1TZDA

Crystal structure of the catalytic core of inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
256
structure length
243
Chain Sequence
GLILKRSSEPEHYCMVRLMADVLRGCVPAFHGVVLQLQDLLDGFDGPCVLDCKMGVRTYLEEELTKARERPKLRKDMYKKMLAVDPEAPTEEEHAPRYMQWREGISSSTTLGFRIEGIKKADGSCSTDFKTTRSREQVTRVFEEFMQGDAEVLKRYLNRLQQIRDTLEISDFFRRHEVIGSSLLFVHDHCHRAGVWLIDFGKTTPLPNGQILDHRRPWEEGNREDGYLLGLDNLIGILANLAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the catalytic core of inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Inositol-trisphosphate 3-kinase A
total genus 60
structure length 243
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.127: Inositol-trisphosphate 3-kinase.
pdb deposition date 2004-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03770 IPK Inositol polyphosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase); domain 1 1tzdA00
4FRFA 1W2DA 1TZDA 4O4CA 2A98A 4O4DA 4O4BB 4O4FA 2IEWA 2AQXA 1W2FA 2IF8A 4O4EA 1W2CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZY6A 2DS1A 3PY3A 1XH8A 3AT2A 3OEFX 2FUMA 5IG1A 3LCOA 3OD6X 3QQJA 4YHTA 5CEKA 2HENA 4K1BA 5AUWA 2XK3A 5E8WA 3DJ5A 5EG3A 3NUUA 4ZXTA 1WBOA 4A9UA 3PXZA 3QTUA 4O4FA 3TJCA 3GU7A 5DOSA 4K0YA 2CGUA 1NY3A 2WELA 3MH1A 2C6LA 5KZ0A 3FJQE 2ITZA 3MH2A 4XS2A 3ERKA 3QRTA 2R9SA 5E8ZA 2CN5A 4DG3E 4LOPA 3V51A 2QONA 4B9DA 2OJ9A 3KCFA 3HGKA 4UYAA 4EKKA 4FKIA 4L7FA 4MD7E 3IOKA 3RK7A 4WNKA 1A9UA 1WZYA 5TE0A 3R02A 3ITZA 2B4SB 3A7FA 3PJCA 4FT3A 4ASDA 3Q32A 3UMXA 4J52A 3SRVA 3C0HA 3FI3A 3H0ZA 5LQFA 4DH3A 2OJGA 3C4XA 4J99A 3QL8A 1VYWA 4U3ZA 3GOPA 5AP7A 3QTWA 5CVFA 4EZ7A 4O0YA 5EKNA 2PMNX 3A7IA 4RWIA 5LWMA 3O23A 3W16A 4BB4A 5AADA 3I6UA 3R1SA 2X6EA 2YDKA 3BE9A 3CLYA 2AUHA 4IB3A 5DEWA 5I9UA 3EMGA 4E26A 4O27B 4YC3A 5LARA 3G51A 2QKRA 1K3AA 5JQ5A 3G6GA 4L45A 5BVNA 5LMKC 3Q52A 1H26A 4A7CA 4EKLA 3TTIA 5HG5A 3WF7A 3B8RA 4OTHA 3DKOA 3ZEWA 3AXWA 2VX3A 2HW6A 4BDEA 4YSMA 1NVRA 1OIUA 5F94A 3UODA 2XCHA 4IADA 4RBLA 4Y46A 1UV5A 3EKKA 2YM3A 3T3UA 3JXWA 3SHEA 1B38A 3BX5A 1XBBA 2BHHA 2R5TA 2YCQA 1ZMWA 3C4ZA 2V62A 4DC2A 4RC3A 3DXNA 5CSVA 3VUHA 2XUUA 3DBCA 5HO8A 5KHWA 4M67A 5LJJA 1G3NA 1QPDA 4BVUA 2KTYA 3L9PA 1MRVA 3MH0A 1PMUA 4IJ9A 5L6WL 3S1HA 3PWYA 4B4LA 1XKKA 4TWPA 3CR0A 4XV3A 3EFKA 4X3FA 2A0CX 1PW2A 4M68A 3LCSA 4HVHA 3DK3A 2C5YA 4BRXA 2XVDA 5BUEA 4FK6A 4P5QA 2WB8A 3F88A 4L8MA 4CMTA 1BI7A 3RWQA 3KULB 4H1JA 4M3QA 3FMDA 4CZUA 3CKXA 3RINA 5HVYA 2A27A 1PXNA 2Q0BA 3P7BA 4FMQA 4X2FA 4BBEA 4RA5A 1P14A 2HYYA 3RZFA 5IA2A 4PX6A 5B0XA 4EOJA 4XG8A 4K6ZA 1W83A 3NR9A 3QQUA 4IIRA 3FMMA 2PVLA 1XWSA 4G3GA 3DLSA 1WBVA 4I92A 4II5A 2XEYA 3ZSIA 5I9VA 3R63A 2BIKB 3C0GA 4UBAA 2IVSA 4EWQA 1ZMUA 4U9AA 2VO3A 5B2MA 5EW9A 2PZ5A 5I0BA 2WKMA 3ZU7A 5IU2A 1MQBA 3QRKA 3S4QA 3O2MA 4UWBA 4WRGA 2X2MA 3I81A 2OWBA 3V8SA 3R8ZA 4BTKA 5AR7A 4NIFA 1ERKA 2P2IA 3PA4A 5FM2A 3PIZA 4Y72A 5LMAA 3I60A 4TYJA 4F6UA 2F7ZE 4MWIA 2GS2A 3QXOA 4MBJA 4OTRA 3SKCA 4EOMA 2BZKB 3C13A 4AUAA 5HU3A 4ZTQA 3NCGA 4YTHA 1PXIA 3R1QA 4CT2A 1KWPA 3KMUA 4CQGA 2YCFA 2PE0A 4MXXA 2R3OA 3LJ1A 2CGXA 4HCVA 2GMXA 3D5WA 2BHEA 4PMTA 3MA6A 3FI4A 4NTSA 3K5VA 4AW2A 2F2UA 3KKVA 4J95A 4LUDA 4DFLA 2VTHA 4N6ZA 4IZ5A 2ZV7A 4L7SA 4M66A 2YAKA 3E5AA 3QCYA 4AOIA 3BGZA 4FTMA 5DI1A 1QCFA 3FZPA 3KN5A 4F99A 4IB5A 2PVRA 5L6OA 3OXZA 3NW5A 3A99A 5HBHA 2BRNA 3TT0A 5FG8A 5CZHA 3Q9YA 2Y4PA 3DLZA 3QTZA 4O4EA 3DB6A 4PPBA 4BIBA 3MJ2A 3O17A 5J87A 4ZY4A 2JDRA 3VS1A 2VZ6A 3VWAA 1H01A 3QHRA 4FZAB 3Q5ZA 4BTJA 1VZOA 3OMVA 2F49A 2JDVA 3PIYA 4FTKA 4H1MA 4MAOA 3TIYA 3UC3A 5KX8A 2IEWA 4BZOA 3BQRA 2XRWA 3JVSA 4IFGA 3VAPA 2WGJA 2IN6A 3LCTA 3E92A 2WTKC 3GENA 3QQFA 4FV4A 3HA8A 2XS0A 3KC3A 4EHVA 4GYIA 2JLDA 3Q53A 5J79A 4O0XA 4DLIA 4KABA 5EKOA 5FEEA 2WEIA 1K2PA 3NIEA 4EC9A 3DBQA 2IWIA 4GUEA 3PPJA 2OJJA 4WNPA 5BVWA 3C4EA 3U9NA 3V5LA 3IS5A 5HLNA 4RSSA 2WMSA 3VS3A 1Q24A 1YXXA 5AP5A 2CMWA 3U51A 4EH2A 4V0GA 3W2SA 5IH4A 1M14A 2J0LA 2OSCA 3C0IA 1UWHA 4NM5A 4QQJA 1GNGA 4ITJA 3M1SA 1ZOEA 4IX5A 4PQNA 3PVWA 1ZYLA 3Q96A 3TI1A 3G5DA 4PRJA 4IEBA 3COHA 1LEZA 1H27A 4X2NA 3EL7A 3ANRA 2AC5A 3MB7A 3QGWA 4G3EA 4C02A 4L6QA 3D5XA 5CEPA 4USFA 4BZDA 4QP4A 5KZIA 4W9WA 4L00A 5DN3A 4MF0A 4QMYA 2QOHA 3MIYA 1YRPA 3TWJA 3EN4A 2WQNA 3CPBA 3GC8A 4JLCA 5LMKA 3MIAA 4ENYA 5LVLA 4L9IA 1BUHA 3OWPA 2J90A 4FV8A 1OPLA 2R7BA 2W1DA 3KVWA 3QQKA 3PP0A 4G9CA 2OFUA 2W05A 4JIKA 5JMSA 3P5KA 4PF4A 5DEYA 5DVRA 1GZ8A 4XP2A 4HGTA 2IZSA 3SC1A 1OKZA 3QCSA 2ZB1A 2XRUA 1VR2A 3VUMA 2I1MA 5J95A 1M7NA 3HL7A 5JFSA 4QT1A 3AGLA 3D7TA 3QX4A 3D2KA 2XK6A 4A4LA 4PDSA 3ODYX 3HRBA 5KBQA 2BMCA 5E7RA 2CCIA 2OKRA 2B9FA 2WMBA 4CFWA 4NWMA 3REPA 5KMKA 4FNWA 2VWYA 3Q5IA 2UVYA 4M0YA 4QTAA 4PL3A 4EOLA 2O5KA 3P79A 1IASA 3CQEA 3VS0A 1U5RA 3CTHA 3E8EA 3IDPA 5HICA 4NFMA 4UMUA 1FPUA 5A54A 4CQEA 4JG8A 4XBUA 4PNKA 3ZOSA 4YPDA 4FZ7A 5HIBA 2Y0AA 5AP3A 4BI0A 3S3IA 5GJDA 3BHHA 3HP5A 4FSTA 3S00A 3MY1A 3UO6A 2JAVA 1MRYA 2P3GX 3C51A 5CYIA 4D4VA 1GZKA 3QTQA 5CSXA 3KRLA 5FD2A 1UNGA 3FI2A 4CXAA 2XH5A 5TOZA 4RLKA 4W4XA 4FV1A 4MBIA 1XH6A 4EUUA 4V04A 4WG4A 5H9BA 2X1NA 5IISA 4QTDA 3UQFA 4O4DA 3NSZA 3A7GA 5KE0A 5I4NA 1UU8A 3D7ZA 4XP0A 3WYYA 4L42A 2VWWA 2R3KA 4NCTA 4EOIA 4S31A 3NNUA 4G6OA 3I5ZA 5E1SA 4XOYA 1FQ1B 4FGBA 5GNKA 1Z5MA 2R3FA 4IHPA 3NYNA 5C1QB 2Z60A 1XHAA 3MFUA 5FBNC 2W9ZB 4CTBA 4EJNA 4BICA 4C33A 5HEZA 3EKNA 1JOWB 3KXNA 3AC5A 1FMKA 3MFRA 4RVKA 4C4IA 4I1ZA 3THBA 1YHWA 1UWJA 4C3RA 2EB2A 3F3WA 2BALA 4GW8A 5EYDA 3OP5A 4L3LA 4F9YA 5HTBA 2HCKA 4XLVA 4QPAA 4MTAA 3I0OA 3BGPA 4RFYA 4GSBA 4FOBA 5LCKA 4E4XA 4EZ5A 5IH6A 3R21A 2QO7A 3R71A 4OTGA 2WTDA 4ZLZA 1LEWA 4L44A 4MH7A 1M2QA 3EYHA 4FSNA 3KXZA 4O6LA 5TR6A 2JFLA 3IG7A 2BFYA 2XNGA 3TTJA 5EYKA 4TNDA 4F64A 4XCUA 3AMYA 1ZMVA 4AZSA 4GFOA 2C3JA 3SXFA 2CN8A 2ITPA 4I23A 5K4IA 2UZLA 4FIGA 4G31A 4I5MA 1I09A 3KL8A 4R3RA 3V3VA 4L46A 2J0KA 1G5SA 1XH7A 1PMEA 3FAAA 4RIXB 2ETKA 2YM8A 1ZYCA 3EZRA 3CTJA 2C6OA 4ZOGA 4HVIA 1WVYA 5CF6A 2X9EA 4OBPA 4MD8E 4X6RA 4FKUA 3R8LA 5JRSA 4LGDA 2J4ZA 5AUUA 1KOAA 4ALVA 5H8BA 1TQIA 1YHSA 5BYYA 3FDNA 4P4CA 3VW6A 4BDAA 4E1ZA 4FYNA 4JDHA 4TW9A 3LJ2A 5BVEA 5A4LA 4BGQA 2WHBA 3WF8A 1PJKA 4WUAA 2WU7A 4OBOA 3SQQA 2YABA 4LV8A 3GGFA 2YIWA 3IW5A 1O9UA 1TQPA 3KRXA 3R9HA 3QRJA 3D0EA 3UO4A 5DT3A 3POZA 4MQ2A 2OZAB 3LIJA 5FRIA 3E8NA 4H3QA 4B8MA 2W4JA 3HKOA 1YW2A 1IA8A 2I6LA 3HV5A 5CNNA 4C36A 4O2PA 4FSUA 4FZFB 5BX0A 3KF7A 2V22A 1YWRA 4AAAA 3IW4A 1PKDA 3E7VA 2WU6A 3H0YA 3HA6A 4LRKA 5HTIA 2OIQA 3F5UA 3OXIA 4FTRA 1ZRZA 4YJRA 4X6QC 2WMXA 1BLXA 2VO0A 2J9MA 1BX6A 3WE8A 3R6XA 5BVDA 2JBPA 4JJRA 3O96A 4EK4A 2XJ0A 3O7LB 4HCUA 3U6HA 3LW0A 3DAJA 3D9VA 3W2RA 3WZUA 4FKWA 2ITVA 3UP7A 5EM5A 5L4QA 2UVXA 2X2LA 4ZTRA 2HWOA 5F95A 5EHOA 5IKWA 4RJ6A 4WNOA 5CEIA 1R1WA 1BI8A 4D9TA 4YR8A 4JVGA 2DYLA 3R1NA 4YJSA 4N70A 3FZSA 2WEVA 4U80A 2JAMA 3DU8A 4YNEA 3U8WA 1MP8A 4FL3A 4CZTA 3Q9WA 4UN0C 5DH3A 1Y8YA 4KRDA 3MTFA 3ZRKA 3RZBA 1V1KA 3A8WA 3RKBA 4YZ9A 3IDCA 4L52A 4Y83A 4G34A 4YJNA 2XNMA 4ENXA 4XG2A 3U4UA 2YLEA 4BWKA 3UQGA 3MTLA 2YIXA 3G2FA 3OT3A 4W9XA 5C03A 1YWNA 4AT4A 2WO6A 3PVBA 3O8TA 5KMOA 2QR8A 5K5XA 2GNIA 4ITIA 2QOQA 5EM6A 2PUUA 3ROCA 2XBJA 1PXLA 3HUCA 4KIOA 4CCUA 5IEVA 3RK5A 2G01A 2R3QA 2UZTA 3P1AA 4IDVA 3PVGA 2XIZA 1YOLA 5CXZA 3WZJA 3TZ9A 4HYIA 3EL8A 2LGCA 3R2YA 3NUNA 3FV8A 2GNLA 2H96A 3HVCA 3MPTA 4OW8A 4QMMA 3LFEA 4QP6A 4ZJVA 4FTUA 5JH6A 3A4OX 1P2AA 3QZGA 2FYSA 5IMEA 1OECA 4D4SA 1H0WA 5HU9A 5HG7A 3VS6A 4Y73A 3H30A 3QQLA 4EK3A 4YLLA 3L8SA 3R01A 3Q2MA 3ELJA 1YKRA 4FKOA 5AV3A 4YBJA 3SV0A 5J5SA 1IR3A 3V8WA 2FSTX 3F66A 4UMPA 3W8LA 4D4RA 2XKEA 1R0PA 3SD0A 1J91A 4O0RA 3GCQA 5CU3A 4JDIA 2W1FA 3SXSA 3AD5A 3E3PA 2C0TA 2YITA 5CLPA 4A07A 2JDTA 3NS9A 4IC8A 3VBQA 2R64A 4CMOA 2UZWE 3LM0A 3I79A 1CSNA 4XUFA 3GEQA 5KMNA 3QAME 4LG4A 5TKDA 4NM7A 3NRMA 1JPAA 4RJ7A 4RJ3A 5H8GA 5JKGA 2JKKA 2Y4IB 3D5UA 4EH8A 3FBVA 1GIHA 4RWKA 4RX9A 3AT3A 3NIZA 4USDA 1JKTA 2ITYA 2UW4A 4RWLA 4HPUE 4FSQA 3PWDA 4GYGA 3MV5A 1GZNA 3ZM4A 2XIYA 3GUBA 2HY0A 4FR4A 1YDSE 2ESMA 2VWIA 5M55A 4BC6A 2QO2A 3E63A 4I21A 2H34A 3ULIA 1UNLA 2X0OA 4N4SA 4FTIA 3VW8A 4ZSEA 4Z16A 3JY9A 3WARA 1J1BA 3NW6A 3QZFA 4XRLA 3T8OA 3C4FA 4KB8A 5EFQA 1WAKA 4BGHA 3QA0A 1Q8UA 2ITTA 4ONAA 4ZEGA 5EHYA 3QGYA 4YPSA 5FDXA 1CTPE 3EJ1A 5M4IA 2JGZA 2Y9QA 3BV2A 2W1IA 5EW8A 2YACA 5E8VA 3ENMA 2F7XE 4PY1A 4IH8A 4TWCA 4EH9A 1O6LA 3QQGA 4QP8A 3FLWA 4R1YA 3IDBA 4HYSA 5FLFA 2W7XA 1Y8GA 4AS0A 5JFWA 4QD6A 2PVYA 2RFEA 4DHFA 4E6QA 4JBVA 3QRUA 4A4XA 3RHKA 3DAKA 1UKIA 3QTIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4ZY6 A;  2DS1 A;  3PY3 A;  1XH8 A;  3AT2 A;  3OEF X;  2FUM A;  5IG1 A;  3LCO A;  3OD6 X;  3QQJ A;  4YHT A;  5CEK A;  2HEN A;  4K1B A;  5AUW A;  2XK3 A;  5E8W A;  3DJ5 A;  5EG3 A;  3NUU A;  4ZXT A;  1WBO A;  4A9U A;  3PXZ A;  3QTU A;  4O4F A;  3TJC A;  3GU7 A;  5DOS A;  4K0Y A;  2CGU A;  1NY3 A;  2WEL A;  3MH1 A;  2C6L A;  5KZ0 A;  3FJQ E;  2ITZ A;  3MH2 A;  4XS2 A;  3ERK A;  3QRT A;  2R9S A;  5E8Z A;  2CN5 A;  4DG3 E;  4LOP A;  3V51 A;  2QON A;  4B9D A;  2OJ9 A;  3KCF A;  3HGK A;  4UYA A;  4EKK A;  4FKI A;  4L7F A;  4MD7 E;  3IOK A;  3RK7 A;  4WNK A;  1A9U A;  1WZY A;  5TE0 A;  3R02 A;  3ITZ A;  2B4S B;  3A7F A;  3PJC A;  4FT3 A;  4ASD A;  3Q32 A;  3UMX A;  4J52 A;  3SRV A;  3C0H A;  3FI3 A;  3H0Z A;  5LQF A;  4DH3 A;  2OJG A;  3C4X A;  4J99 A;  3QL8 A;  1VYW A;  4U3Z A;  3GOP A;  5AP7 A;  3QTW A;  5CVF A;  4EZ7 A;  4O0Y A;  5EKN A;  2PMN X;  3A7I A;  4RWI A;  5LWM A;  3O23 A;  3W16 A;  4BB4 A;  5AAD A;  3I6U A;  3R1S A;  2X6E A;  2YDK A;  3BE9 A;  3CLY A;  2AUH A;  4IB3 A;  5DEW A;  5I9U A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4FRF A;  1W2D A;  1TZD A;  4O4C A;  2X0Q A;  2A98 A;  2X0O A;  4O4D A;  4O4B B;  4O4F A;  2IEW A;  2X0P A;  2AQX A;  1W2F A;  2IF8 A;  4O4E A;  1W2C A;
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similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)

  
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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