5K4IA

Crystal structure of erk2 in complex with compound 22
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
350
structure length
336
Chain Sequence
AGPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADTRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of (S)-1-(1-(4-Chloro-3-fluorophenyl)-2-hydroxyethyl)-4-(2-((1-methyl-1H-pyrazol-5-yl)amino)pyrimidin-4-yl)pyridin-2(1H)-one (GDC-0994), an Extracellular Signal-Regulated Kinase 1/2 (ERK1/2) Inhibitor in Early Clinical Development.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
total genus 116
structure length 336
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2016-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5k4iA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5k4iA01
4EH5A 3GU6A 3UMXA 3IOPA 1FMKA 4D2TA 4MF1A 4HVIA 4DFUA 2C47A 3QLGA 5KMLA 1R3CA 5HO8A 4BDBA 3ZLXA 4DCEA 3EMGA 2XIZA 4YJSA 2IVTA 5DWRA 3ZSIA 1OBGA 4IVDA 2KTYA 3V04A 4N0SA 4AA5A 3R2BA 3QRKA 2W0JA 2EVAA 2FSLX 1U59A 2RSVA 4GJ2A 3BPRA 2BVAA 3D7TB 5HNBA 3H10A 2R3QA 4PMTA 5HCYA 1A06A 3QZGA 4IX5A 2XK3A 2G15A 3RPSA 2GS6A 5AV2A 4AGWA 4K8AA 4D9UA 1UWJA 4F9CA 5LVLA 4M14A 4EHZA 4E5AX 5ITAA 3WOWA 4FKQA 3UOHA 2QI8A 3NUYA 4C33A 4NM0A 3IECA 5DA3A 4IVBA 4JRNA 3BGQA 4L67A 2ZV7A 4N70A 4U7ZA 3SLSA 3H4JA 4QRCA 3ID6C 3UQGA 1I09A 5EQEA 5EH0A 2OIQA 4BF2A 5AR5A 4C02A 3BQRA 2X0GA 4K1BA 3RHXA 4C62A 2VAGA 3MTFA 4IFCA 4QPMA 4R7BA 5I9XA 3F9NA 4HYSA 3UBDA 4AG8A 4K0YA 3OFMA 1HCKA 4O0VA 2ITYA 3V5PA 3R7VA 3ZUVA 2Z7LA 2FGIA 4BZNA 1H24A 2I6LA 5DR9A 1WBSA 3AT2A 3R6XA 4JX7A 4WRGA 4LGGA 4F99A 4NSTA 4EOOA 4IDTA 2VX0A 4XNEA 4OBOA 5AX3A 4OUCA 1R0PA 1LR4A 2OK1A 2YDIA 2JIUA 4Q9SA 5C03A 2BROA 3A60A 4RLKA 2BKKA 4XG8A 4E93A 3BHHA 2BTSA 5GZAA 3IO7A 4D2SA 3UGCA 3SRVB 4UZDA 2EUFB 5DMZA 3CGFA 4OTPA 5CAPA 2UZNA 5AUTA 4GG7A 1DI9A 4DEAA 3WARA 4OAVB 5C4LA 4O0RA 4D4VA 4YZ9A 4IIRA 4DHFA 4AX8A 4DG3E 4TWNA 3ZYAA 4HCUA 3KVWA 2XNEA 1H25A 2Z8CA 2JKOA 3PSBA 3Q6UA 4RQKA 4ZJVA 4Q2AA 2IPXA 4FEWA 3TXOA 3CQEA 5D12A 4F6UA 2EXCX 1OVEA 3RBWA 3U8WA 4ZMEA 3QWKA 4ZK5A 2HWPA 2QVSE 3U4WA 2C4GA 3VQHA 4FL2A 3BYOA 3QC4A 4M12A 5I9YA 2YM6A 2QOLA 2BIYA 5F4NA 2RG5A 4ORKA 4U41A 3Q2JA 1Q61A 1IR3A 2AYPA 3FI8A 1PMUA 1SVGA 2J7TA 4MYGA 4FSWA 4U8ZA 2QR7A 3OWLA 3IG7A 4LV5A 4F6WA 4NCTA 4X2GA 1JAMA 4XBUA 4MNEB 4BI2A 3R9HA 4BBEA 3D83A 5TKDA 3T9IA 5HE2A 4UWYA 4IFGA 4FV6A 4WNKA 2YIYA 4FUYA 4OW8A 4FTCA 4ZSGA 3FC1X 4DAWA 5K5NA 1NXKA 4ONAA 1XBCA 3S0OA 4BN1A 3ORPA 3R8UA 3GCPA 3CE3A 4L52A 3C5IA 1J1CA 5BVEA 4C57A 5E1SA 4HCTA 1OM1A 3PXFA 3KMWA 3BELA 3O96A 1UA2A 3FHIA 4S34A 3TJCA 1XKKA 2UW4A 2ITOA 2UVYA 3W32A 3EL7A 1O6YA 2YM4A 3QTSA 4D1SA 3MFRA 3COHA 2ITUA 4TT7A 3RZFA 1PMVA 2Z02A 4QYHA 4M0YA 5IQCA 1DI8A 5BVKA 3Q3BA 1CTPE 2JGZA 1SZMA 3DS6A 4XLIA 5F94A 3ZZWA 3PXRA 5C1QB 5LARA 1PMNA 4ZSJA 1RJBA 1K2PA 3VJOA 3VS4A 4M8TA 5CTPA 2OBJA 2AC3A 3R2YA 4AA0A 5CF5A 4PPAA 5LCJA 2YJSA 5M4UA 4S33A 2O8YA 1WBOA 4IVCA 3LAUA 2PTKA 3QYWA 4EUUA 1YQJA 2E9PA 4Y5QA 5K4JA 1P4OA 1PF8A 4ZP5A 1WBVA 1Q41A 4BFMA 4I6BA 3CR0A 5T68A 3ODYX 4NFMA 2WELA 2WMRA 4XJ0A 5IA5A 5IKWA 2QOOA 2QD9A 4PV0A 3CC6A 4F7SA 3Q4ZA 4R6VA 3RM7A 5CVHA 3DK6A 3ROCA 2ZV9A 3PSDA 4FT0A 4W4VA 2JIIA 2BTRA 4L46A 2WIHA 4DT8A 3KRJA 3D2IA 2B4SB 4C2VA 2B54A 2PE2A 3VUTA 4RX5A 3A62A 2XJ2A 1PXMA 3EWHA 4NU1A 2H8HA 3GC8A 4AW1A 5A6NA 3UZTA 2FSOX 3CIKA 3G6HA 4MKCA 1PXNA 4WUAA 5EM5A 5AUVA 3TT0A 5DH3A 1FMOE 4FF8A 4IANA 4RG0A 5HBJA 5M4IA 4JBOA 4AQCA 5BYLA 4FTNA 5FTQA 5F95A 1M2QA 1P5EA 3DAEA 4FR4A 4YPDA 4D2WA 2XRUA 2XVDA 4RJ7A 2YIRA 3Q9WA 4IX4A 4U42A 4QMZA 2JDVA 1UWHA 2OXYA 5AA9A 4LRMA 4R5SA 3HV7A 2J0KA 5DR6A 2R3OA 1ZAOA 2ZMCA 4IAKA 5HORA 3OY1A 4RIXA 4B4LA 2BFXA 3NSZA 4AT5A 2P33A 2V55A 3LXLA 4K33A 2G2FA 2OGVA 2RFSA 4FZ6A 2XYNA 4UXQA 3A4PA 2VTRA 4IADA 5ANEA 2W1HA 5AR4A 1CM8A 3S95A 4DH3A 1XQZA 1ZMUA 1UU7A 4FSTA 4QP8A 3E64A 3FYKX 1CKPA 2HELA 2XK8A 3ZFXA 5TF9A 3JUHA 5M4FA 5KX8A 1B6CB 3HX4A 1FGKA 4CYJA 3NUUA 5A14A 3NYNA 2VTQA 2W9ZB 5E4HA 3FQEA 2X2LA 3P7BA 3DK3A 4OBQA 4EJNA 2XH5A 3PG3A 1O6KA 1Q8WA 4FX3A 3IGGA 3ORLA 5H8GA 4AFJA 4FVQA 4YTIA 3EFJA 1LPUA 2I0HA 3KK8A 3QCYA 4QD6A 4I0TA 5EM7A 2J2IB 3Q9XA 5HG8A 4D2VA 5IH4A 4V01A 1YXSA 5M07A 3V8TA 4ZTHA 3W1FA 5CYIA 4KNBA 2PYWA 3KXNA 5J9ZA 4EH7A 4F1MA 3OTVA 5FDXA 3OF0A 3ERKA 4FIEA 4BCMA 5CASA 2HY81 1ZY4A 4NJDA 3V5TA 5L3AA 3FSFA 2YA9A 5CT7A 5HG5A 1H00A 4IE9A 1DAWA 4ZZOA 3W2RA 4JR7A 4DFNA 4EOQA 5T3QA 3UDBA 5CEQA 3RPRA 5C9CA 4QOXA 1WMKA 3A2CA 4IEBA 3D94A 5KHWA 4IAZA 3E62A 1SYKA 2X1NA 4C4EA 2XEYA 2HK5A 2Q0BA 2GFSA 2ITVA 3SW7A 1AGWA 4WT6A 4Y73A 4EHVA 2Y6MA 3DKOA 4IAFA 4G6OA 5EYDA 2OH4A 4O2ZA 4F70A 5CSHA 4IX3A 5K3YA 3R8LA 4BYJA 5AFVA 3ZU7A 5CEKA 3NNWA 1APME 1ZARA 4D58A 3DV3A 4FKRA 4ENYA 4S32A 4FTTA 1XHAA 4DE4A 3QF9A 4I23A 5EK7A 4BCHA 4O1PA 2XM8A 4UY9A 4BIBA 4G3FA 1UKHA 3VUIA 4GT5A 5HNIX 2W1FA 5I4NA 4I6QA 2IG7A 4UMTA 4PL4A 3ZFYA 1PKDA 2YM3A 4FICA 4OT6A 1YHWA 5GZ9A 4YTCA 5AP1A 1YHSA 2R2PA 3KF7A 4CZYB 4DCAA 1KV2A 3G6GA 3NYXA 3QYZA 1CSNA 2F7ZE 5E9EA 4XHKB 4ANQA 5CNOA 3QD3A 3ALOA 2O64A 3L9LA 4ACGA 4EOJA 2VTSA 4XRLA 5IISA 2ZM1A 3TV4A 3VIDA 2XBAA 3OEFX 3ORKA 2C0OA 2V0DA 2F57A 4KRCA 4DH8A 3SOCA 3IQ7A 3NW7A 4FKTA 3AT4A 2IW8A 4YZNA 5JFSA 2C1AA 4DA5A 3K3IA 3QLFA 4HOKA 5E7RA 3C51A 2XBJA 5HEZA 5HHWA 5FGKA 2WIPA 4RVKA 3UYSA 2B9IA 2O0UA 4AZTA 4B8LA 2OFVA 3EIDA 2IZTA 3H0ZA 4WNMA 3FMKA 2OKRA 4QTEA 2P2HA 4EEVA 1H0VA 1Y6AA 1MRYA 4E6QA 4EI4A 1KE6A 3GBZA 3MA3A 4IAIA 4MF0A 4EC9A 4NM3A 4FI1A 3ZUUA 2P55A 3Q5IA 4ID7A 5ANGA 2B7AA 2YAKA 2PZPA 3AC1A 2XIXA 3MWUA 3O8TA 4TPTA 4WG4A 5A4LA 2VTMA 4FV0A 3KCKA 3BYSA 3R9NA 3BKBA 1KE5A 3R0TA 5E91A 3SXRA 2WU6A 2C30A 2W96B 3HGKA 2WXVA 3FQSA 4O96A 4YJQA 1UNLA 2QNJA 4UMQA 4E1ZA 3EL8A 3E5AA 3OY3A 4EOPA 3LJ1A 4RVMA 2J0JA 4ASXA 2X7FA 1WBPA 4JQEA 5DIAA 2ZOQA 4FIGA 4EH8A 3RK5A 3KA0A 3BWFA 3GQLA 3LCDA 3RP9A 3S4QA 4A4LA 2UW5A 4GUBA 2YISA 3D9VA 4XP0A 2CNVA 4WIHA 3RNYA 4AN2A 3N4TA 2VNWA 3LJ0A 4P5QA 3ZEPA 5L8JA 3WZDA 1ERKA 4OR5A 4O84A 2J5EA 2CLXA 1YDSE 4N6ZA 1ZRZA 3UIUA 3HL7A 4QMQA 2WTKC 3ACJA 4BWKA 3EYHA 4RJ5A 1Y8GA 4E20A 3G0FA 3ORZA 5I0BA 4C37A 4DBXA 3PIZA 3VJNA 3HMIA 2WMUA 3F3VA 3MFTA 5EW8A 5M53A 4J7BA 5IF1A 1MRVA 3VUGA 2I0EA 4FG8A 3MFUA 4FKGA 1OL7A 2X4ZA 4ITHA 4AXAA 4C36A 1XBBA 4ANNA 2W4KA 2WQMA 2EXMA 2QU6A 5FQDC 2VWBA 3VVHA 4YURA 2VTAA 5IA3A 3TV6A 5KMOA 5L6PA 1PRYA 2QODA 4EK6A 4A4XA 5CLPA 2FVDA 1JBPE 3M1SA 5E8XA 2Y9QA 5L2TA 4CV9A 3U4UA 5DRDA 3GUBA 4AZVA 5IQBA 3CTJA 4XV3A 5AIRA 5E8YA 5AP7A 4AOTA 4KBKA 2BCJA 3VW8A 3QWJA 3ZZEA 3FBVA 2G01A 4TXCA 1ZOEA 4IAYA 5J5SA 2WEIA 3GU7A 4FZ7A 4MXAA 4FK6A 5AR8A 5JGBA 3MYGA 2PVNA 3QL8A 2UZTA 5JRSA 2YM5A 4D4SA 4AUAA 2PU8A 2VN9A 4G3DA 4X3JA 4LGDA 3P7CA 4MWIA 2A2AA 4AT4A 3P7AA 5HIEA 3OTUA 3O2MA 4V0GB 3MY0A 3FMLA 3K54A 4CCUA 1U54A 5CEOA 4V04A 5AP5A 4D2PA 3A4OX 2BZHB 2R3IA 1XH5A 3FLZA 1Q8TA 4PDYA 2ETMA 4TNDA 4C4FA 3E3PA 1H1PA 4J52A 1LUFA 3G90X 4IBMA 4P90A 4PTEA 3L8VA 2RF9A 4RMZA 2C5OA 3NVMB 2PWLA 5M51A 3LMGA 1YOLA 3DKGA 3EB0A 3TV7A 1SVEA 1WBNA 4ZIMA 2UZEA 4MBLA 4DBNA 4EONA 5HE0A 5J9LA 1XWSA 2PVRA 2W5BA 3F2RA 4TTHB 4BCNA 3VW6A 3W10A 3ENMA 2PMNX 4DF3A 4E4LA 3ORIA 4FKJA 3E7OA 4UEUA 3LMHA 3KULA 4EWQA 3O0GA 4RX8A 1ZLTA 4YSMA 2CMWA 4MXCA 1OIUA 2WQNA 5FRIA 5IH6A 3MPTA 4QP9A 3TACA 3V51A 3QBNA 4RC3A 4C34A 4EYJA 2B9FA 2BKZA 4I92A 4QMSA 5IUIA 4H58A 4FV9A 3ZONA 4CFNA 3QXPA 1WVWA 5D7VA 4JG6A 3IK3A 5M55A 5EFQA 1S9IA 3P86A 1H4LA 1RDQE 5GJFA 3LQ8A 3U9NA 5BQ0A 4WSYA 3LFSA 2FO0A 3D4QA 4QNAA 3ZDIA 5FXRA 2CGVA 3EN9A 2IW6A 4RLLA 3MH3A 2PE1A 1AD5A 4G6NA 4AS0A 5F9EA 3KRWA 5KO1A 3THBA 3ATSA 4LRKA 4YJOA 3BGPA 3EYGA 1NVSA 4FKVA 2GTMA 1YXTA 4HGSA 3PRFA 1KE7A 1W84A 2JFLA 2P4IA 4JR3A 3W2SA 5L8LA 3A7HA 2PY3A 2HZIA 2VGPA 3EKKA 3PJCA 2R3KA 3LFCA 4JQ8A 4PTCA 2R3JA 3JY9A 3H0YA 2PZYA 5EHLA 2E9UA 2XJ0A 3WZEA 3Q4CA 2ZM4A 3P1AA 2OF4A 4NWMA 3SG9A 2VZ6A 4CYIA 2VWIA 4J1RA 3QUDA 2W05A 2C1BA 3DZOA 3QQUA 4YZBA 2Q83A 1Q24A 1QPEA 4HZRA 3UOJA 3VBQA 4AZFA 2AC5A 4F63A 2PZIA 4W9XA 5CF4A 2FSMX 4DH5A 4ZSEA 3ZXZA 5CNNA 4Q5EA 3O7LD 4L00A 3U6IA 2ZB0A 3KVXA 4CG9A 3MB7A 3R00A 3UIMA 4ERKA 1H26A 2PZRA 4CZTA 4EOSA 5CVFA 5AP4A 4Y8DA 3OW4A 4JIAA 3D5XA 3NIZA 2ZDTA 3COIA 2R4BA 3HNGA 3NNXA 3ZRKA 4Q5HA 4O1OA 3RPYA 3LW0A 4E26A 1JLUE 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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