3QTIA

C-met kinase in complex with nvp-bvu972
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
309
structure length
292
Chain Sequence
HIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKFLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEFLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title A Drug Resistance Screen Using a Selective MET Inhibitor Reveals a Spectrum of Mutations That Partially Overlap with Activating Mutations Found in Cancer Patients.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
total genus 90
structure length 292
sequence length 309
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qtiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qtiA01
5IUGA 3BGQA 4MD8E 2BFYA 2CHLA 2BTSA 4IB0A 4Y95A 3WF5A 1YXSA 2OFVA 1DS5A 3GC0A 3QA0A 4DEGA 3R1QA 3BEGA 4YO6A 4QT1A 2C1BA 3H4JA 4MF1A 1BX6A 2VTAA 3OXIA 4O0XA 2B0QA 3MI9A 3OBGA 1F3MC 3F3TA 2BVAA 3FBVA 4APCA 4O7RA 2BHEA 3I79A 2PMNX 3V8SA 1XO2B 3LCKA 2C0OA 5C27A 2UW8A 5FM2A 3AQVA 3NIZA 4BDFA 4FTMA 3F3ZA 4NKAA 4JVGA 1Q3DA 1OECA 4C4EA 3O17A 5CEKA 4EL9A 3FSKA 3NDMA 3V01A 4QTEA 3COIA 2OI4X 5EKOA 5EI8A 4X3JA 4BWPA 3VS7A 3FYKX 4FIHA 3ZRLA 4CFWA 2IG7A 2PE0A 5DH3A 3VHKA 5HESA 3W8QA 4YJSA 5E8XA 4G34A 4G3DA 3DY7A 4WG4A 2ITPA 2J6MA 3NSZA 1GIIA 4O0SA 5BVWA 2YCRA 4AGUA 3FDNA 4JX3A 2FGIA 4D2SA 3ZM4A 4YHFA 4RSSA 3QWKA 1XBAA 4IX3A 4RJ6A 5AP5A 3R9OA 5KBQA 4J71A 4BCPA 5LMKC 2NNWB 4NH1A 4IC8A 4FZ6A 5KHXA 2XNPA 4IAFA 3KVWA 2ZB1A 3MN3A 4AOTA 3SGCA 5FTOA 3VS1A 1SYKA 2QCSA 3SX9A 2BIKB 2HENA 1RJBA 2I0YA 4L53A 3O96A 5CYIA 2VD5A 2WPAA 5AR7A 3UZTA 4F7NA 2W1CA 2W1FA 4D5KA 4AFJA 2XEZA 3FWQA 3CE3A 3VS3A 5AA8A 1PMNA 4FTKA 4BRXA 1WBTA 5EW3A 5HTIA 3QXOA 3WZEA 4RFYA 1APME 3DQWA 2QKRA 5H2UA 4FC0A 3ZYAA 3HAVA 5CSVA 2WZJA 3HMNA 5DMZA 3R1YA 4KIPA 5IH5A 4GG5A 2XIKA 4NM5A 3LXKA 1H01A 3LFDA 2CGVA 2OSCA 3DAKA 2R7IA 3ORNA 4FKPA 1PXMA 5DFPA 3VAPA 4ALVA 5M56A 1RW8A 1XBCA 1YRPA 3RJCA 3MSSA 3ZBFA 3E5AA 4DGNA 2R3NA 4RX7A 5AJQA 5DRDA 3ZZWA 5EQPA 4C3RA 3BELA 4D1XA 4IC7A 4YTIA 4LOPA 2J4ZA 1H1SA 2NO3A 1SM2A 3FUPA 4I6BA 3MPMA 1YOLA 1BI8A 1AGWA 2WXVA 3QCSA 4I6QA 5E8TA 2IZRA 3UO5A 2JLDA 3O0GA 4CRLA 2Z7RA 4FT0A 4H58A 5AUWA 1YWNA 3DXQA 3QGYA 3KK9A 2UW5A 3QTWA 5CY3A 4FBXA 5EKNA 3GU7A 2YZLA 4NK9A 3ORLA 2VWVA 2VNYA 1Q61A 2J90A 4EOIA 4FEQA 3RBWA 4XG7A 3KXNA 4XX9A 3NYVA 3LXPA 1CKIA 2YWPA 3DB8A 2BTRA 4FT5A 3UJGA 2YIYA 4AZFA 5DNRA 4C35A 5L8KA 1V0BA 4EI4A 2LGCA 4YGAA 3UP2A 4NSTA 1XBBA 4YC6A 2VTPA 2EUFB 4K0YA 4FX3A 3LZBA 2XK8A 4Y72A 3KU2A 1J91A 2Q0NA 3OS3A 3PA3A 5HICA 1OITA 1PF8A 4OGRA 4ACGA 5EDQA 5IUIA 3V5LA 2QR8A 1H1RA 1MQBA 2C6KA 4DCEA 2O64A 4ZTSA 3U9NA 4FL2A 2HW7A 4MNFA 2YFXA 3ZC5A 4XJ0A 2YM4A 2X2KA 5LOHA 1H08A 3OUKA 4CLJA 4RFZA 5AP7A 2W1EA 5AP6A 3UIMA 3WZKA 3KXMA 3O23A 4FTRA 3EIDA 2B52A 3E3PA 3G15A 3R0TA 2C68A 4F0FA 3DBEA 4DTBA 2F7XE 4WD5A 5HIBA 3R8UA 2VO0A 4E26A 3GNIB 3CS9A 4H39A 5DIAA 4L3LA 3LMGA 2ITNA 3OP5A 1TQMA 3LIJA 4JNWA 1FMOE 4YR8A 4MF0A 4DFYA 4CKJA 2XM9A 1MRVA 2VAGA 3OHTA 1WVYA 2VN9A 4G6NA 3R8MA 2C3JA 1PXLA 3I7BA 4PPCA 1OIRA 4L42A 4BCOA 4PV0A 3AC5A 5K3YA 1VR2A 4RWLA 4EHEA 4FYOA 4NM7A 4IM2A 4NM0A 4C02A 3AT3A 5I9WA 3RALA 5EOBA 4E5WA 3VUHA 4V0GB 2QHMA 5A46A 4GFMA 5JGAA 4FK6A 4WBOA 4O38A 4H3QA 2OF2A 3G6GA 3GEQA 2W0JA 2R3PA 3FLNC 5DT4A 4ACHA 4BIBA 4E73A 2R3OA 4HVSA 3QXPA 5C8MA 3PXYA 4WT6A 3NUPA 2FO0A 3O7LB 3R8VA 4ENYA 4KSQA 2PVNA 4KSPA 5FEEA 4QQTA 2J0KA 3CR0A 3MBLA 1PRYA 4FE2A 2XH5A 3POOA 4MXZA 3HVCA 5DVRA 4O7VA 3VBWA 5CAPA 5BX0A 3LJ0A 3PIXA 5FBOA 4DGMA 3AMYA 2ZVAA 3EMGA 1UWHA 3W2RA 3FEGA 1UV5A 1ZRZA 4C4GA 4JRVA 4R7HA 3AC3A 4ZY4A 4ZLOA 3QALE 4L45A 1Z9XA 3UZRA 5E8WA 5CZIA 3BZ3A 4BTJA 4YNEA 1CDKA 3BLHA 4NIFA 4R6VA 2XNNA 2BFXA 3FMNA 3HDNA 3KC3A 3Q60A 4TRLA 3TZ8A 4DFLA 4LOQA 2YN8A 5DT0A 2W9FB 3R9NA 4F1MA 2X39A 3IQ7A 5ETFA 2PZPA 1OPKA 4FEWA 2UZLA 4B0GA 4YTFA 2VUWA 2DUVA 3A7IA 1IEPA 4AU8A 4ZTQA 2B9FA 5A6OA 4UYAA 2PUUA 5CVHA 4CKIA 3E92A 1H24A 3H9FA 5HX6A 3N4TA 2B1PA 3VBVA 4ZMFA 4JR3A 3OG7A 4S34A 3FZSA 4TN6A 4Z3VA 2I40A 3I81A 2W7XA 2DWBA 4FT9A 5ANJA 2O8YA 3C50A 4U3ZA 3NMUF 3PY0A 4MAOA 4JBVA 4NTSA 1AD5A 2PMIA 5CANA 2C6EA 3QTZA 4IX5A 5ACKA 4AWIA 3TIZA 4YO4A 3FKNA 4FV9A 5AR4A 4ARKA 3DPKA 5M44A 1PXIA 2ERZE 4WA9A 2Y6OA 3O8TA 2Q83A 3G0FA 3D2KA 4CMTA 5L3AA 4BYJA 1ZY5A 3HP5A 5D41A 4ASZA 3BE9A 2WQEA 5AV4A 4JG6A 2WTKC 4L8MA 3QZIA 4N0SA 1SZMA 4JLCA 3C0IA 1H07A 1SVGA 2I7QA 2SRCA 5AP0A 3EYHA 3FQEA 4N57A 4KKEA 3UPXA 3LXLA 1FVRA 3NW6A 1XH9A 4NEUA 2O2UA 3GC8A 3GUBA 3QZHA 1MUOA 2WMXA 3OCGA 4N6YA 3HMPA 1XH8A 4DN5A 1KE5A 5JT2A 5G1XA 3I1AA 3KMWA 1SNUA 2W96B 4AGDA 3TG1A 3DBFA 3FY2A 4QPSA 4FVQA 5CXHA 4ZIMA 2BPMA 3GCPA 2F49A 4XRLA 3ID6C 2C3LA 3DXNA 4UN0C 2FA2A 2HIWA 4D2TA 3TDVA 2CDZA 4JQEA 4APPA 2F7ZE 3P1AA 4H1MA 3PVUA 5CVGA 5HHWA 3QTQA 1JKKA 3HV3A 1ZYLA 2G2FA 5G6VA 5J7HA 4F7JA 3R1SA 4CFNA 4A06A 2VNWA 4BKYA 4K6ZA 2RFNA 4RIYB 2JDOA 2Y0AA 4ASDA 5K9IA 2BZKB 3VHEA 4BCFA 5M09A 2XF0A 3A7HA 1SMHA 3MVLA 4Y46A 3RM6A 1H4LA 1U59A 2QOBA 3E8EA 3F69A 2J9MA 3TV7A 1OIUA 1QPEA 5BQ0A 5JGDA 2XKCA 3EQHA 4L00A 2JITA 4ZMEA 1H27A 3V6SA 3E7OA 3P08A 3ZONA 4KNBA 4FV4A 3OOGA 2PZRA 3ENHA 5TOZA 4JAJA 3ZEWA 1UNGA 4ZAUA 2YITA 5KMIA 5FDXA 4HGLA 3H9RA 4CQGA 2ZMCA 2Z7LA 3FLYA 3R71A 1H0VA 3FSFA 1ZYSA 4YZMA 4DFZE 3DS6A 5J7BA 3R00A 3OD6X 3GC9A 3RCDA 5EM6A 3D5WA 4Y83A 3QKKA 4KAOA 3KA0A 1IA8A 4EQCA 4G6OA 1E1VA 3FKOA 2IJMA 2E9UA 4MHAA 3PLAE 4S32A 4FT7A 5AR5A 3BQRA 4GFGA 1STCE 3C1XA 5DG5A 4ASXA 1PXJA 4NYEA 2HW6A 3Q3BA 4D5HA 5K4JA 4BC6A 5FDPA 3KB7A 1YHSA 1KE9A 4PY1A 2UZNA 4QTAA 1J3HA 4ITIA 4EBVA 2H9VA 3CPBA 4QPMA 4CQEA 4CKRA 5HBJA 3KN5A 4D2RA 2J0MB 3QUDA 3V3VA 1OKZA 1HCKA 1CSNA 3NNWA 3SA0A 5HG5A 5HLPA 2C3KA 5KMJA 3DDQA 4C4JA 4GK3A 1WAKA 4C7TA 3ZZEA 3MTFA 5J1WA 3FZPA 4Z55A 2IWIA 3NCZA 3RPOA 4D4VA 4XMOA 5ACBC 3BYOA 4EK6A 3SKCA 3ZLXA 4ZLZA 1VEBA 5CLPA 5EHLA 3KQ7A 4QYGA 3BWFA 4LUDA 4WNOA 4BKJA 4C36A 4QD6A 5H9BA 5LCKA 1ZZLA 5K4IA 4U3YA 1E1XA 2GNFA 5L6OA 5CAOA 1ZYCA 3ALOA 4F08A 3EKNA 4EQUA 4NUSA 5LMBA 1JVPP 3QFVA 2YIQA 3LFSA 1YHWA 1UKHA 4XYFA 4M0ZA 3F6XA 3OF0A 4FOCA 2X7FA 3I7CA 3W2OA 4UX9A 1TQIA 1UKIA 2BRBA 1JKTA 3ZO2A 3OXZA 3A60A 3D94A 2X8DA 3EQPA 4PDSA 4MTAA 2GQSA 4NL0A 5DEYA 5J87A 4EH2A 2WAJA 4KIQA 3R7YA 1LPUA 1KSWA 1W0XC 2UVYA 3OCTA 4DT9A 1O9UA 3O7LD 2QOCA 3F9NA 1GOLA 3GVUA 3KKVA 3FMKA 2I0VA 4X0MA 2EB3A 4IJPA 2BDWA 4N70A 4D4YA 2V62A 2GNLA 4DGOA 4DH3A 4WSYA 3OOMA 5CU2A 4WHZA 1LUFA 2R7BA 2BZJA 4C4HA 4EH9A 3DV3A 3OWPA 4ZTHA 4RZVA 4X2GA 1Q8UA 3EFKA 4XP0A 5IA2A 2VX3A 2A19B 5AAEA 5J79A 4J8NA 3VVHA 4FNYA 5KX8A 1JSVA 2O63A 1SNXA 4XV2A 3WARA 2C69A 3OY1A 4QP7A 2WB8A 2OXYA 2OZAB 5HNGA 4EJ7A 4EWHA 2JEDA 3C0GA 4JDIA 4NFNA 5M51A 1M7NA 3HP2A 1WVXA 5E7RA 3P5KA 3SRVB 4RJ8A 3EJ1A 3VRYA 2YDKA 4FVPA 2IW8A 2OK1A 4FKVA 4TYEA 4U6RA 3OTUA 1VJYA 4GUEA 4I94A 3UNJA 4BTKA 3WZUA 5KMNA 4HCUA 3TZMA 2UW9A 4EC9A 3UQGA 4HW7A 3KXHA 4AQCA 2QOHA 5HD7A 1JOWB 3IW8A 4AAAA 4D2WA 2P4IA 4IZAA 5E8SA 4OBOA 3UYSA 4IMYA 3PVGA 5C9CA 2O65A 2X2MA 2GTMA 1MQ4A 4RX9A 3PE1A 5BVFA 2J7TA 2R3GA 5HX8A 4X2NA 2UZWE 3HL7A 2IW9A 3S2PA 5ANOA 5CENA 4J96A 4W8EA 2YCFA 3E62A 3DXPA 4PDYA 3L9MA 1R3CA 1JKSA 3DNEA 1R78A 2AYPA 2QOOA 4QMPA 3ZFYA 1XHAA 3G90X 3AD4A 3QLFA 5BPYA 2ITWA 4MNEA 5AUUA 3D7TB 4BICA 3ZMMA 2YDIA 4RT7A 5K0XA 5D1JA 4M84A 2Y7JA 2CNVA 3DT1A 4FTQA 3OCSA 4IAZA 3KRLA 4B9DA 2PVLA 3BU5A 2E2BA 4BTFA 4E4NA 3F3WA 4E8AA 4RG0A 4FSUA 5TR6A 2ZV7A 2BCJA 3T9IA 3HV4A 4KD1A 2GQRA 5CF4A 4ANBA 3RK9A 3RVGA 4FEUA 3ORZA 3U6IA 1M2RA 3CTJA 5HTBA 3S00A 4FKRA 3P78A 3GFWA 4DG2E 3EYGA 4O6EA 4RWKA 4OTHA 4KS7A 4CD0A 2UZTA 4QYFA 3HNGA 3Q96A 4J98A 4RA4A 5HIDA 5KMKA 5I5ZA 2YACA 4CXAA 1WBWA 3P23A 1O6KA 5GZ8A 5HZNA 5J9ZA 4H36A 2NRUA 2XIZA 4DFUA 4O2ZA 1Q8TA 2GNHA 2YAAA 4GU9A 1M2PA 1XR1A 3OTVA 1P4OA 3TCPA 3JUHA 4ZP5A 2XYNA 3HECA 3VUTA 5IA4A 4GKHA 4G9RA 5HLWA 3HEGA 4JAIA 4B8LA 2WELA 4C62A 5KCVA 4F4PA 4U0IA 1UU3A 3SDJA 3EB0A 3NGAA 5IH6A 4MXAA 4UMUA 5M06A 2Y6MA 3ODZX 2HWPA 5M4IA 2G2HA 3RP9A 4XH6A 5LWNA 2PVMA 5IQHA 3Q5IA 1CKPA 3FLSA 4FTLA 4AUAA 4HVHA 1U5QA 4XV9A 3TXOA 3ZTXA 3EKKA 2C5VA 5FRIA 4P4CA 4GIHA 3K5UA 5GHVA 3I6UA 2X7GA 4PX6A 1KE6A 5A6NA 1Q3WA 1PYXA 2UUEA 2W5AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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