4AE9A

Structure and function of the human sperm-specific isoform of protein kinase a (pka) catalytic subunit c alpha 2
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
339
structure length
321
Chain Sequence
SSDVKEFLAKAKEDFLKKWESPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHKETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure and Function of the Human Sperm-Specific Isoform of Protein Kinase a (Pka) Catalytic Subunit Calpha2
pubmed doi rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA
total genus 94
structure length 321
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ae9A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ae9A02
4LV8A 2UUEA 4BYIA 1ZYCA 2VTMA 4EOLA 3NCZA 2C1AA 3E93A 3Q53A 2JIUA 3A7FA 4ALUA 3FKNA 5CEIA 1CSNA 3OOMA 4LRJA 4MF0A 5M4UA 4YO4A 1V0OA 1Q8TA 5IQEA 3HDMA 5HTIA 3CE3A 4YPSA 3CBLA 4IM0A 4O0YA 3RK5A 3A62A 5A54A 4P4CA 4E5WA 4F7JA 3AC5A 1W0XC 2W1ZA 4FKSA 2FVDA 3MN3A 3KRLA 4EONA 5HNIX 3TDVA 3OWPA 4ZY5A 2R3NA 1MP8A 3KK9A 2JDRA 3AC4A 2PMOX 2WOTA 2XIZA 3EN7A 3MJ1A 4N70A 3RAKA 2JDTA 1M2RA 4J1RA 5DVRA 5ANOA 5EYMA 3ZFYA 4Q9ZA 3DBQA 3ULIA 4Y5HA 4DAWA 4D28A 5E4HA 3NW7A 5KMMA 4XV9A 4E26A 3QWKA 2X2KA 5IDPA 5E8TA 4Q9SA 3VS3A 5CAOA 5JKGA 4AZVA 4CTBA 3PRFA 4G16A 2GCDA 3G51A 4AW2A 3CY3A 2UW0A 1QCFA 4NTSA 1YDRE 3A8WA 2XKFA 4FTKA 4PMSA 5HD4A 4GW8A 5DEWA 4FVPA 4MF1A 2W1DA 3ORNA 4ZS0A 2BVAA 3R8UA 3TN8A 3R73A 4AE9A 4ZLZA 3Q04A 3QLGA 3F61A 5BUJA 3LKMA 4BGQA 2GNIA 4OT6A 2QOQA 3NNWA 4TTHB 3SRVB 1KE5A 5EDRA 2IG7A 5T68A 1ZYSA 4RX5A 2BILB 4NFNA 3C4XA 2P4IA 3HKOA 4M97A 4CXAA 5AEPA 3BV2A 3AGMA 2QO7A 4C35A 2W1IA 1M17A 2G1TA 1UVRA 1S9JA 2F7EE 3ENHA 4G3GA 4JG7A 3RHXA 3TKIA 5T3QA 3TJDA 5AV0A 3MVLA 4EQMA 4RA4A 1Y8GA 2ITQA 5CZHA 4B0GA 3UOHA 3UO5A 3N4VA 3V8WA 5HE0A 2Q0NA 4EJ7A 4BI2A 5H9BA 3Q3BA 2HZIA 4FTQA 4ITJA 3REPA 1OKZA 4MEDA 3KF4A 4FT0A 3IW5A 4AFJA 2HWPA 4BFMA 3IW7A 1GOLA 3D7ZA 5AV4A 3FYJX 3HRCA 5AX9A 2OO8X 2IPXA 5HIBA 3R7IA 4MXXA 3R9OA 3QD3A 4AGDA 3LLTA 3WIKA 1A06A 4O7NA 2WMXA 1IAHA 3QAME 4XP0A 4XV1A 5AUUA 4I0RA 3MSSA 1K2PA 2GPHA 3VS4A 3C51A 3TUDA 4DTKA 4HYUA 4QT1A 4FKUA 4M14A 2UVXA 3FMJA 4RIYA 3E62A 3UOLA 2W5HA 4AX8A 4EK5A 5EHLA 3TKHA 4DA5A 3I79A 5J9ZA 4DEDA 2R3KA 1L8TA 3DXQA 1OL6A 3V5LA 2VTQA 2HY0A 4IX4A 1WMKA 3WI6A 2VNYA 3RAWA 2PK9A 1GNGA 2J5FA 3UGCA 2O0UA 2OJJA 4FKTA 3ZSHA 1AGWA 3FLYA 4NCTA 4I5CA 2QG7A 2ITXA 4KINA 4MQ1A 4WG5A 4R77A 4C4FA 5H8GA 3F5XA 3NIEA 4AACA 3RHKA 2BR1A 4RQVA 4YC8A 3F7ZA 3CTQA 4PF4A 2X7GA 5AM6A 1LR4A 3FQSA 4RZVA 4F1TA 3C13A 4AN3A 5EQEA 4FL2A 5J9LA 4BGHA 2CMWA 5HKMA 1U4DA 2UZEA 2WMWA 3QKKA 5JSMA 1JKKA 2OF2A 4BC6A 5IMEA 2EUFB 2NO3A 4FC0A 4LUEA 2WPAA 3TG1A 5LQFA 1RQQA 4GKHA 1FGIA 1G5SA 2WQOA 1XBBA 3MFTA 1V1KA 3EZRA 4TKSA 4FE2A 5CEOA 3F5PA 2F9GA 2RFNA 2UZBA 3QUPA 3BWFA 2QOIA 3DK7A 2R7IA 4PP7A 4H36A 1GZOA 5IUHA 1PYXA 4FZAB 3LQ5A 4FTRA 2YACA 4DG3E 4IHPA 5DN3A 4C2WA 2PUPA 2GDOA 3P23A 5BVWA 4QQCA 3NUUA 3VO3A 2PPQA 2C5YA 4NUSA 5BVEA 5IISA 3R22A 3SC1A 1ZXEA 2VTLA 3EL8A 2XNBA 4BDEA 4QP8A 3FPMA 5EDQA 4UMUA 4I22A 5CQWA 3TACA 2OXXA 3RPVA 3N4UA 1RDQE 3G2FA 1GZ8A 3C0IA 3MJ2A 5CSVA 4PPCA 2VWIA 4IAKA 2JD5A 3ZO1A 3EQBA 1OM1A 1DM2A 1IRKA 2UVZA 5CXHA 5AV1A 2J5EA 3R83A 3AQVA 4W8DA 1SMHA 4AP7A 4P5ZA 3NVKI 3NPCA 4F64A 1TQIA 3KEXA 3F88A 5M55A 1WVYA 2UZDA 5E7RA 4U41A 3V01A 3E8DA 3BBTB 1HOWA 4LUDA 4YNOA 4HPTE 3GFWA 1MQBA 2VTSA 3EOCA 2O3PA 4GS6A 4FKOA 4EYJA 1P4FA 3JPVA 3P08A 4IZ5A 4CVAA 4WSYA 2WTKB 4FTOA 3NYVA 3ZRMA 3D5WA 2H8HA 2PUUA 3JS2A 2R3RA 3BEAA 3NEWA 5AJQA 5ICPA 3DPKA 4FICA 3GENA 2ZV8A 3LJ0A 3OC1A 1VJYA 3C4ZA 4E5BA 4YURA 2IVVA 3SVVA 3ZUVA 3UYTA 5CF6A 4LOPA 3VBTA 1K9AA 2C3KA 2C5VA 4JRNA 3I5ZA 1OBDA 4C3RA 4A4LA 5E8YA 4DH7A 3OOGA 4S32A 5FQDC 5IA5A 4AXAA 3MI9A 4GJ3A 4IACA 1YQJA 4QPSA 2B55A 3R04A 4M13A 4FTTA 3LM5A 5CI6A 4EH4A 1LP4A 3FZ1A 1LEWA 5HD7A 4MKCA 4D2TA 2BCJA 5AV3A 4A06A 4K77A 4LYNA 3NZ0A 3Q9XA 4XBRA 3ROYA 3WF5A 1WZYA 2UV2A 5AR2A 1KOAA 3OWKA 4FT5A 4QMWA 3ZC5A 2HK5A 3Q4CA 3GU7A 4DFNA 1SNXA 1YHVA 4GT5A 3ZDUA 3WZJA 4ZTLA 4FYNA 4RX7A 1KV2A 1NXKA 4BN1A 4E93A 1YI4A 2YM8A 5J5SA 4FNWA 1YHWA 1ZOEA 5DG5A 4QP3A 3BHYA 3QD2B 4CFWA 2BDFA 2XJ0A 3QRUA 1QPJA 5KNJA 3QU0A 4FSTA 3KC3A 3GU4A 4L53A 4XUFA 2XK7A 5FXRA 2VTNA 4U43A 3VS1A 4MTAA 2R9SA 5D1JA 3UPZA 4XG2A 5AA8A 5KMJA 5IQHA 2VTTA 3K3JA 3QC9A 5K0KA 2VTOA 5HORA 4RA5A 2Z7LA 3QTWA 5CSPA 4TT7A 2P2HA 4X3FA 4FKVA 5CZIA 5I9XA 2PUIA 5DT0A 5E8SA 2QHMA 4RJ3A 3FLSA 1E1VA 4PMTA 4FKRA 4GFGA 4F1MA 2WQBA 3LW0A 1XO2B 4L00A 4J52A 4GYIA 3BLQA 3NGAA 2VTRA 2ZV2A 4DFLA 4HJOA 2BFXA 4WNKA 3S4QA 3KRRA 4F63A 4Z55A 4TRLA 4YHTA 1O9UA 3SXFA 5TR6A 5I9WA 3QRKA 3W2QA 4I21A 5GINE 2XYNA 3FI8A 3H3CA 3Q6WA 2UW4A 4P2KA 2QKWB 2A4LA 3QYZA 4M66A 3WILA 3EYGA 5JGBA 4BDGA 2NRYA 4LQMA 4TYGA 3FZTA 4EQCA 2VUWA 4QP1A 3P78A 3BCEA 2FA2A 4FVQA 3DK6A 4HNFA 1J1BA 3MIYA 1JWHA 3A61A 3KB7A 3ZUTA 4ANLA 2PMNX 1CKIA 4F99A 4WHZA 1NVSA 5LVPA 2GTMA 4Y5QA 5CU2A 4JL9A 4UXQA 5KKRC 4Q2AA 3GC9A 4FT7A 4IFGA 4L46A 4IVDA 4F6SA 1YOLA 2WU7A 5GHVA 1SNUA 4ANOA 5F9EA 4YC6A 2VWBA 3ZMMA 4BBMA 3BGQA 2C30A 4D1SA 2PZPA 2V55A 3VHKA 3HYHA 4EOJA 5GIPE 4CV9A 1OIUA 3TT0A 4C4GA 5GJGA 5HCZA 3BLHA 1GY3A 3SKCA 2CNQA 5KZ0A 4WNOA 2WFYA 3DAEA 2PVLA 4FSMA 3KRJA 3EYHA 3RPSA 1DAWA 3KVXA 4DC2A 1H1SA 2CHLA 3TIYA 5ITAA 3QHRA 4CFUA 5E8XA 4UBAA 1OMWA 4EORA 3QBNA 2VTHA 1UU7A 2ZDTA 1JKTA 2XB7A 3A60A 4DN5A 3ZO2A 2JFMA 1QMZA 4APPA 4GIHA 3H9RA 3ZCLA 3RBWA 3QTZA 2BUJA 5LVMA 4LOOA 2W4OA 4JNWA 2DUVA 2Z2WA 3FMDA 5AP3A 2B53A 2RSVA 3QLFA 1DS5A 4I94A 3QXPA 2PVNA 2XNNA 4PQNA 3FV8A 3NNXA 5HIDA 5IQIA 4U45A 1VZOA 1PKGA 1JQHA 3CCNA 3OUNB 5JH6A 4ACMA 5AR7A 2Y6MA 3EL7A 3MB6A 4M15A 5EFQA 2P33A 4D4RA 5JK3A 3DNEA 2J0KA 3SHEA 4KNBA 1FOTA 3MGYA 4ZJVA 3HP2A 5CNOA 4FL3A 2WQNA 1OB3A 5D9HA 2OBJA 3DQWA 3ZZEA 4EZ5A 3FMHA 1H24A 4MXOA 3SLSA 3SG9A 5HZNA 4IQ6A 5AIRA 3ORXA 1XHAA 2YM3A 3JR1A 4IEBA 3TV7A 4EK8A 5CF8A 4PPBA 3ALNA 3QGYA 3GCSA 3DY7A 1VEBA 3MDYA 3O96A 5BVNA 4LL5A 3TNHA 1U5QA 3TNIA 3OUKA 2YDJA 2ZDUA 5A4TA 3R7GA 3FMKA 2WELA 3LCOA 3PIZA 4IB1A 3Q9YA 5BUEA 2CNVA 3U4WA 4FKQA 4QQ5A 3A4PA 1SVGA 2W9FB 1OZ1A 1Q8UA 1NVQA 3ERKA 3QQUA 4L01A 4BCFA 2E9PA 3W8QA 2HY81 2GU8A 3H0YA 4C4EA 3UDBA 4QMSA 4FTUA 4B8LA 2I0YA 3VC4A 2RKUA 5H2UA 3UTOA 4PP9A 5JT2A 3GCQA 4FIHA 3N4TA 3FXZA 5DIAA 2HIWA 2UW6A 2VTIA 3GCPA 4FTAA 3W2OA 2VGPA 2GNGA 3R8MA 4W9XA 4QRCA 4PL4A 2VTJA 4G34A 3EFKA 2WKMA 3QWJA 4PTEA 4UMPA 4IX6A 4QYYA 1SVEA 3T9IA 3OF0A 4TW9A 3NNVA 3D14A 1AD5A 4JQ8A 5AWMA 4R7BA 4IAZA 3U9NA 5HU9A 4OW8A 4AZEA 2YITA 3QRJA 4R5SA 4C3PA 4R78A 3IDBA 3AMAA 4OTPA 4FV2A 4XV3A 5EKOA 2B1PA 5J1WA 2GQRA 1W84A 5AAFA 4FVRA 2JITA 4HOKA 4RQKA 4IC7A 4ZLYA 1CKJA 4XCUA 4DT9A 1ZOHA 2BAJA 3VUKA 4DEHA 4WRSA 4E1ZA 2EXCX 4BWKA 4O7SA 3SOCA 4BICA 2LGCA 3CKXA 3MV5A 3CP9A 3BYVA 3THBA 2BHEA 4YPDA 2ETMA 4CSVA 1ZY4A 4BTKA 4FSNA 3VUDA 3ZLSA 3GU8A 2HELA 4NK9A 4MK0A 2BDJA 4JI9A 1ND4A 3IW8A 3L8VA 4EH2A 4M84A 3KRXA 3F3VA 2BRMA 5EHOA 3E7OA 2XK3A 4C34A 3ZRLA 3M1SA 1YXTA 2B9JA 4U79A 1YDTE 3W2CA 4PTCA 4U40A 5CY3A 1DAYA 3NNUA 2I0VA 5B2KA 5J5TA 4FUYA 5GJFA 3P5KA 4FGBA 3COKA 4JG8A 4QTAA 1GAGA 3QCQA 3ANQA 2X4ZA 4FIGA 2X39A 5E92A 3VS6A 4BCJA 2J51A 2JBPA 4J7BA 3GC8A 3E87A 4KRDA 4EUUA 3QQGA 4RIYB 5FLFA 3FL5A 3O0GA 4DFBA 4GJ2A 3DKOA 5DLSA 5A4LA 3R1YA 1X8BA 4FI1A 3U4UA 2QVSE 4F0FA 2LAVA 4J53A 2DYLA 4FIEA 3EN9A 5LARA 4AOTA 4BI1A 4JXFA 4E20A 3VIDA 3P79A 4ITIA 3QZIA 2J90A 2OH0E 3F69A 1KE8A 3D4QA 2BFYA 3VUHA 3MS9A 2R64A 1ZMVA 1CTPE 4IDTA 2XEZA 5CSWA 5CEMA 4KUJA 1S9IA 3GXLA 5CX9A 4MXAA 4YJRA 3V6RA 3VS0A 3KQ7A 4X3JA 4FTNA 4FBXA 3E8EA 3H4JA 5CNNA 1HCKA 4FNZA 1ZY5A 5JFXA 3B8RA 3PVUA 1YWVA 3U6JA 4Q5HA 1OPJA 3CTHA 4O0XA 1NY3A 4JR3A 2QCSA 1XBCA 3VHEA 3GT8A 3D9VA 5I3OA 1U59A 3HVCA 3FBVA 3JXWA 4K18A 3QYWA 3K5UA 3RPOA 3PWYA 4RWJA 3COHA 1YXSA 4GH2A 4ANNA 4MBJA 4RIXB 4O7YA 4PV0A 4JIKA 4G3EA 3MTFA 2O64A 2VX1A 4TWOA 5EG3A 4HVSA 3Q5IA 3NWWA 1PY5A 3BIZA 4GT3A 5HESA 4DG0E 3QGWA 1XH5A 5HTCA 2EXEA 4O0UA 2ZB1A 1ZLTA 4TYHA 4ENYA 1ZWSA 4ASXA 3PG1A 4O7WA 3PA5A 3UNJA 4Y73A 1J7LA 1Z9XA 4FSQA 3ZUUA 2YWVA 2ZB0A 3DGKA 4CGAA 1UA2A 2CGUA 2R7BA 2CPKE 3OY3A 4RBLA 5FP6A 3RMFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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