4NEUA

X-ray structure of receptor interacting protein 1 (rip1)kinase domain with a 1-aminoisoquinoline inhibitor
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
308
structure length
286
Chain Sequence
SLNVIKMKSSDFLESAELDSGGFGKVSLCFHRTQGLMIMKTVYKGPNCIEHNEALLEEAKMMNRLRHSRVVKLLGVIIEEGKYSLVMEYMEKGNLMHVLKAEMSTPLSVKGRIILEIIEGMCYLHGKGVIHKDLKPENILVDNDFHIKIADLGLASFKMWGTLYYMAPEHLNDVNAKPTEKSDVYSFAVVLWAIFANKEPYENAICEQQLIMCIKSGNRPDVDDITEYCPREIISLMKLCWEANPEARPTFPGIEEKFRPFYLSQLEESVEEDVKSLKKEYSNENA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of Small Molecule RIP1 Kinase Inhibitors for the Treatment of Pathologies Associated with Necroptosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1
total genus 89
structure length 286
sequence length 308
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4neuA00
4U97A 4YC3A 1I09A 4QPAA 4XEYA 4AP7A 4KKHA 3FSFA 1VYWA 3TNQB 4NM5A 3QHWA 5EI2A 3VS3A 4GFOA 3VUIA 4Z7HA 2W5BA 4BIDA 2GS6A 3OWPA 3U51A 4C3RA 2WEIA 4II5A 3BE2A 5AP4A 4GYIA 3MFSA 4JAIA 1JKKA 3FXWA 4YSJA 3NUYA 3Q32A 2V7OA 2X7FA 3CGOA 5CWZA 2Y0AA 5EHOA 3VUTA 5A4CA 5LVPA 3FDNA 3THBA 3O8PA 1KE8A 3BU5A 4WD5A 2P55A 3KY2A 1V0OA 3PPJA 4QMPA 3U4UA 3VWAA 4Q5EA 3WF5A 4F6SA 5C26A 3UC3A 3IKAA 4ZEGA 1XBAA 4CXAA 5IA4A 1CKPA 3QCSA 4C0TA 4IIRA 3FLWA 4AZSA 3FXZA 3QRUA 3LXLA 5A3XA 5EDQA 4JQEA 1H08A 4OTIA 4FK6A 5HE3A 4TYHB 2YJRA 3T3UA 5EOLA 2J5EA 2OZAB 3OTUA 4IC8A 1W8CA 4CFXA 3H0YA 1F0QA 4EKKA 3A62A 1M52A 3F2NA 4KRCA 2XJ2A 5AJQA 3ZCLA 5IU2A 4MXXA 3RI1A 3AG9A 4AACA 2HY0A 2GNJA 3KRLA 3MI9A 4BTFA 3SXSA 4PY1A 4YHTA 4Q2AA 2W99B 2JKKA 4JBQA 3EQFA 4USDA 3PVWA 1QPEA 3VS5A 3A4PA 2HK5A 4GFGA 4R1VA 2OBJA 2B1PA 2ESMA 5J8IA 3PSCA 2IVSA 4NM3A 3ROYA 4IDVA 3DTWA 2EVAA 2IW9A 3ZFXA 3NAXA 2PUUA 3AD5A 3UQFA 1PF8A 5BVEA 4H58A 2E9VA 2YISA 1U54A 3ZOSA 5CENA 3D9VA 1XR1A 3CJGA 5F95A 4AGUA 1PXNA 3QXOA 2ERKA 4ALWA 1PXPA 3G6GA 1GY3A 3MY5A 5K5XA 2VX0A 3KXHA 3U6JA 3P7AA 3ORIA 4LRJA 4ASZA 1YKRA 4D4SA 4OTDA 4EHEA 3EN4A 3AMYA 2AC5A 3NW6A 3W2RA 1YXUA 4AQCA 1WCCA 2EXMA 3F3ZA 3IDPA 1YXSA 4QP9A 5EH0A 1ZYSA 4C3FA 2HZ0A 4E6DA 3KK8A 5HU3A 2W7XA 5D12A 3NR9A 5F94A 4F9YA 4FT3A 3REPA 2CLQA 5ACKA 3BLRA 3PG3A 1PJKA 4AUAA 5CU0A 3WARA 3VBTA 4L52A 3PP1A 2UW5A 3QGWA 4UXLA 3QQLA 2F7EE 2H9VA 1Q8TA 3KULB 3AT4A 3DPKA 5E8YA 3Q9YA 2GFCA 5FQDC 4U42A 2A19B 1PYXA 4YLKA 4AGDA 4TY1A 4RVTA 4CQEA 4CTCA 1REKA 5EW3A 2RG5A 4IE9A 5HI2A 3QUDA 4RIWA 2WMBA 2FGIA 3D2KA 3R04A 4RIOA 5HCZA 3PJ3A 4OBOA 4F0FA 3TV4A 3OXZA 4KIQA 5HE0A 3FWQA 5D41A 5FRIA 4DYMA 4ERKA 3SLSA 4PMTA 2FSLX 3FMEA 2VGPA 4FZDB 4GG7A 4MWIA 4Y46A 3UGCA 3VBQA 1CKIA 3PIXA 4YTCA 1R0PA 4QMMA 4RBLA 5HOAA 5JFXA 3R28A 3GU7A 4C4IA 4J97A 2ZAZA 2BIKB 3RPVA 3MJ1A 3HECA 2XM9A 3NGAA 4IXPA 4M84A 2Q0NA 3NNUA 1U59A 4E5WA 4NIFB 1UNHA 2GDOA 2VTRA 2VWUA 1OB3A 4IM3A 4ZTSA 5KMOA 3E88A 4GL9A 5I3RA 2F57A 2H8HA 2WTCA 1JAMA 2XK7A 3KA0A 3QKMA 5CAQA 1G5SA 3SD0A 1K2PA 2RGPA 3PUPA 5BVNA 4UB7A 5GJDA 4EKLA 4K9YA 3WZKA 4CZYB 2IZRA 4IX3A 4FYNA 5CNOA 3G0EA 4BI2A 5L6OA 4UWYA 2YA9A 4FYOA 3MVHA 3ZO1A 4A07A 2HZIA 3MFUA 4F7SA 4WT6A 4HYIA 2FA2A 1KWPA 4F7LA 3TZ7A 2HY81 1LPUA 2XVDA 3SOAA 3TZMA 2JFMA 4Y5QA 4I6FA 4CZUA 4FKOA 4G34A 4O27B 3RK7A 4DEAA 3R1NA 2WTIA 2VNWA 4QMVA 2FH9A 4EI4A 3MH0A 1XQZA 4L9IA 4YZDA 5T6KA 4TWCA 2C68A 1HCLA 4MNEA 3ZC5A 4AE9A 5DR2A 3GQLA 3R7VA 3POZA 3R73A 3ZXZA 4C57A 3NIEA 3WF6A 3MFTA 4J8MA 2I6LA 3DU8A 4JRVA 4I94A 4E20A 5LMKC 4QT1A 4FTIA 4J53A 5IMEA 2XYUA 3LQ5A 2YCQA 2XNOA 2HENA 4E3CA 2IWIA 2JKOA 4RMZA 4D2WA 2PVJA 2Y7JA 4NM7A 5LWNA 4M8TA 4EOOA 2QLQA 3EFLA 4Q9SA 3E5AA 5EOBA 4PL4A 3ZYAA 4EH6A 5JK3A 5J1WA 4AZFA 2R3RA 3NAYA 2P4IA 3KXGA 4FZAB 3VS1A 4EYJA 2PVMA 4ZTHA 3UOLA 4D9UA 3HMPA 2Y4IC 4FKTA 4C61A 3GQIA 2HYYA 3IDCA 3EH9A 4HCTA 4K33A 4X3FC 3L8PA 4XBUA 4Y95A 2R4BA 4YO6A 4BDHA 4AGCA 3CKXA 3JPVA 1K9AA 3E8NA 2Y6MA 1U5QA 3TTJA 1OPLA 2C5VA 2F7ZE 1MUOA 4XV9A 4JJRA 3CD8A 3W55A 2X8EA 3VVHA 3EQGA 3LLTA 4YC8A 3CE3A 1DM2A 2CSNA 2ZM4A 3KVWA 3W10A 4BIBA 3UNJA 3OW3A 4IAIA 4ZTLA 3V8TA 2RKUA 3SC1A 4TYHA 3VO3A 2WNTA 3QA0A 4IJPA 2OZAA 4RSSA 4GJ2A 3E62A 4AE6A 4FTMA 5HHWA 2ZV8A 3VW6A 5CF8A 4EOSA 1WVXA 1JVPP 3QTZA 1SMHA 4BCOA 3ZO4A 4IB3A 2XUUA 4FICA 3QQJA 4KBCA 5DIAA 1OM1A 4H1JA 4F0GA 3ANQA 4LUEA 3MSSA 3IONA 5L2WA 4FODA 3A60A 2IVTA 4G2FA 2WMWA 2PVKA 3OUNB 3POOA 3FYJX 4IQ6A 4CFUA 3ZRMA 4QMOA 2W1HA 3BELA 2FB8A 4IW0A 3UJGA 5HTCA 4WO5A 4ZZMA 5J9LA 4TNBA 3EN7A 4JR3A 5EK7A 3U87A 2VTIA 2W1IA 3G2FA 4FVQA 4XJ0A 5AUYA 3C5UA 1OIUA 5M55A 5AUWA 4EK8A 1H07A 5ANKA 4ONAA 3TZ8A 2E2BA 2XNNA 2BRBA 2WMAA 5CEIA 4MEDA 1GIIA 2HXLA 2XKFA 3IGGA 4HYSA 4PQNA 4J7BA 5FP5A 3QHRA 2VTJA 3MY1A 4IACA 3RNYA 3A7FA 3GFWA 2E9OA 4ZLYA 1Q97A 5I9VA 3PSBA 3Q9XA 3WF7A 4CMOA 3FPMA 3LIJA 1Q8UA 4FUXA 4QNAA 3ZDUA 5L2QA 4XHKB 3GT8A 4MQ2A 5DG5A 4DN5A 4NUSA 4MH7A 4DGNA 5AP3A 1WVWA 2VZ6A 3D83A 2G2HA 2OH4A 2WMRA 4HVSA 4RFMA 3AC8A 3DK3A 2VTSA 3CY3A 3DJ6A 4EZ5A 4YO4A 4CLJA 4F1OA 4LV8A 5CNNA 2W1DA 2WB8A 5TR6A 4BCPA 1NVSA 2GQGA 3AMBA 1Z5MA 5CEPA 3AGMA 2BHEA 4RJ7A 3UZTA 5BUJA 1Q99A 2OW3A 2BFYA 3F69A 3MBLA 4YU2A 4O0WA 4A4OA 4RVLA 2X8IA 4RX8A 2JEDA 4G3CA 2VTHA 2H96A 4K0YA 1LEZA 4BBFA 4MCVA 3IGOA 4YUQA 3R8UA 5KNJA 4R6VA 5IUHA 3KEXA 4YZMA 3CQWA 2ITYA 3EOCA 4JR7A 3V5TA 3IW5A 4NIFA 5E8VA 1YWVA 4GU6A 3VJNA 4O0XA 4QP1A 4QP7A 1KE7A 1PXKA 5FXSA 2XIRA 2BPMA 2GPHA 4XG8A 5I5ZA 2R3HA 4DITA 4LI5A 1GAGA 3MS9A 4YHFA 3ALOA 4DGOA 4LOPA 3R8PA 4JAJA 3BV3A 4WG5A 4PRJA 1J91A 4XYFA 3WE8A 4CKJA 2BRMA 3B8RA 3HA6A 5M57A 3EJ1A 3LOKA 4EBVA 4UXQA 4XV1A 2C6IA 4QP2A 3UPXA 4G5JA 4DH8A 1JSUA 3BU3A 3BRBA 3I60A 1OUKA 3MY0A 5BYZA 5AAFA 4FG7A 3SX9A 2J9MA 4IDTA 3V6RA 4EH2A 4CZTA 3DT1A 1FMKA 4G5PA 2I1MA 3MWUA 3BI6A 4FKJA 4JQ8A 4AA4A 3D7TA 5DMZA 4QQCA 1OKWA 4TN6A 2CMWA 1PKDA 4J1RA 1ZXEA 3PXZA 5BVWA 3VN9A 2WQEA 4I0SA 3EQIA 4PUZA 5CI7A 4YJPA 3SRVB 5I9WA 1CDKA 4FTAA 3UYTA 3O7LB 3OCTA 3OP5A 1YRPA 3PP0A 4QMSA 5EM7A 5L3AA 5M4UA 1OIYA 3UMWA 3PPZA 3EQHA 1W7HA 3EFKA 3L8XA 3M1SA 2QLUA 3PIYA 3U4WA 5AA8A 3WZDA 3LXNA 3DV3A 4DG0E 3MH2A 3HGKA 3JY9A 3R6XA 5BMSA 1F3MC 3FUPA 4JI9A 2OG8A 3CEKA 3N9XA 1TQPA 4I6HA 3CJFA 1H27A 3LCOA 2Z7LA 3AGLA 5A9UA 4YURA 4MD8E 4GK4A 3PRFA 4J98A 5LVLA 3TN8A 2QI8A 3LW0A 5AR5A 2RFDA 4NW5A 5CANA 1YWNA 3C50A 1W0XC 3VULA 2XRUA 3LPBA 4FV4A 5TO8A 3W32A 4CVAA 2JFLA 2C6EA 4EL9A 1E9HA 1ZRZA 4X3JA 3W1FA 4FV6A 5LQFA 1BLXA 4RLLA 4FV5A 4ZOGA 3R83A 4F4PA 5AV3A 4B9DA 1YWRA 4BFMA 4F63A 4JG6A 2OU7A 1UWHA 4XG4A 3F7ZA 5E8TA 4KS7A 2GU8A 5DOSA 4CCBA 4AOIA 1DS5A 5FG8A 3S95A 1YHWA 2A0CX 2BAQA 3UO4A 2ZV7A 3TT0A 2C6OA 4IWDA 3CD3A 4L3PA 5FWKK 2XB7A 4QYFA 3OWJA 5FXQA 5KUPA 5CU2A 4DGGA 4U0IA 5JQ5A 3FLZA 4F9AA 4BZNA 3LCDA 4QMUA 3QRJA 3Q60A 2HZ4A 2UZOA 3EZRA 4RGJA 2DWBA 2PMNX 4AA0A 4EOMA 3UG1A 3MN3A 4FSZA 5LJJA 3FSKA 4WNMA 5IG1A 5G6VA 4A4LA 2YIQA 2WMQA 3IW7A 3AD6A 4NKSA 4YZBA 2OGVA 3BGQA 2VO7A 1ZYCA 4FKLA 4BKYA 4FI1A 3I1AA 3KN6A 3R1SA 1O9UA 2PVLA 3E3BX 3P78A 3QZHA 2I0HA 3CPCA 3LE6A 5C8MA 4LRKA 3T9IA 3HNGA 4IAAA 3GCPA 2JDOA 4QP6A 3WYYA 4ENYA 3R7YA 3UP7A 2RL5A 3NNXA 1M7QA 4TTHB 4PV0A 3OY1A 2XEZA 4G3GA 2CN8A 3OT3A 2C69A 5HD4A 2OJFE 3VW8A 1BX6A 1GIHA 4KIKB 2EB2A 4M15A 5B0XA 3VBWA 4S34A 3A99A 3OROA 4R1YA 4GSBA 5HG5A 3Q2MA 2BFXA 3AMAA 3ODZX 4IAZA 5K9IA 4G3FA 3RPYA 4M67A 4YBJA 2OJ9A 5EDPA 3R00A 4D5HA 2VV9A 2B4SB 1U4DA 1M7NA 2GCDA 3LFCA 4K11A 5B2LA 3DBFA 4XG3A 2REIA 2PVRA 4YJVA 3QCXA 2C0IA 2Y4PA 4MXZA 3A8XA 3PA3A 2X2KA 4DFYA 4L7SA 4E8AA 3FKOA 4XOZA 3QYWA 4AW1A 4IWOA 5HO8A 1WBSA 1XH7A 2BIYA 4GJ3A 4Z3VA 5CASA 5AR4A 3ALNA 2C6KA 1OPJA 4ZY6A 1OL5A 2VTOA 2QURA 3GUBA 4RWKA 2AYPA 4GIHA 2CLXA 4ZY4A 3OY3A 3LFSA 4GYGA 2QD9A 2YM6A 3F5PA 3EQRA 3GU5A 3JVRA 4W4YA 4D2RA 2QVSE 4K77A 4GMYA 4ANBA 2ZM3A 4IWPA 1B39A 4TWPA 2HWPA 4CCUA 1U54B 4XV2A 3ERKA 4FTQA 4H3QA 4RJ4A 4PNKA 2ONLC 2OXYA 1H0VA 3T9TA 3A8WA 5C9CA 2PZYA 4IAKA 3HX4A 4J52A 4X2JA 2NPQA 4QMYA 4QPSA 5M4IA 3EFWA 3RPOA 3TV7A 3VS7A 2WIPA 3HUBA 2WO6A 3ZRLA 4G9CA 4FV9A 4QTDA 2YACA 3D7ZA 3AC1A 5JRQA 3OOGA 4IWQA 1KOBA 2IVUA 3KF4A 4L00A 1KOAA 5M56A 3W2QA 4P7EA 3FJQE 4G9RA 4L67A 5M4FA 4MWHA 4RLKA 4BIEA 3F61A 1YI4A 3CQUA 3GENA 4JBOA 3QFVA 3IW4A 2NRYA 2OIDA 2R2PA 3FKNA 3QTXA 1UVRA 5K4IA 2QOCA 1WBWA 1BI8A 2XNGA 2J4ZA 3QQHA 1H1QA 4RJ6A 4L46A 4YHJA 1T46A 2PZ5A 3HDMA 3KF7A 3OG7A 3BZ3A 4O2ZA 1NY3A 1GZNA 4XH6A 4KABA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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