3JY0A

Discovery of 3h-benzo[4,5]thieno[3,2-d]pyrimidin-4-ones as potent, highly selective and orally bioavailable pim kinases inhibitors
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
275
structure length
275
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of 3H-benzo[4,5]thieno[3,2-d]pyrimidin-4-ones as Potent, Highly Selective and Orally Bioavailable Pim Kinases Inhibitors
rcsb
molecule keywords Proto-oncogene serine/threonine-protein kinase Pim-1
total genus 79
structure length 275
sequence length 275
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-09-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3jy0A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3jy0A01
2R0UA 5D7AA 5HD7A 1QMZA 5H8BA 4KABA 2VWVA 1DAWA 4DFZE 1JKLA 2VTLA 5HE1A 3VQHA 3BIZA 3E8EA 1M7QA 2UUEA 4FSNA 5KMOA 3HMOA 2W1DA 3NYVA 5H2UA 4CFVA 3TACA 3PSBA 2OJIA 4BICA 4U9AA 1S9IA 5HG7A 4RVLA 3NSZA 3LMGA 2BMCA 3P5KA 4RVTA 5AAGA 3ZXTA 3CKWA 1YWVA 3RI1A 3DT1A 1YOJA 2BAQA 5CU3A 5HE0A 4RVMA 4RIYA 2CCHA 3HMIA 3FZRA 3A2CA 3ULIA 5HBHA 4GH2A 3DXPA 1CKJA 3OTUA 5HIDA 1J1CA 5DR6A 3SD0A 4ALVA 3OCSA 4MF1A 5KNJA 2GTNA 4K2RA 2O5KA 2CJMA 1PMNA 2I6LA 2ITYA 4LV5A 5TKDA 1KE9A 4ZJIA 2YHVA 4F7SA 5KMLA 4EZ3A 1YXSA 2W9ZB 2C0IA 3AGLA 3CD3A 4Z3VA 2O65A 5IUGA 4I1ZA 4QYFA 4ZSJA 1WBTA 5E1SA 5FQDC 3VS0A 4C2WA 4CFWA 4G1WA 3LLTA 3CQEA 4MAOA 3OOGA 4YC6A 4UWBA 2QOQA 2F2UA 2XNOA 3CC6A 3O96A 3P08A 2GQRA 1R1WA 4IM2A 4HCUA 1OL2A 1GZ8A 3VUHA 1XQZA 4FV9A 1X8BA 2RFDA 4I41A 5DBXA 4MD9E 2VTJA 2GNIA 3CY2A 2O2UA 5FM3A 5A6NA 5AV2A 4Q2AA 4C4GA 4I6BA 4R78A 4AZEA 5L6WL 3H0ZA 3OTVA 3FPQA 4H05A 3AT3A 3A7JA 3BHTA 3GC7A 3VRZA 1WBNA 3W10A 3BLRA 4NYEA 3HV6A 1SVGA 2QOIA 3C0IA 4KS7A 3VAPA 1LPUA 3O71A 4AFEA 2WOTA 2YAKA 2QR7A 4YJSA 4KRDA 2C0TA 3D15A 1ZWSA 4IANA 3EFLA 3FMKA 4CT2A 2BDFA 2C6TA 4FI1A 4L52A 2XMYA 1BLXA 3S1HA 1AQ1A 2QU5A 2R3QA 4L53A 4R3CA 5FXRA 4BKYA 3E8CA 4FSZA 4OW8A 2EB3A 2I0YA 4U8ZA 1M52A 2IW6A 3LFFA 4DYMA 3UQFA 4G2FA 1JKTA 2QNJA 4JG7A 4JLCA 3MI9A 4X3FC 4AF3A 4H3PA 4B8LA 5EHLA 1J3HA 2QODA 5HNBA 4TTHB 2XCKA 1UA2A 3BU5A 3MB6A 4G9RA 3HMMA 4IX6A 1L8TA 3AMAA 3CQWA 3EQCA 2ERZE 2XA4A 5BVNA 4C02A 2G2FA 3M2WA 5JK3A 2DUVA 3LFQA 5DWRA 3QKMA 3VF8A 3DTCA 5JEBA 4Y95A 3PSCA 4K11A 4PMMA 4LMUA 4C61A 5CLPA 4JAJA 4DG0E 5T68A 4CZYB 3CR0A 4Z7GA 1LEWA 2JBPA 4IC7A 4L8MA 4PV0A 3GU4A 4HVIA 1JAMA 3W2QA 2XKDA 2OU7A 2IVTA 4HZRA 1QPJA 3EQFA 2YIWA 5HX6A 2R0IA 3FZSA 3LCDA 3UBDA 3LJ1A 3L8XA 4X6RA 3F2RA 2HK5A 4E6DA 4IMYA 4F1MA 3PLSA 2PVJA 3ZLYA 5DNRA 5GZAA 2YFXA 5KZIA 1JNKA 5IQFA 3OT8A 4BDFA 4OTHA 2Z02A 4FEVA 3TJCA 4C35A 4NM7A 2AC3A 4I5PA 3KN5A 2VO6A 4AOJA 5IQBA 3QRIA 3VS5A 1URWA 3RAKA 4GG5A 4N4SA 3OMVA 4OBPA 4ANBA 3JVRA 4I23A 4DH5A 4M69B 3F5UA 4JIKA 4PPCA 3F3ZA 5E8XA 2FH9A 1W84A 2WU6A 1REJA 4NSTA 2B55A 4J71A 1QPEA 4KB8A 4QO9A 2PVRA 2YCQA 2PULA 3UVPA 3GI3A 4FSQA 4ZSGA 2AUHA 4APCA 3FYKX 2BKKA 4BI2A 3ZZEA 4BDAA 1DS5A 4JVGA 4I94A 4XLVA 3AC2A 2R7IA 3FZ1A 3KN6A 2W1IA 2P4IA 3FKOA 3E62A 2RF9A 3QC9A 3R04A 4GK4A 4XX9A 5M4IA 5GJFA 3LMHA 1A48A 2WTWA 4ZY5A 2A4LA 3O2MA 5AJQA 2H9VA 3QD0A 5A3XA 2OH4A 4R1VA 2GNLA 4ITJA 4D58A 1L3RE 2WTVA 3V5WA 5EOBA 5K4JA 2HZNA 3DBCA 4KIPA 4D2RA 3G51A 2F9GA 4C4EA 3REPA 3OHTA 2W06A 4BI1A 4DEHA 4X2KA 4LG4A 3ZZWA 4HGSA 3HV7A 5ANDA 5LVOA 2DS1A 3MPAA 4YZ9A 3R30A 5K9IA 4BHZA 3V04A 2VAGA 5GZ9A 4WNOA 2B52A 4LYNA 1Q4LA 4MXOA 3SKCA 4ERKA 3OFMA 3R1SA 5ETFA 5CEIA 2QO9A 4XJ0A 5AFVA 2FSMX 2QI8A 3FL5A 3NW7A 1WBWA 4CLJA 3GB2A 4FF8A 2EXEA 5LARA 1YHWA 2EXMA 2Y6OA 1UNHA 3R7IA 3R8PA 2GNGA 4HYIA 4A7CA 5HIEA 3C4ZA 4WUAA 3VUGA 2HZ4A 2JEDA 5IZFA 3R73A 4YZBA 4TT7A 4DG3E 3IGOA 3LAUA 2BAKA 4ZMEA 2W05A 4BDJA 3FWQA 3QGYA 4GVAA 5FDXA 3EQDA 4LQMA 4X3FB 3S00A 1KSWA 4IH8A 2X7FA 1SM2A 5C4LA 2R3FA 3FPMA 3I60A 4QMMA 2IZRA 4QMZA 4IVBA 2PVLA 4EQMA 2FO0A 2ZVAA 4U43A 2W5HA 4BRXA 5LJJA 5HORA 3KXHA 3NAYA 3AD4A 3NUSA 4U0IA 2WELA 5CEMA 5IA3A 4C0TA 4C4HA 3FXXA 3HVCA 5JRSA 4FTQA 4AZSA 4CD0A 4DN5A 1JSTA 4GV1A 5KBRA 4OAUC 4JJRA 3DKFA 5F95A 4LGHA 3LCTA 3WI6A 3DZQA 1JOWB 2X7GA 4EHZA 5LCJA 3OW4A 4CMTA 3JPVA 4M0ZA 5LCKA 5LVMA 5JGBA 4WUNA 2C3JA 1FMOE 3UIUA 3BU6A 3K2LA 3BI6A 4F0GA 1A06A 5I9YA 5M4CA 3K54A 4QMLA 1TVOA 3QD2B 5EYDA 2BDJA 3EMGA 3OS3A 1F5QA 4L42A 4FYOA 2ZB0A 4D1XA 5AA8A 4C7TA 1Y6BA 1GZOA 3FY0A 2ZM1A 4RPVA 5CU4A 3AQVA 5AWMA 3NNUA 3LCKA 2BRHA 5JFVA 4FOCA 3V8WA 3QX2A 4FUYA 4YGAA 3QTXA 4AG8A 4RVKA 3W2PA 4C34A 4FKUA 4MNFA 4QMVA 1ZMUA 4QYYA 2XRWA 1XWSA 4BGGA 3RWPA 5CEOA 4O1OA 4RX7A 3DB6A 3ZM9A 3WF9A 5AV4A 3DKCA 3MFSA 4ZK5A 4LRKA 3SVVA 2R3KA 4DTAA 4M67A 5IDPA 2O63A 5ETIA 2WQEA 3U4WA 4GL9A 3FI3A 3VS6A 5CSPA 4RIOA 2P55A 1H1QA 2YIYA 3PIYA 4HOKA 4HGTA 4R7HA 5CYIA 2IG7A 4D2SA 3QZIA 4DBNA 3H30A 3DQXA 1XH5A 3IS5A 4YP8A 2GQGA 3NCZA 1OVEA 3ZMMA 5AM6A 2CN5A 4GU6A 2WU7A 3F3WA 3Q9ZA 3TI1A 4JXFA 2H96A 1UKIA 2WMUA 3VUKA 3CEKA 3W2SA 4EEVA 4PDOA 5JKGA 2QHMA 1J7UA 3FKNA 5HI2A 5HO7A 2GHLA 2PVYA 4O7VA 4KD1A 3K5VA 2YM5A 1FGKA 3HP2A 4FZFB 4BB4A 2C1AA 1HOWA 3AC1A 3A8XA 3UOJA 1NVSA 1OGUA 2QO7A 2QOCA 4K8AA 3NX8A 2UZWE 4AGCA 4MNEA 3PG1A 2C3LA 4KA3A 1W8CA 3GCSA 4DLIA 2W1FA 1F0QA 4EC9A 4J95A 2PU8A 3PIZA 2XK6A 3H10A 3AD5A 1GY3A 2ZMCA 4AW5A 5C8MA 2A19B 4DF3A 2PMIA 4DEGA 4MTAA 3G5DA 3G90X 4YLKA 3U6JA 5EKNA 5HG5A 3CJFA 5T3QA 2FA2A 4JIAA 2IW8A 1ERKA 3FHRA 4DFXE 3TZ8A 2V7OA 4QQCA 4D4RA 3I5ZA 3NYNA 5CAVA 5IH4A 2C5VA 2J4ZA 4M13A 1ZOEA 2P33A 1OECA 4EHVA 4CMUA 5IQDA 1YWNA 1H00A 3DBFA 3QQUA 1URCA 4CG9A 2CLXA 2WMTA 3CTQA 3RZFA 4AE9A 3M1SA 2VO7A 3POZA 2JGZA 2I0VA 2XRUA 4O84A 3F69A 5BYYA 3UNZA 4C36A 3GCQA 3VBVA 4X3JA 2C47A 1IA8A 5CI6A 1PYXA 3C4WA 3BRBA 3C50A 4C4IA 4ITIA 4ZIMA 2GDOA 2EVAA 4QQ5A 2WMSA 2NRYA 5L2SA 4NEUA 1YKRA 4FIHA 1NY3A 4QMSA 1ZY4A 3R9OA 4D55A 1O6KA 3WYYA 4USDA 2UVXA 4FTNA 4B7TA 3FQHA 5LXMA 3R7OA 4FKVA 1WBSA 4FGRA 3D5WA 4UXLA 1QPCA 5EM6A 3MVJA 4WG5A 4NKAA 1PRYA 5ACKA 4WBBB 3DJ7A 4FNWA 2P3GX 4GT5A 4O7SA 3VO3A 1W82A 3Q4CA 3A99A 5L4QA 3ZSHA 3HAMA 3Q9YA 3DXNA 3PY1A 3FI4A 3ROYA 1RDQE 3KF7A 4WSQA 4XP3A 2R9SA 3D0EA 3FZPA 3BHVA 3KULB 2YIQA 3FQEA 4F99A 3R8MA 4H3BA 2NO3A 4EOSA 3MWUA 5EQYA 3UC3A 4B99A 3MY0A 3MY5A 3GFWA 2KTYA 2PZPA 4IADA 4YLJA 4C3RA 1RE8A 3WIKA 4IM0A 4EK4A 4IVDA 4NM3A 3QTUA 4DGOA 4DEEA 3Q6WA 5EI8A 3VQUA 3QKKA 4FV7A 3MH3A 4NFNA 3COMA 4O0YA 1KOAA 4USFA 3UO5A 5E9EA 4QMQA 3UYTA 5HG8A 2X7OA 3EWHA 4X6QC 4XHKB 5ANOA 4AOIA 5JQ5A 3I0OA 3QALE 1O6LA 4PQNA 4L44A 5J7HA 4YSJA 2W4OA 5KMNA 2VWBA 3RPSA 3KKVA 4HPTE 4QMWA 2JDTA 4XEYA 5L6PA 1Z57A 4X2GA 3QLFA 4GUBA 4G3FA 2WXVA 4QP4A 3UVQA 1OUYA 4CYJA 3GVUA 5LMKA 5AP1A 4GVJA 4DGGA 3C4CA 3MTLA 4GKIA 1YRPA 2QOHA 4DGNA 1KV2A 3PXYA 3WE4A 3MY1A 3HECA 3QZFA 5L2TA 1R0EA 5AV3A 3BGZA 4YZCA 4EWQA 3PJ2A 3EQGA 5C8KA 4M0YA 5GJDA 4NCTA 4XOYA 1XHAA 4OT5A 4GT3A 2H6DA 4OBQA 4O7LA 4MX9A 1OB3A 3OBGA 5HE2A 4EBVA 2X8EA 3GC9A 4WD5A 4IZYA 2VTTA 4R1YA 4JDIA 3TG1A 3NW6A 4D2WA 2VTIA 4F63A 2PE1A 2IVSA 3MA6A 4ZLOA 3ZUTA 2W9FB 3ZONA 4CKIA 4RC3A 2YCFA 3FLQA 5JQ8A 3F82A 3DK3A 3ZSGA 1FMKA 2CPKE 1P2AA 4D4YA 5B0XA 3DV3A 3LHJA 4V04A 5HD4A 4I5MA 5JH6A 2X4ZA 2Y4PA 2ZV9A 3QX4A 3AC8A 3R28A 4F0FA 3CPCA 3H4JA 3EFKA 1U4DA 3NR9A 3SLSA 4C59A 2HXLA 1P14A 2QOLA 4C58A 3GT8A 4ANNA 2VWYA 5BYLA 4BIDA 1PMEA 1ZMVA 2C5NA 4TYEA 4L67A 3RM7A 4V05A 1GZKA 4DCEA 1ZLTA 2XP2A 2UW0A 2YWVA 3UMXA 1YXTA 4DEDA 3RZBA 5IEVA 2AC5A 4XP0A 3OW3A 4A9TA 3TV7A 1PW2A 4Q9SA 3GNIB 5CS6A 4FKWA 4FODA 4FZ6A 1ATPE 5C03A 5FRIA 4AACA 4PL3A 4TW9A 4TWPA 4QNYA 1Z5MA 4N70A 4F9AA 4O7ZA 1TQPA 4O7TA 3SQQA 4AE6A 1JSVA 4E26A 3VS7A 4FE2A 1EH4A 5A14A 2R3LA 4MHAA 4BR3A 2XUUA 1XH8A 5E8ZA 5IQAA 4O7WA 4AW2A 3DNEA 3OWPA 4PY1A 5HICA 3NUPA 2ITQA 3AOXA 3EKNA 1YQJA 4DG2E 1U5QA 4JR3A 4D2VA 4QP6A 3QHRA 3NIZA 3R7YA 4UY9A 3E8NA 4NKSA 4TPTA 4BCIA 3U6IA 2BPMA 1OMWA 2UW7A 5EW3A 2CGWA 4YJVA 2Q0NA 3JS2A 4Q5HA 4X21A 4Z16A 2PUIA 2J0JA 2PUNA 2GHMA 2VX1A 4OTWA 3KVWA 3ID6C 3N51A 2R3GA 3MDYA 1OITA 3PPKA 2ZV2A 4J97A 4EOMA 3LLAA 4BDCA 3FV8A 4ZTMA 5KKRC 3B8QA 2BRBA 4FT5A 3PJCA 1O6YA 4LMNA 2CNVA 1B6CB 2XK9A 4QMXA 2YLEA 3MVLA 4ZZNA 4LI5A 2WGJA 2ZM3A 2Z60A 4GIHA 4FKPA 3R02A 2B9JA 3AG9A 3FBVA 4B4LA 4DTKA 5AP3A 5ACBC 4F4PA 5KMKA 4FV5A 4DA5A 4QTBA 4BCHA 4RQVA 3F66A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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