCU A; 1O9H A; 4B3S B; 2WA4 A; 3AG1 C; 3WB1 A; 2UXB B; 4R6Z A; 3STZ C; 4MVR A; 5L3E A; 3CPW U; 1CP9 A; 1EN4 A; 1Q6H A; 1QCE A; 3WB0 A; 2DMX A; 2EIM C; 1YJW V; 3K08 A; 1GN4 A; 1H38 A; 1L0L H; 3HKB B; 3AG3 B; 4HNA B; 4DR4 B; 3STL C; 4QJF B; 4H37 A; 1I0H A; 1VQM V; 1UFI A; 2FML A; 1GM8 A; 4MSW C; 3ICX A; 2QGN A; 1HW7 A; 1K5Q A; 3H1I H; 1ZSP A; 4H0L B; 3UO3 A; 2DQ0 A; 4FLU A; 2D3O W; 3Q4H B; 4NYK A; 1NKD A; 1N0N A; 1THZ A; 2ZE7 A; 1KBH A; 1R3J C; 4YIP A; 3EFF K; 3SR2 C; 1JR9 A; 3E35 A; 2QWN B; 1DLB A; 2K9P A; 1HWY A; 2JJ2 G; 3CCM V; 1JVM A; 4LFA O; 1TUE B; 4EKW A; 2O57 A; 1XHZ A; 1X59 A; 4HYO A; 1R3I C; 4ZOL B; 1CEZ A; 2DE0 X; 3ASN B; 2YUA A; 1M4U A; 3WG7 C; 3GWO A; 3ABK C; 4JAU A; 5DED A; 4KUM A; 1VF5 B; 4MTG A; 3OUF A; 2ADP A; 4GX2 A; 4LFB B; 1FFT B; 3DSQ A; 3I55 V; 3E8B A; 1K97 A; 4LNU A; 3OEH G; 2E5L O; 3P3P A; 1YTF B; 4ZBM A; 4DR6 B; 2EJ7 A; 4QE7 A; 2JVD A; 3O65 A; 2QKC A; 3K5M A; 1F23 A; 3UT5 B; 4X1I B; 2QM8 A; 5CB4 A; 1SA0 B; 3A0H Z; 1S5J A; 5BMV A; 1DK1 A; 1VMG A; 2X0L A; 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