3SQQA

Cdk2 in complex with inhibitor rc-3-96
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
298
structure length
288
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Development of highly potent and selective diaminothiazole inhibitors of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
total genus 84
structure length 288
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3sqqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3sqqA01
3R7YA 3QD3A 3E3BX 2OW3A 1QPEA 5C8MA 3TEIA 4C2WA 1RE8A 3ZC5A 2ZMDA 2VTLA 4BZOA 4PDYA 3MDYA 3QYWA 1R0EA 4YHTA 3R00A 3VS4A 1YRPA 5HQ0A 5LMAA 2C3JA 2BKZA 5AAEA 3KVWA 5E8YA 2VTRA 4FV8A 1Y6BA 3HRFA 4EQUA 3U51A 4HVIA 4ZS4A 3Q32A 4DTBA 2WQMA 2BRNA 3BLQA 4MF1A 4Y95A 4CMUA 4DGLC 1W84A 1U5RA 2YM5A 3R9NA 1PRYA 1NY3A 3PY3A 3QCXA 2W5BA 1ZXEA 2OH4A 3MY0A 5CAOA 5GJGA 3KN5A 3W8QA 4A4OA 3E3PA 3LM5A 2BDJA 3F5PA 4C38A 2O65A 5CF8A 3U54A 1WZYA 2Y7JA 3L8SA 4AT5A 4BIBA 4HJOA 4V0GA 3N4TA 4CXAA 3F2RA 4O7RA 4BDJA 4RVKA 4KIOA 4R7BA 2C6DA 2ACXA 4FTJA 4BKYA 4G6OA 4QMTA 4YBKA 2UZTA 2OICA 5AX9A 1F3MC 2UVXA 5F95A 2OI4X 1A9UA 3FXWA 4C4HA 5E91A 2OU7A 3BGZA 4O0RA 3ATSA 1H28A 4DFZE 3HRBA 2HOGA 4XRLA 4EZ3A 3SRVA 5KUPA 3PVGA 1W82A 2QHNA 2HIWA 2J90A 3T3VA 4I23A 3VBTA 4IXPA 4BCGA 1MRVA 4LQMA 2AUHA 4EYJA 3BYOA 4A9TA 4CRSA 2UZLA 3OUKA 3WZDA 3NIEA 4BDGA 4BDKA 3LW0A 4UWYA 5DOSA 2R5TA 4JX3A 2RFNA 3BEAA 4KA3A 5CU3A 4FTQA 4AE6A 4EOMA 4TTHB 4JDKA 3DZQA 2VWVA 2VO3A 4I5CA 4EZ5A 3LCKA 4FKRA 3IK3A 4BI1A 2HXQA 5J5TA 1Q99A 3PXKA 3FLSA 3MBLA 4B4LA 4LUDA 3Q4CA 3OTVA 3RVGA 4BZNA 3IONA 3KY2A 4XJ0A 5M44A 5K3YA 2FB8A 3ZFYA 2XIZA 3R7IA 1U5QA 4E93A 2BMCA 4O2PA 3ZRLA 1RW8A 2GNHA 3HRCA 4HYSA 3DJ5A 4QQJA 4YO4A 5I9VA 1P4OA 5I9YA 4YUQA 3EN7A 4QMOA 4U44A 4AN9A 4BDDA 2PTKA 3F61A 4X0MA 4WNOA 1STCE 2W5AA 3PSBA 3QX4A 5JGBA 3RP9A 4K11A 3AC5A 2IVVA 5E7RA 3OCGA 3A4PA 3FQHA 1CMKE 5FBOA 4BTMA 5M06A 4XCUA 2PVLA 2BIYA 3R30A 2HZNA 4ZY4A 2PVRA 1Q8UA 3COIA 3QZHA 1CM8A 1ZMUA 3GUBA 2W4KA 4YNOA 2WMQA 4O96A 4X2NA 2OF2A 5D11A 5AP7A 1KUTA 3GEQA 2QU5A 3W8LA 4FSMA 1XBBA 3MH3A 3G2FA 4KIKB 4ZZOA 4O91A 4QMZA 2B53A 3CJGA 2YITA 4CG8A 3GENA 4K9YA 3PP0A 1G5SA 4MQ1A 3BBWA 2C0IA 4EOIA 4ZTMA 2XK3A 4U43A 4C4IA 2EB3A 4IBMA 4EHVA 1PXPA 3I79A 4IMYA 2Y4IC 2YISA 2CKPA 5J7BA 3O8TA 5HG7A 5BVFA 4JG7A 1MQ4A 2C0TA 2W1DA 1OIRA 1BYGA 2OWBA 2YWPA 3R1SA 3TT0A 5BMSA 4IB0A 2XRWA 3UVQA 2QOOA 1QPDA 5DPVA 4IB3A 5IQHA 3C50A 1XH8A 5D9HA 3MIYA 2VU3A 2QKRA 4BBEA 3R8PA 4CKRA 1I44A 2VTNA 5L2QA 1DAWA 2BROA 4FEWA 4C4EA 4AOIA 4FSTA 4PP7A 4RVTA 2O3PA 4DBNA 4A9UA 4G34A 4BIEA 4YC6A 4ZJVA 4J8MA 2B9IA 3FZRA 4FKGA 4GIIA 1LP4A 3QQKA 3KRLA 4HZSA 3WYYA 4D5HA 3LFAA 5AX3A 5EG3A 2WHBA 1U4DA 4FVQA 2R0IA 4IAZA 4IDVA 4ZSAA 3BE9A 1O6YA 5JQ5A 3U4WA 3UPXA 3EQBA 4FE2A 2XJ2A 5CQWA 4FI1A 4RIYA 3DBFA 1XJDA 1YDSE 1NXKA 4F9AA 4F6SA 4C02A 3OW4A 3JXWA 3O50A 4L52A 2W17A 1BX6A 3OW3A 3BU3A 2OZAA 5EYCA 2GPHA 2HWOA 2JD5A 3P7CA 5AV1A 4FT9A 4JBVA 4UV0A 4XS2A 5ANEA 4G6NA 4HGLA 3RNIA 3Q60A 4RWLA 4PNKA 5EM5A 5HCYA 5IPJA 3P9JA 3IG7A 4MQ2A 4EORA 4QMSA 3L9PA 4CCUA 4FSUA 3HNGA 4CCBA 5FUTA 1XHAA 3UNKA 1R1WA 3DJ6A 4H1MA 2Q0BA 3PTGA 4ALUA 4YTCA 4GK2A 2C6MA 2BUJA 4L46A 2XUUA 5E8SA 3FXZA 4I21A 2WOTA 3S4QA 3MESA 5GIOE 4X21A 1OKZA 5LCKA 5IA2A 3ANRA 2XMYA 2R3KA 3PXRA 3BYSA 2XF0A 4PY1A 2ITZA 5IISA 4PPCA 4FIIA 4ACHA 4NWMA 3S00A 3D5WA 4U9AA 2ZAZA 3NSZA 3ZEWA 3PYYA 5EI6A 4FEXA 4NW6A 5AV2A 5CZIA 1SVHA 1YDTE 2I6LA 3D7ZA 3FSFA 5A4EA 3AD4A 3NYNA 5AIRA 5CWZA 3IDPA 5HG8A 3ZLWA 4D1XA 3UYTA 3SXFA 3K5UA 1SM2A 3HV7A 1XBCA 3GB2A 3VHEA 3O7LB 1XKKA 2BZHB 4FTNA 3CBLA 5E92A 1WAKA 3OC1A 3QYZA 4TWPA 3QUEA 5AA9A 5D7AA 4TXCA 4AU8A 2GNFA 5L2TA 4YJSA 4O81A 3EWHA 3VHKA 5J1VA 2YCRA 2CKOA 3O2MA 4H58A 4EZ7A 4HVGA 1YHWA 2EXEA 1ZYDA 2PZRA 3G0EA 4LRMA 4C35A 4YSMA 3HMNA 4GCJA 4J1RA 5K9IA 3MFSA 2XK6A 1G8SA 2R3OA 2VD5A 4R78A 5AP6A 3NRMA 5FWKK 2X2MA 4G5PA 5HNBA 4CLJA 3W2OA 2ITUA 3E63A 2JKMA 3HYHA 4EUUA 1OUKA 3G9LX 1V0OA 5HHWA 5A14A 3QA8A 4FSRA 4LOPA 3ZXTA 1U59A 3C0GA 3OCBA 1FMOE 3FMEA 4D2SA 2R0UA 2F2UA 1ZOGA 2B9HA 3GVUA 3NZ0A 5IA3A 2GDOA 2REIA 2YFXA 3FHIA 3KKVA 4I0SA 4I4EA 1V1KA 4P7EA 4PMMA 3RCJA 4JBOA 3TKUA 2YABA 4Y5QA 1WBSA 4J7BA 5I5ZA 2GFSA 5AA8A 4O7TA 4EYMA 2XM9A 4MWIA 1XH6A 3CQEA 4IAFA 2XYUA 1KE8A 2XYNA 3E93A 4FV5A 4EH7A 3UQFA 5HEZA 5BVNA 4ENYA 3G6HA 3CD8A 4CNHA 3MH1A 3P0MA 2G2HA 3EQIA 3UE4A 3ORXA 1BUHA 3ORIA 2VWWA 2ZMCA 2HWPA 2I0YA 2X4ZA 4WBBB 5DIAA 3PLSA 4FNWA 4KABA 1GOLA 4I5PA 3V6SA 2H8HA 2F7ZE 5H2UA 3UNJA 2R3MA 5EHOA 3UVPA 4GS6A 3Q5IA 3NYVA 4RWKA 4WHZA 5BVDA 5IQBA 4KB8A 5TR6A 5HIEA 2QNJA 2GSFA 1OIYA 5TE0A 1AGWA 2PMLX 4QTCA 3WF9A 2A2AA 4RG0A 4O27B 1Q8WA 4RIYB 4W8DA 3ZONA 4DG0E 4KBKA 3QRIA 3D94A 5K5XA 2JDRA 1SVGA 3B8RA 2WEIA 3IW5A 4FT3A 4ZJJA 4A4LA 4YLLA 3K5VA 2UV2A 2ZM3A 3OD6X 4I1ZA 4XG8A 3VS7A 5DVRA 2B52A 3ORTA 5FEQA 2YLFA 4EQMA 2YHVA 3T3UA 2OZAB 3PJ8A 4EK4A 2FYSA 2BTRA 2CMWA 2VTIA 3VC4A 4BBMA 2PE1A 4LFIA 2BRGA 1PXOA 4V04A 5HVJA 2WMUA 5C8KA 3BCEA 4AZTA 4IM2A 1GZKA 4G3CA 3NNVA 3VIDA 4RFMA 4FL2A 4DTKA 4Y85A 4WO5A 3PRIA 3MVJA 5ANGA 1OVEA 3HV4A 2YDIA 5EHYA 3VBVA 4ASXA 2YLEA 3IW4A 2GS2A 3MGYA 3TNQB 5B7VA 3O23A 2ZVAA 4D9TA 5KZIA 3NUYA 3QXOA 3G0FA 3KXGA 1M14A 3BYVA 1MUOA 4E3CA 2PVNA 2W1CA 3RHKA 3RINA 4E5BA 3UYSA 3NR9A 4F7JA 5IEYA 3VWAA 2UVYA 3V5WA 4FKLA 4UXQA 4NSTA 2I1MA 4L00A 4WUNA 2CNQA 4ALWA 1H26A 5AMNA 5CSHA 4XOZA 1YHSA 2IZRA 2VN9A 3PJ2A 2QO2A 3BEGA 4XP3A 2FSOX 5CSXA 4FUYA 2QLUA 2FGIA 3RM6A 1YQJA 3V8SA 4XG7A 3OHTA 3TV6A 5BNJA 2J4ZA 4MCVA 4FK6A 4QPAA 2G2FA 3FE3A 3VNTA 4QMWA 4AACA 2QOIA 3KMUA 2BPMA 3WOWA 4I3ZA 4ACGA 1VZOA 4AG8A 5KHWA 1WVXA 2UZEA 2YIYA 5HIBA 2ETRA 5DWRA 3LJ0A 4EKLA 3CIKA 5DN3A 1W98A 3VUTA 2NRUA 2PHKA 4RC4A 3LCOA 4XRJA 5IH6A 4FC0A 3WZJA 4BDIA 3KXNA 5HZNA 5C9CA 5KMIA 4MKCA 2G1TA 3BU6A 2HZ0A 5I3OA 4WIHA 4PL5A 4DFNA 4DE4A 2QG7A 3KA0A 2WNTA 3LQ8A 2O8YA 3C5UA 3FMJA 2B1PA 1W0XC 4OTFA 5HBHA 4ANOA 5KBQA 4G31A 4QYGA 4W4XA 1HCKA 4H05A 4EQCA 3KMMA 2WMRA 4PV0A 2Z8CA 3NVMB 3D83A 1M7QA 3NYOA 4JVGA 4NFNA 5KMMA 1SMHA 4YNEA 3WE8A 1JWHA 3DLZA 3Q3BA 4FKTA 3H0YA 2CJMA 4KINA 4UN0C 3QRJA 4NJDA 3TZ8A 3Q52A 3SKCA 5FM2A 5L8LA 2WEVA 3OBJA 4CFMA 2CGXA 4ANSA 2J9MA 5F9EA 4FV9A 2BTSA 3C7QA 2QQ7A 4CTCA 2XVDA 3C1XA 3IW6A 4CFFA 1KV2A 4BKJA 3Q4ZA 2V62A 3ZM4A 4QMNA 4DT9A 3CKXA 2BAJA 3MB7A 3E7VA 4C4GA 2RGPA 2FVDA 4YURA 3ENHA 4BRXA 1TQIA 4LV8A 5AV3A 5HTBA 1FINA 3QD4A 5AUYA 2E9NA 3DKGA 3KEXA 5HCZA 4GL9A 4YO6A 4M69A 5D7VA 2Z2WA 3EFJA 2PVHA 4BI0A 2WO6A 4CRLA 1WBOA 3CQWA 4HGEA 1L8TA 2NNWB 4GVAA 3KXXA 2PL0A 1K2PA 3DTWA 3AXWA 2W0JA 4MXZA 3HEGA 4AN3A 4LL5A 3TV7A 4UMQA 4U80A 3T9IA 4R1VA 3U8WA 4F7LA 3NYXA 3EKKA 3EJ1A 2W1IA 4GFGA 4X2JA 2XJ1A 5KZ0A 4PMTA 4CFVA 4CFUA 1GNGA 1OZ1A 3DA6A 3VRZA 1UU7A 3C4FA 5JT2A 4E20A 2BCJA 4M0YA 2W4JA 3TNIA 3OZ6A 4HVDA 5HORA 2WFYA 2WGJA 2W05A 1UU8A 4I4FA 5IA5A 4RIXA 5AP3A 3NUXA 3HAVA 3Q2JA 3UQCA 3P08A 5ETFA 5E8WA 3AC8A 3UO4A 2OIDA 2QO7A 4FUXA 4ZSLA 2ERZE 1H1QA 3AD5A 4BCPA 3QRUA 3PA3A 1BKXA 5JFXA 5AIKA 4MVFA 3CTJA 4FNXA 5FTQA 4ASEA 3U55A 3BBTB 4RSSA 3ORMA 3GQIA 1PMVA 3BHTA 3I6UA 2XM8A 4QT1A 5HI2A 1R0PA 2NP8A 3Q4UA 3VW6A 3ZOSA 2NRYA 5D41A 3UJGA 3PXYA 4DCAA 3CE3A 4E4LA 3QLGA 1WBNA 1ZWSA 3EZVA 5ETCA 2ITVA 2GNJA 3EQPA 2ERKA 4S31A 4CLIA 4LM5A 4FEVA 3HV3A 2OSCA 3RWQA 4L42A 3Q5ZA 5ACBC 3PP1A 5A46A 4TRLA 5CAUA 4XP0A 5JQ8A 2VTQA 2I40A 4U45A 3MV5A 3RZBA 2JBPA 5AV0A 4O0WA 2ZM1A 4ASDA 3SG8A 3R7GA 1FGKA 2W1FA 3Q04A 3KC3A 2C6EA 5TT7A 2OK1A 3MTFA 4BCOA 5GIPE 1VYZA 4AFJA 3GBZA 4S30A 3NUNA 3UMWA 4J95A 3CKWA 2VWZA 2XKEA 4RQKA 3QTZA 4WA9A 4XUFA 4I6HA 2VWYA 2C5NA 2WD1A 3Q6WA 3KRRA 2JKQA 3QTRA 2ONLA 4QQCA 4U97A 2J0MB 2X39A 4D2WA 2CDZA 3MWUA 3LXLA 3OEZA 4JDJA 3RPSA 4JRNA 4FIEA 2GFCA 4K2RA 4YZDA 3ANQA 3QQUA 4PMSA 1B6CB 2O64A 3MY1A 4TKSA 3KU2A 2OXDA 4PRJA 3TV4A 3VVHA 4BKZA 4DH1A 3RCDA 2HW7A 4AX8A 3HGKA 3NWWA 4EHEA 2JKOA 3DCVA 3H9RA 3ELJA 1E9HA 3PY1A 4LMUA 4KS8A 2NO3A 3LJ2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3HVC A;  1VJY A;  4B99 A;  3QZF A;  4FKQ A;  5HIC A;  3JS2 A;  4MNE A;  4YJP A;  4O0S A;  4EK5 A;  1REK A;  4RIO A;  2W5H A;  2X9F A;  4UYA A;  2BR1 A;  5KX8 A;  3ALO A;  3QL8 A;  3HMP A;  3O8U A;  3V5P A;  2XH5 A;  4AOT A;  4AQC A;  4V01 A;  1E1V A;  5F94 A;  3OWP A;  4TNB A;  3R8Z A;  3VUH A;  4WRG A;  4B8M A;  4RMZ A;  4EJ7 A;  3COH A;  4J97 A;  4WRS A;  4CD0 A;  3PPZ A;  5DE2 A;  3JVS A;  1JKT A;  3LQ3 A;  4OTW A;  2X7G A;  4R77 A;  1GIJ A;  4ZZM A;  2HEL A;  4C4F A;  4F0F A;  2BFX A;  4PUZ A;  3OOG A;  4I92 A;  5M07 A;  4D5K A;  3OFM A;  3F3W A;  3D7T B;  2CLQ A;  4IJ9 A;  3ZUV A;  2XCH A;  3GC9 A;  5L6W L;  3R2B A;  3A7I A;  4O83 A;  4NKS A;  4JNW A;  3LE6 A;  4GUE A;  4U5J A;  5EFQ A;  4CMT A;  2UZV A;  3BEL A;  3AKJ A;  2CGV A;  2IZU A;  2XJ0 A;  4EOS A;  3MFT A;  3ORZ A;  4FKV A;  2XNO A;  3RAK A;  4FKU A;  4KIQ A;  4MTA A;  4RFY A;  4BGG A;  1HCL A;  3DT1 A;  4DHF A;  4I6B A;  5IA1 A;  2OXX A;  3R9H A;  4E6A A;  3DAE A;  4P4C A;  4QP4 A;  2WAJ A;  1MRU A;  3HDN A;  4DDG A;  5JKG A; 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