3OTVA

Crystal structure of the intracellular domain of rv3910 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
VQLVPGARIANGRYRLLIFHGGVPPLQFWQALDTALDRQVALTFVDPQGVLPDDVLQETLSRTLRLSRIDKPGVARVLDVVHTRAGGLVVAEWIRGGSLQEVADTSPSPVGAIRAMQSLAAAADAAHRAGVALSIDHPSRVRVSIDGDVVLAYPATMPDANPQDDIRGIGASLYALLVNRWPLPEAGVRSGLAPAERDTAGQPIEPADIDRDIPFQISAVAARSVQGDGGIRSASTLLNLMQQATAVADRTEVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A phosphorylated pseudokinase complex controls cell wall synthesis in mycobacteria
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROBABLE CONSERVED TRANSMEMBRANE PROTEIN
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 70
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3otvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3otvA01
1ZMVA 3MFUA 4BZOA 5CF5A 3NYVA 1BUHA 3ORZA 3POZA 1PXOA 2XIZA 3ALOA 3Q6WA 4YHTA 4O0XA 2VX3A 3Q4UA 5HLWA 1DS5A 2XIXA 3S0OA 4TNBA 3RZFA 5FBOA 3G9LX 3GCQA 1PXMA 1CTPE 4I3ZA 1QPJA 2WQNA 3QFVA 5AAGA 1YI4A 4IAFA 3BRBA 2W17A 4M14A 4U0IA 2R4BA 2GFCA 1GZOA 3F69A 2QNJA 3BGZA 3N4TA 2HYYA 4ACDA 4O81A 1JBPE 2DS1A 3VRZA 3C4FA 4HZRA 1OIUA 2UW8A 5EYCA 3DLZA 3FV8A 2WMRA 4QTDA 4RA4A 4AXAA 1Q8TA 3LFAA 5EYKA 3UZPA 3I6WA 2YA9A 2BIKB 4K9YA 1GZ8A 4AZTA 4FUYA 4M67A 4NU1A 1WFCA 2XIKA 2OW3A 3DK6A 5L8LA 4ENXA 3TG1A 2BRMA 4K1BA 4XRJA 2WB8A 3AQVA 5L2TA 2X8DA 1YDRE 3AD4A 2QODA 3CCNA 3RM7A 2E9UA 4FA2A 3Q3BA 1JQHA 1NVRA 2BAQA 1U54B 3Q9WA 2XK9A 4FL1A 4JDHA 4FEQA 2ZV9A 3A4OX 3VHKA 4QP2A 4NYEA 1BKXA 4KIKA 4AE9A 3ZYAA 3ZC6A 4I5MA 3QRTA 3GC7A 5FTOA 3W2RA 5LMKC 2XEYA 3MH3A 4BL1A 2F57A 4AT4A 3EB0A 4S32A 3ET7A 4JIKA 3ZFMA 3WBLA 4L45A 5HU9A 4H3QA 3RPYA 3UNZA 2HY81 4RWJA 2IVSA 4FODA 3ZRLA 2RL5A 5HG8A 3UMXA 3KMMA 5AUXA 2OXXA 2PULA 2VWVA 4W4VA 4PDSA 3V8WA 3MVJA 5E8XA 3KXXA 4XNEA 5CI6A 3UQFA 3EQFA 4U81A 2C1BA 3LAUA 1Y91A 3I81A 5CF6A 4BWPA 4UMUA 4RVMA 1J91A 2Q0BA 1Y6AA 3UJGA 3CQWA 3ALNA 4ZK5A 3VS4A 1YI6A 3A2CA 3QZFA 3QYZA 5M08A 3D15A 3TKHA 5L6WL 2QOHA 4ERKA 4ZMEA 3D5UA 4QRCA 3NW5A 3R00A 3TNHA 4XV2A 5L3AA 4IX6A 2I1MA 2VO7A 4AT3A 3GCUA 4U45A 1JLUE 2R2PA 3P0MA 3UO4A 3AC2A 4BCHA 4L67A 5FDPA 3EKKA 2QKWB 1NVSA 5AAEA 4QO9A 5EKNA 4D2PA 4JNWA 1QPDA 4E5BA 4QNYA 3FKNA 4FSMA 4U97A 4RJ5A 3C4XA 4BY9E 5B2KA 3F2NA 4R7HA 3PIXA 2WTWA 1YWNA 4W4WA 4Z3VA 5LVOA 1OUYA 3TNIA 3IO7A 4R7BA 4RVKA 4WD5A 5E8SA 3COKA 3W33A 4J96A 4FZFB 5FDXA 5FRIA 4FI1A 5JT2A 3FXXA 2WNTA 1MQBA 1GZNA 5HCZA 1QPCA 4DGGA 3B2TA 1H27A 2PMIA 1M2RA 2OJIA 4O7NA 4FSTA 4FEVA 3EQBA 5M44A 4GK3A 5HIDA 2PVLA 3VHEA 4BYJA 4AOJA 4RFMA 1OKVA 4RPVA 3C51A 3V51A 5LMKA 3ORXA 4IAYA 1VJYA 4LOPA 3RWQA 2H8HA 4XYFA 5AP5A 3VBTA 4AF3A 4FVPA 4OTHA 4XP2A 5K3YA 3LXNA 2XS0A 4I6FA 3E64A 3QF9A 4JX7A 4TRLA 5C4KA 3BHVA 3TNWA 2WMAA 4YP8A 3JY9A 3R9HA 1H8FA 3VBXA 4QD6A 2X9EA 3KK9A 4OTPA 4BGGA 5HIBA 5LCJA 3RHXA 4WG3A 5CZIA 2Y8OA 4E4XA 2QR8A 1H1QA 3FPMA 1REKA 5EFQA 4OTIA 4I22A 4HJOA 3A61A 2E2BA 3BYSA 2IZSA 4DGOA 1F0QA 3NCZA 5CWZA 4H1MA 2YIXA 5F20A 5IA0A 4O0RA 2P33A 3LOKA 2WFYA 4QQCA 2ERKA 3ZLXA 2I0EA 3PXYA 3Q5ZA 2HZIA 4KBCA 1DI9A 4JBOA 5F95A 3E3PA 3S4QA 3PWDA 3SX9A 4RX9A 5FG8A 5K4JA 2VTRA 5M4FA 2CKEA 2YJRA 4XBUA 4AN9A 2OU7A 3H30A 5J1VA 3FZTA 3LPBA 3IW7A 4UMRA 5I9WA 4RJ3A 4FYOA 4GSBA 3EFLA 3SXSA 3FLWA 3RPOA 4AT5A 2YITA 1BYGA 1LEWA 4FG9A 4RC2A 5GHVA 4ASDA 4B6LA 5IUGA 3VUKA 5ETFA 2A27A 5ANIA 3QD2B 4R1VA 3GQIA 3KCFA 4LL5A 4G16A 3D0EA 4D5HA 2PVFA 5CSPA 5ANOA 5CSVA 2B9JA 4C4IA 3WIKA 2Z60A 3FMMA 1LR4A 1IEPA 4XG3A 3QTSA 3TV4A 3UOKA 3KXZA 3JY0A 3A99A 4BDKA 5DHJA 4FTKA 4PP9A 5CALA 4EK8A 3F7WA 3KKVA 1E9HA 4XV1A 5GIPE 2FSTX 2PHKA 4UXQA 4U41A 3G6GA 4CSVA 2OZOA 3U4UA 4C36A 2W4KA 2XK7A 2BDFA 4RZWA 4TWNA 3BGQA 4QP4A 4IDVA 2PVJA 1P2AA 2J0JA 2JFLA 4YC6A 3BBTB 3VS1A 5DT4A 2E9OA 2I0HA 2XVDA 4G9CA 4NJ3A 1H25A 4PRJA 3QGWA 3IW4A 3OY3A 5A4QA 3PTGA 4YHFA 5ICPA 3E8EA 5FBNC 4O84A 4AGWA 3SRVA 3KGAA 2C5XA 3E7OA 2X8EA 4BCIA 3P7CA 2YIQA 3K3JA 4KSQA 3TL8A 1H00A 1OB3A 5IZFA 5KBRA 3HYHA 5KMOA 3BGPA 4I4EA 4IX5A 4KKEA 5JFSA 4JL9A 1JKTA 1VR2A 5DWRA 5B2MA 2YACA 1AD5A 4YJOA 4ACGA 5IQDA 4JXFA 3UOHA 4D5KA 1J7LA 3FAAA 5B0XA 5DA3A 5KX8A 5J8IA 4ZIMA 1OL2A 2UW4A 1KOAA 2YCRA 4I21A 4EKLA 4F0IA 5KO1A 3EQCA 5EHOA 2R3FA 5AV2A 3HZTA 3CJGA 5CU4A 1IAHA 4IADA 5HESA 1JKLA 3FMHA 3PXQA 3UOLA 4FOBA 3RVGA 5HG9A 4Q5HA 4TNDA 3QZIA 1KOBA 4WNOA 3UPZA 4K18A 3VJNA 2JAMA 2RF9A 1PF8A 1UWHA 4O6EA 2O2UA 3OBGA 4ALVA 3VUMA 5LVPA 4F1OA 4QYFA 1ZWSA 3BQRA 3R7GA 4F6WA 1H1RA 3C1XA 3DB6A 5LARA 3RAWA 4DEDA 1U5QA 1KWPA 4DFYA 3R71A 4I94A 3UYSA 5I3RA 4FIHA 1YHWA 3EKNA 1TVOA 2O65A 1QL6A 2C47A 2OJ9A 2VX1A 5I9YA 4C4FA 3D5XA 1JSTA 3DBFA 3COIA 1XR1A 1ZRZA 3AT2A 3TKUA 3I7BA 4ZLYA 1SNXA 2PVKA 3A4PA 5HQ0A 2YAAA 1G5SA 2JDRA 2GDOA 3R7OA 4RX5A 4PMPA 3M1SA 4LRKA 4NUSA 3WF7A 4H05A 3QQFA 4DAWA 5CSWA 5IA3A 5CAOA 4WRGA 4KS7A 4V04A 5D1JA 4D2WA 3FBVA 3IW6A 3H0YA 4W4XA 3VVHA 5C8KA 3MTFA 4RIYA 3TZ9A 5DIAA 3GC0A 5AR2A 4A9TA 2R3LA 2XP2A 4FTJA 1O6LA 4MBJA 2FGIA 4Y46A 4FTLA 4EOIA 4AFJA 2ITXA 4IAKA 4YLLA 4JT3A 2ZM1A 4QMTA 1ZMWA 1PMUA 2BKZA 4M13A 2HWPA 5HO7A 1JKKA 4JBVA 2R3KA 5IF1A 3C0HA 2P2HA 1R0PA 2B9IA 3UDBA 3F9NA 2IVVA 3AMAA 3MTLA 1XBBA 4X0MA 5AV0A 4FIEA 1PXIA 4PF4A 3FQEA 4DG3E 5HNIX 3RINA 5C4LA 1PKGA 4KBKA 2QVSE 3Q53A 2UZNA 3VBWA 4AOTA 2OZAA 4CZUA 3KB7A 3NCGA 5K5XA 3QQJA 1H08A 5CX9A 4ZEGA 3C4ZA 3CTQA 3FMNA 1R78A 3W16A 1E1VA 4M12A 2V7OA 4FKQA 1W98A 5LVLA 4E73A 5HNBA 5BPYA 4N70A 4FTAA 2YERA 4DT8A 2CLXA 2X4FA 3U55A 3TIYA 5CASA 3MPTA 1W84A 3PWYA 4ZLZA 3PXZA 2XUUA 2BTSA 3QWKA 3VNTA 4CKRA 4HGTA 3QUDA 4XG8A 4O7YA 4FTMA 3O0GA 3QQLA 4N6YA 3V5PA 5I0BA 2Z02A 1W8CA 2HAKA 3FDNA 4DEGA 4HYSA 2VU3A 4TWPA 5A6NA 5AR7A 3UO6A 4QMQA 3IK3A 1ZYSA 1IA8A 2PZYA 3HV5A 1FMKA 2RKUA 4M0ZA 1OECA 2X2KA 2IJMA 4MNEA 4W8EA 2ETMA 5HTBA 4ACMA 3ULIA 4GU6A 4F7NA 2V55A 3VBQA 4AZFA 3QRKA 3N4UA 2C69A 5CQWA 3VAPA 1PHKA 3R30A 4F9CA 1HCLA 3ZCLA 2ZM3A 2JD5A 2R0UA 2VTPA 4DG0E 5EM6A 3UP7A 1JKSA 4D2RA 3JR1A 2XJ0A 3CGOA 3CJFA 3O8UA 3Q4TA 4P5QA 4IJ9A 2Q83A 2BHHA 3MFSA 4OBOA 4FGBA 3O2MA 4QMZA 4TTHB 2JITA 3I79A 3JVRA 3PSBA 3R63A 4FF8A 2Y7JA 4QQ5A 4TYGA 2XRWA 2ONLC 5EYMA 1OMWA 5KZIA 3HKOA 4UMTA 5EM8A 2XK6A 3DZOA 1OL6A 3LW0A 4HCTA 5FM3A 3QD4A 4R78A 3G33A 4O7TA 3OD6X 1BL7A 3UVQA 1WBTA 4FC0A 3CPCA 3RNYA 3IS5A 3ZLYA 2W06A 1APME 3R7VA 1KE7A 4HGEA 1XHAA 3R8LA 4GRBA 5KE0A 3HUCA 2RIOA 3KVXA 1UVRA 2FB8A 4FV4A 3WZEA 4X3FA 1U54A 3G0EA 4GUEA 4EHZA 3FLNC 5FGKA 5JGBA 2BCJA 1Q62A 2PMNX 3Q5IA 5CVGA 4DFZE 2ITNA 2WTCA 3GCVA 3IOPA 3ORLA 4Y5HA 4KINA 3EFWA 4XBRA 4FOCA 1XKKA 2JIIA 4D2SA 3I5ZA 1PW2A 3V3VA 4K33A 4M66A 4L44A 1PJKA 4DGMA 1I09A 3W8LA 3ZOSA 5JFVA 2RSVA 3NW7A 5A46A 2ITPA 4G17A 5HO8A 2YDJA 3BX5A 5CS6A 4MCVA 5JZJA 4HNIA 5KMLA 3BLQA 2OICA 3IG7A 4GJ2A 4DEHA 2BRNA 2ITOA 3PXFA 2C3KA 4FVRA 2QI8A 4ZTLA 2JIVA 2UV2A 3C4EA 3SD0A 3V5TA 2CGUA 4KNBA 3MWUA 3W2QA 3VUIA 4LRJA 4AFEA 3F3WA 3FLQA 3R02A 2G2IA 3R7YA 2HENA 3WZKA 2PE2A 5HVYA 4R6VA 2VX0A 3HP5A 3K5VA 4YGAA 1R0EA 3OCBA 4BKYA 2F4JA 4C62A 1OGUA 1FGIA 3ROCA 1H1SA 1Q8WA 4FTNA 2YCSA 4Y5QA 3RK5A 4RX8A 3RK9A 5D11A 1PMNA 5HHWA 4I0SA 4GH2A 2QHMA 4C2WA 3JPVA 2EXCX 5IUIA 2CKPA 4C8BA 4EQMA 2OF4A 3SLSA 2VTSA 5AUZA 2GNIA 4J95A 3AD6A 3MGYA 4FIJA 4CQGA 1STCE 5FTGA 3QRJA 2EXMA 2VNWA 4MH7A 3P86A 1Y57A 1Q8UA 2ONLA 1PXPA 2CMWA 4OAUC 4O2ZA 2ITQA 1P4OA 1OM1A 4JQEA 4QOXA 4C57A 4FNWA 3QTXA 3G5DA 4QMVA 5AP7A 3DK7A 4CEGA 4DH8A 3NR9A 4QTBA 3TKIA 3WZJA 4PL3A 4KRDA 4WUAA 3VIDA 3RAIA 1YHVA 3FI4A 3KY2A 3MSSA 2YZLA 3QKKA 4MAOA 4BKZA 3VBVA 4BBMA 5IEXA 4XMOA 1UU8A 3VN9A 3QTUA 5BVEA 4D2VA 4C35A 4M68A 1ZOGA 3LHJA 3C0IA 4Q9SA 4ZTNA 3ZDIA 2CKOA 5M06A 4AE6A 5EW3A 2X81A 5IDPA 5DEYA 1OPLA 2XMYA 4O1PA 3AXWA 4YR8A 3DQXA 4DCEA 1OIRA 4IZ7A 2WPAA 2R3OA 4KKHA 4J1RA 2UW6A 1Q24A 1Q3DA 4C4JA 4X2JA 3FPQA 2F7EE 2IVUA 3ZSGA 3OXIA 2C5VA 3COHA 3UPXA 2QOBA 5FEQA 3LQ3A 5D41A 4FKWA 1MUOA 3F7ZA 5HORA 3W1FA 5IQHA 3PJ1A 4KIOA 3UGCA 2YEXA 5ETCA 3HAMA 4XV3A 4KKGA 5DPVA 4D4SA 3QXPA 3PP0A 4YPSA 2GNHA 3FQSA 3ZO1A 4XX9A 2JFMA 4I20A 4Y73A 4CFNA 4EZ5A 3GUBA 4RC4A 4BDBA 4MQ1A 5KHWA 3CGFA 2QR7A 3WYXA 5BVOA 5J9ZA 3DAEA 4IAIA 5FXQA 4BIDA 3C5IA 2PUNA 3DU8A 2PZRA 4O0UA 5E8VA 3H3CA 2EUFB 3VJOA 5KMNA 1LP4A 3N9XA 3S95A 3UMWA 4IB0A 3QTZA 3R2BA 1M52A 4PNIA 5AR3A 5J95A 2W1HA 1W83A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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