4DFYA

Crystal structure of r194a mutant of camp-dependent protein kinase with unphosphorylated activation loop
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
337
structure length
310
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFATPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
publication title Structural basis for the regulation of protein kinase a by activation loop phosphorylation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
total genus 94
structure length 310
sequence length 337
chains with identical sequence E
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dfyA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dfyA02
5ACBC 3GOKA 4YBKA 2JIVA 4JAJA 5CNNA 3BZ3A 2UV2A 4PMMA 4I1ZA 4IVCA 3WF7A 4BY9E 3NAYA 3QTQA 3NYXA 2FH9A 4U3ZA 5CI7A 3P08A 5TT7A 4BCGA 3HRBA 3OWPA 4GL9A 4U45A 2JDSA 5DHJA 5C01A 1SZMA 2VRXA 1S9JA 4MXZA 2UW7A 2V62A 4XP0A 3CPCA 3Q4TA 4FNZA 5LMKC 2WMUA 5LVPA 4EC9A 3RM6A 1GIJA 1IAJA 5E8YA 5E8ZA 1Q8YA 4D2VA 3PSDA 5EKNA 2X81A 3F7WA 4QTAA 3PIYA 3EYHA 3R2BA 4B6LA 4MBIA 3DBQA 2WIHA 5CEMA 4O7NA 4FYNA 3HGKA 4DCAA 2XNGA 2V22A 5FLFA 4QTEA 4I6FA 4IAAA 5C27A 3PSCA 2BZIB 1EH4A 4QP7A 2QOHA 2W96B 4KD1A 2NRYA 5CT7A 4XG6A 1YW2A 3KRXA 4J8MA 4R1VA 1PW2A 5EQEA 4EBWA 2FA2A 4C34A 4MTAA 4ZY4A 4BDGA 3LCSA 4BDCA 3MVJA 2Y6MA 3U6IA 2VTMA 3QCQA 3DU8A 2GDOA 2RIOA 4U81A 4BCKA 1Q41A 4WNPA 4ZEGA 5E4HA 3ZDUA 1YOLA 1ZRZA 2HW6A 2R4BA 4O22A 5CVGA 3TUBA 1RJBA 2PVFA 3QTUA 2YACA 2QOBA 3ZM4A 3NNUA 3BE9A 4FGBA 5JQ5A 4FK6A 2AC3A 3KQ7A 4MNEB 5D11A 3FWQA 1E9HA 2QO9A 3BRBA 5K0KA 4A7CA 2YLEA 2OIDA 2HK5A 3OMVA 1JQHA 3ODYX 2CGUA 5A4EA 3RTPA 5BUIA 3IO7A 5IUIA 1H00A 4DT8A 3HV5A 2C0IA 3PXQA 2X39A 3KB7A 4WBOA 4O81A 4BKYA 1YXXA 2ZM1A 4ZJJA 3CP9A 4AU8A 5A6NA 5JQ8A 1OI9A 3COIA 4R3CA 3ZONA 1UNHA 1P14A 3C5UA 3Q6UA 4FSNA 3COKA 5L8JA 4BCNA 5EM5A 3A7IA 3WF9A 4QMOA 4O82A 3ORXA 4X7QA 4BGQA 5AIKA 4BIDA 3VS5A 4EH5A 3OW4A 5FDPA 4X3FB 4TRLA 3RKBA 1BMKA 3I6WA 4PQNA 2XRUA 4AS0A 5CF6A 2ITNA 4A9UA 2QOIA 1PYXA 3O71A 4JBQA 5CVHA 3ZFMA 5LJJA 5CALA 3HKOA 1XO2B 3UIUA 1TKIA 3LXNA 5CSHA 3D4QA 4U40A 2BTRA 1HOWA 1ZYDA 4FBXA 4GK4A 3VF9A 1J91A 4BC6A 3KF7A 4FV8A 4ZJIA 4BBEA 1LR4A 2UZUE 3KXXA 2YFXA 3E3BX 4J96A 3L8PA 1PXMA 3NEWA 3B2TA 3DPKA 1H01A 4ID7A 5AV4A 1UU9A 3C4ZA 2PZPA 3Q6WA 5LMAA 4G1WA 5IA5A 3R9DA 2VTOA 1K2PA 5HO8A 5KNJA 1L3RE 1GJOA 2XCHA 3Q96A 4GK2A 4RPVA 3Q5IA 3E92A 3EL8A 4GV1A 4NM7A 4CYIA 2XBJA 3R7YA 4RVLA 1V0BA 3MV5A 2O5KA 4YHTA 5IQAA 4QMUA 3CCNA 4YNEA 4EK5A 5FEQA 4QPMA 1U4DA 4A07A 4O0XA 3SDJA 4KB8A 4F0IA 4IM3A 4O0UA 2YM5A 4I6HA 4OTFA 3RAIA 3SC1A 5AJQA 1IAHA 3FMNA 1ZZLA 2G2IA 3KXGA 3RPRA 5JZNA 3RHKA 4HZRA 5HG9A 3SRVB 3B8QA 4G17A 4A06A 1M17A 3IGOA 4QMXA 2HZIA 4AUAA 2VTHA 3OD6X 2P33A 4HCVA 5CEOA 2QOLA 2VO7A 4IIRA 3DKCA 4IH8A 4YHFA 5TKDA 4EOKA 2BIYA 2ZDTA 3A4PA 4RBLA 3GU4A 3H9OA 5AX9A 3ZO4A 2F7EE 3OXTA 4RVMA 3ACKA 3PJ8A 4F7NA 1SVEA 4NEUA 5DIAA 3PLAE 4FKUA 5I9XA 2OK1A 4AA0A 4WG4A 2BKKA 5HTIA 4I23A 3AMYA 4FV4A 4APPA 3DCVA 5KZIA 4YTHA 2XMYA 3QAME 3BI6A 3P7CA 2IO6A 1NA7A 2UW5A 4O7YA 3RZFA 4ANOA 5HE3A 3VW8A 2W06A 2J50A 3ENMA 4PV0A 2JKKA 4TWOA 5L8LA 4PPCA 4BDAA 2ITTA 1ERKA 5IQGA 4FTQA 3TWJA 3KF4A 3DB6A 4BGHA 3BU3A 5AFVA 1MRVA 4BI2A 3UNZA 5KBRA 1SVHA 2OH4A 3LFSA 3FEGA 3OEFX 2BFXA 2I1MA 3KVXA 3QWKA 4FKLA 2JKOA 4RX7A 4X3JA 3SVVA 4FT3A 4DGNA 2WGJA 4PNKA 4BTKA 4JT3A 4Y8DA 5E8SA 5J5SA 4RJ4A 2BHEA 3EN6A 3PA5A 4FZ6A 3F6XA 3M42A 4ZSEA 3V5PA 1O6YA 4RFMA 1U46A 5EG3A 3ZHPC 4LRMA 3OW3A 4OTDA 4RWLA 5AP6A 4RIOA 5FM3A 3E7VA 1IG1A 5FBNC 2ETMA 4GH2A 2B0QA 2XK4A 4PL5A 3FV8A 3A7JA 4F64A 3HX4A 3UG1A 1FGKA 4O83A 3HECA 3CKWA 4ZSLA 2O8YA 4YC3A 3EN7A 5GNKA 4ALVA 3O2MA 5FQDC 2BFYA 4ALWA 1QPJA 2QOFA 3R7GA 5CASA 5M4IA 2J2IB 3VAPA 2YZLA 3E3PA 4JJRA 3E5AA 1FPUA 3UZPA 3FDNA 4RZVA 3FI4A 3POZA 4BBFA 4M14A 3NYOA 3IW5A 5DNRA 1SVGA 2BRGA 2WOTA 2YCSA 5AA8A 4CMOA 3IOKA 2EWAA 3QTIA 2GNIA 4WUNA 3Q60A 2GS7A 2VTPA 1BLXA 3NUUA 4M67A 2F49A 4FTRA 4LOOA 2XK7A 1FVTA 3JXWA 5L4QA 2PZRA 4Q5HA 3FL5A 2XYNA 4AA5A 2ZB1A 2ZV8A 4JBPA 2XVDA 4B8LA 3MPMA 2HZNA 4Y83A 4EH6A 5DPVA 4NYEA 2ITVA 4BCOA 5HU3A 1LP4A 2JGZA 3KRRA 5AV0A 3ZSIA 1E1VA 2CNVA 3UTOA 5K0XA 4PDPA 4UX9A 3GC7A 3GU7A 4IWOA 3FE3A 3K3IA 3KU2A 3MTFA 5GINE 3UO6A 2HY0A 2WQNA 3ATSA 1T45A 2C1AA 2J0IA 2FSTX 3BYVA 4DA5A 3DXNA 5J95A 3L8VA 4BI1A 4GVAA 2O63A 3DZQA 1BKXA 4Z7HA 2BPMA 4AZVA 5BMSA 4YZCA 2C5YA 1XH5A 1OBDA 4BICA 3LQ5A 2W1CA 4F9BA 3UBDA 4EOSA 3FZRA 1K9AA 5E92A 1RW8A 3TZ9A 3GQLA 2OJJA 1FOTA 3L9MA 1PXIA 3HMIA 2Y9QA 4FKRA 1P4FA 4IVBA 5C8MA 2E9PA 3KL8A 3QRJA 4FUYA 4M3QA 2YWVA 1RDQE 4IM0A 4JIKA 4MXYA 3ROCA 4EH9A 1STCE 5DFPA 4ITIA 4D28A 2H96A 2XB7A 4FODA 4ACDA 4D1ZA 5FM2A 3A7FA 2WFYA 4CGAA 4XG8A 2XIYA 4TPTA 3BE2A 3SXSA 4M84A 5IQEA 5HBJA 3AC2A 3DKGA 4ZXTA 3D83A 4CKJA 3OWJA 3R1YA 5G6VA 2V7OA 3UYTA 5LMKA 2ITYA 2GS2A 5HNIX 4RWKA 4GFGA 5L2SA 4IWDA 1Q8WA 2ZM3A 4TKSA 2W7XA 2ZV9A 4FTIA 4NIFB 3RWPA 5CZHA 2WMWA 4EI4A 2R3LA 4LI5A 1LUFA 2ETKA 3R83A 4I3ZA 1DM2A 4FIGA 4HGEA 2A4LA 3WZEA 3QQHA 2R3NA 3ZO3A 4CRSA 4DEDA 3VUDA 4EUTA 3S0OA 4X2GA 4ITJA 4DINA 3CPBA 2CLXA 2HZ4A 4S34A 4QMVA 2QOCA 1PXOA 1WAKA 2IPXA 4F70A 4QMSA 4E5WA 4NU1A 4BN1A 4KSQA 4LYNA 4HVGA 5J1VA 3GBZA 4IXPA 3FMMA 2GS6A 3EQRA 3KULB 4ZLOA 3P0MA 3VRYA 3CY3A 3TJDA 3LFBA 4IZAA 3LQ3A 4AZWA 2FVDA 3LFDA 3NRMA 3PYYA 4QMZA 4FV5A 3FLSA 4FZDB 3O8PA 2OXXA 3ZCLA 5CXZA 2ZYBA 3QYWA 3HZTA 5ANOA 4CMUA 3WILA 3PY0A 5I9UA 3BBTB 4BCPA 3GT8A 3R01A 2IZRA 1WVXA 2XEZA 4OTPA 1PRYA 1NVRA 3F5XA 5CAVA 4TYHA 2HOGA 5HBEA 5AR8A 4O86A 3LCTA 2R9SA 4OBOA 4XMOA 5J87A 3UJGA 3QKLA 1M52A 4AT3A 5HCXA 5J1WA 4FL2A 2W9FB 3WIKA 4B4LA 4FVRA 3C0GA 3GCQA 5EI2A 4QTDA 1Y6AA 2F57A 4NTTA 3GCUA 4TYEA 1QPEA 2XF0A 3OXIA 4USEA 2XK8A 5KCVA 2BMCA 2XZSA 5DRDA 4DFNA 5IDPA 4IX5A 2GCDA 3G6GA 4GKIA 4H3QA 4XLIA 4E6DA 4ZJVA 3TNIA 3T8OA 5IQIA 1ZLTA 3A99A 3MDYA 5AUWA 5KZ0A 3H30A 4XYFA 5E1SA 2C3JA 3PUPA 3V5TA 4AGCA 2PVJA 4QMLA 1Z5MA 4RSSA 3NR9A 4C4GA 4C58A 2VWBA 4XJ0A 4MX9A 5KMKA 1XBCA 3NIEA 3KKVA 3LMHA 2HY81 5H8BA 3HDNA 3L1SA 3OBJA 1OB3A 4O7WA 4U8ZA 5AP3A 4W4VA 4DGOA 2ITQA 3Q2MA 1H0WA 3F5UA 3RAHA 4R7BA 3KFAA 4FUXA 3WZJA 2VGOA 1Y57A 2W1HA 2PHKA 4TYGA 4CTBA 1MRYA 2ITWA 3K5UA 4HGSA 2NO3A 4G6NA 4O0YA 4F6SA 2ITPA 2HXLA 2V0DA 1OL2A 4WO5A 2QONA 2XM9A 5CF4A 3EQHA 3VO3A 4Z16A 4FG8A 3C1XA 4ZY5A 4QP3A 3R6XA 2F2CB 3A2CA 4M69A 3JR1A 3ZDIA 5LXMA 4N4SA 2I0VA 3UIMA 2ZV7A 3FMHA 4GEOA 4TTHB 3BYSA 2ZMCA 4KIKA 1YXTA 2R0IA 4C4JA 4V04A 3NNXA 4Y5HA 3RK5A 4E7WA 4X6QC 3H10A 2P0CA 4I0TA 5BUEA 2UW6A 3IOPA 4FSRA 5K4JA 1IEPA 3ZFYA 2FB8A 4HGTA 4Z7GA 2VX1A 5J9LA 4K33A 1PMEA 2PK9A 4FV3A 1V0PA 3DTCA 4JDJA 3GGFA 4QYEA 4MNEA 2QO2A 2JAVA 3TACA 2OGVA 3ZSGA 5LVMA 2W9ZB 1XWSA 4J71A 4ZTQA 3ZUVA 1NW1A 4NH1A 1PHKA 4DTAA 5LWNA 3BKBA 4OT5A 4FC0A 2EVAA 1YHWA 3VUGA 4TYIA 4FA2A 3G0EA 1OL7A 2QODA 3FUPA 3QX2A 5EW3A 2B55A 4U7ZA 2H34A 2QI8A 3Q5ZA 2QG5A 4W8DA 4PUZA 4X2FA 5CYIA 3BV3A 5IA3A 3EQBA 3GCVA 4KABA 1Y6BA 2UZVA 3QA0A 2WQBA 3SG9A 3LIJA 4E6AA 5IMXA 5KUPA 3G5DA 2HCKA 4MK0A 5JH6A 4KKEA 3SA0A 3P86A 1QPCA 5IF1A 2B53A 4WG5A 1Q97A 5HCYA 4BCMA 1XHAA 4CCUA 4GFOA 2G2HA 4Q9SA 2VTLA 3SW4A 3L9LA 5AR2A 5J79A 4O91A 2FYSA 3EFKA 3WF5A 4YHJA 4YJPA 3IDPA 2XUUA 5AV1A 3DAJA 3LFEA 4FIJA 2J0LA 3HMOA 3QLGA 4QNYA 2BDJA 3U51A 3PPJA 4O38A 3ZLYA 4F9AA 2WMAA 3DT1A 5AX3A 3R21A 5BYLA 3QQLA 2YM8A 5AM7A 3FZPA 3I1AA 3D2IA 2YITA 3T9TA 4YLKA 1GZOA 4EYJA 3HRFA 3UPZA 3BPRA 4HYIA 3TG1A 3TUDA 2J51A 2JLDA 4O7RA 3LZBA 2ITXA 4BYJA 4QTBA 2W1ZA 3ODZX 3UC4A 1WFCA 2XJ2A 3R1SA 1YHVA 4I20A 5AP1A 5IZFA 4X2JA 2UZDA 4IAFA 1URCA 2OU7A 2OBJA 2QHNA 5CTPA 3JPVA 3GB2A 4E4LA 3PZEA 3LAUA 4F1MA 3CE3A 4NTSA 2VTRA 2NPQA 3ATTA 4DH3A 3UMWA 2R3FA 3RMFA 4P4CA 1Q99A 1OZ1A 3NLBA 4R77A 2XK9A 4AZTA 4FKPA 1XH9A 2UZEA 4Y72A 3NIZA 2QD9A 4DAWA 4GU6A 4I5MA 3SRVA 3NUAA 2DUVA 4C33A 2YHVA 3ZS5A 5GZ9A 5EQPA 3OVVA 1LEWA 2C1BA 4HYSA 3U8WA 5BX0A 2I40A 1QCFA 4JG6A 1YXSA 4PY1A 5HGIA 5GIPE 3DNDA 5CSXA 5DVRA 4U42A 4XOYA 1OIYA 2VTIA 3EOCA 4ZZOA 4ZY6A 4XP3A 2WD1A 2GNFA 4WG3A 3MB7A 2Z60A 4CFFA 3DKOA 4KAOA 5F20A 4BHZA 5IQBA 1KE5A 2QCSA 5EW8A 5HU9A 5AP5A 2IG7A 3LFFA 4AW0A 4EQMA 4BRXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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