1TZDA

Crystal structure of the catalytic core of inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
256
structure length
243
Chain Sequence
GLILKRSSEPEHYCMVRLMADVLRGCVPAFHGVVLQLQDLLDGFDGPCVLDCKMGVRTYLEEELTKARERPKLRKDMYKKMLAVDPEAPTEEEHAPRYMQWREGISSSTTLGFRIEGIKKADGSCSTDFKTTRSREQVTRVFEEFMQGDAEVLKRYLNRLQQIRDTLEISDFFRRHEVIGSSLLFVHDHCHRAGVWLIDFGKTTPLPNGQILDHRRPWEEGNREDGYLLGLDNLIGILANLAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the catalytic core of inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Inositol-trisphosphate 3-kinase A
total genus 60
structure length 243
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2004-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 1tzdA00
2AQXA 1W2DA 4O4EA 2A98A 2IF8A 4O4BB 1W2FA 1TZDA 1W2CA 4O4CA 2IEWA 4FRFA 4O4DA 4O4FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F6XA 2PMIA 4WG3A 1JWHA 5K4JA 2BZIB 5L6PA 1JQHA 2CJMA 3AD5A 4RX7A 2XIRA 4DH8A 5M53A 2O0UA 4A9UA 2G2IA 3VIDA 5EFQA 3PE1A 3R1SA 4BWPA 2XNMA 2BDWA 3CQWA 2A4LA 3ITZA 3SW4A 3W8QA 5LWNA 4D2RA 4FV2A 2PY3A 5IH4A 2QLQA 3CBLA 3LPBA 5JZJA 5G6VA 2XNGA 2R3OA 2ZVAA 3PPZA 4RIXB 4ZZOA 3ZXZA 3VUIA 1ZYCA 2ZM1A 5AV1A 3I5ZA 5AV2A 4RX5A 3Q4ZA 3ERKA 4Y8DA 3CY2A 3ZSIA 3C4XA 4Z7HA 5C1QB 5AUWA 2IVTA 3NAXA 4EH6A 1H25A 3RKBA 1WBVA 3O8PA 4KBCA 2X6EA 2XUUA 2YAAA 5H2UA 3M42A 3MFSA 5BVNA 1OITA 3IOPA 3BU3A 4DEGA 5A6NA 2FVDA 3P08A 4Z9LA 5J95A 4BKZA 1KSWA 3QYZA 2C5OA 1PMUA 1PYEA 2I40A 3QQFA 4PNKA 3SLSA 3CC6A 3C13A 2VX3A 5KZ0A 4FTJA 2CGUA 3IDPA 3RM7A 4I6BA 1WVYA 4DEEA 4QMYA 3HMIA 1YQJA 4G2FA 2V5QA 2WZJA 3EQCA 2ZV7A 2RGPA 2WB8A 2X9EA 2GS2A 3QA8A 4I22A 4FTCA 5CF5A 5TKDA 4ASZA 4IAAA 4ANNA 4EONA 1KE7A 4KWPA 2XRWA 4OBPA 4TYIA 3O71A 5DWRA 5HU3A 1QPJA 4GS6A 2VO7A 3OCTA 3KK9A 2QURA 3FZRA 2UZWE 1XJDA 1MQ4A 3EIDA 5JQ5A 1U46A 1YWVA 3GT8A 3V01A 3JY9A 2VN9A 3QWKA 4AN2A 1Y91A 4EC9A 4MHAA 1H07A 2E9OA 2XJ2A 2WTVA 2PUUA 4BTKA 2ITPA 2Q0NA 5E8YA 2YWPA 3ZOSA 4N70A 4W4YA 1G5SA 2ZMDA 3WF9A 3Q9WA 2QOQA 4TL0A 2QOFA 3SHEA 4F63A 4DITA 4O4FA 2W5BA 2XK3A 1CDKA 4GMYA 4YZ9A 3S1HA 1M14A 5FP6A 3QQHA 4PP9A 5IKWA 1NVQA 5C8NA 4BDFA 3R00A 2YZAA 4IWDA 3A4OX 2W5AA 3TCPA 3RHKA 4AAAA 4I23A 4OTIA 4G6OA 3EMGA 2VTMA 3SDJA 3D4QA 4ZTQA 2F49A 4P5ZA 5KMIA 2HOGA 2I1MA 2BILB 3G9LX 4FTTA 4YP8A 1REJA 3GU6A 5DPVA 4OTWA 3GI3A 4FNWA 4XJ0A 5HOAA 1LEZA 3ZBFA 4M66A 3FXZA 5BUJA 3QLGA 3EFJA 3W2SA 4KD1A 4GL9A 5E8WA 2EXCX 1Y8YA 2OF4A 4C38A 3SQQA 3MPMA 5HG7A 2BTSA 4YZNA 2QQ7A 4CZTA 3VC4A 2H8HA 4GT5A 2IZUA 5A54A 5AP4A 4RJ4A 1XBBA 2P0CA 4E1ZA 2C30A 2JITA 3SD0A 5AA8A 3MH3A 4FKIA 5AP0A 2HZ0A 3DCVA 2O8YA 3PP1A 4LFIA 3EH9A 3NUNA 3AC2A 5CU3A 4CSVA 2RKUA 5JQ8A 3TN8A 4NW5A 4XLVA 4YJOA 5AM6A 1YXTA 3E3PA 5CXZA 3FJQE 3UO4A 1XH4A 3T9TA 1JVPP 2DQ7X 4X6QC 2ZDUA 5AR2A 2IW8A 4M0YA 1UU8A 3VBYA 2BFXA 1MRVA 1H8FA 3MY1A 3IECA 1F5QA 2CCHA 4I5MA 4YJNA 1ZMUA 3HA6A 5ANIA 3U8WA 3V8TA 3ZO4A 1BL6A 5HORA 4XH6A 3AG9A 4FR4A 4KA3A 3V5LA 2PVJA 4BHNA 2X7GA 5A46A 3OWKA 4CV8A 3PVUA 4BCKA 5ACBC 3VUHA 2J90A 3B8RA 3RAKA 4FK6A 1CTPE 3TNWA 4X2KA 5HNBA 2BZJA 4NFNA 4PQNA 2ITYA 5HGIA 3HRBA 2YM3A 3GB2A 3QU0A 3DOGA 4F9CA 3PXKA 2UW3A 2KULA 3NUXA 4XNEA 4FNYA 5E1EA 3ZC6A 4CD0A 5IISA 1CMKE 2VWXA 1OPLA 5EDRA 4QD6A 5KMOA 2QO2A 3QBNA 5KMLA 4QMOA 2VO3A 4BL1A 5K4IA 1P4FA 1QPEA 4QP6A 1PXKA 4L67A 4KBAA 3CJFA 5ETIA 3ZLWA 4C4HA 5DRBA 2OZAB 3AC1A 3L9LA 3FDNA 5E8VA 1BI8A 4RVKA 4QP3A 3WE4A 2JDTA 3U9CA 4BCIA 5GJFA 4XMOA 3MTLA 5A3XA 1LEWA 2DUVA 4XV2A 3VS5A 3VWAA 4IC7A 2CLXA 4EOIA 5HVKA 4TW9A 3G0EA 3GOPA 2R3LA 4FG7A 5E7RA 4QQTA 3LCDA 3A8WA 2C6IA 4AGUA 4JI9A 4JVGA 4C3FA 2P3GX 5D41A 4FL1A 5FDPA 3OY1A 4FKSA 2PVFA 2UW8A 4HPTE 1XH8A 1OL5A 4G3GA 4DH3A 1ZYSA 1VR2A 2YIQA 4GFGA 5BYZA 5C03A 2JBOA 5C8MA 5JFVA 3BYSA 4ZSLA 4XG9A 5AUZA 4EOOA 4CRSA 2IF8A 4KRDA 4U8ZA 3KXNA 4DBNA 2BRGA 3QC4A 4ANOA 1U54A 4QP8A 4IM0A 3NRMA 2J0MB 3C7QA 1BLXA 3VJOA 3QCXA 3DBCA 2ITZA 5FM2A 3JVRA 4JBQA 4MBLA 4NUSA 5ANGA 2O63A 3FMLA 3ZZWA 2CDZA 3QZFA 1Q41A 2BUJA 2X1NA 3O8UA 4OT5A 4I24A 4ERKA 3ORMA 4Y83A 1Z57A 5DNRA 3V5WA 1KOBA 3ZSHA 4BDAA 2VX0A 2ESMA 3D5WA 1PMNA 4YMJA 2B52A 4O0TA 4ZXTA 5KKRC 2B9FA 4XG4A 4YJQA 3VS3A 3UOHA 2H6DA 3H4JA 3V6SA 3V5JA 3CLYA 3ORKA 4XHKB 3BLRA 3Q5IA 4WG5A 4I5PA 4X3FA 1CKPA 3RVGA 3WZEA 4BCMA 4LUEA 2XK7A 5JMSA 4OTPA 3UC4A 3BHTA 1YWNA 3QRTA 4FMQA 3UODA 2XS0A 4GJ2A 4ZSEA 5EI8A 2WTKC 3BWFA 2XJ1A 3FL5A 3ZLYA 3GU4A 2BZHB 5CASA 3TKIA 2ZM3A 3F82A 5CSVA 4B6LA 5IA2A 4P90A 3RJCA 2BTRA 3QWJA 2OSCA 3FWQA 3W2CA 4FSNA 3NUUA 4G3EA 4BIDA 4LV5A 4WNMA 4P2KA 3Q04A 3GBZA 3WF7A 4E20A 1Y57A 5CEPA 5DT4A 3UMWA 2BFYA 3KQ7A 4U6RA 3TJDA 2BIKB 4A7CA 3C50A 1W7HA 4QNYA 3A8XA 3O7LD 2RSVA 4ZEGA 4QMXA 4BCJA 3W2QA 4TWCA 2VTJA 4BGHA 4FTNA 4D4VA 3IONA 3WZKA 4C57A 3B2TA 3VBQA 3LFSA 3PXZA 5DGZA 2GDOA 4WD5A 4I41A 5DI1A 5FEEA 5D7VA 1OIQA 3UIXA 4C61A 3D5UA 1T45A 2YITA 3LXKA 3PIYA 5HCYA 3QQJA 4QYFA 3ZO3A 4J1RA 2BRNA 3ZFYA 5LMBA 2Y0AA 4QP1A 2B1PA 5DR6A 4IVDA 4L44A 3E92A 4L3JA 4O0RA 3CR0A 3FZ1A 4EK6A 4C3PA 4A4LA 1KOAA 4X2JA 1DAWA 2ONLA 3HMNA 5HHWA 4UYNA 1RW8A 4HNIA 2QR8A 3BQCA 3KMWA 4R6VA 3VUGA 4BWXA 1GZNA 3KXHA 2X6DA 4MNEA 3I6WA 4X21A 1O6KA 2ZDTA 3COHA 3DAEA 3EQIA 3VF9A 4F0IA 4PL4A 3G6HA 3MJ1A 3RWQA 1Y6BA 2WMXA 1JKKA 4FKTA 2BHHA 3FXWA 3ZM4A 3ZUVA 2PL0A 4AG8A 2VNYA 3TKHA 5I0BA 3PZEA 4XG8A 2OW3A 4O0YA 1GZKA 3UE4A 2PE2A 3LJ2A 4BCNA 4PUZA 2VO0A 4E5WA 3R7EA 3H30A 1X8BA 5H9BA 3WOWA 4AF3A 4ANMA 4EJNA 4MD9E 1ZOGA 3ALNA 4C4FA 3SVVA 1XHAA 5IMEA 3EB0A 1OPKA 1MQBA 3CQEA 3Q9ZA 1YDSE 4YJUA 4JG7A 4WSYA 2YCFA 4CYIA 2UZLA 4JRNA 4O0WA 4JL9A 3TXOA 3NDMA 3DTCA 3TZ9A 3GC7A 4U79A 3Q9YA 5CNNA 2ITXA 2XEYA 3KXZA 4AX8A 5CZHA 2PE0A 3FQEA 5C01A 5AAEA 2QHNA 3R04A 2F9GA 3MSSA 2QOKA 3C0IA 4FTQA 3Q3BA 4MEDA 4ONAA 2IW6A 4ENXA 3UMXA 4CFNA 4MYGA 4YJVA 4FSYA 4OTQA 3C4WA 5CALA 2ITUA 3S95A 4KBKA 3GFEA 2RFEA 3O50A 4UYAA 4ZIMA 2LGCA 4EH5A 1ZARA 1ZLTA 4BZOA 1OVEA 5D12A 3QRKA 5D9HA 3RAIA 3EQRA 2UVYA 2ZV9A 4EYJA 4LYNA 4UXQA 4HGTA 4IXPA 3POZA 5EYCA 1OIUA 4D58A 3PRIA 3UNZA 1PXPA 3DNDA 4W4WA 1Q4LA 1U5RA 2OO8X 1DM2A 3BLHA 1M2RA 3VRYA 4G6LA 3AC5A 4X2GA 1Y6AA 3FMKA 4XBUA 3V8SA 5L2IA 2WMSA 4IDVA 4BBMA 4BCFA 4M84A 5AMNA 3ET7A 3VULA 2X8DA 2ERZE 2X0OA 4HW7A 4QYEA 4DGLC 5BQ0A 3QD0A 3M1SA 3F5XA 2BPMA 2EUFB 5FP5A 3DXNA 4K0YA 3VS4A 3PTGA 4XOZA 4F09A 2YM5A 4ALUA 4QPAA 5LMAA 5LVOA 3IGGA 4BVUA 5CF8A 1H1SA 4M97A 2YDJA 5KMKA 2WXVA 2IZRA 3QHRA 3PSCA 1UNGA 4YO6A 2PVMA 4GVAA 3P86A 3MIYA 2OBJA 4IQ6A 2PVNA 3JXWA 3NYNA 4XV9A 3WZUA 4K11A 2VTTA 5HESA 3I7BA 2V7AA 2XKFA 5IZFA 3EQBA 2UZNA 4FKRA 4C4IA 3GP0A 3OXTA 2JDSA 3DBQA 1WVXA 2GU8A 1RJBA 4ZJIA 2X7FA 5B2LA 2JEDA 3AOXA 2IN6A 4UZDA 1CKIA 4ASEA 1RQQA 3O17A 4IM2A 3QZIA 3AC8A 2O3PA 3BE9A 3BU5A 4LM5A 4UALA 1AD5A 2X4FA 3IDBA 4JS8A 4JDHA 4WRSA 3A7JA 3DQXA 3FMDA 3KXXA 1KE5A 2GHLA 1OL1A 4OLIA 2YCQA 3ZZEA 3FE3A 3LVPA 1U54B 3NYVA 4ZP5A 5AV0A 3I7CA 4JQ8A 5GHVA 2ITQA 5HNGA 2B4SB 2V62A 2VTPA 2GNGA 3QXOA 4F1OA 1Q97A 3EWHA 2PHKA 5JFWA 4TKSA 3G33A 5DRDA 2WMWA 4YHJA 5F9EA 3S2PA 4CQGA 4OBQA 3G51A 3OFMA 4JIKA 5HVYA 4CYJA 3VBTA 3AT3A 4RFZA 2YISA 3VAPA 1UNHA 3MPAA 3W2RA 5CAVA 5L2TA 5LXMA 4GH2A 1B39A 3BIZA 1UNLA 1Q8ZA 4XRJA 3RK9A 2R3GA 1Q61A 3I5NA 3DY7A 3OCSA 3QRUA 4O4EA 4WT6A 3U6HA 2UVXA 4FTMA 4YZMA 2OXYA 4RLKA 3DZOA 1OM1A 4M3QA 4C37A 4PMPA 4DEIA 4CZYB 4MBIA 4YTHA 4DGOA 5IUHA 2OJ9A 3FHIA 3NGAA 4QMSA 5HG8A 5E8ZA 3SXRA 3V04A 2WOTA 1YXVA 5E8TA 3BQRA 2X81A 3MVHA 3ENHA 3SV0A 4I4FA 4LOPA 2OJFE 2BROA 4YNOA 4NT4A 3ZXTA 3QF9A 1ZZLA 4KKHA 1BL7A 2J0JA 3HA8A 3CIKA 1YHWA 5HIDA 1M2PA 5T68A 5TR6A 3ZEWA 1MRUA 2OJGA 3WARA 5EW8A 4PMTA 4YHTA 5FXQA 3SOCA 3QUPA 5HBHA 2IO6A 4QMTA 4U7ZA 3CE3A 3Q32A 3U87A 1GZ8A 3BHYA 4PPAA 3AMBA 3DLSA 4JX3A 3WBLA 2HWPA 4BI1A 4ZTLA 3UYSA 3G90X 4O4BB 5JT2A 5D10A 3EJ1A 2C0IA 3MY5A 4P4CA 3DDQA 3BEAA 3IGOA 3QCQA 3THBA 3MH2A 2VD5A 1Q62A 3ZTXA 4MK0A 3RPRA 4RQKA 3MV5A 1NXKA 2RFNA 4M67A 3QKLA 2HZ4A 1DS5A 3ZUUA 4G3FA 3E7VA 2BRBA 3HV5A 4E6AA 4JAIA 1H27A 4AWIA 3DNEA 1JLUE 1GIHA 2C6OA 2C5NA 5M51A 1E9HA 3BYVA 4HOKA 4MBJA 3VUKA 2OKRA 3CGOA 3NYOA 2JFMA 5LVPA 5CNOA 2UW5A 4DEHA 4EQCA 3DKFA 3EZVA 4YZBA 1T46A 4MNEB 4DG0E 3QKMA 4DEDA 4HYSA 3TKUA 4R5SA 2HZIA 2YACA 3KB7A 2F2UA 4MXZA 4YPDA 4FKOA 4CMTA 3D15A 2C47A 4GIHA 2C6EA 2VWUA 4NIFB 3RBWA 3GGFA 4U42A 3FBVA 3UGCA 3ZDIA 3MY0A 2R3MA 4GU6A 4NTTA 4HCUA 1NVRA 2W1IA 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 2AQX A;  1W2D A;  4O4E A;  2A98 A;  2IF8 A;  4O4B B;  1W2F A;  1TZD A;  1W2C A;  4O4C A;  2IEW A;  4FRF A;  4O4D A;  4O4F A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3F6X A;  2PMI A;  4WG3 A;  1JWH A;  5K4J A;  2BZI B;  5L6P A;  1JQH A;  2CJM A;  3AD5 A;  4RX7 A;  2XIR A;  4DH8 A;  5M53 A;  2O0U A;  4A9U A;  2G2I A;  3VID A;  5EFQ A;  3PE1 A;  3R1S A;  4BWP A;  2XNM A;  2BDW A;  3CQW A;  2A4L A;  3ITZ A;  3SW4 A;  3W8Q A;  5LWN A;  4D2R A;  4FV2 A;  2PY3 A;  5IH4 A;  2QLQ A;  3CBL A;  3LPB A;  5JZJ A;  5G6V A;  2XNG A;  2R3O A;  2ZVA A;  3PPZ A;  4RIX B;  4ZZO A;  3ZXZ A;  3VUI A;  1ZYC A;  2ZM1 A;  5AV1 A;  3I5Z A;  5AV2 A;  4RX5 A;  3Q4Z A;  3ERK A;  4Y8D A;  3CY2 A;  3ZSI A;  3C4X A;  4Z7H A;  5C1Q B;  5AUW A;  2IVT A;  3NAX A;  4EH6 A;  1H25 A;  3RKB A;  1WBV A;  3O8P A;  4KBC A;  2X6E A;  2XUU A;  2YAA A;  5H2U A;  3M42 A;  3MFS A;  5BVN A;  1OIT A;  3IOP A;  3BU3 A;  4DEG A;  5A6N A;  2FVD A;  3P08 A;  4Z9L A;  5J95 A;  4BKZ A;  1KSW A;  3QYZ A;  2C5O A;  1PMU A;  1PYE A;  2I40 A;  3QQF A;  4PNK A;  3SLS A;  3CC6 A;  3C13 A;  2VX3 A;  5KZ0 A;  4FTJ A;  2CGU A;  3IDP A;  3RM7 A;  4I6B A;  1WVY A;  4DEE A;  4QMY A;  3HMI A;  1YQJ A;  4G2F A;  2V5Q A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
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#similar chains, but unknotted
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