1M7QA

Crystal structure of p38 map kinase in complex with a dihydroquinazolinone inhibitor
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
348
structure length
348
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Design and synthesis of potent, orally bioavailable dihydroquinazolinone inhibitors of p38 MAP kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 107
structure length 348
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2002-07-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1m7qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1m7qA01
1IR3A 2IJMA 1NVSA 5EYKA 3PZEA 4IVAA 2IZTA 3EFLA 2PVNA 3MFUA 3ZMMA 3H0ZA 3FZOA 3QLGA 4YLJA 4YSJA 3QALE 3QYZA 3E8EA 1WVYA 4FV7A 3SXFA 1J1CA 4KIOA 4A06A 4FNYA 5IH4A 3GCVA 2WTKC 1LR4A 3UOKA 2GNLA 2XB7A 3CY2A 4XP0A 4X2KA 3G9LX 3AC1A 4JNWA 3O0GA 3SXRA 3TCPA 3KY2A 3VS2A 2JEDA 3VNTA 4EZ5A 3DK6A 3VIDA 3FYKX 5J9LA 4QMSA 4FKRA 2JFMA 1FQ1B 1OUKA 1Q99A 4DEBA 3HL7A 3P7AA 4R7HA 2GCDA 3CKXA 4D9UA 4FEQA 1RJBA 1XQZA 2C1BA 3W55A 3KCKA 2WMWA 4EHVA 4QO9A 2H9VA 5AR3A 3SXSA 2YIWA 1PKDA 5JQ8A 2G01A 2VWXA 3DB6A 4IJPA 3R7VA 3PJCA 4HZRA 3W2PA 4C3PA 4L00A 4E4NA 2AC5A 1PXNA 3LXPA 4DFNA 5AA8A 1Q97A 5FXQA 3N4UA 3DV3A 3UOJA 4AA0A 4KRCA 4E3CA 2BAJA 2VTLA 2WMBA 3NYXA 5AV1A 3ZM9A 2QKRA 3FLZA 3NAYA 4JI9A 4O0TA 4RIXA 5K4JA 5AP2A 4CCBA 3RAIA 5AMNA 1YXTA 3FZ1A 3UMXA 3F88A 3P1AA 3V5TA 4BDJA 3WBLA 4DC2A 5IEVA 2WIHA 2HENA 4NM0A 3W1FA 3FKOA 2WELA 1LP4A 3QD0A 2W99B 3V8TA 4RWLA 2BROA 4HYSA 3RZBA 4C2VA 5ETCA 3FC1X 2HK5A 3LFDA 4JBOA 2QOHA 3HAMA 3U51A 1YDSE 4R3PA 4ZJJA 4CFFA 2W1FA 4QQTA 4K8AA 5AFVA 2VX1A 4MKCA 4ERKA 3O23A 3C51A 4QOXA 5IEYA 2ETMA 3MBLA 2WEIA 5E91A 5HCZA 4JT3A 3T9IA 3ORZA 4DBNA 3FQSA 4XRJA 5JGDA 2RFDA 4GJ3A 4E5AX 2EUFB 5KMMA 1UNGA 4IADA 1G8SA 2YM8A 1MUOA 3LJ1A 3EWHA 2VO3A 1MQBA 1OL6A 3EFWA 4O7YA 4U42A 4R7IA 4EOJA 2W05A 2WQOA 5AP6A 3QQKA 3A2CA 4PL4A 3QWKA 4H36A 4KKGA 4YJPA 5T3QA 3BWFA 4CZUA 2ITXA 3KXMA 4M12A 4BBFA 3AMYA 3GOKA 1CTPE 2ZB1A 3I6UA 4I4EA 4LRMA 5DG5A 2PMIA 3D5UA 4L7SA 2WHBA 5FGKA 4P5QA 3KF7A 4AE6A 2B4SB 2QI8A 3NLBA 1KOAA 2H34A 4OTFA 2C68A 3FI8A 4QTCA 5CF6A 4BGHA 1Q62A 2G9XA 3QXPA 1H25A 3BGPA 3W10A 3IDBA 4QQ5A 4R7BA 4DA5A 3MH2A 4XBRA 2CGUA 4EWQA 5HU9A 1Y6BA 3OMVA 4JQ8A 5AUXA 1TQIA 4QMUA 4TYEA 4F9AA 3ID6C 2AC3A 3LMIA 3DXNA 2CGXA 4V0GA 3OCTA 3HKOA 4GUEA 3H9OA 3I4BA 3MYGA 2OJIA 2OZOA 4FL3A 4LOOA 3FMEA 1IRKA 3BQRA 2SRCA 2YABA 2Q83A 4B8MA 4EBVA 3R8ZA 4EUTA 4IWPA 5CS6A 4WNOA 5J1VA 3PIYA 4S31A 4N6YA 4HVGA 4EH7A 4MWHA 1OIUA 3ZONA 4IH8A 4DN5A 5KNJA 3K2LA 4G34A 2WTIA 3RPVA 2BKZA 4TNBA 2I0EA 5FP6A 4XUFA 4YBKA 4FZFB 5HG5A 3M11A 3FXWA 4RIYA 4FV1A 4M66A 3LFFA 3ULZA 2YA9A 3K5UA 1OL1A 4FTNA 4NW5A 5G6VA 4FE2A 3QRKA 3RKBA 3OY3A 5BUEA 4LQMA 4IM0A 2W5BA 3HVCA 2IW9A 1HCKA 3HMPA 3FMKA 2XIYA 5A4LA 3V6SA 2PHKA 3IECA 2X9FA 1H0WA 1SM2A 2YISA 3R7UA 4BN1A 1LPUA 4IAYA 3H9RA 1O9UA 5E8UA 5HVYA 2NP8A 1JNKA 2JDRA 3RWQA 4EORA 3RINA 4L43A 3SA0A 2VWVA 2GQRA 1R39A 3R21A 4MYGA 4RJ6A 1PXJA 1XHAA 3ZO3A 2OBJA 4HOKA 4MH7A 3ZBFA 4BR3A 4JL9A 2PPQA 2R7BA 5CU4A 4WSQA 3SRVA 1ZZLA 1F5QA 2WPAA 3CEKA 4FNXA 4O1OA 5T68A 3TV4A 3AMAA 4XS2A 1MRUA 4NL0A 2ITVA 4RX8A 5AM6A 4O6EA 2WMAA 4WRSA 1H1WA 2QOKA 3PXFA 4F6UA 5IG1A 3SG8A 2W0JA 2ZVAA 4I6BA 4UMPA 3DXQA 3VHKA 4EOQA 4RFYA 4L46A 4D4VA 5BYLA 5D10A 4YLKA 2QCSA 4ZSJA 4BICA 4UXLA 4QMTA 1Z9XA 2PZIA 2VNYA 3MN3A 1PMEA 4L3JA 2WFYA 3V51A 5ETAA 3A7HA 3ZHPC 4CT1A 4I5HA 2YITA 2P2HA 1ZY5A 2BFXA 5HIDA 2JDTA 5H8GA 4P90A 3R0TA 3O50A 3NUSA 2IVVA 2UZDA 4RVMA 5E92A 2OGVA 2XEYA 3UO5A 3DBCA 3V5WA 3LW0A 5B2KA 4NSTA 5DR6A 3R2YA 2PUPA 4P2KA 3DDQA 3HUBA 5AP1A 4PP7A 3OCSA 4I92A 3JVSA 4PMPA 4ZY5A 3E8CA 4IM2A 3SQQA 2JFLA 4EYMA 3SX9A 3VHEA 4MBLA 5EW3A 2R3JA 3E5AA 4X2NA 4FV2A 3QQGA 3RK7A 3ZSIA 1F0QA 2OIQA 3R9OA 1H01A 5G1XA 3F69A 3GU6A 1UV5A 3ZDUA 3IW8A 3IQ7A 2DWBA 4A4OA 3E62A 5EFQA 4M0YA 3FHRA 3A7GA 2XKCA 1QPCA 4XYFA 3UC3A 2YERA 4K2RA 1QL6A 3POOA 4ZSEA 3UJGA 4J8MA 2XK9A 3QTQA 4RJ3A 1ZYLA 4G2FA 5CNNA 4BVUA 4RX5A 3NPCA 1YXVA 3UVPA 5IA5A 2YHVA 5CNOA 1Q8YA 3F61A 3QGWA 4DFUA 1XBBA 3I1AA 4H05A 4DYMA 2ZAZA 4O7LA 4MTAA 3MFTA 5I9VA 4V01A 5HD4A 5LMBA 2XNGA 2B0QA 2E9NA 3MS9A 2PL0A 2F9GA 5EM8A 5CU0A 4AFEA 1FPUA 2X8DA 3PIXA 4DEDA 4X3FA 3P23A 4YMJA 4EOIA 4Q5EA 3EQCA 2YCFA 4QP4A 2C6DA 3FHIA 4EEVA 2QR7A 3CKWA 2VD5A 3P78A 4IAKA 4W4YA 4WSYA 5DIAA 5IEXA 5CF5A 3C50A 4FIGA 3SHEA 2O5KA 4GVJA 3ZZWA 3QX2A 4Q2AA 5DEYA 3PE1A 3MVLA 4C02A 4UMQA 4CMTA 4WG5A 1A9UA 4L44A 4R3RA 4AF3A 3EZVA 2X7OA 4FSZA 5DA3A 1CKPA 4BZDA 2BTRA 1FGIA 1P4OA 3EYGA 1B38A 4BDHA 4JX7A 4KSPA 1QCFA 4YZDA 3ZCLA 4A4XA 3UC4A 2BUJA 3HUCA 2QQ7A 5EDPA 1PXKA 5FEDA 4C4IA 4E4MA 3BE2A 4FUXA 1JKKA 1KE7A 2Y4IC 5CU2A 5E8SA 3LQ3A 5CYIA 4DTKA 4UYAA 5IKWA 2B53A 3D7TA 1J7IA 2Y9QA 5FD2A 2OXYA 3R7YA 1W8CA 5AUUA 1W98A 3DXPA 5C4KA 2QOLA 3C1XA 3I60A 4ANNA 4L9IA 3QYWA 4QP3A 4PRJA 3ATSA 3SKCA 1YWNA 4AOIA 4CFMA 3QAME 3FLYA 2BTSA 2IWIA 2B54A 4U9AA 3UOLA 2PVLA 2YM5A 2QONA 4XOYA 2W5HA 4UMUA 3VUDA 3NIZA 3MY5A 2B55A 3GI3A 4RQVA 4E26A 3WIGA 4E8AA 2HXQA 5AR2A 5EOBA 1T45A 2YZLA 3UYTA 1FINA 2OJJA 4RA5A 3E8DA 4YJOA 5L2SA 1KV2A 4ZTNA 4I5PA 1XBAA 2C6IA 5A54A 4OR5A 4ARKA 4WG4A 2F4JA 2QNJA 3COMA 3NDMA 3CSVA 1UA2A 3CQUA 4MX9A 5HTBA 4PMSA 2GS2A 3OWKA 4IX6A 3AQVA 2ZOQA 1OPJA 3A60A 3PP0A 5DI1A 2J2IB 2IVTA 3DK7A 1OI9A 4CZYB 4RZWA 4X3FC 3D2IA 1RDQE 3KRJA 3KXGA 1GZ8A 4QMXA 4QYHA 1R0PA 5FRIA 4GK2A 4DAWA 3BV2A 5KZIA 1YW2A 2QOQA 4WNMA 3WF9A 3GCSA 4ASXA 4F9WA 5HOAA 4GV1A 2BZIB 4B8LA 3E87A 4FKWA 1CMKE 5TOZA 4CV8A 4ZJVA 4C37A 4RRVA 5I3RA 1B39A 4RVKA 5AV0A 1P4FA 4I1ZA 3R01A 2CGVA 4FYOA 2UZUE 3ROCA 2OH4A 2ITUA 1YXXA 5GHVA 3OP5A 4B0GA 5BVNA 3VUGA 2EXEA 4WBOA 4U5JA 4MXZA 1UNLA 4GH2A 3SW4A 2G2IA 4PMMA 4FL1A 5DH3A 3HV6A 4FTOA 3UTOA 3BYUA 4EH2A 3QUPA 4FT3A 5M55A 2HW6A 5FDPA 1R78A 3W32A 4AWIA 5M4FA 4JQEA 2GHLA 5TF9A 3TZ7A 2V7AA 2X6DA 4JR3A 4CSVA 1XH6A 3IW4A 3QTZA 5L2QA 3R9RA 4F7NA 5CANA 2OKRA 3BHHA 2RGPA 3WE8A 5IA0A 2QU5A 4XRLA 5EDRA 5HO6A 3OWJA 3W2CA 5KMIA 3BZ3A 3HEGA 3AT3A 3UO4A 2R64A 3MI9A 1FVRA 3BV3A 5I9ZA 2PVHA 4FKLA 3ENMA 1W84A 3U9NA 3V8WA 2EB2A 4U40A 5K9IA 4BCPA 3QUDA 5FLFA 3WZKA 3OXTA 5HD7A 4IWDA 4RFMA 2C3IB 4NIFA 4EH3A 3D9VA 4XEYA 4J71A 4FG9A 2UW8A 4AW1A 1M52A 2OICA 4IX3A 2W9FB 1R1WA 2X0GA 1SNXA 2FO0A 4H3QA 4C59A 3ORMA 3KF4A 4M69A 3IW6A 3VBTA 4NTTA 2XNBA 4QMVA 5AR8A 1PW2A 3GC0A 4I24A 3RP9A 3UO6A 2JC6A 5E4HA 1YHSA 2B9JA 4RWIA 1XJDA 1J7UA 4EJ7A 5K5NA 3VO3A 4W4VA 4H58A 5F95A 4D5KA 1NW1A 1DM2A 3DFAA 5DMZA 2YEXA 1OB3A 4ZK5A 1MQ4A 3FLQA 3ZLWA 2EXCX 4FEXA 2GNIA 4C58A 5J95A 4ZTHA 2W7XA 3F5UA 4J52A 3BWJA 3FSFA 2C1AA 5CEKA 1CM8A 1DAWA 1IAJA 1M2PA 2YAAA 4XBUA 5HLWA 5AUWA 3MVMA 2VO7A 3MFRA 2WTJA 5AV3A 3UZTA 2OI4X 3A8WA 3AT4A 2VTSA 4HCTA 2UW3A 2XNPA 4XJ0A 3SW7A 2HIWA 4RMZA 4J97A 3R71A 3MVHA 4TYIA 3ZLYA 5CU3A 2W17A 4FF8A 2JD5A 2UW7A 3MB7A 2C5YA 3OUNB 2XK7A 3JPVA 4R8QA 4XCUA 3QQFA 2VTJA 3HLLA 4X2FA 5BX0A 5I4NA 4KIQA 2Y6OA 2XF0A 4M84A 1LUFA 4RIWA 2J5EA 3BLHA 2IPXA 1ZYCA 2GS6A 5HBJA 3TZ9A 2W5AA 4J1RA 1K9AA 3RNIA 2R3GA 4DFXE 3FC2A 2VV9A 1H1PA 3JUHA 3IO7A 3KXZA 4FV0A 4O22A 5EHLA 1SVHA 4FR4A 4IFGA 4LRKA 5HE1A 5IUIA 3TV6A 3PE2A 3SAYA 4YO4A 3PVUA 5DHJA 3SOCA 4F1MA 3AT2A 2HZ4A 4PL5A 5IQDA 3WARA 5AIRA 3GXLA 4O81A 2YLFA 3E3PA 3V8SA 3P79A 4W4WA 5KE0A 3QZGA 2C30A 1EH4A 5C01A 4CKIA 5K0KA 2NRYA 2C6EA 3TL8A 5KCVA 1OMWA 3GCQA 3LXNA 4I6HA 3ZBXA 4JR7A 3NGAA 3R7OA 2XKDA 5DFPA 4BY9E 3EHAA 4FGRA 4RLLA 4MD8E 3VBYA 3R8UA 2WQNA 5AUVA 5DRBA 4E6DA 3FL4A 3RAKA 1FMOE 1OKYA 2X2LA 2CN5A 4NFMA 4QTEA 5K0XA 3LFSA 4OTDA 4W9XA 3KEXA 5KHWA 2EU9A 2UZTA 3OBGA 5IZFA 4BCMA 4EQMA 1E9HA 3OD6X 3U9CA 4OTWA 2CKPA 1R3CA 4F65A 4TW9A 2QODA 4QD6A 4H1JA 4YJRA 3Q6UA 3UZRA 3HRCA 3VJOA 1YKRA 5J8IA 2UV2A 4O0UA 4ENXA 3DBQA 3TKHA 4NWMA 4ACHA 3WZEA 2CPKE 5IPJA 1APME 2Z7RA 5AUYA 4AZEA 3QXOA 4LGGA 3TNQB 4YUQA 3THBA 3PSDA 4LOQA 4AW5A 3WZJA 2P55A 3NZ0A 2OFVA 3R1SA 5CEPA 5IH5A 2OZAB 2X6EA 3R8LA 3EKNA 1K3AA 4BDCA 1H08A 2O2UA 5AP3A 4C2WA 4WUNA 5KMJA 1PF8A 3IW7A 2WZJA 3NR9A 2LGCA 4MWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IR3 A;  2IJM A;  1NVS A;  5EYK A;  3PZE A;  4IVA A;  2IZT A;  3EFL A;  2PVN A;  3MFU A;  3ZMM A;  3H0Z A;  3FZO A;  3QLG A;  4YLJ A;  4YSJ A;  3QAL E;  3QYZ A;  3E8E A;  1WVY A;  4FV7 A;  3SXF A;  1J1C A;  4KIO A;  4A06 A;  4FNY A;  5IH4 A;  3GCV A;  2WTK C;  1LR4 A;  3UOK A;  2GNL A;  2XB7 A;  3CY2 A;  4XP0 A;  4X2K A;  3G9L X;  3AC1 A;  4JNW A;  3O0G A;  3SXR A;  3TCP A;  3KY2 A;  3VS2 A;  2JED A;  3VNT A;  4EZ5 A;  3DK6 A;  3VID A;  3FYK X;  5J9L A;  4QMS A;  4FKR A;  2JFM A;  1FQ1 B;  1OUK A;  1Q99 A;  4DEB A;  1XML A;  4MUQ A;  2XAL A;  3HL7 A;  3P7A A;  4R7H A;  2GCD A;  3CKX A;  4D9U A;  4FEQ A;  1RJB A;  1XQZ A;  2C1B A;  3W55 A;  3KCK A;  2WMW A;  4EHV A;  4QO9 A;  2H9V A;  5AR3 A;  3SXS A;  2YIW A;  1PKD A;  5JQ8 A;  2G01 A;  2VWX A;  3DB6 A;  4IJP A;  3R7V A;  3PJC A;  4HZR A;  3W2P A;  4C3P A;  4L00 A;  4E4N A;  2AC5 A;  1PXN A;  3LXP A;  4DFN A;  5AA8 A;  1Q97 A;  5FXQ A;  3N4U A;  3DV3 A;  3UOJ A;  4AA0 A;  4KRC A;  4E3C A;  2BAJ A;  2VTL A;  2WMB A;  3NYX A;  5AV1 A;  3ZM9 A; 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 2ZB1 A;  3I6U A;  4I4E A;  4LRM A;  5DG5 A;  2PMI A;  3D5U A;  4L7S A;  2WHB A;  5FGK A;  4P5Q A;  3KF7 A;  4AE6 A;  2B4S B;  2QI8 A;  3NLB A;  1KOA A;  2H34 A;  4OTF A;  2C68 A;  3FI8 A;  4QTC A;  5CF6 A;  4BGH A;  1Q62 A;  2G9X A;  3QXP A;  1H25 A;  3BGP A;  3W10 A;  3IDB A;  4QQ5 A;  4R7B A;  4DA5 A;  3MH2 A;  4XBR A;  2CGU A;  4EWQ A;  5HU9 A;  1Y6B A;  3OMV A;  4JQ8 A;  5AUX A;  1TQI A;  4QMU A;  4TYE A;  4F9A A;  3ID6 C;  2AC3 A;  3LMI A;  3DXN A;  2CGX A;  4V0G A;  4JMQ A;  3OCT A;  3HKO A;  4GUE A;  3H9O A;  3I4B A;  3MYG A;  2OJI A;  2OZO A;  4FL3 A;  4LOO A;  3FME A;  1IRK A;  3BQR A;  2SRC A;  2YAB A;  2Q83 A;  4B8M A;  4EBV A;  3R8Z A;  4AXE A;  4EUT A;  4IWP A;  5CS6 A;  4WNO A;  5J1V A;  3PIY A;  4S31 A;  4N6Y A;  4HVG A;  4EH7 A;  4MWH A;  1OIU A;  3ZON A;  4IH8 A;  4AAY A;  4DN5 A;  5KNJ A;  3K2L A;  4G34 A;  2WTI A;  3RPV A;  2BKZ A;  4TNB A;  2I0E A;  5FP6 A;  4XUF A;  4YBK A;  4FZF B;  5HG5 A;  3M11 A;  3FXW A;  4RIY A;  4FV1 A;  4M66 A;  3LFF A;  3ULZ A;  2YA9 A;  3K5U A; 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